CmaCh02G013870 (gene) Cucurbita maxima (Rimu)

NameCmaCh02G013870
Typegene
OrganismCucurbita maxima (Cucurbita maxima (Rimu))
DescriptionUnknown protein
LocationCma_Chr02 : 8068226 .. 8071779 (-)
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexonthree_prime_UTR
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ATGCCATTAGTTTGTGTTAAACTAATGTTACTATTGCATTTGGGTTGCTTCCTTCCATTTCTTAATCTGGGTAGTTTATGGGCAGCTAAAGGGTACATTATTAGAAGTAATTAGATTCTATTTTTGTGAGATCCCACATTGGTTGGAGACGAGAACGAAACATTTCTTATAAGGATGTGGAAACCTCACCCTAATAAACGTGTTTTAAAACACTGAGGCTGATAGGGATATGTAATAGGTCAAAACGAACAATATCTGCTAGCGGTGGGTTTGAGTTGTTACAAATGGTATTAGAGCTAGACACCAGACGGTGTGCCAGCGAGAACGCTGACCCCCAAGGGGTTGGATTGTGAGATCCCATATCGGTTGGAGAGGAGAACGAACCATTCCTTATAAGGTGTAAAAACCTCTTCCTAACAGACGTGTATTGAAATCGTGAAGCTGACAACGATAGTAACGAGTCAAAGCGGACAATATCTGCTAGCGGTGGGTTTGGGCTGTTACAATTTTAGTACTTAAGATCCAAATGTTTTGCTCTATGTGTGTTTTGTTTGTTGTTAGCTTCTCTGTTTCTTTTCAAGTTCTAATTAGGTTCCACTTTTAGTGCTTCCAAAGATTATCTCATACATGTGTATGTATGCGAGTAGAAAGTTGCATATATAGCCGTGTTAACAATGTTTTAGGCTCTGGCTTACACTAAGTAAGAAGTGATTTCTTTCTTAAGAAACCCCATGAGCCTTTTACTCTAGCAACTCTAGAAATCGAGTACTCATGAGTTGGTTGTATTTTTGTCCTAGGATGGCTTCATCTCTGAGACTTCTAAACAAAGTTATTCTAGTCGAACTCTTCGTTAAGTTGAAAATGATATCCTAATTCACTTGTTGGTGGTAAAGCAGGATTATCAAGGACAAGAAAACCTACTAAACAATATTCAGATGTTTGAGAGCATTTTACTGAAGTAGAGGGATGCTAGGCTGAATTTTATAGGGCTGCTTATAAATATTAGGCTAAATTAATAAAAATGCTCTCAGACTTTTCACATGTTTTTGAACTTTTAAAAGTTTCAATAATGCCTTTAAACTAAAATTAAAGTTAAAGTTTTGGGGGACAACCATCAGTATTTTGTTTCAAATATATCTGTGAACTTTTAAAAGTGTTTCAAAATATTCTTGAACTTTCCAAAGTTTCATTAATATCCTAAAACTTTTTTAAAACTTCAAAAATATCTTTATCGTTGGAATATGGCTAGAATTGTTAGTATCACGTTTCAAAAATACCTATGAACTTTTTTCAAATTTTTAATAAGTTTCTAGAGTTAGTATATAAACAAAAATAGTTTATCTTCACTCCATAGATCATCTCCCTCTTTGATTGTCTCTCTCTTCTTTGCTTTTACCCCTAACAATTTCTCATTTCTTTTTTCTTTTTCTCACTTCTCGAATATCCTATTAATCCCCTTCTTTTCCACAATCTCTAAAAATTCGTCCATTTATTTTATTTTCTTTTTTACTCTTTTTAAATAACAAAACTTTGATGGAAATCTCTCATTTGTGAGCATTTCTAGACATACAAAAATTTTCATCACGCAAATAGACAATATGTTTTCAAATTGCCTATTTGGGTATTAATGTTTCATATTTATGTTTATAAATGCTCAACAATGAGAAGCTTCTCCTTTTCATTTAGAGTTTTGATATTTAAGAAGAGAAAAAAGAGAAATGAGGGAAGTTTTAAAGATTGAGGAACAAAAGAAGGAGAATAAGAGGATATTCAAGAATCAAGACAAAAACGAGAAATTGTTGAGCCATAGGTTGAAGTAGAGGAGAGAGATGAAATTGAAGAAGGAGATTTTTGTTTAGGGTTTAGATAAACAGCTTACGTCTAAATATTAACCGTAAGAACTTGTTTAAGGCTAAGGGTATCAATTCTACTTTTGAAAGTTCATGGGTATTTTTATAATGTGGTATTAACGGTAAGGGTACTTTTTAAACTTTTTTTAAAAGTTCAAGGGCATTAATAAAACTTTTGAAAGTTAAAGGGTATTTTTAGAACAAAGTACTAATAGTTTCCATCCAAAACTAATGGTTAGAATATTTTTGAACTTGTGTCAATAGTTAAGGGTATTATTGAAATTTTTGAAAGTTCAAGAATATTTTTGATGCAAAGTACAAAGTTCGAGTGTAATTATATTAATTTAGCATAAATATCACGGGGCTACATATGCACGTGATTCTTAGGGGAAATGGGGCAACAAATTTTAAAAGGCACTTAGGAGAAATGTAAGAAGTATACAAGTTAAAGAATTATGTTGAAGGAGATTCTAAATGTAATTTGATAACTAATCTTTCACTCAAGAGAATTATTTAACGATGTTTGCTTGTATGGTCCTATTGAATGAATTGCCATTTAAGTTTGTAAATGAAGAATTTCATAAATTTTGTAAGGCATTAAATCCTAAGTTTGTAATTTCATAACGAGTCACTATTGCAAAAGGTTGTTTTCAATTGTACGAGGGAGAAAAAAAGGTTTAAAAGTGCTTTAGTTCGAATAGCCAAAAAGTTTGTTTAGCGTTTGATACACGACTTTCATTCATGATATTAATTACAAGGTTATAAAGAAGAGGAGGTGGGGAAAAAAACTTGACCAAACCATTGGCGGATTCGTTTTTGGAGGGGGCTTATTTGCTTTTCTGTTGATTTCTCAAGCGTTCTTTCATGGTTTTTCATTCTTTCAACTCCAAGGTTCCTGTCTTCATCTCTCCAGATTGCATGCAAGTATACCAAGGTTAGCTATTTTGTCCCAAACACTCCAGTCTTCCTCAGGTTCCTTCTATTTGAAACTGAATTGGCTGCCTTAGTTTCATCATTTAGAATTGACATTCCTTAAGATTCTAGTATTTTTCTCTAAATTTTGCAGAGCTTTACGTTGCCGGATGTCCTGTATTGTACTGAATCATTTGTTGGGCTGCTTATCATTCATGTAGATAAGTTTAGGTCTGTGGGAATTCGAATGTTTATATTATATTTGTGGGTCTTTGTTACGTTCTTCCTTGGAGCTCATTGATTGATAATTCAAGTTTCACAATCTCTAAACGTTCAGGTCAGGCTCCACTTGAGCTAAAATCTTTGATTTTCTCATGCATTCTAGAATATTGCAACGTTTATAAAAAGTTCAAATGTTTTTCTTTTCCTCTTTTGTTTTCTTGACTTGGTGTGATTTTATTTATCTTTTTTGTTGGAAATGGCTACCACTAAGCCTAAATATACTTAATTAGATATTATGCATATCCTTATAGCGTGTGTTTGCTTTATTAATTATTTCATCATGTGCCCAATCTGCATCCCTGGTTCAAGCTGGAGCCAGCTTTCTTTCTTAATGGATTCAATCTCTCTTTTATCGTCAATCTGTTGAATTGTAGCTCAATTGCAACCTAACTAGGATCATTTATTAAGTTAACAGATCTATCGTGATGAATAATTAATATAATAGAAGTTCCTCTACTTTATTTGCTGGTTCTTTAAGCTTTAATGTTTCCGTATGAAATTGAGTAATGA

mRNA sequence

ATGCCATTAGTTTGTGTTAAACTAATGTTACTATTGCATTTGGGTTGCTTCCTTCCATTTCTTAATCTGGGTAGTTTATGGGCAGCTAAAGGGGGGCTTATTTGCTTTTCTGTTGATTTCTCAAGCGTTCTTTCATGGTTTTTCATTCTTTCAACTCCAAGGTTCCTGTCTTCATCTCTCCAGATTGCATGCAAGTATACCAAGAGCTTTACGTTGCCGGATGTCCTGTATTGTACTGAATCATTTGTTGGGCTGCTTATCATTCATGTAGATAAGTTTAGGTCTGTGGGAATTCGAATGTTTATATTATATTTGTGGGTCTTTGTTACGTTCTTCCTTGGAGCTCATTGATTGATAATTCAAGTTTCACAATCTCTAAACGTTCAGGTCAGGCTCCACTTGAGCTAAAATCTTTGATTTTCTCATGCATTCTAGAATATTGCAACGTTTATAAAAAGTTCAAATGTTTTTCTTTTCCTCTTTTGTTTTCTTGACTTGGTGTGATTTTATTTATCTTTTTTGTTGGAAATGGCTACCACTAAGCCTAAATATACTTAATTAGATATTATGCATATCCTTATAGCGTGTGTTTGCTTTATTAATTATTTCATCATGTGCCCAATCTGCATCCCTGGTTCAAGCTGGAGCCAGCTTTCTTTCTTAATGGATTCAATCTCTCTTTTATCGTCAATCTGTTGAATTGTAGCTCAATTGCAACCTAACTAGGATCATTTATTAAGTTAACAGATCTATCGTGATGAATAATTAATATAATAGAAGTTCCTCTACTTTATTTGCTGGTTCTTTAAGCTTTAATGTTTCCGTATGAAATTGAGTAATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCCATTAGTTTGTGTTAAACTAATGTTACTATTGCATTTGGGTTGCTTCCTTCCATTTCTTAATCTGGGTAGTTTATGGGCAGCTAAAGGGGGGCTTATTTGCTTTTCTGTTGATTTCTCAAGCGTTCTTTCATGGTTTTTCATTCTTTCAACTCCAAGGTTCCTGTCTTCATCTCTCCAGATTGCATGCAAGTATACCAAGAGCTTTACGTTGCCGGATGTCCTGTATTGTACTGAATCATTTGTTGGGCTGCTTATCATTCATGTAGATAAGTTTAGGTCTGTGGGAATTCGAATGTTTATATTATATTTGTGGGTCTTTGTTACGTTCTTCCTTGGAGCTCATTGA

Protein sequence

MPLVCVKLMLLLHLGCFLPFLNLGSLWAAKGGLICFSVDFSSVLSWFFILSTPRFLSSSLQIACKYTKSFTLPDVLYCTESFVGLLIIHVDKFRSVGIRMFILYLWVFVTFFLGAH
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmaCh02G013870.1CmaCh02G013870.1mRNA


The following gene(s) are orthologous to this gene:
GeneOrthologueOrganismBlock
CmaCh02G013870Cp4.1LG05g02930Cucurbita pepo (Zucchini)cmacpeB647
CmaCh02G013870Carg02580Silver-seed gourdcarcmaB1268
The following gene(s) are paralogous to this gene:

None