BLAST of CSPI06G08680 vs. Swiss-Prot
Match:
NUP62_ARATH (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana GN=NUP62 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 393.3 bits (1009), Expect = 6.1e-108
Identity = 410/783 (52.36%), Postives = 522/783 (66.67%), Query Frame = 1
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTG---FSFG------STNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNP 60
+ GF FGSS++ +SS SSTT FSF ST F FGSS S SS++ S
Sbjct: 12 VGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTGFGFGSSVSSTPASSTTPSFGFG 71
Query: 61 TSSSSPFPNPTSNPSSS-SFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSAS 120
SS+ F +S SS+ SFGFGSS+ T S+ SF +A++ SS+ APS +S +
Sbjct: 72 ASSTPSFGFGSSASSSTPSFGFGSSASVTPASTTPSFGFGTAAS--SSAPAPSLFGSSTT 131
Query: 121 SLFGVSSSSTGFNSFGF--GASSSSANSSASLFGA-ASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGA 180
+ SS++ G + FGF ++SS+A S+SLFGA ASS+ T S+S FGA AP+ G+
Sbjct: 132 N---ASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGA----APASGS 191
Query: 181 APSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSA 240
P GSS PS + SSA S++ LFGA+ SA S++P LFG A S+ T + P F ++
Sbjct: 192 TPLFGSS--PSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSP-LFG-APSSATGATPSFSVAS 251
Query: 241 SAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTS 300
SA S S +FG A+GS S F +++SGS+ S G GSSPF SSS S+ ST
Sbjct: 252 SAPGSSSSIFG----ATGSSPS-FSVASSASGSSPSIFGATGSSPFFGSSS---SAGSTP 311
Query: 301 NLFASS------LSTSPF-QSSLSSSSSQNLT--SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSIT 360
+LFASS S SPF S+ +SSS+ N + S+SPF AS +GFSF + S TTS T
Sbjct: 312 SLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSST 371
Query: 361 NVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL 420
S+ + ++SSSSFSFGT A+S GF++ STG S+AP++
Sbjct: 372 TPSAPPQT-----ASSSSSFSFGTSANS------GFNL----STGSSAAPAS-------- 431
Query: 421 SLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG 480
S S +V + +T TTTS+STPAA T+ P+ S PA + + + S A ++ P ASS
Sbjct: 432 STSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPASSAPASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSA 491
Query: 481 AVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTS 540
A S TGFG+ SS ++ + S + KTST ASSSQ + P+ + + ++T+T+
Sbjct: 492 ATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTT 551
Query: 541 GFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQER 600
+ SS + T + LVV SSS TST A V+ +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQER
Sbjct: 552 APATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGSPKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQER 611
Query: 601 TGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL 660
TG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL
Sbjct: 612 TGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQSSLERQLELIETHQQEVDKAL 671
Query: 661 VSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQG 720
S+EE+AERIY DER LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQG
Sbjct: 672 QSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQSELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQG 731
Query: 721 GELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKL 758
GEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G DREL+ K
Sbjct: 732 GELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI-ALQGSGGDRELMAPKH 739
BLAST of CSPI06G08680 vs. TrEMBL
Match:
A0A0A0KA27_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G108530 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 639.4 bits (1648), Expect = 5.5e-180
Identity = 518/756 (68.52%), Postives = 580/756 (76.72%), Query Frame = 1
Query: 8 SSTSQSSSPF---SSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSN 67
SS SS+P + + G S + F SS + S +S+S +S S F
Sbjct: 184 SSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLF-----G 243
Query: 68 PSSSSFGFGSSSF---STSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTG 127
S+++ G G S F +TS+ S S S+ GASSS SSA+TS +LF S S++
Sbjct: 244 ASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTS--NLFASSLSTSP 303
Query: 128 FNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGA 187
F S +SSSS N ++S AS SG S F GSL + SS SS + S +
Sbjct: 304 FQSTL--SSSSSQNLTSSSPFVASPSGFS----FPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSSSSSS 363
Query: 188 LSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASA 247
SSS+ +SS+ ++ S+ +SS+ S +SS+++SS+ +S+S++SS S +S+
Sbjct: 364 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 423
Query: 248 AASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSSL 307
++S S +SS S+ S SS +SSS + SS+S+S+ +SS S+S SS
Sbjct: 424 SSSSS---------SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 483
Query: 308 SSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTP 367
SSSSS + +SSS +S S S + S S ++S ++ SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTP
Sbjct: 484 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTP 543
Query: 368 ASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANS 427
ASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL SASTPAANS
Sbjct: 544 ASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL----------------SASTPAANS 603
Query: 428 TTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSL 487
TTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSL
Sbjct: 604 TTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSL 663
Query: 488 PTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTV 547
PTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTV
Sbjct: 664 PTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTV 723
Query: 548 SATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLR 607
SATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLR
Sbjct: 724 SATVSSTPKLPSEITGKTVEEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLR 783
Query: 608 LEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTR 667
LEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTR
Sbjct: 784 LEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTR 843
Query: 668 DAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLM 727
DAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLM
Sbjct: 844 DAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLM 901
Query: 728 WIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
WIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS
Sbjct: 904 WIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 901
BLAST of CSPI06G08680 vs. TrEMBL
Match:
A0A061E270_THECC (Structural constituent of nuclear pore isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_005631 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 480.7 bits (1236), Expect = 3.2e-132
Identity = 449/817 (54.96%), Postives = 563/817 (68.91%), Query Frame = 1
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSP-------------------LSL 60
MSGF F SS+S SS SS+T FS GS+ FGSS S ++
Sbjct: 1 MSGFSFPSSSSSQSSSSSSSTPFSLGSSPSPFGSSTSASAPTFGSSLFNSNPSCSSSTAI 60
Query: 61 SSSSSSSSNPTSSSSPFPN---PTSNPSSSSF----------GFGSSSFSTSTSSPFSFS 120
+++ + SSNP S SSPF P+S+ SS+S G G+S FS+S+SS S
Sbjct: 61 TTTPAFSSNPASGSSPFVGFGQPSSSSSSASSAPVSSFAVGSGSGASPFSSSSSSATSGL 120
Query: 121 LASASTGASSS---SAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAAS 180
+AS+ ++S APSSAA SAS LF +SS+ G S FG S SS +S + F AS
Sbjct: 121 FGAASSASASPLPWGAPSSAAPSASPLFVSASSAAGSGSSLFGTSISSTSSPSFGFATAS 180
Query: 181 SSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSA 240
S+ +S+ S+FGA S AA ++GSSL FGA S +A T+ + LFGA+ A +++
Sbjct: 181 STVSSALSIFGASS------SAASTTGSSL---FGASSFTASTTGSSLFGASSFAASTTG 240
Query: 241 PSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGL 300
SLF SSA+T+ PLFG S ASSG LFGASA A S S FG S GS L
Sbjct: 241 SSLFVACSSASTT--PLFG---STASSGPSLFGASALAVSSASSPFGA------SGGSSL 300
Query: 301 FGSSPF--GASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP-FQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGF 360
F SSP A ++ + S+S+S+ ++ +T+P F S LSSSS+ N TS+SPF+AS +GF
Sbjct: 301 FLSSPAPTAAPTTSSFGSSSSSSASTAAAATTPSFSSLLSSSSASNSTSASPFLAS-TGF 360
Query: 361 SFPTGS--LSKTTSITNVSSSSSS-SLTLASTSSSS--FSFGTPASSSSQSSFGFSINNA 420
SF + S L T S T+ +S+++ SLT A++SSSS FSF P+SS+SQ +FG+ NA
Sbjct: 361 SFSSSSSFLKSTASSTSTPTSTTAPSLTAAASSSSSSGFSFAPPSSSASQPTFGYG--NA 420
Query: 421 ASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTS------ASTPAANSTTQPSFSVPA 480
A+ +KPTSLS S APLFSTVTTT+ AST AA++++ + S PA
Sbjct: 421 AAM----------SKPTSLSFGTSSAPLFSTVTTTTSAYTPAASTAAASASSSAAASTPA 480
Query: 481 FSS---SSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSL---SLPTKT 540
F + SSS+ATT S +A+ A SAASS AVSSFTGFGVT++A++S + S SL TK
Sbjct: 481 FPTFNLSSSSATTASSSAAPASSAASSAAVSSFTGFGVTNAAATSGSTSSFTGFSLSTKP 540
Query: 541 STAASSSQAPAS-----FGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 600
S SSSQA ++ F FP +SA++ +T+S ++ +QTSS LVVASSS GT+ +
Sbjct: 541 SAPTSSSQAQSTTTAPVFSFPGSSSAASITSTSS----TTTAQTSSTLVVASSS-GTSLS 600
Query: 601 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 660
+A +S+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA+AIAEWDRRI+QNRD+LL
Sbjct: 601 ATAAISATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQASAIAEWDRRILQNRDVLL 660
Query: 661 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 720
RLEIEVAKVVE QA LE++LELIETHQQEVDKAL+S+EE+AERIYKDERGLLLDDEAAST
Sbjct: 661 RLEIEVAKVVEAQASLERQLELIETHQQEVDKALLSMEEEAERIYKDERGLLLDDEAAST 720
Query: 721 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 758
RDAMYEQAE +ERELEQM EQIKSII+T+N++QGGEL+ +DGMTPLD VVRILNNQL+SL
Sbjct: 721 RDAMYEQAEIVERELEQMAEQIKSIIETVNSSQGGELEALDGMTPLDVVVRILNNQLTSL 778
BLAST of CSPI06G08680 vs. TrEMBL
Match:
V4VYQ1_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10019079mg PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 462.2 bits (1188), Expect = 1.2e-126
Identity = 432/781 (55.31%), Postives = 543/781 (69.53%), Query Frame = 1
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
MSG F +SQSS+P + G S ST FSFGSSP + NPTS+SS
Sbjct: 6 MSGSSF---SSQSSTPSQFSFGSSASSTGFSFGSSPLAFA---------NPTSASS---T 65
Query: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
TS+PS +SF F +SSFS+S SSPF AST A+ SSAP++A
Sbjct: 66 TTSSPSPTSFSFNTSSFSSS-SSPF------AST-ANPSSAPAAAPPG------------ 125
Query: 121 GFNSFGFGASSSSA--NSSASLFGAASSS--GTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGS-SL 180
FGFG+ SS+ +SS SLFG+ASS+ SST +G+ P+P FGA S+ + +
Sbjct: 126 ----FGFGSFSSTTVPSSSPSLFGSASSAFGAASSTGNSKSGASPSP-FGANLSANTITT 185
Query: 181 APSFGALSSSAGTSSAPL----FGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAAS 240
PS +++SSA S++ FGA+ +A ++++PS FG ASSA ++++PLFG + AAS
Sbjct: 186 TPSPFSVASSAANSASSTTTSQFGASFTASSAASPS-FGTASSAASTASPLFGAPSLAAS 245
Query: 241 SGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSAST--SNLFA 300
+ S +FGA A+A + S FG PA+S+ +T L GS+ ASS+ L A+T S+LF
Sbjct: 246 TTSNVFGAPASAVSTTPSPFG-PASSAATTTLSLIGSASSTASSAPGLFGAATGSSSLFG 305
Query: 301 SSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFP--TGSLSKTTSITNVSSSSSSSLT 360
S+ S+ P SSLSSSSS + S+SPF S +GFSFP T SL+ TT+ T + S +SS
Sbjct: 306 SA-SSGPSFSSLSSSSSSS--SASPFSVS-TGFSFPKATQSLTSTTASTTIPSLTSS--- 365
Query: 361 LASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFS 420
SS+S SS FS NNA ++TATKPTSLS S APLFS
Sbjct: 366 ---------------SSASSSSLSFSFNNAT--------TSTATKPTSLSFGMSTAPLFS 425
Query: 421 TVTTTSASTPAANSTTQPSFS---VPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGF 480
TVTTTSAS PAA++TT P+ S +P+FS SSS+A ++ A +SAP+++++ SSFTGF
Sbjct: 426 TVTTTSASAPAASTTTAPAASTVALPSFSVSSSSA-AITTALTSAPASSAASTTSSFTGF 485
Query: 481 GVTSSASSS---SAIGSLSLPTKTSTAASSSQ-----APASFGFPSLASASTAATTTSGF 540
G S+A+SS S+ SL +K AS+SQ +FG P+ SASTAATT+SG
Sbjct: 486 GTASTATSSGTTSSFTDFSLASKPIVPASTSQPQSTATATAFGVPT--SASTAATTSSG- 545
Query: 541 SASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTG 600
++ QTSS+LVVA SSSGT+S+VS V++TPKLPSEITG+TVEEIIKEWN+ELQERTG
Sbjct: 546 -STPAPQTSSSLVVA-SSSGTSSSVSTAVTTTPKLPSEITGRTVEEIIKEWNSELQERTG 605
Query: 601 KFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVS 660
KFRKQA A+AEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S
Sbjct: 606 KFRKQATAMAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQSNLERQLELIETHQQEVDKALQS 665
Query: 661 VEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGE 720
+EE+AERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE++ERE+E MTEQIKSIIQTLNA+QGG
Sbjct: 666 MEEEAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEFVEREMEHMTEQIKSIIQTLNASQGGG 707
Query: 721 LDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWM 758
D DGMTPLD VV+ILNNQLSSLMWID+KAEEFSSRIQKL AT+G +ADR L+G K WM
Sbjct: 726 FDAFDGMTPLDVVVQILNNQLSSLMWIDDKAEEFSSRIQKL-ATQGSSADRVLMGPKFWM 707
BLAST of CSPI06G08680 vs. TrEMBL
Match:
A0A061DVE1_THECC (Structural constituent of nuclear pore isoform 2 (Fragment) OS=Theobroma cacao GN=TCM_005631 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 458.4 bits (1178), Expect = 1.7e-125
Identity = 364/604 (60.26%), Postives = 449/604 (74.34%), Query Frame = 1
Query: 179 FGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFG 238
FGA S +A T+ + LFGA+ A +++ SLF SSA+T+ PLFG S ASSG LFG
Sbjct: 3 FGASSFTASTTGSSLFGASSFAASTTGSSLFVACSSASTT--PLFG---STASSGPSLFG 62
Query: 239 ASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPF--GASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 298
ASA A S S FG S GS LF SSP A ++ + S+S+S+ ++ +T+P
Sbjct: 63 ASALAVSSASSPFGA------SGGSSLFLSSPAPTAAPTTSSFGSSSSSSASTAAAATTP 122
Query: 299 -FQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGS--LSKTTSITNVSSSSSS-SLTLASTS 358
F S LSSSS+ N TS+SPF+AS +GFSF + S L T S T+ +S+++ SLT A++S
Sbjct: 123 SFSSLLSSSSASNSTSASPFLAS-TGFSFSSSSSFLKSTASSTSTPTSTTAPSLTAAASS 182
Query: 359 SSS--FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVT 418
SSS FSF P+SS+SQ +FG+ NAA+ +KPTSLS S APLFSTVT
Sbjct: 183 SSSSGFSFAPPSSSASQPTFGYG--NAAAM----------SKPTSLSFGTSSAPLFSTVT 242
Query: 419 TTS------ASTPAANSTTQPSFSVPAFSS---SSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSF 478
TT+ AST AA++++ + S PAF + SSS+ATT S +A+ A SAASS AVSSF
Sbjct: 243 TTTSAYTPAASTAAASASSSAAASTPAFPTFNLSSSSATTASSSAAPASSAASSAAVSSF 302
Query: 479 TGFGVTSSASSSSAIGSL---SLPTKTSTAASSSQAPAS-----FGFPSLASASTAATTT 538
TGFGVT++A++S + S SL TK S SSSQA ++ F FP +SA++ +T+
Sbjct: 303 TGFGVTNAAATSGSTSSFTGFSLSTKPSAPTSSSQAQSTTTAPVFSFPGSSSAASITSTS 362
Query: 539 SGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE 598
S ++ +QTSS LVVASSS GT+ + +A +S+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE
Sbjct: 363 S----TTTAQTSSTLVVASSS-GTSLSATAAISATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE 422
Query: 599 RTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKA 658
RTGKFRKQA+AIAEWDRRI+QNRD+LLRLEIEVAKVVE QA LE++LELIETHQQEVDKA
Sbjct: 423 RTGKFRKQASAIAEWDRRILQNRDVLLRLEIEVAKVVEAQASLERQLELIETHQQEVDKA 482
Query: 659 LVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQ 718
L+S+EE+AERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE +ERELEQM EQIKSII+T+N++Q
Sbjct: 483 LLSMEEEAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEIVERELEQMAEQIKSIIETVNSSQ 542
Query: 719 GGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK 758
GGEL+ +DGMTPLD VVRILNNQL+SLMWIDEKAEEFSSRIQKL A +G AADREL+ K
Sbjct: 543 GGELEALDGMTPLDVVVRILNNQLTSLMWIDEKAEEFSSRIQKL-AMQGSAADRELMAPK 576
BLAST of CSPI06G08680 vs. TrEMBL
Match:
A0A067KYS2_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_15753 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 438.3 bits (1126), Expect = 1.8e-119
Identity = 437/832 (52.52%), Postives = 547/832 (65.75%), Query Frame = 1
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFG--SSPSPLSLSSSSSSSSNPTS---SS 60
MSGF F SS+SQSSS SS++ FSFGS+ SFG +S S S SSS +++NP+S SS
Sbjct: 1 MSGFSFASSSSQSSSS-SSSSPFSFGSSAPSFGPTTSASLFSFGSSSFAAANPSSASSSS 60
Query: 61 SPFP---------NPTSNPSSSSFGFG--SSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPS- 120
SP NP+S P++SSFGFG SSS S+S+SS + SL+ S A++++ PS
Sbjct: 61 SPLSFSFNTSSNSNPSSAPTASSFGFGFSSSSSSSSSSSGPALSLSFGSAPAATTTTPSL 120
Query: 121 --SAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLP 180
S S SS FG ++S G S FGA S++A+S++SLFG SS+ +S + L G
Sbjct: 121 FGSVPISTSSPFGQAASPAGSGSNLFGAVSAAASSASSLFGTVSSAASSGSPLLGT---- 180
Query: 181 APSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSA--GTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSS 240
A+ S+G+S+ FG +SS+ GTS +P FG SA ASS + FG S T+S
Sbjct: 181 -----ASASTGTSV---FGGSTSSSLFGTSISPQFGTTSSA-ASSVSTQFGTTLSITSSP 240
Query: 241 APLFG-TSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGA----- 300
+P FG TS+SAASS LFGA++ A SG S FG ++S+ S+GS LFG+S G
Sbjct: 241 SPPFGTTSSSAASSAPSLFGATSPAVSSGPSPFGI-SSSTASSGSFLFGTSSSGTGTSSG 300
Query: 301 ----SSSGTLSSASTSNLFA--------SSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSG 360
SSG ++ TSNLFA SS ST+ F S+L S++ N + F ++P G
Sbjct: 301 PSLFGSSGASNTTGTSNLFASSANALSSSSASTTSFSSNLFSATPSNSSPGLSFSSTPPG 360
Query: 361 FSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSS-SSFSFGTPASSSSQSSFG--------- 420
FSFP S TS T VSSS++ SLT +S +S SSFSFGTP+S+SS S+ G
Sbjct: 361 FSFPK-STPSVTSTTTVSSSAAPSLTQSSAASVSSFSFGTPSSASSASASGFSFLTPSSA 420
Query: 421 -----FSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS 480
FS +NAA + + +T A KPTS S PLFSTVTTT++ TPAA ST
Sbjct: 421 SSQSSFSFSNAAYSSAPATSTTVAAKPTSPS------PLFSTVTTTNSLTPAAGSTV--- 480
Query: 481 FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTS 540
+SSS+ +TLS+ A +A S +SS + ++ S+A+SS S + +
Sbjct: 481 ------ASSSATTSTLSLPAFTAFSVSSSSSATT------ASTAASSGTTNSFTGIGTAN 540
Query: 541 TAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSAS----------------------SQSQT 600
T ASS+ A A GFP S A+T+ S + + +QT
Sbjct: 541 TTASSANA-AFTGFPLSNKTSVPASTSQAQSTAAAPLFSIPTSTSAAATATSSSTTTAQT 600
Query: 601 SSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANA 660
+ +L VA SSSGT+S+VSA VS+TPKLPSEITGKTVEEIIK+WNAELQERTGKFRKQA A
Sbjct: 601 TLSLAVA-SSSGTSSSVSAAVSATPKLPSEITGKTVEEIIKDWNAELQERTGKFRKQAAA 660
Query: 661 IAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERI 720
IAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQA LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERI
Sbjct: 661 IAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQASLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERI 720
Query: 721 YKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMT 757
YKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE IER+LE MTEQ+KS+I TLN++QGGELD ID MT
Sbjct: 721 YKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAELIERDLEHMTEQVKSVIDTLNSSQGGELDTIDRMT 780
BLAST of CSPI06G08680 vs. TAIR10
Match:
AT2G45000.1 (AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore)
HSP 1 Score: 392.9 bits (1008), Expect = 4.5e-109
Identity = 402/794 (50.63%), Postives = 515/794 (64.86%), Query Frame = 1
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
+ GF FGSS++ +SS SSTT SPLS S N
Sbjct: 12 VGGFSFGSSSATNSSSASSTT---------------SPLSFSF----------------N 71
Query: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPS----SAATSASSLFGVS 120
+SNPSS+ FGFGSS ST SS + S G +SS PS S+A+S++ FG
Sbjct: 72 QSSNPSSTGFGFGSSVSSTPASS------TTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTPSFGFG 131
Query: 121 SS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSS 180
SS ++ SFGFG ++SS+ + SLFG S T++ S GS P FG SS
Sbjct: 132 SSASVTPASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFG----SSTTNASSAAPGSSP---FGFVTSS 191
Query: 181 GSSLA-PS---FGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLF 240
SS A PS FGA +SSA T S+ FGAAP++G++ S+PSLF SSA+ S++ LF
Sbjct: 192 ASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLF 251
Query: 241 GTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS--GLFGSSP-FGASSSGTLS 300
G S+SAA+S S LFGA ++A+G+ S F +++ GS+ S G GSSP F +SS +
Sbjct: 252 GASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPS-FSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASS---A 311
Query: 301 SASTSNLFASSLSTSPFQSSLSSSSSQNL---TSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITN 360
S S+ ++F ++ S+ F SS S+ S+ +L +SS +SPS F T + S T++ +N
Sbjct: 312 SGSSPSIFGATGSSPFFGSSSSAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSN 371
Query: 361 VSSSSSSSLT----LASTSSSSFSFGTP------ASSSSQSSFGFSINNA--ASTGGSSA 420
S+S S+ T L ST+SS+ S TP ASSSS SFG S N+ STG S+A
Sbjct: 372 ASASPFSASTGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQTASSSSSFSFGTSANSGFNLSTGSSAA 431
Query: 421 PSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIA 480
P++ S S +V + +T TTTS+STPAA T+ P+ S PA + + + S A
Sbjct: 432 PAS--------STSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPASSAPASTMAFPSFGVTSSA 491
Query: 481 ASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSL 540
++ P ASS A S TGFG+ SS ++ + S + KTST ASSSQ + P+
Sbjct: 492 TNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTT--SPAF 551
Query: 541 ASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEI 600
+ + ++T+T+ + SS + T + LVV SSS TST A V+ +PKLPSEITGKTVEEI
Sbjct: 552 SFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGSPKLPSEITGKTVEEI 611
Query: 601 IKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELI 660
IKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELI
Sbjct: 612 IKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQSSLERQLELI 671
Query: 661 ETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIK 720
ETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+
Sbjct: 672 ETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQSELVERELEHMTEQIR 731
Query: 721 SIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGP 758
SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G
Sbjct: 732 SIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI-ALQGS 739
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
gi|778712216|ref|XP_011656864.1| (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 1166.4 bits (3016), Expect = 0.0e+00
Identity = 752/758 (99.21%), Postives = 754/758 (99.47%), Query Frame = 1
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPN 60
Query: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST
Sbjct: 61 PTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSST 120
Query: 121 GFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFG 180
GFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSS+APSFG
Sbjct: 121 GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFG 180
Query: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS
Sbjct: 181 ALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGAS 240
Query: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSS 300
AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQS+
Sbjct: 241 AAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQST 300
Query: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSS-SSSSSLTLASTSSSSFSFG 360
LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSS SSSSSLTLASTSSSSFSFG
Sbjct: 301 LSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFG 360
Query: 361 TPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAA 420
TPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNS APLFSTVTTTSASTPAA
Sbjct: 361 TPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSXAPLFSTVTTTSASTPAA 420
Query: 421 NSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSL 480
NSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSL
Sbjct: 421 NSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSL 480
Query: 481 SLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTS 540
SLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTS
Sbjct: 481 SLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTS 540
Query: 541 TVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDIL 600
TVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDIL
Sbjct: 541 TVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDIL 600
Query: 601 LRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAS 660
LRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAS
Sbjct: 601 LRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAS 660
Query: 661 TRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSS 720
TRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSS
Sbjct: 661 TRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSS 720
Query: 721 LMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
LMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS
Sbjct: 721 LMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
gi|659119573|ref|XP_008459731.1| (PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucumis melo])
HSP 1 Score: 1109.7 bits (2869), Expect = 0.0e+00
Identity = 729/762 (95.67%), Postives = 738/762 (96.85%), Query Frame = 1
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSS--PFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPF 60
MSGFGFGSSTSQSSS PFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSLSSSSSSS NPTSSSSPF
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSS-NPTSSSSPF 60
Query: 61 PNPTSNP--SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVS 120
PNPTSNP SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGASSSS PSS+A SASSLFGVS
Sbjct: 61 PNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVS 120
Query: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLA 180
SSSTGFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSS+A
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVA 180
Query: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGL 240
PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS L
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSAL 240
Query: 241 FGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 300
FGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Sbjct: 241 FGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP 300
Query: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-SSSSSSSLTLASTSSSS 360
FQSSLSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV SSSSSSSLTLASTSSSS
Sbjct: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSS 360
Query: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS
Sbjct: 361 FSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSAS 420
Query: 421 TPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
TPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSA
Sbjct: 421 TPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSA 480
Query: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS
Sbjct: 481 IGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSS 540
Query: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
Sbjct: 541 GTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN 600
Query: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDD 660
RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDD
Sbjct: 601 RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDD 660
Query: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720
EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN
Sbjct: 661 EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN 720
Query: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 721 QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 761
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
gi|700191351|gb|KGN46555.1| (hypothetical protein Csa_6G108530 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 639.4 bits (1648), Expect = 7.8e-180
Identity = 518/756 (68.52%), Postives = 580/756 (76.72%), Query Frame = 1
Query: 8 SSTSQSSSPF---SSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSN 67
SS SS+P + + G S + F SS + S +S+S +S S F
Sbjct: 184 SSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLF-----G 243
Query: 68 PSSSSFGFGSSSF---STSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTG 127
S+++ G G S F +TS+ S S S+ GASSS SSA+TS +LF S S++
Sbjct: 244 ASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTS--NLFASSLSTSP 303
Query: 128 FNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGA 187
F S +SSSS N ++S AS SG S F GSL + SS SS + S +
Sbjct: 304 FQSTL--SSSSSQNLTSSSPFVASPSGFS----FPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSSSSSS 363
Query: 188 LSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASA 247
SSS+ +SS+ ++ S+ +SS+ S +SS+++SS+ +S+S++SS S +S+
Sbjct: 364 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 423
Query: 248 AASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSSL 307
++S S +SS S+ S SS +SSS + SS+S+S+ +SS S+S SS
Sbjct: 424 SSSSS---------SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 483
Query: 308 SSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTP 367
SSSSS + +SSS +S S S + S S ++S ++ SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTP
Sbjct: 484 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTP 543
Query: 368 ASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANS 427
ASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL SASTPAANS
Sbjct: 544 ASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL----------------SASTPAANS 603
Query: 428 TTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSL 487
TTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSL
Sbjct: 604 TTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSL 663
Query: 488 PTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTV 547
PTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTV
Sbjct: 664 PTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTV 723
Query: 548 SATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLR 607
SATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLR
Sbjct: 724 SATVSSTPKLPSEITGKTVEEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLR 783
Query: 608 LEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTR 667
LEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTR
Sbjct: 784 LEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTR 843
Query: 668 DAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLM 727
DAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLM
Sbjct: 844 DAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLM 901
Query: 728 WIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
WIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS
Sbjct: 904 WIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 901
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
gi|590723563|ref|XP_007052219.1| (Structural constituent of nuclear pore isoform 1 [Theobroma cacao])
HSP 1 Score: 480.7 bits (1236), Expect = 4.7e-132
Identity = 449/817 (54.96%), Postives = 563/817 (68.91%), Query Frame = 1
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSP-------------------LSL 60
MSGF F SS+S SS SS+T FS GS+ FGSS S ++
Sbjct: 1 MSGFSFPSSSSSQSSSSSSSTPFSLGSSPSPFGSSTSASAPTFGSSLFNSNPSCSSSTAI 60
Query: 61 SSSSSSSSNPTSSSSPFPN---PTSNPSSSSF----------GFGSSSFSTSTSSPFSFS 120
+++ + SSNP S SSPF P+S+ SS+S G G+S FS+S+SS S
Sbjct: 61 TTTPAFSSNPASGSSPFVGFGQPSSSSSSASSAPVSSFAVGSGSGASPFSSSSSSATSGL 120
Query: 121 LASASTGASSS---SAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAAS 180
+AS+ ++S APSSAA SAS LF +SS+ G S FG S SS +S + F AS
Sbjct: 121 FGAASSASASPLPWGAPSSAAPSASPLFVSASSAAGSGSSLFGTSISSTSSPSFGFATAS 180
Query: 181 SSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSA 240
S+ +S+ S+FGA S AA ++GSSL FGA S +A T+ + LFGA+ A +++
Sbjct: 181 STVSSALSIFGASS------SAASTTGSSL---FGASSFTASTTGSSLFGASSFAASTTG 240
Query: 241 PSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGL 300
SLF SSA+T+ PLFG S ASSG LFGASA A S S FG S GS L
Sbjct: 241 SSLFVACSSASTT--PLFG---STASSGPSLFGASALAVSSASSPFGA------SGGSSL 300
Query: 301 FGSSPF--GASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP-FQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGF 360
F SSP A ++ + S+S+S+ ++ +T+P F S LSSSS+ N TS+SPF+AS +GF
Sbjct: 301 FLSSPAPTAAPTTSSFGSSSSSSASTAAAATTPSFSSLLSSSSASNSTSASPFLAS-TGF 360
Query: 361 SFPTGS--LSKTTSITNVSSSSSS-SLTLASTSSSS--FSFGTPASSSSQSSFGFSINNA 420
SF + S L T S T+ +S+++ SLT A++SSSS FSF P+SS+SQ +FG+ NA
Sbjct: 361 SFSSSSSFLKSTASSTSTPTSTTAPSLTAAASSSSSSGFSFAPPSSSASQPTFGYG--NA 420
Query: 421 ASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTS------ASTPAANSTTQPSFSVPA 480
A+ +KPTSLS S APLFSTVTTT+ AST AA++++ + S PA
Sbjct: 421 AAM----------SKPTSLSFGTSSAPLFSTVTTTTSAYTPAASTAAASASSSAAASTPA 480
Query: 481 FSS---SSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSL---SLPTKT 540
F + SSS+ATT S +A+ A SAASS AVSSFTGFGVT++A++S + S SL TK
Sbjct: 481 FPTFNLSSSSATTASSSAAPASSAASSAAVSSFTGFGVTNAAATSGSTSSFTGFSLSTKP 540
Query: 541 STAASSSQAPAS-----FGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTST 600
S SSSQA ++ F FP +SA++ +T+S ++ +QTSS LVVASSS GT+ +
Sbjct: 541 SAPTSSSQAQSTTTAPVFSFPGSSSAASITSTSS----TTTAQTSSTLVVASSS-GTSLS 600
Query: 601 VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILL 660
+A +S+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA+AIAEWDRRI+QNRD+LL
Sbjct: 601 ATAAISATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQASAIAEWDRRILQNRDVLL 660
Query: 661 RLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST 720
RLEIEVAKVVE QA LE++LELIETHQQEVDKAL+S+EE+AERIYKDERGLLLDDEAAST
Sbjct: 661 RLEIEVAKVVEAQASLERQLELIETHQQEVDKALLSMEEEAERIYKDERGLLLDDEAAST 720
Query: 721 RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSL 758
RDAMYEQAE +ERELEQM EQIKSII+T+N++QGGEL+ +DGMTPLD VVRILNNQL+SL
Sbjct: 721 RDAMYEQAEIVERELEQMAEQIKSIIETVNSSQGGELEALDGMTPLDVVVRILNNQLTSL 778
BLAST of CSPI06G08680 vs. NCBI nr
Match:
gi|1009140487|ref|XP_015887679.1| (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Ziziphus jujuba])
HSP 1 Score: 463.8 bits (1192), Expect = 5.9e-127
Identity = 428/780 (54.87%), Postives = 525/780 (67.31%), Query Frame = 1
Query: 2 SGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNP--------TS 61
+GF FGSS SSS + T S S F+ SS S +S+ SS+S P T+
Sbjct: 60 TGFSFGSSPFSSSSSLAPATASSSFSLPFNTTSSSSSSFSNSNPSSASTPSFRFGSSTTA 119
Query: 62 SSSPFPNPTSNPSSSSFGFGSSSFSTST-SSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSL 121
SSS P+ + + S FG ++F+ T SS F S + S G+S++ AP S SL
Sbjct: 120 SSSALPSSAGSSAPSPFG---NTFAPGTGSSRFGISTITPSFGSSAAPAPGS------SL 179
Query: 122 FGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAAS-SSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSS 181
FG +SS T + FG S S+G+S ++LFG + F A+ SS
Sbjct: 180 FGTASSVT-----------------VTSFGTPSFSTGSSGSTLFGTSVSGSSGFVASLSS 239
Query: 182 GSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAAS 241
SS +P F SS A SS +F A ASSA SLFG + S + +S+PLFGTS+S S
Sbjct: 240 SSSSSP-FLVASSVAPPSS--MFLGASGPAASSASSLFGASLSGSGTSSPLFGTSSSTTS 299
Query: 242 SGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSG------TLSSASTS 301
SG LFG+S +A G+ FGT ++S+ S+GS FG+S G S G + SAS
Sbjct: 300 SGPSLFGSSVSAPGTSFPPFGT-SSSAPSSGSPSFGTSASGTSQFGASTPAVSTGSASLG 359
Query: 302 NLFASSLSTSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGS-LSKTT--SITNVSSSS 361
+ ++ + T+P S ++SS N +S+SPF AS +GFSF T S K T S + SSS
Sbjct: 360 SSSSALVPTTPSILSFPTTSSTNSSSASPFSASSTGFSFSTSSAFGKPTADSTSTAVSSS 419
Query: 362 SSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSV 421
+ S + +ST+SS FSFG PASS+SQSSFGF N A+S +S KP LS + S
Sbjct: 420 APSTSSSSTNSSGFSFGPPASSASQSSFGFG-NAASSAAMASNKPLAGAKP--LSFTTSA 479
Query: 422 APLFSTVTTTSA-STPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSF 481
APLFSTVTTTSA STPA++STTQ SFSVPAF ++SA+T + SA SS + F
Sbjct: 480 APLFSTVTTTSASSTPASSSTTQSSFSVPAFGVTASASTAAPV------SAVSSATTAPF 539
Query: 482 TGFGVTSSASSSSAIGS---LSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLA-SASTAATTTSGFS 541
TGF +T + +SS A S SL TKTST ASS A ++ G P+L+ SA T+ T S
Sbjct: 540 TGFSLTGTTASSGAASSSPTFSLSTKTSTPASSVPAQSTSGVPALSVSAPTSVAATVPSS 599
Query: 542 ASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGK 601
++ QT+S+LVVA SSSGTTS VS TVS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWN+ELQERTGK
Sbjct: 600 GAAAIQTTSSLVVA-SSSGTTSAVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNSELQERTGK 659
Query: 602 FRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSV 661
FRKQANAIAEWDRRI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQA LE++LELIETHQQEVDKAL SV
Sbjct: 660 FRKQANAIAEWDRRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQANLERQLELIETHQQEVDKALQSV 719
Query: 662 EEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGEL 721
EE+AERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE+IERELEQM+EQIKSIIQ++NANQGG++
Sbjct: 720 EEEAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEFIERELEQMSEQIKSIIQSINANQGGDI 779
Query: 722 DVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 758
D D + PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI KL A++G AADR+ +G K WMS
Sbjct: 780 DANDAVAPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIHKL-ASQGSAADRQSMGPKFWMS 798
The following BLAST results are available for this feature:
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| NUP62_ARATH | 6.1e-108 | 52.36 | Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana GN=NUP62 PE=1 SV=1 | [more] |
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| A0A0A0KA27_CUCSA | 5.5e-180 | 68.52 | Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G108530 PE=4 SV=1 | [more] |
| A0A061E270_THECC | 3.2e-132 | 54.96 | Structural constituent of nuclear pore isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_00563... | [more] |
| V4VYQ1_9ROSI | 1.2e-126 | 55.31 | Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10019079mg PE=4 SV=1 | [more] |
| A0A061DVE1_THECC | 1.7e-125 | 60.26 | Structural constituent of nuclear pore isoform 2 (Fragment) OS=Theobroma cacao G... | [more] |
| A0A067KYS2_JATCU | 1.8e-119 | 52.52 | Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_15753 PE=4 SV=1 | [more] |
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| AT2G45000.1 | 4.5e-109 | 50.63 | structural constituent of nuclear pore | [more] |
