CmoCh12G005960 (gene) Cucurbita moschata (Rifu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGCTAAAATTCGACATGGGTTATGCTCATTCTTCATGCTCTCTCGTTACAACTTTCTCCACCAAACATTTCTGCTTTTCCCAATCTTCAATTTGCGTATCAAAGTTACGCCCAACAAGTCAGAATCAAATCAGATCTATCAAATTCACTTCTCACCCTTTTCATTGTTGTTGTTCCTCTTCACAACATTTGCCTTTAAGGTGTAATCAAGTAGGTGAATTCGAAACCCAAGTGAAGTCTTTGAAAACCATGGTGGATATTCATGGCATTGATCAAGAGTTGCTGAAGAAGATGGTCTATGATGCTCTTGTTTGGAGTTCTCTACATGGACTTGTTGTTGGTGACAAGTCAGTGAAGGTAAGCGTTTCTGCAGTTTATAGGATTGATGTTCTCTGCCTTCTATTTGGTTTTTGTATGCTGAAAATGTCTTGTGATTGTTGCTTCTACTGTTAGTTTGGAAAGATGAAGGACCGAATGATTCATAATAATGGACTATTACTCGTTGCTTATGATACTCTCTCCAATTAGTGTTTATGAAAGAGAAACGCAAATGTTCTTACTAAAGGAGCATTGGAAGAAGATATGGTGCATTCCTTTAGATTCTGAACCAAAAAGATTGAAAATTCCATATCCTCTCATCATTTCAAGTAACTGTTATTTCTCCATTAAAAAAATGGTAGAAATTTCTCAAAATAGTGATTGGAATAAGGACGTATGTAAAGTGGTTTCTGATGCTGAAACAGCAAACGTCTTTTGGGGTAAATTTTAATATCATTTCAAATTTTTTGGGCTGCAGAGATCAGGTAAAGTACCTGGTGTAGGTTTGGTTCATGCCCCAATTGCCTTGTTGCCTGGGTTATTTCCTGAAACTCATTGGAAGCAAGCATGTGAGTTAGTCTCCATTTTTAATGAATTAGTCGATCGAGTTAGCTTGGATGGGACATTTATACAGGAATCATTATCGAGGTATGCTCGAGCCCTTTCATGCCTGGCACAGACACTAGTTATTGACTCTTTTTTCTAATTTCCATGAAACATGTTCTTGGCTGTTCCATGTAATATGTCTTGAGCTTAGGTACGCTCTGACCTCTGGCTTAGAAAAACTAAAAGGCAGTGCCTTCTTTATTAGCATGTATCGATTATGATCCGAACGTATTCTATTCATCTGCTGATCTGGTTCATCCTCATTCGTTTGTTCTTTCCTTTTTAATTCTTCTAACTAGTTAGGGTGTATGACTACCTTCCCTATTTTCTACCATTATGGTTATTAGTGGAGATTGTCTCTGCCTAAAAAAGACTTTTGATATGTCATTCATGTTGCAGAACCAAAAAAAGTGGATGCTTTTACGTCTAGACTTTTAGTTATTCATTCCAAGATGCTTTTACGCCTAGACTTTTAGATATTTATTCCAAGATGCTTTTACGTCTCTGCCTAAAAAAGAGTTTTGATATGTTATTCATGTTGCAGAACCAAAAAAGTGGATGCTTTTACGTCTAGACTTTTAGATATTCATTCCAAGATGCTTCAGATTGACAAAAAAGAGGCAAGTGTATGCTAATTTTTTTGATATTGTGTAGGTCAACTATCAAACTTTTATATTGTAGCTTTTTGGATACAGTTAATGTGTTTCATGACCAATTTTTTAAAAGGCTTAAGGCGGCTTGAGGTTTTTCCTTATAGAGAGGCGAAGGGTAAAAACTCACTGTGAAAAAAAAAAAAACAGAAAGAACACAAGAGTAAAGAAGGGACAAAGAATAAAACAAAACTCACCTTGTTGTGTTGGTCGTCAAAGAGTTGTGACTTTTTTCTTTTGTTAATGCAGTCACTCAGAGTCAGTCTATTAAAATAACACAGCAAGGTGAACACTGGATATATATATATTTTTTAAGTAAACCAATAGAACTTCTTCTAATTTTTCAGTGCATTTTTAAGTTTTCTTTGATATCTGTCTTTCCCCATGGTTGACGAAAATGAACTGCTTGAATTAAATGCACCGCTTGCACAGCACAGGCCTATGGCGCACCAGAAATAAACACAAGGCTTACGCCTTATAGCCACAGAGGTGTTAGGATTGAGGCTTATGCCTCTATTGAGCAAGGCGTAGGCCCCTCTTTGTGTGTAAAAGACATAAGCCTTGAGAAACAATGTTGCTGCCTCGCTTCAAGGCTTCTGCCTTAAACACCTTTTAAAACGTTGTTTATGACAAGTTTTTAGTTGTTATGTTTTTACTATGTGACATGAAATATTTACATAACCTTGCAGTTTAGAATAAGTTAACTTCAGTCTTGTAAATGAATATGAAACTTCCATTATGTTTGTGGCTCCTAAAGACATTACCTACTTAATTTTGATGTTTGTGGTTCCGAAAGGCCTTACCTACATAATTTCTCCATGCTATGCAATTTTATCCAAAAGGGTTGTATTATTTAATTGAAGGATTATAACGAACTTCTCCAATTATTCAAGTAGGAAATTCGCTTGGGTTTACATCGCTCAGATTATATGCTTGATGAGAAAACAAAATTACTTCTTCAAGTAGAGCTCAACACCATATCATGTTCATTTGCTGAATTTAGTCATCTAGTCAGCCAACTTCATAGGTAAATATAACTTTTATAGACATTTACCATTGAGATTTCTTGTGCCTTAGATTTTGTGTATATTTGGCCATTTTAATCCTCCCATTAAAATATAACTTCTATCAGAAAAAACTTGTACATACAGCAGATTATATTTGATCCTTCAATTATTTATTTATTTTTATGAGAAACCAAGTTTTCATATACAAGGGCATATAAGAAAAATATCCCAACAAGGGAAGTCCAATCGAAGAACGAGACTCCAACAGAAAAGAATGATGCCTAGTTGTTAATGTGAGACCCACATCGGTTGGAGAGGGGAGCGAAGTATTCCTTATAAGAGTGTGGAAACCTCTCCCTAGCAAACGCGTTTTAAAACCGTGAGGCTGACGATGATTCGTAACGAGCCAAAAGGGACAATATTTGCTAGCGGTGGGCTTGAGCTATTAAAAATGGTATCAGAGCTAGACATTGGACAATGTGCCAGCGAGGACGTTAGGCTTACAAGGGGGGGATTGTGAGATCCCACATTAGTTGGAGAGGGAACAAAGCATTCCTTACTAGGTGTGGAAACCTCTCCCTAGTATACGTGTTTTAAAAATCTTGAGGGGAAGCCCAGAAGGGAAAGTCCAAAGAGGACAATATCTTCTAGTGGTGGACTTGGGCTGTTACAACTTTTCCTCCGGAAGTTCTCTTGATTGTTTGAGATGTCCCAGAGCTTTGGCTTAACTCTTCAGTAAAAGAACATTATTTATCCATGCCTGATCATTCATTTTGTTATTTTATCTTGCAGTGATTTACTTGGTCAATATGGGGAAGTCCTCGGATTAGACTCGAGAATGATTCCTGAAAATCATGCGGGTAATCAATATGCTGAGGCATTGGTCAAAGCTTGGACTGAATATAACAACCCAAGGTTAGATTTGAAAATTTGATATTCTTATTCATCACCATTCCTCAAACCTAATTTTCAGTGGGTTATTAATGTTTGTAGTGCTGTTATCATGATTGTGGTTCAAGCTGAGGAACGCAACATGTATGATCAACACTGCCTTTCTGTTAACTTGAGAAAAAGATATCCACTTTTTCCTGATTGTCAGGCTCCATTAGAGTACATAATTTTCTTTATTGTGCACCCATTCTTTTTACTATTTGAACAATTTGATCTATCGAGTTTTCCACGTAAACGTTCCTTAGCTTTATAATACACATTATGTCAAAACTCTTCGGAAAACACTGGCAGAAATCGATAGGGAGGGAGAACTGCAATCTGATGGAACACTCCTTGTGTAAGTAGTTTTGAATGTCAAAATTAGTTTTTCCTATGAAAATTGGGTTACCATTTTATGTTACTTGGGATTCCTGAGAGCTTCCTCCTGCAGAGATGGCCAAGCAGTTGCAGTTGTGTACTACAGGGCTGGATATACACCCACTGACTATCCTTCTGAATCGGTAAGTAACTGCTTCCTTCCTGTTCTAACTTGTCATTCATGCATCTCCTATGCATGTATTGGCATTTATTTGATTCATAACTCTAATTTATTTGGTTCATCTTCCATTTTGTTGATTCATGTATGACATTAATGCTTCTATACCTATATAAAGGGTTGTCTAGGATGGTTGAGATGTATTGAGTTTGAGTGTCATTTTGCATTTGTTGAGTGACATTTGGGAGGAACTTTGTTGAGAGATCTTGTGGGGTGAGATATACACTTTGTAAACACTTTGATTATTGAGATTGGTTGTTATCCGTGGATGTAGGGGAATTTCTTATCTCCGAACCACGTAAATCTTTGTGTCTCTTTGTTTAACTTTTGTTTGTGGGTGAGTGAGTGCGATCGATCTTGCCTCCGCTTCCGTTACAACACTTCTTTGATTGGGATTACGTTCATATATTCTTTTGGAATGAGCTTCCTGGGCATTAGTGTTACCCTTCATTTTAGGAAGAAACTCGCATTTTCGAATGAATCTCAATAGTTTTATGAAATCTTAAGACAAGCAAAAGTTGGTTTTTTCATATAGAAATTGATGACTTTTATCTATTTCAATTCCAAGCAATTTCATTATATCTTGAGTAAAGCTTTGGGGTTATTTTTTCATTTGAATGGTAACAAATTTCAGGAATGGAAAGCAAGGTTACTTGTGGAGCAGTCATCTGCAGTCAAATGCCCATCCATATCTTACCATTTAGTGGGCACCAAAAAAATTCAACAGGAACTTGCACAACCAAATGTACTTGAAAGGTATTAATTATTGATCTTAGTCTTGCTGAAAAATATTACCCAATGATCCTATGCTTTTCCGTTAGAAACGAAAGATGGTCCGAGATAGTTTAATGATCGTCTGAGGTCATTAGGACTGCATTACTCGAGGGAAAGGTGTCGAGTTATCCCAATTCCCTGCCGAAAATG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ATGGAGCTAAAATTCGACATGGGTTATGCTCATTCTTCATGCTCTCTCGTTACAACTTTCTCCACCAAACATTTCTGCTTTTCCCAATCTTCAATTTGCGTATCAAAGTTACGCCCAACAAGTCAGAATCAAATCAGATCTATCAAATTCACTTCTCACCCTTTTCATTGTTGTTGTTCCTCTTCACAACATTTGCCTTTAAGGTGTAATCAAGTAGGTGAATTCGAAACCCAAGTGAAGTCTTTGAAAACCATGGTGGATATTCATGGCATTGATCAAGAGTTGCTGAAGAAGATGGTCTATGATGCTCTTGTTTGGAGTTCTCTACATGGACTTGTTGTTGGTGACAAGTCAGTGAAGAGATCAGGTAAAGTACCTGGTGTAGGTTTGGTTCATGCCCCAATTGCCTTGTTGCCTGGGTTATTTCCTGAAACTCATTGGAAGCAAGCATGTGAGTTAGTCTCCATTTTTAATGAATTAGTCGATCGAGTTAGCTTGGATGGGACATTTATACAGGAATCATTATCGAGAACCAAAAAAGTGGATGCTTTTACGTCTAGACTTTTAGATATTCATTCCAAGATGCTTCAGATTGACAAAAAAGAGGAAATTCGCTTGGGTTTACATCGCTCAGATTATATGCTTGATGAGAAAACAAAATTACTTCTTCAAGTAGAGCTCAACACCATATCATGTTCATTTGCTGAATTTAGTCATCTAGTCAGCCAACTTCATAGTGATTTACTTGGTCAATATGGGGAAGTCCTCGGATTAGACTCGAGAATGATTCCTGAAAATCATGCGGGTAATCAATATGCTGAGGCATTGGTCAAAGCTTGGACTGAATATAACAACCCAAGTGCTGTTATCATGATTGTGGTTCAAGCTGAGGAACGCAACATGTATGATCAACACTGCCTTTCTGTTAACTTGAGAAAAAGACATTATGTCAAAACTCTTCGGAAAACACTGGCAGAAATCGATAGGGAGGGAGAACTGCAATCTGATGGAACACTCCTTGTAGATGGCCAAGCAGTTGCAGTTGTGTACTACAGGGCTGGATATACACCCACTGACTATCCTTCTGAATCGGAATGGAAAGCAAGGTTACTTGTGGAGCAGTCATCTGCAGTCAAATGCCCATCCATATCTTACCATTTAGTGGGCACCAAAAAAATTCAACAGGAACTTGCACAACCAAATGTACTTGAAAGGTTCCTTGACAATAAAGAGGATATTGCCAAGATAAGGAAATGTTTTACAGGGTTATGGAGTTTAGATGACAAAGATATAGTAAACAAAGCCATCGAAACACCAGACCTATTCATTATGAAGCCGCAAAGAGAAGGCGGAGGGAACAATATCTATGGCGATGATGTGAGGAAAACCCTTGTAAGATTGCAGAAGGAAGGGAATGTAGAAGATGCTGCTTACATTCTTATGCAGAGGATATTCCCATCTGTTTACCCGACGATTTTTGTTCGAGATGGGATTTGTCATAAGGATCACGCCATTTCAGAGCTCGGTATATTTGGCGCTTACTTAAGGAACAAGGACAAAGTAATTGTGAATGACCAATGTGGTTACTTGATGAGGACAAAAGTATCTTCATCAAATGAGGGCGGTGTTGCAGCTGGATTTGCTGTCTTGGACAGTATTTACTTAACTTGA
BLAST of CmoCh12G005960 vs. Swiss-Prot
Match: GSHB_BRAJU (Glutathione synthetase, chloroplastic OS=Brassica juncea GN=GSH2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 709.5 bits (1830), Expect = 2.8e-203 Identity = 342/509 (67.19%), Postives = 417/509 (81.93%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. Swiss-Prot
Match: GSHB_ARATH (Glutathione synthetase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=GSH2 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 707.6 bits (1825), Expect = 1.1e-202 Identity = 356/552 (64.49%), Postives = 433/552 (78.44%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. Swiss-Prot
Match: GSHB_SOLLC (Glutathione synthetase, chloroplastic OS=Solanum lycopersicum GN=GSH2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 706.4 bits (1822), Expect = 2.4e-202 Identity = 366/554 (66.06%), Postives = 436/554 (78.70%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. Swiss-Prot
Match: GSHB_DICDI (Glutathione synthetase OS=Dictyostelium discoideum GN=gshB PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 338.6 bits (867), Expect = 1.3e-91 Identity = 195/476 (40.97%), Postives = 287/476 (60.29%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. Swiss-Prot
Match: GSHB_XENLA (Glutathione synthetase OS=Xenopus laevis GN=gss PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 2.5e-90 Identity = 193/473 (40.80%), Postives = 287/473 (60.68%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LW32_CUCSA (Glutathione synthetase OS=Cucumis sativus GN=Csa_1G571280 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 892.9 bits (2306), Expect = 2.0e-256 Identity = 451/553 (81.56%), Postives = 495/553 (89.51%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. TrEMBL
Match: K9JF36_CUCSA (Glutathione synthetase OS=Cucumis sativus GN=GSH2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 823.2 bits (2125), Expect = 2.0e-235 Identity = 404/472 (85.59%), Postives = 440/472 (93.22%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. TrEMBL
Match: M5WHF4_PRUPE (Glutathione synthetase OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa003677mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 766.1 bits (1977), Expect = 2.8e-218 Identity = 388/564 (68.79%), Postives = 451/564 (79.96%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. TrEMBL
Match: A0A0D2NX98_GOSRA (Glutathione synthetase OS=Gossypium raimondii GN=B456_003G066300 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 759.2 bits (1959), Expect = 3.5e-216 Identity = 368/474 (77.64%), Postives = 419/474 (88.40%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. TrEMBL
Match: U5FUH4_POPTR (Glutathione synthetase OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0013s02780g PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 758.4 bits (1957), Expect = 5.9e-216 Identity = 391/587 (66.61%), Postives = 464/587 (79.05%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. TAIR10
Match: AT5G27380.1 (AT5G27380.1 glutathione synthetase 2) HSP 1 Score: 707.6 bits (1825), Expect = 6.1e-204 Identity = 356/552 (64.49%), Postives = 433/552 (78.44%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. NCBI nr
Match: gi|659099631|ref|XP_008450698.1| (PREDICTED: glutathione synthetase, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 907.1 bits (2343), Expect = 1.5e-260 Identity = 459/552 (83.15%), Postives = 496/552 (89.86%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. NCBI nr
Match: gi|449435701|ref|XP_004135633.1| (PREDICTED: glutathione synthetase, chloroplastic [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 892.9 bits (2306), Expect = 2.9e-256 Identity = 451/553 (81.56%), Postives = 495/553 (89.51%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. NCBI nr
Match: gi|305430792|gb|ADM53349.1| (glutathione synthetase [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 823.2 bits (2125), Expect = 2.8e-235 Identity = 404/472 (85.59%), Postives = 440/472 (93.22%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. NCBI nr
Match: gi|743829494|ref|XP_011023533.1| (PREDICTED: glutathione synthetase, chloroplastic-like [Populus euphratica]) HSP 1 Score: 769.2 bits (1985), Expect = 4.8e-219 Identity = 375/511 (73.39%), Postives = 439/511 (85.91%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh12G005960 vs. NCBI nr
Match: gi|595823097|ref|XP_007205011.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa003677mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 766.1 bits (1977), Expect = 4.1e-218 Identity = 388/564 (68.79%), Postives = 451/564 (79.96%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata
Date Performed: 2017-05-19
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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