Cucsa.031930 (gene) Cucumber (Gy14) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGTGCCTTGTATGTTGGTACCTTACACTTCTCGAGTGTGAATAGCTTAGTTTATCTAGACCTCATGGGAAGCTTTATGGCCTCATAAACCAGAAGTTGCACAGTACTATCATATATCTAACTCTTTTATTGTTTAAAAATGCCACTCCAGGTTTATAGATCACTGGCAGAAGTTGTTGGATCTTACTTTAGGTCAATTTCTGCTTTTCACACAGATGCCAGACCCTTGCTGTAAGAACTCTTCTTTCTTTtCTCTTCTTTtCTTTTTTtACCAATTTGCAGGGTTCAATTCTTATTGATTATCTATTTTGTCATTGCATACAACCTATAAGTTTATAATCACTTTCTCAAGAGTTAAGGGTCAACTAGATCTTGTTAAATCATCAATGAACTAAAAATCAAATTGATGGATTATGGTAAATTTAATTAGTTATATTAATTATCTAACATTCTCCCTCACTTGTGGGCTTGGAAATTTGTAGAAGGCCCAACAAGTGAACATCACTATTAATTGGGAAGAAGATGATATTGTAGGGTTTCAAATACAAGATGTCCTTCTTCGATTACTGTGTTAAATCACCAATTATCTCATGAATCATGGTAAATTTAATCATATCAACTACTATACTGTTCTGTGCTCTCTCCTCTCTCCTTTCTTTACCCCTCCACCTTCCTTCGTCTAGCCTCCCCATCCGGTCAACCTCCATTGACATCCAATTTTGTTTCGTGTTGAATTCCATCTATTAGTTTTCCGGCAAGAAAACCTTCGTTTTCAGTATTCTGGTGAGTGTGTTTTCAGATTCTTTCCTTTTTGGACGCTTCAATCATAGTGGAAGTGGAATGTTGTATTATTGATAACTTGTTTTTCCGCATTTTCATACGAGGATGATCATTTCATGTGAAAGATGTAGAAGCCAACTTATACTGTCATTATCATTACCCCCAGCTTATATGGTTTCACGAAGGCATTTCAGTTCTGAGCCAAAAACCAAAAGATAGATTCTTTTTCAAAAATGAAAAAGTTGAAAATGGAATGGTTGAAGTTTCTAAGTTCAGAGCTAAGTTTGGTTGGGTAATGAGATGCATTGTTTGTCCCTGTACAGGTGGGAGGTTCTTCATTCATATTCCCTTAGGTCAAGATAAACAGGGTTGGGTTTCGCTGAGCAAAATGTTAAGAGGCTTCAAGTTAAAACATGAATACATGACTTGGTACTCATCCCATTCAAGGTGATCAATCAGGAGTAAGAAGATTGAGGAGCAATCTTTTAAGGTGTTGAAAGATAATTATGCAGAGAAGGTGAAGCCAATGAGTTACATTCATTCCTTTGTTCTAGAACCTGAAAAaCAAAGCATGGACTGTCATTGGATTCACAAGAATCCAGAAGTTTGTAAAGTTGATTTCAACAATCTTTGGACCGTTACGGGACTGTTTGAGTTTGATGAATGGACATAAATAGCAAGCACTTTAAAATTATTCTTTGATTCTGATATCATTTTCAATCCTTTGTCTGCGGAAAGTGCTTTACTTGATTTGGATCAAGGTGAGGTGGAAGATTTTGTTGAATACATGGGGAAATCGCAAGTTTGTTGCCATTTTCATTTAAAACTTGAAAAGTGGAACATGCAGTTACATGGTCGTTCAAAAGTAGTGAAGGGCTTTGGCAGGTGGATTTGAATTAAAAACTTACCCTTAGACTAGTGGAGTCGGCAAACCTTTGAAGCTCTTGTGTCTTATGTCGGTGGTCTAGTATCTATTGCAAATGAAACATTGAATGTTGTTAATGTTGTTGAAGCAAAAATTCAAGTTCAAAAACATGTATGTTGTTTTATACCATCTACTATAGACATCTCAGATGAAAAAAAaGGTAACATTTTTCTGAATTTTGGATATATTGAATGTTTGGAACCTACGATCAAAGTTCAAGGTGCTTTATTTATAAAAGATATCCAACTCAATTGACTTGACCCGTTTAAAGCATGTTTTGTTGGACGAAGCGTTTGATTCTTCCGGTTCCGTTACAAATCAAAACCAAAACAAGGATGAACTAAAGAGCAGAACAACTCAAAATTTAATAGAAACAACAAACCCTAAGCACAAAAGGTAATTTCAAATAACTTCACACCCTGAGTCGATTTTGATGATAACAAATGCACAAACCAGCCAGAAAaCAAAAATCGAGACGACCCAACCAATGGAAACCAAAACGGAGCTTCACGCGTGGAAACAGAACACTCTCTTCTGACGGTGCGTGATGTGTCCGACAAACTTCGGTGGATGGTAGTGGCACTCCTCCTAAGATGGGCAACGTCAACAAACAACCACTCGGAGTTGACCTAAACTTAAACCCTAATGGAGAGCAAAGCCATCAAGCAAATATTTCCAAACCTTAGATTCTCTGATACCATGGACTATGTACTTTTGGAAAATATAATGATCTTATTCTTTAATCAGACTGAAGATACATACATATAGACAACTACAATATAAACAAATATTATAACAACCACCACCATTATCTGTCGAACAAAGAGGACAAACTAAAGGCAAGAGAAAGTTACTTGGAAGCTTTCTTTGCACAGTCTTTGAGCTATTGAGTGCCTAAAAAATCATAACCCAAACAATGAACTCTTTGTGGACATCCCCTTTTTTATGTTTTATTCGGGATATGATGCTTGGCGCTAAAGGGGTTTCAACCTAGCTGAGACGTCCTTGTGCGTCTCATGGTCCATCTAGGACTCCCTTGATTCATCTTCTTTATTGCTTTCATTGTTAACTCTCTTGTATTTTGAGTTCTTATTAATAAAGAAGTTGTCTCTAATTCAAACTAGAAAAAAACTCTTCTTGGACAACATGATTTCCACAAAGCATTATACTACTTATTACTATTACTATTATTTTCGAAAAGGGgACGGGCAGCTTGATACAGCTTATTAACCGTTGGAGGAGATGCAACCAAATCCTTCAAAAGAGAGTTAACTGAAAATGAACCTGACGCCTCCAATTTTCAGCTTCTAGAATCCCTTCTATTGACCACTCTTTAGTCGTTATGAGAGTTAGTAACAGAGGTAGACAGGGAGTTGTTTTTTAGCTGTTGGGGAGTTAATGCAATTCTTTGGTCACTTGGTGCCTGTGAATAGTAGCTCTCTAAGTTGTAAAATAATATTCAATTGATAAAAGATTATCATTACACCCCTACTCATATGCTCTAATATCATTCATCACACTGAGCTCCTTAAGTCCCTCGATTCATGGTGTTTTTGTGTTATTATATTATTATTATTTGGAAACTATGTTTTTATGTTTATAACCAATCGTCATTTATATGCTAATGATATTCTCAATAAACACCTATTGGTACTTTTTCATATTCCATGACTGCTTCCTTGTTGACCTATGACTTCATGGCTTGGATCATATCGAACCATTCATCTATAGAAATATGATCACGTTGGGCTGAAGTTTATTGTTTGCACGATTGTAGTATATAATCTATCATCTATTGATGCAATGCTCGTTCCAACTGTATTCATCTTCTTTATTATCAATAAGAAGTAAATTTATTTATTTTTGAATTCTAGTTTTTCCCTTTTATATTGATCTTCTGTTTTCAGATTATTTCTTGCTACTGGGATCACAGAATCTGTCTGTTCACATGCTTGTGCCTTTGCCCTCCGTAAAATTTGTGAAGATGCAACTGCTGTAATCTTTGAACTGCCAAATTTGGAAATTTTGATTTGGATTGGAGAGGTAATATTCCTTGATTATTGTTACAAGTCAGCTAAATTTGAACGAAAATGAATATTGTGCAATCCTTAGTGACTGATGTTATAGATGAAACTAAGAGTTAAATTCAGCACACAATATTGTTTGATGTTATAATAAACATTTCTCATTAAATGTAATATGTGATGTTTTGAAACTTTATTGCCATTGAGACAATATGAAAACAATATAGATTTATGTTATTGCTAGTCCTGTTTGTATAATGATCTCTTGGACTAAGTGTAACTAGCCTTCGGTTTCCTAGAGTCTGGAGAAGTTACATTTACCTTTGGAGGACGAGGAAGAAGTAGTGAGTGCTGTAAGTTTGATTCTTGGTTCAGTTCCTAATAAAGAACTGAAGAGCAACTTGTTGGCTAGATTGCTTTCGTCAAGCTATGAAGCAATTGAGAAACTAGTAAGTTTCCACTTATAACTATTTTGATATTAATGTTTTCTCATTTCTTGGTATATTGTAGGTCTGTTTGGAGATTTCTTTCTGACAAATGAATTTTTCAAATAACAATAGACATCTTGCAAGTGTCACTTGGCCTCAGTCTTAACCAATATCCACCCCATTTCTCAAGATTTAACCTGATAAGGTCCTGTTTCAATAAAGATAAAAGGAGAGGGATGGGATTAAAAAGGAGGTAGCAGATTAGGTGAGGTTTTCTACTTATCAAAATCGACAGCAAGTCACTGAGAAGTTTTCCAATGAATTTGAATAACCAAAGAGGAATATATTTACAACCTTCCCTGCAACACACGTAGTTTTTCTTTACTTTGTATTGTACTCTTTTCTTTTTCTTTTTTtGAATGGAAACAAGATTGGTCATTGAATAAATGAAAGGAGGTTACTGCTCAAAATACAAGGAGACAATACAAAACAAGAACTTCCCAAGTACAGTTAGAGCAGTACATAAACAAGATTACAAAATTCTGCAAATAGAGTTGAAAAAGTGTTCCAAAATTAAGAAGCTTTAATTTTGGCAGCTTTAAAGTGGTGAAGCTAGGGATGATGCTTGAAAATTTGTTTGATCCCGAGAGAAATAACACTACTAAGAGGAATTACCTTAAGCTTCTTAACTCTGTTTAAGGCCGATGCTTGAACATTCACTCAATTGTGTGGAAGCCGAAAGGGAAAAGAATTTGATGCTTCAAGCTAGAGATTTTGCAACTTGATCGGAGGCAAGATGGTGAAGAAATTGATACTCATAAAGTCAAACTCATTGTTC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MPLQVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVCSHACAFALRKICEDATAVIFELPNLEILIWIGESLEKLHLPLEDEEEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNALSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEPTLDDPMFSLLIVFWPMLEKLLRCEHMENGNLSAAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHQEKFGHLFITTFERFTYAASVSAINSSYICDQEPDLVEAYTNFASIFLRCSHKEILAAAGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVSNILYALLGVSAMSRVHKCATILQQLAAICSVSERTDLKPILRWESLHGWLLSAALPLEYLKPGEVESLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDEVKANYGHMQGKGGRVLKRLVREFADGHRNVT*
BLAST of Cucsa.031930 vs. TrEMBL
Match: A0A067F7S2_CITSI (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g0017891mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 764.6 bits (1973), Expect = 7.6e-218 Identity = 388/506 (76.68%), Postives = 438/506 (86.56%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. TrEMBL
Match: V4TI48_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10014134mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 761.5 bits (1965), Expect = 6.4e-217 Identity = 386/506 (76.28%), Postives = 436/506 (86.17%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. TrEMBL
Match: D7SVD3_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_14s0068g00630 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 749.2 bits (1933), Expect = 3.3e-213 Identity = 384/506 (75.89%), Postives = 434/506 (85.77%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. TrEMBL
Match: W9QX28_9ROSA (Uncharacterized protein OS=Morus notabilis GN=L484_007573 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 740.0 bits (1909), Expect = 2.0e-210 Identity = 372/506 (73.52%), Postives = 434/506 (85.77%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. TrEMBL
Match: A0A067L3U1_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_26921 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 733.0 bits (1891), Expect = 2.4e-208 Identity = 373/506 (73.72%), Postives = 432/506 (85.38%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. TAIR10
Match: AT1G12930.1 (AT1G12930.1 ARM repeat superfamily protein) HSP 1 Score: 674.1 bits (1738), Expect = 6.8e-194 Identity = 344/507 (67.85%), Postives = 414/507 (81.66%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. NCBI nr
Match: gi|778680555|ref|XP_011651344.1| (PREDICTED: transportin-3 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 988.4 bits (2554), Expect = 4.6e-285 Identity = 504/507 (99.41%), Postives = 505/507 (99.61%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. NCBI nr
Match: gi|778680546|ref|XP_011651341.1| (PREDICTED: transportin-3 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 988.4 bits (2554), Expect = 4.6e-285 Identity = 504/507 (99.41%), Postives = 505/507 (99.61%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. NCBI nr
Match: gi|659098064|ref|XP_008449960.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491690 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 970.7 bits (2508), Expect = 1.0e-279 Identity = 496/506 (98.02%), Postives = 501/506 (99.01%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. NCBI nr
Match: gi|659098062|ref|XP_008449959.1| (PREDICTED: transportin-3 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 970.7 bits (2508), Expect = 1.0e-279 Identity = 496/506 (98.02%), Postives = 501/506 (99.01%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.031930 vs. NCBI nr
Match: gi|568829300|ref|XP_006468961.1| (PREDICTED: importin-13 isoform X3 [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 765.8 bits (1976), Expect = 4.9e-218 Identity = 388/506 (76.68%), Postives = 438/506 (86.56%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (Gy14)
Date Performed: 2017-01-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |