Cla97C05G080140 (gene) Watermelon (97103) v2
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTCCCACCAATGGAGCTGGACTTGAATGCCTTCATTCACGCACACCTCTCCGGCGGCGGCGGCGACGACGACGACGACGACCTATCATTCCCTCACCGTAGCATCGACGAGATTCTAAACGAATCCAGTTCTTCCACCTCATCTTCACCATCCTCTCCTCCCCATTCTCCCCCTCCCCGTGGCCGTCGCAACATCGCCGCCGGGGACGGCGGGGTCTCCACTCCTCCTTCTATATCACCGTTCAAGTCTCCGTTCGAGGAAAGAATAAAGGTTTCTGAAGCTCCCAGAAGCAACCAATGGAACGAGAAGTCAGTTCAATTGAAACCAGGTACGGTCTCTCATGCCAAGGTCGGTGAATTAACGGACGACCCGTTTCGAAGGGGATCTCGTCCATTGCCATCGTTGTTTGGAGGGGTTAGATCGAATGCGAAACCTGGGGCGGCGCTTGCCGCAGCTGCTGCGGCGTCTCGGTCCATTCCAGCCCCGCACGCTGCAGCAATTAAGTCGAGGAGGGCAGGATATGGGAACACGGTTCTCGACGACGACGAGTTGCCTTCCTCTTCTGCTGTTGAATCAGAGTTTTTCTCTGATAATTTATATCATACTAACATTCACTCAAAGGAGTCTGGCGAAAAGACAATTTCAATGGTCGACAGGATTGCTGATTATCAGGTTGCTTCTACAAATGTCGGTGCTGAATTGTGGGCAAGGGACAACATTCTGGACACTGTCCCATATAATGACGAGTTTCGTATAACTAGAGATATGGAATGCGAAGCAGAACTGAGTTCCGTGGATGATGTGAATTTCAACGAGAGCCCTACAACTCTACCGCCAGTGGAAGCCAACGACAGAAGCTTGTGTGGTCCTGTTGAGAAAAATGTTTGTTCGATGGATGCACATCCAGCAGAATTGGATGTCGATGAATCAAATGAAGGGGCTATTCCGTGTTCTACTGAACCTGACGACGAGGGAAGTGCTGTCGGCTATGGGAGCCTGGAGTTGGAAACTCAAGATTTCGAGAAATGTCTTCAACCGTCAGAAGATAAGGAGGTGGATCTTGCCATTGAGGATCCCGGTGTAGTGAACGATATCACTGAATCGGGGGAAACAACCAAGCAGCTGGACAACTTTCAAATCGGTGAACGTCCAGAAATGATGCCCCTGTCCTCGACCAATCCACTCGAATTGGCTGAAGAAATTGAAAAGAAGCAGGCTTTCACTGCACTGCATTGGGAAGAAGGCGTCGCTGCCCAACCGATGAGGCTTGAACGCATTAAGGGAGGCACAACAACATTGGGGTACTTCGACATTCAAGCTGACAATAGTATTTCAAGAACTATTTCATCACATTCATTCAAGCGCGAACATGGTTTTCCCCAAGTCCTCGCTGTTCATGCGAATTATATTGCTGTTGGGATGTCAAAAGGAAATGTTGTTGTGGTGGCTAGTAAATACTCAGCTCAAAATGGTGACAACATGGATGCGAAGGTCAACATTGTACCTATTCAATATGTAGTTTCTTTCCTGGTGCTAGTTTCTTTTTGTCTGCTTAGAACTTTAGATGAATAATGGAGCTGCGACCATAATGCATGTTTGATATATTGTTCAATAGCATCAGCTAATAGATGCAAGTAGTGTTACCGATTGCATTCCTCTTTCTCCTTCTTCCCCACTTGTACTATATGGGTCTCTCGAATTTTACATTCAGTTTTTGCACCCATTTCAACAAAATGCTTGAGATGTTAAAAATGTTGGGCAAGACTCAGAAACTTTTGGCGTCTTATACAGGAGACTTGAAGTTACAGTCAGAATTCTCCTATCCAGCAATGCCATAAGTTTCCAGTTTAGATAACTGTAGTACATCCATGGTTTAAGTTTGCTTAGAACGTACATGACCTTACTTGAACATGATCTATTCTATAAGTTACACAACTGTGTCCTTAAATTCTAAAGTTTTCTTAAAACATACCTTTCTTTTTGTAGGGAGATATAAGCATTAGGATAATTATGTTGTTTATTTTACGTTTTACCGGCAAAGTATTACAAGTGCCAAATTTGGCATCATATAGGAATTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTGGGAAGCATATAGGATTTTCTGTTGCCTTTTCAGAAATGCCACCAGTTTCTGTTCCTCCAGATGATGATATCATTTTTACTATTCAAATTCTTAATAATTTTATCTACCATAAAGGGAAATGACTGTCGCATACTAAGTGAAATAGGGTTGTGTTTAGAAGAATTGAAAGGACCAAATTTGGAGGCTTAAGAAGGTAGGGACACACATGATGAAAAATATGCCTGTGAACATTATAGTAGGAGGACGAGCAGAAAAAAAAAGATAAGAATAGAAGAATGGGGAAGTTTCAACACCTTTATGGTCGTTTTTGATCTCAAGGAAGTTGTTAGAACATTATACTTTGTAGTAGGAGCATGAGCAAAAAAGGATTAAAATAGAGGAACAGGAAATTTCAACACCTTTATGGTCTTTTTTGATCTCAAGAAAGTTGTTCGAATTGGAGATTTCTTCTCTGACCCAAAATTCTGCACTCTAAACTCAAAATTATCTAGGAAACACCGCCTTGGGGAGAATACTCTGTAGGTGCAAAAGGCACTAACAATGGTGATGTTTTGCAGAGCTTCTGAAACTTGAAAAAAATTGTGTGAAAGCAATCCTGTTAGTGCTTGTGAGCTAAGATAGAGATGATTGAAAATCTTTTTGATTTCCCACCCAAAAATTTCTGTAGGGTACCTCCATTGGTAGAGCTATTTCCCTTTGTTCAGTTAAAATTTGATCCTTTCCCAAGGAGGTCAATTTTCGACTAATCAAGTTGTTGTGGAAGGAAGTGGACCTTTTCAAAAAAGATTGGGAGACTACAATAGTGGTTATTTGGCATGGTTCAATATTTACTAATACTAACCACCATGGATTGATTAGTTGTCATTGGGGCTAGTGAATTTTTTGGATGAATGAGTGCAAATTTCACAGTGGCCTCTCCTTACATTAGGACATTAAAATAGGACTGCCCACATCAAATGTTGTTAGGTGAGATGGTTGTTTATTAGATTAGTAGAGGTACTCATAATGCTAACCTAAACACTCCCGCATATATATTTAAATTTTTTTTTGCTAATACTCTTTAGGAGAGAAACAATTCTAAGTACATGATGCCCAATATTTCCCAACTTGACAAAGCTTTATTAAGTCATTGAAACCCAAATGCCTGAAGACAACTCTGCTTAAATCAAGGTCAATCCATGCTTTGGTGTGCACCTCCTTGATGGCCTTCTCATTGGCAAATATCCCATATAGTTAACCTGTGTTCACCCTTCACTCTTCAATATGCAAGTCACAGGTTATTGCTTTCTTCATACAGAGAAGGTTGGCTTGATAATCTCCTTAAAGCCATTAAAATCTTTAAGCTTCATTTTGATTAAAGTTGATCTGCAAGTCTTTGATCATAGATAATCAATATTGACGTAAATCTTATCCAGGAGGTGTATTTTGGGTCAATGACACATGCTATTTGGGTATGCAGTAGATGGTAGCTTAAATCTTCTTATTTTTTGATATCCATGAAAGAATCATAACTAGGCTGGCAAATGAAGGACTTCTTCCTTTTGAAAGTCTCGATAATCTCTTGTGAAAAAGGAGCCAATAATGAGGGAGATAGCCATCTCATATGCTGGGATAACATTTGCTTACCTGTTAACAAAGGAAACCCAGCGTCAATATTTTGGGAAAAAAGAAAGTATAATTTGCTAGGTAAATGGAAGTGGTGTTTATTTTCGATTAGGGTTGTCTTGAGCTGTATATTAATTGTTAGCAATACAGAACTAAACTCGGAGTTGGTTTAACTTAAAAGTATTACTCAAGCACTAAACATCACGGGCTACACTTTTAAATGTTGTGAGGCCACGAGAAATGATATTCTTTTATGGTAGGCAGTGGAAACCGAGTTTATTGGAGAAGTACTTGGATTGGTCAAGACGTTTGTTGTCTGAAGCTGTTTTGGTCGACAAACTCCAATGATTATCATCCAGAGGATCGTGAAGGCTGTATACTTGTTGGAGATAAAAGGCATGAACGAACACATATTTCTTTTACCCTCTCCAATTCAGTTAGTTAAGAATTCAGTTAGCAAATGCCAGTATAAGATTTTTTCCCTTTTTCTCTCAGCCATAGTCTTGGAAGGATCCAACAAATTGCAAACGTAGTGCCCCAAACGCCCTTTGGCTCATTGATAGTATATTCTCTTCAAAAAGTTTATTGAAGTTCAAAGCCTCTTCACAAATCCAAGATACTATTGAAGATTTGATGCAAGCTCTCTAGTAGGGAACTTGGAGGGAAAAAAGGGATTTTTTTTTGGTTGTTTTTTTAAATAAAAAATATATATTTTTTTAGATATTAAAAGAAAGGAAAGAGTTGCAACTCTTGATGAATTTTGGGACATTAACGAAGTTTTTGCTTTGATTTGGTATATTTTGTCAAATTCCTTTTCTAATTCTAGTGCTCAAAATTTTAATGATTGTGGTCAATTGCCATGCCTTTTTATGTCTCTTGGTGGAGGCTGGATGCTTTATCTTTTTACATCCTTCATTGTCTGGTAAAGTCTCTAGTTTGTTTTTGGAAGAAGAAGAGACTTTTTCTTGTTTAAAAAAGAGTGATATCATCTTTCCAAACCAAGCTGGGAAACTGACTTTTATATTTATTATTTTTGTATTTGACTGACAAGATTCTCAGTCATCCTTGTTGGTCTCAGTCTTTTTGTTACTTCTCCATTTATTAAGATATTTTAATATTATGAATTACACTATGTGGATATAGATGCTATTGCTTGGATCACAAGGGGATAAATCAACTGCACCAGTAACATCTCTATGCTTTAATCAGCAAGGGGACCTGCTTCTAGCTGGTTACAGTGATGGTCATGTTACAGTCTGGGATGTGTTGAGGGCATCGGCAGCGAAGG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MLPPMELDLNAFIHAHLSGGGGDDDDDDLSFPHRSIDEILNESSSSTSSSPSSPPHSPPPRGRRNIAAGDGGVSTPPSISPFKSPFEERIKVSEAPRSNQWNEKSVQLKPGTVSHAKVGELTDDPFRRGSRPLPSLFGGVRSNAKPGAALAAAAAASRSIPAPHAAAIKSRRAGYGNTVLDDDELPSSSAVESEFFSDNLYHTNIHSKESGEKTISMVDRIADYQVASTNVGAELWARDNILDTVPYNDEFRITRDMECEAELSSVDDVNFNESPTTLPPVEANDRSLCGPVEKNVCSMDAHPAELDVDESNEGAIPCSTEPDDEGSAVGYGSLELETQDFEKCLQPSEDKEVDLAIEDPGVVNDITESGETTKQLDNFQIGERPEMMPLSSTNPLELAEEIEKKQAFTALHWEEGVAAQPMRLERIKGGTTTLGYFDIQADNSISRTISSHSFKREHGFPQVLAVHANYIAVGMSKGNVVVVASKYSAQNGDNMDAKMLLLGSQGDKSTAPVTSLCFNQQGDLLLAGYSDGHVTVWDVLRASAAKVISGEHTSPVVHSLFLGQEAQVTRQFKAVTGDNKGLVLLHTFSVVPLLNRFSIKTQCLLDGQKTGTVLSASALLLNEFCGSSLPQTLSNAAVSTSSIGSMMGGVVGGDSGWKLFNEGSSLVEEGVVIFATHQTALVVRLSPTVEVYAQLSKPDGIREGSMPYTAWKCSQSFETSPSEAVERVSLLAIAWDKMVQVAKLVKTELKVCGRWSLESAAIGVVWLDDQVLVILTVTGQLFLFEKDGTMIHQTSIFLEGFDKEEFIAYHTHFANVLGNPEKAYHNCVAVRGASIYVLGPMHLVISRLLPWKERVQVLRKAGDWMSALSMAITIYDGHAHGVIDLPRSLESLQELVMPFLIELLLSYVDEVFSYISVAFCNQIEKNEKLDDVTSESHSAHSEIKEQYNRVGGVAVEFCVHITRTDILFDEIFSKFVAVQQRDTFLELLEPYILKDMLGSLPPEIMQALVEHYSHKGWLQRVEQCVLHMDISSLDFNQVVRLCRDHGLYSALVYLFNKGLDDFRTPLEELLAVLRTSKSKRASALGYKTLVYLKYCFSGLAFPPGQGTLAHSRVQSLRDELLQFLLENSDTVDARSISNKSSEVGYLNLYHLLELDTGATLDVLRCAFVEGEILTTNSFLDGSVDASMQLREEKNLISGRKNFLIQNVVDALVHVLDKAICETDGSLAGDNITLVDNWPSKKDLIHLFDFVATYVACGKATASKDVVGLILEHLISNSNIPETASDFLPRVTANSVHSRKREKQVLSLLEVVPETHWNPSSVLRMCEKAQFFQVCGLIHSIRRQYSSALDGYMKDVDEPIHAFAFINRALLELSNSEQTEFRAVVISRIPELFNLNRGAAFFLVIDHFNNDVSDILSQLHNHPRSLFLYLKTLIEVHLSGSLDISCLKKDDNLEVNYSTKGLDEYLQKLSDFPKYLSNNPVDVTDDIIELYVELLCQYERESVLKFLETFDSYRVEHCLRLCQQYEVIDAAAFLLERVGDVGSALFLTLSSLDKKFHDLEAAVGGIVTNGASGGSNDSQHFSSVLKLQEVNAIDVLLHACIGLCQRNTPRLNSEESETLWFKLLDSFCEPLIDSYNYRTASFEENQVQFLNESSSLQKDKGHIVTWRILKSNKAAHILRRLFSQFIKEIVEGMIGYVHLPTIMSRLLYDNGSQEFGDFKLTILGMLGTFGFERRILDTAKALIEDDTFYTMSLLKKGASHGYAPRSVVCCICNRLLIKSSSSYRVRVFNCGHATHLQCEVLDNEASGGDFTCPVCVNSNHSQRSRSKAVTEYSVANKFSSRTQSSSGASVSYPQETDLLELPYTLQQIPRFEILTNLQKNQKVIDIENVPQLRLAPPAVYHDKVTKGYHLLVGESRGGIEKVEKLNKSRQLTEVKVKRPSSLRFPLKASLFGKEKTNS
BLAST of Cla97C05G080140 vs. NCBI nr
Match: XP_011650623.1 (PREDICTED: vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog [Cucumis sativus] >KGN56350.1 hypothetical protein Csa_3G116870 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 3340.8 bits (8661), Expect = 0.0e+00 Identity = 1750/1958 (89.38%), Postives = 1817/1958 (92.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. NCBI nr
Match: XP_008437780.1 (PREDICTED: vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 3310.4 bits (8582), Expect = 0.0e+00 Identity = 1740/1958 (88.87%), Postives = 1808/1958 (92.34%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. NCBI nr
Match: XP_023526489.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 3278.0 bits (8498), Expect = 0.0e+00 Identity = 1676/1887 (88.82%), Postives = 1747/1887 (92.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. NCBI nr
Match: XP_022924308.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 3266.9 bits (8469), Expect = 0.0e+00 Identity = 1719/1957 (87.84%), Postives = 1790/1957 (91.47%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. NCBI nr
Match: XP_022979268.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 3260.7 bits (8453), Expect = 0.0e+00 Identity = 1709/1956 (87.37%), Postives = 1786/1956 (91.31%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0L2X7|A0A0A0L2X7_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G116870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3340.8 bits (8661), Expect = 0.0e+00 Identity = 1750/1958 (89.38%), Postives = 1817/1958 (92.80%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3AUY3|A0A1S3AUY3_CUCME (vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483112 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3310.4 bits (8582), Expect = 0.0e+00 Identity = 1740/1958 (88.87%), Postives = 1808/1958 (92.34%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2I4ETR7|A0A2I4ETR7_9ROSI (vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog OS=Juglans regia OX=51240 GN=LOC108992639 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2236.8 bits (5795), Expect = 0.0e+00 Identity = 1197/1925 (62.18%), Postives = 1461/1925 (75.90%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. TrEMBL
Match: tr|V4U715|V4U715_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina OX=85681 GN=CICLE_v10018449mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2192.2 bits (5679), Expect = 0.0e+00 Identity = 1162/1889 (61.51%), Postives = 1428/1889 (75.60%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A067H3N5|A0A067H3N5_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis OX=2711 GN=CISIN_1g000170mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2189.8 bits (5673), Expect = 0.0e+00 Identity = 1161/1890 (61.43%), Postives = 1428/1890 (75.56%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q0P5W1|VPS8_MOUSE (Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Vps8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 332.4 bits (851), Expect = 3.4e-89 Identity = 348/1443 (24.12%), Postives = 604/1443 (41.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q8N3P4|VPS8_HUMAN (Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS8 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 313.5 bits (802), Expect = 1.6e-83 Identity = 347/1446 (24.00%), Postives = 597/1446 (41.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q9VRX2|VPS8_DROME (Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Vps8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 128.6 bits (322), Expect = 7.4e-28 Identity = 147/614 (23.94%), Postives = 259/614 (42.18%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. Swiss-Prot
Match: sp|P39702|VPS8_YEAST (Vacuolar protein sorting-associated protein 8 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=VPS8 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 4.5e-09 Identity = 31/157 (19.75%), Postives = 80/157 (50.96%), Query Frame = 0
BLAST of Cla97C05G080140 vs. TAIR10
Match: AT4G00800.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein) HSP 1 Score: 1800.0 bits (4661), Expect = 0.0e+00 Identity = 957/1648 (58.07%), Postives = 1217/1648 (73.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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