Cp4.1LG11g06450 (gene) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNTTTCAATCAGGGTTTAAGGAAATTCGTGTCTGATTTGGAAGATCATTTTGTGATTGGAGAAAAGTCGAGTTTAGAAGCTGGCGCTATTGGACCACTGAGTGCATTTGGACCCATAAATAGCTACTGAAATCTACCCACGTAGCGGACTGCATCATTCTAATCAGGCAGGGCTCCCTCTTCTTTCCATTTGTTGAAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAAAAATCGAAGATGTTTAAGTTCTTGAAGGGAGTGGTGGGTGGATCTGGGACTGGGCTCAAAGATCTACCCTACAACATCGGCGATCCGTACCCATCAGCCTGGGGCTCATGGACTCACTTTCGGGGTACCTCCAAGGTATGTTTTAACCGTCAAGTAGTCGCTTGGGTAATGAACATGATCTAACTTTGGCATTGCGGATTGCTGAATTGTGGTTTGTATAATTCTAAGTGATTTGTACTGCATTTTAGAATTGACGAGCCTTGATCCTGTAGTTGGGAAATTGCCCATCCTTTACTTAGTTGGCTTCTTACATGTTTTGGTCGGTGGTGTGTGGCAGCCAATTTATGGGGTGAATTTGAATTGCTTTACATTTGACAACTTTGAGTTTGTTGTGTTTTGGCTTTTACTGCCCAACTTTTCCCACCTTTGTTCCTTTCGAAGTAAGGAAATGAACTCTCAAAAATTTTGTACGTTGAGATGAAACAATGCTAGCATTACCTAATGTTACAAAGCTCTTCTTCTTCTTCTTCCCTTTTTTCTTCATGTTTGGTAACTGAAACACGTTAGTTAATTACAAAGTGCCCTATAATTATTTCCTATACTATAATTACTTCCTATATAAGAAATTTTTAAATAAGACGGTCTTGGTAAAATAATGACCTACTGTTGGTGGTGGATAGCTTCTATCAGATCCGAACATTAAGCCTTTTAGAGAAGGGAGTGGATAGTGGGTATGAACTTATTTGAATAGAATTTGTTCTATAGGTTATACAATTGTGTCTTTTAAGTTCTAAAAGTTATAAGAAGAAAGTAATGAGTTCTTATGGAGGTTCTCATATTTTTGTGACAACGCGGAGATTTTCAAGTAGTAGCTTTAGGATTGTTGAGGTCAGACAAATTTGAAACCATGTGAACGATTGCTTGTTGGGCATTGTCTAAGCTCTAGATGTGTTCTTCCATTCGGGCAACAAAGCCCGTCAGCTATCTCTATGCTCGAAGCCACCAGCAGTTGTGGCTCTGTCTTCTAGGACTTCGACCCTAGTCATTAATTCGTGGATAGGCATTGCCTCAAGGCGACCTGCCATCTCATCAATGCTGTCGGCTTTAGTGGCAATCTCATTCATGCGAGAATCCAAAAGCCCCATTCGATCAAGAACTTCACTCATGCAGAGTAATTGATCTTCGATTCCAGCTAATCGGTTAGCTTGAGATTTGCCCAATTGTTTTGCAGCGGACATGGTTGTGTACTACTTTTCAATGACCCGACTCGGCTTTGATACCACTTGTCACAATCCCACTCTTGCAGTAGTGGGACAACGATTGTGCAACACTTGTTCTAACCCAGTGAACAAGTCAGCCGTGAGAAATTTGGACTTCGCGGCCAACGTTGGCGTATACTCGAACCTTGAGTCACGTTTGAGATAAATGTTTCGGAAAACGTGAGCGAGGAAATATGTTGAAAACAATTTGAAAGAAAGCAATATTATAGCTAAAAGCGTTTAGGCAACAACAACGACTTTGATAGCATATAACCCGGGTAGCAGGAAGAGACAACTAGTCATATCCCCCTATAGTACATTTTATGGCATTTTAGCTCTGACAGGTGTAGACATGATTTTGGTGAATGGTCATACACCCCCATATTGACACAACATGAAATAGTAAAGACCTATCTAAGATGAAAGTATGTAAAAGGGGTTTAGAACAGGCATATGGCCATGGACAACACGTCCTAGACAAGCATGACCGGAACATCTGACATGTGGTCATAGACAACATGCCTTGGACAAGCATGACCGTGACACATGACAACCTCCAACCATGCTTGCTATCAAGTTAGATGTGAGCCAATAGCTGCTTGGGAACTACAAACCTGCTTTTCTTAGGATTGGGAGCAGGGAGTTTTTGCTGAGTTTCAATGAGAAATCTTGAGGAAGTTTCATGATAAAAAGGTAGAAAAGAACAATCTTTGGGGTAAGGTGCTTATTTTTAATTTTATGGTGGTCAAAGAGGGTTAACTTTTTAGATTTTGGGCTTACATTTGCTTCCATGCATATTGAATGGGGAACTTTTTAGTCTTTTTTTTAGTTAGAGGATTTCTTATCCTTTTGCTTGCAATTATTCGTTTTATATCAATTTTTTGTCCAAAAAGAGATTTGCTGTATTCTCATATTCTCCTCTCTAATAGGCATTCATTCTATAAATATTAGAGATCGTTTGGTACCTGGTTTATATGACATCTATAGAGATTATATTTGTATCTACTTTTGCCTTTTTTTCCCCCTTTTGTTCAATTGAAAGCTCTTGCTTGTGGTGTATGTTGGACGTTTTCCTTGTCAAGCAGTTAGCTGCTAAATCTGGTTGTTGCATATAGGATTTCAGTCCCTGAAGTCTAGATTACAGAAATGTTTGGGCTTCTATGTTCGCCTTTTATATTTTATGTATATTTTATGTCAGCTCTATAATCTTCTGACATTACTATAAACTTCTAAAATTTTTGTATTAGGTGAAATTGATGTTAGAATTGTTTCACTTTCAGGATGATGGATCTCCAGTCTCTATATTTTCGCTTTCAGGGAGTAATGCACAGGATGGACATTTGGCTGCAGGTCGCAACGGTGTGAAACGGCTGCGAACTGTAAGCTGCCAACGACTATTGTTATGGATCTTATGCATACAAATGAGATAATTTTTGGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTTATTTTTATGAAAAGCTAAGCTTGTATTGAAATCAAAGAAAAGAATACAAGGGGAATTAAAAAACCCACCCCCAAGAGGAACTCAATTAACACAAATGAGATTATTTTGTGTGTATTCATAATTTTGACTACTGTCGTGCCATTTCAACTCTAGTTTGTGTGGATTTTGATGTATTTTTAATTGATAATGTATTCTATACCAAAAATGACATGCGATTTATATTCTGAGGATTGATAACTTTTCTTGGTTAATCCATTAAATCTACTATGCATTTTTTCTAGACTATCTGTCGGCATATTGATATTCCATTGACATTAATAATCTTATCTACAATTTTATTCAGGTTAGGCATCCAAATATTTTATCCTTTCTTCACAGTACTGAGGCTGAAACTACTGACGGTTCTGCTTCCAAGGTTACGATTTATATGGTTACAGAGCCTGTTATGCCATTGTCTGAAAAGATCAAGGAATTGGGTTTAGAAGGTACCCAAAGGTATAAGCCAAATCCAACCAGAAGCTTTTTTCCAATTTTGGTTTTTGCATTTTTTGTTATTGCTGGTTACATGTTTTTTAGTACTGTCGTGTCATTCATTTTTCAGAAATACATTGTTTTATGTAACATGATAATGAAAGAGCCAAAGAGTTTTGTCTCGTGCTTCTAAAATGATCTGCCATTAATTTTATGCACTGGTAACGGATGCATTATATAGTTGTAGACTTATAAGAAGTTTAAAATGTGAAAAAGATGGGCATTTTTCATATCATGAATTACATCATTTGCGGAAATGTTTTTTCTATTTGTCATCATCAAAATGAGATTGCCTAATTCTTGCTCAAGGAGCCCTCTGAGATCTCTATTGGAGGATGGGAAGTCTTGGGGCATGTTTGAAAGTGATTTTAGAAGTGGTGATCTTAGTGAAAACGATTTGTTTATAAGTAGTTTATTAAAGGTGTTTTTATATAATCATTTAAACGATCAGTTTTACACTTTTGAAGACAACTTTCATTGCATGAAAAATGATTTTTAATGATTAAATCAATGATTGATTGATGACATGTTTGACAGTCATTTTGAACATGACAAAAGTGATCTTAACCATTTCAAAATCACTCCCAAGCATGCCTGTCATTTCACTCTCTCCTCACCTCCTCCCTCCCCCGCTCGTTTGTCTCCCTCCAAATCTGGAACTTTTGGGATTTGAAAAAAGTTCTAGATTTGAAACTTTCGAATCTCAAAGGAGGGAGGCAAATTTTTTGTATAAAATTTCTAGATGTAACAGAAGTTTCATATCTGTAACTTTTAGATTTATAAGGAGAAAGGCCAATGAGAGGAATGTGAGGAGTAAAGAGAGGCGATAGTGGCGTGGTGGTTGACAGATGTTGGCAACACAGCTCTTGGAGTACTTCGGCAATGTTGTGGTAGTAATAGTTGGCATAGTGTGATGGTTGGTATCAGTGGCAGACAGTGAACACCAGACGAAAAAAAGGAGAGGGAGAAAAGAGAAGGAAGGAGAAAGGGAGGGAGGGAGGGGAAGAGAGAGAAAATGCTTCTTTTAGAAAAAAAGAAAAATGCTAATTCAGCTTCAAAATTATAAAAATAGTGTCTAGTTAGCTCAATATTAATAACAAATGCTGAGTCAGCCCTACATAAATAACAGTTGAGAGGATGTTAATAATTGAGACTAGAATGAAGATTATCCCAAACTTCAGAGGTAAGAATGTTGAGTTTGAAAACAAGGAAAGGGCCTATGTGAACTTCTTTGATAATCTTCTATACCTTGCTCTATCTTGATGTAAATTGAATTCTCTCTTTTGTTATTATAGCTTCTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTCTCGAATGGAAGTTTATTGTAGCTCATTTGGATTGGTGTCTTTCTTTCACCCTCTCCCCACCCCTTTTTTTTTAAAATAAATTTCATATATAAATGAAGTTCTTTCNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAATGGTGAGCTCGAAACCTTAGGAAC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BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. Swiss-Prot
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BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. Swiss-Prot
Match: NTKL_XENLA (N-terminal kinase-like protein OS=Xenopus laevis GN=scyl1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 366.7 bits (940), Expect = 6.2e-100 Identity = 237/671 (35.32%), Postives = 361/671 (53.80%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. Swiss-Prot
Match: NTKL_HUMAN (N-terminal kinase-like protein OS=Homo sapiens GN=SCYL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 366.7 bits (940), Expect = 6.2e-100 Identity = 250/712 (35.11%), Postives = 374/712 (52.53%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. Swiss-Prot
Match: NTKL_BOVIN (N-terminal kinase-like protein OS=Bos taurus GN=SCYL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 363.2 bits (931), Expect = 6.8e-99 Identity = 250/707 (35.36%), Postives = 371/707 (52.48%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. Swiss-Prot
Match: NTKL_RAT (N-terminal kinase-like protein OS=Rattus norvegicus GN=Scyl1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 359.8 bits (922), Expect = 7.6e-98 Identity = 234/669 (34.98%), Postives = 348/669 (52.02%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. TrEMBL
Match: F6HC35_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_13s0067g03110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1213.4 bits (3138), Expect = 0.0e+00 Identity = 635/794 (79.97%), Postives = 693/794 (87.28%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. TrEMBL
Match: W9S6W1_9ROSA (Putative inactive serine/threonine-protein kinase scy1 OS=Morus notabilis GN=L484_015110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1209.9 bits (3129), Expect = 0.0e+00 Identity = 650/816 (79.66%), Postives = 700/816 (85.78%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. TrEMBL
Match: A0A061FT96_THECC (Kinase family protein with ARM repeat domain isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_045553 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1206.0 bits (3119), Expect = 0.0e+00 Identity = 644/803 (80.20%), Postives = 691/803 (86.05%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. TrEMBL
Match: A0A061FTQ4_THECC (Kinase family protein with ARM repeat domain isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_045553 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1206.0 bits (3119), Expect = 0.0e+00 Identity = 644/802 (80.30%), Postives = 690/802 (86.03%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2TTU7_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_009G292700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1198.7 bits (3100), Expect = 0.0e+00 Identity = 637/803 (79.33%), Postives = 693/803 (86.30%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. TAIR10
Match: AT2G40730.1 (AT2G40730.1 Protein kinase family protein with ARM repeat domain) HSP 1 Score: 1128.6 bits (2918), Expect = 0.0e+00 Identity = 605/798 (75.81%), Postives = 668/798 (83.71%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: gi|659120620|ref|XP_008460279.1| (PREDICTED: probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1378.2 bits (3566), Expect = 0.0e+00 Identity = 725/794 (91.31%), Postives = 743/794 (93.58%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: gi|659120614|ref|XP_008460276.1| (PREDICTED: probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1371.3 bits (3548), Expect = 0.0e+00 Identity = 724/797 (90.84%), Postives = 742/797 (93.10%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: gi|778682394|ref|XP_011651704.1| (PREDICTED: probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1370.9 bits (3547), Expect = 0.0e+00 Identity = 724/794 (91.18%), Postives = 742/794 (93.45%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: gi|449453348|ref|XP_004144420.1| (PREDICTED: probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1365.1 bits (3532), Expect = 0.0e+00 Identity = 721/796 (90.58%), Postives = 740/796 (92.96%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG11g06450 vs. NCBI nr
Match: gi|225448715|ref|XP_002280870.1| (PREDICTED: N-terminal kinase-like protein [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1213.4 bits (3138), Expect = 0.0e+00 Identity = 635/794 (79.97%), Postives = 693/794 (87.28%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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