Cla97C03G062010 (gene) Watermelon (97103) v2

NameCla97C03G062010
Typegene
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr03 : 22363313 .. 22372360 (+)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCCCTTCCTTTACACTTGAAACAAGTTCCTGTGCCAATCAGACAACGCCCCTGGTGGCGCTTCCCACAGATCTTACATACGGGCAAGTCCCTCCAGACTCCTCCTGCCTCAGTGGCCAATTGCTTATAATGACTGAAGGGTCTATCTGAATGCGAACCCTTTCGCGGGGCTCGGTTGCCTTTTGATCCGCTTTTCGCTTCTGACCCACCAAGATCCCTGTCATCAAAGACCTCCGGTACTCCTCACCTTCCCAGGCATCTGCGTCGATTCTGACTGTTGCTCGAAGTGCTGCGTCATAAGTCTTGGGGTCCTGAGAATAGACCAAACCTCGCAACCCGACCTTCAGGCCCTGAACAAACCTCTACACCCTGGTTTTCTAAGTGGCCACCATCTTTGGTTCAAAATGGGACAGCTTGTCGAATTCTTCCCCGTACTCTTCCACTATCATAGCCCCTTGCTTCAGGCTCAGGAACTCCGCCTGCTTGTTGAACCGTGTATTCGCGAAAAAGTACTTCTCATAAAACCACTCCTTGAACTGGTCCCAAGTCGCTAGGCCACCTCAAGTGTCTATCATTCTCTTGGCTGAGCACCACCATATCTCAGCATTATCTGTCAGCATAAAAACGGCACATTGGAGCCTCTGTTCCTCTGGGCATCTCATGTAACGAAAAATTGTCTCAATCGAGGACAACCACATTTCTACTTTCGTAGGGTCTTTCAGCGACCCATCGAAGGTACGAGGGTTAAATTTTTGGAAGTCCCTCAGGTGCTTAGCTTTTATTGACCAATCATGAGCATTCTGGTTTTGGGGTTGAGGCGGAGGTATTGCTGCTTGTGGGGTTGGTACTTGCTGGGGTCGTGCAAATTGAGCAAAACGCTCATCCATCATATCGTTCATCCCGCCTAATACCGCGGTCGTGACTACTTCTCCAATTGCCGCTGTCAGAGCTGTAAACTCAGATGTGACGGCAGAAGGATTCACTATTGGGTTAGTCTCAGCCGTGTTCCCTACTCGACTCCTTGCCTGAGTCGTCTTGGACCTCGGGGCCCTGCTCCTTCAATGACACTGCGGGGTCCTGAAGCCCACCCTTTTCCTTTCTCTTTCCTTTGTCCTTCGGTGCCACAACCTACCATACACACCATCAGTCACGTTATGACCCCTTCAAGAGAGACTTGACGATTAAACCCATAAACCCATCTAAAATTTTTTTGACACATTTAAATACATATGCAGGCATAGGTTTTTGTTATATATATGTATGGAGAGCATACCTAGCGATGACGAGGAATTCGTTACTACCATGGGACATTCTTGACTAATCTAATAAGTTAGTCTACAGAACCTATAACTGAGGCTTTGATACCAACTGTAACAACCTGACCCTTTTGTAACTAACAGGACACTAAGTTATGCATGACCATTTAGTAAATGCATTGGAACCTAAGAGACACAGCGTTACACACTTTAAATAAACTTGGTCAAGTTTGTAAAACGACTTGAATCCTGATAGTTCATTAAATCAAACATAGAGGAGTAAAAAATGCTTTAGCGGGGTACCCCTTAAACAGTTAGGCAAACCTCAAGAAAACAAAACCGAACATAAAAGTACCAAATCAAATAATCAAACGGTCAAATGAATAACAAATACCGCTACCCTACAAGTCCAATACGCTATACCCTAGGCTAAGCTGTGGAAGCGATGACGACGATCCCATGGTACGATCACAGATTCCCTCGGTCATACGTCTAGCCATCCCGTTCTATACCTGGAAAAAAAAACATAGGAAAGGGTGAGTAGTCATACTCAGTAAGAGACCCACTACTAGGTCTAGTTGTTATCCTTTTTTTTTATCGTGTGCGCCCATGTACCCGGCATAGGCATAAGCATAGGAAGCGACCCGAGGGTACGCAGTGATCACATTTGTAGACATAAACATAGGTGGTGATCCCAAGGGAAACCCATCGTAGGCACAGTACGTTAGGGGTACAGGGCACGACAAGTAGGATAACCTGCAGTAACATGTCATGGCATAACTAGTTCATCGTGGAGATTCACAATATCACAGGCACGTAAGCATAACCACAACACATACAAGCTACATGTCTTTGCATACCCGAAATAGTTTAAGTAATAATCAACCGAGGCAATAGTTACACATCGACACAATAAATAATCAGTAACATAACTGGGCATTAGGCGTCACTAGAGCCCGGTAGTAAGTCCCTTACCTGTGAGAGCGAGATTGCGGGACAGCAAGACAGCGAGACAGCGAGACTGAGCAAGACAGCGAGACTCAGCGAGATAGCGAGACTGACTGTGCAAAGTCGCGACTTCCCTACACTGCGGCAATGTGCTATGCAGGCTGTGACGACGCGGCGCGAAGAAGGCTGAGATGACGCGGCGATGAAGACTGTGATGATGTACCGCAATGAGGGCTGTGATGATGCGGCGCGAGGAGGGTTGAGACGCTGCGGCGCAATGAGAACTGGGACAATGCGGCGATGAGGACTGTGATGACGCGGCAATGAGGACTGATGATGCGACAATGAAGGCTACGATGAAGCGGCGATGAGGACTGCGATGATGGCGATGAGGACTGCGATGATGGCGGCTGTGTGACGAAGGGGTGCAGAAGACGGCTGACGAAGAGGTGATCGAGAGAGAGATTTGACATTTCTCTTCTTCCCCTTTTTTGTTTTACCTATTCACACAACCCAGGTCAATAAATAACTCACCAGAAAATCTTTCCCAAACCGATCCCTGTTTCCTTTTAATGACCAAAAACCTAATCTCCCTTAATGCTCCCCTTCGCCTAAATATTTATTTAATTATTATTATTTTTTTTCATTTTATTTTTTTTTCACCTTTCAACCTCCTCCAAAAGCATTAATGAAGAATAGTGCACAATAAAGCGGGAAGGAGGGTATATATTTACCTGAAATTTCGGGTCGTTACACGATCAAATTGAGGTTGGAAAAGCTTATAAACCTCGAGGATCATACTCGGACTGTGAGTGATACTTGTTTTCTTGAAAAGGATTTTATTTATAATTTCTAGCCATGAGTTCTTATGAAATGTGATCTCTTGATGATTTGCTAAATGTCGAGCATGGTTTACTGTCTAATGCTTGATTTTATGGCAAGAAGAGCATGTTTTATATGTTTTCTCATGATTAAAGAAGCATGTTTAAATAATGTCAGTTACTGAGAAATGTTTTAGTTTTTTTTTCTATGAAATGTTTTACGATGTACTGTTGGTTCAAAGTATACATGTTTTCTTAAAATGTTTCTGAAGGGTCCCAATGTTGAAGGACGTTGAGAAGGCATATGAGTAACCCTGAGACATGAAGGAACTCAATGTTGAAGGACGTTGAGAAGACATTTTAGTATCCTAGGGACCCAATACTGAAGGACATGGAAAAGGTAATTGGGCAGCCCGAGATAGTTGCTATATGCACATAGCGAGAATTGACGTTGTTGTGTTAAGATTACTCCACACTAGCTAAGGTTATTCGATGTTGGGTGTGTTGAGATTACTCCACCCCAACTAAAGTTTGTTTTCGACTTTGAGTCTGTTGAGCTTGCTCCGCCTTAACTGATAACTTGTAGAAATACAAGTTATTATAGTCACTATTTGAATTAATTAGATTAACTTTAGAGCTAAATGCATGATTTTGGTAGTTGAATTATGTAAAATATATTACCATGCGTTGGCACTATTTACAAAAGAAAATTCCTGAAAAATTATGAGCTTTTCTGTTCTTAACGCAGGATTAAGAAGAAAAGAAGCACAAATAACCCAAATACTAGAGACGAAGCTGCTGTGAGAACAAGTGGAAACCCATGCATTGAGACTATGCGTCGAGAAAAGTAGATACAGACGTCTGGGCAAAAGCTGTCATGTCAATATGCAAAAGTATAACGCGCTATCAGAATATGGCAGAACAAATGGGCCGACGATGTGAAAAGTCTGCGCAGCAGGGCATGGAATTTAATGTAAAGGTGTCAGGTCATCATGAGTTTCAACTTTTCGACGCCTATAAATAGCCCAAAGCTTCTCCATTCAAAAGGAGGAGAGAAACGAGTTCAAGAGGCGAAAGCTCTGCACAATTTCTTCCTCACCATAACCAGCCTCCATTTCGAGCTCTTCTAAGAGAAGGATTCTGAGAACTTTCAGAGTCGTCTCCCAGTGAGTGAGAACCTTCACCCTATGAAATTTATGTATCAGATAGCAACCATCTCAAGCCTCCATGAAGCAAGACGTTGCCAGTGGCGGCTTGACGTCTTCCATTTCCATTTTATCTCCATTTTCCTCCTTCTTACTTATGTTTTGTTAATGACATTCGAGAGAATGGTTTATTTCCTTAATATAAGTTTGATTGACGATTATCTTCCATCTATTTCCATATTAAATACCTTACACCATGTTGTTTGAATGCTAAATGAGTTAGATGTAGAAGTTAGTTTTTCTTAAGCAATATTAAGTATATTACATCTTGATTAATGCATATTATTAGCTTGCATAACTTTGTCTGACAAACAAAAGTAGTAAACACGACTGTCTAGCTTGAGAGAGTGGATGGTTAATCTTTAGCATTTATCGAGATTAGATGAGGTGCAGAGATGTAGTTTATCTTTTGCCAACGCAAACTTACCATGCGTCTTAGAGATAAGATTAATGTGGCGTCGATAACATCGAAAGATGGATTCACAAATTAAGTTTGTAGGCATGTAATTATACTTGGATATGCTTAAGTAACCAACTAGCTCCTGTGTTAACTCTACTTTTATCGCATGGTTCCATTCATTCTCAACGCATGCTATCTGACTAAATGACATTTGACTAACCATCACCGCGTCCATCTCATTGTTAGTTGTAGGAAATTTTATTCATTTTTTATGTATAGTTTTAGACACATACAACCAACACATGCACATATTACATGTACAGTTCACCGCATAGTCATGCATCTATTCTCAACGCCTAGTTATTACA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mRNA sequence

ATGGCCCTTCCTTTACACTTGAAACAAGTTCCTGTGCCAATCAGACAACGCCCCTGGTGGCGCTTCCCACAGATCTTACATACGGGCAACTGGAGTTACTACCAGTTTATTCTGTATTGTATAACTGACCACCGATTACCGATTCCGATTGAATGTCTTAAAGCGACCGCTTTCTTCAATAGAACTGTGCTTGACGATAGAAGCAAACGAGTTGGCTATGATAGATTGGGCATGTTCTCGCTTACGACTTGGGAGAGTCTGGGACATTCCCTCATGATGGAACGGCTACCTTCTTTGTGTTGTCTACTCAAGGAAAGAGCGGGATACTTAGCTGAAAGGGTGAACAAGGTCGAGCGCGTTCAAACGTTGCTCCAGAGTACCCTCTTGGGCAGCAGTCGAAGAATAGCTAGTGCGCGCATCCCTTGGCAATTTCGCTTTCAATCTGCTAGCTCGACTTCCTGTCCAGTCTGCCTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCCTTCCTTTACACTTGAAACAAGTTCCTGTGCCAATCAGACAACGCCCCTGGTGGCGCTTCCCACAGATCTTACATACGGGCAACTGGAGTTACTACCAGTTTATTCTGTATTGTATAACTGACCACCGATTACCGATTCCGATTGAATGTCTTAAAGCGACCGCTTTCTTCAATAGAACTGTGCTTGACGATAGAAGCAAACGAGTTGGCTATGATAGATTGGGCATGTTCTCGCTTACGACTTGGGAGAGTCTGGGACATTCCCTCATGATGGAACGGCTACCTTCTTTGTGTTGTCTACTCAAGGAAAGAGCGGGATACTTAGCTGAAAGGGTGAACAAGGTCGAGCGCGTTCAAACGTTGCTCCAGAGTACCCTCTTGGGCAGCAGTCGAAGAATAGCTAGTGCGCGCATCCCTTGGCAATTTCGCTTTCAATCTGCTAGCTCGACTTCCTGTCCAGTCTGCCTTTGA

Protein sequence

MALPLHLKQVPVPIRQRPWWRFPQILHTGNWSYYQFILYCITDHRLPIPIECLKATAFFNRTVLDDRSKRVGYDRLGMFSLTTWESLGHSLMMERLPSLCCLLKERAGYLAERVNKVERVQTLLQSTLLGSSRRIASARIPWQFRFQSASSTSCPVCL
BLAST of Cla97C03G062010 vs. NCBI nr
Match: KUM47620.1 (hypothetical protein ABT39_MTgene5806 (mitochondrion) [Picea glauca])

HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 6.1e-14
Identity = 42/56 (75.00%), Postives = 47/56 (83.93%), Query Frame = 0

Query: 78  MFSLTTWESLGHSLMMERLPSLCCLLKERAGYLAERVNKVERVQTLLQSTLLGSSR 134
           M SLTTW+ +GHS+M E LP LCCLLK RAGYLAERV+K ERVQTL QS LLGS+R
Sbjct: 1   MLSLTTWDGMGHSIMREWLPGLCCLLKGRAGYLAERVDKAERVQTLPQSALLGSNR 56

BLAST of Cla97C03G062010 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A101LYE4|A0A101LYE4_PICGL (Uncharacterized protein OS=Picea glauca OX=3330 GN=ABT39_MTgene5806 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 4.0e-14
Identity = 42/56 (75.00%), Postives = 47/56 (83.93%), Query Frame = 0

Query: 78  MFSLTTWESLGHSLMMERLPSLCCLLKERAGYLAERVNKVERVQTLLQSTLLGSSR 134
           M SLTTW+ +GHS+M E LP LCCLLK RAGYLAERV+K ERVQTL QS LLGS+R
Sbjct: 1   MLSLTTWDGMGHSIMREWLPGLCCLLKGRAGYLAERVDKAERVQTLPQSALLGSNR 56

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
KUM47620.16.1e-1475.00hypothetical protein ABT39_MTgene5806 (mitochondrion) [Picea glauca][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
tr|A0A101LYE4|A0A101LYE4_PICGL4.0e-1475.00Uncharacterized protein OS=Picea glauca OX=3330 GN=ABT39_MTgene5806 PE=4 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003723 RNA binding

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cla97C03G062010.1Cla97C03G062010.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
Cla97C03G062010Cla001024Watermelon (97103) v1wmwmbB128
Cla97C03G062010ClCG03G011740Watermelon (Charleston Gray)wcgwmbB186
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None