Bhi11G000278 (gene) Wax gourd
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGCAGTGGCGGAGGGATTGTGGAGGCTGGCAGATTACCACGAGAAGCAGGGGGAATTAGGGAAGGCAATAAAGTGTTTGGAAGCCATATGCCAGAGTCCCGTGTCTTTCTTTCCTGTCGTTGAGGTCAAGACTCGGCTTCGAATTGCCACCCTTCTACTCACTCACTCTCACAGCGTCAATCATGCCAAATCCCATCTCGAGCGTTCTGTATGAAATATTTTATTTTTTCACACAACTAATGATGTAGACTAACTATTTTTACTTTCTAATTATTAATGATGGTTTTTGTTTCCCGGCAGCAATTGTTACTGAAGTCTATCCCATCATGCTTCGAATTGAAGTGCCGGGCTTATAGCTTATTAAGCCAATGTTATCATCTCGTCGGTGCTATTCCTCCCCAGAAACAGATTCTTCATAAGGGTCTTGATCTCACCAATTCTGCTGGTCACGAGTAAGCGCTCATCCTATTTCCCTGTGCCCAATAAATTTTTTCTTCATTTCCTTCGCCAATTGATATAATCAGTTTTTTGTTTCCCTCTCATTTGTTGTTGTCGTTGGTAACACTGGATTATCCTGCAAATATTTTGCTTTAGTGTTACTTTATCAACTTTACTCATTGGCGTTCTCTTCTTGCACCCATTTAAGACTGTCAGTGAAGCTATGGTCTTGCAACTTCAATTCACAGTTAGCAAATGCTCTGATTATTGAAGGAGACTATCAAAATTCAATTTCTGCCTTGGAGTCGGGATACATATTTTCAGTTGAGATATGCTATCCTGAACTGCAGGTTGGCATCTAAAATTTTGTTTTCGTTCTCACTGCCATATTTCTTTATTCTTCTGAAAGCGTATCTTCTTGTTGCTTCTTTAATTTTTGAGTTGCATATATATATATACATAACAGAAAATTTCATTGATAAGATGAAATTACAAAAAGATTCTATTTAGTGGATTACAAAAAACTTCTCCAATTGGTCATGGGATTAGATAAGCTATAGTTATCCTTGTATATGTGCGAGGAAAGAAATTATCTCCAAAAGTGTAAAAATTTCATGGCTCAAAGAAAGGGATGGAGGCACAAGTTTGTTTCACTGAATGCTATCAGCAAAGAGAAGTAAGTCTTTAATGTCAGAATTGCAGTCTTCAAGGGCACTTCTTTGCTGCCTTTTAATGAGATTGAAGAGGAAAAAACAGTTTTTTCAATTCACTATATCAAAAGATGCTTGGAAAGAGATATATGCCTTCTAACTCGGTTTGGAATACAGTTTCAGACTTTCAACTTCACAAAATTCCAAGCTCATTAGGCCCTTTAAAGATGAAGAAATTTGGATTGGAGTTCAGTCACATGGTAAAAACAAGGCTCTTGGACCAGGCGGTTTCACCACAGAATTCTACATAAAATTTTAGAACCTTTGCAAAAGAGATTTCCAAAAGCTGTTTAGTGAATTTCAGCGAAATGGCCATGTAAATGCTTGCTTGAGAGAGAATTTTGTTTGTCTTGTTAAGAAAACAGAGACAGCTAGCTTTGTAAAGGACTTTAGACTAATCAGTTTGACTTCCTCAATTTACAAGATTCAAGCTAAAGTCTTGGCAGAAAGGATTAAGGAAGTTATGCCTTCTCTCATCTCTCCTTACCAAAGTGCGTTTGTAGAAGGAAGACAAATACTTGACCCTATCTTGATTGCAAACAAAGTCGTCGAAGAATACAGAGTTGAAAAGAAGAAATTGTGGATTTTGAAACTGTAGAAATTGGAGGAATAGAAATATTAATCTCCTTTTTCTCTTATTAAATATGTGCAGAGTAGGTCTTCTTATATAGGAGAAAGACCTTTTACAAATATGGAAAGAATAAAGACAATAAAGGAAAATAAATATTCATATACAAATATAGAAATTCCAATACTCCCCTCAAGCTGGTTTGAAGATGTCTTCCATAGCCAGCTTATCAATCAATTTGTCAAATTGTTTCTTTGGAAGACCTTTAGTTAGCACATTAGCAATTTGCTCTGATGTAGGAAGATAAGGAATGCATATTGTTCCTGCTTCAATTTTTTCTTTAATAAAATACTTATCAACCTCAACATGTTTTGTTCTATCGTGTAAAACTGGATTATGGGCAATAGAAATTGCAGCTTTATTGTTACAATAAATCCGTATAGGCATAGTCAAAGAAATCTTCAACTCTTCAAGTATCTTTTTGATCCATGTGCCTTCACAAATTCCATGAGCCAAGGCTCCAAACTTTGCTTCAACACTATTTCTGGCCACCACATTTTGTTTTTTTACTTCTCCAAGTAACCAAATTTCCTCCAACGAAGGAACAATAACCAGAGGTTGGTCTTCTATCTTTAGTACTTCCAGTCCAATCTGCATCAGTGTAGATGTCACACCCCCTCTCGTTTTTACTCCCTAAGTCCGAAAGGAGGCGTGAAGACGGCAACACCATCCTTTTGTGATATCTACTGTCCCCTTTTCCCTGTATACTAGATAATTCTTATAACACAGATGTGTCTAATATCAAAGTTAAATTGATTAGCTACATTTATTTATACTAAATAGGTTTATAATAATTTTTGTGATTATTTCTTAAACCTACTATCTCTCTATTGTAGTAGGATCCATCGCACCGCTAGAGTGGCAGATCTTAACCTCAAGTGGTACTTCCAAAACGTCCTTTTCCGCTATCGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNGGGGACAAAATATTGGAAAATGTGAGCTAAAAGCTCAGTGAGGGGTAAGCCATTTAAGAAACTAGGTTTTTCTTTTAGTAATTCATTTTGAAATAATTTCACAGACAACAAACACAAACAACGTCAAGAAATAAGATATAACCATCCCAGCCTGGTTGCTGAGATACCACAAGCATGATCTGTTTTCCCAGGTAGTCCAGTCTAACCCAAGACACTTGTGCAAGGAAACAATCCCAGTGCTCAATATGTCCCGCCGAATGTGCACATGTTGACAAAATCTCGTTAGACGTGCTTGAAACACGCTAACATTTACCCAGGGTACAATTCTAGTTTCCAGACCAATCCTTATAAACATGCTATCAAGCAAATGCGAAGTTACACAATCTTTTACGTAAAACAATGTAAACTTAGTAACTTGACTTCGAGAGGACACCTTCCTGATCATACTAGCCTCATCAAACCATACATATATAAATATATATATATCATAACATATATGTAGATAAGATCAATTAAAACAATTGAAAATAAAACCACTCATAGTTCACCCGTAGGAGTTTCTCTTTCCTGAGCTTTTCCTGCTTCCCTAGTTCCTTTATGATTCTGAACCTATGTTAATCTCATAATCAACTTAGAATCCTATTTTCTAGGGTTAAAACAACTTTAACATACCTTCTTGGCCTTAGCCCTATCTTACCAACTCTAACAAATGCTAATCTACACCCTAGGACAAACCAAGACAACTGTGGGCGCAAGGGTCATTTCCTGCAGGTTGATTGGTGTATGGACACTCCTTTAACACAAGCAAGCCTTGATCAACGCATGGCAAACTACCATTAATGCATGGTAAACCTCCCATTAACGCATCCCCCTCCTCGAGCTCCTCAATTTTCTCCAACTTCCTCTCTTTTTAAGTCTCCTTAAGGATATTTTGAGTTGTAAAGTGAAATGGAGTCTCCTCGGGTATTTATAGGCATTCCAAAGGGATCCTTGTCATCATTCCTATGCTCCAACGCATGACACCTTGCTTGTATGGCAAGTTTATGTTGGTCCAATGGATCTTCCTTGACACCTCCTCCTTGCATGCAAAGCTTAAGTGTCTTCATCATGCCTAGACTAACGCATAGCTATCTTTTGAAGTGTTATTCCACCCTTCTTCATGTCCTACTATGCGTCCACCTCATCCTTGGCTTGGCCAAGACTTCACTTGGTTGAGCCACGTACCCTATATTGTTGTCAATCCGACCTTACTTGCCAAATTCTCTAATTAACGCATACTAACCTAGGTTGGGCGCATGGTGGCTTCATCAACCCTCCTCTATGCGTCCAACATCTCCTTTATGCATTCATGATGGTGCCTCCAACGCATGCTCACTTAGGTTTAGATGTATGGTTCCTCAATTTGGCTCTTAATCACCACGTCTTCCTCTTAGGTCTTAGGCAAGAGTATGCCCCAACTACCTCAAGCTTGCACCAACTAGGGTTTTTGGCTTCCTTGGTGTAACTCTCTACCAAGGATGTGTCTTATGCTTCCATCTTGCTCCTCCTAAAGTTCAAATGAAGTTTACAAGACCTCCCTATGCGCCAACCCTAGGTTTTATGCGCCCATCTCTCCCTCATGCGCCCATCTATCTTCTTTTTTCTTCTCTTGGTTTTTATTTTCCTCCTCAACGCATAGCCTACTCCCCAACTCCAAGACTTAGCCATATGTCTTCTTGTCTTACTTTTCCTTCAAGACTTCCATCAACATAGCCATTGATGCACCTAATGTTTCACCTATGCGCCCATCCCTTCCCTTTTTAGGGTTTCCTCCACTTGTGGTGTCTTATGTTGTCCAACACTTAGCCAACTTTTCCCCCTTGAATCCCCTATGCGCCCACCACTCATTCCTCATGTGTTAATTCCAAATTTCCTTCCTTGGTGGTGCATAGTTCAATACATGATCTTCCAACACAACCACTTCTTTCCTTAGGTTTCCACTTGATCCCAAACATCTCACCATAACACCTCCCATGCGTCCAAAATCCTCATGGTATGTGCCCACCATGTCTATTTCTACCCTAGCATGTGTCCAAGTCCTCTTTCCTTCCCAGAATATGTTCCACTTGAAGTGTCTTACCATAAGTTAAGCTCCTACCCCTCATATCCTTGGTACTTAGTCAATTTTTCTTAAGTACTCTCTTCCTTCCAAGGCATAGTTTTGGATACTTGGGTATTTTCCTTTCAAGAGCTTGAATTTTGAGTTTCTCTTTCTGCCTAAAGAATCCTGTGAAGGTTCG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BLAST of Bhi11G000278 vs. TAIR10
Match: AT5G51340.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein) HSP 1 Score: 918.7 bits (2373), Expect = 2.2e-267 Identity = 468/723 (64.73%), Postives = 584/723 (80.77%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9FGN7|SCC4_ARATH (Sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SCC4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 918.7 bits (2373), Expect = 4.0e-266 Identity = 468/723 (64.73%), Postives = 584/723 (80.77%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9Y6X3|SCC4_HUMAN (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAU2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 5.9e-07 Identity = 36/132 (27.27%), Postives = 65/132 (49.24%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9D2X5|SCC4_MOUSE (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Mau2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 5.9e-07 Identity = 36/132 (27.27%), Postives = 65/132 (49.24%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. Swiss-Prot
Match: sp|B1H1Z8|SCC4_XENTR (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=mau2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 7.7e-07 Identity = 36/132 (27.27%), Postives = 65/132 (49.24%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. Swiss-Prot
Match: sp|B4ZIX8|SCC4_XENLA (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=mau2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 5.0e-06 Identity = 36/134 (26.87%), Postives = 65/134 (48.51%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BJ17|A0A1S3BJ17_CUCME (LOW QUALITY PROTEIN: MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1353.2 bits (3501), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/720 (96.39%), Postives = 706/720 (98.06%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P4HMM1|A0A2P4HMM1_QUESU (Mau2 chromatid cohesion factor like OS=Quercus suber OX=58331 GN=CFP56_06589 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1168.7 bits (3022), Expect = 0.0e+00 Identity = 593/722 (82.13%), Postives = 653/722 (90.44%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5DRE7|A0A2P5DRE7_9ROSA (Cohesin loading factor OS=Trema orientalis OX=63057 GN=TorRG33x02_244680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1156.0 bits (2989), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/722 (81.16%), Postives = 650/722 (90.03%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5D892|A0A2P5D892_PARAD (Heme biosynthesis-associated TPR protein OS=Parasponia andersonii OX=3476 GN=PanWU01x14_086520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1151.0 bits (2976), Expect = 0.0e+00 Identity = 584/722 (80.89%), Postives = 649/722 (89.89%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4EFQ8|A0A2I4EFQ8_9ROSI (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC108989169 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1145.6 bits (2962), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/725 (80.83%), Postives = 646/725 (89.10%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. NCBI nr
Match: XP_008448423.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: MAU2 chromatid cohesion factor homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1353.2 bits (3501), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/720 (96.39%), Postives = 706/720 (98.06%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. NCBI nr
Match: XP_004146189.1 (PREDICTED: MAU2 chromatid cohesion factor homolog isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1351.7 bits (3497), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/720 (96.39%), Postives = 705/720 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. NCBI nr
Match: XP_022949168.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1330.5 bits (3442), Expect = 0.0e+00 Identity = 684/721 (94.87%), Postives = 700/721 (97.09%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. NCBI nr
Match: XP_022158435.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1329.7 bits (3440), Expect = 0.0e+00 Identity = 679/721 (94.17%), Postives = 700/721 (97.09%), Query Frame = 0
BLAST of Bhi11G000278 vs. NCBI nr
Match: XP_022998788.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita maxima] >XP_022998789.1 sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1327.8 bits (3435), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/721 (94.73%), Postives = 698/721 (96.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of wax gourd
Date Performed: 2019-11-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: None |