Csa6G017010 (gene) Cucumber (Chinese Long) v2

Overview
NameCsa6G017010
Typegene
OrganismCucumis. sativus (Cucumber (Chinese Long) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationChr6 : 1985308 .. 1986223 (+)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGATGATGGCGCATACTGTCTTAATTCTTGTAACAGTTAATTTGTGTTTGGATTTTTTTCGTGGGATTGTACTTCTGCTTTGTTGTTGTCTCAATTCTTCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCTTGTTGCGCTTATGGAAATCATTCTTAAAACTTCTCGATGGAGTTAGATTTTCATTTTATGTTGTCAGTTTTGAAGAATAGGAAGAAAGAGGGAAAACTAACCTGCCTTTTTTCAGTTGAGGATCTCCTTGTTAGGTGCGGTGCTATGTACATGTCTTGTCTTGTAATTTCTGGGAGATCAGGCCATTGGCTCTTGTAATTTCAGTTCATAGTACTCTTTTATCTCTTCTACCTAATTTATTGATGAACACTTTGCCCTTGACAAATTTTTTGTCCAATTCTCTCCTTAGCCTTTGACAGACAGATAAAAGAAATAGCTGTTCAATGTATGTATTCTCCCTCTCTCCCTCCTCCC

mRNA sequence

ATGGAGATGATGGCGCATACTGTCTTAATTCTTGTAACAGTTAATTTGTGTTTGGATTTTTTTCGTGGGATTGTACTTCTGCTTTGTTGTTGTCTCAATTCTTCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCTTGTTGCGCTTATGGAAATCATTCTTAAAACTTCTCGATGGAGTTAGATTTTCATTTTATGTTGTCAGTTTTGAAGAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGAGATGATGGCGCATACTGTCTTAATTCTTGTAACAGTTAATTTGTGTTTGGATTTTTTTCGTGGGATTGTACTTCTGCTTTGTTGTTGTCTCAATTCTTCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCATCTCTTCTCTTGTTGCGCTTATGGAAATCATTCTTAAAACTTCTCGATGGAGTTAGATTTTCATTTTATGTTGTCAGTTTTGAAGAATAG

Protein sequence

MEMMAHTVLILVTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLLLRLWKSFLKLLDGVRFSFYVVSFEE*
Homology
[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K7Z6_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G017010 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 394.8 bits (1013), Expect = 6.6e-107
Identity = 213/213 (100.00%), Postives = 213/213 (100.00%), Query Frame = 1 

Query: 1   MEMMAHTVLILVTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 60
           MEMMAHTVLILVTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS
Sbjct: 1   MEMMAHTVLILVTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 60

Query: 61  HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 120
           HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS
Sbjct: 61  HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 120

Query: 121 HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 180
           HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS
Sbjct: 121 HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 180

Query: 181 HLFSSLLLLRLWKSFLKLLDGVRFSFYVVSFEE 214
           HLFSSLLLLRLWKSFLKLLDGVRFSFYVVSFEE
Sbjct: 181 HLFSSLLLLRLWKSFLKLLDGVRFSFYVVSFEE 213

[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. TrEMBL
Match: K7GUJ8_CAEJA (Uncharacterized protein OS=Caenorhabditis japonica PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 138.3 bits (347), Expect = 1.1e-29
Identity = 88/151 (58.28%), Postives = 106/151 (70.20%), Query Frame = 1 

Query: 36  LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHL--F 95
           L++S +L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L  +
Sbjct: 33  LIVSPNLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSY 92

Query: 96  SSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLF 155
           SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L 
Sbjct: 93  SSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLV 152

Query: 156 SSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFS 185
           SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L S
Sbjct: 153 SSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVS 183

[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. TrEMBL
Match: K7GUJ8_CAEJA (Uncharacterized protein OS=Caenorhabditis japonica PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 1.5e-26
Identity = 89/158 (56.33%), Postives = 104/158 (65.82%), Query Frame = 1 

Query: 32  LNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLIS--SHLFSSLLIS 91
           L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+S  S L SS L+S
Sbjct: 44  LVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSYSSRLVSSRLVS 103

Query: 92  SHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLIS 151
           S L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+S
Sbjct: 104 SRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVS 163

Query: 152 SHLFSSLLISSHLFSSLLIS----SHLFSSLLISSHLF 184
           S L SS L+SS L SS L+S    S L S   I+  LF
Sbjct: 164 SRLVSSRLVSSRLVSSRLVSYRSDSRLSSKARITLALF 201


HSP 2 Score: 138.3 bits (347), Expect = 1.1e-29
Identity = 88/151 (58.28%), Postives = 106/151 (70.20%), Query Frame = 1 

Query: 36  LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHL--F 95
           L++S +L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L  +
Sbjct: 33  LIVSPNLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSY 92

Query: 96  SSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLF 155
           SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L 
Sbjct: 93  SSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLV 152

Query: 156 SSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFS 185
           SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L S
Sbjct: 153 SSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVS 183

[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. TrEMBL
Match: K7GUJ7_CAEJA (Uncharacterized protein OS=Caenorhabditis japonica PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 1.5e-26
Identity = 89/158 (56.33%), Postives = 104/158 (65.82%), Query Frame = 1 

Query: 32  LNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLIS--SHLFSSLLIS 91
           L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+S  S L SS L+S
Sbjct: 44  LVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSYSSRLVSSRLVS 103

Query: 92  SHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLIS 151
           S L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+S
Sbjct: 104 SRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVSSRLVS 163

Query: 152 SHLFSSLLISSHLFSSLLIS----SHLFSSLLISSHLF 184
           S L SS L+SS L SS L+S    S L S   I+  LF
Sbjct: 164 SRLVSSRLVSSRLVSSRLVSYRSDSRLSSKARITLALF 201


HSP 2 Score: 132.5 bits (332), Expect = 6.1e-28
Identity = 100/163 (61.35%), Postives = 113/163 (69.33%), Query Frame = 1 

Query: 27  LLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS-LLISSHLFSSLLISSHLFSS 86
           LLC  L SS L+SS L SS L+ S L SS L+SS L SS LLIS HL SSLL SS L SS
Sbjct: 106 LLCSPLLSSALLSSALLSSPLLCSALLSSSLLSSPLLSSPLLISPHLSSSLL-SSPLLSS 165

Query: 87  LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 146
            L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS   SS
Sbjct: 166 PLLSSLLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSALLSSPLLSSPLLSSPLLSSPHLSS 225

Query: 147 LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLL 189
            L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS LFSS LL
Sbjct: 226 SLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLFSSPLL 267

[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. TrEMBL
Match: K7E0X0_MONDO (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Monodelphis domestica PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 7.5e-26
Identity = 95/167 (56.89%), Postives = 111/167 (66.47%), Query Frame = 1 

Query: 27  LLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSL 86
           LLC  L SS L+ S L SS L+SS L SS ++SS + SS L+SS L  S L+SS L  S 
Sbjct: 46  LLCSPLLSSSLLCSPLLSSPLLSSLLLSSPVLSSPVLSSPLLSSALLFSPLLSSPLLCSP 105

Query: 87  LISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS-LLISSHLFSSLL----ISSH 146
           L+ S L SS L+SS L SS L+ S L SS L+SS L SS LLIS HL SSLL    +SS 
Sbjct: 106 LLCSPLLSSALLSSALLSSPLLCSALLSSSLLSSPLLSSPLLISPHLSSSLLSSPLLSSP 165

Query: 147 LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLL 189
           L SSLL+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS LL
Sbjct: 166 LLSSLLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSALLSSPLLSSPLL 212


HSP 2 Score: 124.8 bits (312), Expect = 1.3e-25
Identity = 96/167 (57.49%), Postives = 110/167 (65.87%), Query Frame = 1 

Query: 27  LLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS- 86
           LL   L  S L+SS L  S L+ S L SS L+SS L SS L+ S L SS L+SS L SS 
Sbjct: 86  LLSSALLFSPLLSSPLLCSPLLCSPLLSSALLSSALLSSPLLCSALLSSSLLSSPLLSSP 145

Query: 87  LLISSHLFSSL----LISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSH 146
           LLIS HL SSL    L+SS L SSLL+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS 
Sbjct: 146 LLISPHLSSSLLSSPLLSSPLLSSLLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSALLSSP 205

Query: 147 LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLL 189
           L SS L+SS L SS  +SS L SS L+SS L SS L+SS L SS LL
Sbjct: 206 LLSSPLLSSPLLSSPHLSSSLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLLSSPLL 252


HSP 3 Score: 123.6 bits (309), Expect = 2.8e-25
Identity = 95/172 (55.23%), Postives = 111/172 (64.53%), Query Frame = 1 

Query: 27  LLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSL 86
           LL   L SSLL+SS + SS ++SS L SS L+ S L SS L+ S L  S L+SS L SS 
Sbjct: 61  LLSSPLLSSLLLSSPVLSSPVLSSPLLSSALLFSPLLSSPLLCSPLLCSPLLSSALLSSA 120

Query: 87  LISSHLFSSLLISSHLFSS------LLISSHLFSSL----LISSHLFSSLLISSHLFSSL 146
           L+SS L  S L+SS L SS      LLIS HL SSL    L+SS L SSLL+SS L SS 
Sbjct: 121 LLSSPLLCSALLSSSLLSSPLLSSPLLISPHLSSSLLSSPLLSSPLLSSLLLSSPLLSSP 180

Query: 147 LISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLL 189
           L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS L+SS L SS  +SS L SS LL
Sbjct: 181 LLSSPLLSSPLLSSPLLSSALLSSPLLSSPLLSSPLLSSPHLSSSLLSSPLL 232


HSP 4 Score: 112.5 bits (280), Expect = 6.6e-22
Identity = 80/156 (51.28%), Postives = 99/156 (63.46%), Query Frame = 1 

Query: 33  NSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHL 92
           +  +L+     S  L+SS L SS L+SS L  S L+SS L  S L+SS L SSLL+SS +
Sbjct: 17  SEKVLVGFEARSFSLLSSPLLSSALLSSPLLCSPLLSSSLLCSPLLSSPLLSSLLLSSPV 76

Query: 93  FSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHL 152
            SS ++SS L SS L+ S L SS L+ S L  S L+SS L SS L+SS L  S L+SS L
Sbjct: 77  LSSPVLSSPLLSSALLFSPLLSSPLLCSPLLCSPLLSSALLSSALLSSPLLCSALLSSSL 136

Query: 153 FSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLL 189
            SS L+SS L  S  +SS L SS L+SS L SSLLL
Sbjct: 137 LSSPLLSSPLLISPHLSSSLLSSPLLSSPLLSSLLL 172


HSP 5 Score: 117.9 bits (294), Expect = 1.6e-23
Identity = 91/156 (58.33%), Postives = 101/156 (64.74%), Query Frame = 1 

Query: 36  LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLIS-SHLFSSLLISSHLF--SSLLISSHLFSSLLISSHL 95
           LLISS L  SLL  SHLFSS+LIS   LF S L+S +    S +L  S+LFS  L    L
Sbjct: 44  LLISSPLIFSLLFCSHLFSSVLISFPFLFCSHLLSHYFLISSPILFDSYLFSPSL----L 103

Query: 96  FSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS-LLISSHLFSSLLISSH 155
           FSSLL  SHL SS+LIS  LFSSLL  SHL SS+LISS L SS LLI SHLFSS+LISS 
Sbjct: 104 FSSLLFCSHLISSVLISPLLFSSLLFCSHLISSVLISSVLISSPLLICSHLFSSVLISSI 163

Query: 156 LFSSLLISSHLFS-SLLISSHLFSSLLISSHLFSSL 187
            FSSLL S   FS  L  +S L S   +S    SSL
Sbjct: 164 PFSSLLFSFLFFSLPLPFNSTLLSLSSVSPLALSSL 195

[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. NCBI nr
Match: gi|700190681|gb|KGN45885.1| (hypothetical protein Csa_6G017010 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 394.8 bits (1013), Expect = 9.5e-107
Identity = 213/213 (100.00%), Postives = 213/213 (100.00%), Query Frame = 1 

Query: 1   MEMMAHTVLILVTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 60
           MEMMAHTVLILVTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS
Sbjct: 1   MEMMAHTVLILVTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 60

Query: 61  HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 120
           HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS
Sbjct: 61  HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 120

Query: 121 HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 180
           HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS
Sbjct: 121 HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 180

Query: 181 HLFSSLLLLRLWKSFLKLLDGVRFSFYVVSFEE 214
           HLFSSLLLLRLWKSFLKLLDGVRFSFYVVSFEE
Sbjct: 181 HLFSSLLLLRLWKSFLKLLDGVRFSFYVVSFEE 213

[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. NCBI nr
Match: gi|989344264|emb|CWP86355.1| (transposase [Neisseria meningitidis])

HSP 1 Score: 161.4 bits (407), Expect = 1.8e-36
Identity = 110/155 (70.97%), Postives = 113/155 (72.90%), Query Frame = 1 

Query: 6   HTVLILVTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 65
           H+VL  +  +    F R IVL     L SSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSS
Sbjct: 29  HSVLQHLRESFSFLFIRYIVLKHRXLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSS 88

Query: 66  LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 125
           LL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSS
Sbjct: 89  LLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSS 148

Query: 126 LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 161
           LL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL  S
Sbjct: 149 LLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFRS 183

[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. NCBI nr
Match: gi|989344264|emb|CWP86355.1| (transposase [Neisseria meningitidis])

HSP 1 Score: 161.4 bits (407), Expect = 1.8e-36
Identity = 107/144 (74.31%), Postives = 109/144 (75.69%), Query Frame = 1 

Query: 40  SHLFSSLLISSH---LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSL 99
           S LF   ++  H   LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSL
Sbjct: 40  SFLFIRYIVLKHRXLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 99

Query: 100 LISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSL 159
           L SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSL
Sbjct: 100 LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 159

Query: 160 LISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 181
           L SS LFSSLL SS LFSSLL  S
Sbjct: 160 LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFRS 183


HSP 2 Score: 149.1 bits (375), Expect = 9.1e-33
Identity = 101/140 (72.14%), Postives = 103/140 (73.57%), Query Frame = 1 

Query: 60  SHLFSSLLISSH---LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSL 119
           S LF   ++  H   LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSL
Sbjct: 40  SFLFIRYIVLKHRXLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 99

Query: 120 LISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSL 179
           L SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSL
Sbjct: 100 LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 159

Query: 180 LISSHLFSSLLLLRLWKSFL 197
           L SS LFSSLL   L  S L
Sbjct: 160 LFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 179


HSP 3 Score: 117.9 bits (294), Expect = 2.2e-23
Identity = 91/156 (58.33%), Postives = 101/156 (64.74%), Query Frame = 1 

Query: 36  LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLIS-SHLFSSLLISSHLF--SSLLISSHLFSSLLISSHL 95
           LLISS L  SLL  SHLFSS+LIS   LF S L+S +    S +L  S+LFS  L    L
Sbjct: 44  LLISSPLIFSLLFCSHLFSSVLISFPFLFCSHLLSHYFLISSPILFDSYLFSPSL----L 103

Query: 96  FSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS-LLISSHLFSSLLISSH 155
           FSSLL  SHL SS+LIS  LFSSLL  SHL SS+LISS L SS LLI SHLFSS+LISS 
Sbjct: 104 FSSLLFCSHLISSVLISPLLFSSLLFCSHLISSVLISSVLISSPLLICSHLFSSVLISSI 163

Query: 156 LFSSLLISSHLFS-SLLISSHLFSSLLISSHLFSSL 187
            FSSLL S   FS  L  +S L S   +S    SSL
Sbjct: 164 PFSSLLFSFLFFSLPLPFNSTLLSLSSVSPLALSSL 195

[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. NCBI nr
Match: gi|642118196|emb|CDQ66324.1| (unnamed protein product [Oncorhynchus mykiss])

HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 5.9e-16
Identity = 69/129 (53.49%), Postives = 80/129 (62.02%), Query Frame = 1 

Query: 86  LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLIS-SHLFSSLLISSHLF--SSLLISSHLFSSLLISSHL 145
           LLISS L  SLL  SHLFSS+LIS   LF S L+S +    S +L  S+LFS  L    L
Sbjct: 44  LLISSPLIFSLLFCSHLFSSVLISFPFLFCSHLLSHYFLISSPILFDSYLFSPSL----L 103

Query: 146 FSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLLLRLWKSFLKLLDGV 205
           FSSLL  SHL SS+LIS  LFSSLL  SHL SS+LISS L SS LL+        L+  +
Sbjct: 104 FSSLLFCSHLISSVLISPLLFSSLLFCSHLISSVLISSVLISSPLLICSHLFSSVLISSI 163

Query: 206 RFSFYVVSF 212
            FS  + SF
Sbjct: 164 PFSSLLFSF 168


HSP 2 Score: 92.0 bits (227), Expect = 1.3e-15
Identity = 76/146 (52.05%), Postives = 88/146 (60.27%), Query Frame = 1 

Query: 7   TVLILVTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLIS-SHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 66
           +VLI      C        L+    L  S L S S LFSSLL  SHL SS+LIS  LFSS
Sbjct: 63  SVLISFPFLFCSHLLSHYFLISSPILFDSYLFSPSLLFSSLLFCSHLISSVLISPLLFSS 122

Query: 67  LLISSHLFSSLLISSHLFSS-LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFS 126
           LL  SHL SS+LISS L SS LLI SHLFSS+LISS  FSSLL  S LF SL +    F+
Sbjct: 123 LLFCSHLISSVLISSVLISSPLLICSHLFSSVLISSIPFSSLLF-SFLFFSLPLP---FN 182

Query: 127 SLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 151
           S L+S    S L +SS   +S +IS+
Sbjct: 183 STLLSLSSVSPLALSSLSGASSVISN 204


HSP 3 Score: 116.7 bits (291), Expect = 5.0e-23
Identity = 75/102 (73.53%), Postives = 78/102 (76.47%), Query Frame = 1 

Query: 33  NSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHL 92
           +  LL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS L
Sbjct: 5   DKKLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLL 64

Query: 93  FSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFS 135
           FSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL ++   S
Sbjct: 65  FSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFAARAAS 106

[Close]
BLAST of Csa6G017010 vs. NCBI nr
Match: gi|7443351|pir||S16613 (opacity protein opaB precursor - Neisseria gonorrhoeae (strain MS11) (fragments))

HSP 1 Score: 116.7 bits (291), Expect = 5.0e-23
Identity = 74/94 (78.72%), Postives = 76/94 (80.85%), Query Frame = 1 

Query: 92  LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSH 151
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS 
Sbjct: 9   LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 68

Query: 152 LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 186
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LF++
Sbjct: 69  LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFAA 102


HSP 2 Score: 116.7 bits (291), Expect = 5.0e-23
Identity = 74/94 (78.72%), Postives = 76/94 (80.85%), Query Frame = 1 

Query: 82  LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSH 141
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS 
Sbjct: 9   LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 68

Query: 142 LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 176
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LF++
Sbjct: 69  LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFAA 102


HSP 3 Score: 116.7 bits (291), Expect = 5.0e-23
Identity = 74/94 (78.72%), Postives = 76/94 (80.85%), Query Frame = 1 

Query: 72  LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSH 131
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS 
Sbjct: 9   LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 68

Query: 132 LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 166
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LF++
Sbjct: 69  LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFAA 102


HSP 4 Score: 116.7 bits (291), Expect = 5.0e-23
Identity = 74/94 (78.72%), Postives = 76/94 (80.85%), Query Frame = 1 

Query: 52  LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSH 111
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS 
Sbjct: 9   LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 68

Query: 112 LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 146
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LF++
Sbjct: 69  LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFAA 102


HSP 5 Score: 116.7 bits (291), Expect = 5.0e-23
Identity = 74/94 (78.72%), Postives = 76/94 (80.85%), Query Frame = 1 

Query: 62  LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSH 121
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS 
Sbjct: 9   LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 68

Query: 122 LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 156
           LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LF++
Sbjct: 69  LFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFAA 102


HSP 6 Score: 112.8 bits (281), Expect = 7.2e-22
Identity = 75/105 (71.43%), Postives = 78/105 (74.29%), Query Frame = 1 

Query: 41  HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 100
           H     L+    FSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS
Sbjct: 2   HTADKKLL----FSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSS 61

Query: 101 HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 146
            LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LF++
Sbjct: 62  LLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFAA 102


HSP 7 Score: 112.8 bits (281), Expect = 7.2e-22
Identity = 75/105 (71.43%), Postives = 78/105 (74.29%), Query Frame = 1 

Query: 61  HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 120
           H     L+    FSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS
Sbjct: 2   HTADKKLL----FSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSS 61

Query: 121 HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 166
            LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LF++
Sbjct: 62  LLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFAA 102


HSP 8 Score: 112.8 bits (281), Expect = 7.2e-22
Identity = 75/105 (71.43%), Postives = 78/105 (74.29%), Query Frame = 1 

Query: 81  HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISS 140
           H     L+    FSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS
Sbjct: 2   HTADKKLL----FSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSS 61

Query: 141 HLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 186
            LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LF++
Sbjct: 62  LLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFAA 102


HSP 9 Score: 104.0 bits (258), Expect = 3.3e-19
Identity = 69/91 (75.82%), Postives = 69/91 (75.82%), Query Frame = 1 

Query: 106 LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSS 165
           LL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSSLL SS LFSS
Sbjct: 8   LLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSS 67

Query: 166 LLISSHLFSSLLISSHLFSSLLLLRLWKSFL 197
           LL SS LFSSLL SS LFSSLL   L  S L
Sbjct: 68  LLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSLLFSSL 98


HSP 10 Score: 116.3 bits (290), Expect = 6.5e-23
Identity = 51/190 (26.84%), Postives = 125/190 (65.79%), Query Frame = 1 

Query: 12  VTVNLCLDFFRGIVLLLCCCLNSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSH 71
           + V++ +  F  + +++   +  S++I + +F S++I + +F S++I + +F S++I + 
Sbjct: 76  IFVSIIIGTFIFVSIIIGTFIFMSIIIGTFIFMSIIIGTFIFVSIIIGTFIFMSIIIGTF 135

Query: 72  LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSH 131
           +F S++I + +F S++I + +F S++I + +F S++I + +F S++I + +F S++I + 
Sbjct: 136 IFMSIIIGTFIFMSIIIGTFIFVSIIIGTFIFMSIIIGTFIFVSIIIGTFIFVSIIIGTF 195

Query: 132 LFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLFSSLLISSHLF---SSLLL 191
           +F S++I + +F S++I + +F S++I + +F S++I + +F S++I+  +F   S+++ 
Sbjct: 196 IFMSIIIGTFIFMSIIIGTFIFVSIIIGTFIFVSIIIGTFIFMSIIINFFIFIYRSTVIF 255

Query: 192 LRLWKSFLKL 199
           + +W   L L
Sbjct: 256 IIIWFGVLFL 265

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csa6G017010 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0K7Z6_CUCSA6.6e-107100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G017010 PE=4 SV=1[more]
K7GUJ8_CAEJA1.1e-2958.28Uncharacterized protein OS=Caenorhabditis japonica PE=4 SV=1[more]
K7GUJ8_CAEJA1.5e-2656.33Uncharacterized protein OS=Caenorhabditis japonica PE=4 SV=1[more]
K7GUJ7_CAEJA1.5e-2656.33Uncharacterized protein OS=Caenorhabditis japonica PE=4 SV=1[more]
K7E0X0_MONDO7.5e-2656.89Uncharacterized protein (Fragment) OS=Monodelphis domestica PE=4 SV=1[more]
BLAST of Csa6G017010 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|700190681|gb|KGN45885.1|9.5e-107100.00hypothetical protein Csa_6G017010 [Cucumis sativus][more]
gi|989344264|emb|CWP86355.1|1.8e-3670.97transposase [Neisseria meningitidis][more]
gi|989344264|emb|CWP86355.1|1.8e-3674.31transposase [Neisseria meningitidis][more]
gi|642118196|emb|CDQ66324.1|5.9e-1653.49unnamed protein product [Oncorhynchus mykiss][more]
gi|7443351|pir||S166135.0e-2378.72opacity protein opaB precursor - Neisseria gonorrhoeae (strain MS11) (fragments... [more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
molecular_function GO:0003676 nucleic acid binding
molecular_function GO:0000166 nucleotide binding
Unigene
This gene is associated with the following unigenes:
Unigene NameAnalysis NameSequence type in Unigene
CU093738cucumber EST collection version 3.0transcribed_cluster
CU114196cucumber EST collection version 3.0transcribed_cluster
CU177487cucumber EST collection version 3.0transcribed_cluster
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csa6G017010.1Csa6G017010.1mRNA


The following transcribed_cluster feature(s) are associated with this gene:

Feature NameUnique NameType
CU093738CU093738transcribed_cluster
CU114196CU114196transcribed_cluster
CU177487CU177487transcribed_cluster


Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Csa6G017010Melon (DHL92) v3.6.1cumedB455
Csa6G017010Silver-seed gourdcarcuB0699
Csa6G017010Watermelon (97103) v2cuwmbB490
Csa6G017010Watermelon (97103) v2cuwmbB504
Csa6G017010Wax gourdcuwgoB589
Csa6G017010Cucumber (Gy14) v1cgycuB511
Csa6G017010Cucurbita maxima (Rimu)cmacuB032
Csa6G017010Cucurbita maxima (Rimu)cmacuB485
Csa6G017010Cucurbita maxima (Rimu)cmacuB487
Csa6G017010Cucurbita moschata (Rifu)cmocuB022
Csa6G017010Cucurbita moschata (Rifu)cmocuB473
Csa6G017010Melon (DHL92) v3.5.1cumeB415
Csa6G017010Watermelon (Charleston Gray)cuwcgB500
Csa6G017010Watermelon (Charleston Gray)cuwcgB513
Csa6G017010Watermelon (97103) v1cuwmB462
Csa6G017010Watermelon (97103) v1cuwmB475
Csa6G017010Cucurbita pepo (Zucchini)cpecuB584
Csa6G017010Cucurbita pepo (Zucchini)cpecuB793
Csa6G017010Bottle gourd (USVL1VR-Ls)culsiB471
Csa6G017010Cucumber (Gy14) v2cgybcuB282