CsaV3_5G026060 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACCATTGCAGAAAGTGAAGAGGTGCTTAATATTCTTCTTTGATGTTCTCTGGATATTGAAGATCTTGCAACTTTCTTCTTAATGGTTATAATTAGTCAGTAAATGTTTTATTGGCACTATGCAGGTTGGTTTTAAGCGCATTGGGCTGTCAGCTAGTGATTATGAGGCAAATATTCCTATCAAGAAAAGGAGATTTCCGGGAGTGCAATTAACTCCATCACCATCTAAAGATATATCTTCATTCCATTCAGATGGAAATTTATTGAAGGTGGAGCAGCCATCTCCACCTAAAGATGTATCTTCCTTTAATCACAATGAAAATTTAATAAAGAGTGAGGAGCCGATTCTATCTGTGACAACAGTTTCAAGTTCTAGTGTGGTTACAAGTTGTGCATTGTCGAACAATAACCAGGACAGTGTTTCTGAAGAGAAGAAAGGAAAATCTGATACGGATTCATGCTGCGTGGATATAGTCCAAAGCAATATTGGAGCAGCAGGAGTCAAGTTTCAAGAACCCAGTTTGGGAAGACATGCTTGTACTGATGGTTTTGTTGAATGTGAAGGTAAGTCATTGGTAACTGTAGAACATACCGATCATGCATCACCAGTGATCTGTGCGGGGTTGAAGTTGTTGTCAACTAGCCTTGACTCTGATCATTTTGCTGGTAACAAAGAGGAAGAAATTGATGTAAAAATGCCTGAAGAAAATTGCAGCCCTCCAATTTGTCAACTTGGAGGAGCTGGAGTATTGGTAGGTTTGAAGGGACATATGGATCTGAAACTAGTTTCTGAAAAGAGTGATTTGAATTTCCTGAAGCAGAATTCTATGGAACCTGTGTTACTAAACTTCGCTTTAAACAAGCAGGGAAGTAGCACCCAATGTGTCAAAGGTAACGTAGGGTTTGATTGTGATGGTTCTTTTTTGCAGTCGAACAGGGAAAAATGGGATCTAAATACTTCAATGGAATCATGGGAGGGTTGTACTAGTGGTGATGCTCCTGTAGTGCAGATATCGGCCACTCGGACAAATACAACTATTGAAACTTATTCTTGCTCATCTGAAATGGTTGAAAGTGACAGTCCATGTGGAAAACAAACCCTTTTAGATAATGAAGATAAAGGTGACTCTACAAAAGAGCATCTTCATTTAAGTCTTGATTCATCTTATCTGAAGTCTGTGCTTGATGAAGACCCTTACATTTCTGAATATGAATCAGATGGCAACTGGGATATAGCTGAGACTGTTGATGATAATGATGATAATGATGATAATGATAATGATGATAATGATAATAATGTAGAAGAAGACTATGAAGATGGGGAGGTCCGGGAAACAATGCAGGAAACTGAAGTAGAGGTCCATGTATATGAGAAAAGAGAAATTGAGCCTTTGGATCATGCTGGTTGTAACGACAAAAAGATCAATTCTGTTGGATTGCTGGATCATGAATTTTTTACTTTAGGCCCTAAGAAACAGGAAACAAAATTAGAAAATCTGGATTATAGAAGTGAAGATGAAGATGAAGTTCAGACCACAACTAAAAGTAATTCTTATGAGCAAGAAAATGAAGATCTTTGTGTGAAAGAATTGCATGCTGTAGAGAATGCTATTGGTGAGGATGTAAACATATCTGCGAAGGCCACAGAAAGAAGCCAATTATCTCAATATGATAAAAAGGGCAACTTTGAGGGACAGGGCACTGCTGACAAAATCCTAAATGAGGAACCGGTTCCTACATTTTCTCAGAATGAGGTGGAGAATGCTGTAGCAGTAGATGTAGTGCAGAATAGGGATCTAACTTTGCCTACTGTAAAGGAATCTGTAAACGAAGATAATGCAAAGGATATCAATGGAGGCACTAGAAATAGTCGGATAATTAATTTTAATCGAACATCTACTGATTCAACTCCTTGTAAGGCAAAATCTAATTTTGCTAAGCCGGTTTTATCACATAAGGATAGAGAGTTTGTACCCAACATGGTAGTTGAACGAGCAAATATGAAACCTCAAGAAAGGTGATTATCAGTTACTTGATTTCTTCTATTCATTTTTCTTTCTAAACTTGTTTTAACTGCTCTTATGTCTATGTTTATCTTGTCTTTTTCTCTTTTTGCTAGAGATGACGTGTACAGTAATATTTCCAAGAAAATTTCTATAGACAAACGCCAGGGTCCACCACCGTTGATGGGTTTTAGTCATAGACGAGGGAGAAATACTAATAGGTTGGACAACCGATCCGAGGAATGGGATTTTGGTCCCAACTTTTCTCCTGAAACATACAGTGAACAACAGATAGATTACCATGTTACTGGTCTTGATCAAAACCGATATAAGATTATACCTGATGGTCCATTTGGTGGCGCTAACCGTCGTGGTCGAGAATTGGTAGAGGATGAGGAACCTTTTTTTTTCCATGGGCCCTCAAGGAGGAAGTCACCTGGAAGAAGACATGGGCACAGTGTACGAGGTGGAAAAATGGTAAACAGAATGCCTAGAGATTTTAGTCCAGGTAGATGCATGGATGAAGGTGGCTCTTTTGATAGACAACATGGTGAAAAGTTCACTAGGAATTTTGCTGATGACACAGTGGATGAGATGTATCCACGACCTCAACCTCCATATGATGTAGACAGACCTTTTTTTCGAGAAAGAAGGAACTTCTCATTCCAAAGAAAAACTTTTCCCAAAATTGATTCTAAATCTCCAGTAAGATCCCGAGCTCGTTCTCCCAGCCAATGGTTCTCTTCAAAAAGATCTGATAGGTTTTGTGAACGTCCCAACATGACACATCGAAGATCTCCAAATTATATGACAGACAGGATGAGATCTCCTGATCAGCGTTCTATACGTGGATATATGCCAGGCCAAAGACAAGGATTCCGTTACCTTTCACCACCTGATGAATTGAGAGATGTGGGTCCTGCACCTGACCATGGCCATATGAGGCCTTTTATCCCTAACAGGAATCAAACTAAAAGATTACCACTTAGAAACAGAAGCTACGATGCTATAGATCCTCGAGGAAGGATCGAGAATGATGGACTTTTTTATGGTCCTGTACGTTTGGGTCAATTGACTGGGTACAATGGTGGCGAACCAGATGACGATGAAAGAAGATTTAATGAGAGACATGAACCTCTTCATTCTTTTAAGCATGGATTTCGTGATTCTGATGGTGAGAGATACCGAAACAAGGGGGAGGATTGTTCTAGGCCATTTAGGTTTTGTGCAGAGGATGACCCAAGAATTTCATGGAAGAGAAGGTAGTCAGGGAGAAAGACTGAGTTAAGGATCTCTACCAAGGGAGTGGAGAATGCTTTAGACTAGGCCATTCTGTTAGTTTAATTTTGAGGTTTTGTAGGTGATATTTTATGGTGCAAAGGGGGCCACTTTTTGTTCTCCTTTGTTTTATTTCATAATTGCAACTGTAAAAAAATTCCATTTCTATGCAGAAAGTATACCTCTCAAGTGCTATTGTGACTTCAAACTGACTAAACCACTATGGAAATTTTGTTCTCTAAAACGTTAGAATCTTACTTATTATTCTGATAGAGAAATTCAGTTGAGAAGGGAAGTAGATCAAGTGGGGTTGTTTCCCTTTCTAATCTCCACAAATGGTTTGCAATTCTTTTAACAAGTGTTATTAATTTGTTCTTTTAATACCAATGTATTCACTGATTTACTATTGAATTTGATAGCCATTTCTAGATCGTTGAAGCGCAAGGGGAGGATATCTCTAAGGTATTCTTTTCTTGGACCAAGTTACATTCTACTCTTCTATGCCTTCTGTTACTGTTCTACTTCAGTACTGAAGTTGGACCTTGGTCAGTTGGTCCTCGAAATCGTTGCCCGCTAACCCAGTTCTGAATCGGCAGTAGGAGATTTTGGATCTGCTCTTGTCACGAAGGTTAGAGGCTTTGGCTTCTGAGGCTTTGAATTGGAAGGAAATGTGAGAGAGTTGGGGAATTGCAGTGAGGAGATGGAATGGCCCCCATGGAAGGTGACACATGAGCTTGAGGATAAACTCACCCCTCTGTGCTTGCTATCACCGTTTGGACCTTATATTGCTGCTTTTTCTTTTTGTATTTTTTTTACATTCTTTAAGTTAATGGGTTTCTTTCTTTCTCTTTTTTTTATTTGAATAAAATAAATTAATGATTTCTATTTGTTTTGTTATATTTTTGTATATATATGTGCGTATATTACATAGGTCCTTATAATTTTGAAAATTGATTGTTTTTGTTTAACCTTTTTTAATCTCATTTTTTAATACCATTGCAGGCCATGTTTACCAATCCATAATGGATGTATATATATCGATAAAATCAACAACTTTCACTGGGAAAAAAATGAAAGAATACAGGGTATACGAAAACACAAGCCCACCCAAGCGACCTCCTAAAGAAAGGGTTCCATCTAAGCAAAATATTATCTAGTGAGTAGTTATACAAAGGTTTTGAGTTCAAGCCCAAAGTGAAACCCGAAGCCTCACTAATAACCAAACCTACTAGGGTGGTTATCCAAACCTCTAAAAATCCTATTGCTTCTCTCCCCCCAAATGTCCCACAACACAGCACATCTCGGAAAACACAACAAACAGCCTCTCTCTGGAAAGCAAATGGAGGACGAACTCCCTGATCATTGCCCGAATACCCCTCTGGTGATAATTAGAACGCCAAACTTTTGCATGAAACAAATCCACACAGACATTGCACATTGACATCCCCAAAGAAGGTGATCTAGGTTTTCCTCTACCTCCTGACAGAGAATACAACAGAAAGGACCTATTAATGGGGCCATTTTCCAGTAAGCCTATCAAAAATGTTCATATGACCAAGTAGAACCAGCCAGGTGATGAACCCAACTTTCTTTGGGTATCTTAATCCTCCTGACTGCATCAAAGACTGAGTCACAAACAGGAAAGGGAACCAACAGCAACATAAAGAAAGAATATTAGTGTCATCGGTAATTGGAGTTCATTGATAGATCA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MTIAESEEVGFKRIGLSASDYEANIPIKKRRFPGVQLTPSPSKDISSFHSDGNLLKVEQPSPPKDVSSFNHNENLIKSEEPILSVTTVSSSSVVTSCALSNNNQDSVSEEKKGKSDTDSCCVDIVQSNIGAAGVKFQEPSLGRHACTDGFVECEGKSLVTVEHTDHASPVICAGLKLLSTSLDSDHFAGNKEEEIDVKMPEENCSPPICQLGGAGVLVGLKGHMDLKLVSEKSDLNFLKQNSMEPVLLNFALNKQGSSTQCVKGNVGFDCDGSFLQSNREKWDLNTSMESWEGCTSGDAPVVQISATRTNTTIETYSCSSEMVESDSPCGKQTLLDNEDKGDSTKEHLHLSLDSSYLKSVLDEDPYISEYESDGNWDIAETVDDNDDNDDNDNDDNDNNVEEDYEDGEVRETMQETEVEVHVYEKREIEPLDHAGCNDKKINSVGLLDHEFFTLGPKKQETKLENLDYRSEDEDEVQTTTKSNSYEQENEDLCVKELHAVENAIGEDVNISAKATERSQLSQYDKKGNFEGQGTADKILNEEPVPTFSQNEVENAVAVDVVQNRDLTLPTVKESVNEDNAKDINGGTRNSRIINFNRTSTDSTPCKAKSNFAKPVLSHKDREFVPNMVVERANMKPQERDDAYSNITKKISIDKREGQPPLMGFSHRRGRSSNRLDHRSEEWDFGPNFSPETYSEQQIDYHVPGLDQNRYKITPDGPFGGANRRGRELLEDEEPFFFHGPSRRKSLGRRHGPNVGGGKMVYKIPRDFSPGRCMDEGGSFDRQHGEKFSRNFADDTVDLMYPRPQPPYDIDKPFFRERRNFSFQRKSFPRIDSKSPVRSRARSPGQWFSSKRSDRFCERSDMTHRRSPNYRSERMRSPDQRPIRGHMPPGRRQGFHFLSASDEMRDVGPAPDHGHMRSIIPDRNQTERLPLRNRSYDAIDPQGRIENDDFFYGPPVRLGQLTGYNDGVPDDDERRFNERHEPLYSFKHPFGDSDGERFRNNREDCSRPFRFCPGNDPRISWKRR
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: KGN51251.1 (hypothetical protein Csa_5G504130 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1772.3 bits (4589), Expect = 0.0e+00 Identity = 965/1023 (94.33%), Postives = 993/1023 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: XP_011655341.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101204083 [Cucumis sativus] >XP_011655342.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC101204083 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1768.1 bits (4578), Expect = 0.0e+00 Identity = 935/1023 (91.40%), Postives = 963/1023 (94.13%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: XP_008463540.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X2 [Cucumis melo] >XP_008463541.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X2 [Cucumis melo] >XP_008463542.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1619.8 bits (4193), Expect = 0.0e+00 Identity = 869/1024 (84.86%), Postives = 918/1024 (89.65%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: XP_008463536.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008463537.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008463538.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1608.2 bits (4163), Expect = 0.0e+00 Identity = 863/1017 (84.86%), Postives = 912/1017 (89.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: XP_008463543.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1600.5 bits (4143), Expect = 0.0e+00 Identity = 814/1017 (80.04%), Postives = 864/1017 (84.96%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. TAIR10
Match: AT5G13590.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 1.3e-10 Identity = 111/466 (23.82%), Postives = 180/466 (38.63%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KU39|A0A0A0KU39_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G504130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1772.3 bits (4589), Expect = 0.0e+00 Identity = 965/1023 (94.33%), Postives = 993/1023 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CJI4|A0A1S3CJI4_CUCME (uncharacterized protein LOC103501669 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501669 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1619.8 bits (4193), Expect = 0.0e+00 Identity = 869/1024 (84.86%), Postives = 918/1024 (89.65%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CJG6|A0A1S3CJG6_CUCME (uncharacterized protein LOC103501669 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501669 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1608.2 bits (4163), Expect = 0.0e+00 Identity = 863/1017 (84.86%), Postives = 912/1017 (89.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CJG9|A0A1S3CJG9_CUCME (uncharacterized protein LOC103501669 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501669 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1600.5 bits (4143), Expect = 0.0e+00 Identity = 814/1017 (80.04%), Postives = 864/1017 (84.96%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0KNM2|A0A0A0KNM2_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G503580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1573.1 bits (4072), Expect = 0.0e+00 Identity = 859/1074 (79.98%), Postives = 903/1074 (84.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |