Carg22822 (gene) Silver-seed gourd
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACATCTCCTTGGCGGCAATGGACGACTCTGCAACCAGTCCCGTCAAGGCCTTGGCTTCGTTTCTAATTCGCCGCCACTCCGATCAGCTTCTTTCCATTGCTCATTCCCCTGATCCTAAGCTCCATTACCCTCTATTCGTGGAGTAAGCAATTCCATTTCCATCCTTGTCTTCCTCTCTCATTCTCGTGTTTTCTCATTTTTTTTTTCATGCGTCTTCGTTCTATTAATCAGATTCGCAGAGCTGATGGACGACGATCCACCTCTTGCTCGTCTTGTTTTCTCCCATCCGACCGAGTACTTGCGTATTTTTGACGATGCAGCTGTTTGGGCGCATGTTTGTAATCATATAGTGTTGCAAAGCTTACTTATTCTCGTCTCATGGGTTGTTGATGTTCGTTTTTGTGGTGGTGGTTGCAGAAGATCACTTTGGGCGATTCGAAAGGTTGTATAAATGGAATTAAGAAAGATTTCATCCATGTTCGCATTAATGTCGCCGGATCCCCTCTGGAATGGCCTGGTTTGATTCTGTTTCCGAGTTTATTACTGCAATGTTGATTACTCTCCTGTTAATAGTGTGGTTACGTTTAATTGAGTTCTTATTGTTCGCGTTATGCTTGGTTTTAGAGACTTCTCCAAGTATTGGGTCTATCAGAGTGAAGCATCGTGGAGTGCTTCTCACACTTAAAGGGACGGTAATCAGATCTGGGGCAATTAAGATGTATGAGGGGGAGAGGTGGTACATTTGCCGGAGATGCAAGCACAAGTGAGTTGAATTTTCTCAAGTTTCAAACGTCATTTGTCTACTTATCTACTTACATGCAACGCATTGCTGGTTCGAGTTTTCACCGTGTTATGATTCGGTTCTACCATCTTTGGCTCAACTGTATGATCCACTTTTTCATCCTCTCCTTTCTCGGTTGTATTAATTTTGAATATTCTCAAGCTTTGCAGAGGAGATAGAAGCCTTAAGGATGTTAGAGACGTAATAGGGGAAGTTTCCAAGCTCTTAGGTTCAATTACTAATGCTAAAATTGTTGCTGAATTAATATCGACAAGCTTGAATGGGCTAGAGAACGTTCGTATGCTTTTTGAAGGAAAAGAAACTCTAGTAATTTGGTATTTGGTAACCTTGCATTTCAATTTTGCTATAATAAATGTGATAGCTGTGAACATAATGGCCTCCTTTCCTTTCCCCCTTTCCCCTTCCACAGACTTCCATGGGCTTTCCCCTTCCCTGACCACCGTCCAGTTGGCCACCTTTCACTATGAAAGATTGTAAAAAAACATTCTCATAATATTAGAATTGCATACATAGATAAATATCACCAAACTCAATACAGCACTTTGTAGAAGCATGCACAACTTCACAATGTTGCGTTAAACTTAACTAAAAACATAATTAAAAGTTACATACTGGGAGGTTTGGAGCGAGAGAGTAAAAGAGGGTGAGTGTGGCGTGGAGAGTATCAATATTTCTAGCTATTTCCTCAGCATTTTCTGACATTTTCTCTATATTACTAAACACCTCAGCATTTTACTCAACATCTTGATATTTGCTCGACATCTTAGAACAATAATATATAAACCTCTTGTTTTGTTTTTTCTTTTTCTGTTTTCATTTGCATTCGGCTTCCATAGTACCTCCAGTTTTTGGTCTGAAATAGCCCCATGAATAAAAAAATGCTTTGTACAATTGAATATGATGTAAAATCATTCTGCAAAAGAGGCAGTACTGCGTGGTATAACTGTTCTTTTGTCATTGATGTTTCATATTTAATAGGTAGCTGAAATCTGGTGGAACATCCATTTACATGAAGTAAAAAGGATAACTTTTGTGATGAATCTAATGTATAATTTTATTCCTCCAATCCTTTTAACAATGCGCTGGATTTTAATCTTTATTTGGGCCACCCTTATATGGATGCCAAAGCTAAACTGTGGGTAATTATCAACCGAGCCTTCTTTTGGGTTACATGGAAATAGAGGAATCAAAGGGGCGTTTTCTTTTGGACAAAGAGCACACCTTTGAATTGTTCTTTGATCAAGTCATTTACTATGCTATTTCTTGGTGTAAATTGTGTCACCAACATAGATTATCCATCCATTTTATAAATTGTATACATCAATGAAATTGTTTCTTATATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAACATTGTCCAATTGCTGAAGATAATCTAGCATGTCCGTTTGTGCTCACCATTTCTAGATTCTTCTTATTTCTTTTAACAGTTTTACTTTGCTCTGTGAAGGTTCCCAGTATATCCCGAGCTGGAAGCCAGAAACTCAATACAGTTACCATCATTTTGTCCCTCTCAGGTACTTAGTTTTCTAATTCCATGTCATTTGTTTCATTTTTATTAGTTCCACATCCCTGACAAATGATCTCATGATTCAAATCTCCCATGCATTATGCACCAACACGTTAGCATATTGCTTCAAATGGTTCTAATAAATCCTCGGTTTAATCAACATAAAGTTGGGGTTGGTAGCTGTAATAAGCCACCTGCTACGGGGTGCCTTTCTTTCTATCTTAGCCACATTGTATGGGTTTAAGAGAAACTTAATTACAGTAACAATTGAGCCTCCGGTTTCAACCTCTCTCTAAATATAATGCCAAACCAAAAGAGGAGGGGGAGGGAGAGGGGGAGAGATGGTGGGGTATTCTATCAGTTCGCTGTGAGATTCCTAGTCACCTTGCTTCTAGCACCCTCCAATCAAAATGTCACCTTACCACCTTCCCCTTCACTTATCTTACTTCTTAAGAACCATTTTATTTTTACTCCTTTGGATCCAGTTTTAGGTTTAACAAGAGGAGTTATCCAGTCGATAAAGGACTCTCCACCTCATGGTGGCATCTTAAGGTTGACTCCGAGGTAAGTTTGAGTAGTGTGGAATCAATCATTCAAGAAATGAATTTCAATATGGAGGTTGATGTTCTTGAAGATTCTTTTTATGAAGCTTTTGACTTATAGTTTCAGGATTGTGACAAGAAGTCTCTTCCTCCTATTCCTTCATTCATGTCTGCCAATTTGCTTCGTTGATAGAAGTTTGTGGTCTTGAGTTTTGTGAAATTATTCCTTTGGCTCAAGAAGGAAGTAGCGCCATGATTTAGCTTTGTAAAATTTTGTTTTGTCTCCTCTGAGATATTTGGATTGACTTGCATGGGGAAATTCTTTATTTCTTTGTTGGGGATGGTTTTTCCAAAGCTCCTTTTGTTGGGTTAAATAGTTACCTAGCAATACTGAACAGTTTTTCAAGGTTTGTTTTTTATGGGTTTTAAAAAGTTTTTGTTTTTGGTTGGTTAGTGGTCAGTTCTTCATTTTTTTGGGAAGACTATCAATTTTCATTGTTTGGTGGAGGCCTTGTTCATAGTTTCATCATTCATTTGCAATCTCTCTAAGTTTTTTGAACGAAGTTTTTCAAAAAGTTCTTGATTCTTTAAATGTTTATTTATTTTCATGGCTAAATTCTATTTAGTTGTATTTTCTATTTTGTATCTTTTCTTTTTCACTCCATTTGGGAGTCTATATCCCTTCAACATTTACTTCTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATACTCTTCCTAAGTTGGTTCTTCATTTCACTGCTCCTAACACATTGAACTAAAAGAAAGTAGTAGTTGGAATACAAAAGATTATTCTCTAGGTAAAAACTAATTGCTAATAAATTAACCGACTAACAAGCAAACAACTGAAACCAATTTACAACTAAATGTCGTCCACCAAGGGGGGGCCTATGGCCTGTAGTCTCTAAGTAACGCCTATCCAAAGGTTGTTGGTTGGAATCTTTGAGCAAGTTTAGTAGCAAAAACCTTTGATGTTTCCGAAGTATGGGTTGTAGGTTCGAATCTTTTTGCAAGTTCAGTAAGGAAAACCTTTGATGTTTCTGAAGTATGGGCCTTGGGGTAGACACAAGCTTCGTTTAGAAAGAGTTTGCAACAAAATGTCTAAACCCAAATACAACCGAAAAATTCTAACTGAGAATTACAAGATTATTCTTAATCCTAGTACATCTTTTCCTAATTCTTTCTTTCTATTTCTGAATATCTCATTTGCTTCCTTGTCCAATCTCGATAGTTTATGCTTCAGAATGTATAAGTAAACTATCATGAAATCATTTAGCACCATGTTACTGAGTTGATGAGTTCAAGATTTGATTGGATCCTTGTCTAATTAATTGTCTATCTAGTATAATTCTCCTGGTTACAGTAAGTTTTTGTAGTTCGGACTAATCTATTGACTTTGATTATAGAGGGCAAAACCATGTGAAGGGAAAAGTTTTGAGTGCTTGGAAGGTTCTGTAGTACGCCATGATTACCAAGAGATAAAAATTCAGGAGAGTACACAAGTATTGGGTGTGGGATCCATTCCTCGTGCCATTCTAGTCATTCTCAAGGATGACCTTGTTGACCTTGTTAAAGCTGGAGGTACTGATGTTACAGGGAGGGCTTTATGCTTTATTTTCTTCCCCTTACACTCTATTCCATTCATCACTTACTAAACTTTATCCTTCCGCAGTTCTAGATTTTTTTTTATATAGTTTTTAATACTTTTTTTTCCAATTAAAATCAGATGAAGAATCTGCCTTTAAGGTAAACATTTAGTGTAGGAGCAACAGTATACGAGATTACTTTCTTAATCTCTCTGTCAAGGTTAGCGCTATACAAAACATTATATACTGAAGTAGTGAGACTAACTGGAAGACAATATTTTCACCGTTGATAGCTTTTCCTACATCTGAATTAGACAAATAAATTTCTCTTCGACGTAAGCATTTATGCACCTGTTTCTATAGAAATCTTTGATCATCCCATGAAATGATTAAATCCCAACCACTTAAGAACTCAACCTTGAACTCATTTGGACCTGGAGACTTGTTTCTTCACAAAAATACTTATGGCAACCAGAATTAGGAGCGGTAGAATTTTCAATGGG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ATGGACATCTCCTTGGCGGCAATGGACGACTCTGCAACCAGTCCCGTCAAGGCCTTGGCTTCGTTTCTAATTCGCCGCCACTCCGATCAGCTTCTTTCCATTGCTCATTCCCCTGATCCTAAGCTCCATTACCCTCTATTCGTGGAATTCGCAGAGCTGATGGACGACGATCCACCTCTTGCTCGTCTTGTTTTCTCCCATCCGACCGAGTACTTGCGTATTTTTGACGATGCAGCTGTTTGGGCGCATAAGATCACTTTGGGCGATTCGAAAGGTTGTATAAATGGAATTAAGAAAGATTTCATCCATGTTCGCATTAATGTCGCCGGATCCCCTCTGGAATGGCCTGAGACTTCTCCAAGTATTGGGTCTATCAGAGTGAAGCATCGTGGAGTGCTTCTCACACTTAAAGGGACGGTAATCAGATCTGGGGCAATTAAGATGTATGAGGGGGAGAGGTGGTACATTTGCCGGAGATGCAAGCACAAGTTCCCAGTATATCCCGAGCTGGAAGCCAGAAACTCAATACAGTTACCATCATTTTGTCCCTCTCAGAGGGCAAAACCATGTGAAGGGAAAAGTTTTGAGTGCTTGGAAGGTTCTGTAGTACGCCATGATTACCAAGAGATAAAAATTCAGGAGAGTACACAAGTATTGGGTGTGGGATCCATTCCTCGTGCCATTCTAGTCATTCTCAAGGATGACCTTGTTGACCTTGTTAAAGCTGGAGACGATGTTATTGTTACAGGAGTATTGAGTGCAAAGTGGTCCCCAGACATCAAAGATGTACGGTGTGACCTTGATCCAATGCTAATTGCTAATCATGTGAGAAGAACCAATGAACTGAAGGCAGAGGTTGACATCCCTGATGACATAATTATGAATTTTAGGCAGTTCTGGTCAGATTTCAAAGACACTCCTTTAAAAGGTAGAAATGCTATTCTAAGAGGTATATGCCCTCAAGTGTTTGGACTTTTTACTGTAAAACTTGCAGTGGCTTTAACACTCATTGGAGGTGTACAACATGTGGATGTATCTGGAACCAAAGTTCGAGGAGAATCTCATCTATTGTTGGTTGGCGATCCTGGTACTGGAAAGTCACAGTTCCTGAAATTTGCTGCCAAACTGAGCAACCGGGCTGTTATTACCACTGGATTAGGAAGCACTAGCGCTGGACTAACTGTTGCTGCTGTCAAGGATGGAGGGGAATGGATGCTGGAAGCTGGGGCACTTGTACTGGCTGATGGAGGACTTTGTTGTATAGATGAAGTGGACAGCATGAGAGAACATGACAGAGCCACGATCCATGAAGCAATGGAGCAACAGACTATAAGTGTCGCAAAGGCTGGTCTTGTAACAACTCTCAGTACTAGAACGATAGTATTTGGCGCAACAAATCCTAAAGGACATTATGACCCTGAACAACCTCTCTCTGTCAATACAACACTCTCCGGACCCTTATTGAGCAGATTTGATATCGTCCTTGTGCTTTTAGATACCAAAAATCCCGAATGGGATGCAGTTGTCTCATCACATATTCTCTCCGAGTGCCAACAAGAAAAGGGAAAGCGTGATAATGATCTTTCAAGTAACTGGCCTCTTACTATGCTTCGAAGATACCTCCAATTTGTAAAAGGATACTTCAGACCGGTCCTGACCAAGGAGGCAGAACAAATTATTTCAAGATACTATCAGCTTCAAAGAAGATCAGCAATGGATAATGCAGCCAGAACAACAGTCCGCATGCTCGAAAGTTTGATACGTTTAGCACAAGCACATGCACGGCTCATGTTTAGAAATGAGGTTACTCGGCTCGATGCCATTACGGCTATATTGTGCATCGAATCATCCATGACGACCTCAGCTTTAGTGGATAGTGTTGGGAATGCCTTGCACTCCAACTTTACCGAGAACCCAGATGAGGAATGTATCCTTCCTTCCTAA MDISLAAMDDSATSPVKALASFLIRRHSDQLLSIAHSPDPKLHYPLFVEFAELMDDDPPLARLVFSHPTEYLRIFDDAAVWAHKITLGDSKGCINGIKKDFIHVRINVAGSPLEWPETSPSIGSIRVKHRGVLLTLKGTVIRSGAIKMYEGERWYICRRCKHKFPVYPELEARNSIQLPSFCPSQRAKPCEGKSFECLEGSVVRHDYQEIKIQESTQVLGVGSIPRAILVILKDDLVDLVKAGDDVIVTGVLSAKWSPDIKDVRCDLDPMLIANHVRRTNELKAEVDIPDDIIMNFRQFWSDFKDTPLKGRNAILRGICPQVFGLFTVKLAVALTLIGGVQHVDVSGTKVRGESHLLLVGDPGTGKSQFLKFAAKLSNRAVITTGLGSTSAGLTVAAVKDGGEWMLEAGALVLADGGLCCIDEVDSMREHDRATIHEAMEQQTISVAKAGLVTTLSTRTIVFGATNPKGHYDPEQPLSVNTTLSGPLLSRFDIVLVLLDTKNPEWDAVVSSHILSECQQEKGKRDNDLSSNWPLTMLRRYLQFVKGYFRPVLTKEAEQIISRYYQLQRRSAMDNAARTTVRMLESLIRLAQAHARLMFRNEVTRLDAITAILCIESSMTTSALVDSVGNALHSNFTENPDEECILPS
BLAST of Carg22822 vs. NCBI nr
Match: XP_022952900.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022952901.1 probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1278.8 bits (3308), Expect = 0.0e+00 Identity = 642/642 (100.00%), Postives = 642/642 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. NCBI nr
Match: XP_023554772.1 (probable DNA helicase MCM9 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023554774.1 probable DNA helicase MCM9 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1273.8 bits (3295), Expect = 0.0e+00 Identity = 639/642 (99.53%), Postives = 640/642 (99.69%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. NCBI nr
Match: XP_022952902.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1272.3 bits (3291), Expect = 0.0e+00 Identity = 641/642 (99.84%), Postives = 641/642 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. NCBI nr
Match: XP_022971956.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1259.6 bits (3258), Expect = 0.0e+00 Identity = 631/642 (98.29%), Postives = 635/642 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. NCBI nr
Match: XP_022971957.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1253.0 bits (3241), Expect = 0.0e+00 Identity = 630/642 (98.13%), Postives = 634/642 (98.75%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TAIR10
Match: AT2G14050.1 (minichromosome maintenance 9) HSP 1 Score: 993.4 bits (2567), Expect = 6.4e-290 Identity = 495/633 (78.20%), Postives = 561/633 (88.63%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TAIR10
Match: AT3G09660.1 (minichromosome maintenance 8) HSP 1 Score: 256.9 bits (655), Expect = 3.3e-68 Identity = 193/565 (34.16%), Postives = 293/565 (51.86%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TAIR10
Match: AT2G16440.1 (Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein) HSP 1 Score: 255.8 bits (652), Expect = 7.3e-68 Identity = 189/607 (31.14%), Postives = 304/607 (50.08%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TAIR10
Match: AT1G44900.1 (minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein) HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 9.6e-68 Identity = 188/547 (34.37%), Postives = 290/547 (53.02%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TAIR10
Match: AT2G07690.1 (Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein) HSP 1 Score: 253.4 bits (646), Expect = 3.6e-67 Identity = 187/601 (31.11%), Postives = 296/601 (49.25%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. Swiss-Prot
Match: sp|F4IFF3|MCM9_ARATH (Probable DNA helicase MCM9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 993.4 bits (2567), Expect = 1.2e-288 Identity = 495/633 (78.20%), Postives = 561/633 (88.63%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. Swiss-Prot
Match: sp|B8B406|MCM9_ORYSI (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 893.6 bits (2308), Expect = 1.3e-258 Identity = 452/634 (71.29%), Postives = 523/634 (82.49%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q69QA6|MCM9_ORYSJ (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MCM9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 889.8 bits (2298), Expect = 1.8e-257 Identity = 451/634 (71.14%), Postives = 522/634 (82.33%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. Swiss-Prot
Match: sp|I0IUP4|MCM9_CHICK (DNA helicase MCM9 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=MCM9 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 582.4 bits (1500), Expect = 6.2e-165 Identity = 319/639 (49.92%), Postives = 416/639 (65.10%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. Swiss-Prot
Match: sp|F1QDI9|MCM9_DANRE (DNA helicase MCM9 OS=Danio rerio OX=7955 GN=mcm9 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 578.6 bits (1490), Expect = 8.9e-164 Identity = 314/627 (50.08%), Postives = 406/627 (64.75%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C107|A0A1S3C107_CUCME (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495403 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211.1 bits (3132), Expect = 0.0e+00 Identity = 602/642 (93.77%), Postives = 624/642 (97.20%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0K618|A0A0A0K618_CUCSA (Minichromosome maintenance protein MCM OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G064040 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1205.7 bits (3118), Expect = 0.0e+00 Identity = 598/642 (93.15%), Postives = 622/642 (96.88%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S4E118|A0A1S4E118_CUCME (probable DNA helicase MCM9 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495403 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1204.5 bits (3115), Expect = 0.0e+00 Identity = 601/642 (93.61%), Postives = 623/642 (97.04%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3C1I3|A0A1S3C1I3_CUCME (probable DNA helicase MCM9 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495403 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1193.7 bits (3087), Expect = 0.0e+00 Identity = 596/642 (92.83%), Postives = 618/642 (96.26%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22822 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3BZV6|A0A1S3BZV6_CUCME (probable DNA helicase MCM9 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495403 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1179.9 bits (3051), Expect = 0.0e+00 Identity = 591/642 (92.06%), Postives = 613/642 (95.48%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of silver-seed gourd
Date Performed: 2019-03-07
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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