CsGy3G017690 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAGCTTGTTTTTGCTGTCTTCACTGGAGAGTCCTGGGGTTACCTTGGTAGTAGGAGATTTTTGCTTGAACTTGATTTACAGTCTGATGCTGTCAGTGGCCTCGAAAATAGATTAATTGATACGGTATACTACTGAACTTGTGAATTAACTTTTGAATTAGTGCTCTGAATTTTAGTTTGCTTGTACTCACTATATTTGACAGCGCAGAATTATAGTTGTCTCTGAGAGAATCGTGTATGTTTTCTACTTTTGTTATTCGAGTGTCTTCCTTGGATAATATCACTGGAAAAATGCATAATGGATGAAGAGAATTATCCAAATCCTTTGGCTGCTAATTTGAAACAGTTGAAGGGTGATTTCTCCCTTTATTGTGTGTGGTTTTTGTTTGTATCATGTGTAGTTTGTTTAACATACGAACAATTTTGGCAAGTTTTTGGTGTGGATGTTTATCTTTAAAACTTCTCTCTTTATTTTTAAATTTTTATTTGTTAATTTTGTAAATTTTAATTTTTGTTTTTGTTTTTTGAAACGAAAACAAACGTCTTTATTAATATAAGAACTTTCTGTCCAAGAGAATTATACAACGAGTATAATAAAGAAGTCTAGACAAGCGAAAGAGAAACTAGAAGGATCAGAAGGTGCACCTGGACATTTCAACTAGGTTGACACCCTCTTAGCACCAAAAACATCATATCCAAAATAAGATTAGCCTATTAATTTTAAAGATGGATGTATTCTTTACGTGTCAATTTTCAGGACTTAAGAAATAGGTTTCCCCTCTTGTGGTCAGAAATTTCTATTATTTTGAACTATTTGCTTCCAATGACTGGAGGATGATTCACAAATTTCTGGAAATGAAACTCCAAACCAATATTTATGACAATGCCCTTATCGGTATTGATCAAGGCTCTCTTAGTGACATCATCGGTGCAGAAGGTAAATGGCAGGCATGGGAAATTTCCATCTTAAATTTGAAAAATGGACAACATGAAACATAGTAGACCACTAGTGTTGAAAGGATATGGAGGTTGGCTTAAGGTTAAGAACCTTCCCCTTGATTTATGGAGTAGAAGTGTTTTTGAGGCAATTGGAGATCATTTTGGAGGCTTCATCAAAATAGCCACAGAAACACTAAATCTCACAAATTGTAGTGAAGCTCGCATTCAAGTAAAAAGGAACCTTTGTGGATTCGTCCTTTCAACAAATGAAATTTCTGACCACAAGAGGGGAAACATCTTCTTACATTTTGGAGAGTTTGAATTTTTAAGCCCTCCAATCTCCAGAAAATCACCCAGTGTGCATGATGTCTACAAAAACTCCCTTGATCGACTAAGAATAAGAGAAGCCTTGTTTGATGAGGGCTGTGATCTCTCCTCCTTCCCACCTATACTTAGTGTCCCAAAATCAGTTTTTGCAACCTTGCCGAGGAGTAGAAGTCCATTTCAACCTCTACAACATTTTCCGGCCACCTCACCGGCGCCAGAGAAGATGAATAGTTCTGGAAAACAGGTGACAGCCAACTCCATTGGGCGGGATCCTGAACAGCCTTCACCTTTAATTAATGACACTCCTAAGGGACACAGCTGTCTCAAAAAGCAACTGGGGCCCGCGGGTATTAATCAAAATCCCATTAATTCGGCTGCTGGAGTCCTAAGTAGAGAGAGAAAAAAGGAAAAAGCATCTTTAATTACTATCATGCAGAATTATGATATATCCTCCAAAATAATTAAAGATGACTGTTCTCGTTCCAACCAACGGCCACTACCAAATCCAGCCTCCACAGATCCTTCTCTCCCTTTAGTTTCTGGTTTCTGTAACAAGCCTAAATCAACAAAAGGTGGTAATTCTCTCCAAGTTCACGCTCCAAAAATTCTGAAGCATTATATCCGGAAACATACATCTTTCAATAACATATGGACAGCCTTATTAAAGTCCGAGTTGGATGGAGGATGTGACCTCAAAATCCCAATTTCAGCCCCGTCTCGGATGCACCGTTCAGAGCCATCTATTTCAGCAAACAATCCAGACCTTTTGGAGGTTTACTGCTCCAAAATTCAGTCTTCTAATTGCCTCACCAGGTCTGTAAACTTGGTTTCTCCTACCAAGCAGTTCAAATACTCAAAACTTCCAAACTTTAACATAAAGTTACTTTGATGCAAGGCTCCCCTGGTCGTGCTGCCATTGACGTGCCCACCAAGACCTTGGATTCTCCATTTAGTGTCAGTAGTGAGGAGTCTTTGGGCTTCTTAAATGATTTTGATCTCAAGAGTAATGAAGAAATTGAAGGGGCAGACCTCTCTATTTTATTTGATGAAGCTGGCGCTCTTCCCTTCCAAGTCCCCTCAGAATTGCCTAAGGATCTGCTGCCCTTAGTGAATGATTGTGGCATCATCTTGGTTTAATAAAAGATTGATAAGTCTTACTCCCTCTTAGTCAATGATTGTGGCATCATCCGGTTGCATCTTCTTGCATGTCTCCAATTTTGAATGTTTTCCTTATGAGAGACTTTTCGTTATGCTTTGTTTTCAGTTCTCTTTGTTTTGGTTTGGTTTAGCTTAATTTTTTCTGTTTGGATTTCACTTTTTTAGCTTGATCATTGTGATTGTTTTTCTCTTTGTCGTTTTTTCCCTTTAGTTTTACCCAAGTTCATCTTTGTCTTAGTTTGTTTGGACGATTTTGTCCTCTTTTTTTGCTCTTTATATAATTCTCTTGTACTTTGAGCATTAGTGTTATTTATTATTATTAATAAAGAGGCCTGTCTCCGTTTCAATTTTTTTTAAGGATTTAAGTTTTTGTTAGTAGAAAGATTGAGAAGATTATGTGAGATTTCCTATGAAAACCCTTTCCAGAGAACACTAGGTTAGATGAGGCATTGTGTCTAGGTCGATTAGTTAGGGAGAGCTTAGACATCTGGAATTTGAAACTTCAGAATGAGGCCTTGCAATACCAATGATTACAGCAGTTTCTTATAAAGACATTGACCCTCACCCATTTGAATGGGCCCCATTACGTCATTTAAAAGGCACAACCAATAATACTTGGTTAGCCTCTCCCTCCTTTTCTAAATATGTTTTTCCTCTGGGTTGGGATGGCCTGAAGACCTATTTTTGGTCAGATTGTTGGTGTCTTGGTGGAGCACAAACTTCTTTGCCTAGATTTCCTTCTCTATTATCAATCTTCATCTAGGCAGCACTATATACCATTATTTCCCTTCTTTTTGGGTCCTCGTTTGTACAACTTGGGTTGTTGTAGCCTTGTCTAACTCAGGAGTTTGTGTGTATGTTGTTGCCCTTGCCTCTTTTTTATTCTTCAGTTATCTTCGTGGGAATTTGGAACATTAGGTGTTAGGTTTTCTAATTCTTCAAAAGGCTTCTCTTGCAATATCTTTTTCAACCTTTTAGCAGCCCTTGTTTCCAATGATCTTCTACTCACTATGGAAGGTGTATACTCCAAAGAAGGTCAATTACTTTGGATCGAATTTAGAGACTATTCTTATGTCTTTGAGACCAAAATGTTGTTTTCTCTCCAAGGAGGTGTTAAGGATCTATGTCATTTGCCAGGCAGTGCCAGTTTTCTTGCCATATTAGGGATCGCATGTTTGAGACCCTACAAGTGAGGTAGCTTGGTTCGTAAAAGAGATTGTTCTTGTACGATGGAGAAAGTGTTTCTCCATGGAAGCTGTCTTTGCACATCTGCTTGTTTTGCCATCAATAGGAGTATATGACTTGTGAGAAATAACAGGATCTTTAGAGGGTTTGAGAGGCCTTGGTTTTTAATTTGGCCCAATGACTTGCTTTGGGCAATATCCTGCTAGGGTAATCTGAGGGTGATTTCTTTTTGGGATTCCACGGTGGATAAGGTTTGGAAGAGGTTCACTTAATGGAAGAATAATATTCGAGGTATTTCACTTGGGAAAGAGTTGATGGAGTAAGAGGTTCGAGGAGGGGTAGAGCTTGGATATTTCATTTCTATCTCAATGAAAGTTGGTTTTGGTAAAAAACTGTGTGAGGATAGAAGAATTGAAAATTCAAATGATGCATAGTTTTCAAGATAAATTCTCAGATCTTTGAGATGTTTGGGTGCACCTTCTGATCCGAATGCTTTAATTTATTTTCTCTTTGTATTCTTTTTGTACTTTGAGAATTAGTCTCATTTCTGATTTAAAAAAGTTTAAATTCTCATATCCCTGAAGCCACACCTACAGATGGTACCTTCATTGCCAGGATTGTTTCTATAAATTGGCAATCTCATATGGGTAAGAGAAGTATGCTGGCAATAACTTTTCTCCCTCATATGGCATAAAAAGAGTGAGGTTTCACATTTTCTAATTGAGGAAAATAAGGATTTCATGTCTGTCATATTTGAAGTGGCCTAGCCTGGCTTTCCTTCAAATGAAATGATGCAGATTTGGGAATATGTTTTCTGTTGGATTTCCTTATATCTTTTGTAATATTTATTGTGTTTTATGTATACATTTCTATTATTTAGGTTTGGAATGTTTCTCATTGGTTGGTGGCTGTATATAAGAATACCTTGTAGTTGTTCTTAGAGAAGTAAGAAGAAATGCAATAAAATCTAATATGCAAAATTGTCAAGTAGTCATAAAGCCTTCACTTCTAGAATAGACAACTTATTTGTTCCCGGAATATACAAGAAGCCCTTGATTCCTAATTGGAAACTAGCAATTTTGGAGGAAATGAAAACTCTAAGCCAAGGTAATCAGCCCCTCCAATGTGTTTCACTGAAGGTAGGCAAATCCTTGATCCGGTCTTAATTGCAAACGAAATCGTGCGGAAGAATACCGAGCTAAGAGGAAAAAAGGGTGGATTTTGAAGCTTGTGCTTGAAAGGCCTTCGACCATGTGGATTGAGATTTCCTTGAAAAATTCGTGACCAGAAATTTTTTTGGTCAGAAGTGGATATCGCATTTTTCCTTCTCTTCATCTTTTAGAAAAATGTTGTTTTTTTCTCCATTTTTTCTTTCTTTATTTC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BLAST of CsGy3G017690 vs. NCBI nr
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BLAST of CsGy3G017690 vs. NCBI nr
Match: XP_008457115.1 (PREDICTED: nicastrin isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 296.2 bits (757), Expect = 8.5e-77 Identity = 175/338 (51.78%), Postives = 178/338 (52.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017690 vs. NCBI nr
Match: XP_022997757.1 (nicastrin [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 272.7 bits (696), Expect = 1.0e-69 Identity = 162/332 (48.80%), Postives = 168/332 (50.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017690 vs. NCBI nr
Match: XP_023525268.1 (nicastrin [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 272.7 bits (696), Expect = 1.0e-69 Identity = 163/338 (48.22%), Postives = 171/338 (50.59%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017690 vs. NCBI nr
Match: XP_022948878.1 (nicastrin [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 270.8 bits (691), Expect = 3.8e-69 Identity = 161/338 (47.63%), Postives = 171/338 (50.59%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017690 vs. TAIR10
Match: AT3G52640.2 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein) HSP 1 Score: 169.1 bits (427), Expect = 2.8e-42 Identity = 119/360 (33.06%), Postives = 138/360 (38.33%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017690 vs. Swiss-Prot
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BLAST of CsGy3G017690 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C4S1|A0A1S3C4S1_CUCME (nicastrin isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496866 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 237.3 bits (604), Expect = 3.1e-59 Identity = 152/338 (44.97%), Postives = 155/338 (45.86%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017690 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5Q8N6|A0A2P5Q8N6_GOSBA (Uncharacterized protein OS=Gossypium barbadense OX=3634 GN=GOBAR_DD32219 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 232.6 bits (592), Expect = 7.6e-58 Identity = 122/183 (66.67%), Postives = 136/183 (74.32%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017690 vs. TrEMBL
Match: tr|I1LMA4|I1LMA4_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max OX=3847 GN=100801506 PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 205.7 bits (522), Expect = 1.0e-49 Identity = 135/346 (39.02%), Postives = 156/346 (45.09%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy3G017690 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0B2QWJ0|A0A0B2QWJ0_GLYSO (Nicastrin OS=Glycine soja OX=3848 GN=glysoja_034806 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 205.7 bits (522), Expect = 1.0e-49 Identity = 135/342 (39.47%), Postives = 156/342 (45.61%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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