CmoCh04G009460 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAAGAGCAAGCAGATTTGAATGTGGTCTGTTCCTTGTTAGTCCAAGTGCATTTTACCGGGGCCTTGAGGAAACCAACTTAAAAAATAGAGACTTGGTGGAAAAGGACCCCTGATGACTTCAAGGACCATCTAATTTTTTCTTCATCCTGACCCAAACGAAAACCTTCCAGCTTCTTGGTCAGCCCTGCTCAAGCCTGAAATACGATGTCAAACAATCCTCTCTGATTCCCAAATCCCGTGCCCTATGTATCATTCCGGCATTCTTCCACCATGGCATCTTTCTTCAGAGAAAGGGTAAAAATATCATGGAAGACATCCTTAAGAGAGGTTTCGCCCCGCCAAATATCCTTCCAGAAACTAATCCTATGCTCATTTCCAACTTTGAATCTATCAAAATTTCGTACAGGGGGCGAATTTTGCAATACCACATCTGGGCTGGTTGTATGAGCGACCTTTATGATGAGATGACACACATCCTAGGGGTTTTTCCCCATAGATACTAGCCACCTCCTACCTCGACAAAGCATTTCTTTCAGTTGGAAACCTCCAAAACCATTTAGTTAGGAGCACTGCATTTCTATGCTTGAGATACCCTATGACCTTGTATTATTTCATTTTCCCGATGAAAGTTGTTTTTCTTAAAAAAGAACACAATGATTAGAATATAATTGAGTTACAGCTGTAGCTATGGGTGCTCCAGATAATCTAGTAAGGAAGTGATAAACAAGATCTAATGAGTGAGTGAGTGATTAACTCTCAAGTGTTCTTGAAAGTAGCAAATTTTTCCTATAGAACGTCTGCATACAAGGGGATTCGATTGAAGGTTACAACAATTCCTGTGTATTGAGTTCGTTAGCTCATTTCCTATTGAGTTTGGGAAGATGATAGGATAACAAGATAGACCTAATTACTGCTAGTAGTCTTCTTTTCTTTCTCTCAGTTATTTTATTTTTGTTATCTACCATAGGTTGGTCTAATGGTCAATAAGAGCCGTTGTAAAAAATAAAAACTGAGGAATGAGTTGAAATCATGATGGACACTTGGATTTAATATCCAATGAGCTATCTTGAGGGTGAAGTGAGATTAGTCGAGGCACATACTAGATTGGACACTCTGCACAAAGAGAAAAAAGAATTTGTTCCATTTAGTTGAAGTGCTTACATGGATTAATAGATAGCAATTGTTATCCTAATTCTTTTTAGAGAAAAAAAAGAAGGAAAGAATCACCTAGAGATGAAAATGTTCTCTAGTCGGGCCAGAGTGTTTATGAAACATGATTACTGTTAAATATGCATATAGATTTTCTCGTTCTGTAAGCAATTGATTGGATGTGATTACTGCACGATTAACTTGATCTTTGTGCATATAGGATCTCTCTAGTCCTGTTTTATCTGCTGTTGGAGAGCGTTATTATAAGGTTACTGCTGAAGCATTGAGAGTATGTGGGGAACTTGTTCGGGTTGTTCGTCCTGGTATTGAGGTGAGTTCAAGTTCCACTTTAAATGTAGAACTGTATTACTTTGGGCCCATTTAATAATAAGTTAATGTTTCGTTTTTCTCAAGATACAAGTTTTCCCTTTAACTAAGTATTTCATCTAAGAAACATATATATAGACACGCAGCACAAATATGATATGACACCACACAAACAAGGTGACATGCCAATTTTGTCACCCTTAAAAATAGTAGGACACACAAATTGAAGTCGTTGTCAGTTTATTTAAAAAAATATACATGATGTGTGTGTGCATAGTTTGACCTACCATGCAATATCTAATCTCCTTAATTCCAATATGACTTACTGAGAAGCACATGTACTCAGATACAACATGCCGGACACGATGAAACGTCATTTTTTAAAAATCTAGGACACAGAACAAATTTATTAAAAATATGCATTTTTTTTATCAAATATATATCATTTTTGTAGAAAGAAATTTAAAGTCGATAAATCCACACATTTATATGCTTAAAAATTGAATTTGCTATATTTTACTCTCAAAATTTGTTATTTTGTCCTATATTATTATGTTTCTATTTAGTATACCTAACAAATATTCGTTGGGATTAACAAATGTTGGTTGTACACAAGTAGTGCCTGACTCTCTATTGTGCTAACAAGTTTTCATTACGTATCCAACCAGTGTTAGAGTGTCCAAGTGTTGGATATGGACATGATAGCCAAATTAAAGTTTCTATGCTTCTTAGAATATCATTTTTTTTAAAATTTAAAAAAGAATCTTTCCTATCTAAGTCATACTTTAAATCAAAAACAGTATCCCCTCCCAAAGAAAAATAGTTTTTAGGCATTTGAGGTTTTATATTAATTATTTTATTTTATTTATATTAAATCAATCTGGTTTTGCCCTATTTGTCCATAATCTATTTTTAAAAATGGAAGGGTATGGGAAGGAAAGTTTCTAAATCTGCCTAACTTTAGAAAACCGAGAATAAGGATCAGAGAGATCCGAGGATGCGTTTGTTTAGAGATTCAGAAGGAAATTTGGAAATAACTGATTCAATGAGAACAAAGTTGGTTTTTGTTAAGTTTTTGGTAATAAATTTATAAATTGATCTCAATTTAAAAAGGTTGTTCAAAGTGTGTTTTTAAAAGGTTATTAACTAGAAATTATGTTCAATCTCAAATTTTATTAATTGATTTACTTAATGTTATAAATTCTGTATAATTGTTGTTAAACAGTACGATATAAATATATATAGCACGTTGTCATGTTTTAATTTTAACAATGTTTTTTTTTTCTTTTTAATAGTGTAACTATGCCCGTTTAAAATTTCAAATTTAAATCTGAAAACGTAGAAATGTTTCAGAATTTCCACTAATTGTATGATAAAATCCAAAAGCTGTTTTAAAACACAAACTCAAGAAATGTTCACCTAATACATTGATTTCTTTCGGTTCAAATTGCATACCGAACACGGCTTTAGCTTTTTGAAATTTGGAGATGTTTTAAAAAATGATTAAATAATATTGAGAATATAAATAAGCTATTCTTAGTAAACAAGCTTATATTTTTTTTTTTAAAATCTTATTTTCTTCATCTTGTTCTTTTTCCAGGGGCATGGTTTTGACTTCAGACAGTACGTGCATCCTATATATAATGCTATAATGTCGCGCTTGACTAATCAAGATCAAGATCAGGTCTGTGGAATTTTCAAGGGTGAACAGCATTTTATTCTTTCCATCTACAACTATTGCTCATTTAATATTTGATTTTGGAAGTTTTTATTTAAAATATTAGGTCCTTAAAGCACTGAGGAATTAGTTTGAATGTTCTGTTCATCTTTCAGAACAACGAATGCTTAATTTTTAGATATTAAAATTTTATGTTAGAAATTGGACACTGGGAAGTGTCGTCAATGATTGGCATCTTCATTGTGCTCTCGAGAAAGGATGCACCCAAAATGGTATTTTTCTTAATGTTTGAAATTAGTGTAATGATGTGCCCATAATGCGCTCATTATGGCTTATTAACACAACTTGGACTACATCATTAGTAAGAGACCACCTAACGTTCTTATCCACAAAACAATTATGGATGCTTCCATTTCCAAAATGTTTTGGTCAGAATGCATATTTTTGTGGGTTTAAAAGTGGAAGAATTTTATTAGTAACCATGTGGATACCATAAGAGAATGAGTAGACTGAATACAACTTTCAATTGATTCGTGTACTTGAGACCCTATAGGTGACGAGATGGTTCCTGGAGTGTTTATTGGTTGGAACTTCCAAATACTTGTTGTGAGGATTATCTAGGAGTGACCTTGATTTAAAGAATATCTGTAAAATTCCTAACCTTAAGTTGGGAGATATTTTTGTAATTCTACTAAATAAGGGAAGTAGTTGACTCAATTTATTTGTATTGTTACCTAATATCTATGGATTTATTCAGATTTATTGTTACCTAGTATCTAGAGATTTAGTTAGCCTTTATGTATTCATAGTGACAATAAATCGTGATATTGTACTCAGGTCACATGGTTATTCCTTCTCGAACAAAAATCAGATGTTAGTAAATATTATTTCTGCCTTCCATTCAATGATTTAGACCCAATTTGGAGTCAAAATCAAAACATTTCGAAGTCACAATGCTAGAGATTATTTCAATCAAAACTTATTTCCTTATTTCTGATCTCAAGGCATTATCCACGATTCTTGGTTTGTTATAACACCACAACAAAATGGAGTGGCCGAAAGGAAAAATGTGCACCTTTTAAAACTACTTGAGCATTTCTTTTTGACGGAAACATGCCAAAAATTTACTGGAGAGTGGCCGTCCTTATTGCAACGCACATGAGTAATCATCTTCCACCTAGTGTCCTGAATAATCTAAGTCCAATAGAAGTCAACCAATTTCATCCTCACTTTTGAACATGAGATGGTCTCGCACCCACATATTTGGGTGCACTACCTTTGTTCATGTTCACAATACTTAAAGAGGTAAACTTGATCCGAGAGCAATACAATGTGTCTTTTTAGGATATTTTTCGACTACAAAGAGGTACAAATGTTACAACCCTACATTTAGGAAGTCTTACACTTCAATTGATATGACACTCATTGAACATAAAGTGTTCTTCCCTAAGGCCTCTCTTCAGGAGGAGAACATAGAGATTGAAGAGGGTCTGTGGAAACTAATGAACCCTTAGACACACTAAATAACTATTCCATATAATGAATTACTGATTCCATGCCTGCTACGGATTCTAATTATGAGTCACCTTTACTATCATAGATTATGAGTCCACCCCTACTACCGTAGAGTTACCAATTGAACCACAGGCTCCACCTACATTGATGGATTTGTTGTTCTCTCAAGTATATATTAAAAGGAATGTCATTTCAGAATTGGTACAAGTCCAAACATCTGATTCTACTAAAAAAATAAGGATGTAACATAGGTACCAATAGATGGTAGACCCATACTAAACCAAAAACCAGCTAGAGAATGCACAAAACGACCCTTATACCCTCT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GAAGAGCAAGCAGATTTGAATGTGGATCTCTCTAGTCCTGTTTTATCTGCTGTTGGAGAGCGTTATTATAAGGTTACTGCTGAAGCATTGAGAGTATGTGGGGAACTTGTTCGGGTTGTTCGTCCTGGTATTGAGGGGCATGGTTTTGACTTCAGACAGTACGTGCATCCTATATATAATGCTATAATGTCGCGCTTGACTAATCAAGATCAAGATCAGGAAGTCAAAGAGTGCGCCATTTCTTGCATGGGGCTTGTTGTGTCTACATTTGGTGACAACCTCAAAGCAGAGTTAGCAACCTGCCTTCCTGTTCTTCTTGATCGGATGGGAAATGAGATTACCCGACTTACAGCTGTTAAGTATGGGTGGATTGGGGACGCTACCTTAGCCTCCCTTTTCTCGGAGTATGGTATTTCTTTGAAGCAAGATGCAACTATGAATTGTGCATTTGCTGTCATTGCTGCTTCTCCACTTCAAATAGACATGTCATGTGTTTTAGAGCATGTTATATCAGAGTTGACAGCATTTCTCCGGAAGGCCAATCGGGCATTGAGACAAGCAACCTTGGGGACTCTAAATTCGCTTATAGCTGCTTATGGTGATAAAATTGCTCCTTCAGCCTATGAAATCATTATTGTGGAACTTTCAACATTGATAAGTGATTCAGACTTGCACATGACAGCTCTTGCATTGGAATTATGCTGCACCTTGATGGGTGACAGGAGGTCGAGCCCAAGTATTGGTCTGGCTGTTCGGAACAAAGTTCTTCCTCAGGCACTTCTGCTAATCAAAAGTGCACTTCTGCAGGGGCATGCACTTATGGCTTTACAGAGTTTTTTTGCTGCAATGGTCTATTCTGCAAATACGAGCTTCGATGCTTTGCTAGACTCTCTTCTTTCCTGTGCCAAACCATCTCCCCAGTCAGGTGGTGTAGCAAAACAAGCTTTGTTTTCGATAGCGCAATGTGTTGCTGTTTTATGTCTTGCAGCTGGTGATCAAAAGTACTCTTCAACAGTAAGAATGCTAACGGAAATTCTTAAAGATGATAGCAGTACAAATTCTGCTAAGCAGCACCTTGCATTACTTTGTCTGGGGGAGATTGGGAGAAGAAAGGACTTAAGTTTACATGTTCACATAGAGAATATTGTTATTGAGTCATTTCAATCTCCCTTTGAAGAGATCAAGTCTGCTGCCTCCTATGCTCTTGGTAATATTGCTGTTGGTAACCTATCCAAATATTTGCCTTTTATATTGGACCAGATCGATAATCAGCAGAAGAAACAATATCTTCTCCTTCATTCACTCAAGGAGGTGATAGTTAGGCAATCTGTGGATAAAGCTGAATTTCAAGACTCAAGTGTTGAGAAGATACTTAATCTACTCTTTAATCATTGTGAAAGCGAGGAAGAGGGAGTCAGGAATGTTGTAGCTGAGTGCCTCGGTAAAATTGCTCTTATTGAACCTGGAAAACTTGTTCCCGCTCTCAAGGTAAGGACAACAAGTCCAGCAGCATTCACTAGAGCAACTGTAGTAATCGCTGTCAAGTATTCTATAGTTGAGCGACCTGAGAAGATAGATGAGATTATATACCCTGAGATCTCATCATTCCTGATGCTTATAAAGGATCATGATCGTCATGTTAGACGTGCTGCTGTCTTGGCCTTGAGTACATTTGCTCACAATAAGCCTAACCTCGTCAAAGGGCTTCTTCCTGAGTTACTGCCACTTCTTTATGATCAAACAATCGTGAAGCAAGAATTGATAAGAACAGTTGATCTGGGTCCCTTTAAGCATGTTGTGGATGATGGTCTTGAGTTGCGGAAGGCTGCTTTTGAATGTGTGGATACATTGCTCGATAATTGCCTTGACCAAGTGAACCCATCGTCTTTCATTGTTCCTTATCTTAAATCTGGTTTGGATGATCACTACGATGTTAAAATGCCATGCCATCTGATTCTATCGAAACTCGCTGATAAGTGTCCATCAGCTGTATTAGCAGTTTTGGACTCTCTGGTTGATCCTCTTCAAAAGACTATTAACTTCAAGCCAAAGCAAGATGCTGTTAAACAAGAAGTAGATCGTAATGAGGACATGATTCGCAGTGCTCTTCGGGCTATAGCATCTCTAAATCGCATAAGTGGAGGAGATTGCAGCCTTAAGTTCAAGAATCTTATGAATGAAATTTCTAAATCTCCGGCACTCTCAGAGAAATACTACTCCATCCGAAATGAGTGA
BLAST of CmoCh04G009460 vs. Swiss-Prot
Match: CAND1_ARATH (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=CAND1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1111.7 bits (2874), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/735 (79.73%), Postives = 643/735 (87.48%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. Swiss-Prot
Match: CAND1_MOUSE (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Mus musculus GN=Cand1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 3.5e-148 Identity = 312/737 (42.33%), Postives = 460/737 (62.42%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. Swiss-Prot
Match: CAND1_RAT (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Rattus norvegicus GN=Cand1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 526.6 bits (1355), Expect = 4.5e-148 Identity = 312/737 (42.33%), Postives = 460/737 (62.42%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. Swiss-Prot
Match: CAND1_BOVIN (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Bos taurus GN=CAND1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 526.2 bits (1354), Expect = 5.9e-148 Identity = 312/737 (42.33%), Postives = 460/737 (62.42%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. Swiss-Prot
Match: CAND1_HUMAN (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Homo sapiens GN=CAND1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 526.2 bits (1354), Expect = 5.9e-148 Identity = 312/737 (42.33%), Postives = 460/737 (62.42%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. TrEMBL
Match: B9SPA7_RICCO (Tip120, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_0495920 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1251.5 bits (3237), Expect = 0.0e+00 Identity = 655/735 (89.12%), Postives = 684/735 (93.06%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. TrEMBL
Match: F6HJZ9_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_12s0035g01840 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1245.0 bits (3220), Expect = 0.0e+00 Identity = 654/735 (88.98%), Postives = 681/735 (92.65%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. TrEMBL
Match: M5X623_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa000384mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1242.6 bits (3214), Expect = 0.0e+00 Identity = 654/735 (88.98%), Postives = 680/735 (92.52%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. TrEMBL
Match: A0A067LEJ8_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_00311 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1241.9 bits (3212), Expect = 0.0e+00 Identity = 651/735 (88.57%), Postives = 681/735 (92.65%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. TrEMBL
Match: I1MQT7_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_17G002000 PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 1241.5 bits (3211), Expect = 0.0e+00 Identity = 649/735 (88.30%), Postives = 682/735 (92.79%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. TAIR10
Match: AT2G02560.1 (AT2G02560.1 cullin-associated and neddylation dissociated) HSP 1 Score: 1111.7 bits (2874), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/735 (79.73%), Postives = 643/735 (87.48%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. NCBI nr
Match: gi|659102599|ref|XP_008452214.1| (PREDICTED: cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1307.7 bits (3383), Expect = 0.0e+00 Identity = 690/736 (93.75%), Postives = 698/736 (94.84%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. NCBI nr
Match: gi|449431894|ref|XP_004133735.1| (PREDICTED: cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1306.6 bits (3380), Expect = 0.0e+00 Identity = 688/736 (93.48%), Postives = 699/736 (94.97%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. NCBI nr
Match: gi|255573814|ref|XP_002527826.1| (PREDICTED: cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Ricinus communis]) HSP 1 Score: 1251.5 bits (3237), Expect = 0.0e+00 Identity = 655/735 (89.12%), Postives = 684/735 (93.06%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. NCBI nr
Match: gi|297739452|emb|CBI29634.3| (unnamed protein product [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1245.0 bits (3220), Expect = 0.0e+00 Identity = 654/735 (88.98%), Postives = 681/735 (92.65%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh04G009460 vs. NCBI nr
Match: gi|359486235|ref|XP_003633418.1| (PREDICTED: cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1245.0 bits (3220), Expect = 0.0e+00 Identity = 654/735 (88.98%), Postives = 681/735 (92.65%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata
Date Performed: 2017-05-19
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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