CsGy1G014170 (gene) Cucumber (Gy14) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACAATTAATAAATTCAACGTCTATTCCCTTGCAGTTAAAACCCCTTTGTCACTTGACACTGTAAACACAAAACATGCACCCGTCAATCATTCTTTATATTACACCCAAACTTCCAACTTCTAACCAACAACACCCTACACCACCATTGTAATTCTTATTATTTTCTCTCCTTCCTCTTTCTGATCTTCCTCTTTCCATTTCCATGGAGTTCCAAAGTGTACTTCAATTTCTTCACAATAAGTCCATCTTCGTCACCGGCGCCACCGGATTTCTCGCAAAAGGTCACCCGTCTCCCCTTTCTCGCTTTTAAAATCTCAATAAAAAGTAAAATTTAACTGAAACCTGCCAACTTCAATTGTTAAGTTCATCAGTAGTTTAATATGATCTGACGATAGGAAATTTCAAAGTTCACTCTTGCTTTTACAAAGATTGTACTTAAAAGTATATCCTACGAAAATGTGTTGAGATGTACATGAAAATTGCAGTCATGGTGGAGAAGATCTTACGAGTTCAACCAAATGTGAAGAAGCTTTATCTACTTATAAGGGCAGCGGACGAGAAAGCTGCGACACAACGCCTTAACACTGACGTGATTGGGAAGGAGTTGTTCAGGATATTGAAGGAAAAATGGGGAGAAAATTTTAGATCTATGATTTCAGAGAAGCTCGTGGCGGTGGCTGGAGATATCTCCGACGAACTTTTGGTTCTCAAAGAGTACTCTAAATTGAGAGAAGAATTGTATGACCAAATTGATGTCATAGTGAACTTGGCTGCAACTACCAACTTTGATGAGAGGTACAAATAGAATGAAATACACATAATTTTGATTCTGCATATATTCGTATACCTTTTTACATTTGAGATACTTAAATCAAACAAATAATTATACATTAAATGTTATTTTCTAGAGCTACTTAAATACTATTTTGGCTTTTAATATGGACTGATTTTAGTCTATTTAGTTTCATTAAAAATAGTTTTCATCCAAATTTATAATAATAATATTTACAAATATAGCAAAAATATCACAATTTATCTATCATAAACCATAAAGATTATTATATGTGTATATCATGATACATATAGACATAAATACTAGTCTATCTTGATCTATCACGATCCGTAGATAAATGATGATATTTTGTTATATTATGTAAATATTTTTGTTTATTTTGGTATATGTGAATATAACTCTAATAAGAAGGGTCTTTAACAAATCAATCATGGAATAAAATTATAAATTAAATCATGGGACAAAATTATAAATTAAACGAAAGCATATAAATTAAGATTGAACAATTAAGATCTTGTTTAACAACCATTTCGTTTTTTGTTTTAAAAATTAAACTTATTTTCATCTCATTTCTTATAATAATTTGTATCTTTCTTAACTATAATAGTTGAATGGGGAGACTTGTTTCTAAAAGCTATTTTTTAAAAAGTAAAAGTTCAAAATTTGTTTGGTTTTTTAAATTATTGGTAAATATGGATAATAATAAAAAAGAATTTTGAAGATGAAAATAGTCGAGTTAACTTAATTTTTAAAATATAAAATATGAAAATCAAATGGTTACTACATGTATAAAAACAAAAGTTAAATAACCTTTCAAACTACAAAAACTAAAACGATACTTTAACTTGCTTTTCTTGTTTTCAGATATGACGTTGCTCTTCATGTCAACACTTTGGGAGCTAAGCATGTTATAAACTTTGCCAAAAATTGTGTGAAATTGAAGGCGTTCGTTCATGTGTCCACAGGTTTTTCCTCTTCGAACCATCTCTTGTGAATTTACTTATTTGATGGGAAAATAAATATTAAACTAATTGAGTTTATGTTTAGATGAATCATATTATATGAATTTAATACATGTTGTCCTTATATAGATCTCATTAATTATTCACAACTTTTAATAATAATGGTAAGAAATTTAATTTGATACAACAAATTTCAATGCTAGTTGGATAATTCATTTAATGATTTTTGAAAGCATAATATATTTATTCATAAAAGAGAAAAAGATATGTTTTTTGTTTGATTGAGATGCCAATAAATGCATTCACGACTAAATATTAATTCGTTCGTTGTGAAGATCCGACTTTTGGAGTTATTTGTTATTTGTTTGAATCCATAATTTCAACCACTTTTTATTTTAATCTGTTTTTAGCTTTTGTATTAATTTTTTTTTGAAATAGTAATTTAGTTAATTTAGTGAAACTATTTTTATACCATCACAATGTTAGGGTTCATGTTTAACTCTAAACTTTTGGAAGTGATTTCCATGATTTTAAATTATCTATCTTTTATTTCTAAAATGATTTTAGAATTATCAACATCTCATTTAATAACTATTTGATTTTTGGTTTTTGGTTTTTAAAATGAAGTCTATAAACACTTAACTTTTATCCATTTTTAAAGACAATTTTTGGAAAAAAAAAGTTTTTCTTTTGTTGAAATTTGAGGTAAAAAATTAAACACTTGTATTTAAAAAATGGTATCCATCTAAGAAACTTAAAGGAAAATATCAAAATATCTTATCACTCAAATTAAACTCTTGTATTTAAAAAATGGTATACATGTCTTTTAATCACTAAAATCAATTTAATATATTGTGATTTTGAAATAGTAAAAGAATGTTTCTAAGGTGATTTTAAAAATGAAATCTTATCACAAACGGATCCAATGAAATCTTACAATGACAATAGCAAAATCATAAACACAAATGTAAAAATAAAATTTTTTAACGCCATGAAAACCACACCCACAATAAATGAAAGTGAGCCCTACCAAATATATTTATATTTGTTTATATCATTAATATTTTGGCTACTACAATTACATGTCTTCTTCCAACTCAAATAAATGAGCATTGTAAGCTCTACCTCCAATAGGATAATACACCTATGTACATGGTTAACCAAATATTTCTTCCTCTCATACCTAGTAGAGTACTAATTTGTTCAATATTGACTATACTGAATGAATATTTGAAATTTAATTGTTGATTTTGTTTGGTTAGCTTATGTCAGTGGCGTGAAGGAAGGGCTAATACTTGAATCCCCATATGTTATGGGAGACACTCTAAATGGAAAATGTGGCCTACAAATTGAAGATGAGTTAAAGCTTGTGGATCACAAACTATCTGACCTTCGAGCTGAGGGAGCTACCCAGCAATCCATCACTTTGACCATGAAAGATTTGGGTATACAAAGGTTGGTATATCTATCTCTATAAAAAGCACTATCATTTTTTTATTTCAACATTATTAATTACCGTAAACTTGTGGATACAAAAATAATAATTTTTTTTCTAAATTTTGGGTTTAGTTTAAATAATTTTATTTTTACAAAAATAATAAATATGGGTTATGAATATACTTCATTTATACAAATTTGATGAACGAGAACGAATTATGAATGGAATTGAACAGGTCACAAAATTATGGGTGGACAAACACATACGTATTTACAAAAGCAATGGGAGAAATGTTGATATCAGAATTAAAGGAAAATATTCCTGTGGTTATTATACGTCCTGCTATTGTTTCAAGTACTTACAAAGAACCATTTCCTGGCTGGGTCGAAGGTGTAAGGTATGCATTTTACATTTCCAAATACTTCATTATATACTTTTATTTTGAATAAAAATATCAATTTTATTAATATAAATTATTTTAAATCATGAATCTATTTGAAAATATTTATGAATATAACAAGATATAATTACTAGGGACATCAATAATCATCTATTAGTGGTTTATATGGTAAGCAGACTAATATTTTTCTTTATTTGAAAAAACAAACTATTTAATTATATACCTTCAAAGAACGAGGGTGGTATGAATTTAAACTCTAAGCTAATGAATGACTCTGACCACTTAAAGTCTAGAATTTCGTATTTTACATTCTATTTTACATTTGTATGTTTGAAAAAATTATTGGGTAAGACTTATAATTCATTTAATTGAACTATTAGGTTTTGTAAATAAATTAAATTAGATTCTTACTCACAATTCTATTTGAGAATTTTTATTTTAGATAAACAACATTTGGAGGAGGAAGGGTTCTTACACATATTTGAAAATTAATGCATGAATATGATTTTCAAAGGTAACTATATTGGGTTGTGTGAAAATTTGGGAGCTTAATTAACTAAAACTATAAGTTCAACATGATATATTTGATCAACTTAAATATGAAAGATGGTATAAATTGATATATTCACAGAAGAAAAAAAAGAAGTAAAAAAGAATAAAAGATCAAAGTTTACATTATTAATCAAATTATCAATTTAACCATCGTGGGTTGACATGGTGGTTAAAAGATAGACACGGACTCAATAACTAACTAAAATATTATAAGTTCAATATATGGTAGTCACCTACCTAAAAATTAATTTTCTACAAAAAAATTTACAGAAAAAAGAACAAAACACAGTAGAAAAGCATAACTAATTATACATTATTAATAAAAGTATAAGTTAATTAAGAACTATTTTCCCTTAAATAATGAATAATTATATTTGATGACCATTTTAGAAATAATAATTAAGGATATAAAAACATTTTAAAAAATTGTAAACTTTTTTGGATAGAGGTTTGCGTTTCTCGAAAAAAATATTATTGAATTTTTGAAAATTTAAAATATACCTTTGAAATTAAGAAATAAGTAAAATTAGATCAATTTTCATAAATATAACAAATCCGCAAAATATTTAGGGTCCTGTATAACAAATTGAAAATTTTCATGAAACTTACCGTTTTTTTTATTTCAAATTTTCTCTTCCTTATAATCGTTTTTCTTCTCTTTTATTCTGCTATCTTTCTTTTCCTCTTTTGCGATTTTTTTCTTTCCATTGTTTTTCTCTTCTTCTATAATTTTTTTAAATTTTTTCTCAAACTATTATTTGGTTCACGATCGTGTACCAAATACAAAATATCTATTTTTTTCTAAACTGTTACTTGGTTGTTTAAGATTGTGTGTCAAATATAAAAGAA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MEFQSVLQFLHNKSIFVTGATGFLAKVMVEKILRVQPNVKKLYLLIRAADEKAATQRLNTDVIGKELFRILKEKWGENFRSMISEKLVAVAGDISDELLVLKEYSKLREELYDQIDVIVNLAATTNFDERYDVALHVNTLGAKHVINFAKNCVKLKAFVHVSTAYVSGVKEGLILESPYVMGDTLNGKCGLQIEDELKLVDHKLSDLRAEGATQQSITLTMKDLGIQRSQNYGWTNTYVFTKAMGEMLISELKENIPVVIIRPAIVSSTYKEPFPGWVEGVRTIDSLAVAYGKGKITCFLGDVNALVDVIPADMVVNAMLVAMVAHASQLSSYTIYHVSSSMRNPIMYRKLQEYGFHYFSANPWINKDGQPVKVGKVTILNDMASFHRYMTIRYLVFLKGLEVLNIALCHYFDGILFNFNRKIKYVLRLVDLYGPYLFFKGVFDDINTEKLRIAAKANGIETDLFYFDPKSINWDDYFMNIHIPGVVRYVFR
BLAST of CsGy1G014170 vs. NCBI nr
Match: XP_004139568.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: fatty acyl-CoA reductase 3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 973.0 bits (2514), Expect = 3.8e-280 Identity = 490/492 (99.59%), Postives = 490/492 (99.59%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. NCBI nr
Match: XP_008462137.1 (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 3-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 931.0 bits (2405), Expect = 1.6e-267 Identity = 465/492 (94.51%), Postives = 480/492 (97.56%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. NCBI nr
Match: XP_008462145.1 (PREDICTED: fatty acyl-CoA reductase 3-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 922.5 bits (2383), Expect = 5.8e-265 Identity = 461/488 (94.47%), Postives = 476/488 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. NCBI nr
Match: XP_022152881.1 (alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 797.3 bits (2058), Expect = 2.8e-227 Identity = 397/495 (80.20%), Postives = 447/495 (90.30%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. NCBI nr
Match: PON84334.1 (Fatty acyl-CoA reductase [Trema orientalis]) HSP 1 Score: 704.5 bits (1817), Expect = 2.5e-199 Identity = 343/492 (69.72%), Postives = 415/492 (84.35%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TAIR10
Match: AT4G33790.1 (Jojoba acyl CoA reductase-related male sterility protein) HSP 1 Score: 599.7 bits (1545), Expect = 1.6e-171 Identity = 294/491 (59.88%), Postives = 373/491 (75.97%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TAIR10
Match: AT3G44540.1 (fatty acid reductase 4) HSP 1 Score: 519.6 bits (1337), Expect = 2.1e-147 Identity = 257/488 (52.66%), Postives = 356/488 (72.95%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TAIR10
Match: AT5G22500.1 (fatty acid reductase 1) HSP 1 Score: 506.5 bits (1303), Expect = 1.8e-143 Identity = 254/488 (52.05%), Postives = 355/488 (72.75%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TAIR10
Match: AT3G44550.1 (fatty acid reductase 5) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 2.3e-138 Identity = 250/492 (50.81%), Postives = 352/492 (71.54%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TAIR10
Match: AT3G44560.1 (fatty acid reductase 8) HSP 1 Score: 481.9 bits (1239), Expect = 4.8e-136 Identity = 249/498 (50.00%), Postives = 352/498 (70.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q93ZB9|FACR3_ARATH (Fatty acyl-CoA reductase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 599.7 bits (1545), Expect = 2.8e-170 Identity = 294/491 (59.88%), Postives = 373/491 (75.97%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9XGY7|FAR_SIMCH (Alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase OS=Simmondsia chinensis OX=3999 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 582.0 bits (1499), Expect = 6.1e-165 Identity = 283/490 (57.76%), Postives = 373/490 (76.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9LXN3|FACR4_ARATH (Probable fatty acyl-CoA reductase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 519.6 bits (1337), Expect = 3.7e-146 Identity = 257/488 (52.66%), Postives = 356/488 (72.95%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q39152|FACR1_ARATH (Fatty acyl-CoA reductase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 506.5 bits (1303), Expect = 3.3e-142 Identity = 254/488 (52.05%), Postives = 355/488 (72.75%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q0WRB0|FACR5_ARATH (Probable fatty acyl-CoA reductase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 4.1e-137 Identity = 250/492 (50.81%), Postives = 352/492 (71.54%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CGS1|A0A1S3CGS1_CUCME (Fatty acyl-CoA reductase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500564 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 931.0 bits (2405), Expect = 1.1e-267 Identity = 465/492 (94.51%), Postives = 480/492 (97.56%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3CGA9|A0A1S3CGA9_CUCME (Fatty acyl-CoA reductase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500564 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 922.5 bits (2383), Expect = 3.9e-265 Identity = 461/488 (94.47%), Postives = 476/488 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5EFP1|A0A2P5EFP1_9ROSA (Fatty acyl-CoA reductase OS=Trema orientalis OX=63057 GN=TorRG33x02_198990 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 704.5 bits (1817), Expect = 1.7e-199 Identity = 343/492 (69.72%), Postives = 415/492 (84.35%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TrEMBL
Match: tr|M5WHQ7|M5WHQ7_PRUPE (Fatty acyl-CoA reductase OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_6G126900 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 703.4 bits (1814), Expect = 3.7e-199 Identity = 339/492 (68.90%), Postives = 406/492 (82.52%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G014170 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2C9VYC4|A0A2C9VYC4_MANES (Fatty acyl-CoA reductase OS=Manihot esculenta OX=3983 GN=MANES_04G005400 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 701.4 bits (1809), Expect = 1.4e-198 Identity = 343/495 (69.29%), Postives = 417/495 (84.24%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber Gy14 genome (v2)
Date Performed: 2018-09-25
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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