Cp4.1LG12g11440 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)

NameCp4.1LG12g11440
Typegene
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (Zucchini))
DescriptionUnknown protein
LocationCp4.1LG12 : 8664522 .. 8671933 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CGATATGCAGGTTTCGTTCCGGCTACTAGAAGTCCTCCGTTCGTGTTTCAAGTCCAGTACGATATTTTACTTCACTAGTGTAGCAATTCAATCGTCAGTTTCTGCAACTAGAAATGAATTTTGTTGAAATATCTTAGATGATTTTTTAGTTATGTCTGATTGCTTACTACCTTTTACTTGGAATTTTCTTGTTCGATTTTATTTCCATGTTTTTTTTCTTGAAATTTTCAGTTTCTGCAACTGGAGTTGAACAAGGAGATGCCGTTAGTGTGCATTATGATCCTATGATTGCTAAGCTTGTTTGGGGAGAAAATCGTGTTGTTTGAGGTAAATCTAGTCAGAATTAGTTTGCGTTGCGGAATTTACTGTTCAACATGATTTTCTTTTTGGACAAGAAACTAAAGTTTTCATTGAAAATAAGAATGATTTGGAATTTGAAGTAGTGAAGGTGGTAGACTTGGTTGCTTCAATGGCTAATATAGTTATTTTATAGCTGCTATTGATCAAGTTGCCTTGATGGCCAAATTTACTTGACCTTTTCATTTAGTTTATGGCAGTTATCTTAGGTGAGAGTCTAATGATTCAATATCACATTGCTTGTAGGTTTATGTTCAGGAGGTTTCTGACTTCGGCTTAGCCTTTTTAATTGACAGTCTGCTAAAATTGTGTAAACATTTTGTAGCTAATTTTCAACCCTTCAAAAATTCAAATTCATCCAGAATCATTGAGGCGATTTCTCTTACGTAAGGTTTTAGGTGTCCCAACCAACACCCAACCCCACCGCTAGCAGATATTGTCCTCTTTGGACTTTCTCTTTCAGGCTTCCCTTCAAGGTTTTTAAAACACGTCTACTAGGGAGAGGTTTCTACACCTTTATAAAGAATGTTTCGTTCCTTTCTTCAACCGATGTGGGATCTCACAATTCACCTCCTTGGCCAGCATTCTCGTTGGCACTTGTTCCTCTCTCTAATTGATGTGGGATCTCACATAAACTTTCTATTAAAACTTGCAAAATCATTATGCATTTGAACGTAGGGACGTGGAAACTCATTTTATTGAGCGCTATAAAGATGACCTCTTTGTCGATCCTTCTAATCTTTTGATGGCAGAAGAAGGATATGAAGCTGCTGGACTTGATGCCCGTCTAGCTGCTGCTTGTATCGTCAGTTTGGAACATTCTAAACTCACTGAAATTCTTCTGGTATTGCAAGCTCTTATCTATTTCTCTGACCTTAATTGTTTTAGAAAGCACTTCTTAAATTGAAAATTCTATATCTTATCAGGGAATGATTTATATTCAGTATAGAGTCCTCATTGTGCTAGGCGCACACTGGAGTTTGAGTGGGAGAATCAATATGATAGCAGTGTCTCCAAGCCGTTTGCACTTACAAAATCACCTACCAGCATGATGGGGCCTTTTTAATTGAGGTACTGTATTCCTTTTAGAGGCACACTCAATTAGCCATTCAATTGAAGTCTTGGTTTTTGATTTCTTATTTGAATAATATCCCCTGTATTTATCTTCTCCTTTACAAAGATCCATGGGAAGAATTTCACTTTCTTAGGAATTTTAGCCCTCCAAATCACCTTTGACCGATTAATATCAATAGGAACCCAGTGAATGCGTAACTGAGAAGTTAAGGAATTGACCGAAAATGGAACATCTTTGTTAAGGGTCCAAGGTTTGGAATCCTCTAAAGCTGACGACACATTGATTATGCCTAATCAAAATGTACTATAGAGGGTAAGATTGGTTGTCAATCCTTTCGACCTTGGTCGTATTCTATCAAAGCGGTTAATCTTACCTGCTTTCTAGCCTACAACAAATGTTTTTAAAACCTTTCTCTCAACCCCATTTTCTAAAATTCTTTTCTCAGAAACGGGGTAGAAGCTGAGAGGTAGGCAAGTTATGCCACCACCGTTCCAAATTCAAGTTGGCCGACTTGCTCTAGGGAACGAGCAAGTATTGCACAATCACTTTACACAATATGGACAGATTTTCCCCCCCTGACGATTTCATAACTTACACTGTCAAATGAAATTGTTGCTCCACGAAGGATTTAGACTCTCTTACTAGACTATCCTTTTGTAAGAACCTTTGGAAGTCCCCCATTCCTAGGAAATGTAAATTCTTTTTCGATCTCTTGTTTGTGCTCATGGAAGAATAGTCTGGTTTAATGCAACGAGGGGATGTGAAACCTTATTTGAAAGGAATTACACCTTTCTCGAGTCTTGTTTTGTATGTCCTAAATTGCAATGCTAGGAGACAAAATTGGTTTAGACACATACTTTCGATCAAAAGATCAGATTCGAATCTCCCAACCCCAAATATTAGACTCAAAAGACAAAAAGAAACCGAAAAGGTCCAATGCTAGAAGAACTGTTGTTACATCGACCTTAGAAAAAAACAATCTAACAATGCCCGATTTACCCCCTGGAGAGAGGAGGAGGTGACAAACAAAAAAAGCTTTGTTTGTTACCTAATCTAAGAAAGTTGTTCATAGTTTAGTTCTTATTGTAGCTATTGTTTCAAAGCAAAGTTTTAGAAACTGAAGCAGTAAAAGCTTATAAATGAAAATGAAACATGTTCATAAATAGGATTTTCCTTTTCGATTTTATGAGTTGAGACATTCATTTTTCTTTGGTACAATGTATTGTACGAAGGAAATTATGGTGAGAGGTCTAATTGATTCTTAGAGAGTTGCGTGAAGGGTCGGGAAAGCTTCTTATATCATCAATAGTGCATACCATACATCAATTATTTGACATATCATAGATAGTACAGTCTTATTGGATTCCACGCTATTCCTAATTTCTTATTTTATGACGAACAATGAATGAAAGTAGCATAGAAAAATTGTCGCTTTTTTAAGCTGACTAAAAAGCACACCAAATTTCTGTACCTCAACATACACTCCTTATTCAATTACTGAGAGTGAACTCCGTAACCTTTGAAGTCAGAAAAAGAGGTCAGTGCAGTGGTTGACACTTTCGCTCCTGAGCCTATACTGTCTCATTGCTTCTCGCCTTCCCCTATGTATTCTTATTCTTTAACTGATCTTGCTTGATCTTTGAACTGTAAACACTATCGATTCATTCTACTTAGCTACTGAACCTGATTCCTACTTAACTACACCTGAACCAGATTAAACTGATCCTTCTCCTTATTACCATCTGTTATTGTCTTATTCTTTCACTATGTTTACGGTCTCGTTGCTTTGCTCCTTGCCTTGATTCCTTCTTTCTCTCCGTAACCCATTATTGATTGATTCTTTCTCCTTCAACTGATTTAAGTGATTCAGCTATCGGTGTCTTCTCTGTTCTTTCCCTGAACTATAAGGAGGGAATATTCAAAAAGTTGATAAGAATGCATTCATATCTTTCTTTGCTAACTTAGATCGAGTTGTGTTAGTTTAAGCTAAGCTGTTCTGATCCTTTGTTTAATAAGCTCAACCGTTCTTACGTAAATTTGCCCAATTGAAATTGAGTTAAGTTAGTGTTGGTTGTTTTGCAATTCGTTCGACAATGCCAGTTATTCAAATTACAAGTCTATCCAATTGTGGATAGAGTTCGTTCGAGCTCGTTCAAAATTTTGTAAGAATTAAATTGATCTTAGAACATTGAATTTTATTTTGTAGAAAAAAATATATCATACCTACCCTAGCTAGATCTAAGTTGGATTGATCCAAGTTTTTGAAAGTAATGAATTTCATTTTCATCCATTACTTTGCAAATGCTTTCAACAATACTATGGATGACTTTTTGAACTGCTACTAGTGGTAGTGGGTGAGTTTGCTTTGTGTGCCTCTTTATATTTGCTTTTTTATTTTTATTATTTTTTTAATGAAAAAAATCAATTTATAAATGTCGAGGTCATGAATGAATAGTAGTGGATTTCTTTAATTATGAGTGATTTTTTCATTCTTCTTGTCCTCTATTATGTATGTTTAACGATATATAAATGAACTGAGTTTATATCTGAATGAGAGCACTATGAGAATATAAAAGTATGGGTAAGAAAGTTTACAAAATTGGTAGTTACCACTATATCACTTTTTGGTGACTTGGTGATAGGAACTTCGAAATTAAGTGATGTAACAATTTTTTTTTTTGGAAACAATGAGTAATGACAAAACATGTTAAAAACACTCACTTTGGACTTTACATTTCTTAAGTTCGTGAATTTATTAGACGACATCAAAATTTCAAAGACCTGGTAGTTGTTAATATTTTTTAGTTTTCTAAGACCGAACCAACATGATTGTAAATGTTTGTGCACTAAACTTATAATGTAACAAATTAAAAACATATACATTTCAATATATAGTTGACAAATTAGTTGTATGTAAATGTTAGAGTTTTAAATCATTCCGCTCCACGTAGTATTTATTTATTTTTTTAGAAAAACATATAATTTAAATTATTTGATATTTATATAATAAAGACTCAGAAACAATCCTTGGCTGTAATTGCATTACGATAGGGCAATACGACAAGACGAAAAAAAAAAAACCTAATAAAAAGAGAATAAAACCAATAGGGTCATTTCAGGAATTTCACGAAAGAAACCAAAATTTGTACGGAACATCCAAGGAGGAAGAAAACTAATAAATAAAATAAAAATAAAATACCGTTAAATCCGTTGAAGGCAAAGCGTGGCGTATCAGAGGGCCCGATTCTTCGATGTTTTTTGATTTGGCATTCAAAATCCCGAAAAGAAAATTCTCCCCCGAAAATTCATTCATTTTGCATAATTTTTTTTTTAATAATAATAATAAAAAAAAAATCTCCATTTAATCGATTTTGTTATTCTCCATGTATCTTCCTTTTTTCCGATTCCCTCTCTGAATTTGCCAATTTTTTCCTCTATAAGTTGTTGTCCACAAAACCCACCCCTCTCTTTCGCTTTCTCCCACCAATTCAACGATACCCATCTCCTCTTTGTTCACTATTTCTTTTATTTGGGATATCCCCTTCCGATTTCGGTGAAGGTTTTTGGGTTCTTCATCCTGTTCTTGTTGTTTTTCTACGATTCTTGGCGATTCTGCATGTGGGTCGGTTTTCTCTGGGCTTCTTTGTCGCCCAAACTTGCAGAAACTGATCGAAGATAGTAAAATTTCACGGTTCTAAGCTGCTAGATTTGTGGGGTGGTTCGAACACTGGCTGCTTATCGAGTTTTTAATCTTCCAATACCATAATATTTTATTTGTCGTTTGAGTTCCTTGGTTATTGTTTTTTTTATATATATAAAAGAAACAAAAGATGTGTTGAGAGGTTTCTGGTTGTTTGTTTGTTTGTGTTTTTAGATTAGAATTATGGTTGTTTCGTTGAACTGGTAACGTATTGCTTGTCGTCTTCTTGTCATTTTCGTTAAGTTTTTTGAACCAATTTCTAGGTCTAGTTTTTATTGTCTTCCATGTGTTTGTAAAAATGTCCCTGTGTTTTTTTTGAATTCCTTTGTTTTCCTTTTTCCTCTTTACTTTCAATCTATCTGTCAAAGCTTTATTGGAACATGGATTTAACAAATGGGGGCAGGGCCGGCAAAGCTCCGATAGCGAATAATTCCGGTACCGAAGTAGCTGATATTGTTTCTGGTAAGTCTAGCAATCCCCAAGAGAATGATTTGGGATCAAAGTTGGGGATAGGAAGCAAAAGCAACAAGGATATGGTATTTCGTGCTGATAAGATTGATTTCAAGAGCTGGGATATTCAGCTGGATAGACACTTGAGCAGGGCATGGTCAAGGGACAGGGAAGTGCCTGCCAAAAAGGAAGAATGGGAGATTAACTTGTCTAAACTTGATATCAGATATGTTAAAGCTCATGGCACTTATGGTACTATTTACAGAGGAAACTATGATGGCAAAGATGCTGCAGGTAATTTGCACCTCGTTTTCGAGTATTTTTCGCAGTCTAGACAATCATCGTAATGATCGACCATGTGTTCTTGATTCGATATGGATCAGTTTTCAAATGATTAAGCCAGTCCATCTTTGTTTTGAGTAATTTGATAATGATGCCTTTTTCCTTATTGAAGCTGACATAGCTAATTAAGTTTAATGTGATCAAAAGATGTTGAATGTGGTTCCTATGTTGGTAGTCTTCCTATAAGAGAATTTCTCTGACAATTATAGAGTTGATAACGTTTTGGAAGTACTTTAGCTCCATGCATTAGATGATTACTGGACGACATAGTCGAGTTTTTGTTTGTATTTTCGCTTTTATGACGATGTTCTGAATATTGTAGTGAAAGTGCTTGATTGGGGGGAGGACGGTGTTTCCTCCGTTGCTGAAATTGCTGCTCTTAGAGCATCTTTTCGCCAGGAAGTTGCTGTATGGCATAAGCTTGACCATCCCAATGTTGCCAAGGTCAAGTATCTTTTACATGTAGTGTATGGTATTACAGTATCTCAAACAGGTCAAACCATTCATTTTTACTGTGATTATTCTAATAGGGAAGGCTTTGATTCTTTACATTTGGTACTTCCACTGTTCTTCATGTTCATATTCTCCTGCTGAAATGTCTAACTATTTTGTTTTCCTGTTCGATGGGGCTCTTGTGTTCATATGTGAAGATCAAATGATAAGAACTTTATGATACAGTTTTATGGAGCTTCAATGGGGACCTCCAACCTTAAAATCCCTCCCAAAAGCCCATCACTTGACAGTAACCAATCTTTTCCTTCAAGGGCTTGCTGCGTTGTTGTTGAGTATCTTCCAGGTGGAACGCTAAAGGGCTTTTTAATCAAAAACAGGAAAAAGAAACTTGCATTTAAGGTTGTGATTCAACTTGCTTTGGATCTTTCTAGAGGGTAAGGAAACGTTAGATTCTACAAATCATTCCAATATGCTGAGTTTTGAGGCAGTTGATTATTTTGATCTTGCAGTTTGAGTTATCTACACTCCAAAAAGATTGTACACCGTGATATTAAGACGGAGAACGTGCTGTTTGATGCTCAGAAGACTCTCAAAATTGTTGATTTTGGCGTTGCTCGAGTCGAAGCGCAGAATCCACGGGATATGACTGGAGAAACTGGCACGCTCGGTTACATGGCTCCCGAGGTTCCTTCATTTTTTTCTCTAAGATCTTATGGCTGATGATAATTTGCTTTTCATTTCAATACAGTTCATTCAACAGATCCTTTTTCTACAGGTCCTTGATGGTAAGCCTTATAATCGAAAATGTGATGTCTACAGTTTTGGTATATGTTTGTGGGAAACATATTGCTGCGATATGCCTTACCCAGATCTCAGTTTTGCTGAAATTTCATCTGCAGTTGTACGCCAGGTATGTTTATTTCATTAACTACACAATTATTGACATTACAAATACGAAATGGTATGCTTTAACTTCGAGAACGTTCTTCTTAATCTACCGTCATTGTAAGAGTATTGTTTTCTTTTTTCGGGTGG

mRNA sequence

CGATATGCAGGTTTCGTTCCGGCTACTAGAAGTCCTCCGTTCGTGTTTCAAGTCCAGTACGATATTTTACTTCACTAGTGTAGCAATTCAATCGTCAGTTTCTGCAACTAGAAATGAATTTTGTTGAAATATCTTAGATGATTTTTTAGTTATGTCTGATTGCTTACTACCTTTTACTTGGAATTTTCTTGTTCGATTTTATTTCCATGTTTTTTTTCTTGAAATTTTCAGTTTCTGCAACTGGAGTTGAACAAGGAGATGCCGTTAGTGTGCATTATGATCCTATGATTGCTAAGCTTGTTTGGGGAGAAAATCGTGTTGTTTGAGGGACGTGGAAACTCATTTTATTGAGCGCTATAAAGATGACCTCTTTGTCGATCCTTCTAATCTTTTGATGGCAGAAGAAGGATATGAAGCTGCTGGACTTGATGCCCGTCTAGCTGCTGCTTGTATCGTCAGTTTGGAACATTCTAAACTCACTGAAATTCTTCTGGGAATGATTTATATTCAGTATAGAGTCCTCATTGTGCTAGGCGCACACTGGAGTTTGAGTGGGAGAATCAATATGATAGCAGTGTCTCCAAGCCGTTTGCACTTACAAAATCACCTACCAGCATGATGGGGCCTTTTTAATTGAGGGCCGGCAAAGCTCCGATAGCGAATAATTCCGGTACCGAAGTAGCTGATATTGTTTCTGGTAAGTCTAGCAATCCCCAAGAGAATGATTTGGGATCAAAGTTGGGGATAGGAAGCAAAAGCAACAAGGATATGGTATTTCGTGCTGATAAGATTGATTTCAAGAGCTGGGATATTCAGCTGGATAGACACTTGAGCAGGGCATGGTCAAGGGACAGGGAAGTGCCTGCCAAAAAGGAAGAATGGGAGATTAACTTGTCTAAACTTGATATCAGATATGTTAAAGCTCATGGCACTTATGGTACTATTTACAGAGGAAACTATGATGGCAAAGATGCTGCAGTGAAAGTGCTTGATTGGGGGGAGGACGGTGTTTCCTCCGTTGCTGAAATTGCTGCTCTTAGAGCATCTTTTCGCCAGGAAGTTGCTGTATGGCATAAGCTTGACCATCCCAATGTTGCCAAGTTTTATGGAGCTTCAATGGGGACCTCCAACCTTAAAATCCCTCCCAAAAGCCCATCACTTGACAGTAACCAATCTTTTCCTTCAAGGGCTTGCTGCGTTGTTGTTGAGTATCTTCCAGGTGGAACGCTAAAGGGCTTTTTAATCAAAAACAGGAAAAAGAAACTTGCATTTAAGGTTGTGATTCAACTTGCTTTGGATCTTTCTAGAGGTTTGAGTTATCTACACTCCAAAAAGATTGTACACCGTGATATTAAGACGGAGAACGTGCTGTTTGATGCTCAGAAGACTCTCAAAATTGTTGATTTTGGCGTTGCTCGAGTCGAAGCGCAGAATCCACGGGATATGACTGGAGAAACTGGCACGCTCGGTTACATGGCTCCCGAGGTCCTTGATGGTAAGCCTTATAATCGAAAATGTGATGTCTACAGTTTTGGTATATGTTTGTGGGAAACATATTGCTGCGATATGCCTTACCCAGATCTCAGTTTTGCTGAAATTTCATCTGCAGTTGTACGCCAGGTATGTTTATTTCATTAACTACACAATTATTGACATTACAAATACGAAATGGTATGCTTTAACTTCGAGAACGTTCTTCTTAATCTACCGTCATTGTAAGAGTATTGTTTTCTTTTTTCGGGTGG

Coding sequence (CDS)

ATGGCAGAAGAAGGATATGAAGCTGCTGGACTTGATGCCCGTCTAGCTGCTGCTTGTATCGTCAGTTTGGAACATTCTAAACTCACTGAAATTCTTCTGGGAATGATTTATATTCAGTATAGAGTCCTCATTGTGCTAGGCGCACACTGGAGTTTGAGTGGGAGAATCAATATGATAGCAGTGTCTCCAAGCCGTTTGCACTTACAAAATCACCTACCAGCATGA

Protein sequence

MAEEGYEAAGLDARLAAACIVSLEHSKLTEILLGMIYIQYRVLIVLGAHWSLSGRINMIAVSPSRLHLQNHLPA
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG12g11440.1Cp4.1LG12g11440.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
Cp4.1LG12g11440Carg07271Silver-seed gourdcarcpeB0158
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
Cp4.1LG12g11440Cucumber (Gy14) v2cgybcpeB310
Cp4.1LG12g11440Cucumber (Gy14) v2cgybcpeB902
Cp4.1LG12g11440Cucumber (Gy14) v2cgybcpeB906
Cp4.1LG12g11440Melon (DHL92) v3.6.1cpemedB148
Cp4.1LG12g11440Melon (DHL92) v3.6.1cpemedB147
Cp4.1LG12g11440Melon (DHL92) v3.6.1cpemedB151
Cp4.1LG12g11440Melon (DHL92) v3.6.1cpemedB171
Cp4.1LG12g11440Silver-seed gourdcarcpeB0076
Cp4.1LG12g11440Cucumber (Chinese Long) v3cpecucB0159
Cp4.1LG12g11440Cucumber (Chinese Long) v3cpecucB0185
Cp4.1LG12g11440Cucumber (Chinese Long) v3cpecucB0189
Cp4.1LG12g11440Wax gourdcpewgoB0194
Cp4.1LG12g11440Wax gourdcpewgoB0197
Cp4.1LG12g11440Wax gourdcpewgoB0203
Cp4.1LG12g11440Wax gourdcpewgoB0212
Cp4.1LG12g11440Cucurbita pepo (Zucchini)cpecpeB157
Cp4.1LG12g11440Cucurbita pepo (Zucchini)cpecpeB183
Cp4.1LG12g11440Cucurbita pepo (Zucchini)cpecpeB192
Cp4.1LG12g11440Cucumber (Gy14) v1cgycpeB0151
Cp4.1LG12g11440Cucurbita maxima (Rimu)cmacpeB371
Cp4.1LG12g11440Cucurbita maxima (Rimu)cmacpeB520
Cp4.1LG12g11440Cucurbita maxima (Rimu)cmacpeB900
Cp4.1LG12g11440Cucurbita maxima (Rimu)cmacpeB902
Cp4.1LG12g11440Cucurbita moschata (Rifu)cmocpeB335
Cp4.1LG12g11440Cucurbita moschata (Rifu)cmocpeB479
Cp4.1LG12g11440Cucurbita moschata (Rifu)cmocpeB839
Cp4.1LG12g11440Wild cucumber (PI 183967)cpecpiB162
Cp4.1LG12g11440Wild cucumber (PI 183967)cpecpiB163
Cp4.1LG12g11440Cucumber (Chinese Long) v2cpecuB160
Cp4.1LG12g11440Cucumber (Chinese Long) v2cpecuB161
Cp4.1LG12g11440Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cpelsiB113
Cp4.1LG12g11440Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cpelsiB119
Cp4.1LG12g11440Watermelon (Charleston Gray)cpewcgB126
Cp4.1LG12g11440Watermelon (Charleston Gray)cpewcgB147
Cp4.1LG12g11440Watermelon (97103) v1cpewmB131
Cp4.1LG12g11440Watermelon (97103) v1cpewmB150
Cp4.1LG12g11440Melon (DHL92) v3.5.1cpemeB119
Cp4.1LG12g11440Melon (DHL92) v3.5.1cpemeB121
Cp4.1LG12g11440Melon (DHL92) v3.5.1cpemeB124