CsaV3_3G022140 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CATAAATTCAATTTTAAGAAACCACCCGGTTTGGTCAGCTAACAGGATTAGTAACTAAATTTTCGGTTTAACTATACTGAACCGGTTTAGTATATATACAATTCTAGGTTTTCATTCTTCATTTCAACAGCCGCCCTTCGTCCCTACCTCCCGTTCATTGGCGCGCCCCCGGTCGTTCGTTCTTGGTCTCGCCGCCGTTCGCCTTTTGTTGCACCTCTGTTCATTTCGTCAGTCACTGGTTCCTCACCTTTTCTCTAATCTAATTTGTATAATCAATATCAATAACCCCCCTCCTCCCCCTTTTTTTTACAGGTTGGGTGCCTATCGACGATGTATCTTCAGTTTTACATAAACGAAAATGGTGATAAAGTCTACACCACAAAGGTTTTTATTTCTTGTTTCTTCTTTTGCTCTTTGTGTTGAAGTTAATGGATATCATATCGTTTAGTATTGGGGTTGTACTATTTTTGACAGCGTCTGCTGCGTATCAGATAAGCAGTGTTATATGGGGTCCTTGATTTTTAAGATAGTTAAAGATTGCCGAGTTAATGATCATAAGTTTTGGAGACTGGACTAGTTCTATTTGTGCTGACCTTCCTTAGAAAATTAGCCTACCGTTATTAAGTGCAAGTAATCTGTGTAGTTGCAATTAATTTATGTACCCATGAAATGATTGATTAAATCTATAGGATACCTTTGCTTAGAGTGTCTCAATTTTACAGTAAGTTTCTGTTAAGGCTTTGAGCTTTGTTCCAATAACTTCTAATCCTCCCGTCTTTACTTTACCATATCACGATAGTAGTTTAGAATTCCCTTCGCCCGTTCCTTGACCAAGAAGAAGGAGTTTTAGATTTTAGGCTTTCGATGCCATTCTTTCTCTGCTAATTTGATTGGTAAGTTTCACATTTACCAAGGATGCTCTTTCATTATCACCTGCCATTTCTTGGGAAAAATGTAACAACCTGTCAATTCGAATGTTTTATTGAATGTCATGGAAGTGATTATAACTTAAGGTCAAGGATTCAATCCATTATGGCCGCTCCTAGGAATTTCCTATGAGTTTATTTGACACCAAAATATTGAAGGGTCAGGTGGGTTGCCCCTTAAATTTGTCTGTGTGTGTGTAAGATGACCCGAAAACTCACGGATATAAAAAAAACTGGAAACCAAAGGTAACTAATTTTTACTTGATCGAATAATAAGGCTTAAAATTCAAAGCCAAGTCCATCACCAAAATGTAAAGGACTAGGCAGTGGTATGAATTAACCCAAATACTAAGCACAGAAGCTTAATCTAAAGTAAAAGCTACTTTAATGAAAACTAAAATCATACAATTATGAACCAGCAGATCTTCTTGAATCCCCCCAGAAGACACCAATCCATTAGTCACTGCAAGAACTATTGCTTGCACTTCCATTTGATAAAATTTTATAAATAAAGATGAGTACAAAAATACTAATGTGTAATTTCCTAGCGATTTATAACTTGGACTGTAACCTAAAACTTTCTCTAGACAGTTAGTCTTATTACGTAAACCAGATCCTTGCGTTGATAACCTGGACAGAAACCTCCTCATAGTTCAAATCTTCTTTCACTTGCAATGGTGTATGGCTTAACTTGGGAGACATTTGCAATATACTTCCGAAGTATGGAGGTACGGAAAGTATTATGGATTGAATCTAAGACAGGCAGTAAGGCTAAGCGATATGCCAGTATACCCACCTATTCCAAATTCTCAAAAGTTCCAAAAAGTCTTAGGCTGAGCTTCCCTTTCTTCCCAAAGCTCAAGATTCCTTTCAACGACAAGACTATACCATATATTCAACTTTTAAAATTTAGTTATTTTCTTCTGACTGCTGACTTTAAGCTGTCTTCCTTTTCTACTTAACTGAGTCAAGACCTCATTAGATATTTGCACTGACTCAGGTCCCAAAATCGAGCTCTCTCCCACTTCAGTCTAATTGGTTGGTGACCTACGCTTATCCGTAGGGTGCAATGAAAGGGGCCATTCCGATAGTTGCTTGATAGATATTATTATAACTAAATCGTGTTAGATGGAAAATGTTTGTCCCAGCTGCCCTGGAAGTCCAAAACTTAAACTTGAAGCATATCGTACACTATTTGAACTGTCCTTTCTGACTGACCCATCTGCGGGTGGAACAAGATACTAAACCGTATTAGATGGAAAATGTTTCTCCCAGCTGCCCTGGAAGTCCAAAGCTTAAACTTGAAGCATATCCTACACTATTTGAACTGTCCTTTCTGACTGACCCATCTGCGGGTGGAACAAGATACTGAAATCAAGTCTTGTGTCTAGAGCCTTTTCCATACTTTTCCAAAGTTTGGAAGTGAACTTTGGATCTTGTTCTGACAGTATAGTCTATCAATCTTGTTCTGACACCTTGGATCTTGTTTAGACCAAGTGTCTATAAAATACAACTAAAATAGGTCCTGCACATACGTCTTCACTTGCTTGATAAACTGAGTATCAAAAACAAAACAAAAGAGAAAAACTAGCTTGATAAGCCATTGCTAATTGCCCTTAACTGCTTGTAACTTCTTTTGTGCAGACAATTTTATGCTAACTTGTCTGTTTCGTATTTGTCCTTACCTTGTACAGAAGGAATCTCCTCTAGGTTTGGCCACGCAATCTGCTCATCCAGGTAATTTTTTTTTTTGCATTATTTGGCTAGTTGTGCCCCACTTCCTTTCACTGACTTGCATAATTAGCAATATCAATGTTCCTGTTAGGGAGAAAGACCATGTTCTAATGTCGTTTTTTCTTATAACAAGGGAATTGGTTGAACATTATACATGGTCTATTTCAGTTGTAATTTTCACTGTGGCTGAGGCTATTGTGAAGATTGGAATTATACATTCGTGAGAATGGAAATGCACCGTTGATATACAACATTTATCATTGTAGAAGAGGATAATATCATTGGTCACTTATCTCTTTAGAGATACCATCGTTTGTTCTCTATCTATATTAATTGAATTAATAAAGATATTGCCTGATAGGCTGCCTCTTCAATGTGGTCATGGTTTTAGCAGTTTTGGGGATTTCTGTTAACCTGTTTTACATTTTCTGACTGCAGCTCGTTTCTCCCCTGATGACAAATATTCGAGGCAAAGAGTTCTTCTTAAGAAGCGATTTGGCTTGCTTCCTACACAGCAGCCACCTCCAAAGTACTGAACTCAACGCACTCTCAAATCACAACTCTATGGCAGTTCTCAAGTGTTTGTTTCCCAAACCCCCATCAATAGTTAGATCGTGACTTGGTTAAACTTTGATAGATAGTTTGCCTTTTCTTTCTATGGCTTGTAATTGAGCTGTAAAGCACAATTCACTGTTGAACCTTTCTTTAAGCTTGTCAGTGGCTTTATGTTTGTATTAAACTTTATTTTACTGAAAGCAAACTTTTATGTACTTTGAAGATCTGGTTTTAGTGCAAGATAATGTGCCTTTTTTCATACTTTTCTCCTCCTTTTGTACAAACATTGCAGTTGTCAAGCACCAATGTCTGCTGATCCTTTCTAAAGTTGTTGGCATTGTTTATGTATTTAACCTGATTCATTGACAATTAATTGAGTCTAAGCCATAAGGTGGTAGTCTCCAATTTCCTTGGTTTTGACATTCAAGTTCCATCGACGTTTGTGATTCAAGACGCATATGCACCGGAATTCATCTCTAGACTATGAAGGTATGCAAGGTTCATTTTATGATCCATTGATTTGAAGAACTATAATATTTTAGAGATGATCATGTGCTTCTCTTGGCCTGGGAATATGGTTTTTGTTCCAGGGTATTTGAATTTGAACATTGAAAAAGTATGTTCAAATGGGTTATAGGAGCTAGGAGTTTGGGCCTAAGTTTGCCATATTGCTTGCAAAAATATAGCTGAACGGTTAGGTGCTTGACTCTTCTGCCCCACTTAAGGAATAATTAACTGGATGCAGATATAAAATTAGCTTATGAAACAGATATATCATCATCAACTATTTTGATGGTTTTGGTCTCTAAAGTACCATTTAGAGTTACAAGTTATACTTGGTGAATTGAGTTTCAAACTTTTAACCTTAGTTGAATTTATAACTTAATTCGTTAGTTGAATGTATAACTTAATTAATTTCTTAAGCTATGCTTAAGTTAGCATGATTGAGATGTGTCTTAAATAGATAAACAAAAGTTAAAATTTTCAATCAAAATATAAAGCAGGCTAAAGTTGGAGAACAAAGGTATATTGTCACATGCGATAAACCGTGTTTGTCGAATTATTGTCTTCTAAACAAAACTTTGTCAAATTATGGTGGGTTCGTCTGTCAAATAAAATGATTTTTGAAAAAGGAAATGTAGAAAAAGGAAAATAGAATACGAAATGAATCTTCCTTGAAACGATTGATGGAAGTATTATATCTTTGTTATAGACATTGTTTTTAGAAAAGGAGGAAGAACATGGCATCCATTGAAGAAGACCAGAACTCTGTAGCCCTTTTCTTCAATCACAAAAGCACACTCTAACATGATCATACTTCTTTAATTTCCTAAAGATATGATTTGATATACACGAGTCCAAATCACCTAGAGTTTTTGTTTTCCCAAAAAGTAATTTAATTAACATAATTTTCTTTTCTTGTTCTTTTAATTACAATTCAAAAGGTACTTTAGAAAAACAATTATGAAACAAATGTGGTTAGGATTAAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAGTGATTTAGAAAAGGAGCCAATTGAAGCACCATATAGAAACTTTAATTTATGTTATTTTTAGGTTCATATATGTGAACATGCTCTATTTTAAACTAAACATACAATATAGTTTTTCTAAAAAAAATGTACAGTCTAAAACAGCACTTTATTATTTTGTCAAAAACTATGTGCTGAAAATATCTTAATAATCACTCTATTTCCCAATTAAACCTAAACAAAAAGAAAATAATGCGA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ATGTATCTTCAGTTTTACATAAACGAAAATGGTGATAAAGTCTACACCACAAAGAAGGAATCTCCTCTAGGTTTGGCCACGCAATCTGCTCATCCAGCTCGTTTCTCCCCTGATGACAAATATTCGAGGCAAAGAGTTCTTCTTAAGAAGCGATTTGGCTTGCTTCCTACACAGCAGCCACCTCCAAAGTACTGA ATGTATCTTCAGTTTTACATAAACGAAAATGGTGATAAAGTCTACACCACAAAGAAGGAATCTCCTCTAGGTTTGGCCACGCAATCTGCTCATCCAGCTCGTTTCTCCCCTGATGACAAATATTCGAGGCAAAGAGTTCTTCTTAAGAAGCGATTTGGCTTGCTTCCTACACAGCAGCCACCTCCAAAGTACTGA MYLQFYINENGDKVYTTKKESPLGLATQSAHPARFSPDDKYSRQRVLLKKRFGLLPTQQPPPKY
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. NCBI nr
Match: XP_011651438.1 (PREDICTED: H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Cucumis sativus] >XP_021665893.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Hevea brasiliensis] >PIN05065.1 H/ACA snoRNP complex, subunit NOP10 [Handroanthus impetiginosus]) HSP 1 Score: 136.3 bits (342), Expect = 3.6e-29 Identity = 64/64 (100.00%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. NCBI nr
Match: XP_009410656.1 (PREDICTED: H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Musa acuminata subsp. malaccensis] >XP_009410663.1 PREDICTED: H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Musa acuminata subsp. malaccensis]) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 6.1e-29 Identity = 63/64 (98.44%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. NCBI nr
Match: XP_008447412.1 (PREDICTED: H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Cucumis melo] >XP_016900440.1 PREDICTED: H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 8.0e-29 Identity = 63/64 (98.44%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. NCBI nr
Match: XP_021663890.1 (H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Hevea brasiliensis]) HSP 1 Score: 134.8 bits (338), Expect = 1.0e-28 Identity = 63/64 (98.44%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. NCBI nr
Match: XP_015957125.1 (H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Arachis duranensis] >XP_015968038.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Arachis duranensis] >XP_016190259.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Arachis ipaensis] >XP_016207587.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Arachis ipaensis] >XP_025690500.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Arachis hypogaea] >XP_025603224.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Arachis hypogaea] >XP_025638752.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Arachis hypogaea] >XP_025663306.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein [Arachis hypogaea]) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 1.8e-28 Identity = 62/64 (96.88%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. TAIR10
Match: AT2G20490.1 (nucleolar RNA-binding Nop10p family protein) HSP 1 Score: 116.7 bits (291), Expect = 5.3e-27 Identity = 55/64 (85.94%), Postives = 59/64 (92.19%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q93XX8|NOP10_ARATH (H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g20490 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 116.7 bits (291), Expect = 9.6e-26 Identity = 55/64 (85.94%), Postives = 59/64 (92.19%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q6DRH5|NOP10_DANRE (H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 OS=Danio rerio OX=7955 GN=nop10 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 98.2 bits (243), Expect = 3.5e-20 Identity = 45/62 (72.58%), Postives = 51/62 (82.26%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9NPE3|NOP10_HUMAN (H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOP10 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 8.7e-19 Identity = 42/62 (67.74%), Postives = 50/62 (80.65%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9CQS2|NOP10_MOUSE (H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nop10 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 8.7e-19 Identity = 42/62 (67.74%), Postives = 50/62 (80.65%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9V5P6|NOP10_DROME (H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=CG7637 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 1.1e-18 Identity = 44/64 (68.75%), Postives = 51/64 (79.69%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2G9GIP1|A0A2G9GIP1_9LAMI (H/ACA snoRNP complex, subunit NOP10 OS=Handroanthus impetiginosus OX=429701 GN=CDL12_22395 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 136.3 bits (342), Expect = 2.4e-29 Identity = 64/64 (100.00%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. TrEMBL
Match: tr|M0S1K9|M0S1K9_MUSAM (Uncharacterized protein OS=Musa acuminata subsp. malaccensis OX=214687 GN=103992599 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 4.1e-29 Identity = 63/64 (98.44%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BHD2|A0A1S3BHD2_CUCME (H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489864 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 5.3e-29 Identity = 63/64 (98.44%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P2IS35|A0A2P2IS35_RHIMU (H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein OS=Rhizophora mucronata OX=61149 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 5.3e-29 Identity = 63/64 (98.44%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G022140 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1Q3CIS0|A0A1Q3CIS0_CEPFO (Nop10p domain-containing protein OS=Cephalotus follicularis OX=3775 GN=CFOL_v3_23611 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 133.7 bits (335), Expect = 1.5e-28 Identity = 62/64 (96.88%), Postives = 64/64 (100.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber chineselong genome (v3)
Date Performed: 2019-03-04
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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