CmaCh01G002610 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

Overview
NameCmaCh01G002610
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr01 : 1234964 .. 1239606 (+)
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATGCACGTATTCCATAGCGTCGAGGTACGTCTTGGCTTTCTTATGTAACGTTGAGATGCTCTTCTATAATGCCTCAATGCTACTCTCGTGGGTAGAATAGCTCGAGTGTTACAAAGTCAAACATCTAGTTGTTCTAGGAGCATTGAGAAGCTCTCCTATTTTTTGTCTCGAGCTCCACTAAAGACGTCACAACTTGTATGGTATCATCAAGCCATAAATTATAGCCTACTCATCATAAAGTTTGTAAGTAATAGACATGTGCAAGAAAAGCGTATCAACGAAGGCTCAAAGATAAAATTTATAATCTTTTTATACCTTTTCAAGGGTCGTTTTCAAAGCTATCGTGTAATTGGTTTCTTCACACGAAAAAATGACTTTAGGTACCTTTCACAAATAAGACGATATAATTGATTTAAGTAAAACATGCATAACCATGAATTTCCAATAATTGGTATATGCAGTAACTTTCATTTCTAAGTCTTTCTTAGTCATCATATCATCATATCACTCTTAGTTGAATGTGGTCCCAGTTCTCACCGAAAAATAAAGGTGCACCTTATTGATCTAGGTAGTAAATATTTTTTTATTAAATAAATAGCACTTTTTTTGTGATTTTTTAAATTAAATTACAATTTTAAATTTTTTTAGTGACTAGACTTATTCCTATCAATAAAACTTATATATTAAATATATATATATATATTAAAAAAATTTAAAGACTAATGTATCAAATTAAAAAAAAAAAAAATCAAACTCAAAATTTAGAAGAGAAAATATAATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTAAAAATATCGTTATTTAGTGTGAGCATTGCTTTAATGATATTGAAACAATATTGACAAATAAATATATAAAAAATCTATTAATTTTAAAATTTATGTGAAATAAAATTAATTAATTTTAGAAAATTATGAAAAAATTAGACACAAATATAAAAGTTAGGGACTAGATATGTAATTTCACTTTTTTTTTTAAACCTTTTTGTCCAATACGACAATATTTTACCTTAATTAATTAGAATAAAAATTTCTTAATTGCCATATATTTGTTAAACGACGTCGTTCTGTCTAACAAGTAGATTTATAGGTAGCAAACATAAAAATGACGTTCTATTTCTTTGAAGAATTTTCAAAGCAATATAATAATTCTTTTTTATTTTTACAAAACATATATAAATATTAAAATTTTCACTGTGTAAATTCTCCACAATTTTATTTTAAATCTTTAATTTAAGTACTTTTTCATCTATACTTAATTTTTATATCTTTAATAAATCTTAAAAATAAAAAATATATCTTTATTAGTGTTTACTATAATTTTTTTATTTAATTAATTTTCAAAATTATTAAAAATACGAGAACAAAATATAGACATTAAAAAGTACAAAGATTAAAATACAAAAAAAAAAAAAAACTAAGAGTCGATGATTTTTCTTTTCTATTTCAAACTTTTTTTAATTAAAAAAACGTTCGAGTAAGTAGCCATACAGTGTCACATGGCCACTAACTAGCCTGGTACTTGAGAAGATGGAAAAAAAAATATAAAAAATAAATAAAATTAATATTAATAAGCCATGAATTAAAGGAAATTTAATTTTGAAGTTATAATATGTTTTGATGGTACAGATTTAAAATTGATTATCCACATGGGAGATCAAGAGAACCATTTTAATAATTTTATATTTTAGTATATATTATATACTTTTAAAAATTAATTAATATTCGGTATATTTTGAAAATTTGAAGACCAAAAGTGAAAATATCAATTAACAATTGTCACTGTTTCAATTTGGATGACATCATTCTTAACTGTTGTTGTATAATAATGACACTCTAGACTGACTTTGTAATTAACGGTTGTCGTATATAGTCTAAGATGATGGTAAAAGAGTCCTGAAATACGTTTAAATTATGTGAGTTTGATCATATGTGAAGTACTGGAAAATAATGTTAATGTTCGTTTTTTGTGTAATGATTACGTTATTGAATAAGAAAGTCGTTCATTAATGAATTTATTAAATGAGAAAATAGTTTACCGACAGTAGAATTATTTAATCGTTGAGTAAATCAGTTAAAGGCACTCAAATTTATTTTTTATTATTTATTTTTATTATTATTATTATTATTGTCTTGGCTCAATCTTAAGTCACGTTCTTAAGTGAAAAATAAATAAAATTAATTTTAATTTCCATATTATTTTTTACCCGAAAAAAAAAAAAAAAACAATTTATTTATTCAATTATTGATTTTGGGTAAGTGGGGCAAGTGGGGCTGCCCGAATTAAATCGGCTGCCGCCCACCAACAGTAAATCCGACAGTAAAAACACTCCACATCAACCCAGCTAGGAATTCCGACATATTTTCCTTAATTTTTTTTTGTTTCCTTTTTTTTTTTAAATGATAATGGTTATTATTTATTATTATTAGTTCAATGACGGTGCATTCAACCTACATTATGCTCTATTTAACTCTACCTTTAACTTTAATTTCCTCCTAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATTATATAATAGCTTTGGCCCATTATGAATTCACCTCTAAAAAATGTTAGATTCTAATATTTTATTTTTTTAAAACATTTTTAACTTAATAAAAAAATTCAATTCAATTTGAATAGATCCACTTAGTAAAAGAAATATTAACATTAAAATATGGTTTTGATTTACTTATGTGAACATGTGGGCGCATGCCACTCGGAATACATAGATATTGTTGATGAGTTGTATTTTATATGTCAAGCCGTATTCAAGTGGCTCTATATATGATAATAATAATAATAATAATTAAATAATATACAATGTTTAAGTTAAACAATTTCAATTTTTTTTTATTTTTTTTGTGAAATGTTCTTATTAATAGACACGATAAATTTTTGCTTAATTTTATTAATTATTTAATTTTAAAATAACTAATATATCATTGTTTTCTTTAGAAAAAAATGGCACAAATCACTCTTAATTTAAATATAAAATCTAAATTGAATAAAATATTAGAAATTTGTAATGTTTCATGACTAAAAATAAAGTATATATTTAAAATATAATAAAAATGAAAATATTATATTGAATAAATTGCAAACAAATGTTTATGATAAAATACGATAATTTGATTGGTTGTTGAAGACGTTTAGAAAAGTAACGGTCCATTTATTTTATTATTTTTCTTCAAATAATTGAGTCATCATTAATCGAATAAAAATTCTTTACTAAGTCCAATGTTTTGAGTCGGTCCACTTTCATTGATATGAAACATTATTATTTATTTTTTATATTTTTTCTTTTTAAATTTTAATTTTGGTGAGAATTTACGGATCTAATTCAACGTAATTATAATTTTTTTTGGATGGTTTGGTTAAGTCATTTATTCATAATTTTATTTTCAATAAAAATAAAACGTTAATTCATAAAACATTTATTTATTTATTTTTAACGATGTATTTTAGGTTTATTTTTCTAGAAAAATCTTCTTAAAGGAGTAATTAAAAAATAACTAATAAAAAATTATTATAAAATTAAATAAAAATATGTATATATATTTGCGCAAATATGTAAAAATTAACCATAAATTTAGGTTAATTCGATTTAATTTAATTTAGTTTTAATAGAATCTACGAACTCAGCCCAATTCGTATGATCGAGTTGATTAATTTTTTCGCATGCTATTGCTTAAATTTTTCATTCAATATATTTTAAATAAAATAAATAAAAACAGCAATTTTAATATTTTATTTGATTGTAACGCGCATTTTATTTTCTAATTAAGTTTAAACAAAAAATAATTATATATTAATCTGAAAAATTAAAAAAAGGGAAGGAAATTAAACAGGGAAATATAGGTTTTAGAAAAAGAAGTAAATAAATAAAGAAAAGCGCGAAGCAGAGGATAACTACCCTCCCTCCGGTACAAGCAACGCAAAGGGCATCTTTTGAGGCATTGGGAGAGGGAGGGTCACGCGGTGTTGCTGTGCTGGGCCCCACCATTTTGCTTCTCTCTCTTCATTCCTTTTCTTTTATTAAAAATAAATAAATATCAATAATAATTCAATTAATTTGTTTTTTTCTTGTATAAAGATTTGAAATTTGACTTTGATTCTAAAATTTTTAAGATTATTATTATTATTATTATTTAAAAAAATTTGTAACAGACTCGAACTTAATTTTTTTTAAAAAAAATTAATTTTTAGTTTTACGGTGGATAGATTATGTGAGTGATGGAAAGAAGTAGCTCATAGTTTAATCTTTCATGTGATGAATTAGCTCTTACAATTACCAAATCTTTACCATCACTACTCCCACTTCCAACACCCAATACGAATCAAAGCCCACACGCTTTTCCATTCATTCATTTCGTCATCGCCTCTCATCTTCCCCTTTTCTCCTATATCTCCGACGGATTTCTGGCGGCCGATCTCTGTTGACTCCACTCGGTATTCACTTACTCTCTTTAATTTTGCTTTCTTTCTGATTTCTCGCTTTCTGGGTCTCCATATCTCAGTGTTCTTCACATGGGTTTCTGTTTTTTGGGCTATTCAATCACTTCACCCCATTGCTTTTTGA

mRNA sequence

ATGATGCACGTATTCCATAGCGTCGAGCTCTTACAATTACCAAATCTTTACCATCACTACTCCCACTTCCAACACCCAATACGAATCAAAGCCCACACGCTTTTCCATTCATTCATTTCGTCATCGCCTCTCATCTTCCCCTTTTCTCCTATATCTCCGACGGATTTCTGGCGGCCGATCTCTGTTGACTCCACTCGGTATTCACTTACTCTCTTTAATTTTGCTTTCTTTCTGATTTCTCGCTTTCTGGGTCTCCATATCTCAGTGTTCTTCACATGGGTTTCTGTTTTTTGGGCTATTCAATCACTTCACCCCATTGCTTTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGATGCACGTATTCCATAGCGTCGAGCTCTTACAATTACCAAATCTTTACCATCACTACTCCCACTTCCAACACCCAATACGAATCAAAGCCCACACGCTTTTCCATTCATTCATTTCGTCATCGCCTCTCATCTTCCCCTTTTCTCCTATATCTCCGACGGATTTCTGGCGGCCGATCTCTGTTGACTCCACTCGGTATTCACTTACTCTCTTTAATTTTGCTTTCTTTCTGATTTCTCGCTTTCTGGGTCTCCATATCTCAGTGTTCTTCACATGGGTTTCTGTTTTTTGGGCTATTCAATCACTTCACCCCATTGCTTTTTGA

Protein sequence

MMHVFHSVELLQLPNLYHHYSHFQHPIRIKAHTLFHSFISSSPLIFPFSPISPTDFWRPISVDSTRYSLTLFNFAFFLISRFLGLHISVFFTWVSVFWAIQSLHPIAF
Homology
[Close]
BLAST of CmaCh01G002610 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L9D4_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G664540 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 3.8e-10
Identity = 40/54 (74.07%), Postives = 41/54 (75.93%), Query Frame = 1 

Query: 8  VELLQLPNLYHHYSHFQHPIRIKAHTLFHSFISSSP-----LIFPFSPISPTDF 57
          V L+QLPNLYHHYSH QHPIRIKAHTL HSFISSS      LIF    ISPTDF
Sbjct: 5  VPLIQLPNLYHHYSHSQHPIRIKAHTLLHSFISSSSLSSSLLIFLTFLISPTDF 58

[Close]
BLAST of CmaCh01G002610 vs. NCBI nr
Match: gi|700203397|gb|KGN58530.1| (hypothetical protein Csa_3G664540 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 5.4e-10
Identity = 40/54 (74.07%), Postives = 41/54 (75.93%), Query Frame = 1 

Query: 8  VELLQLPNLYHHYSHFQHPIRIKAHTLFHSFISSSP-----LIFPFSPISPTDF 57
          V L+QLPNLYHHYSH QHPIRIKAHTL HSFISSS      LIF    ISPTDF
Sbjct: 5  VPLIQLPNLYHHYSHSQHPIRIKAHTLLHSFISSSSLSSSLLIFLTFLISPTDF 58

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmaCh01G002610 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh01G002610 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0L9D4_CUCSA3.8e-1074.07Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G664540 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CmaCh01G002610 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CmaCh01G002610 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|700203397|gb|KGN58530.1|5.4e-1074.07hypothetical protein Csa_3G664540 [Cucumis sativus][more]
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh01G002610.1CmaCh01G002610.1mRNA


Synteny
The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmaCh01G002610CmoCh01G002720Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB468
CmaCh01G002610Lsi03G011540Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB422
CmaCh01G002610Cla97C10G194640Watermelon (97103) v2cmawmbB445
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmaCh01G002610Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0347
CmaCh01G002610Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0557
CmaCh01G002610Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0559
CmaCh01G002610Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB462
CmaCh01G002610Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB466
CmaCh01G002610Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB490
CmaCh01G002610Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB453
CmaCh01G002610Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB456
CmaCh01G002610Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB502
CmaCh01G002610Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB450
CmaCh01G002610Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB453
CmaCh01G002610Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB496
CmaCh01G002610Melon (DHL92) v3.5.1cmameB404
CmaCh01G002610Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB377
CmaCh01G002610Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB387
CmaCh01G002610Watermelon (97103) v1cmawmB407
CmaCh01G002610Watermelon (97103) v1cmawmB416
CmaCh01G002610Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB491
CmaCh01G002610Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB465
CmaCh01G002610Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB472
CmaCh01G002610Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB494
CmaCh01G002610Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB418
CmaCh01G002610Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB364
CmaCh01G002610Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB366
CmaCh01G002610Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB938
CmaCh01G002610Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB461
CmaCh01G002610Silver-seed gourdcarcmaB0143
CmaCh01G002610Silver-seed gourdcarcmaB0626
CmaCh01G002610Silver-seed gourdcarcmaB1059
CmaCh01G002610Silver-seed gourdcarcmaB1134
CmaCh01G002610Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0542
CmaCh01G002610Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0545
CmaCh01G002610Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0595
CmaCh01G002610Watermelon (97103) v2cmawmbB511
CmaCh01G002610Wax gourdcmawgoB0552
CmaCh01G002610Wax gourdcmawgoB0553
CmaCh01G002610Wax gourdcmawgoB0610
CmaCh01G002610Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB255
CmaCh01G002610Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB360
CmaCh01G002610Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB440