CsaV3_7G028790 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAGATTTTGTGCAGGCTCACTCAGCTAAAGGAAGGCTTCAGCATTTTGATGCTAATACCTGTAAATATAGTTCGTGATGATCGATTGAGCATCTCCACGACACCCTTATAATACAGGTATGTCTCTTTTTAAATCATAAAGAATATTGCTCAAATCAGTTCTTGGAAGTTTTTTTAGTAGTAAAATGTGGGTTTATTGATTATTGACGGATCTAGTGCTGTTGTGTTTTTTTTCTCTTTACTACTTACTATTTCTGAGAATTAAGTACTACAGAATGTTGTTGAAAAGCTTTTTGAAAGTTTGCATTTGTTTTCCTGAGAATGGAAATATTTCTTCAATGAGTTAGTAGAGGTATGCTTGGCTGATTTTAGAGAAGGAAAACTTAACCAAAATGGTACGTTAGAACGTAATTTTGGACAAAATCGATCCTGAAAGCATGCAGTGAAGTTTTAGACAATTAAATCATTAATTGGTCCAATGAAATGTATTAGAGGAAGAAATACGTCAAATAATTTTCCATCACTAAAAGAGATAATTTATGAGTATAATGATCTTTTTAGTATCGTAGGCACACTATCTTTTGGTTGCAGCACATCCAGTGTGTCACTTGGACTATCCTAACGTTTTTTTTACGGGGTAGGAGATTGAACCTCTAGCCTCAAAACTGATTATACATACTAATGTCGGTTGAGTCGTACACTTTTTAGCATAAATATAATCTTTTGGAGACGTTTGGGGGTGCTAAGTTATTGTTATAATCGGTGATCGTTATAGTCTGAGTTATAATAGTTTGTATGTTATAATAATTCATGTTTGAGTTGCATACTATTATACCTTAAACTATAATAACATGTACTTGTTGTACAAGTAGCCTAAGTAGAAAATAGTATGCACGATAACAAAAACAAATAGATCTGAAATAGTAATAATACAAATAAGTATTGTAAGTTATATTAGTTGTTAGAAACATTGATCATTATAATTAAAAGTTTCAAACATGAAATGAACTATAACAATACACTCCACCAACTTCAAGTTGACGACCCACAATGGTTCCTTCTTACAATTTAGTTCGAAACATAATTTGATAACTAATTTGAGAAAGTATACATTCTTCTTTAGTTACGTGTGAGTAATGACTATAAATCTCTTCATAAATGGAGAGTGGATCCATCTTTATCCTGCAAATGTACATTTTTGCTCATAATTTTTGATTGAATGTTAGACTATATGTCAATTTTTTTTACTAATTCTCACAATATTCTAAGAACTCACAAATTAATTCACTAGAAAACAGTACACAAAACTAAGTAATACATGAATAGCTTGATCAAAAATCACAAAATTTGACTCATTTTTGTTCTTCAAACAAAAACCTATTAAGAGGTAGAAGTTTGCAAAATTTTCAAGTTTAAGATAAAAGATCGCGATATTTGTCTAATTTTCAATATTTAAATTGAAAGTTGCTTAAAAATTCGATTTACTCATTTGCAAGTTTATAAGTTTATGAGAAAAATTAATTTTTATTCTTGATATTTTGTTTGGGTTAGAAGATAAAAATTTGGTCCAATTTTCTAATTAGTTATTTGGTTTAGAGATGAAATCAATTTGAATTTTATGATTTTAACATGTATATATTTTAGAAATTCAAATAATAGTTCTCATAGTTTCTAGCGCATTTATATATAATTGAATTATGTTCATTGAATTAATAGTTCTCATAGTTTCTAGCGCATTTATTAATTGAATTATGTTCATTGAATTGGGTTGATTGTGTTGGTATTAAATTTATAACGGAAAGAAACAATGAATATCTTCAAAGGAATAATGACCATCAAACTAAAACTTTCATAATTATTATATAATTGTAGGATAATTAAAGTGAAGCTTTTCAAAATTTAATAATAACATAACAATAATAAATATTATTATTATTATAATTGTAATATTGGCTAAAATATTCTAGATTGGATGGTTTATTTATTTTTACATATAAAAGGTTTTCTTTCTTTGAAAATCACATGTTTTTTTAAAAAGGGAGTTGAATTTCCAATGGGCATAAGAACCTTAAATGTTTACCCTTCAATCTCTTCCAATTCCATTTGTCGTATAAAGTACCTCAGAGAATAATAATTGAGTTCATACTCTAATTTACGTGGTTATTAACATGTATTCAATTTTATGTAAGAATTTTAAATGTAATATACATAATTCAATTTAAGAAAGATTTATACATATGTATATAGTTAAAATAAACTAATACTAAAAGGAGCTAAATAGAGGGATTTTTTTTTTTTTTGGTCAACCATATCTAGTAATGAATATTCTAGAGATTATGTGCCACAAACTAAATGAAATGTGGATGAGTTAATCTTGAAAAGGAGAAAAAGTATAATACTTTATTTCTACTTTTGTAAAACTAAAAAAATAAATATGCTTTTCCATTCAAAATTTGAATGCAACATTTTTAGCACATTTTAGTTTTAGGGAATGTGAAAAAGAAAGAGAGAAAGAAATAGGAATATCATCAAACATTATCTCAAGAGTAAGAGAAGTAACTTTTTTTTAATATGTATGTGGTGAGACTATTAATCATGTGACTTAAAAAAAAAAAAGTAAAAGTTTATATGTTAATTGGACTTCCTTAATAAATATTTTTCTTTGTAAGATGAGTGTTGAAAAAGAAAAAAAAAAAAGTAAAATATGAGCATTTACATAAATCAATACGAAAAGAAACTAATAAATAAATATATATCAATTGAACAAAGAAGAAAAAATGTTTTTCAAAAAATTTATTTTTGTGAAAATGGATAGTTTAAAATATACTTAGAAAAACTATTTTTAGTAGCTTCTAAACTCGCAATTTTTTTTCAAAATGTAATCTAAACACCTCGTAGACTTGAAACTATGCTTAAGTTTGAGTTTTGTGATTATTTTGTGATTTATGGTTTGATTGTTAAAGAAGACATATTAATACAAATATCAATATTAGTATGTACGTACAATGCTTACTATATATAAGTTTAACGGTTATAATAAAGAATATACTTTTCAGTAAAAAAAACTAAAAATTTTTTAAGAAAAAAATAAAAATGAATGAAAGAAAACAAGAAAATTGTTGTAAATTTACTATTAATTTGCTGTCTTTCAATTTCATACAATAATTTGCATTATTTTCTATTTACTATAGTTGAATTTTAGTCCAATTGTGAAAATAAGTTTTTAAGAACTATTTTGTTTAGTTCTTAAAAATATTTATAAAAAGTTTGTCATGCAAACCAAGAGATTTTAGGGGTTAGAATGAATGTTTTGAGACTTAATTTTTAAAAATTTAAAACTAAATTGTTACGACGAAAAGTCTAAAATGATTTAAATACTTCGTTTAGGTTTGCTTTATTTTCATGTATTTTAAATTTTTGTCTATTTTAGAGCTAGTTTTGTAACTATTTTAATTTTTAAATTTAAGTTCGTTGATATTATTTTTAACCTTCCAACTTTCTTCCTCTATTGTATACATCTTACCATTAATTTAGAAAACCAAATCAAGATTTAAAAACTAAAAAACGAATATGCGAATGAAAGGTAAATAAACTTAATTTTCAAAAACAAAAACTTATATCTAGATGGTTATGAGACGGAGTCTTAATGATTATACTTTTAAATACACATTTTTCTTTATTTACCAAACAAATGAACCTCTTGATTATTTTAGTATTTTTAAAACTTCAACATAAATTATTTACATTATTTTTAAAATAATAATAATATATAGATTTGTCATCACATTTTAGTAATTTTTGTGATTTGAAGTCAAAATTTTAACCTTACAAAATGGAACAGAAATGAATTGCACGTTCTTAATTGTCAATTTTCAAATGCATTATTTAGACCAAATTCAAAGTTAAAAGTAATAATTAATATTCTAATTTTTTCTCTTAATTTTTAAAGAAACCAAACCTCAACCTCTCGAATAAAAAATAGATTAATTATATATCATAATGAAAATAGAAATAACCGAATTTCCAACCTCTCAAGTTAGATTAATTATATATCATGATGAAATTATAAAAACCGAACTTTCAACCTGTCGAACGAAAAGATAGGTTAATTATAGGTTAGTTAATACTTTTAATGTTTAAATTAAGTCTTAGTTAATGTTATGTTAATGGGTTGATACAAATCTGCCACTAACAATTGTTTTTTCCCCTAATTCTCTTCTTCCTCATTATTTCATTTCTTTCCTTTTCCCTTCTTCTCCCACTTCCTAACTTAATTTAAATGAATCAATTCTTTAAATATTCTCTAACTATTTATTCTAATAATTCATTCACTGAATGAAAAAAAAAATCTTTAATTCAACTTAATTATAAGTTTTACATAATATTTAACCAACAAATAAAATATAAATATATATAATATATTTACGAAAACTCATGATTTAAATATGGATGAAACTTGTAAAGTATAAAATATAAAATTAAAATTAGGATACTATTTTCTATAATAAAATAAAGCCATCATTCAATAATTTCACACTTACCTATTATAGGGATATTTTATTAATAATATAAGAATGTTTCAAACCCTACTCAGCGGCCGACGTCTATGGTCAAATGTGGCCAAATTGAAATCCATTAATCTTTCCTAACACCATTCATTCTTATACTATAAATAATAATCTCATACATTATGTATGTTTCTATCTTCCATATTCACTTGTAAACAACATTTGAAATCCAAAAGAAATGCCTCCATTTATCAAATCTTTAATTTCTGTAGCTCTTTTGGCTCTTCTTTTGCTCTCTCGATTTCCATCCACTTCTGCTGTCAATCACAACATGGCTCCTAATTCGCCTATTGGGATGTTTCAAATGACCGAGTATCAACAAGTTGTAGAGAACAAGAATGGATATCGATACTCTTTTGAACAAAAAATCGTCAAAAAACGAGCTCGACGATCCAAGAAGGAAGCTGAAGGTCCAAGTCCCTCAATGGCAAATCGAAGCCGAATGACGTGGTTTGACATCCAGTCTTTATTGTGTATGTGTATTGTTTTTGGCTTGTTGATGTGA ATGGCTCCTAATTCGCCTATTGGGATGTTTCAAATGACCGAGTATCAACAAGTTGTAGAGAACAAGAATGGATATCGATACTCTTTTGAACAAAAAATCGTCAAAAAACGAGCTCGACGATCCAAGAAGGAAGCTGAAGGTCCAAGTCCCTCAATGGCAAATCGAAGCCGAATGACGTGGTTTGACATCCAGTCTTTATTGTGTATGTGTATTGTTTTTGGCTTGTTGATGTGA ATGGCTCCTAATTCGCCTATTGGGATGTTTCAAATGACCGAGTATCAACAAGTTGTAGAGAACAAGAATGGATATCGATACTCTTTTGAACAAAAAATCGTCAAAAAACGAGCTCGACGATCCAAGAAGGAAGCTGAAGGTCCAAGTCCCTCAATGGCAAATCGAAGCCGAATGACGTGGTTTGACATCCAGTCTTTATTGTGTATGTGTATTGTTTTTGGCTTGTTGATGTGA MAPNSPIGMFQMTEYQQVVENKNGYRYSFEQKIVKKRARRSKKEAEGPSPSMANRSRMTWFDIQSLLCMCIVFGLLM
BLAST of CsaV3_7G028790 vs. NCBI nr
Match: KGN44887.1 (hypothetical protein Csa_7G394070 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 119.4 bits (298), Expect = 5.5e-24 Identity = 61/63 (96.83%), Postives = 61/63 (96.83%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G028790 vs. NCBI nr
Match: XP_022992473.1 (uncharacterized protein LOC111488793 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 1.7e-09 Identity = 43/82 (52.44%), Postives = 55/82 (67.07%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G028790 vs. NCBI nr
Match: XP_022954099.1 (uncharacterized protein LOC111456466 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 2.2e-09 Identity = 39/67 (58.21%), Postives = 49/67 (73.13%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G028790 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0K934|A0A0A0K934_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G394070 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 119.4 bits (298), Expect = 3.6e-24 Identity = 61/63 (96.83%), Postives = 61/63 (96.83%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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