Cp4.1LG12g04250 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)

NameCp4.1LG12g04250
Typegene
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (Zucchini))
DescriptionNuclear pore glycoprotein p62
LocationCp4.1LG12 : 3189150 .. 3204115 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
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mRNA sequence

AACCCCCTAAAACCCTCACTTCACAGTCTCTGCCGCCGGAGATCGATCCATCGGCGTTCAATCAACATGTCGGGTTTCTCCTTCGGTTCTTCCTCCTCCCAATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCGTTTTCGTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCGTTCGGATCATCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCAAACCCTAGTTCCTCTTCCTCTGCATTTTCCAATCAAACCTCCAATCCTCCCTCTTCCACTCCCTTTGGCTTTGCCTCTTCTCCTTTTCCCTCTTCCGCTTCCTCTCCTTTCTCTTTCTCCCTTCCCGCCGCTTCCACTGGGGTCTCTTCAGGAAGTTCAGGTTCTTCATTGTTTGCGGCTTCTTCATCCTCAGGAGGGTTGAGTTCTTTCGGGTTTGGGGTTTCATCTTCATCAGGAGGCTCGTCTGCTCCTTCATTTGGGGCTGCTCCGACCTCTGGGAGCTCACCTGTGCCCTCATTTGGGGCTGCTTCGGCCTCTGGGACCTCATTTGCGCCCTTGTTTGGGTCTGCTCCGTCATCTGGGAGCTCACCTGTTCCCTCATTTGGGGCTGCTCCGGCCTCTGGGAGTTCAGTTGCGCCCTTGTTTGGGTCTGCTCCGTCCTCTGGGAGCTCCCCTTTGCCCTCGTTTGGGGCTGCTCCGTCCGCTGGGAGCTCACCGTTGCCTTCGTTTGGGGCTGCTTCGTCCTCTGGGAGCTCATCTTCGCCCTTTTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCCTCGGCTCCGTCCTTGTTCGGAGGGGTGTCTTCTGCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCACCCACTGCAAGTCCGGGGTCATCGATATTTGGAGCTTCTGCTGCCGCTTCAGGTTCAAGCTCCTCCCTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGCTTCATCTTCTTCGGTATCCACTTCGAACTTGTTTGGATCATCTTCATCATCTGCATCGACTTCTCCATTCCAGAACTCTTTTTCTTCGAGTTCTTCCCAGAATTTGAGTTCGTCTTCACCATTTGCGGCTTCTTCTTCTGGGTTCTCATTTTCGACCACTTCTTTGTCCAAAACTACTAGTATTACCGCAGCATCTTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCATCGGCATCTCAATCTTCTTTCGGGTTCAGTATTAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTTCTGCTCCGGGCACTACAGCTGCGAAGCCTACTTCTCTATCGTTTTCAACTTCTGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTTACAACCACCAGTGCTTCCACTCCGGCTGCAACTAGCACAGCTCAGCCATCCTTCTCCATGCCAGCTTTTAGCTTGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTATCCATAGCAGCATCCTCCGCTCCCTCAACTACTTCTTCAGGTGCTGCGAGTTCATTCACCGGTTTTGGCGTCACAAGCACGGCTGCTTCATCAAGTGCCATTGTTTCCTTGTCGTTGCCAACCAAATCATTGACTGCTGCTTCATCATCCCAAGCACCAGCCTCTTTCGGTTTCTCTTCTCTTGCTTCCGCTTCCGCTGCTGCCACCACCACGTCTGGTTCCAATGCTTCCAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTGAGTGCAACAGTGTCTGCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATCAAGGAATGGAATGCGGAGCTTCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGGAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTTTGCAAAATCGGGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTTGTTGAGACCCAAACTGAGCTGGAGAAGAAATTGGAGCTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCAAAGTGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTCCTTGACGATGAAGCTGCATCTACTAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAACGAGAACTTGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAGCCAGGGAGGAGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACGCCGTTAGATGCAGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTGAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCCAGGGTCCTGCTGCAGATCGTGAATTGTTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTAATCTGTAAGCTGGTTTCTGTTTTAACTGTTGCGAAGATGATTTTGAAATTAGTGTTCACAGGCCTTAACACATTCACATTTGAGGTGTTTCCATTTTTCTGCTTTTTTAAAGGAATCATAAGTATAAGGCGGGCAATGGAATTTACGACTTTTTAGATGAGATGGGGATATTTTAATTCACAAATTATGCTCAAGTTGATGCACATAAACTTTTAGTTCTCATTTATGTATCTGTTACAACTTTCCTGTGCCAGATCTCTCCATTTATTCTCACATGGTGTTTGAACTAAAAAGAGAGAAGTTAACTCTAAATTATTCTCCAACTAAATATAAACTTTGGAGCTTAATATTTTGATATTTCTATCTTTCTTC

Coding sequence (CDS)

ATGTCGGGTTTCTCCTTCGGTTCTTCCTCCTCCCAATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCGTTTTCGTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCGTTCGGATCATCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCAAACCCTAGTTCCTCTTCCTCTGCATTTTCCAATCAAACCTCCAATCCTCCCTCTTCCACTCCCTTTGGCTTTGCCTCTTCTCCTTTTCCCTCTTCCGCTTCCTCTCCTTTCTCTTTCTCCCTTCCCGCCGCTTCCACTGGGGTCTCTTCAGGAAGTTCAGGTTCTTCATTGTTTGCGGCTTCTTCATCCTCAGGAGGGTTGAGTTCTTTCGGGTTTGGGGTTTCATCTTCATCAGGAGGCTCGTCTGCTCCTTCATTTGGGGCTGCTCCGACCTCTGGGAGCTCACCTGTGCCCTCATTTGGGGCTGCTTCGGCCTCTGGGACCTCATTTGCGCCCTTGTTTGGGTCTGCTCCGTCATCTGGGAGCTCACCTGTTCCCTCATTTGGGGCTGCTCCGGCCTCTGGGAGTTCAGTTGCGCCCTTGTTTGGGTCTGCTCCGTCCTCTGGGAGCTCCCCTTTGCCCTCGTTTGGGGCTGCTCCGTCCGCTGGGAGCTCACCGTTGCCTTCGTTTGGGGCTGCTTCGTCCTCTGGGAGCTCATCTTCGCCCTTTTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCCTCGGCTCCGTCCTTGTTCGGAGGGGTGTCTTCTGCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTGGCACATCTGCACCCACTGCAAGTCCGGGGTCATCGATATTTGGAGCTTCTGCTGCCGCTTCAGGTTCAAGCTCCTCCCTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGCTTCATCTTCTTCGGTATCCACTTCGAACTTGTTTGGATCATCTTCATCATCTGCATCGACTTCTCCATTCCAGAACTCTTTTTCTTCGAGTTCTTCCCAGAATTTGAGTTCGTCTTCACCATTTGCGGCTTCTTCTTCTGGGTTCTCATTTTCGACCACTTCTTTGTCCAAAACTACTAGTATTACCGCAGCATCTTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCATCGGCATCTCAATCTTCTTTCGGGTTCAGTATTAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTTCTGCTCCGGGCACTACAGCTGCGAAGCCTACTTCTCTATCGTTTTCAACTTCTGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTTACAACCACCAGTGCTTCCACTCCGGCTGCAACTAGCACAGCTCAGCCATCCTTCTCCATGCCAGCTTTTAGCTTGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTATCCATAGCAGCATCCTCCGCTCCCTCAACTACTTCTTCAGGTGCTGCGAGTTCATTCACCGGTTTTGGCGTCACAAGCACGGCTGCTTCATCAAGTGCCATTGTTTCCTTGTCGTTGCCAACCAAATCATTGACTGCTGCTTCATCATCCCAAGCACCAGCCTCTTTCGGTTTCTCTTCTCTTGCTTCCGCTTCCGCTGCTGCCACCACCACGTCTGGTTCCAATGCTTCCAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTGAGTGCAACAGTGTCTGCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATCAAGGAATGGAATGCGGAGCTTCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGGAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTTTGCAAAATCGGGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTTGTTGAGACCCAAACTGAGCTGGAGAAGAAATTGGAGCTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCAAAGTGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTCCTTGACGATGAAGCTGCATCTACTAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAACGAGAACTTGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAGCCAGGGAGGAGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACGCCGTTAGATGCAGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTGAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCCAGGGTCCTGCTGCAGATCGTGAATTGTTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTAA

Protein sequence

MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTSNPPSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGSSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFGSSPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLGQKFWMS
BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. Swiss-Prot
Match: NUP62_ARATH (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana GN=NUP62 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 416.4 bits (1069), Expect = 6.9e-115
Identity = 423/810 (52.22%), Postives = 532/810 (65.68%), Query Frame = 1

Query: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGS-----SPLSLSSSSSSNPSSSS 60
           MSGF FG S+S             GFSFGS+SA +  S     SPLS S + SSNPSS+ 
Sbjct: 1   MSGFPFGQSNSVG-----------GFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTG 60

Query: 61  SAFSNQTSNPPSS--TP-FGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGSSGSSLFAASSS 120
             F +  S+ P+S  TP FGF +S  PS     F F   A+S+  S G   S+    +S+
Sbjct: 61  FGFGSSVSSTPASSTTPSFGFGASSTPS-----FGFGSSASSSTPSFGFGSSASVTPAST 120

Query: 121 SGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPS---FG----AASASGTSFAPLFGS 180
           +    SFGFG ++SS   +   FG++ T+ SS  P    FG    +AS++ T  + LFG+
Sbjct: 121 T---PSFGFGTAASSSAPAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGA 180

Query: 181 APSSGSSPVPS-FGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASS 240
             SS ++P  S FGAAPASGS+  PLFGS+PS  S+P     ++ SA +S L  FGA+SS
Sbjct: 181 PASSAATPSSSPFGAAPASGST--PLFGSSPSLFSAP-----SSASASNSSL--FGASSS 240

Query: 241 SGSSSSPFFGAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASG 300
           + +S+SP FGA  SA  + PS    V+S+A  SS+ +FG     A+  S  F  +++ASG
Sbjct: 241 AATSTSPLFGAPSSATGATPSF--SVASSAPGSSSSIFG-----ATGSSPSFSVASSASG 300

Query: 301 SSSSLF---GSSPF--ASSSSVSTSNLFGSSSSSAST---SPF-QNSFSSSSSQNLS--S 360
           SS S+F   GSSPF  +SSS+ ST +LF SSSS A+T   SPF  ++F+SSS+ N S  S
Sbjct: 301 SSPSIFGATGSSPFFGSSSSAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNAS 360

Query: 361 SSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFS 420
           +SPF+A S+GFSF  ++ S TTS T  S+     S   SSSSFSFGT A+S      GF+
Sbjct: 361 ASPFSA-STGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQTAS---SSSSFSFGTSANS------GFN 420

Query: 421 ISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS-----FS 480
           +    STG S+AP   A+  +   FS       +T TTTS+STPAATS    S      +
Sbjct: 421 L----STGSSAAP---ASSTSGAVFS------IATTTTTSSSTPAATSAPASSAPASTMA 480

Query: 481 MPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTA 540
            P+F ++SSA  T   ++++  STT  G ASS      T    S+++    ++P  S  A
Sbjct: 481 FPSFGVTSSATNTTPASSAATFSTTGFGLASS------TPATGSTNSFTGFAVPKTSTPA 540

Query: 541 ASSSQAPASFGFS-SLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSA 600
           +SS     S  FS SL S    +T+T+    SS + T +TLVV SSS   TST  A V+ 
Sbjct: 541 SSSQPQTTSPAFSFSLPS----STSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAG 600

Query: 601 TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVA 660
           +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RILQNRD+LLRLEIEVA
Sbjct: 601 SPKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVA 660

Query: 661 KVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQ 720
           KVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKALQS+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ
Sbjct: 661 KVVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQ 720

Query: 721 AEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKA 778
           +E +ERELE MTEQI+SIIQ++NA+QGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKA
Sbjct: 721 SELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKA 739

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. Swiss-Prot
Match: NSP1_CHATD (Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) GN=NSP1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 1.6e-07
Identity = 211/706 (29.89%), Postives = 344/706 (48.73%), Query Frame = 1

Query: 86  FSFSLPAASTGVSSGSSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSP 145
           F+F  P+     +SG+SG S  + + +SGGL  FG     S+ GSS P+F    TSG+  
Sbjct: 3   FTFGQPS-----TSGASGQSNTSTAPASGGL--FG-----STTGSSTPAFSFGNTSGTQS 62

Query: 146 VPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSF 205
              FG A+    +   LFG+     SS  P       +G+    LFG + SS S P    
Sbjct: 63  GSLFGGATTGQKT--SLFGNT----SSTTP-------AGTPATSLFGQSTSSSSGPSLFG 122

Query: 206 GAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTS 265
            A+  +G+     FG  S+S + S        S  A  PSLFG  S  ATTS+     T 
Sbjct: 123 NASKPSGN----LFGNTSTSAAGS--------STPAGTPSLFG--SKTATTSAGASSTTP 182

Query: 266 APTASPGSSIFGASAAASGS----SSSLFGSSPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQN 325
           A TA  GS     +A   GS    S+ LFG S  AS S   ++    + +S + T+P + 
Sbjct: 183 AATAGSGSLFGSTTATTQGSSTPTSTGLFGGSSTASKSLFGSTTTPATGTSGSQTTPAKP 242

Query: 326 SFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAAS--SSSSLTSASTSSSSFSFG 385
            F S  S   + + P  A+ +   F   S   TT  +  +   S+S T+   SS+     
Sbjct: 243 LFGSFGSTTPAGAPPTDATKTAGLFGNLSKPATTGTSTPTLFGSTSATTQGQSSTPLFGA 302

Query: 386 TPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTT-SASTPA 445
            PA +++ ++     ++ A+T  +SAP +T       +  TS AP  ST T+T +ASTPA
Sbjct: 303 KPAETSTTTA-----ASGAATPATSAPASTTPTLFGGATLTSSAPAASTSTSTATASTPA 362

Query: 446 ATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAA--SSAPSTTSSGAASSFTG--FG----VTSTA 505
           AT   +P F   A + +  ++TT +     S+ P+TT++  +S+ T   FG     T+ A
Sbjct: 363 AT---KPLFGATATTSAPGSSTTTATPGLFSTTPATTAAAGSSTATSTLFGTKPATTTAA 422

Query: 506 ASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPAS---FGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSST 565
           A+SS   + S P+   +  +S+ APAS      ++ AS SA ATTT+   + + +  S+T
Sbjct: 423 AASSTPAATSTPSLFGSKPASTTAPASGTPTTTTAPASTSAPATTTAAPTSGASATASTT 482

Query: 566 LVVASSSSGTTSTVSATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAE 625
                + + T    ++TV    +LP  +  KT++EII  W  +L +   +F++QA  + E
Sbjct: 483 TAGQDAKTTTAGLGASTVGPQSQLP-RLKNKTMDEIITRWATDLAKYQKEFKEQAAKVME 542

Query: 626 WDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKD 685
           WDR +++N + + +L     +      E+E++L  +E+ Q+E+   L   E + + +Y  
Sbjct: 543 WDRLLVENGEKIQKLYTSTYEAERASNEIERQLSNVESQQEELTAWLDRYERELDELYAK 602

Query: 686 ERGLLLDDEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ASQGGELDV 745
           + G    ++AA     R+  Y+ AE +  +L++M + +  +I+ +N      S+G + D 
Sbjct: 603 QMGSAAGEQAAGPDQERERTYKLAEKLTDQLDEMGKDLAKMIKEINDMSNTLSKGSKPD- 655

Query: 746 IDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATQG 763
                PL  +VR+LN  L+ L WID  A    +++   QK A + G
Sbjct: 663 ----DPLTQIVRVLNGHLAQLQWIDTNAAALQAKVAAAQKAAGSMG 655

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KA27_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G108530 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 600.1 bits (1546), Expect = 3.8e-168
Identity = 514/817 (62.91%), Postives = 592/817 (72.46%), Query Frame = 1

Query: 2   SGFSFGSSSSQSSSS--------SSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP------------L 61
           + F FG+SSS ++SS        SS  SST+ F  GS  A SFG++P            L
Sbjct: 123 NSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGAL 182

Query: 62  SLSSSSSSNP----------SSSSSAFSNQTSNPPSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLP 121
           S S+ +SS P          SS+ S F   +S   SS P    S+   SS S  F  S  
Sbjct: 183 SSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAA 242

Query: 122 AASTGVS--------SGSSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTS-G 181
           A+ +GVS        SGS+GS LF +S          FG SSS   SSA +     +S  
Sbjct: 243 ASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSP---------FGASSSGTLSSASTSNLFASSLS 302

Query: 182 SSPVPSFGAASASG--TSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSS 241
           +SP  S  ++S+S   TS +P F ++PS  S P  S        +S+  +  S+ SS SS
Sbjct: 303 TSPFQSTLSSSSSQNLTSSSP-FVASPSGFSFPTGSLSKT----TSITNVSSSSSSSSSS 362

Query: 242 PLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAP 301
              S  ++ S+ SS   S  ++SSS SSSS    ++ S+ +S        SS++++SS+ 
Sbjct: 363 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS--------SSSSSSSSSS 422

Query: 302 LFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFGSSPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQ 361
              +S+ ++S  SS   +S+++S SSSS   SS  +SSSS S+S+   SSSSS+S+S   
Sbjct: 423 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 482

Query: 362 NSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGT 421
           +S SSSSS + SSSS  ++SSS  S S++S S ++S +++SSSSSLT ASTSSSSFSFGT
Sbjct: 483 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT 542

Query: 422 PASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAAT 481
           PASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS                ASTPAA 
Sbjct: 543 PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLS----------------ASTPAAN 602

Query: 482 STAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLS 541
           ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPS  SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLS
Sbjct: 603 STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS 662

Query: 542 LPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTST 601
           LPTK+ TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTST
Sbjct: 663 LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 722

Query: 602 VSATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILL 661
           VSATVS+TPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILL
Sbjct: 723 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 782

Query: 662 RLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 721
           RLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST
Sbjct: 783 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 842

Query: 722 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 778
           RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL
Sbjct: 843 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 901

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. TrEMBL
Match: A0A061E270_THECC (Structural constituent of nuclear pore isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_005631 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 465.3 bits (1196), Expect = 1.4e-127
Identity = 464/823 (56.38%), Postives = 569/823 (69.14%), Query Frame = 1

Query: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSL-SSSSSSNPSSSSSAFS 60
           MSGFSF SSSS  SSSSS           S++ FS GSSP    SS+S+S P+  SS F+
Sbjct: 1   MSGFSFPSSSSSQSSSSS-----------SSTPFSLGSSPSPFGSSTSASAPTFGSSLFN 60

Query: 61  NQTSNPPSSTPFGFASSPF----PSSASSPF-SFSLPAASTGVSSGSSGSSLFAASSSSG 120
              SNP  S+     ++P     P+S SSPF  F  P++S+  +S +  SS FA  S SG
Sbjct: 61  ---SNPSCSSSTAITTTPAFSSNPASGSSPFVGFGQPSSSSSSASSAPVSS-FAVGSGSG 120

Query: 121 GLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPV 180
             S F    SSSS  +++  FGAA ++ +SP+P +GA S++  S +PLF SA S+  S  
Sbjct: 121 A-SPF----SSSSSSATSGLFGAASSASASPLP-WGAPSSAAPSASPLFVSASSAAGSGS 180

Query: 181 PSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPS-FGAASSSGSSS-SPF 240
             FG + +S SS +  F +A S+ SS L  FGA+ SA S+   S FGA+S + S++ S  
Sbjct: 181 SLFGTSISSTSSPSFGFATASSTVSSALSIFGASSSAASTTGSSLFGASSFTASTTGSSL 240

Query: 241 FGAAP-SAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFG 300
           FGA+  +A  +  SLF   SSA+TT   PLFG+   TAS G S+FGASA A  S+SS FG
Sbjct: 241 FGASSFAASTTGSSLFVACSSASTT---PLFGS---TASSGPSLFGASALAVSSASSPFG 300

Query: 301 ---------SSPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTSP------FQNSFSSSSSQNLSSSSP 360
                    SSP A +++ +TS+   SSSSSAST+       F +  SSSS+ N +S+SP
Sbjct: 301 ASGGSSLFLSSP-APTAAPTTSSFGSSSSSSASTAAAATTPSFSSLLSSSSASNSTSASP 360

Query: 361 FAASSSGFSFSTTS--LSKTTSITAASSSS---SLTSASTSSSS--FSFGTPASSASQSS 420
           F AS+ GFSFS++S  L  T S T+  +S+   SLT+A++SSSS  FSF  P+SSASQ +
Sbjct: 361 FLAST-GFSFSSSSSFLKSTASSTSTPTSTTAPSLTAAASSSSSSGFSFAPPSSSASQPT 420

Query: 421 FGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTT-SASTPAATSTAQPSFS 480
           FG+   NAA+           +KPTSLSF TS APLFSTVTTT SA TPAA++ A  + S
Sbjct: 421 FGYG--NAAAM----------SKPTSLSFGTSSAPLFSTVTTTTSAYTPAASTAAASASS 480

Query: 481 --------MPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASS---SAIV 540
                    P F+LSSS+ATT S +A+ A S  SS A SSFTGFGVT+ AA+S   S+  
Sbjct: 481 SAAASTPAFPTFNLSSSSATTASSSAAPASSAASSAAVSSFTGFGVTNAAATSGSTSSFT 540

Query: 541 SLSLPTKSLTAASSSQAPASFG---FSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSS 600
             SL TK     SSSQA ++     FS   S+SAA+ T++ S  ++Q  TSSTLVVASSS
Sbjct: 541 GFSLSTKPSAPTSSSQAQSTTTAPVFSFPGSSSAASITSTSSTTTAQ--TSSTLVVASSS 600

Query: 601 SGTTSTVSATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQ 660
            GT+ + +A +SATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA+AIAEWDRRILQ
Sbjct: 601 -GTSLSATAAISATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQASAIAEWDRRILQ 660

Query: 661 NRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLD 720
           NRD+LLRLEIEVAKVVE Q  LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIYKDERGLLLD
Sbjct: 661 NRDVLLRLEIEVAKVVEAQASLERQLELIETHQQEVDKALLSMEEEAERIYKDERGLLLD 720

Query: 721 DEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILN 778
           DEAASTRDAMYEQAE +ERELEQM EQIKSII+T+N+SQGGEL+ +DGMTPLD VVRILN
Sbjct: 721 DEAASTRDAMYEQAEIVERELEQMAEQIKSIIETVNSSQGGELEALDGMTPLDVVVRILN 778

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. TrEMBL
Match: A0A067KYS2_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_15753 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 464.9 bits (1195), Expect = 1.9e-127
Identity = 453/832 (54.45%), Postives = 559/832 (67.19%), Query Frame = 1

Query: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSS--PFS-STTGFSFGST---SAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSS 60
           MSGFSF SSSSQSSSSSS  PFS  ++  SFG T   S FSFGSS  + ++ SS++ SSS
Sbjct: 1   MSGFSFASSSSQSSSSSSSSPFSFGSSAPSFGPTTSASLFSFGSSSFAAANPSSASSSSS 60

Query: 61  SSAFSNQTS---NP---PSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGSSGSSLFA 120
             +FS  TS   NP   P+++ FGF    F SS+SS  S S PA S  +S GS+ ++   
Sbjct: 61  PLSFSFNTSSNSNPSSAPTASSFGFG---FSSSSSSSSSSSGPALS--LSFGSAPAATTT 120

Query: 121 ASSSSGGL---SSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGS 180
             S  G +   +S  FG ++S  GS +  FGA   + SS    FG  S++ +S +PL G+
Sbjct: 121 TPSLFGSVPISTSSPFGQAASPAGSGSNLFGAVSAAASSASSLFGTVSSAASSGSPLLGT 180

Query: 181 APSSGSSPVPSFGAAPAS---GSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAA 240
           A +S  + V  FG + +S   G+S++P FG+  S+ SS    FG   S  SSP P FG  
Sbjct: 181 ASASTGTSV--FGGSTSSSLFGTSISPQFGTTSSAASSVSTQFGTTLSITSSPSPPFGTT 240

Query: 241 SSSGSSSSPFFGAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAA 300
           SSS +SS             APSLFG  S A ++  +P FG S+ TAS GS +FG S++ 
Sbjct: 241 SSSAASS-------------APSLFGATSPAVSSGPSP-FGISSSTASSGSFLFGTSSSG 300

Query: 301 SGSSS--SLFGSSPFASSSSVSTSNLFGS-----SSSSASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSS 360
           +G+SS  SLFGSS   +S++  TSNLF S     SSSSAST+ F ++  S++  N S   
Sbjct: 301 TGTSSGPSLFGSS--GASNTTGTSNLFASSANALSSSSASTTSFSSNLFSATPSNSSPGL 360

Query: 361 PFAASSSGFSF--STTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFG-- 420
            F+++  GFSF  ST S++ TT+++++++ S   S++ S SSFSFGTP+S++S S+ G  
Sbjct: 361 SFSSTPPGFSFPKSTPSVTSTTTVSSSAAPSLTQSSAASVSSFSFGTPSSASSASASGFS 420

Query: 421 ------------FSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA 480
                       FS SNAA +   +   T AAKPTS S      PLFSTVTTT++ TPAA
Sbjct: 421 FLTPSSASSQSSFSFSNAAYSSAPATSTTVAAKPTSPS------PLFSTVTTTNSLTPAA 480

Query: 481 TSTAQPS------FSMPAFSL----SSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTST 540
            ST   S       S+PAF+     SSS+ATT S AA       SSG  +SFTG G  +T
Sbjct: 481 GSTVASSSATTSTLSLPAFTAFSVSSSSSATTASTAA-------SSGTTNSFTGIGTANT 540

Query: 541 AASS--SAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFG---FSSLASASAAATTTSGSNASSQSQT 600
            ASS  +A     L  K+   AS+SQA ++     FS   S SAAAT TS S  ++ +QT
Sbjct: 541 TASSANAAFTGFPLSNKTSVPASTSQAQSTAAAPLFSIPTSTSAAATATSSS--TTTAQT 600

Query: 601 SSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANA 660
           + +L VA SSSGT+S+VSA VSATPKLPSEITGKTVEEIIK+WNAELQERTGKFRKQA A
Sbjct: 601 TLSLAVA-SSSGTSSSVSAAVSATPKLPSEITGKTVEEIIKDWNAELQERTGKFRKQAAA 660

Query: 661 IAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERI 720
           IAEWD+RILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ  LE++LELIETHQQEVDKALQS+EE+AERI
Sbjct: 661 IAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQASLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERI 720

Query: 721 YKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMT 777
           YKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE IER+LE MTEQ+KS+I TLN+SQGGELD ID MT
Sbjct: 721 YKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAELIERDLEHMTEQVKSVIDTLNSSQGGELDTIDRMT 780

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. TrEMBL
Match: V4VYQ1_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10019079mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 451.1 bits (1159), Expect = 2.8e-123
Identity = 428/791 (54.11%), Postives = 529/791 (66.88%), Query Frame = 1

Query: 8   SSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSA---FSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTSN 67
           S SS SS SS+P    + FSFGS+++   FSFGSSPL+ +     NP+S+SS     T++
Sbjct: 7   SGSSFSSQSSTP----SQFSFGSSASSTGFSFGSSPLAFA-----NPTSASST----TTS 66

Query: 68  PPSSTPFGFASSPFPSSASSPFS-----FSLPAAS-TGVSSGSSGSSLFAASSSS-GGLS 127
            PS T F F +S F SS+SSPF+      S PAA+  G   GS  S+   +SS S  G +
Sbjct: 67  SPSPTSFSFNTSSF-SSSSSPFASTANPSSAPAAAPPGFGFGSFSSTTVPSSSPSLFGSA 126

Query: 128 SFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSF 187
           S  FG +SS+G S          SG+SP P     SA+  +  P   S  SS        
Sbjct: 127 SSAFGAASSTGNSK---------SGASPSPFGANLSANTITTTPSPFSVASS-------- 186

Query: 188 GAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAP 247
            AA ++ S+    FG++ ++ S+  PSFG A SA S+  P FGA S + S++S  FGA  
Sbjct: 187 -AANSASSTTTSQFGASFTASSAASPSFGTASSAASTASPLFGAPSLAASTTSNVFGAPA 246

Query: 248 SAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFGSSPFAS 307
           SA ++ PS FG  SSAATT+ + L G+++ TAS    +FG   AA+GSSS          
Sbjct: 247 SAVSTTPSPFGPASSAATTTLS-LIGSASSTASSAPGLFG---AATGSSS---------- 306

Query: 308 SSSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSF--STTSLSKTT 367
                   LFGS+SS  S S      S SSS + SS+SPF+  S+GFSF  +T SL+ TT
Sbjct: 307 --------LFGSASSGPSFS------SLSSSSSSSSASPFSV-STGFSFPKATQSLTSTT 366

Query: 368 SITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTS 427
           + T   S +S +SAS+SS SFSF                        ++A  +TA KPTS
Sbjct: 367 ASTTIPSLTSSSSASSSSLSFSF------------------------NNATTSTATKPTS 426

Query: 428 LSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFS---MPAFSLSSSAATTLSIAASSAPST 487
           LSF  S APLFSTVTTTSAS PAA++T  P+ S   +P+FS+SSS+A  ++ A +SAP++
Sbjct: 427 LSFGMSTAPLFSTVTTTSASAPAASTTTAPAASTVALPSFSVSSSSA-AITTALTSAPAS 486

Query: 488 TSSGAASSFTGFGVTSTAASS---SAIVSLSLPTKSLTAASSSQ---APASFGFSSLASA 547
           +++   SSFTGFG  STA SS   S+    SL +K +  AS+SQ      +  F    SA
Sbjct: 487 SAASTTSSFTGFGTASTATSSGTTSSFTDFSLASKPIVPASTSQPQSTATATAFGVPTSA 546

Query: 548 SAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKE 607
           S AATT+SGS  +   QTSS+LVVA SSSGT+S+VS  V+ TPKLPSEITG+TVEEIIKE
Sbjct: 547 STAATTSSGSTPA--PQTSSSLVVA-SSSGTSSSVSTAVTTTPKLPSEITGRTVEEIIKE 606

Query: 608 WNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETH 667
           WN+ELQERTGKFRKQA A+AEWD+RILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETH
Sbjct: 607 WNSELQERTGKFRKQATAMAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQSNLERQLELIETH 666

Query: 668 QQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSII 727
           QQEVDKALQS+EE+AERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE++ERE+E MTEQIKSII
Sbjct: 667 QQEVDKALQSMEEEAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEFVEREMEHMTEQIKSII 707

Query: 728 QTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAAD 778
           QTLNASQGG  D  DGMTPLD VV+ILNNQLSSLMWID+KAEEFSSRIQKL ATQG +AD
Sbjct: 727 QTLNASQGGGFDAFDGMTPLDVVVQILNNQLSSLMWIDDKAEEFSSRIQKL-ATQGSSAD 707

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. TrEMBL
Match: M5XS35_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa002546mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 448.7 bits (1153), Expect = 1.4e-122
Identity = 419/724 (57.87%), Postives = 502/724 (69.34%), Query Frame = 1

Query: 67  SSTPFGFASSPFPSSASSPFSF-----SLPAASTGVSSGSSGSSLFAASSSSGGLSSFGF 126
           S  PFG +SS   S +++PFSF     S PA S G S GSS S  F ++++    S+ GF
Sbjct: 2   SGFPFG-SSSAASSQSTTPFSFTNPPASFPATSIGFSLGSSASP-FGSTTAQAATSTSGF 61

Query: 127 GVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAA- 186
              SS        F A+ +S SSP P      A   SF     +A ++ S+  PSFG   
Sbjct: 62  SFGSS--------FSASISSSSSPFPP-----ARAPSFGSGASTATTASSAAAPSFGFGF 121

Query: 187 PASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAG 246
            A+ S+ + LFGS+ S+     P FG++PS      P FG+ SSS  + +P    AP   
Sbjct: 122 SAAISAPSSLFGSSAST-----PLFGSSPSQ-----PLFGS-SSSAPAPAPASAPAP-VS 181

Query: 247 ASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFGSSPFASSSS 306
           ASA +LFG  SS A++    LFG +   AS  S + G+   AS S+SSLF S+ F  S+ 
Sbjct: 182 ASASTLFGAPSSTASS----LFGATVSAAS--SPLIGS---ASASASSLFSSTSFTHSAP 241

Query: 307 VSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTS-LSKTTSITA 366
              S+LFGSSS+ +ST  F ++ SSS+S   SS   F +SSS FSF T S LSK  + + 
Sbjct: 242 ---SSLFGSSSTVSSTPLFSSALSSSASTT-SSFPSFTSSSSAFSFPTASPLSKPPTTST 301

Query: 367 ASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFS 426
            +S +S  +AST+ S FSF  P SSASQ SFGFS  NAA    S+AP +TA KPTS SFS
Sbjct: 302 PTSVTSSATASTAPS-FSFAPPTSSASQPSFGFS--NAAL---SAAPISTA-KPTSQSFS 361

Query: 427 TSVAPLFSTVTTTSAS-TPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAA 486
           T  APLFSTVTTTSAS TPAA++T Q SFSMP+F      AT  + A S+APS+T    A
Sbjct: 362 TPSAPLFSTVTTTSASSTPAASTTTQASFSMPSFG-----ATPSTSAVSTAPSST----A 421

Query: 487 SSFTGFGVTSTAAS-----SSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTT 546
             FTGFGV+S AAS     +++    S  TK  T ASSSQA  S   ++L + +AA T+T
Sbjct: 422 GLFTGFGVSSAAASLGTTAAASYTGFSSLTKGSTPASSSQAQPS---TTLPAFAAATTST 481

Query: 547 SGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE 606
           S    ++  QTS++L+VA S+SGTTSTVS TVS  PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE
Sbjct: 482 S----TAAIQTSTSLIVA-STSGTTSTVSTTVSTAPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE 541

Query: 607 RTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKA 666
           RTGKFRKQANAIA+WD+RILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ  LE++LELIETHQQEVDKA
Sbjct: 542 RTGKFRKQANAIADWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQANLERQLELIETHQQEVDKA 601

Query: 667 LQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQ 726
           LQS+EE+AERIYKDERGL+LDDEAASTRDAMYEQAE+IERELEQ+TEQIKSIIQTLNA+Q
Sbjct: 602 LQSMEEEAERIYKDERGLILDDEAASTRDAMYEQAEFIERELEQVTEQIKSIIQTLNANQ 660

Query: 727 GGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLGQK 778
           GGELD  DGM PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL A QGPAADREL+  K
Sbjct: 662 GGELDTNDGMAPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL-ANQGPAADRELMSPK 660

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. TAIR10
Match: AT2G45000.1 (AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore)

HSP 1 Score: 416.4 bits (1069), Expect = 3.9e-116
Identity = 423/810 (52.22%), Postives = 532/810 (65.68%), Query Frame = 1

Query: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGS-----SPLSLSSSSSSNPSSSS 60
           MSGF FG S+S             GFSFGS+SA +  S     SPLS S + SSNPSS+ 
Sbjct: 1   MSGFPFGQSNSVG-----------GFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTG 60

Query: 61  SAFSNQTSNPPSS--TP-FGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGSSGSSLFAASSS 120
             F +  S+ P+S  TP FGF +S  PS     F F   A+S+  S G   S+    +S+
Sbjct: 61  FGFGSSVSSTPASSTTPSFGFGASSTPS-----FGFGSSASSSTPSFGFGSSASVTPAST 120

Query: 121 SGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPS---FG----AASASGTSFAPLFGS 180
           +    SFGFG ++SS   +   FG++ T+ SS  P    FG    +AS++ T  + LFG+
Sbjct: 121 T---PSFGFGTAASSSAPAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGA 180

Query: 181 APSSGSSPVPS-FGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASS 240
             SS ++P  S FGAAPASGS+  PLFGS+PS  S+P     ++ SA +S L  FGA+SS
Sbjct: 181 PASSAATPSSSPFGAAPASGST--PLFGSSPSLFSAP-----SSASASNSSL--FGASSS 240

Query: 241 SGSSSSPFFGAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASG 300
           + +S+SP FGA  SA  + PS    V+S+A  SS+ +FG     A+  S  F  +++ASG
Sbjct: 241 AATSTSPLFGAPSSATGATPSF--SVASSAPGSSSSIFG-----ATGSSPSFSVASSASG 300

Query: 301 SSSSLF---GSSPF--ASSSSVSTSNLFGSSSSSAST---SPF-QNSFSSSSSQNLS--S 360
           SS S+F   GSSPF  +SSS+ ST +LF SSSS A+T   SPF  ++F+SSS+ N S  S
Sbjct: 301 SSPSIFGATGSSPFFGSSSSAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNAS 360

Query: 361 SSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFS 420
           +SPF+A S+GFSF  ++ S TTS T  S+     S   SSSSFSFGT A+S      GF+
Sbjct: 361 ASPFSA-STGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQTAS---SSSSFSFGTSANS------GFN 420

Query: 421 ISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS-----FS 480
           +    STG S+AP   A+  +   FS       +T TTTS+STPAATS    S      +
Sbjct: 421 L----STGSSAAP---ASSTSGAVFS------IATTTTTSSSTPAATSAPASSAPASTMA 480

Query: 481 MPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTA 540
            P+F ++SSA  T   ++++  STT  G ASS      T    S+++    ++P  S  A
Sbjct: 481 FPSFGVTSSATNTTPASSAATFSTTGFGLASS------TPATGSTNSFTGFAVPKTSTPA 540

Query: 541 ASSSQAPASFGFS-SLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSA 600
           +SS     S  FS SL S    +T+T+    SS + T +TLVV SSS   TST  A V+ 
Sbjct: 541 SSSQPQTTSPAFSFSLPS----STSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAG 600

Query: 601 TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVA 660
           +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RILQNRD+LLRLEIEVA
Sbjct: 601 SPKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVA 660

Query: 661 KVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQ 720
           KVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKALQS+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ
Sbjct: 661 KVVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQ 720

Query: 721 AEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKA 778
           +E +ERELE MTEQI+SIIQ++NA+QGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKA
Sbjct: 721 SELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKA 739

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. NCBI nr
Match: gi|659119573|ref|XP_008459731.1| (PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 855.1 bits (2208), Expect = 9.3e-245
Identity = 626/794 (78.84%), Postives = 669/794 (84.26%), Query Frame = 1

Query: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSS--PLSLSSSSSS-NPSSSSSA 60
           MSGF FGSS+SQSSSSS PFSSTTGFSFGST+ FSFGSS  PLSLSSSSSS NP+SSSS 
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQSSSSS-PFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSP 60

Query: 61  FSNQTSNPPSSTP-FGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGS-------SGSSLFAA 120
           F N TSNPPSS+  FGF SS F SS SSPFSFSL +ASTG SS S       S SSLF  
Sbjct: 61  FPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGV 120

Query: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
           SSSS G +SFGFG SSSS  SSAP FGAA              S+SGTS A LFG+    
Sbjct: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAA--------------SSSGTSSASLFGA---- 180

Query: 181 GSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSS-GSSPLPSFGAAPSAGSSPLPS-FGAASSSGS 240
           GSSP PSFGAAP+SGSSVAP FG+  SS G+S  P FGAAPSAG+S  PS FG ASS+ +
Sbjct: 181 GSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATT 240

Query: 241 SSSPFFGAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTA-SPGSSIFGASAAASGSS 300
           SS+P FG A SA +S  +LF G S+ A+ S A LFGTSAP++ S GS +FG         
Sbjct: 241 SSAPLFGTAASAASSGSALF-GASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFG--------- 300

Query: 301 SSLFGSSPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSF 360
           SS FG+S   +SSSVSTSNLF SS SS   SPFQ+S SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSF
Sbjct: 301 SSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSF 360

Query: 361 STTSLSKTTSIT---AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS 420
            T++LSKTTSIT   ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGS
Sbjct: 361 PTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGS 420

Query: 421 SAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLS 480
           SAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA+ST QPSFS+PAFS SSSAATTLS
Sbjct: 421 SAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLS 480

Query: 481 IAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSL 540
           IAASSAPS  SSG  SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SL
Sbjct: 481 IAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSL 540

Query: 541 ASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATPKLPSEITGKTVEEI 600
           ASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS+TPKLPSEITGKTVEEI
Sbjct: 541 ASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEI 600

Query: 601 IKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELI 660
           IKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELI
Sbjct: 601 IKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELI 660

Query: 661 ETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIK 720
           ETHQQEVDKAL SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIK
Sbjct: 661 ETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIK 720

Query: 721 SIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGP 778
           SIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GP
Sbjct: 721 SIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGP 761

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. NCBI nr
Match: gi|778712216|ref|XP_011656864.1| (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 845.9 bits (2184), Expect = 5.7e-242
Identity = 622/812 (76.60%), Postives = 656/812 (80.79%), Query Frame = 1

Query: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP----LSLSSSSSSNPSSSSS 60
           MSGF FGSS+SQSSS   PFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP    LS SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQSSS---PFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSS 60

Query: 61  AFSNQTSNPPSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGS-------SGSSLFAA 120
            F N TSNP SS+ FGF SS F +S SSPFSFSL +ASTG SS S       S SSLF  
Sbjct: 61  PFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGV 120

Query: 121 SSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSS 180
           SSSS G +SFGFG SSSS  SSAP               FGAAS+SGTS   LFG    +
Sbjct: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPL--------------FGAASSSGTSSTSLFG----A 180

Query: 181 GSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSS 240
           GS P PSFGAAP+SGSSVAP FG+                            +SS+G+SS
Sbjct: 181 GSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGA---------------------------LSSSAGTSS 240

Query: 241 SPFFGAAPSAGA-SAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGS--- 300
           +P FGAAPSAGA SAPSLFGG SS ATTSSAPLFGTSA  AS GS +FGASAAASGS   
Sbjct: 241 APLFGAAPSAGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVS 300

Query: 301 ------------SSSLFGSSPFASS-----SSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSS 360
                        S LFGSSPF +S     SS STSNLF   +SS STSPFQ++ SSSSS
Sbjct: 301 LFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSS 360

Query: 361 QNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT---AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSA 420
           QNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT   ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+
Sbjct: 361 QNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSS 420

Query: 421 SQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQP 480
           SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S S APLFSTVTTTSASTPAA ST QP
Sbjct: 421 SQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSXAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQP 480

Query: 481 SFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKS 540
           SFS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPS  SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+
Sbjct: 481 SFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKT 540

Query: 541 LTAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATV 600
            TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATV
Sbjct: 541 STAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATV 600

Query: 601 SATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIE 660
           S+TPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIE
Sbjct: 601 SSTPKLPSEITGKTVEEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIE 660

Query: 661 VAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMY 720
           VAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMY
Sbjct: 661 VAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMY 720

Query: 721 EQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDE 778
           EQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDE
Sbjct: 721 EQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDE 758

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. NCBI nr
Match: gi|700191351|gb|KGN46555.1| (hypothetical protein Csa_6G108530 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 600.1 bits (1546), Expect = 5.4e-168
Identity = 514/817 (62.91%), Postives = 592/817 (72.46%), Query Frame = 1

Query: 2   SGFSFGSSSSQSSSS--------SSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSP------------L 61
           + F FG+SSS ++SS        SS  SST+ F  GS  A SFG++P            L
Sbjct: 123 NSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGAL 182

Query: 62  SLSSSSSSNP----------SSSSSAFSNQTSNPPSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLP 121
           S S+ +SS P          SS+ S F   +S   SS P    S+   SS S  F  S  
Sbjct: 183 SSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAA 242

Query: 122 AASTGVS--------SGSSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTS-G 181
           A+ +GVS        SGS+GS LF +S          FG SSS   SSA +     +S  
Sbjct: 243 ASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSP---------FGASSSGTLSSASTSNLFASSLS 302

Query: 182 SSPVPSFGAASASG--TSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSS 241
           +SP  S  ++S+S   TS +P F ++PS  S P  S        +S+  +  S+ SS SS
Sbjct: 303 TSPFQSTLSSSSSQNLTSSSP-FVASPSGFSFPTGSLSKT----TSITNVSSSSSSSSSS 362

Query: 242 PLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAP 301
              S  ++ S+ SS   S  ++SSS SSSS    ++ S+ +S        SS++++SS+ 
Sbjct: 363 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS--------SSSSSSSSSS 422

Query: 302 LFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFGSSPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQ 361
              +S+ ++S  SS   +S+++S SSSS   SS  +SSSS S+S+   SSSSS+S+S   
Sbjct: 423 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 482

Query: 362 NSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGT 421
           +S SSSSS + SSSS  ++SSS  S S++S S ++S +++SSSSSLT ASTSSSSFSFGT
Sbjct: 483 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT 542

Query: 422 PASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAAT 481
           PASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS                ASTPAA 
Sbjct: 543 PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLS----------------ASTPAAN 602

Query: 482 STAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLS 541
           ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPS  SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSAI SLS
Sbjct: 603 STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS 662

Query: 542 LPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTST 601
           LPTK+ TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTST
Sbjct: 663 LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 722

Query: 602 VSATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILL 661
           VSATVS+TPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILL
Sbjct: 723 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 782

Query: 662 RLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 721
           RLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST
Sbjct: 783 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 842

Query: 722 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 778
           RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL
Sbjct: 843 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 901

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. NCBI nr
Match: gi|1009140487|ref|XP_015887679.1| (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Ziziphus jujuba])

HSP 1 Score: 471.1 bits (1211), Expect = 3.8e-129
Identity = 451/795 (56.73%), Postives = 557/795 (70.06%), Query Frame = 1

Query: 4   FSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTS 63
           FS GSS+S   S+SS  SST   +    + FSFGSSP S  SSSS  P+++SS+FS    
Sbjct: 32  FSSGSSASPFGSTSSSSSSTNTTTNSLHTGFSFGSSPFS--SSSSLAPATASSSFS-LPF 91

Query: 64  NPPSSTPFGFASSPFPSSASSP---FSFSLPAASTGV--SSGSSGSSLFAASSSSG-GLS 123
           N  SS+   F++S  PSSAS+P   F  S  A+S+ +  S+GSS  S F  + + G G S
Sbjct: 92  NTTSSSSSSFSNSN-PSSASTPSFRFGSSTTASSSALPSSAGSSAPSPFGNTFAPGTGSS 151

Query: 124 SFGFG-VSSSSGGSSAPSFGAA--PTSGSSPVPSFGAASAS-GTSFAPLFGSAPSSGSSP 183
            FG   ++ S G S+AP+ G++   T+ S  V SFG  S S G+S + LFG++ S  S  
Sbjct: 152 RFGISTITPSFGSSAAPAPGSSLFGTASSVTVTSFGTPSFSTGSSGSTLFGTSVSGSSG- 211

Query: 184 VPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSF-GAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPF 243
              F A+ +S SS +P      SS + P   F GA+  A SS    FGA+ S   +SSP 
Sbjct: 212 ---FVASLSSSSSSSPFL--VASSVAPPSSMFLGASGPAASSASSLFGASLSGSGTSSPL 271

Query: 244 FGAAPSAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFGS 303
           FG + S  +S PSLFG   SA  TS  P FGTS+   S GS  FG SA    S +S FG+
Sbjct: 272 FGTSSSTTSSGPSLFGSSVSAPGTSFPP-FGTSSSAPSSGSPSFGTSA----SGTSQFGA 331

Query: 304 SPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSL- 363
           S  A S+   +++L  SSS+   T+P   SF ++SS N SS+SPF+ASS+GFSFST+S  
Sbjct: 332 STPAVSTG--SASLGSSSSALVPTTPSILSFPTTSSTNSSSASPFSASSTGFSFSTSSAF 391

Query: 364 ----SKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPG 423
               + +TS   +SS+ S +S+ST+SS FSFG PASSASQSSFGF  + +++   S+ P 
Sbjct: 392 GKPTADSTSTAVSSSAPSTSSSSTNSSGFSFGPPASSASQSSFGFGNAASSAAMASNKP- 451

Query: 424 TTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSAS-TPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAA 483
              AKP  LSF+TS APLFSTVTTTSAS TPA++ST Q SFS+PAF +++SA+T   ++A
Sbjct: 452 LAGAKP--LSFTTSAAPLFSTVTTTSASSTPASSSTTQSSFSVPAFGVTASASTAAPVSA 511

Query: 484 SSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVS---LSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSL 543
            S+ +T      + FTGF +T T ASS A  S    SL TK+ T ASS  A ++ G  +L
Sbjct: 512 VSSATT------APFTGFSLTGTTASSGAASSSPTFSLSTKTSTPASSVPAQSTSGVPAL 571

Query: 544 A-SASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATPKLPSEITGKTVEE 603
           + SA  +   T  S+ ++  QT+S+LVVA SSSGTTS VS TVSATPKLPSEITGKTVEE
Sbjct: 572 SVSAPTSVAATVPSSGAAAIQTTSSLVVA-SSSGTTSAVSTTVSATPKLPSEITGKTVEE 631

Query: 604 IIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLEL 663
           IIKEWN+ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ  LE++LEL
Sbjct: 632 IIKEWNSELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQANLERQLEL 691

Query: 664 IETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQI 723
           IETHQQEVDKALQSVEE+AERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE+IERELEQM+EQI
Sbjct: 692 IETHQQEVDKALQSVEEEAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEFIERELEQMSEQI 751

Query: 724 KSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQG 778
           KSIIQ++NA+QGG++D  D + PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI KL A+QG
Sbjct: 752 KSIIQSINANQGGDIDANDAVAPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIHKL-ASQG 798

BLAST of Cp4.1LG12g04250 vs. NCBI nr
Match: gi|590723563|ref|XP_007052219.1| (Structural constituent of nuclear pore isoform 1 [Theobroma cacao])

HSP 1 Score: 465.3 bits (1196), Expect = 2.1e-127
Identity = 464/823 (56.38%), Postives = 569/823 (69.14%), Query Frame = 1

Query: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSL-SSSSSSNPSSSSSAFS 60
           MSGFSF SSSS  SSSSS           S++ FS GSSP    SS+S+S P+  SS F+
Sbjct: 1   MSGFSFPSSSSSQSSSSS-----------SSTPFSLGSSPSPFGSSTSASAPTFGSSLFN 60

Query: 61  NQTSNPPSSTPFGFASSPF----PSSASSPF-SFSLPAASTGVSSGSSGSSLFAASSSSG 120
              SNP  S+     ++P     P+S SSPF  F  P++S+  +S +  SS FA  S SG
Sbjct: 61  ---SNPSCSSSTAITTTPAFSSNPASGSSPFVGFGQPSSSSSSASSAPVSS-FAVGSGSG 120

Query: 121 GLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPV 180
             S F    SSSS  +++  FGAA ++ +SP+P +GA S++  S +PLF SA S+  S  
Sbjct: 121 A-SPF----SSSSSSATSGLFGAASSASASPLP-WGAPSSAAPSASPLFVSASSAAGSGS 180

Query: 181 PSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPS-FGAASSSGSSS-SPF 240
             FG + +S SS +  F +A S+ SS L  FGA+ SA S+   S FGA+S + S++ S  
Sbjct: 181 SLFGTSISSTSSPSFGFATASSTVSSALSIFGASSSAASTTGSSLFGASSFTASTTGSSL 240

Query: 241 FGAAP-SAGASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFG 300
           FGA+  +A  +  SLF   SSA+TT   PLFG+   TAS G S+FGASA A  S+SS FG
Sbjct: 241 FGASSFAASTTGSSLFVACSSASTT---PLFGS---TASSGPSLFGASALAVSSASSPFG 300

Query: 301 ---------SSPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTSP------FQNSFSSSSSQNLSSSSP 360
                    SSP A +++ +TS+   SSSSSAST+       F +  SSSS+ N +S+SP
Sbjct: 301 ASGGSSLFLSSP-APTAAPTTSSFGSSSSSSASTAAAATTPSFSSLLSSSSASNSTSASP 360

Query: 361 FAASSSGFSFSTTS--LSKTTSITAASSSS---SLTSASTSSSS--FSFGTPASSASQSS 420
           F AS+ GFSFS++S  L  T S T+  +S+   SLT+A++SSSS  FSF  P+SSASQ +
Sbjct: 361 FLAST-GFSFSSSSSFLKSTASSTSTPTSTTAPSLTAAASSSSSSGFSFAPPSSSASQPT 420

Query: 421 FGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTT-SASTPAATSTAQPSFS 480
           FG+   NAA+           +KPTSLSF TS APLFSTVTTT SA TPAA++ A  + S
Sbjct: 421 FGYG--NAAAM----------SKPTSLSFGTSSAPLFSTVTTTTSAYTPAASTAAASASS 480

Query: 481 --------MPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASS---SAIV 540
                    P F+LSSS+ATT S +A+ A S  SS A SSFTGFGVT+ AA+S   S+  
Sbjct: 481 SAAASTPAFPTFNLSSSSATTASSSAAPASSAASSAAVSSFTGFGVTNAAATSGSTSSFT 540

Query: 541 SLSLPTKSLTAASSSQAPASFG---FSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSS 600
             SL TK     SSSQA ++     FS   S+SAA+ T++ S  ++Q  TSSTLVVASSS
Sbjct: 541 GFSLSTKPSAPTSSSQAQSTTTAPVFSFPGSSSAASITSTSSTTTAQ--TSSTLVVASSS 600

Query: 601 SGTTSTVSATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQ 660
            GT+ + +A +SATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA+AIAEWDRRILQ
Sbjct: 601 -GTSLSATAAISATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQASAIAEWDRRILQ 660

Query: 661 NRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLD 720
           NRD+LLRLEIEVAKVVE Q  LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIYKDERGLLLD
Sbjct: 661 NRDVLLRLEIEVAKVVEAQASLERQLELIETHQQEVDKALLSMEEEAERIYKDERGLLLD 720

Query: 721 DEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILN 778
           DEAASTRDAMYEQAE +ERELEQM EQIKSII+T+N+SQGGEL+ +DGMTPLD VVRILN
Sbjct: 721 DEAASTRDAMYEQAEIVERELEQMAEQIKSIIETVNSSQGGELEALDGMTPLDVVVRILN 778

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
NUP62_ARATH6.9e-11552.22Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana GN=NUP62 PE=1 SV=1[more]
NSP1_CHATD1.6e-0729.89Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KA27_CUCSA3.8e-16862.91Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G108530 PE=4 SV=1[more]
A0A061E270_THECC1.4e-12756.38Structural constituent of nuclear pore isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_00563... [more]
A0A067KYS2_JATCU1.9e-12754.45Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_15753 PE=4 SV=1[more]
V4VYQ1_9ROSI2.8e-12354.11Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10019079mg PE=4 SV=1[more]
M5XS35_PRUPE1.4e-12257.87Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa002546mg PE=4 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G45000.13.9e-11652.22 structural constituent of nuclear pore[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|659119573|ref|XP_008459731.1|9.3e-24578.84PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucumis melo][more]
gi|778712216|ref|XP_011656864.1|5.7e-24276.60PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sati... [more]
gi|700191351|gb|KGN46555.1|5.4e-16862.91hypothetical protein Csa_6G108530 [Cucumis sativus][more]
gi|1009140487|ref|XP_015887679.1|3.8e-12956.73PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Ziziphus jujuba][more]
gi|590723563|ref|XP_007052219.1|2.1e-12756.38Structural constituent of nuclear pore isoform 1 [Theobroma cacao][more]
The following terms have been associated with this gene:
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0017056structural constituent of nuclear pore
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0005643nuclear pore
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR026010NSP1/NUP62
IPR007758Nucleoporin_NSP1_C
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
biological_process GO:0006913 nucleocytoplasmic transport
cellular_component GO:0005829 cytosol
cellular_component GO:0005643 nuclear pore
molecular_function GO:0017056 structural constituent of nuclear pore

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG12g04250.1Cp4.1LG12g04250.1mRNA


Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR007758Nucleoporin, NSP1-like, C-terminalPFAMPF05064Nsp1_Ccoord: 563..667
score: 2.4
IPR026010Nucleoporin NSP1/NUP62PANTHERPTHR12084NUCLEAR PORE GLYCOPROTEIN P62-RELATEDcoord: 20..777
score: 1.1E
NoneNo IPR availableunknownCoilCoilcoord: 681..708
score: -coord: 619..663
scor
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR12084:SF0GH12838Pcoord: 20..777
score: 1.1E