Lsi08G005300 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi08G005300
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr08 : 13257621 .. 13261875 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDS
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CAAGCCAATACTTTTTAGCTCCAAAAATTAACTTCCCTTTTGTCTCAAAATGGCGATCTCTAAGGCTGCTGGAGTCATGGCCATGGCCGCGTTCCTTGCCCTCTTCCTCCTCATATCCACCGCCAACGTAGCAGCCGCTCTGCCCTACGAGTCGATGATACCGCAAGAATTTGCTCTTGGTCAGTATGATTTACACCCTAAACTTGTTCAGTAATTCTGTTGTTTAGGGTACGTTCGGTAATCATTTCGTTTTTGGCATGTTATATAACAAAACAATTTAAATAAATTAGCCATTTTGAACGTGAATAATATATTCATAATTAATTATTGTTTGATGATATAAGATTAAATTTGTTTTCACCTATTGGCTTAAGTTTTTGAGTTAATTGACGATTTAACATGGTATCAGAGTAAGTTTGTTCAAATAGGACCAATTGATTCAAAAACTTTTGGATCAATCAACGATTTAACAATTATCATCTCAATAGTCGATAGTTTGATTTTATCTCATAGTCAAATAAATTAAATTAAGTGAAGGTCATGTCATATCACTAATATATTATTATCCTTTATCCTTTGTTCCGTATCTTGATTTCTTTGTAATGAAATTATAAATTTAGTTCATGAAATCATGATTGTGTCTAATAAATTCAAAAACTTTAAGAAATATTTAATAGATTATTCAACTTTTGATTTTCTTTCTAATAGGTCAATAGATTTTAAAAATACAAAATAAATCCTTGAACTTTCATTGTTTTTGTCTAAGCATATTCAACCTATCTTAAAATTAACAAATCTTTTAAACATATAAAATTAAATTTCTTTTTTCAAAAAATACATTAAAGTTTTAATTTTTTACAAATTTTAAGAAATGTCGAATAAATCAAAGGTTTACTGGACACAGAAATGATTAGTTGATGTTATTTGGTATATATATATATTTTTATCAGGACGAAAGGTTCTTGAGGAGAAATATGAAGCAACAGGTAGAAGTGGATATAACAAATATGAACCCAATGGTAGAAGTGGATATAACAAATATGAACCCAATGGCAGAAGTGGATATAACAAAAATGAACCCAATGGCAGGAGTGGCTACAATGGCAACAAGCCCACAGGAAGGGGAGGATATAATTAAACTTTATAATCTCTTCTACAAATAATAATCATCACTCTTTATCTACTTTCTATAATATATATATACACACACGTATGTCTGTGTGTATATATATACATATGGTGTCCTTACTTATCGTTAATATAGATAAATAAAATAAATGTTTGTGTTTGTCATAGTATTAAATTTTCATCGATATGTCGATATTTTCATCGATATTTTTATGTTTCTATGGGTTCAATATCGAAATGAGGGATAATATTTCCATTATATCATAGAAAAATCCACAAAACACAAAAAATAAGTATCAAAATGTCATTAATATAAATATAATATAAATAATAGACATGTTTACTTATTTAAAAATAATAAAATGTTTATTTAATAATTTAAATTTATTTTTTAAATTTTTTGTTTTTATAATTTTTCCAAAAATATCTGTCGAAATCGATATTTTATCGATATTTCCATCAATATTTCCGTAAAATTAATACCTTGATATTTCCATCGACATCAATATTTTAAACCTTGGGTTTGTGTTTTTAGGCTCTGTTTGATAACCATTTCGTTTTTTGTTTTTTAAAATTAAGCTTATTTTCTCACATTTTTATCTAAATTCTAAATTTCAAGAACAAATTTTTAGAAACTATATTTTTTTTTAGTTTTCAAACTTTGGTTTGGTTTTTGAAAATTTGGCTTGGCTTGATTTAGAAGTTAGAGTAATGTTTATAGGCTTAAATTTTAAAAACTAAAAACTAAATGATTATCAAACGGGTCTTAACTATTTGTTTAAAAAAATTGTTAATTTGAATTAAAACTAAAAATTCAAAAAGAGATATGACGAGGAGAATTATTAGATAAATAGTATATTTAGGTTTAATATTTGTTTAGTTGTTAATTTAGATTAATTAGTGTTTGATTAGATTTGATTGGTTAATTATGATATTTCCTTGTGAAGCTATAAATAATATCTTTAGGGTTGTAATAAGGAGCTTTTGAATATCCATTTTGAAATAGAACATTGTTCTTGGAGAGTTTCTCTCATCTTTAGGGATGAATTTCCTTTGTTTGGCCCTGGACTTGGTCTAATACCTTAACCCGCTGCATCAAGATCTGACCACTGTTTAAACCGAAATTTTAACCAAATAGCAAATAATTTTAGAAAAACTAATATCTACAAACAATATGTCAACAACAACAATGTTTTAAAAACTATATAAAAAAAATGGAAATAGGTAATTACACATTAGTTAATATATATGGTTTTTATCTATGAGTGGATTTCCATCAAAATTAATATTAGAATATTTAATATTAATATAATACAACATTTAGGCATTGCATAAACAAATAAGTTATCTTTAAAATGTTTGTCTAAAAAAAAGTTAAATACCTAATCCCCACAAATACATTGTCCTACTTTTGCCACACAACCTAGTACCAAACAACTTAAATCTTTGTTGAACTAAACAAATACTTTGTAATATATAATTGTTAACATTATAAAAATAAATAAAAAATCTTCGTCAAGTTGAATTTGCAAATACTAAATACTAAAAAGTAAAATCTCTCGATTATTTTGTGGTAATGTGAATAAAATCATGTACCGTAACAACTTAGCCATGGTTAAAAATACTTATTGAAAAATAAAGTATGCCAAAAATACCTTGTATTTGAAGATGTTTAATAGTGTCATCAAACATTTGTCCTTTCATCTTCAACAATCTTCAACGTTAACACAATTATCGTGTTAAGATAAATCTCATGACATGTATAAAACGAAACCAATGTTTTCAATTTGATAAATTGAAACCAACGTCCACTATTGAAGCTTACAAGTTTTTCATATAATCCCTTTAAAATCACCAAGTCTCTTTAGAGCATACTTGTTATCTAGTACCATTGGTAAGTCCTAAATTTTAGGAGAATGAGATATTAATTTAGCTACAAAAATGTAAAAAAGACCAACAAAAATTATCTATTAGAAACCATGAGAGATTTGGGAGAAGATTGTACATCATCTTTTACCATAAATCAGTATTTTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCACTTAAAATGGTCAATCCTCACAATTTTTCATTTAGTCGGTAAGTACTCTTCAGGGAGTGTAAATAAGGGGAAAAATAGCAAATGAAAAAGAAATATCATTTTGCCATATTTTTCAGCAGAATTTTATTTTAGATGTTTTTCAAAAAATAGCCTTTTGAGATGGTCATTCCTCATAATTTCTCTATTACTTATGTGTCAAAGCCCAAGCCCACGAGAAGATTGGCCCAAAAGTAGTCGTTTAGCCTCTTTAACAAAATCATGTTGTTAGGAGGGTTAAATCTTGGGTTTATATTTTATTTAGAAAAATGAAAAAAAAGTTTTTAAAATCTCAATAATAACAAACCGATTTTTAAATAAAATTATATTAATTTGTAAATATCCAAACTACTAATGCACACTAAAATTGATAAAATAAAACAAATCTAAAAAGAACTAAACCAACACAAATATATTTTATTTAATAATACACAAAAAAAAATTGTTGAAAAGAAACCCCCAAATACACTTTATTTAAGTATTTTAGAGGTCACCTACTACAAGTAAAATTACAGATTTACAAAAAAAAAATAAATAAAATAAATAAATAAATAAATAGATTGTTGAAAAGAAACCCTAACATCCAAACATGGTGGGTAAATCGATATTTAGGTCAAAACTTAATGGCATTCATAAACTAAACAAGGAACTCACAAAACTTACCAAAAACATATTGAAACACCTTGAATCTACTATCTCCAACAAAAACCCATAAAACACTGGTAATGTACGATGGCGTTGGTCGAGCGGCAGGCATGAACGACGATGGAAGCAAGGCATCGAGAGCAATGTTCGGTGTTGAGCAACGGCTGACATGGGTTCTGTTTTACGTAAAAGAGAAATTGAGAGAAAGAGAGAGATGA

mRNA sequence

CAAGCCAATACTTTTTAGCTCCAAAAATTAACTTCCCTTTTGTCTCAAAATGGCGATCTCTAAGGCTGCTGGAGTCATGGCCATGGCCGCGTTCCTTGCCCTCTTCCTCCTCATATCCACCGCCAACGTAGCAGCCGCTCTGCCCTACGAGTCGATGATACCGCAAGAATTTGCTCTTGGCATGAACGACGATGGAAGCAAGGCATCGAGAGCAATGTTCGGTGTTGAGCAACGGCTGACATGGGTTCTGTTTTACGTAAAAGAGAAATTGAGAGAAAGAGAGAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGATCTCTAAGGCTGCTGGAGTCATGGCCATGGCCGCGTTCCTTGCCCTCTTCCTCCTCATATCCACCGCCAACGTAGCAGCCGCTCTGCCCTACGAGTCGATGATACCGCAAGAATTTGCTCTTGGCATGAACGACGATGGAAGCAAGGCATCGAGAGCAATGTTCGGTGTTGAGCAACGGCTGACATGGGTTCTGTTTTACGTAAAAGAGAAATTGAGAGAAAGAGAGAGATGA

Protein sequence

MAISKAAGVMAMAAFLALFLLISTANVAAALPYESMIPQEFALGMNDDGSKASRAMFGVEQRLTWVLFYVKEKLRERER
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
cellular_component GO:0031410 cytoplasmic vesicle
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi08G005300.1Lsi08G005300.1mRNA