CSPI02G07350 (gene) Wild cucumber (PI 183967)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGAGAAGTGAGAAAGGAGAATGGAAGAGGAAAGAGAGAGAGGAAAAAGAAAAGAAAATTCACATCGTTAAAAAGATACTAACTACGATCATTTTTCGGTTAATAAACTAAGAGTGAAGTTAACTAAAGACCACCAAATAGACACCAAATAGCTAAGAATTTCGCTCGCATCTCTATGCTCTACTACCCTTCGTCTCCAACGCAAAACTCACACCACCCACCTTCTTCCCGTTTCTTCTACTGACCAACACCATCCGTCAGACCTACGCCGGTCGCCGCCGCGCCTCAATCTCGCTGCAGCCTCGCCACCGTCAGTTCCAAAGCTCTCTGCCTTTCATATACTTTTTTGTCTTTTTTTTTTTTCCCTCTCTCTTTCTGAAACCTCCTTTAGTTTTAATTTAAATACTTAGGTAGCTAGTTAAGTAATATGTCATCTTCATCCTCAAGCCAAAGTCAAGTCTCAAATCATTCCATATAAATTAAACTTCCTCCATTGTTGAAGATGATTCAAAACCCTTTTGGCGAATCGTTCTTAAACAAAGTGTATTTTATGCTTTGGTGGAATACAGTTTATGTTTATATTAAATTTATATATACAAGAAAATGTATAAAAAATGACGTATCCTCGATATATTCTTATTTTAGTTCTTAATCGTTGTGTCTGATCGTATTTGTATAGCATATGTTTATCCATGTACGTGCTTCTTAAGATATAGCTATGGAATAATTTTTGTTTTATTCATTTTTTTTGTCCGACCACGAATACAGATTTTCTCTTTGGGTGGAAAGCCCCCTGAAAAAGCGATTGAAGGAGAAACAAATTTTCCTTCATTTCTACCAGTGCCGGAAGCTACCTAAACCCCAAAGAACAAGCTGAGAAATTTCTTTCGGTAGGGTGATCGAAGATGAAGGTGGTGGCATTGGTGAGCGGTGGCAAAGACAGTTGCTTTGCCATGATGAAGTCTATTCAATATGGCCATGAGGTTTTGTCTTCTCTTTTGATTCCCCATGTTTACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTGTCTGGTTTCGAGGACATTGTTGATTGGCTGCTATGTTTACTTCTTTTTTCAATATATGTTTGTTTGATTTTTAATTTCTTGTAAACTGATGCTTGTGCTTGGTTGTGTTGTTCTATGTTTGGTCTAGATTGTAGCGTTAGCTAATTTGATGCCTGCCGATGATTCTGTGGATGAGCTTGATAGTTACATGTATCAAACTGTAAGTCTTCCTGCCTTCTTCCTTATGCAAAATATTGTACACTCGTTCACTTAAATTTTTGAAGTCAATGGTTGATTTGGGTCGTTGTCCTTACTCATGAAAGTGGTTACTTTTTTGGTGCATCTTGCATTCCACTAATGTGAAAGTATATTGTATTTTTGTCGTTAGTATGAAGCGACATTATTTTATCTACCTCAAGTATAACAGTTAACTCAGTCCTTTGAGTTGAGCCTTGAGTTACCTCGCTCCTTTGGGTTTCTATAATCTATATATCTTTTCATTTCAAAGCTAATTGAACACCTGTAATCCATGATTGCTAATTTGGGTTATTGGCTATCAATCTTCAGGTTGGACATCAAATTATTATTAGCTACGCAGAATGCATGGGAATTCCATTGTTTAGAAGGCGAATTCAAGGATCCACAAGGCAAGCCTATTAAACAAAATAATTTATTTGATAAAAAAGATAAATTTTGGTGCGTGCGTTTTCTTTTTTGAATAAGAAACATGTCAATTTTCATTAAAAAGTCAGGAAAAAGCATTGAAAATTACGTTTTGGAGAATCTTGTCGGTCCACTGTGGAGGAAGTGGTATTTCATCACCATCTTTTTCTGGCTGGGGGAAGCTATTCGACAAGGGCTTATTGTTATTTATTTATTTAATAAAATTATTATTGCAATTTTACAGAACATTTTGCCTGAGAATTTTAGGAGTGGTTATAGTGATGTGGATACTTGAAGACTTGTTTTTGTCCTTGGTTAGGTTTAACGTTTTCATTTGAGTTTTGGTAACATAGGAGTTAGGTTTTTAGTACTTTTCCTTTGTCAGGAGCTCATTTTGTTATAGCTAGTCGGTTCTTGTTTTTTTCCACTGAATCTCATTTTCCTGGGCTTCCATTTTCTGTATTGATATTCTGTACTCCTATTTAATTGTATGGAAGCTAGTTTTTCATTGATGTTTGGCTGGCAGCCCTAGTCTCCCTTCTCTTTTTCCCACTCCTTGGGAGTTTGTATCATTGAACATAATTGTTTCTTTTTCATTAATCATAAAGTTTGTATGTTCATACAGGAAAGATATATGCATTAGGTTGCCCTTCTTTCTTATGGTTATTATTTTCTGGATTATTCTAGGCATCAGAAGCTTAACTATAGAATAACTCCAGGTGATGAAGTGGAAGATATGTATATTTTGTTAAATGAAGTGAAGAAGCAATTACCTAGTGTCATGGCAGTATCCTCTGGTGCCATTGCATCTGATTATCAAAGATTGCGGGTAGAGAGTGTTTGTTCAAGGCTAGGACTTGTTTCTTTAGCATATTTGTGGAAACAGGATCAATCTTTGCTTCTACACGAAATGGTATATAACATTTATATGAGCTATGAAATGGACATGCAACATTTGGATTCAACTCATTTAAGTCTTCCCCTCTTCTTTTGAACTAGATAAACAATGGAATTTTGGCCATCACGGTGAAGGTATAGTACGATTAATTCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTTGCATTAAATTACACATGCACGGTCTGTCTAATTAGTCGTAAAGATTTTTCCATCATTAACCTATTTTGTGCTCTGGCTAGATGTGATAGAAAACTTAATTCATTTTGTAAAGATAATGGATGTTTTAGTATGTTTATCTTTTTTTAACATGGATAATGTTCGAAGGTTCAGAGCAATATTTTATACTAAAAGTTTGAATTGTGCTTTCACTATTTTATTCTAACATTTTTAATTGTGCTTTATTGTATCTTATTTTTATTTTTATCCTTTTTATCACTTAAAAATTTGAAGTGTGTAGGGATATGCATCCGTTTGCAGATGCCCAGAATTAATTTCCGAACCAGTAGTTAGACATCTTTGTTCTCCCCTGCCTATTTGACCATCGAAGTTCTTTTTGTGTGAATGGTTGATATTTGTATGGGGGCATTGAAAAGATTTAAAGATGGAGAAGAGAGTTAGGAGCTCTCCTACCCTCCCTATCTCAACATATTGGAATATTAATCAAATGTTTGCCAACCTCCCCGAGCCTCCTAACCGGCACCACTTAAACCTCTTTCGGTACCATTAGAAAATTTACTTCTTTCCAACCATTTCACCATTTCAAACCCTAATTGTCCCGTATTATATTACACAATTTTTAGGATATACAAGGGAAGAGCTTACCGAGCAGGGACTTTGCATTGCAATATAAAAGAGAGGATATCTTGAGATAGCCCTTTGAGAGCCTTCTCATAATTATCATTTCCAAAAATTATGCTTTTGCGCCAAACTTCAAAATGATTTTGTGCTTTGCAAAATGATTAAGCTGTGATGAAATAGCATTGTTAGTGGGTACCTCCTAGACATGCAACAACAACTCTTTAACACATCCCCAAATAGAGATTGTGAACACCTAAATTCAAGAGGGGTACATGAATGCATCGAGACACATCATCATCTAAATAAGAGGTATCTTGAGAATATGAAAGTATAGTTAAGATGGACTTTAAAGAATTGAAAGTTACTATCTATACTAATAAGATGCATATTCCTTTTTAGTGGCCCAATCATAGGAATTCCAAAGTTAAATAGGCTTAGTGTCACGAATGGTGTAGTGGTGTATGCGCATAACGGGTGTGCGGGAGGTATGCGGAAGTGTGCATTGGTTTGCATGTGTGTAAAGATACTACAGATGTATCTTAAGGTATTGAATTTCCTCAAAAATTACAAAATGGAAAATATGAAATTACTCACAGAAACTTGATCACAGATGATCAATCAGCCAAAACACAAAAAAAAAAAAAAACTTACTAAAGTAATTTCTAAACCAGAAAACGCAACAATGAACAATGATCAACAAAATACAATGAAAAACGAAGATCAAACAATAGAACCTGGACCCTCCGCTTTCCTTCCCACGCAAGGAGGATTGCAGCCTCTTCCCTTCTCCAGAAAATATCTTTGATACCCCCCTCCTTTCTCTTTCATCCTCTTTTATTCTATTTTGCTAACTAACTACCGATCCCCACTGAATGGTCCCCAACTTCCTTCCTCTCCTAAACTCCCACATGTGGCTCTATTATTTTCTTTATTTCTTCTGCTGTATTTAAACAATATTTGGGGGCCTAGCAGTGTGGTTGGCACTCATGGGCCCGTGGCTTGTGCGGCTTCAGGGCAAGCCTTGACCAGCCTTTAACTACTTGGTCCAAAGGTAAGCAAGCACTCATAGGTTAGTCCCTCACGTAAATGGCACAATTCCTAGAATGGGATGATCAGCTAAGGCTTCGCACGTTTGAGAGTTTAAGAAGAAGATAATTGTGGAAATATCTTTATTGATATGAAAACAACAAACACTACATAGGAGAGTTACACTTACTCAAAACTTCACGTGTGGAAATGAATGTAAGAATGTGTGTCCCTTGACATCTCTAAAGGTACATTATATAGTGAGGGAAGGAGTTACTTTAGGCTAAAGAAAAGGAAGGAGTGGCTTAGTGGATGGTTATAGCTTTCCACGATTTATGCTTAGCCACTCTTTCATCCACTACTCTACGGTCCCTACCTTTAAGGCCATTCAAAGGGATAGTGGCCCTTGTCCGACCCCTAGAACTAACATTGAGCACTACAAGAGGTTAGCTCCAAATCCATTGACCACAAAAACTATTGTCTCGCTTGCTACCCTACGTCTGCTACATGCTTGGAGGTTGGCACAACTGCCTTAGTTTCACCTGTTGTGCTGCCCCTCATGCCTTCCTATA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BLAST of CSPI02G07350 vs. Swiss-Prot
Match: DPH6_SCHPO (Diphthine--ammonia ligase OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=mug71 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 311.6 bits (797), Expect = 2.3e-83 Identity = 194/512 (37.89%), Postives = 281/512 (54.88%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. Swiss-Prot
Match: DPH6_DANRE (Diphthine--ammonia ligase OS=Danio rerio GN=dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 294.3 bits (752), Expect = 3.8e-78 Identity = 148/257 (57.59%), Postives = 188/257 (73.15%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. Swiss-Prot
Match: DPH6_HUMAN (Diphthine--ammonia ligase OS=Homo sapiens GN=DPH6 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 280.0 bits (715), Expect = 7.3e-74 Identity = 144/255 (56.47%), Postives = 186/255 (72.94%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. Swiss-Prot
Match: DPH6_BOVIN (Diphthine--ammonia ligase OS=Bos taurus GN=DPH6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 278.1 bits (710), Expect = 2.8e-73 Identity = 147/266 (55.26%), Postives = 188/266 (70.68%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. Swiss-Prot
Match: DPH6_RAT (Diphthine--ammonia ligase OS=Rattus norvegicus GN=Dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 275.4 bits (703), Expect = 1.8e-72 Identity = 145/255 (56.86%), Postives = 181/255 (70.98%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LKJ7_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G075360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1481.1 bits (3833), Expect = 0.0e+00 Identity = 730/735 (99.32%), Postives = 733/735 (99.73%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. TrEMBL
Match: A0A067E2C5_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g004613mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 995.0 bits (2571), Expect = 5.0e-287 Identity = 500/748 (66.84%), Postives = 597/748 (79.81%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. TrEMBL
Match: B9S7L7_RICCO (Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis GN=RCOM_0609580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 947.6 bits (2448), Expect = 9.1e-273 Identity = 473/747 (63.32%), Postives = 578/747 (77.38%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. TrEMBL
Match: A0A067JIG5_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_23554 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 945.7 bits (2443), Expect = 3.5e-272 Identity = 481/753 (63.88%), Postives = 576/753 (76.49%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2TMJ6_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_007G275500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 940.3 bits (2429), Expect = 1.5e-270 Identity = 469/748 (62.70%), Postives = 575/748 (76.87%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. TAIR10
Match: AT3G04480.1 (AT3G04480.1 endoribonucleases) HSP 1 Score: 880.9 bits (2275), Expect = 5.3e-256 Identity = 444/741 (59.92%), Postives = 559/741 (75.44%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. NCBI nr
Match: gi|778667915|ref|XP_004152819.2| (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1481.1 bits (3833), Expect = 0.0e+00 Identity = 730/735 (99.32%), Postives = 733/735 (99.73%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. NCBI nr
Match: gi|778667919|ref|XP_011649008.1| (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1466.4 bits (3795), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/735 (98.78%), Postives = 729/735 (99.18%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. NCBI nr
Match: gi|659082418|ref|XP_008441829.1| (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1448.7 bits (3749), Expect = 0.0e+00 Identity = 708/734 (96.46%), Postives = 725/734 (98.77%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. NCBI nr
Match: gi|659082420|ref|XP_008441831.1| (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1434.1 bits (3711), Expect = 0.0e+00 Identity = 704/734 (95.91%), Postives = 721/734 (98.23%), Query Frame = 1
BLAST of CSPI02G07350 vs. NCBI nr
Match: gi|778667923|ref|XP_011649009.1| (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1306.6 bits (3380), Expect = 0.0e+00 Identity = 644/648 (99.38%), Postives = 646/648 (99.69%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (PI183967)
Date Performed: 2017-01-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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