Lsi06G002030 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTCAGTCACCAAGAATGAAGTCAAAACAATTGGTTTCTATTTATATTCTTTCTTATTCTAATTTCACTTTATTACTTTTTTTCTTAATCAATTAGTTTGTTTCTTTCAATAAACTCAAAAAATGAAGACACACATTTCCTACAGGGATTGAGTGGAGTCTCGATGGTGATGCATCAAATGCCACTGTTTTAGTTGCTAGTGAAGCGCATGCAATAACCCTGGCCGTTGAGGGCCTATTAGGTGTTGTCTTTACTGTGGCTACTTTAACTGATGAAGCAGTTGACCTTGGGGAGGTATCTTGGTTTTCATTTTACCATTCTGATATACTTTACGATCATTCATTTTATTGAGATGCAATATGAGATGGGCTGATCATATCTTGTGTTCTTTTGATATTATAGCTTGAATCTCCAAGGTCCGATTATGATCCATCAGGAAAGTGTAATGGAAGAATAGCAAGTGTCTGCATTTCGATGGTTGATTCTTTGTGGCTGACAATACTTGATGCATTGTCCCTTATTCTTACTAGGTACGATAATCTTTTTTTGCTCCCTCTGTATTGCATGTTCATGAATGGTGCGGAACTTGAATTAAGCTTCTGATGAAAGATCACAGGGAGAGGCTATTGTCTTGGAGATTTTGAAAGGATATCAAGCGTTCACTCAGGTGACTGAATATGATTACTGTTATCTTATCGCGATGGTGTTTTCCCTGAGAATTTTTTTGTGAGAAACCGTAGCTTAGCTTTCTTTCGTAGTGTCAAAAACTAATGTTGACATTTCTTTTTATGAAGAAACTTAAATGATCAAATGATTTGAGTTAACTTTTGAGTGGAGACTCACGTAATCAAACATTACGTAGCTAACATACCTCCATTTAGTCATAACTTTTCTTCCTGATACTGCGATGCACAATGAAATGGAACGTACATAAAATTCAATGCAACCAAACTCATTGGGATGGCTAGAAAATGTTCTGTCCTTTATTTTCATGGTTTTATGCGAGAACCCTTACTGAAATGATATTCGATATTTCTTTAACAAGTAGCAAACTTTTCATCAAATATGAAAAGAAAGAAAAAGTTCAAGGAAGAAACTCCCATAAGGAGTGAAAAGAACTAGCAACCAAACCAAAAAGAAAGTAATTTCCAAAGATACATAAAATGAAATGAAATTAAACAATGAAGAACCAAGCACCTAAAAGGGAACAAACACAATAAACCTAGAAGTAAATCTGTGACGTCCAAGAGGCCGTTGAAGCTACTCAAAGATTGCATAATTAGCAACTAAAGCATTGCCCCATAGAGACTAATTCAGCTCCCTAATGAAGGGAATAGTAGATAGAATGCTTAGAGGTTTGGGGAGGGACCATTCAGATGTTTGGTCCCTTGTTAGATTTCATATTCCTTTTTGGGCTTCAACTTCAAAGTGCTTTCTAATTATTCTAAGGTTTTATTTTGCACAATTGGAGCTCCTTCTTTAGTAAGGCTTCCTTTTGAGGGCTTGTTTTTTTATGCCCTTATATTCTTTCATTTTTTCTCAATGTAAGTTTCATAAAAAAAATTCAGCTCCATAACTAATGAGAAAACTTTGAAAGCAAAGGCGATCAAGTCCCTTAAAAGTGAAACTTGAAGGGGGTTGTTTGGTTGGAGGTTTTTCTAGATGTGAAGCAACACGGCAAACTAAACCCATGTTTGTTACACAATTTTCAACACTTTGCCTAAGAATAAGTTATTCCCAAACATCATCTTTCCCTATAACAATGGTTTTCTTTACCCTTCCAAAACTGTGGATTTTCTCTTTGCTCCATTCCTCTTTTGTTTTTCGTTTTATATATAATTTTATTTTGAATATAGTTAATTAATTAATTAACTACTTGATATTAATTTAGCAAAATTAATATAATTATTTATTTTAATAAATCAATAATAATTTAGGGGAATTTTTAAAAATAGAAAAATAAAGGAAACTATTTACACAAAATAGCAAAATTTTTAGATAGTTGTGATAGACGCTGATAGAAGTCTATTAGGGTCTATCAGTGTTTAAAATGATAGAAGTCTATCACTGATAGATGCTGATAGAAGTCTATCAATGTCTATCAGTGTTTTTTTTGCTATTTTTTTGTAAATAGTTTCACATTTTTTCTATCTATAAAAAGTTTCCAATAATTTTATTAAAATATTTGATTATTTTATTTTTATAAATAAAAATGTATTAAATGAATGCAATTACTTATTTACATAAATTATTAACTAATTAGCTAACAATATCTTAAATATATTTGATTAGTTAACTAGGATTAGTTAAATTAAGTTAGTATAAAAATTCATTTTCCAATAGGGAAATTACTATAAACACAACAAATATCAAACTATTTACAAATATAGAAAAATTTCATTATCTATCAGCGATAGATTGCGATAGAATTCTATCGCAATCTATCGCTGATAGACAGTAAAAAATTCTATCGCAATCTATCGCTGATAGACAGTAAAATGTTTCTATATTTGTAAATAGTTTGACTCATTTTTCTATATTTGAAAACGACCCTTTTCAATAATTATAATTGATCACTTATTAATCAAATAATCATTTCTTGGGATTAATTTTAATTAGATCATTCATTATTAACATATCATGATTTGAAAACATTTTTCTTGTATTTCTTATTAACTTTTATTATTAACATATCATATTTTGTTCTCTTTTTCTTACTTTCATTTTTGTATATCGTTTATTAAAATATATTTATGTGTGTTATTTAATTAAATTTTAATTTATTCAAATTAAATTTATAATTAATAATGTTGAAGTCTACTTAATTAAAATTAAATAATTGATTTTAATATATAAATAACTATATACTCGTTTAATTCATTTGTATTGATAAATACCAAATGAATGCAATTAAGGATATTTATTAAAAATATTAATTAATTGTTTTAGTATTTGTGTGAATAAGAACAATTTTAGTATTAGTTAAATAAGTTTAGTTTAAGTATTTGAAATAGTACTTATAATTAAGGGAAAATTTTAAAAATAGAAAAATAAAGGTAACTATTTACACAAAATAGCAAAATTTTTAGATAGTTGTGATAGACGTTGATGGAAGTCTATTAGAGTCTATTAGTGATAGAAATGATAGAAGTCTATCACTAATAGATGCCGATAGAAGTCTATCACTAATAGATGCTGATAGAAGTCTATCAATGTCTATCAATGTCTTTTTTGCTATTTTCTGTAAATAGTTTGACATTTTTCTATTTGTGAAAATTTCCCTATAATTAAATATCCAATTAACATTGTTGTTCTTGATATGCTTTGTCCTATCACATTGAACTAGATCGTGGGATATAAAGATGACATCTTTGTTGGCGCAGTAAACTCGTATAGATGTTTTTTTTAAAGAACTTTCAACTTCTCAAGTAGCCTTTTTATCCATATTCCGTCATATGGGCTAATGCCTGAAATTCTGCTTTCGTGTTGCTTCTAGCCACAACATTTTGTTTTTGTCGCCAATTGACTAAGTTACCACCTACAAAAGAACAAAGGAACAATAGCTAAACGTAGATCTTCTATCCACTGTACTTCTTGCCCAATCAACATCAGTTTATACCCGATGTGCTTTTTAAACAAGATACTTGGGTCATGAAAATTTATGGGGTTTAGCTTTACATAGGTTTTTCCCTCTTAATCATATTAATTATTTGCAGGAGGAAAGCAATTAAAAGAGAACTAATAAGTAGGAAGTTCAAACGTGCAATTATGGAAGAATTTACTCTCCAAATTGAAGTGGAGATATATTGCATCTTCCTGAAAAGTTGAACTTTCTGTTTAAAGATGAATATGTTTTATGCATTCTACTTATGTCACGTGAATCACAGGCATGCGGAGTTCTCCATGCTGTTGAACCATTAAATTCATTTCTTGCCTCCCTTTGCAAGTTTACGATTAATTTTCCGACTGAAGTGGAAAAGAAGAGGTATTTAGTTCTATATCAACCAATGTAACAATTTCAATTTTCTTTCTCAGTTCTCCCATCTTCTCCACATGATGACTAGCATATATTTGATATTTTGAAATTGAAAGCATGTCTGTTTCTAATAACAATAGTAACATGGTCGAGATCAAGATTGAAGTTTAAAGGAAGATGTTTCCCTATTAATTTGTTCTAATAGTTTTCTTTATCATTAGCGTATATTTGATTTGTCCCTTTTTGTTAGCCTGCTGGATGGGGCTTTCTCTAACCTAGCGTCTCTTTCTTGGCCTTTTCTAATATGCTCCTTGTTTCTTATATGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAAGAAATCAAGGTTAGGGTTGAGATCAAGGTCGAATTTAAGGTTGGGATTTATAATAGAGAGGCTTAAGAAATTGAGATAATGGTTAGGGTTAGAGATGGAATGTGGAATGCATAATAATAGTTAATCGTAATCATTAATAATTAAAGAAAGGAGAATGGAAAGATTACCATTGAACTGTCGGGGTTAGTTATTAGCATCTCTGAAGTATATACTTGCGCAAATAATATCTCTGAAGCATTAGCTTCTTTGTTTGGATCATCCTTTTGGTGGTACTTGGAAGACAATTTGGTTGGCCATTACTCGTGCTTTCTTGTGGAGCTTATGGGGTGAAAGGAGCATATGACTTTTTAATGATTCTTTTTCACCATTTTCTCGTTTTATGGAACTTGTTTTATCTACTGCTTTTCTTTTCTGTGTAAAACGAAGCATCTTTTTACTCATTTCAACTTTTTTTTAATCAGTAATTGGCTTTCCCTCCTATAACTCTCATATTGCTTGGGGTTTTTCCCTTGTTTTATCAATGAATGTTTCTTTTACCAAAAAAACTGTAGGGGTTAGTTATTAGACTCGTATCTCTCGATTTTTCAATTTGAGCCCCCTTAAATTTATTAAATTGCTGCAATTAAATCTTGCCAATATGATGAACATGTGCATACTGTATCGTCTTGG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MGIEWSLDGDASNATVLVASEAHAITLAVEGLLGVVFTVATLTDEAVDLGELESPRSDYDPSGKCNGRIASVCISMVDSLWLTILDALSLILTRSQGEAIVLEILKGYQAFTQACGVLHAVEPLNSFLASLCKFTINFPTEVEKKSILQSPNSKRLEPFSDQRDTVILTPKNVQALRTLFNIAHRLHNVLGPSWVLVLDTLAALDRAIHSPHAMTQEVSTTVPKLTRESSGQYSDFHILSSLNSQLANNSNQHVRNIALDALDQSICSVLGSEPFLDFTSPNNHTSLKVSLYSSQSTDVCSGSLKILLHVLERHGEKLHYSWPNILELLRSVADASEKDLVALGFQSLRVILNDGLSSIPQECLHVCVDVTGAYSAQKTELNISLTAIGLLWTITDFIVKRLSHDHVGEKDSSSLPDVAFVPKQVNDERSEEQMVEASSHTDSSPFTNIVDSNKLLFSVFSLLHKLGADDRPEVRNSAIRTLFQSLGSHGQKLSESIWGTCLWDYVFPILDHASHMAATSSKDEWQGKELGTHGGKAVHMLIHHSRNTAQKQWDETLVLVLSGIARILRAFFPFLRSLTNFWSGWESLLLFVKNSILNGSKEVALAAINCLQTTVVSHSPKGNLPMTYLISVLNVYELVLQKSPHYSGNAASKVKQEILHGLGELYVQAQMMFDNQMYTQLLSVVDLAIKQAIITNENFETEFFKTGGLRLCKMRFYVLELVGHVPPELRTILEILPLLRPTDAISSMWLILLREFLQYLPRSGSPSIRENDADQTSTSYLVQANQGRLRNERHSRAASTTSNHEASQSVSPGSAAAPVGIQNVLFAEKLVPALVDLFLHAPVVEKCIICPEIIQSLGRCMTTRRDHPDGALWRLAVEGFNQILSDDVQNLTMMVLPETCTSRPARTRIWKEVADVYEIFLVGYCGRALSSSLPSGSMKANESLEMTLLNILGDKILKSPLDAPHDVIQRLVSTLDRCASRTCSVAVETVELMPIHCSRFSLTCLQKLFSLSSYDNEDDKWSSTRCEVSKISILLLVTRCQSILSRFLIDESYLGERPLPTARLDEIIYVLQELARLKIHYDTASVLPLPSHLNIDLNKENHDRRPHLLILFPSFCELVISREARVRELVQVLLKLIATELTLDKVSLAN
BLAST of Lsi06G002030 vs. Swiss-Prot
Match: MON2_DROME (Protein MON2 homolog OS=Drosophila melanogaster GN=mon2 PE=2 SV=4) HSP 1 Score: 187.2 bits (474), Expect = 1.0e-45 Identity = 105/315 (33.33%), Postives = 170/315 (53.97%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. Swiss-Prot
Match: MON2_MOUSE (Protein MON2 homolog OS=Mus musculus GN=Mon2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 186.8 bits (473), Expect = 1.3e-45 Identity = 108/324 (33.33%), Postives = 181/324 (55.86%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. Swiss-Prot
Match: MON2_HUMAN (Protein MON2 homolog OS=Homo sapiens GN=MON2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 186.0 bits (471), Expect = 2.3e-45 Identity = 108/324 (33.33%), Postives = 180/324 (55.56%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. Swiss-Prot
Match: MON2_DROPS (Protein MON2 homolog OS=Drosophila pseudoobscura pseudoobscura GN=mon2 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 186.0 bits (471), Expect = 2.3e-45 Identity = 105/315 (33.33%), Postives = 171/315 (54.29%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. Swiss-Prot
Match: MON2_XENLA (Protein MON2 homolog OS=Xenopus laevis GN=mon2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 2.1e-43 Identity = 106/324 (32.72%), Postives = 178/324 (54.94%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LW83_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G574770 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1622.1 bits (4199), Expect = 0.0e+00 Identity = 834/926 (90.06%), Postives = 858/926 (92.66%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. TrEMBL
Match: M5WNG8_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa000159mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1518.8 bits (3931), Expect = 0.0e+00 Identity = 819/1212 (67.57%), Postives = 942/1212 (77.72%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. TrEMBL
Match: B9REU1_RICCO (Guanine nucleotide-exchange, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_1428750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1484.5 bits (3842), Expect = 0.0e+00 Identity = 791/1200 (65.92%), Postives = 919/1200 (76.58%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. TrEMBL
Match: A0A022Q4T3_ERYGU (Uncharacterized protein OS=Erythranthe guttata GN=MIMGU_mgv1a000431mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1351.7 bits (3497), Expect = 0.0e+00 Identity = 742/1209 (61.37%), Postives = 876/1209 (72.46%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. TrEMBL
Match: A0A0L9VJ39_PHAAN (Uncharacterized protein OS=Phaseolus angularis GN=LR48_Vigan10g095300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1178.3 bits (3047), Expect = 0.0e+00 Identity = 677/1165 (58.11%), Postives = 820/1165 (70.39%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. TAIR10
Match: AT5G27970.2 (AT5G27970.2 ARM repeat superfamily protein) HSP 1 Score: 1060.1 bits (2740), Expect = 1.0e-309 Identity = 565/922 (61.28%), Postives = 679/922 (73.64%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. TAIR10
Match: AT3G43300.1 (AT3G43300.1 HOPM interactor 7) HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 1.1e-13 Identity = 61/274 (22.26%), Postives = 112/274 (40.88%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. TAIR10
Match: AT3G60860.1 (AT3G60860.1 SEC7-like guanine nucleotide exchange family protein) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 4.6e-12 Identity = 69/312 (22.12%), Postives = 132/312 (42.31%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. TAIR10
Match: AT1G01960.1 (AT1G01960.1 SEC7-like guanine nucleotide exchange family protein) HSP 1 Score: 68.9 bits (167), Expect = 2.3e-11 Identity = 67/300 (22.33%), Postives = 125/300 (41.67%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. NCBI nr
Match: gi|659099747|ref|XP_008450757.1| (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: protein MON2 homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1627.5 bits (4213), Expect = 0.0e+00 Identity = 836/926 (90.28%), Postives = 862/926 (93.09%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. NCBI nr
Match: gi|778662699|ref|XP_011659941.1| (PREDICTED: protein MON2 homolog isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1623.2 bits (4202), Expect = 0.0e+00 Identity = 835/926 (90.17%), Postives = 858/926 (92.66%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. NCBI nr
Match: gi|700211064|gb|KGN66160.1| (hypothetical protein Csa_1G574770 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1622.1 bits (4199), Expect = 0.0e+00 Identity = 834/926 (90.06%), Postives = 858/926 (92.66%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. NCBI nr
Match: gi|778662702|ref|XP_011659942.1| (PREDICTED: protein MON2 homolog isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1622.1 bits (4199), Expect = 0.0e+00 Identity = 834/926 (90.06%), Postives = 858/926 (92.66%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G002030 vs. NCBI nr
Match: gi|595835923|ref|XP_007207156.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa000159mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 1518.8 bits (3931), Expect = 0.0e+00 Identity = 819/1212 (67.57%), Postives = 942/1212 (77.72%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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