Carg22724 (gene) Silver-seed gourd
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGAGCGCTTCAACGCTCACCCTTCTTGATCATTACCACTCGTTAAATACTGCTTCCCCTCTCTATTTCTCTCTCGTCTTTCGCTCTTCTCCCAATCTTTCCCTCAGATTTTCCCTCAGATTTTCCCTCATTTCCTCCCATGGCAGACACACTTCTCGATTCTGGCATGGACGAAGTCCAGAAGCGCCTCATGTTCGACGACGAGTGCGTATTTCCTTTCCCTATCTGGTTTCAGATTCCGTTTCGTTTCTTGTTTTTTGCTTTTGACTTTCGTTGATTCTTGATTGATTTCTTTCTGTTTCTGGTGGGGCATTCTTGATTTCGATTCTTGATGATTTGAGGTTTGAGGTTTCTGTGGAGCTCTTCTTGTCTATTTGTACTTTACATTACTTGAATTTGAATGATTATCATATCCGAGACCTTTGAAGGAAGTTGTAGGTTGAAAATGCTTGCAAACGACCTCAGTTTAATGGCCCTCTGTTTCTGTTTCTGTCTCTTTCTCTTTCTGATGTTGCTTTGGACTTTGATTCTTTGATTCTTTTTTGTGTTTTTTGATTTCTCTGACTAGTTGTTGAGATTCCTGATGATTTGATATGCTCAATCTGGATCCAGTTTCTTCAGTTTATGCGTTTTTGGTTCTTTTGAATTTGATTTTGAAGTCCTTTCAGAGAGCTTATGCTCAAAGAGAAAGCCGAAGAAAGGAAACTGGACTTTTGATCGAAGGTTGCAGGAAAGAACCCCTAAGCAATGCCACCTGCTCCGCCCCTCTCCTTTCTAGTCGAGCTTCTTCGCCCCTTCGCCCTATGGGTCTCAGAGCTCCGCCCCTCTGTCAACCCGAGGGAAATCTGTCTCATTCATAAAGAGTCTTAGTTTATCGTGCAAATGATTTCTAACGTATAGTTTATCGATCCCTTTTTTCTCTCGTTTGTCCGATTAGCATGTGCTCTGCTTGTTGGTGGAAGAAGTATTTGAATGGGGAAGGAATTAAATCTGAGTCTCTTTTTTCCTGGAAAGGGAATGAGAAGTTGTTGGTCAAGTGTTTGAAACCAGTCGAATTACATTTCATTTGAAGTTCTTGATGATTTGATGCTTAAAAGGTTTCTGGGATCTGAACATCTCTGGCTTAATTTGTATGATACAATGTTTGAGTTTGAATCATGGCATGGCCAACAGTTTTGAAGGTGTTTAGTTTGAATTCATTCACTTAGTACACTCGGATATAATTCATTCACTTACTCACAAATACCTTCTGTCGATCTTGAATTGCTGGATAGATGCATTTTAGTGGATGAGAACGATCGTGTTGTGGGTCATGAATCCAAGTATAACTGTAAGTTAAATCTTTTCCAGTATTGATTTCTTTGAAGCAAGTTCTTATGACAATGCTAACAGTCATGATTTGCTTATTTTACTTTAGAACTCTTGTCTCGTTGCTATAGTGGTATGATATTGTCTACTTCGAGCTCTACGTAGTTTGATAATGCCCAATGTTCTCGTCTAACCTGCAGGTCACTTGATGGAAAATATTGAATCTAAAAACTGGCTGCATCGCGCTTTCAGCGTCTTTCTATTCAACTCCAAATACGAATTGCTTCTTCAGGTATGCTATTTGGGTTTGATTCGGACCGTTTCTGAAATGGTGGCTGTTTTGTGAGATCCCACATTGATTGGTGAGAGGAACGAGTGCCAACGAGGATGCTAGACCCATAAAGGGTGTAGATTATGAGATCCCACATCAATTGGAGAGGGAAACCCGTGCTAGTGAGGACGTTGGGCCCCGAAAGTGGGTGGATTGTGAGATCCCACATTGGTTGGAGAGGGAACGAAACATTCTTTATAAGGATTAGGAAACCTCTCCCTAGCAGATGTGTTTAGAAAGTCTGAAAGGGAAAACCCAAAGATGATAATATCGGGTAATGGTGGACTTAGGATGTTACATGTTTAAACGTTCGAGTTTGTATCGTTTTTCCGTTAGTCTCTTGCTGAAACTAAGTTAATGTTTTGATGATGTCTATGGTTTTTCTAGCTTTCTTGTTTGTTTTGTTGTTAGTATTTTTCTTATCTATATTCCGAACACGGAAAATGTTAACGTGTTGAACTCGATATCATCTCTGAAGCAACGATCTGCGACAAAGGTGACGTTTCCGCTTGTCTGGACGAACACTTGCTGCAGCCATCCATTGTATAGAGAATCTGAACTAATTGAGGAGGAAGCCCTTGGTGCAAGGAATGCTGCACAAAGGAAGCTGTTGGATGAACTCGGTATTCCTGCTGAAGACGTCCCGGTCGACCAGTTCATTCCGGTTGGTCGAATGCTATACAAGGCACCCTCAGATGGCAAATGGGGGGAGCATGAATGTACCTTCCCTAACTATAACTCATCTGTTTACAACTTGAGCTGATTTGGTATCACATTTGTTTCTAATAAGTATAACGTGCAGTGGACTATCTCCTCTTCATCATTCGAGATGTCAACGTGAACCCGAACCCGGACGAAGTGGCGGATGTGAAGTACGTAAACAAGGAGCAGTTGAAGGAGCTTGTGAGGAAAGCAGATGGTGGAGAAGAGGGCTTGAAGCTGTCTCCTTGGTTCAGGCTAGTTGTGGACAATTTTCTGTTCAAGTGGTGGGATCATGCGGAGAAGGGGACTCTTAAGGAAGCTGCTGACATGAAAACAATTCACAAGTTGACCTGAGAGCTTAAACAATCAACCTGCTTGTTGTTTTTAGTTTTTGAATCCATTTCTTCCACAGCTCAATAATGCTTACTTTTTCAGTCTTCTACGAATAACTTAACTGACAGTAGGTTTTGTTATTCGGTGGAAATTGAAAATTTCTTGCACTATATTTAATAATGTGAGCCAATTTTTAAATAAAAGTAAGGTTGAATTATCGAACCATTAGATTTTACGTGTAAACTGCACTAACTGTAGTATTCTCATGCATGTTTTGCTAGAGAGATAACTTGGATCACCCAAGTACGTAATCTACCATTTGAACTTCACTTTAGTCATATCTGAAGATTGAGGTGTGGTCTATTAGATTCCCAAGACAAACTAGGTAGCTTAACGAGGACTTCTGACGGTAGGTTGCTCTATTTTGACTCCTCGAGTCTTTCTTACTCTGGGAGAACTAGGAATCTAGTCTCTCTAATTGTTGCTTACGATCCTATGGTGCTTAGTCTTCTGGAAGCGTCCTGACCTAGGTCATCATCTAGTCAACTTAACTCTAATACCCTAGCTCTGTGTAGATTTCCAACGAGGTGTCGGAGATCTCACGTTTTCAACCAACCCTCGACCCCTACAAAGGCCACACTCCCTCAACGCTTCAACCAACTGAACCCTCATGCCATTTGAGAATAACAAAGCACAAAGAGAAGGAAATCCAACCAAAACCTTCTCTTTGGAGTGCGATGCCAGCGAGACAGAGAGATTTGACCCAACGTCGTAACAAACGACACACGCTGCAGAAGTGGCGACCGAAAACTCAGGACACACCACAGTATGCCAAACCACGTCCGTCTTCATGGTATTCAACGTGGTCTTATTGTCGGTAAGGGAGTTTATTTTTCTATAAATAGTTACGTCGTGGTTTGTTGTTTTAGGTTACACGAACACCTCCATTGCCTCGGGTGTGAAAGAGAAGTGGATAGAGACGTAGAAAATGGAAAGAACAAATCACGACTATCAGGTGCTAAATTCAACTTCGACCTTATCAACAGGATTTAAGTTCTATATAACTCTCATCTACTCAATTCAAGTGAAATTAAGTTACAAAATTAGAATTACTAAAGCTATTGAGCGAATATTCAAATAGGTAAAGCCTCGTATAAGTGAGAAAGAACTCAAAGGGAAAAAGCAAACTAAGTTATAGAAAGAGAACGTTGGTTAAGGCCAACCAAGTAAGTGGCTCTACTATCGGCTCGGTCAGAAGACCTGTCTTATGTATGATGACACATGCCCAATAGCACGTGTCATGTATGTTATTATGGTATTAGGATGTGTATTGATAATGCTATGATAATGCGATTTGATATGACATTATGATATGTTACGATGATGTTGCGATGCTATGATGATGTGATGTACTATGTTACTATCATAGGTTAGGATGACGATGTATTATGATGTGATGACATGACATGGTACGATAATACCTCATGTTACGATGATGTACATGTATGAAATGTTATGTTGCATCATGATAAGTTTTTCTAATACACAACCCTTAGATGATGTTATAAATGATGAATGTATGAAGACTTATGCATGCATGTTACCTAAGGTAATATGTGAAGGATGTCTGGGTTGTGTCACATAATGATAAGGACCTCATGCATATTGTATGCTCATTTATTAATCGGGATACTTCCCTTTTATGACTATGATGGACCTAGGGAGTGTGTGAACCCTTGGTGGGCTCACGCTCGCACGTATTGGTTGTGTGTAGGGATCACCTCTATAATGGTTTTAAATGATAGGTCCTTTATCATGATTCAATGTATTTGCATTCCATGACCCCAATAGTACGGTCACGTATTTCTTAAATACTCAAGCCATGTGTTACTTCTATATATCAAGTAAAGGTAAGGCACCTTTGTATGGTTGACGACAACATCGTAATTAAAGACTATGACACATGCATATGATAGTTGCATTTAGTCTCATAGATCTTAGGTTATTATAGGATATTGGTAGGGTTAGGTTTAATGAGCCATTTCTTTCCAATAATTCTTACCATTGATATATACACAAAAACTGTCTATCGACCGCTCATAGATTATCTCCAAATTTTTTTATATTAGTTTGAAAAATTCACGAATATTTTAAAAATGTGTTTATTTTTTTAAAGTTTGAGTATTTTTAAAAGGGTAAGGTTTATGGGTATTTTTTGTTTATTAATTATGCCTAAATAATAATGTGTTAATAAATTAACAAGAGTTAAATAGATCATTTAATAATAATAACAACAACGCAATAATTAATTTTGACA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MADTLLDSGMDEVQKRLMFDDDTLGYNSFTYSQIPSVDLELLDRCILVDENDRVQRSATKVTFPLVWTNTCCSHPLYRESELIEEEALGARNAAQRKLLDELGIPAEDVPVDQFIPILSPVSPCNSMEDALLDAGMDEVQKRRICILVDENDRVVGHESNVFLFNSKYELLIQQRSAKKVTFPLAWTDSCCSHPLYKESDLVEEDALGARKAAQRKLLHELGIPAEDIPVDQIIPVGRMLYKAPSDVKWGEHELDYLLFIVRDVNVNPNPNEVADVKYVNKEELEELVRKVDAGEEGLKLSPWFRLVVDNFLFKWWDHVEKGTLKEAADMKTIHKLT
BLAST of Carg22724 vs. NCBI nr
Match: XP_023520678.1 (isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 411.4 bits (1056), Expect = 3.0e-111 Identity = 205/235 (87.23%), Postives = 209/235 (88.94%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. NCBI nr
Match: XP_023005703.1 (isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 405.6 bits (1041), Expect = 1.6e-109 Identity = 202/235 (85.96%), Postives = 208/235 (88.51%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. NCBI nr
Match: XP_023005712.1 (isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 377.5 bits (968), Expect = 4.8e-101 Identity = 184/235 (78.30%), Postives = 201/235 (85.53%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. NCBI nr
Match: XP_022933729.1 (isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 376.3 bits (965), Expect = 1.1e-100 Identity = 184/235 (78.30%), Postives = 199/235 (84.68%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. NCBI nr
Match: XP_008443691.2 (PREDICTED: isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 4.5e-99 Identity = 183/235 (77.87%), Postives = 198/235 (84.26%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. TAIR10
Match: AT3G02780.1 (isopentenyl pyrophosphate:dimethylallyl pyrophosphate isomerase 2) HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 8.5e-92 Identity = 162/228 (71.05%), Postives = 185/228 (81.14%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. TAIR10
Match: AT5G16440.1 (isopentenyl diphosphate isomerase 1) HSP 1 Score: 329.7 bits (844), Expect = 2.1e-90 Identity = 157/228 (68.86%), Postives = 184/228 (80.70%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. Swiss-Prot
Match: sp|O48964|IDI1_CAMAC (Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I OS=Camptotheca acuminata OX=16922 GN=IPI1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 354.8 bits (909), Expect = 1.1e-96 Identity = 171/234 (73.08%), Postives = 195/234 (83.33%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. Swiss-Prot
Match: sp|O48965|IDI2_CAMAC (Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase II OS=Camptotheca acuminata OX=16922 GN=IPI2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 351.7 bits (901), Expect = 9.2e-96 Identity = 169/235 (71.91%), Postives = 195/235 (82.98%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q39472|IDI1_CLABR (Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I OS=Clarkia breweri OX=36903 GN=IPI1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 341.7 bits (875), Expect = 9.5e-93 Identity = 162/230 (70.43%), Postives = 193/230 (83.91%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q39664|IDI2_CLAXA (Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase II OS=Clarkia xantiana OX=3938 GN=IPI2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 336.3 bits (861), Expect = 4.0e-91 Identity = 164/235 (69.79%), Postives = 187/235 (79.57%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. Swiss-Prot
Match: sp|Q42553|IDI2_ARATH (Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase II, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 1.5e-90 Identity = 162/228 (71.05%), Postives = 185/228 (81.14%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S3B9E9|A0A1S3B9E9_CUCME (isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487224 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 3.0e-99 Identity = 183/235 (77.87%), Postives = 198/235 (84.26%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A0A0M046|A0A0A0M046_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G656460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 4.7e-97 Identity = 180/232 (77.59%), Postives = 194/232 (83.62%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. TrEMBL
Match: tr|K7NBZ8|K7NBZ8_SIRGR (Isopentenyl diphosphate isomerase OS=Siraitia grosvenorii OX=190515 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 4.7e-97 Identity = 184/244 (75.41%), Postives = 200/244 (81.97%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P5C2H3|A0A2P5C2H3_9ROSA (Isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type OS=Trema orientalis OX=63057 GN=TorRG33x02_300320 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 357.8 bits (917), Expect = 2.6e-95 Identity = 176/244 (72.13%), Postives = 202/244 (82.79%), Query Frame = 0
BLAST of Carg22724 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P4HXD2|A0A2P4HXD2_QUESU (Isopentenyl-diphosphate delta-isomerase ii OS=Quercus suber OX=58331 GN=CFP56_32057 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 357.8 bits (917), Expect = 2.6e-95 Identity = 174/229 (75.98%), Postives = 193/229 (84.28%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of silver-seed gourd
Date Performed: 2019-03-07
The following gene(s) are orthologous to this gene: The following gene(s) are paralogous to this gene:
The following block(s) are covering this gene: None |