Cla97C10G184560 (gene) Watermelon (97103) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGCAGTGGCGGAGGGATTGTGGAGGCTGGCAGATTACCACGAGAAGCAGGGGGAACTAGGGAAGGCAATAAAGTGTTTGGAAGCCATATGCCAGAGTCCTGTGTCTTTCTTTCCAGTCGTTGAGGTCAAGACTCGGCTTCGAATTGCCACCCTTCTACTCACTCATTCTCACAACGTCAATCATGCGAAATCCCATCTCGAGCGTTCTGTATGATATAGTTTTTTTTTTTTTCCACACAACTAATGATGTAGACCAACTATTTTTATTTTTTAATTATCAATGGTGGTTTTTGTTTCCCGGTAGCAATTGTTACTGAAGTCTATTCCATCATGCTTCGAATTGAAGTGCCGGGCTTATAGCTTATTAAGCCAGTGTTATCATCTCGTCGGTGCTATTCCTCCCCAGAAACAGCTTCTTTATAAGGGTCTTGATCTCACCAATTCTGCTGGTCACGAGTAAGCACTCATCCTTTTCCCTATGCCTAATGAATTCTTTATTCATTTCCGTATGCTTTTGTTTGTTTTTTCCCTCTCATTTGTTGTTGTTGGCAATAATTGATTACCCAGCAAATATTTTTCTTTAGTGTTACTTTATCAACTTTACTTATTGGTGTTTTCTTCTTGCACTCATTTAAGACTGTCAGTGAAGCTATGGTCTTGCAACTTCAATTCACAGCTAGCAAATGCTTTGATTATTGAAGGAGACTATCAAAATTCAATCTCTGCCTTGGAGTCGGGATACATACTTTCAGTGGAGATATGCTATCCTGAACTGCAGGTTGGCATCTGAAATTTTGTTTTCGTGCCCACTGCCATATTTCTTTATTCTTCTGGAAGCGTATATTCTTGTTGTTTCTTTAATTTTTGAGTGGCATACATATATATTGGAAACAGAAAATTTCATTGATAAGATGAAATTACAAAAAGGATCCTATCCAATGGATTACAAAAAGCTTCTCCAATTGGTCATGAGATTAGATAAGCTATAGTTGTCCTTATATGTGTGTGAGGAAGGAAATTATCTCTAAAAGTGGAAAATTTCATGGCTCAAAGAAGCGGATGAAAACACAAATTTGTTTCACCGAATGCTCAAAGAAAAGAAAGTCTTTGATGTCAGAATTGAAGTCTTCCAAGGGCACTTCTTTGCTGTCTTTTAATGAGATTGAAGAGGAACTGATCAGTTTTTTCAATTCACTATATCAGAAGATGCCTGGAAAGAGATATATGCCTTCTAACTTGGTTTGGAATACAGTTTTAGGCTTTCAGCCTCACAAAATTCCAAGCTAATTAGGCCATTTACAATAGGGGTGAGCAAACCAAACCAAGAAACTAGTCCAACCGACCGAAACTGAAACAAGATTCTGTTTTGGTACAAGATAAACAGAGTAAGACACATCAATGGGTGCTAAAGAATTCTGATGTTAAACAAGAAGATTTTAGTAAGTTGTGGATAGTTTCAAGATTGTTTGAGTTTAATGACTAGTCGGAAATAGCGGAAATATTAAAAATTTACTTTCAATTTGAGATCATCATCAATCCCCTATTTGCGAAAAATGCCCTAATAAAATTGGGCCAAGGATCTTAGAGGAATTAACTGAAAATCCGGGCAGTTGGCAAATTTGTGGCTCATTTCATCTGAAATTTGAAAAGTGGAATAAGTTAGTGCATAGCCGGCCAGTGTATTCGAAAGGTTGTGGAGGATGGATTTCCATTAAGAATCTCCCATCAGATAATTATTGGTGTAGACAAACCTTTGAAGCTATTGGAGTCTATTTTGGAGGACTAGAAGCTATTGCAACAGATACTTTGAACCTTCTTAACGTCTCCGAAGCTAAGATTCAAGTTAAAAGTTTTTTATGTGGTTTCATTCCATCAACCATTGAGATTTCGGGTGAGAAGCATGGATCTCTTTTTCTGAATTTTAGAGACACTGAATCAATTGAACCTCCCTCAAAAGTTAAAAGATGAATTACTTGTTAAGGATTTTTCAAATCCACTTGACTTAGTTAGAGTGAATAAAGTTTTACAAGATGAAGGATTAGAGGTTGAAGATGTGGATTCTAAGTGGGCCTTTCTGCTACTTTCTCGTTTTTCCCCAAATTTTCCAAGAAATCCTTTAGCTTCCTACACAAAGGAGGGAAACTTCCCGCCGGAAAAGTCCTTGAAAGTTGTTCGACAGGTCCCCTCGGCATCTGGTTACAATCAGCTAGTTGAAAAGTCTTTTGGCCCTCCTACTCTCCTTGGTGGATTTACTGAGCAGCATTATTGAAGAGTGAGAGTGCAGTTGGGTAGTTAACTCTTTGCCAAAAAGAGACCGTTGACCTCCCTTCGAAAGAATCTCGTCAAGTCTGTGCCGCCAAGGATGGAGTTGCTTCAGATTTAGCGCTTCCCAAGTGCTGTTGCCCCACGCCCGCTAATGTCTCTTCGTTGCCGCGTGCTTCCCCTCCCATTGGAACTCCCCCAATAGAGTTTAATGCTGTCGGCCCCTCTTTATTTGAAAAAGAATTATTAACTCACTCTTTTATTCTCTCTCCTGGAAATCCAAGAGTCAATAGCCCTTTCTTACCAGTAGTCCCTCTATCTTCGGTCCATTCCAAAAGAAGTCCAGTAAACGATTCTCTCCCTTTAAAGGCTAAGAATTGTCACAATTTGCTCATGCCTTTCCCTAAGCATTTTGTTAGAAAAAAGACTTCTATAAACTCTTGGTCTATGATAGTAAACTCGAATTTACTAGAAAATTGCTGTGTTAAATTTCAAATCCCTGGGTTGTTCTTAGAAAAAGAAGAAGTCCTTACTTCAGATCGTGTCTCTTTCTCCCATTCGGACTTTACAATCCCGGGTTCTAAAGTAAAATTTGTTAGAGGTTTACCGGTCAGGGTTTCAAGCAAAAATTGACACAAAAATCAAGATTCAGACATGGATTCAGATGGAGTTTCTATAGCAAGTGCTAGCAGTGAAGACTTAGAAAATCTTGAGTCAGAGGATTTTTGCGAAGAGGAAGATTTAAATGATGGTTTTAACAGAGACTTTCACCGATTATTTCAATCAGAGGAAGGTCCTTTGCTTGGTAAGACTGAAGCTTCCTTATTTACTCCCTTAGAAAAGAATGAAATCCCACAACATCTTCATTCCATCATTGATGCTTGCGGTATTGTTCTTGGTTGAATTTTTAAAGAAGTATGAATTTTGCGGTGGGAATTCGAAAAGGTCCTTGGGAGCCGACCGGTCGTCTGCACTTTCTTCATAATTAGTATGCAAGGTGTCGAACCGTTCCTTAGGATCCGAACAGACATCAACACTTATTTTCTTCGTTAAATGCTCGTTTGCTAACTTCTTTCTCGGTTTCACATTGATCTGGTTTGGGGTGATGGATCCCCTTGGACGAAGAATCGCCGGTGCTTACTTCATCTTCTCCGGCGAGCTTTTTGAACTTTTGTCAGAGTGTTTCTTCATGGCTGCGAACGGATTTCTCGAAATACTTGGCATTTTTTGTTGAAGAAATGCCCAATTTTGAATCGGAAATTCAAATTCAATGTCTTCCTCTTGAGCGACTTGCTTTAGCCTAAGTAAATCAATCGGGTTTGAGAAGTGTGAAAGAAATAGAGCACTCTTATGTGGCATGGAATCTTCTAAACTCTCAATATCACCGAAATTTAAAAAGAAATTTCCCCTCTTTTCATTTTCAATTTCGATTGTTGCCAGCATCAAACCACATATGTTCCTTTAACCTTTAATTCTTGCTTCAGAGCAATTTAACAAGTTAAGCGTTTCAAGTGCAATGCTTTCTAATCCCCCGAAATGAGCTCCAATGGCTTCAAATGTACTCCTTCTCCAATATTCTAGTGGAAGATTGTTGATAGAAAGCCAACCTTCGAAACCTCTGATGAATTCTGGTCGGCTATGTTTAAGTGTTCCATTTTTCAATTAATAAATGAAATTGTCCGAAATCCTGCCATTTCCTGGGAGCGTCAAACCAATCATCCATTCTTCCTTCCTCACACTTGATCAATGCTTTATCTAAAAATATGGGATTAATGGTAAATTTAACCTTGAATGATTCTTCTAAATGATTTCTAATTGCATTCCAATCGTCAAACACAAATAATCTCGATATCACCCATAAGTTGCTGAAATCTTCTTGGAAAACCTCATGATTTTTTTGAATCCAAAATGCATCCGATTTCTGATTTTCATGTCGCCAAACTGAGTTTAATGGACTGCTTTGTTTTCCTTTGCCCAAGCTCTGCTTCCCACATTGCCGATCAGGGTCTTCTTGAGTACTCTGTTTTCCTTCAAACCGGTCAGGGTACGTGCTCTGTTCAATAGGTGCAAAATCAAAGGATTTCGAATTTAATGGGGGGGCCTCCCAAGCTGTGTGGTTGTGATGTCTTGGTCCTTTTGATACCATCTCAGCGTACTTGGCTGAAGTGTGTTAGGAGGAGGGATAATTGCCTGATTGATCCCCAGATTTTCTTCCTTCTCTCTATAGCTCCCCCTTCCGTGGAGGAAGCTATTAGTCATTTCAAAGAAATCATTCCATCCTTGATGCGCTATCCCTTTTGGTATGTGAATAAAATAACGTCCACCTGTAGCTGGCCAGACTACACAATTTAAAAACCAACTCCTATTTCTCTTGAATTTTGAAATTCTCATTGCACCCGAGTCATCACGCACTTCCCTTAAGAAGAAACAAACACTTGAACCATTAAGGAGATTTGAGACTTGATTCATCATCCATTTCATAAGTGTTTCTGATAAATAAATTGCTTTTCGAGCTTCCATATCTTCTATTATGAATTTACCATTTTCGAACCAAGTGCAGAAGAAAGAATTAATGATTTTGCAGCTATTGAAACTCGAAAGAGGAATGAAAGGGGACTGTCAATGCCGAAGGTAGAGCTTGTATGGCAGGGATATAGATTGTCGGAGTATATGGGAAAGTTGCCAGAGGGGAGAAAGACAGGAGGAGGAGGGGGGTAAGAAGAGGGG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BLAST of Cla97C10G184560 vs. NCBI nr
Match: XP_008448423.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: MAU2 chromatid cohesion factor homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1361.7 bits (3523), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/720 (96.39%), Postives = 709/720 (98.47%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. NCBI nr
Match: XP_004146189.1 (PREDICTED: MAU2 chromatid cohesion factor homolog isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1361.3 bits (3522), Expect = 0.0e+00 Identity = 695/720 (96.53%), Postives = 708/720 (98.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. NCBI nr
Match: XP_022158435.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1339.7 bits (3466), Expect = 0.0e+00 Identity = 679/721 (94.17%), Postives = 703/721 (97.50%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. NCBI nr
Match: XP_022949168.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1335.9 bits (3456), Expect = 0.0e+00 Identity = 680/721 (94.31%), Postives = 703/721 (97.50%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. NCBI nr
Match: XP_022998788.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita maxima] >XP_022998789.1 sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1333.2 bits (3449), Expect = 0.0e+00 Identity = 679/721 (94.17%), Postives = 701/721 (97.23%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BJ17|A0A1S3BJ17_CUCME (LOW QUALITY PROTEIN: MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1361.7 bits (3523), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/720 (96.39%), Postives = 709/720 (98.47%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P4HMM1|A0A2P4HMM1_QUESU (Mau2 chromatid cohesion factor like OS=Quercus suber OX=58331 GN=CFP56_06589 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1169.5 bits (3024), Expect = 0.0e+00 Identity = 589/722 (81.58%), Postives = 652/722 (90.30%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5DRE7|A0A2P5DRE7_9ROSA (Cohesin loading factor OS=Trema orientalis OX=63057 GN=TorRG33x02_244680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1156.7 bits (2991), Expect = 0.0e+00 Identity = 584/725 (80.55%), Postives = 654/725 (90.21%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5D892|A0A2P5D892_PARAD (Heme biosynthesis-associated TPR protein OS=Parasponia andersonii OX=3476 GN=PanWU01x14_086520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1151.7 bits (2978), Expect = 0.0e+00 Identity = 583/725 (80.41%), Postives = 652/725 (89.93%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4EFQ8|A0A2I4EFQ8_9ROSI (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC108989169 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1150.2 bits (2974), Expect = 0.0e+00 Identity = 584/725 (80.55%), Postives = 647/725 (89.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9FGN7|SCC4_ARATH (Sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SCC4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 917.9 bits (2371), Expect = 6.9e-266 Identity = 465/723 (64.32%), Postives = 580/723 (80.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9Y6X3|SCC4_HUMAN (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAU2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 2.0e-07 Identity = 38/132 (28.79%), Postives = 65/132 (49.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9D2X5|SCC4_MOUSE (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Mau2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 2.0e-07 Identity = 38/132 (28.79%), Postives = 65/132 (49.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. Swiss-Prot
Match: sp|B1H1Z8|SCC4_XENTR (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=mau2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 2.6e-07 Identity = 38/132 (28.79%), Postives = 65/132 (49.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. Swiss-Prot
Match: sp|B4ZIX8|SCC4_XENLA (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=mau2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 1.3e-06 Identity = 38/134 (28.36%), Postives = 65/134 (48.51%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C10G184560 vs. TAIR10
Match: AT5G51340.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein) HSP 1 Score: 917.9 bits (2371), Expect = 3.8e-267 Identity = 465/723 (64.32%), Postives = 580/723 (80.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |