CmoCh04G025550 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)

Overview
NameCmoCh04G025550
Typegene
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr04 : 18728663 .. 18729604 (+)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGGAAAATGGGATCCTCAATGGCTCCTCTTCTTTTCACTGCCTTTGTGGCTCTTCTTTCCCTAAGCTTGCCATCAACCACCAATGCTAATTATTTCTATGCATCTCCCCCTCCTCCTAAGAAGGTAGACTATCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTGTATTATCCGCCTCCTGTCTACTCTCCGCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAAAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCGGTCTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAAGTCTACTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTATCCACCTCCAGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCTGTCTACTCTCCCCCGCCACCCAAGAAAGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCACCCGCCACCCAAGAAGGTGTACTACCCCCCTCCCGTCTACTCTCCCCCACCACCAAAGAAGGTATACTATCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCTCCACCCGTGTACTCTCCACCACCACCCAAGAAAGTATACTACCCGCCACCAGTACACTCGCCACCACCACCGGTCTACTACTACTCATCCCCACCTCCTCCCCACTACTAG

mRNA sequence

ATGGGGAAAATGGGATCCTCAATGGCTCCTCTTCTTTTCACTGCCTTTGTGGCTCTTCTTTCCCTAAGCTTGCCATCAACCACCAATGCTAATTATTTCTATGCATCTCCCCCTCCTCCTAAGAAGGTAGACTATCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTGTATTATCCGCCTCCTGTCTACTCTCCGCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAAAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCGGTCTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAAGTCTACTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTATCCACCTCCAGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCTGTCTACTCTCCCCCGCCACCCAAGAAAGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCACCCGCCACCCAAGAAGGTGTACTACCCCCCTCCCGTCTACTCTCCCCCACCACCAAAGAAGGTATACTATCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCTCCACCCGTGTACTCTCCACCACCACCCAAGAAAGTATACTACCCGCCACCAGTACACTCGCCACCACCACCGGTCTACTACTACTCATCCCCACCTCCTCCCCACTACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGGAAAATGGGATCCTCAATGGCTCCTCTTCTTTTCACTGCCTTTGTGGCTCTTCTTTCCCTAAGCTTGCCATCAACCACCAATGCTAATTATTTCTATGCATCTCCCCCTCCTCCTAAGAAGGTAGACTATCCGCCTCCCGTCTACCATTCTCCACCACCACCTAAGAAGGTGTATTATCCGCCTCCTGTCTACTCTCCGCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAAAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTCTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCGCCTCCAGTTTACCATTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCGGTCTACCATTCTCCACCACCACCGAAGAAGGTCTACTACCCACCACCTGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAAGTCTACTACCCGCCTCCTGTTTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTATCCACCTCCAGTCTACTCTCCCCCACCACCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCTGTCTACTCTCCCCCGCCACCCAAGAAAGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCACCCGTCTACTCTCACCCGCCACCCAAGAAGGTGTACTACCCCCCTCCCGTCTACTCTCCCCCACCACCAAAGAAGGTATACTATCCACCTCCCGTCTACTCTCCACCACCACCCAAGAAGGTATACTACCCTCCACCCGTGTACTCTCCACCACCACCCAAGAAAGTATACTACCCGCCACCAGTACACTCGCCACCACCACCGGTCTACTACTACTCATCCCCACCTCCTCCCCACTACTAG
Homology
[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN1_ARATH (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 8.2e-67
Identity = 219/333 (65.77%), Postives = 223/333 (66.97%), Query Frame = 1 

Query: 8   MAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY- 67
           MA  L  AF    SL+  S T ANYFY+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 1   MASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYK 60

Query: 68  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP--------PPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 127
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y P        PPVY SPPPP K Y PPPVY SPPP
Sbjct: 61  SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPP 120

Query: 128 PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY- 187
           P K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 121 PVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYK 180

Query: 188 SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPP 247
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 181 SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPP 240

Query: 248 PVYSHPPPKKVYYPPP-VYSPPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY 307
           PVY  PPP   Y PPP VY  PPP   Y PPPV  +SPPPP     PP VY  PPP   Y
Sbjct: 241 PVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHY 300

Query: 308 YPPPV--HSPPPPVYY------YSSPPPP--HY 314
            PPPV  HSPPPPV+Y      Y SPPPP  HY
Sbjct: 301 SPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHY 329

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN3_ARATH (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 241.1 bits (614), Expect = 1.6e-62
Identity = 222/354 (62.71%), Postives = 229/354 (64.69%), Query Frame = 1 

Query: 4   MGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKK-----VDY--PPPVYHSPPPP 63
           MGS MA L+ T  V  +SL+  S + ANYFY+SPPPP K     V +  PPPVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 64  KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPK 123
           KK Y      SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  KKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 120

Query: 124 KVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 183
           K Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPK
Sbjct: 121 KHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 180

Query: 184 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SP 243
           K Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SP
Sbjct: 181 KHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 240

Query: 244 PPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY 303
           PPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY  PPP K +Y   VY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 241 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---VYKSPPPPVKHYSPPPVY 300

Query: 304 -SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV-HSPPPPV--YYYSSPPPP--HY 314
            SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV HSPPPP   Y Y SPPPP  HY
Sbjct: 301 HSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY 328

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. Swiss-Prot
Match: LRX1_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 5.6e-39
Identity = 162/285 (56.84%), Postives = 167/285 (58.60%), Query Frame = 1 

Query: 34  YASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY- 93
           Y  PPPP     PP VY SPPPP        VYS PPP     PP VY SPPPP  VY  
Sbjct: 456 YPPPPPPSPSPPPPYVYSSPPPPY-------VYSSPPP-----PPYVYSSPPPPPYVYSS 515

Query: 94  -PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 153
            PPP  +S PPP  VY  PP    PPPP     PPP   S PPP  VYY P V  SPPPP
Sbjct: 516 PPPPYVYSSPPPPYVYSSPP----PPPPSP---PPPCPESSPPPPVVYYAP-VTQSPPPP 575

Query: 154 KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 213
             VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP  YSPPPP  VYYP    SPPPP
Sbjct: 576 SPVYYPPVTQSPPPPSPVYYPPVTNSPPPPSPVYYPPVTYSPPPPSPVYYPQVTPSPPPP 635

Query: 214 KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 273
             +YYPP   SPPPP  VYYPP   S PPP  VYYPP   SPPPP  VYYP    SPPPP
Sbjct: 636 SPLYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPP 695

Query: 274 KKVYYPPPVYSPPPPK--KVYYPP---PVHSPPPPVYYYSSPPPP 312
            + YY P   SPPP K  K  +PP   P + PPP   Y SSPPPP
Sbjct: 696 TEYYYSPS-QSPPPTKACKEGHPPQATPSYEPPPEYSYSSSPPPP 719

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. Swiss-Prot
Match: LRX2_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 5.2e-29
Identity = 161/307 (52.44%), Postives = 170/307 (55.37%), Query Frame = 1 

Query: 25  PSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYH-SPPPPK-------KVYYPPPVYSPPPPKKVYY 84
           PS+  +    A PPPP     PPP Y  SPPPP        + Y PPP  SPPPP     
Sbjct: 449 PSSKMSPSVKAYPPPP-----PPPEYEPSPPPPSSEMSPSVRAYPPPPPLSPPPPSPP-- 508

Query: 85  PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP--VYHSPPP 144
           PP +Y SPPPP     PP +Y SPPP   V   PP   SPPPPK    P P   Y SP P
Sbjct: 509 PPYIYSSPPPPSPSPPPPYIYSSPPP---VVNCPPTTQSPPPPKYEQTPSPREYYPSPSP 568

Query: 145 PKKVYY---PPPVYHS----PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYP 204
           P   Y    PPP Y++    PPPP   YY   V SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYY 
Sbjct: 569 PYYQYTSSPPPPTYYATQSPPPPPPPTYYA--VQSPPPPPPVYYPPVTASPPPPP-VYYT 628

Query: 205 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYP 264
           P + SPPPP  VYY P   SPPPP  VYY PPV   PPP  VYY PPV   PPP  VYY 
Sbjct: 629 PVIQSPPPPP-VYYSPVTQSPPPPPPVYY-PPVTQSPPPSPVYY-PPVTQSPPPPPVYYL 688

Query: 265 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK--VYYPP--PVHSPPPPVY 311
           P   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP     Y+PP  P  SPPP   
Sbjct: 689 PVTQSPPPPSPVYYPPVAKSPPPPSPVYYPPVTQSPPPPSTPVEYHPPASPNQSPPPE-- 736

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN_DAUCA (Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 127.5 bits (319), Expect = 2.6e-28
Identity = 164/350 (46.86%), Postives = 190/350 (54.29%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGKM--GSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKK 60
           MG++  GS M+ L+ +  V L+SL+L S T A Y Y+SPPPP+         HSPPPP+ 
Sbjct: 1   MGRIARGSKMSSLIVSLLVVLVSLNLASETTAKYTYSSPPPPE---------HSPPPPE- 60

Query: 61  VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY---YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 120
                  +SPPPP     PPP  HSPPPP  VY    PPP  HSPPPP     PPP  HS
Sbjct: 61  -------HSPPPPYHYESPPPPKHSPPPPTPVYKYKSPPPPMHSPPPPYHFESPPPPKHS 120

Query: 121 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVYY----PPPVYSPPPPK 180
           PPPP  VY     Y SPPPPK  + P PV+H    SPPPP  VY     PPP +SP P  
Sbjct: 121 PPPPTPVY----KYKSPPPPK--HSPAPVHHYKYKSPPPPTPVYKYKSPPPPKHSPAPEH 180

Query: 181 KVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPK 240
              Y     SPPPPK  ++P P +        +Y     SPPPP  VY      SPPPP 
Sbjct: 181 HYKYK----SPPPPK--HFPAPEH--------HYKYKYKSPPPPTPVY---KYKSPPPPT 240

Query: 241 KVYYPPPVYSHPPPKKVYYPPPVY-----SPPPPKKVYY--PPPVYSPPPPKKVYY---- 300
            VY     Y  PPP K + P PV+     SPPPP  VY   PPP +SPPPP  VY     
Sbjct: 241 PVY----KYKSPPPPK-HSPAPVHHYKYKSPPPPTPVYKSPPPPEHSPPPPTPVYKYKSP 300

Query: 301 PPPVYSPPPPKKVYY----PPPVHSPPPPV---------YYYSSPPPPHY 314
           PPP++SPPPP  VY     PPP+HSPPPPV         Y Y+SPPPPH+
Sbjct: 301 PPPMHSPPPPTPVYKYKSPPPPMHSPPPPVYSPPPPKHHYSYTSPPPPHH 305

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K8S7_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 491.1 bits (1263), Expect = 9.9e-136
Identity = 295/334 (88.32%), Postives = 298/334 (89.22%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGKMGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKK-- 60
           MGKMGSSMAP+LF AFVALLSL+LPSTTNANY YASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKK  
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60

Query: 61  --------------VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120
                         VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPK
Sbjct: 61  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPK 120

Query: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPP 180
           KVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPP 180

Query: 181 PPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 240
           PPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP
Sbjct: 181 PPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 240

Query: 241 PPKKVYYPPPVY-SHPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYS 300
           PPKKVYYPPPVY S PPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYS
Sbjct: 241 PPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYS 300

Query: 301 PPPPKKVYYPPPVHSPPPP--VYY----YSSPPP 311
           PPPPKKVYYPPPV+SPPPP  VYY    YS PPP
Sbjct: 301 PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 333

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TrEMBL
Match: D7KTY3_ARALL (Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 262.7 bits (670), Expect = 5.7e-67
Identity = 220/329 (66.87%), Postives = 225/329 (68.39%), Query Frame = 1 

Query: 4   MGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 63
           MGS MA  L  AF    SL+  S T ANYFY+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 64  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV 123
           PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K 
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKY 120

Query: 124 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY------SPPPPKKVYYPPPVY 183
           Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY      SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 121 YSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPSPPPPVKHYSPPPVY 180

Query: 184 -SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYP 243
            SPPPP K Y PPPVY S PPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y P
Sbjct: 181 KSPPPPVKHYSPPPVYKSAPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSP 240

Query: 244 PPVYSHPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKK 303
           PPVY  PPP   Y PPPV  +SPPPP     PP VY  PPP   Y PPPV  +SPPPPKK
Sbjct: 241 PPVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKK 300

Query: 304 VYY----PPPVHSPPPPVYYYSSPPPPHY 314
            Y     PPPVH  PPPVY+  SPPPP Y
Sbjct: 301 HYEYKSPPPPVHYSPPPVYH--SPPPPVY 323

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TrEMBL
Match: R0IMM6_9BRAS (Uncharacterized protein OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10009850mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 238.0 bits (606), Expect = 1.5e-59
Identity = 212/332 (63.86%), Postives = 220/332 (66.27%), Query Frame = 1 

Query: 4   MGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 63
           MGS MA L+    V  +SL+  S + ANYFY+SPPPP K  Y PPV H  PPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASLVAALLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVK-HYSPPVKHYSPPPVKHYSPP 60

Query: 64  PVY-------------SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 123
           PVY             SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PP
Sbjct: 61  PVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPP 120

Query: 124 PVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKV 183
           PVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K 
Sbjct: 121 PVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKH 180

Query: 184 YYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPP 243
           Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPP
Sbjct: 181 YSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPP 240

Query: 244 PKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-S 303
           P K Y PPPVY  PPP K +Y   VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY S
Sbjct: 241 PVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKS 300

Query: 304 PPPPKKVYYPPPV-HSPPPPVYYYSSPPPPHY 314
           PPPP K Y PPPV HSPP   Y Y SPPPP++
Sbjct: 301 PPPPVKHYSPPPVHHSPPHHPYLYKSPPPPYH 304

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TrEMBL
Match: A0A0D3CC16_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 236.9 bits (603), Expect = 3.4e-59
Identity = 223/383 (58.22%), Postives = 230/383 (60.05%), Query Frame = 1 

Query: 4   MGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPP-KKVDY-----------PPPVYH 63
           MGS MA L+ T  V  +SL+  S + ANYFY+SPPPP K   Y           PPPVYH
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYQYKSPPPPVKHYSPPPVYH 60

Query: 64  SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHS 123
           SPPPPKK Y      SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHS
Sbjct: 61  SPPPPKKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 120

Query: 124 PPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHS 183
           PPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHS
Sbjct: 121 PPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVMHYSPPPVYHS 180

Query: 184 PPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPP 243
           PPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPP
Sbjct: 181 PPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPP 240

Query: 244 VY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYY 303
           VY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY  PPP K +Y   VY SPPPP K Y 
Sbjct: 241 VYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---VYKSPPPPVKHYS 300

Query: 304 PPPVY-------------SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYY-------------PPPV 314
           PPPVY             SPPPP K Y PPPVY PPPP K +Y             PPPV
Sbjct: 301 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHPPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPV 360

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TrEMBL
Match: A0A0D3D7I6_BRAOL (Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 232.3 bits (591), Expect = 8.3e-58
Identity = 218/362 (60.22%), Postives = 224/362 (61.88%), Query Frame = 1 

Query: 4   MGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPP-KKVDY---PPPVYHSPPPPKKV 63
           MGS MA L  T  V  +SL+  S + ANYFY+SPPPP K  +Y   PPPV H PPPP K 
Sbjct: 1   MGSPMASLAATLLVLTVSLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYEYKSPPPPVKHYPPPPVKH 60

Query: 64  YYPPPVY-------------SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV 123
           Y PPPVY             SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K 
Sbjct: 61  YPPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKH 120

Query: 124 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPP 183
           Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPP
Sbjct: 121 YSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKDY----VYKSPPP 180

Query: 184 PKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-S 243
           P K Y PPPVY SPPPPKK Y      SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY S
Sbjct: 181 PVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---AYKSPPPPVKHYTPPPVYHSPPPPKKHY----VYKS 240

Query: 244 PPPPKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-------------SP 303
           PPPP   Y PPPVY  PPP K +Y   VY SPPPP   Y PPPVY             SP
Sbjct: 241 PPPPVMHYSPPPVYHSPPPPKKHY---VYKSPPPPVMHYSPPPVYHSPPPPQKHYVYKSP 300

Query: 304 PPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVY-----------YPPPV-HSPPPPV--YYYSSPPPP-- 314
           PPP   Y PPPVY SPPPPKK Y           YPPPV HSPPPP   Y Y SPPPP  
Sbjct: 301 PPPVMHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVK 340

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TAIR10
Match: AT1G21310.1 (AT1G21310.1 extensin 3)

HSP 1 Score: 241.1 bits (614), Expect = 9.0e-64
Identity = 222/354 (62.71%), Postives = 229/354 (64.69%), Query Frame = 1 

Query: 4   MGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKK-----VDY--PPPVYHSPPPP 63
           MGS MA L+ T  V  +SL+  S + ANYFY+SPPPP K     V +  PPPVYHSPPPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPP 60

Query: 64  KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPK 123
           KK Y      SPPPP K Y PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPK
Sbjct: 61  KKHY---EYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 120

Query: 124 KVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 183
           K Y             PPPVYHSPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVYHSPPPPK
Sbjct: 121 KHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 180

Query: 184 KVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SP 243
           K Y    VY SPPPP K Y PPPVY SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY SP
Sbjct: 181 KHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 240

Query: 244 PPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY 303
           PPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPVY  PPP K +Y   VY SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 241 PPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY---VYKSPPPPVKHYSPPPVY 300

Query: 304 -SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV-HSPPPPV--YYYSSPPPP--HY 314
            SPPPPKK Y    VY SPPPP K Y PPPV HSPPPP   Y Y SPPPP  HY
Sbjct: 301 HSPPPPKKHY----VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY 328

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TAIR10
Match: AT1G12040.1 (AT1G12040.1 leucine-rich repeat/extensin 1)

HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 3.1e-40
Identity = 162/285 (56.84%), Postives = 167/285 (58.60%), Query Frame = 1 

Query: 34  YASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY- 93
           Y  PPPP     PP VY SPPPP        VYS PPP     PP VY SPPPP  VY  
Sbjct: 456 YPPPPPPSPSPPPPYVYSSPPPPY-------VYSSPPP-----PPYVYSSPPPPPYVYSS 515

Query: 94  -PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 153
            PPP  +S PPP  VY  PP    PPPP     PPP   S PPP  VYY P V  SPPPP
Sbjct: 516 PPPPYVYSSPPPPYVYSSPP----PPPPSP---PPPCPESSPPPPVVYYAP-VTQSPPPP 575

Query: 154 KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 213
             VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP  YSPPPP  VYYP    SPPPP
Sbjct: 576 SPVYYPPVTQSPPPPSPVYYPPVTNSPPPPSPVYYPPVTYSPPPPSPVYYPQVTPSPPPP 635

Query: 214 KKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 273
             +YYPP   SPPPP  VYYPP   S PPP  VYYPP   SPPPP  VYYP    SPPPP
Sbjct: 636 SPLYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVYYPPVTPSPPPPSPVYYPSETQSPPPP 695

Query: 274 KKVYYPPPVYSPPPPK--KVYYPP---PVHSPPPPVYYYSSPPPP 312
            + YY P   SPPP K  K  +PP   P + PPP   Y SSPPPP
Sbjct: 696 TEYYYSPS-QSPPPTKACKEGHPPQATPSYEPPPEYSYSSSPPPP 719

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TAIR10
Match: AT1G76930.1 (AT1G76930.1 extensin 4)

HSP 1 Score: 157.9 bits (398), Expect = 1.0e-38
Identity = 117/176 (66.48%), Postives = 121/176 (68.75%), Query Frame = 1 

Query: 4   MGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 63
           MG+ MA  L  AF    SL+  S T ANYFY+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGAPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 64  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV 123
           PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPP        PPVY SPPPP K 
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPP--------PPVYKSPPPPVKH 120

Query: 124 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYS 178
           Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPP Y+
Sbjct: 121 YSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPSYT 164

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TAIR10
Match: AT1G62440.1 (AT1G62440.1 leucine-rich repeat/extensin 2)

HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 2.9e-30
Identity = 161/307 (52.44%), Postives = 170/307 (55.37%), Query Frame = 1 

Query: 25  PSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYH-SPPPPK-------KVYYPPPVYSPPPPKKVYY 84
           PS+  +    A PPPP     PPP Y  SPPPP        + Y PPP  SPPPP     
Sbjct: 489 PSSKMSPSVKAYPPPP-----PPPEYEPSPPPPSSEMSPSVRAYPPPPPLSPPPPSPP-- 548

Query: 85  PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP--VYHSPPP 144
           PP +Y SPPPP     PP +Y SPPP   V   PP   SPPPPK    P P   Y SP P
Sbjct: 549 PPYIYSSPPPPSPSPPPPYIYSSPPP---VVNCPPTTQSPPPPKYEQTPSPREYYPSPSP 608

Query: 145 PKKVYY---PPPVYHS----PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYP 204
           P   Y    PPP Y++    PPPP   YY   V SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYY 
Sbjct: 609 PYYQYTSSPPPPTYYATQSPPPPPPPTYYA--VQSPPPPPPVYYPPVTASPPPPP-VYYT 668

Query: 205 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYP 264
           P + SPPPP  VYY P   SPPPP  VYY PPV   PPP  VYY PPV   PPP  VYY 
Sbjct: 669 PVIQSPPPPP-VYYSPVTQSPPPPPPVYY-PPVTQSPPPSPVYY-PPVTQSPPPPPVYYL 728

Query: 265 PPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKK--VYYPP--PVHSPPPPVY 311
           P   SPPPP  VYYPP   SPPPP  VYYPP   SPPPP     Y+PP  P  SPPP   
Sbjct: 729 PVTQSPPPPSPVYYPPVAKSPPPPSPVYYPPVTQSPPPPSTPVEYHPPASPNQSPPPE-- 776

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TAIR10
Match: AT4G13340.1 (AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein)

HSP 1 Score: 122.1 bits (305), Expect = 6.1e-28
Identity = 153/289 (52.94%), Postives = 162/289 (56.06%), Query Frame = 1 

Query: 36  SPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP 95
           SP PP     PPP   SPPPP  ++  PP  + PPP     PPPVY  PPPP     PPP
Sbjct: 393 SPRPPVVTPLPPPSLPSPPPPAPIFSTPPTLTSPPPPSP--PPPVYSPPPPPPP---PPP 452

Query: 96  VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 155
           VY  PPPP     PPP    PPPP  VY PPP    PPPP  VY PPP   SPPPP    
Sbjct: 453 VYSPPPPP-----PPP----PPPP--VYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPP--SPPPP---- 512

Query: 156 YPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY--SPPPPKK 215
            PPPVYSPPPP     PPPVYSPP       PPPVYS PPP     P PVY   PPPP  
Sbjct: 513 -PPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPP-------PPPVYSSPPPPPSPAPTPVYCTRPPPPPP 572

Query: 216 VYYPPPVYSPPPPKKVYY--PPPVYSHPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 275
              PPP +SPPPP+  YY  PPP +S PPP   + PPP +SPPPP   Y  P    PPPP
Sbjct: 573 HSPPPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPP---HSPPPPHSPPPPIYPYLSP----PPPP 632

Query: 276 KKVYYPP--PVYSPPPPKKVYYPPP-------VHSPPPPVYYYSSPPPP 312
             V  PP  PVYSPPPP     PPP          PPPPV +YSSPPPP
Sbjct: 633 TPVSSPPPTPVYSPPPPPPCIEPPPPPPCIEYSPPPPPPVVHYSSPPPP 644

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. NCBI nr
Match: gi|700190951|gb|KGN46155.1| (hypothetical protein Csa_6G058200 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 491.1 bits (1263), Expect = 1.4e-135
Identity = 295/334 (88.32%), Postives = 298/334 (89.22%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGKMGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKK-- 60
           MGKMGSSMAP+LF AFVALLSL+LPSTTNANY YASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKK  
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPILFAAFVALLSLTLPSTTNANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKSY 60

Query: 61  --------------VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK 120
                         VYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPK
Sbjct: 61  YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPK 120

Query: 121 KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPP 180
           KVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYSPP
Sbjct: 121 KVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYSPP 180

Query: 181 PPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 240
           PPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP
Sbjct: 181 PPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 240

Query: 241 PPKKVYYPPPVY-SHPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYS 300
           PPKKVYYPPPVY S PPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY PPPPKKVYYPPPVYS
Sbjct: 241 PPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYPPPPPKKVYYPPPVYS 300

Query: 301 PPPPKKVYYPPPVHSPPPP--VYY----YSSPPP 311
           PPPPKKVYYPPPV+SPPPP  VYY    YS PPP
Sbjct: 301 PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPP 333

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. NCBI nr
Match: gi|778722016|ref|XP_011658392.1| (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: extensin-1-like [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 305.4 bits (781), Expect = 1.1e-79
Identity = 198/229 (86.46%), Postives = 200/229 (87.34%), Query Frame = 1 

Query: 88  KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHS 147
           K+   PPP  +SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY  PPPPKKVYYPPPVY S
Sbjct: 52  KEGILPPPXVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-PPPPPKKVYYPPPVY-S 111

Query: 148 PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPV 207
           PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPV
Sbjct: 112 PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPV 171

Query: 208 YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSHPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV 267
           Y PPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYS PPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV
Sbjct: 172 YPPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV 231

Query: 268 YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVHSPPPPVYYYSS-PPPPHY 314
           YSPPPP     PPPVY  PP      PP  HSPPPPVYYYSS PPPPHY
Sbjct: 232 YSPPPPVYHSPPPPVYHSPP------PPVYHSPPPPVYYYSSPPPPPHY 271

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. NCBI nr
Match: gi|297842453|ref|XP_002889108.1| (predicted protein [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata])

HSP 1 Score: 262.7 bits (670), Expect = 8.2e-67
Identity = 220/329 (66.87%), Postives = 225/329 (68.39%), Query Frame = 1 

Query: 4   MGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPP 63
           MGS MA  L  AF    SL+  S T ANYFY+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 1   MGSPMASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPP 60

Query: 64  PVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV 123
           PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K 
Sbjct: 61  PVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKY 120

Query: 124 YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY------SPPPPKKVYYPPPVY 183
           Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY      SPPPP K Y PPPVY
Sbjct: 121 YSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPSPPPPVKHYSPPPVY 180

Query: 184 -SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYP 243
            SPPPP K Y PPPVY S PPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y P
Sbjct: 181 KSPPPPVKHYSPPPVYKSAPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSP 240

Query: 244 PPVYSHPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKK 303
           PPVY  PPP   Y PPPV  +SPPPP     PP VY  PPP   Y PPPV  +SPPPPKK
Sbjct: 241 PPVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKK 300

Query: 304 VYY----PPPVHSPPPPVYYYSSPPPPHY 314
            Y     PPPVH  PPPVY+  SPPPP Y
Sbjct: 301 HYEYKSPPPPVHYSPPPVYH--SPPPPVY 323

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. NCBI nr
Match: gi|21263615|sp|Q38913.2|EXTN1_ARATH (RecName: Full=Extensin-1; Short=AtExt1; Short=AtExt4; Flags: Precursor)

HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 1.3e-64
Identity = 219/333 (65.77%), Postives = 223/333 (66.97%), Query Frame = 1 

Query: 8   MAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY- 67
           MA  L  AF    SL+  S T ANYFY+SPPPP K   PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 1   MASFLVLAF----SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYK 60

Query: 68  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYP--------PPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP 127
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y P        PPVY SPPPP K Y PPPVY SPPP
Sbjct: 61  SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPP 120

Query: 128 PKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY- 187
           P K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY 
Sbjct: 121 PVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYK 180

Query: 188 SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPP 247
           SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PP
Sbjct: 181 SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPP 240

Query: 248 PVYSHPPPKKVYYPPP-VYSPPPPKKVYYPPPV--YSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVY 307
           PVY  PPP   Y PPP VY  PPP   Y PPPV  +SPPPP     PP VY  PPP   Y
Sbjct: 241 PVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHY 300

Query: 308 YPPPV--HSPPPPVYY------YSSPPPP--HY 314
            PPPV  HSPPPPV+Y      Y SPPPP  HY
Sbjct: 301 SPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHY 329

[Close]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. NCBI nr
Match: gi|659081816|ref|XP_008441528.1| (PREDICTED: extensin-1-like isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 248.8 bits (634), Expect = 1.2e-62
Identity = 161/197 (81.73%), Postives = 163/197 (82.74%), Query Frame = 1 

Query: 1   MGKMGSSMAPLLFTAFVALLSLSLPSTTNANYFYASPPPPKKVDYPPPVYHSPPPPKKVY 60
           MGKMGSSMAP LF AFVALLSL+LPS+ NANY YASPPPPKKV YPPPVYHSPPPPKKVY
Sbjct: 1   MGKMGSSMAPHLFAAFVALLSLTLPSSANANYIYASPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY 60

Query: 61  YPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP 120
           YPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPP
Sbjct: 61  YPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVYKSPPPPKKVYYPPPVY-SPPPP 120

Query: 121 KKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYSPPPPKKVYYPPPVYSPP 180
           KKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP     PPPVY  P       PPPVY  P
Sbjct: 121 KKVYYPPPVY-SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP-------PPPVYHSP 180

Query: 181 PPKKVYYPPPVYSPPPP 197
           PP   YY  P   PPPP
Sbjct: 181 PPPIYYYSSP---PPPP 185

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmoCh04G025550 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
EXTN1_ARATH8.2e-6765.77Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2[more]
EXTN3_ARATH1.6e-6262.71Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3[more]
LRX1_ARATH5.6e-3956.84Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX1 PE=1... [more]
LRX2_ARATH5.2e-2952.44Leucine-rich repeat extensin-like protein 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX2 PE=2... [more]
EXTN_DAUCA2.6e-2846.86Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1[more]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0K8S7_CUCSA9.9e-13688.32Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G058200 PE=4 SV=1[more]
D7KTY3_ARALL5.7e-6766.87Predicted protein OS=Arabidopsis lyrata subsp. lyrata GN=ARALYDRAFT_476851 PE=4 ... [more]
R0IMM6_9BRAS1.5e-5963.86Uncharacterized protein OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10009850mg PE=4 SV=1[more]
A0A0D3CC16_BRAOL3.4e-5958.22Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1[more]
A0A0D3D7I6_BRAOL8.3e-5860.22Uncharacterized protein OS=Brassica oleracea var. oleracea PE=4 SV=1[more]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G21310.19.0e-6462.71 extensin 3[more]
AT1G12040.13.1e-4056.84 leucine-rich repeat/extensin 1[more]
AT1G76930.11.0e-3866.48 extensin 4[more]
AT1G62440.12.9e-3052.44 leucine-rich repeat/extensin 2[more]
AT4G13340.16.1e-2852.94 Leucine-rich repeat (LRR) family protein[more]
BLAST of CmoCh04G025550 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|700190951|gb|KGN46155.1|1.4e-13588.32hypothetical protein Csa_6G058200 [Cucumis sativus][more]
gi|778722016|ref|XP_011658392.1|1.1e-7986.46PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: extensin-1-like [Cucumis sativus][more]
gi|297842453|ref|XP_002889108.1|8.2e-6766.87predicted protein [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata][more]
gi|21263615|sp|Q38913.2|EXTN1_ARATH1.3e-6465.77RecName: Full=Extensin-1; Short=AtExt1; Short=AtExt4; Flags: Precursor[more]
gi|659081816|ref|XP_008441528.1|1.2e-6281.73PREDICTED: extensin-1-like isoform X1 [Cucumis melo][more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmoCh04G025550.1CmoCh04G025550.1mRNA


Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmoCh04G025550Cucsa.363580Cucumber (Gy14) v1cgycmoB1004
CmoCh04G025550CmaCh04G024410Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB729
CmoCh04G025550Csa6G058200Cucumber (Chinese Long) v2cmocuB760
CmoCh04G025550CSPI06G05030Wild cucumber (PI 183967)cmocpiB769
CmoCh04G025550Lsi08G005440Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB697
CmoCh04G025550CsaV3_6G005380Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB0898
CmoCh04G025550Cla97C08G149570Watermelon (97103) v2cmowmbB760
CmoCh04G025550CsGy6G004960Cucumber (Gy14) v2cgybcmoB815
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmoCh04G025550Watermelon (97103) v2cmowmbB770
CmoCh04G025550Wax gourdcmowgoB0865
CmoCh04G025550Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB029
CmoCh04G025550Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB262
CmoCh04G025550Cucurbita moschata (Rifu)cmocmoB367
CmoCh04G025550Cucumber (Gy14) v1cgycmoB0137
CmoCh04G025550Cucurbita maxima (Rimu)cmacmoB309
CmoCh04G025550Cucumber (Chinese Long) v2cmocuB771
CmoCh04G025550Melon (DHL92) v3.5.1cmomeB672
CmoCh04G025550Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB605
CmoCh04G025550Watermelon (Charleston Gray)cmowcgB680
CmoCh04G025550Watermelon (97103) v1cmowmB661
CmoCh04G025550Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB657
CmoCh04G025550Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB673
CmoCh04G025550Cucurbita pepo (Zucchini)cmocpeB708
CmoCh04G025550Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmolsiB643
CmoCh04G025550Cucumber (Gy14) v2cgybcmoB950
CmoCh04G025550Silver-seed gourdcarcmoB0094
CmoCh04G025550Silver-seed gourdcarcmoB1121
CmoCh04G025550Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB0902
CmoCh04G025550Cucumber (Chinese Long) v3cmocucB0911