ClCG05G000190 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAACGATCAAGGAGCTGACTGACACCGAAATGCTCCCACCAATGGAGCTGGACTTGAATGCCTTCATTCACGCACACCTCTCCGGCGGCGGCGGCGACGACGACGACGACGACCTATCATTCCCTCACCGTAGCATCGACGAGATTCTAAACGAATCCAGTTCTTCCACCTCATCTTCACCATCCTCTCCTCCCCATTCTCCCCCTCCCCGTGGCCGTCGCAACATCGCCGCCGGGGACGGCGGGGTCTCCACTCCTCCTTCTATATCACCGTTCAAGTCTCCGTTCGAGGAAAGAATAAAGGTTTCTGAAGCTCCCAGAAGCAACCAATGGAACGAGAAGTCAGTTCAATTGAAACCAGGTACGGTCTCTCATGCCAAGGTCGGTGAATTAACGGACGACCCGTTTCGAAGGGGATCTCGTCCATTGCCATCGTTGTTTGGAGGGGTTAGATCGAATGCGAAACCTGGGGCGGCGCTTGCCGCAGCTGCTGCGGCGTCTCGGTCCATTCCAGCCCCGCACGCTGCAGCAATTAAGTCGAGGAGGGCAGGATATGGGAACACGGTTCTCGACGACGACGAGTTGCCTTCCTCTTCTGCTGTTGAATCAGAGTTTTTCTCTGATAATTTATATCATACTAACATTCACTCAAAGGAGTCTGGCGAAAAGACAATTTCAATGGTCGACAGGATTGCTGATTATCAGGTTGCTTCTACAAATGTCGGTGCTGAATTGTGGGCAAGGGACAACATTCTGGACACTGTCCCATATAATGACGAGTTTCGTATAACTAGAGATATGGAATGCGAAGCAGAACTGAGTTCCGTGGATGATGTGAATTTCAACGAGAGCCCTACAACTCTACCGCCAGTGGAAGCCAACGACAGAAGCTTGTGTGGTCCTGTTGAGAAAAATGTTTGTTCGATGGATGCACATCCAGCAGAATTGGATGTCGATGAATCAAATGAAGGGGCTATTCCGTGTTCTACTGAACCTGACGACGAGGGAAGTGCTGTCGGCTATGGGAGCCTGGAGTTGGAAACTCAAGATTTCGAGAAATGTCTTCAACCGTCAGAAGATAAGGAGGTGGATCTTGCCATTGAGGATCCCGGTGTAGTGAACGATATCACTGAATCGGGGGAAACAACCAAGCAGCTGGACAACTTTCAAATCGGTGAACGTCCAGAAATGATGCCCCTGTCCTCGACCAATCCACTCGAATTGGCTGAAGAAATTGAAAAGAAGCAGGCTTTCACTGCACTGCATTGGGAAGAAGGCGTCGCTGCCCAACCGATGAGGCTTGAACGCATTAAGGGAGGCACAACAACATTGGGGTACTTCGACATTCAAGCTGACAATAGTATTTCAAGAACTATTTCATCACATTCATTCAAGCGCGAACATGGTTTTCCCCAAGTCCTCGCTGTTCATGCGAATTATATTGCTGTTGGGATGTCAAAAGGAAATGTTGTTGTGGTGGCTAGTAAATACTCAGCTCAAAATGGTGACAACATGGATGCGAAGGTCAACATTGTACCTATTCAATATGTAGTTTCTTTCCTGGTGCTAGTTTCTTTTTGTCTGCTTAGAACTTTAGATGAATAATGGAGCTGCGACCATAATGCATGTTTGATATATTGTTCAATAGCATCAGCTAATAGATGCAAGTAGTGTTACCGATTGCATTCCTCTTTCTCCTTCTTCCCCACTTGTACTATATGGGTCTCTCGAATTTTACATTCAGTTTTTGCACCCATTTCAACAAAATGCTTGAGATGTTAAAAATGTTGGGCAAGACTCAGAAACTTTTGGCGTCTTATACAGGAGACTTGAAGTTACAGTCAGAATTCTCCTATCCAGCAATGCCATAAGTTTCCAGTTTAGATAACTGTAGTACATCCATGGTTTAAGTTTGCTTAGAACGTACATGACCTTACTTGAACATGATCTATTCTATAAGTTACACAACTGTGTCCTTAAATTCTAAAGTTTTCTTAAAACATACCTTTCTTTTTGTAGGGAGATATAAGCATTAGGATAATTATGTTGTTTATTTTACGTTTTACCGGCAAAGTATTACAAGTGCCAAATTTGGCATCATATAGGAATTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTGGGAAGCATATAGGATTTTCTGTTGCCTTTTCAGAAATGCCACCAGTTTCTGTTCCTCCAGATGATGATATCATTTTTACTATTCAAATTCTTAATAATTTTATCTACCATAAAGGGAAATGACTGTCGCATACTAAGTGAAATAGGGTTGTGTTTAGAAGAATTGAAAGGACCAAATTTGGAGGCTTAAGAAGGTAGGGACACACATGATGAAAAATATGCCTGTGAACATTATAGTAGGAGGACGAGCAGAAAAAAAAAGATAAGAATAGAAGAATGGGGAAGTTTCAACACCTTTATGGTCGTTTTTGATCTCAAGGAAGTTGTTAGAACATTATACTTTGTAGTAGGAGCATGAGCAAAAAAGGATTAAAATAGAGGAACAGGAAATTTCAACACCTTTATGGTCTTTTTTGATCTCAAGAAAGTTGTTCGAATTGGAGATTTCTTCTCTGACCCAAAATTCTGCACTCTAAACTCAAAATTATCTAGGAAACACCGCCTTGGGGAGAATACTCTGTAGGTGCAAAAGGCACTAACAATGGTGATGTTTTGCAGAGCTTCTGAAACTTGAAAAAAATTGTGTGAAAGCAATCCTGTTAGTGCTTGTGAGCTAAGATAGAGATGATTGAAAATCTTTTTGATTTCCCACCCAAAAATTTCTGTAGGGTACCTCCATTGGTAGAGCTATTTCCCTTTGTTCAGTTAAAATTTGATCCTTTCCCAAGGAGGTCAATTTTCGACTAATCAAGTTGTTGTGGAAGGAAGTGGACCTTTTCAAAAAAGATTGGGAGACTACAATAGTGGTTATTTGGCATGGTTCAATATTTACTAATACTAACCACCATGGATTGATTAGTTGTCATTGGGGCTAGTGAATTTTTTGGATGAATGAGTGCAAATTTCACAGTGGCCTCTCCTTACATTAGGACATTAAAATAGGACTGCCCACATCAAATGTTGTTAGGTGAGATGGTTGTTTATTAGATTAGTAGAGGTACTCATAATGCTAACCTAAACACTCCCGCATATATATTTAAATTTTTTTTTGCTAATACTCTTTAGGAGAGAAACAATTCTAAGTACATGATGCCCAATATTTCCCAACTTGACAAAGCTTTATTAAGTCATTGAAACCCAAATGCCTGAAGACAACTCTGCTTAAATCAAGGTCAATCCATGCTTTGGTGTGCACCTCCTTGATGGCCTTCTCATTGGCAAATATCCCATATAGTTAACCTGTGTTCACCCTTCACTCTTCAATATGCAAGTCACAGGTTATTGCTTTCTTCATACAGAGAAGGTTGGCTTGATAATCTCCTTAAAGCCATTAAAATCTTTAAGCTTCATTTTGATTAAAGTTGATCTGCAAGTCTTTGATCATAGATAATCAATATTGACGTAAATCTTATCCAGGAGGTGTATTTTGGGTCAATGACACATGCTATTTGGGTATGCAGTAGATGGTAGCTTAAATCTTCTTATTTTTTGATATCCATGAAAGAATCATAACTAGGCTGGCAAATGAAGGACTTCTTCCTTTTGAAAGTCTCGATAATCTCTTGTGAAAAAGGAGCCAATAATGAGGGAGATAGCCATCTCATATGCTGGGATAACATTTGCTTACCTGTTAACAAAGGAAACCCAGCGTCAATATTTTGGGAAAAAAGAAAGTATAATTTGCTAGGTAAATGGAAGTGGTGTTTATTTTCGATTAGGGTTGTCTTGAGCTGTATATTAATTGTTAGCAATACAGAACTAAACTCGGAGTTGGTTTAACTTAAAAGTATTACTCAAGCACTAAACATCACGGGCTACACTTTTAAATGTTGTGAGGCCACGAGAAATGATATTCTTTTATGGTAGGCAGTGGAAACCGAGTTTATTGGAGAAGTACTTGGATTGGTCAAGACGTTTGTTGTCTGAAGCTGTTTTGGTCGACAAACTCCAATGATTATCATCCAGAGGATCGTGAAGGCTGTATACTTGTTGGAGATAAAAGGCATGAACGAACACATATTTCTTTTACCCTCTCCAATTCAGTTAGTTAAGAATTCAGTTAGCAAATGCCAGTATAAGATTTTTTCCCTTTTTCTCTCAGCCATAGTCTTGGAAGGATCCAACAAATTGCAAACGTAGTGCCCCAAACGCCCTTTGGCTCATTGATAGTATATTCTCTTCAAAAAGTTTATTGAAGTTCAAAGCCTCTTCACAAATCCAAGATACTATTGAAGATTTGATGCAAGCTCTCTAGTAGGGAACTTGGAGGGAAAAAAGGGATTTTTTTTTGGTTGTTTTTTTAAATAAAAAATATATATTTTTTTAGATATTAAAAGAAAGGAAAGAGTTGCAACTCTTGATGAATTTTGGGACATTAACGAAGTTTTTGCTTTGATTTGGTATATTTTGTCAAATTCCTTTTCTAATTCTAGTGCTCAAAATTTTAATGATTGTGGTCAATTGCCATGCCTTTTTATGTCTCTTGGTGGAGGCTGGATGCTTTATCTTTTTACATCCTTCATTGTCTGGTAAAGTCTCTAGTTTGTTTTTGGAAGAAGAAGAGACTTTTTCTTGTTTAAAAAAGAGTGATATCATCTTTCCAAACCAAGCTGGGAAACTGACTTTTATATTTATTATTTTTGTATTTGACTGACAAGATTCTCAGTCATCCTTGTTGGTCTCAGTCTTTTTGTTACTTCTCCATTTATTAAGATATTTTAATATTATGAATTACACTATGTGGATATAGATGCTATTGCTTGGATCACAAGGGGATAAATCAACTGCACCAGTAACATCTCTATGCTTTAATCAGCAAGGGGACCTGCTTCTAGCTGGTTACAGTGATGGTCATGTTACAGTCTG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MLPPMELDLNAFIHAHLSGGGGDDDDDDLSFPHRSIDEILNESSSSTSSSPSSPPHSPPPRGRRNIAAGDGGVSTPPSISPFKSPFEERIKVSEAPRSNQWNEKSVQLKPGTVSHAKVGELTDDPFRRGSRPLPSLFGGVRSNAKPGAALAAAAAASRSIPAPHAAAIKSRRAGYGNTVLDDDELPSSSAVESEFFSDNLYHTNIHSKESGEKTISMVDRIADYQVASTNVGAELWARDNILDTVPYNDEFRITRDMECEAELSSVDDVNFNESPTTLPPVEANDRSLCGPVEKNVCSMDAHPAELDVDESNEGAIPCSTEPDDEGSAVGYGSLELETQDFEKCLQPSEDKEVDLAIEDPGVVNDITESGETTKQLDNFQIGERPEMMPLSSTNPLELAEEIEKKQAFTALHWEEGVAAQPMRLERIKGGTTTLGYFDIQADNSISRTISSHSFKREHGFPQVLAVHANYIAVGMSKGNVVVVASKYSAQNGDNMDAKMLLLGSQGDKSTAPVTSLCFNQQGDLLLAGYSDGHVTVWDVLRASAAKVISGEHTSPVVHSLFLGQEAQVTRQFKAVTGDNKGLVLLHTFSVVPLLNRFSIKTQCLLDGQKTGTVLSASALLLNEFCGSSLPQTLSNAAVSTSSIGSMMGGVVGGDSGWKLFNEGSSLVEEGVVIFATHQTALVVRLSPTVEVYAQLSKPDGIREGSMPYTAWKCSQSFETSPSEAVERVSLLAIAWDKMVQVAKLVKTELKVCGRWSLESAAIGVVWLDDQVLVILTVTGQLFLFEKDGTMIHQTSIFLEGFDKEEFIAYHTHFANVLGNPEKAYHNCVAVRGASIYVLGPMHLVISRLLPWKERVQVLRKAGDWMSALSMAITIYDGHAHGVIDLPRSLESLQELVMPFLIELLLSYVDEVFSYISVAFCNQIEKNEKLDDVTSESHSAHSEIKEQYNRVGGVAVEFCVHITRTDILFDEIFSKFVAVQQRALVEHYSHKGWLQRVEQCVLHMDISSLDFNQVVRLCRDHGLYSALVYLFNKGLDDFRTPLEELLAVLRTSKSKRASALGYKTLVYLKYCFSGLAFPPGQGTLAHSRVQSLRDELLQFLLENSDTVDARSISNKSSEVGYLNLYHLLELDTGATLDVLRCAFVEGEILTTNSFLDGSVDASMQLREEKNLISGRKNFLIQNVVDALVHVLDKAICETDGSLAGDNITLVDNWPSKKDLIHLFDFVATYVACGKATASKDVVGLILEHLISNSNIPETASDFLPRVTANSVHSRKREKQVLSLLEVVCGLIHSIRRQYSSALDGYMKDVDEPIHAFAFINRALLELSNSEQTEFRAVVISRIPELFNLNRGAAFFLVIDHFNNDVSDILSQLHNHPRSLFLYLKTLIEVHLSGSLDISCLKKDDNLEVNYSTKGLDEYLQKLSDFPKYLSNNPVDVTDDIIELYVELLCQYERESVLKFLETFDSYRVEHCLRLCQQYEVIDAAAFLLERVGDVGSALFLTLSSLDKKFHDLEAAVGGIVTNGASGGSNDSQHFSSVLKLQEVNAIDVLLHACIGLCQRNTPRLNSEESETLWFKLLDSFCEPLIDSYNYRTASFEENQVQFLNESSSLQKDKGHIVTWRILKSNKAAHILRRLFSQFIKEIVEGMIGYVHLPTIMSRLLYDNGSQEFGDFKLTILGMLGTFGFERRILDTAKALIEDDTFYTMSLLKKGASHGYAPRSVVCCICNRLLIKSSSSYRVRVFNCGHATHLQCEVLDNEASGGDFTCPVCVNSNHSQRSRSKAVTEYSVANKFSSRTQSSSGASVSYPQETDLLELPYTLQQIPRFEILTNLQKNQKVIDIENVPQLRLAPPAVYHDKVTKGYHLLVGESRGGIEKVEKLNKSRQLTEVKVKRPSSLRFPLKASLFENMRTRSTKSEMLARFRHKK
BLAST of ClCG05G000190 vs. Swiss-Prot
Match: VPS8_HUMAN (Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog OS=Homo sapiens GN=VPS8 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 1.1e-57 Identity = 273/1214 (22.49%), Postives = 501/1214 (41.27%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. Swiss-Prot
Match: VPS8_MOUSE (Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog OS=Mus musculus GN=Vps8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 224.2 bits (570), Expect = 1.2e-56 Identity = 268/1213 (22.09%), Postives = 493/1213 (40.64%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L2X7_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G116870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3365.5 bits (8725), Expect = 0.0e+00 Identity = 1718/1950 (88.10%), Postives = 1785/1950 (91.54%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. TrEMBL
Match: F6I2Y1_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_15s0048g02590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2163.7 bits (5605), Expect = 0.0e+00 Identity = 1183/2006 (58.97%), Postives = 1456/2006 (72.58%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. TrEMBL
Match: A0A061DU42_THECC (Transducin family protein / WD-40 repeat family protein isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_005038 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2150.2 bits (5570), Expect = 0.0e+00 Identity = 1160/1988 (58.35%), Postives = 1438/1988 (72.33%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. TrEMBL
Match: A0A061DT70_THECC (Transducin family protein / WD-40 repeat family protein isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_005038 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2149.4 bits (5568), Expect = 0.0e+00 Identity = 1160/1992 (58.23%), Postives = 1438/1992 (72.19%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. TrEMBL
Match: V4U715_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10018449mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2137.5 bits (5537), Expect = 0.0e+00 Identity = 1158/1990 (58.19%), Postives = 1437/1990 (72.21%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. TAIR10
Match: AT4G00800.1 (AT4G00800.1 transducin family protein / WD-40 repeat family protein) HSP 1 Score: 1795.0 bits (4648), Expect = 0.0e+00 Identity = 1015/1977 (51.34%), Postives = 1319/1977 (66.72%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. NCBI nr
Match: gi|778676625|ref|XP_011650623.1| (PREDICTED: vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 3365.5 bits (8725), Expect = 0.0e+00 Identity = 1718/1950 (88.10%), Postives = 1785/1950 (91.54%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. NCBI nr
Match: gi|659074757|ref|XP_008437780.1| (PREDICTED: vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 3360.1 bits (8711), Expect = 0.0e+00 Identity = 1722/1950 (88.31%), Postives = 1792/1950 (91.90%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. NCBI nr
Match: gi|731420761|ref|XP_002267626.3| (PREDICTED: vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 2163.7 bits (5605), Expect = 0.0e+00 Identity = 1183/2006 (58.97%), Postives = 1456/2006 (72.58%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. NCBI nr
Match: gi|590720801|ref|XP_007051429.1| (Transducin family protein / WD-40 repeat family protein isoform 1 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 2150.2 bits (5570), Expect = 0.0e+00 Identity = 1160/1988 (58.35%), Postives = 1438/1988 (72.33%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G000190 vs. NCBI nr
Match: gi|590720805|ref|XP_007051430.1| (Transducin family protein / WD-40 repeat family protein isoform 2 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 2149.4 bits (5568), Expect = 0.0e+00 Identity = 1160/1992 (58.23%), Postives = 1438/1992 (72.19%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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