CsGy7G008030 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGGTGGTGTTAATTGTTTTCCTTTCCTCCTTTCTGGGCTTTAGCGCCCTGTGGCCACGGAAATCGATGATCGTCAGTATTCAATGGACCCGTCGTCAGTGCGCAAAGCTCCTCCAGCTGAAGAAGATGAGTGGGGTATTGTTCCTTCTTTGATTCTTGCATCTCTTTTTCCCTCATTGGAAATGGGGTTTGATTGTTTCTTCAAATTGAGTTTCCGTGGATTGGAAATTTTGGAATCTGTAATCTCATTTTTGGAATGTGGTTATGAACCCTAATATTGAATGGTGGGTCTGTCTTTGTTTCTATTTTGAATCCATTTAATCTCCCTTTTCTGGAATTGTGCTGGAAATTTGTCTACTTATTTTAACCCAATATTGCTGATTGTTTGATAGTGTATACTACAGATTTGTTTGCTTTGTTGTCTGTATTTGGTGGTTTGTTCTTTGTAGTGGTAGGAATTTGATTCCCCTGTTTCTGAGGCCTTGTTCCTATCGTTTTCACTTTGTAATCTTACATGGCCTTCTGAATATTTGAGGTTTGGTTGAGTGAATTTTAAGCCAGTTACTTTTTGAGAATAGGAGTGATTCACGAATTTTAGTACATAGGAAATCGAGCCTGTTTTAGCCTTACAAGTTGTAGTTCATCTAATTTAAGCTCTATACTTCGGTTAGTAGTAATTTGTTGCCCTAATCCTAACCAAGTAAGAACATTGGTCAATAAAATCCAAGTGCAGAAAGATTCAAGCCTAGCAAAAAGTAATGTAGCCAAAAGACTGCCCAAACTGAGAACAAAAGGACTTCAGTTTGGCTCAGCTACAAGAGCACCCACCTATTATACACATTTTTCGAGAACACATCTTAACAATTAAAGGATACGGATGTTGATTCTCGTTCTTTAGCTCAGGTTAAACTGGATAAAGTTGATAGTCTAAATTTAACTCGCTTAGCTACGAAGTTACATGAGGTAAATGATTTTGCTCAAAAAAATGTATTCTTTTGTCGGGCGGTTTCATCATGAAAACAGAAAGCAATGTGTTACTTGATGAATAGCTCTTTTTGGTATCTTTGCAAGTTATCTCGTGGAATGTGTTGATTAGAATTTAGTTGTTAGTTGAAAGGTTAACAGTGAGGTAGTGCTTTTCATTCAAATAGTTGTTAGCTTGGAAATGCTAAATTTAATATCATTCCAACGTTTTTCTTAGATGGGAATAATTTTATTGATGTTAAGAGTTTAGAAACGAAGGGTGGAGAGTCAAGTCCTAGCGTGAAGGGGACTATGAAAAGCTTCTCTTATTGACCAAACGCATACAAAGAAAGAGCTGCTAAAGTTAGATAACCTAAGAATTGATAAAAGGACGTCTCCTTGGTGATAAAAGTGGCCTGATGAATTGAGAGCCAAAGAACTTCCTTTCCTCTTTTTAAAGGGTGCCCTACCAGAATCTGACTTTCCTTTCCTGTTTGGCAAATAGAACAGCATCTCAAGAATAAGCCACTTTTCAATCTTGTCATGGGGATTTGGACTTCTGCGAATGAGCCCTCATTGAAAGAACTCGACCTTCTTTGGACATTGGTCATGCCAAAGGACTTTTTTGGATGAGAACTCTCATTTATCTGTAATTTACTATATCAACGAGTGGAGAGCATGCAATGAGCCGCCAAATGGACCTAGCACCCACATCGATTCATCTGTGTAAATCGATTTACTGACAACTAGATAAGAAATTTGTGAACGTCTGTTCAAAGATATTGTCGTCCTTGACCATTTTGTCTTATGCCTAGGTTCTATGACTTGGTTAAGAACTCCACAAGTCTTGGAACAATGAAGTTTCTTGAATAAAATAGAAGATACTTGGGTATTGCCAGTTCAAAAAAACTCCCAGATGTGCATGGACGAACCATCAGTCAGTCAATTTGATCTAAAATAAATAAAATATGTGCTCAGTAGCTTGATAATAAAGGAGATTCTAACATTATCTTTCATACGTTTGTTGTTTTAATGCTTTAGTCGAGTTCGTTACAGCGCCTGTGCTCAGTGGCTTAATAATAATACCAAAAGTATTTTGCTTTTGGTACCCCCAAAAATGGAGGATGTGCTCACTGGCTTGATAATAGTGCCGAAAGTAGAGAGACCAAAGTGGATAATTTCTGGATTGTCATGAATGCTTTATGAACAATCTCTGTCATTGTGGGGTACTACACAGTAGATGCTCATGAGCAAGTTACCATCATTTATTTAACTGCCACAGCTCTTCCCTAGCTTTTTCACCTTTCGAGAATGATTTCCCTCAAAAGAATTGGCATTCCCTTGATATTATTTCTTTTCTTAATGAGATCTCTAACTATGAATATGCCTCTACTTTTTTCTCTTGTATCTTTTTGTTTGCAACGATTAAATTTACTTTTTTGTTAATCATGGAGAAAAAATCAAAATATTGTCAAAGGAGGACTTTTTCAACAGATTCCTCCAAGCTTGAGAATATACAAACACATTACACTGAAGTTTTTGTTTCAAAAATAATCTTCATGAGGCATGGCACTGATTGTAGTGTGTGGTTATTTTTGTAACAGACACTGATGGGTTCGTGATTCCCAGCTTGGGAATAGAAGAGGCAGACCAAACAAGAGTTGGTTCTCCAAAAGTAGAAATCGAAGAACCTCCCCCAAAGGTAGTTATTAGTAAATCCTCTTAATATAAATGCCAGCAAAAGCCACCTTGGAGATTGGCCAAGGAAAATTAGTGGATAAGCTGTAAATATTTTATATTCAATGTAAATGAAATTCAGACGCCAAATATTATTGATTCAGGTGATGGTTTTTGTCTTCACAATTCAATGATTGCTTTGCTTATGCTTCTTTCATATTCAGGTTAAAGAAGAGACGACGATCTATCTTGGCCCACATGGCGCACCACCATCACAGTCAAAACAAGATTTGAACCCCACCAATCGTAAGCAACGGTTAAAGCAGAAATTGAAGGAAGCAGACCGGAGGACCACGACAGGACGAGAGAATAAGTTGGAAAATTTAAGAGAGCTTGTAGGTGGTGGAAAATCAAGCACCAATATGGCTAAGGGTTCTTCTAGGGACTGGCTTGACCCACACTGCCATGAGGCTGAGTTCGAGAAGTAATGTCCACAGAGATCAAAGTATTTTATAAGACAGCTTAAGAAAGTTAGCACAGTTTTTGAGATAAAGATCGGATTGGTCGTTCTATCAGTCTATTAATCTGTCCTTTCGAGACAATGTACCCTTCTCTATATTTACATAAAGCTGGGAGTTTATAACTATAATAAGTTTTGCATTGGAGCTTTGATGGTATAAATGAAGCAGTTGCTTACAAAGCAGAGATTTGGTGAAGCTAATTCATTGAATGATTTTAATCTTCCGAACAACAATGTCTTAAGTCTTACAAAATTGAATATCTCGATGAATTACTCGTATCCAACATTCTACAACAGTTTAGTTACTTCAAGACCTTCAAATATGATGTGCTGTTAATTCTCTATATTCAGTTGCATATCATGATGACGCAAACCTCCATACTCTTTAACACGACATTCTGAGACTCATAGCTCTACCATTTCACCTGGATTCGAGGAATTCTAAGCCAGTAGCCTTGGGCGTCAGATTGTATTGACTCAGATACTCTGAACTGAAAAATTTGCTCAGATGCCTCATTCCATTGTCGCAAAGAATGGTGACAATGGTTTTTCCGGGGCCAATTGATTGGGCCAATTTCACAGCTCCAACACAATTCATGGCTGAAGAGCTCCCGAGAAAGAGCCCATCATTCCTCAGCAGATATCTGGTTTATAACGTTGCAAGAAGATCGATTAGCGTTGCTAAAATTGAACATGAAGATTAAAGCTATGGAGAAAGTAAATGTGAGAATACAAACAGCATGCTCTATATATATAATAACGAGATTTTTGTGTGGATGTCCCAATCTCAAATCCATTGATGCTGAATCATCAAATATTAGAAATCAATAAAAATTAACATTTATGATCCTTCATGATCTAATTATAGAATTAAAAGAAAACATTCTACTTAAGTCATAGAGCATTCAATCGTTTGGAACTTCGTGAAATATTCGAATCCCTAACGTAGTGCTTTTTGTATCAGGATGTTTTTAAAAAATCCACTCGTTTGACAATTGCAGTCCCGGTGACAAACCACAGTGAAATTATAGTGGATCCCGATTATAAAGTCAAACGAAATTTCTAAAAAAAAACCATTCTTTACAGAACCATGACTGACAAACAGGAGAACTTTCAAAAACTCATCTTAGGGATCCGAATATTTCATGATGGGAGAGAAGGCACAGTCGAGAGAATAAAGTCCAAGCGGTTGAGTCTTTTGTGGCGTAAGCAGGAGAGGTTAGTTTTCATTGATCCTCTAAACTTTGATCATTCCACATTAACACAACTATAATTGGGTCAAAAGTAACAAGGTCTCAATAACCTCAATAAACCAAAAAAAACAGATAGTTGCATCAGTAGAGAAAGGGAGATGATACCATCAAGAAATTAGTTCTACAATGGTTTGGCCACTAACCTTGACATTTCAACAGCTTCCCTGTCTGTTCCACAAAATGCCCCGTCAAGTTTTGCCATCAAGAAATTCTGCGTTAATCTATTGATTCCAATTCCTTCAGTTATTGTGTCAAAAGGATTCTTTAATCTTCGTCCTTCAGCCTCCTCTTTGGCGTACATAACTCCTCTAGTCACCTTGTTGAACAGGCCAGAACCGGGTGGATCTATGAGGAAACACTTAACATTTGGATTCTTCTCCTGTTGAAGAAGTGGAAGAGAAGTTGCACAATTGCCTCAGAAAACTATACACACAGATTTGGAAGGATAAGGAATGCAGAGTTTACCTGGAGAAACCTGGAAACACCGGCCACAGTACCACCGGTTCCTGCAGCTGCAACAAAGGCATCGATGTGCCCACCAGTTTGTTCCCAAATCTCTGGTCCCGTACCCTCATAATGAGC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BLAST of CsGy7G008030 vs. NCBI nr
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Match: tr|M5WVM2|M5WVM2_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_4G242300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 186.8 bits (473), Expect = 3.8e-44 Identity = 99/142 (69.72%), Postives = 117/142 (82.39%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G008030 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P4KQQ3|A0A2P4KQQ3_QUESU (Uncharacterized protein OS=Quercus suber OX=58331 GN=CFP56_05687 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 185.3 bits (469), Expect = 1.1e-43 Identity = 99/141 (70.21%), Postives = 115/141 (81.56%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G008030 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1R3IMB4|A0A1R3IMB4_COCAP (Uncharacterized protein OS=Corchorus capsularis OX=210143 GN=CCACVL1_11239 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 184.1 bits (466), Expect = 2.5e-43 Identity = 95/142 (66.90%), Postives = 116/142 (81.69%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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