CmaCh20G001480 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

NameCmaCh20G001480
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr20 : 729286 .. 737641 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGACAACGGTGAAAGTTATGGCAAATGAAAAGGCAATCTCCAAAAAAGAGAAAAAATCATTCCGCGATTCAACATTCTGGGATCTTCCTTTCCCCGCCAAATGCAATTTCTGTATAATCAGTCCTCTTTTCCCCCGATCCACCTCCCATCACCGCCAAAAGTCGAAAATTTTTCATAGCCCCAAAAAAAGAAAAAATTTGAAGAAAAATACAGAATCCCTTCTTGTACTTTCGCTTCTGCTTGATATTTCAAGCAAGCCACGCCTATTTTCCTTCAATTTCTTTAAAATACAATTATTTTATGGTGTAGCTCAGTCCCCACATGACATGAACGCTCCCTTCTCTCAGTAAATTAACTAAACAACTCCCAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGATGCCTAGTAAGAAACTCCGGTGTCGGGACGGTTAACTGGATAATGCATCTTCCTTCGCCGACACTACTTTATTAATTTTCTATCATCATCAATTATACCAAATATTAATGAGCGACAATGTTTAAGGACTTAATGCAATTTCACATAATTAAATTAATAATCTTTGGAACATAAATTGTTCAGATGGTAATTAAGAACAATGAGTTTGGATTGATTAATGAATGAAATTGTGGTTTAGGGGTTAGTAGGGTGGAATAATAATTAATAGGCGGAGACGATATTATAATGGCAGTAATAAATCATTTTTAATATTATTGAAGTAATAATATTAAAATAAGGGAGGGCAGGTTGGGGCGTTGGGGAAGCACGTGGCTACCAATGCATTGCCAACTTGCGGGGTGGACTGTTCCATATTTATGGTTAAAATAAATTATAGACTACCAATTGGGACCTCAATAATCGAATCTAAATCATTATATTTTAAAATAAATTAGTTTTTTTTTTTTTTTTAGAGTTAAAATATCCGTATATCTCATTACAATGTGTAGAAGCCGCAATGATACAACAAAAATCCACATGCGCTTTGCCGATAATTGTGCGCTGTCTAGTACATGCCCATGCTGGCGCCATGGCCCTGCCTCTCTAACATCCTCACATGCTCTTCTCCCCGTCTAGGCTCCACCCTTTTCATTTGAATGGCGCACCGCCCGCCCCCCGCCCGCCTTTCAAGTACTCATCACTGTCCATATCATGGTCAGCATGTTAGAATGGGGCGGAACTGAAGTTGCAGACTTGCTGTACAGATTTGGCGCGATACCCTAACACGTGGAGGCCCACAATTGGTGACCTGCCACCTGGATGCGCACATGGCTTATCATTATTATCCTTATTATTATTATTATTATTAATCCCCCTATCTAAGTCTTGTGCTCCCACTCCCCGAAATTGTATAACTCATCACTCATTACTCTTTGCACAGCTGGTCTAAATTTGCTTCCTTTAATTATTAATATATTATTACCTCCGTGTTTCAACGACTTATCATTAAAATTACAAGCGCCAATATGGTAAGGTAAATAAAGGGCTTTGAAAGTGGGCCCATTCCACTTCATTTCCAACAAAGTCCAACATTTAGAGCCCAATTACCCGGTAGAACTACTTGGGCCTAAGCAAGCAACCATTTGGGCTTTATTGGGCCTATACTCGTGGGCTTGAATAAATCTACACGTTTTATTTGAAAAGGCAAACATCAAACATGTGTATGTTTGAGGCGGAAGACAATAATTAAAATTAAATTAAAAATTAACATTGTACATAAAATGGTCGGAGAGTTATGCCAAATGCTTTGTCGACACTTTTAGGAGCACATTAAGCTCTCCCTCAATTATTAAAAAAAAAACATGTTACAACAGACCTGTAGTTATTTAAATAATTAAATTAAGTTTTTTTTTTTTTTTCCGGCAGTGTCCATTTTTTTCGCTATGATAATTTAATTTCCAAATGCGATCCCCTAATTAATCGATACGATAGAGGAGGTTCATGCATATGCTTTCTTTGTTTCAAATCATTTACCTACGTCAACCTATTTAAATTTATTCTCATGTAACGAGTTCCACCAATTTCTACTTTAAGAATCACCATCCTTCCTCTCGATTTTGATCCCAAATTTCTCTCTTTTTTTTTTGAGTTGTACCCAACTTGCTATGTGTGTGTGTGGGGCTTTGAACATGAATTCACAAAATTTATGATATATATGCACGAAATGAAACATATTTAATTCAATTCCATTTTGATGGGGGACTGCTACAGTTATTTTTTGGAACATGATTTAAACCGATTTCATTTTCAAAGACTTTTTCAATATCCTGAGTCTCTTGGACAAATATCAGTTATTTCGTGGGACAAAATTTAACGGCGGTACCTTTTGGGTTTAGGGTAATTTTATTGTGGGAAGGAAAGCAATAAACTTTATTAAAGTGAATTTGTATGCTTATGAGGAAGTCTAAAAGGCTGTAATTAAGGGGTTAAACTATCGTTTTCAGATAGCGACACGACTAATTAAAATTAAGGGTTTTGAGTGTAAGGATTAGGAACCTGATCTTGCCACGTGGACTAATAGTCTCTTGACGTGATGTTGGTGGGCCACTACACTTTCGGAAAAGTCTTGAAATTTATCTACAACCACACAAGTTTTATCGTATTTACAAACCACCCCCCGGCCCAAAAGCAATTATTAAATTTCCCACTCCACATTGGCATTTTCCTTTTTTTTTTGTTTTTGACTCCATCCAGACTCCGGTGGGCCCCGCGGGTTCGTGCCCGGAGACCCGTTCGATTGGGGTGTGGGGGATCGGGCCCCGCACCTCCTGAGATAACCTCCTCGAACACGCCGAATCTTGAAGTGGGAACCACACCATGCGCGACTTTCGACGCGCGTAGGAGCCGACGGACAACCCTTGGTGGGACCCACGCAAGGAGGGTTAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATCGAGATCCCACTGACACGTGTATAGTGCTTTCGTACATTGTGGGTCCCGCGATTCTCCAGCAAAACTCCAACGCGAATTCACAAAAGTCGTACGGAGCCCCTTGCGTGAAAGAGCGTCACGTGAGCGTGTCTTGGGCCTACTTTTGTAGCAGCCCAATTAGGTCGCTTCATGTTTTTTTTTTCTTTAAATTAATTATATATTATAAATTAGCAGAATTCGTGAATGACGTGGCCGATTATTAACTACTCGTGGATAATAAATCTACTTTAAATTTTAAAATTAATATCTACAGTCACGTTTGGAAACCCTAAGATTAGGTGAATCATAATAATTAGACTCAATAATTTATATTTTTTAGGATAATTATGCAATTTAATTTTCTTAATATTATCCAAATATTAACTATAATCTTTTATATTAAAACTTTTCAAATGATGCATCAATTTCTCCATTGACGTTTAGTCATAAATAAATAAGAAATAAATGTACGAAATTCACGCTTTTGAAAAGTTGTCGTTTTCTTTCAAATTTCAAAATGTTTTTATTTGGTCTTCCCTCCTTTAATCAAAAGTGAAGGAAATGGAGATGCACCCAACAAATATCTATCATTATTATCCTCAACTTTCATAAAATAGTAATTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAAATTACTTCTTTAACCCGACTGAATATCTATTATTTTTAAATTGATATATTTAATTTTTTTAAAAAAATAATTGTTGAATTGAATATGGGAAATTCAATTCCAATAATTGAAAACATAAAATGGTAAGTGGGAATTAATGATGCATAAATATGAGTTGCGCTTTAATTTATGTGACCAATAATTGAATGGTTTATTTACTCATAGTCAACAAATATTGGAGCCTTGAAGTACAAGGTATTTCTATAATTTCACACGAATTAAATATTAAATGTGAGGGTGCAATGTAAGTTTCAAAAAAATTATTAATTTCTTTTAATATAGGTATCAAGATTTAACATCTCACGGTTGAGGTGGTTAGAGGTGGACAGACCAACCTAAGTTCTCATACAAACAAAAAACATTAACTTAACCACGTCAATGCAATCCTCCATTGTCAAACAAATGCGTACTTTGTACGAGGGTTCTAGAAAAGGAGTCGAGCTCGATGTTAATAGAATCATCAAGTATATCCTTTGTTCGAAATGAAATCTCGATTAACTCGACTCTAATATTAAAACGAGTTCGTGGCTGGGTGAGAGAGGGCTGGGAAAGGGAGGGGAGTGGAGTTTAGAGGGGAGGGCATATAATAAGCACTATGGAAAGGGAAAGGGAAAGGGAAAAAGTGGAAGTGGAGGGTGGGTTTAATAGAATGGGGGAAAGAACAAAGTAAGAGTATTTAAGTAGAAATTGGGCACCACTTTTTTGATTTTGATGCCAACTTTAAAGGATGAAAGTATTTAGCCTTCCCCCTCAACTCCATCACCACCATCCACCTACTTATTCTACTTACTCTAATGTCATATAGCATATAGTTTAATATGGTTTTATGAGTTGACCTAATAACCAAAACTTTATCATATACGCAACATTTATTAACAACGACATTTTGTGAAAGCCTATGATCCTCGATAGCTCAACTAAACATAGCCTATGACAACTTTTGATATAGCCGGCGTTCATTGTTCATAAAACACTCTTAATATATAACCCAATCTTTTTATTTTTGGAGGAAAATTATAAGATACGGTGTAAGAAAAGTGTAATGGGTATTGGGTTAGCTAACTCAATTGAAGGAGTGAGTGATCTAAGTCCATTGTGGACCATTTTATGCATCATTGTCTCCTCCACTATCTACCAAAAAAAAACAACCTATCTACTACTTAAATGGATAAAAAGAGGTAACCAAAATGTGGTCCTTTTGTTTATATATACCCTACTTCTTCATCTACCTTTTCCTTTTTGCATTTTCCATTATTACTCTTTTTCCTCCAAATTGTCTTCCAAGGCTAATTTACTGATATTTTTTTGTAACGGTCCGAGACTGTTACTAATAGATAT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mRNA sequence

ATGAAGACAACGGTGAAAGTTATGGCAAATGAAAAGGCAATCTCCAAAAAAGAGAAAAAATCATTCCGCGATTCAACATTCTGGGATCTTCCTTTCCCCGCCAAATGCAATTTCTGTATAATCAGTCCTCTTTTCCCCCGATCCACCTCCCATCACCGCCAAAAGACTCATCTATGGAACCCAATTAAGAAGAACCAAAAGGGACCTCCATTCTTCTCTATTTCCGTGGGTTTTAGATTGATTGCTCTGTCCGGTTGTTCTGGGCTTTCCCTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAAGACAACGGTGAAAGTTATGGCAAATGAAAAGGCAATCTCCAAAAAAGAGAAAAAATCATTCCGCGATTCAACATTCTGGGATCTTCCTTTCCCCGCCAAATGCAATTTCTGTATAATCAGTCCTCTTTTCCCCCGATCCACCTCCCATCACCGCCAAAAGACTCATCTATGGAACCCAATTAAGAAGAACCAAAAGGGACCTCCATTCTTCTCTATTTCCGTGGGTTTTAGATTGATTGCTCTGTCCGGTTGTTCTGGGCTTTCCCTTTAG

Protein sequence

MKTTVKVMANEKAISKKEKKSFRDSTFWDLPFPAKCNFCIISPLFPRSTSHHRQKTHLWNPIKKNQKGPPFFSISVGFRLIALSGCSGLSL
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh20G001480.1CmaCh20G001480.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:

None

The following gene(s) are paralogous to this gene:

None

The following block(s) are covering this gene:
GeneOrganismBlock
CmaCh20G001480Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB262
CmaCh20G001480Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB470
CmaCh20G001480Cucurbita maxima (Rimu)cmacmaB491
CmaCh20G001480Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0530
CmaCh20G001480Cucumber (Gy14) v1cgycmaB0678
CmaCh20G001480Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB550
CmaCh20G001480Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB555
CmaCh20G001480Cucurbita moschata (Rifu)cmacmoB570
CmaCh20G001480Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB553
CmaCh20G001480Wild cucumber (PI 183967)cmacpiB569
CmaCh20G001480Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB548
CmaCh20G001480Cucumber (Chinese Long) v2cmacuB562
CmaCh20G001480Melon (DHL92) v3.5.1cmameB519
CmaCh20G001480Melon (DHL92) v3.5.1cmameB521
CmaCh20G001480Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB475
CmaCh20G001480Watermelon (Charleston Gray)cmawcgB489
CmaCh20G001480Watermelon (97103) v1cmawmB511
CmaCh20G001480Watermelon (97103) v1cmawmB531
CmaCh20G001480Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB564
CmaCh20G001480Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB572
CmaCh20G001480Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB586
CmaCh20G001480Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB592
CmaCh20G001480Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB500
CmaCh20G001480Bottle gourd (USVL1VR-Ls)cmalsiB522
CmaCh20G001480Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB390
CmaCh20G001480Cucumber (Gy14) v2cgybcmaB799
CmaCh20G001480Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB595
CmaCh20G001480Melon (DHL92) v3.6.1cmamedB598
CmaCh20G001480Silver-seed gourdcarcmaB0345
CmaCh20G001480Silver-seed gourdcarcmaB0575
CmaCh20G001480Silver-seed gourdcarcmaB1267
CmaCh20G001480Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0658
CmaCh20G001480Cucumber (Chinese Long) v3cmacucB0676
CmaCh20G001480Watermelon (97103) v2cmawmbB563
CmaCh20G001480Watermelon (97103) v2cmawmbB577
CmaCh20G001480Wax gourdcmawgoB0693