Lsi03G006160 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGTATCTCGGCCTCTGGTTATACACAGAGAGCATTGGATCTAATTTTAGTTAATAGTATTTCATGGTATCAGAGCACCAGGTGCTCCTTTTTCTTTTTTACGTTTGATGGCGTCGTCTTCAATGCACCATTCAGAGGTCTCTACTGATGTTACAAATACAGTCCCGCCGCTGTCACATACTCAGTCACCAACCGTTTCACCGATTGGCAGCCAAACACCTCCTGTAACCCCATCTGTCCCACAGACTCGTCCTCCTCAAGTCAATACTCGTCAATCTGTAAACCCTAATTTTAATCCTCACTCACCGTTTCCTCCCTTTCAAAATCACAACGGCACATTTCCCTTCCCTTCGCCACAATCTCTGCCGTTTTTTCCCCCACCCCAAGCCAACGTCAGTCCGTTTCCTTCCCTCTCCCAACCTTTATCTATCAAACTCACAGACTCCAACTATCTTCTCTGGAAGAATCAGCTTCTAAACTTCATTATTGCCTATGACGTCGAAGGCTAGGCTTTAGTTACGGGCAACAACAACAACCTAATTCAACAGTTTATTTCACAGTTACATGCTACTTTTTCTCTTAAAGATATGGGTGGTCTATCTTATTTTTTGGGTATTCAAGTTGTTCGTGCTTGCTCTTCAATGCATTTGTCTCAAGCAAAATATATTAGTGATCTTCTCAAGAGGGCTAAAATGTCTTATTGCAAACCTATTACCTGTCCAATGATGGCTGGTACTCAGTTGTCTCTTCATGATGGGCTACCTTTGGCTGATCCAACCGAGTATCAAAGTCTGGTAGGTGCCTTACAGTATTGTACTCTCACGCGGCCAAAAATCAGTATTGTGGTTAACAAATTGTGTCAATTTCTACATGCTCCCACAACTTCCCATATGCAGGTTGTCAAGAGACTTTTAAGGTACTTAAAAGGTACTTCTTCTCTTGGTTTGTCATTCACTAAGAGTCCTCATCAGTCTCTTACGTGTAGCACGGATGCAGACTGGGCTAGTTGTCCTGATGACCGTCGAAGTACGAGCGGATTTTGTGTTTTTCTTGGTTCAAACCTAGTCTCTTGGAAATCCTCAAAGCAAAGCGTTGTATCTCGCTCAAGTGCTGAATCCGAGTATCGCGGAATGTCTAATGCCACAACTGAACTTGTTTGGATCCAGTCATTATTATATGAAATTGGATTAGCCACTCGTTCTCCTATTTTGTTGTGTGATAATGTAAGTGCAACATATATGGCAGCTAATCCAGTCCTTCACAACCAAACCAAACATGTTGAGATCGATCATCATTTCATCCGTGAACGTGTTGCTCGAAATCAACTCATTGTTCGGTTTGTTCCTTCAGAAGACCAGCTTGCAGATATTCTCACTAAGGCATTACTAGCAGCTCGTTTTATCAATCTTCGAACCAAGCTCACAGTCCTCTCCAAGGCCCATTCACTTGAGGGGGGATGATAGAAGATATTTCCTCATATGTTTTTACTATTCTATCCCTATTGTATTTGGTTATATTTATGTTATTTTGTATCCAATCTTCTTTTGACACTTGTCTTTATTTTTCCCTATTAATGGAGTATCTCGGCCTCTGGTTATACATAGAGAGCATTTGATCTAATTTTAGTTAATAGTATTTCATTGATTAATAATTTCAATTGAATTCTAAAGTGTTGTTGTTTTGGGTTGGATTAACTTTGTTTCATTTTGCATTTGAGGATCTTTCTATGTATGTTAAGAGAGATGAAAAACGTGTGGTCAATTTTTAGCAATTAAGGATAAACGGGGTAAAATTACTTATTTACTTTAAGTTGTGGACAAAATAGATACTACTTCAATTAAGTTAATTTTGCTTTTTAGTTAAACAACATATAGATAGAAATTTGAATGAGATATAATACTTTAATAAGTTAACCTAACTATGGTCAGGTTTCACTCAATTAAATAAGGGAAAGTGCATTAATTATATTAGATAGAATTAATGGAATGTATATAGATACATTATAATATAAAGTTAATTTTATATTAGATTCAAAATTGAACTTTATAGTATGAGAGTATTAATGTTTGAATAAGATTCAAATATTAAATAAATATGAATATGATTCATATTGTAAAAGATTCAAATGTTAATTGTATATGATACAATTAATATAATGTATATAGTTTCATTATATTATAAAATTGATTTTGAATTAGATTCAAAATTAAACTAAATAATATGAGAGAACAATATATTTGAATGAGATTCAAATACTAAATAATATGAATGAGATTCATATTAAAACTTTAGGTTAAAATTTAATATGAATGAGATTCATATTTAAACTATAGATTATGAGATAGAAATACATTTGAATATGATTCAAATGTAATATTAATTAAATATCTATTTATTCAATTAGATTAATTAATATATGTTTATTAAATTAAATTAAATTAAATTAGATTTAATTTAATTTAACCTTAGGTTAATTTTAGGAAAATTTTTAAAAATAGAAAAATAAGAAAAATTATTTACACAAAATAGCAAAATTTTTAGATAGTTGTGATAGACGCTGATAGAAGTCTATCAAGGTCTATCAGTGTTGTTTTTGCTATTTTCTGTAAATAGTTTGACATTTTTTCTATTTGTAAAAATTTTTCTTAATTTTAACTCCCCATGGTTAAAGGAAGTTAATTGTCAATTAAGGGAAACATGTAACTTCCCCCACTCTCTCTTAGTATGGGATAATAACGTGATTTTATTCGTTTTGAATAATAAAAAGCGATTAATCAAGTACGTGGAATCATTAAAAGGGGAACCATATCTCTCTCAACACAGATTCTCTGAAAGATTATTTTAGGAAAAAAAAAACAATTCTCTTTAACTCCCAATTCAGAAGAAGAGAAAAGTGTTTTCTTTACATTCTTCTTCTTCCCTTATTATTCCAAAAGGGTTCCCAAAAACCATATCCTTGCTGGAGAATAGCAGGGAAGATCTTGGTGGTTGTGTTCTAACCAAGTTTCTAACAACTATTTTCGATTATGTGATCAAAATACAACAAATTCTAAACTCAACATTTTATATTTTTAATCTATCTATATTTTGAATTTTAAAATTTAAAGATCCATAATTATATTTAATAAAAATAAAAATATTTAGAAATACAGTATATATATAAACTCAATTTTAAAAATTAAAATATGTATTACAATTTATATAATATTACAAAATATAGGTATACAGAAGTTAATTTGAACATAAAACATCTTCATAAAATAATTAATACTTTATAATCTCTCTAAAAAAATTATAGTTTATAATTAACCTAATGAGTGAAAAATCGATAGGATGACTCGTCACTCGATATACGGATGTTAAACAAAAAGCACAGACAAACACTATAACAACCACAAAACCAACAGCAAGTAAAAGACTAATTATTGCACACATAAGTTGGTAACCAAATTCAATGATAAACCGCCCACGTCTAGGGGGGATTGTGCCCAGGAAAAGATAATAAACTAATATTAAAAAGTTAAGCGTTTACAACAAATTACTAATCCGTAAAGTGACAACTTCTACAGTGACTCTTGCAGAGCTTAACTTGCTCTGCATCTAGGCTCATCCTAGATGTAAGACTCCCTCTCAATGGAACTTAAGCTCCCCCTAAGTGTGATAATATTAGTGATGAACACTTTGGCTTTCGACAGTGTGCGAGACTCCTCTCAGCTTGATTATCTTCCTTGTAGTTCAGTGAACTCCCTTCACTGAAGAATCTTAGGTCCCCTTAAGATAGAGAAATCCTTCTCGAGAATGAAGTCTTAGGCTCACCCTAAGACAAAGAATTCCTTCTCTAAGTTAATGCCTTAGACTCCCCCTAAGATAGTGATTATCTTCAAGGTTTCGAGATCGATAACGGATGAACTTGCATAGTAGAAACACAGCGAGTAAAAATCGAAACACAATGGTGCACAAGTTCGACCACCAAGAACAAAACTCTCTCACAAAATAAATAAATGCGGCAACCCTGATCACATCAAAATGTGTCGTCGCTAAAACACACTTCTTGGAATCAAAAGAAATTTATAACACCTTACTTATCAATCAACACAAAAGATATAATATAGATGGTAAGTTCGGGATTGATCTGCAGGGAGCTAAAGAATTAATCTATTCTAAACTAAATTAATCATCGCAAAGCGATAAAAATGGGGGTTTAAAAGAAAAAGAAAAATGATAGAAGAAATCAATAATATTTTTGGTATATTGATTTTTGGGAGAGTCAATATAATAGATGGAGAATTTGGACAAGTTGATTTCAAATTCTACCATCGAATTGAAAAGAATATGATTAATATCAAGAATGCAGAACCAAAGAGAAATCAAATCCCTAATTATTCTAACTCATAAAACCAATACAATTAGAGATGATCAATTTCTAATTGCCCTAATTTGTTAAAGAAAGATTTTTTTCAAAATTAACTCTAAACTTCGTTTAAGTGTGTATATCTTTCAGCAGTTTTCAATACTAAACAAATTTTATATTAAGATCTAGGTTTTGTAGTTGCAACGAATTAAAGAACGGATAGTCTCTTTGTTAATTCGATTTGTTGATCAATTCTAATTAGTTCAACATGCATTGATTGAGAGGAAACATGCTTTAAACAAATACATGCATTCCTAATCTTGCAACCTAATTCATAATTTGATTGCTTAGCACATTATGAATTTTGTAAACAAGAATCGAATCGATTCAAATTTCAGTAGATATGTTCAAGAGAATTAACCAAGATTCAAGAATTTAATCAAAGAGTTATAGAAGAAATCCTCAAGAAATTGAATACAACTTACCAATTCCCTAAAGAATTACCTTAGACTTTCATCCTTTGATAGATCTTCAAAGAATTTTGAGAGAAAAGGTGAAGGGAGAATGAAAATCTCTCTGGAAAATGGGTAAAAATGCTCTCTCCCTTGAAATGAAAATGAAATTAAGTATTTAAAATCTA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BLAST of Lsi03G006160 vs. Swiss-Prot
Match: PRB1_TOBAC (Basic form of pathogenesis-related protein 1 OS=Nicotiana tabacum PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 143.7 bits (361), Expect = 3.2e-33 Identity = 67/126 (53.17%), Postives = 86/126 (68.25%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. Swiss-Prot
Match: PR1A_TOBAC (Pathogenesis-related protein 1A OS=Nicotiana tabacum PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 136.7 bits (343), Expect = 3.9e-31 Identity = 70/143 (48.95%), Postives = 95/143 (66.43%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. Swiss-Prot
Match: PR1A_SOLLC (Pathogenesis-related protein 1A1 OS=Solanum lycopersicum PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 1.1e-30 Identity = 63/130 (48.46%), Postives = 85/130 (65.38%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. Swiss-Prot
Match: PR1_HORVU (Pathogenesis-related protein 1 OS=Hordeum vulgare PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 2.5e-30 Identity = 66/139 (47.48%), Postives = 90/139 (64.75%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. Swiss-Prot
Match: PRB1_ARATH (Pathogenesis-related protein 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=PRB1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 2.5e-30 Identity = 65/157 (41.40%), Postives = 100/157 (63.69%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K7N5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G070232 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 3.4e-66 Identity = 126/152 (82.89%), Postives = 133/152 (87.50%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K4C6_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G070250 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 173.7 bits (439), Expect = 3.2e-40 Identity = 81/158 (51.27%), Postives = 113/158 (71.52%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K4C1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G070225 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 167.5 bits (423), Expect = 2.3e-38 Identity = 80/141 (56.74%), Postives = 104/141 (73.76%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K2C5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G070230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 3.9e-38 Identity = 76/138 (55.07%), Postives = 103/138 (74.64%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0K6A0_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_7G070235 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 157.5 bits (397), Expect = 2.4e-35 Identity = 68/120 (56.67%), Postives = 93/120 (77.50%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TAIR10
Match: AT4G33720.1 (AT4G33720.1 CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathogenesis-related 1 protein) superfamily protein) HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 3.4e-33 Identity = 64/132 (48.48%), Postives = 89/132 (67.42%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TAIR10
Match: AT1G50060.1 (AT1G50060.1 CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathogenesis-related 1 protein) superfamily protein) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 6.4e-32 Identity = 64/137 (46.72%), Postives = 88/137 (64.23%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TAIR10
Match: AT2G14580.1 (AT2G14580.1 basic pathogenesis-related protein 1) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 1.4e-31 Identity = 65/157 (41.40%), Postives = 100/157 (63.69%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TAIR10
Match: AT2G19990.1 (AT2G19990.1 pathogenesis-related protein-1-like) HSP 1 Score: 132.1 bits (331), Expect = 5.4e-31 Identity = 61/135 (45.19%), Postives = 84/135 (62.22%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. TAIR10
Match: AT3G19690.1 (AT3G19690.1 CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathogenesis-related 1 protein) superfamily protein) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 2.7e-30 Identity = 58/129 (44.96%), Postives = 89/129 (68.99%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. NCBI nr
Match: gi|659110139|ref|XP_008455069.1| (PREDICTED: basic form of pathogenesis-related protein 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 273.9 bits (699), Expect = 3.3e-70 Identity = 127/146 (86.99%), Postives = 137/146 (93.84%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. NCBI nr
Match: gi|778724756|ref|XP_004137080.2| (PREDICTED: pathogenesis-related protein 1A-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 4.9e-66 Identity = 126/152 (82.89%), Postives = 133/152 (87.50%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. NCBI nr
Match: gi|659110135|ref|XP_008455067.1| (PREDICTED: pathogenesis-related protein 1A-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 178.7 bits (452), Expect = 1.4e-41 Identity = 88/179 (49.16%), Postives = 123/179 (68.72%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. NCBI nr
Match: gi|778724761|ref|XP_004137082.2| (PREDICTED: basic form of pathogenesis-related protein 1-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 173.7 bits (439), Expect = 4.6e-40 Identity = 81/158 (51.27%), Postives = 113/158 (71.52%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi03G006160 vs. NCBI nr
Match: gi|659110141|ref|XP_008455070.1| (PREDICTED: basic form of pathogenesis-related protein 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 173.3 bits (438), Expect = 6.0e-40 Identity = 79/140 (56.43%), Postives = 108/140 (77.14%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene: |