Cucsa.365640 (gene) Cucumber (Gy14) v1
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGCATTCTCTCTTCATCAGCGTCCCAAGCCACCAATTGTTGATGGGGAAGATGGTGATGATATCAATATCGATGTTTATAATGCCGGAACTCCGATTCGCTACCTTTCTCTTGATCATGTCTACTCCACTACTTCTCCTTTTGTTAGTACAAGTGGGTCTTCCAATGTTATGTCTAAAAAGGTGAAAGCTCGGAGGCTTATGGTCAATCACTTTGACGATCTTAATTTCAAGCCCCCTCGTTTGCTCCATGTTTATTCTCGCCGCCGGAAGAAACCCCGCCACTCCTCTGCAAGTTCCTCTATGTACGACTCTTTGGTTGAGCAGGTTGAATTGGGCTCGACAACTGTTATGGAATCTGAAGCTTGTGAGACTGATGAGATGGTGAATGGTGTGGACGGCCATGCAGAGGAATTTGAAGTCGATAGAACGCCCAAAAATAAGAAAAAGAAGAATGATAAGTTTGGGTGTAATGAGCTTGTTAAATTGGAGGTTGATTCCAGTGTTATTCGTACCATGAATGGTCCTAGGTTGAGAGACTGCCGCACTCACAGCAATAACAATAATAATTCTGGACAGAGTAAGAAGCGCAATTCTTCACAAATTTCTGAGAAGACCACGTTCAAATCTCCTACTGCTAAGAGATGGGTCAGGTATTGGTTTCTGGTTTTCGAGTTACAATTTAAGGACTCAAATGTGTCGTTTGAAGCATTTTCCATAAAGTTTTTCTATCTTGATTTTTGTGTAGTTGTTTCTTAATTAGGCAGTTCTATTTACTGGAATATAATCAATTATCAAATCACAGGTTAAGTTTTGAGGATGTTGATCCGAAAGTGTATGTTGGATTACAATGCAAGGCAAGTCATTCTGTCTGTACCTCTGATTTGAATCATCTTCTTGGAATATGCTTGAAATGATATGGTACTTCACAACATCACAGGTTTATTGGCCATTGGACGCTCAGTGGTATTGTGGTCGTGTTGTGGGCTATAATTCAGAGACCAGTTGTCATCATGTATGCTCTCACTCAATTTAACCTCACAGTGGTGTTTGATATAAGTACTTACTGTGAACTGTAAATTATGTGTCTTCTCCTGTATTGATCTTACGTATATAATTCAATGTAGATTGAATATGAAGATGGGGATAGAGAAGATTTGGTTCTTTCAAATGAGAAAGTCAAATTCCATATTTCCGGTGAAGAGATGCAGACTTTGAACTTGAATTTTGGTGTTGATAGTGTAGATAGCGATGCTTATGATTACAATGAGATGCTAGTGTTAGCAGCAACCTTGGATGACTGTCTGGAACCTGAACCTGGAGATATTGTTTGGGCCAAACTTACTGGTCTGTGCTTTATCCCTTCCCTTTTCCCTTAGTTTTTTCCTCCTCTTTCTCATTTTAAAATGGAAAAAAAGAAGAACAGTAATGAAAATAAAGAATAAATGTCTTCAAAAATAGTAAACAAGAAAGTGGGAGTGCTGGCTATTCCTGAAAAGGAAAAAGAGATGAAGGAAACAAGCACCATCTTCAGGTCCTCTGTTGTGAAAACAAATGGCTTTTGGAGCAAACAGATTGTGCTTCTCTTAGTGAATGCATTTATTTATTTTTTGATGAGAAGCATTCAATATTAATTTCATTGATAGAATGAAATTACAAGAGGGCAAATGTGCCATGGGAGTTCATAGTACTTTTCCAATGTGCAATAAAATAAGGGATGTAAGATGGTAACCACAAAAAGTAGAAGTAAATCATTTATCTGTTTCTTAACATATTGTGAGAGGGCGAAAATCAAAATTTAAATAATGGAAATAGGAAAACATGAATGTGCTGTACCTTTCTGCAATGCTTCAAGCTTAACTGTTGCTATGGTCTATGGAGAGTATGAAATCAGGAGTGGGGCAGTTCATGTATGGGTTTTGTTCAACGTCTGAGAATTTGTTGTGTCTGGCTGTGTTTTCTCTAAAATTTAAGTTTAAAGTTGGAAGGAAGTGAAGAAATTGCTTAATTAAAATTGAGAGTTGATATTGAAATTGATTAGGAAGAATAAGCCAGAATTGAAGAAAAAATAGAATTGTTTGGCTAGAACTGAAGAGGGAGGCAATATCAAGGATTCAATAGCAAGATGAAAGGATTTATTGAGCAAGAAAAAACACCTTCGGTAGTGGAGTCCTTTTGTTAACCTTATCGAATTGTTATGGTGATAGAAATGCAAATAAAAGTTGGCTTCTTATAAAAATTGATAATTCTTGCTAGGGATGATTTATTTAATCAAATATATTTTTATTACTTCTTTTGTTAGTTAAATGCAGGTCATGCTATGTGGCCAGCAATTATAGTGGATGAATCACTCATTGGTGATCGGAAGGGGTTAAGAAATATTTCAGGAGGAAGGACAGTACCAGTTCAATTTTTTGGTACACATGACTTTGCGAGGTTTGTGAACTTTCTGGTTTAAAATGAACTATATTTGTCTGGTCTGATGTACCAGAACTTTGGACGATTATTTGTTGGGTATGTGCACACTGACCAGTTTTTTCTTTGGTCCAGGATTAAAGTAAAACAGGCCATCTCATTTCTCAAAGGTCTTCTTTCTTTTTTCCACCAGAAATGCAAGAAACCACACTTCATGCGGAGCCTTGAAGAGGCAAAAATGTAATGCTGGATTGATTTGGCTTCTTATATCAAAAAAGAAATGATTATGACATTTATTTCTCCCAAGTCCCTATAATTGTTTATCCCAAATTAACTCATTTGACTGCCTGACCGCTGATTTTTGTTAGCAGTGTCAGCTCTGTCAATTTATAGTTACCATGCTAAGTACCTAATGAAGCTATCTTTACTTTGAATTGGCAGATTCTTATTGAGATATAGTTGTTCCTTCGTCCAAGTACGGAAATTTAGTTTTTATATAGTTACTTTGAGAGCATGGTTCTATCTCTATCAATCTCCATTTCAATTGAAAACTAGCATCATGAATAGTCCAAAACATAAAACGAAACTGAGTATGATGATGTAAGAAGAGCTTTGTTGGTTCTTATTTATAGAAGAAATTTACTGACTTGCCTGTTGAAGCAGGTATCTAAGTGAGCAGAAACTTCCACCAAGTATGTTACAGTTGCAAAATGGAATTGAAGTGGATGATTTTGCAAGTGCAAGTGGAGAAGAAGAAGGAACAACAGATTCAGGGGAAGAATGCCTAAATGAAGGAGGAGGGGTCCGTTGTGCACTCAATGGATATAGATCTCCATTTAAAGTTGGGGATTTGGAAATAATAAGCCTTGGTAAGTTTTGAATTACTACTTTTCCTAATGTACTATAGGATATCTTGGAATGTTGATTATCATGCGCTGATTTTGAAATTGTAGGGTATGATAAAATTTGAATTGGTATTGTTCTTAAATGTTATATAGGTTAATTTGACTTGTTAGTTCTCAGAAGAACTAGATAACGTCGTGGGAAAAATGATCAAAATCTTCATTTTACTTTTGACAAATAACATACTTTTGAGGTAGGTATAGTAATCTTTTGATATGAAATAACATTGCTATTAGTCGTTTTTTTTATAAGAAATATTTACTTGATTAATGAAATAGGGGAAACCCCAAAAGCCAAAAGGCAGTTACATGAAGCATTTCCAATTGGAAACTAAATAAGATTAACTGTAGGTATAGTAATCTTTTTGATATGAAGTAATATTGCTATTGTTCTTTTTTTTTCTCTCATTTGATAAGAAATATTTCATTGATTAATGAAATAGGGGAAACCCCCAAAGACAGAAGGCAATTACAAGAAGCATTTTCAATTGGAGACTAAATAAGATGAACTAAAATGATTAAAAGGGTGCTTATCCTTGCACCAATAAAAAGTCATAGACAAAACCAAATCCATAAATCTATGAAAGAGGATAAAGAATCCTTGAAAAGGGTGTCACACCATAGAGTCCATAGCTATTATTAGTCTTTTCTACGAGCACACTTTCCAAATATAAGAAAAGTGACTGATAGGTTCTGCCTTGCTATCTTTATGAATTTTTTCTTCTTGTGTCACTTAATTGGTGTAATTGGGTTTCTCCTTTGTGTAATTATCACTTAAACTCCCTGATTGCCCGTTGGAGAATATTTTTTTGTAACTCTTTAAACTGGCCTCTCATTTTGTAATTTCACTTATATCTATGGTACTGGTGGCTATGTGGCAAGTTGTCAAAGTATGGAAAAATAAGGGTAATTGACTAATTGTATATTAATCTTAAGCAACCTTTTTATTAATGTTTATAAGCACATTTTTTTGTTCTTAGGGAAGATCGTCAAAGATTCTAAATATTTCCAGAATGATGGGTCTGTATGGCCCGAAGGGTACACAGCTGTGAGGAAATTTTCTTCTTTAACTGGTGGATATTTGAACTTTTGTAATTATTATTTTTGAAATTATTCTTATTTTTTCAGATATTTTTACACCTTTTCAACATGATGAATTTCTAACACTATTCTTGTCATCTCTTTTGCTTGTTTCCAGATCCCAATGTCTGTACTTTATATAGAATGGAAGTTCTGAGGGATTTTGAATCAAAATTTCGACCATTGTTTAGAGTAACTTTGGATAATGGAGAGCAGGTCAGTTTGTTAAATTGAATCGATATACTTGCATTTGAATGTTATTTCAGTTCTTTTATTCTTTCGATGAGAAATAATTTGCATGTTAGTTCTCTTTTTACTTCAGTTTATGATGGCTTTTTTGGTGCTTTAAAGTTGCAAATATGATATATATAGAAAGCAACTGCTGTGAATTGGATGGAAGCCAGATACTATAATCACCAATAAACTTATCAAAGTGCCCTTCCAATAGAGAATCATCATGGAAGAACAGTCTATTATTCAGTTTTTTGTCAATAGAAGTTATTTGGTTGAAGCCTTTCAGTGAGTGTAGTATTTTTTTGGTGTTGGATCATCATTTTTCACTTACAGTGGGTGTTTAATAGCTTGGTTAAGGTC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MAAFSLHQRPKPPIVDGEDGDDINIDVYNAGTPIRYLSLDHVYSTTSPFVSTSGSSNVMSKKVKARRLMVNHFDDLNFKPPRLLHVYSRRRKKPRHSSASSSMYDSLVEQVELGSTTVMESEACETDEMVNGVDGHAEEFEVDRTPKNKKKKNDKFGCNELVKLEVDSSVIRTMNGPRLRDCRTHSNNNNNSGQSKKRNSSQISEKTTFKSPTAKRWVRLSFEDVDPKVYVGLQCKVYWPLDAQWYCGRVVGYNSETSCHHIEYEDGDREDLVLSNEKVKFHISGEEMQTLNLNFGVDSVDSDAYDYNEMLVLAATLDDCLEPEPGDIVWAKLTGHAMWPAIIVDESLIGDRKGLRNISGGRTVPVQFFGTHDFARIKVKQAISFLKGLLSFFHQKCKKPHFMRSLEEAKMYLSEQKLPPSMLQLQNGIEVDDFASASGEEEGTTDSGEECLNEGGGVRCALNGYRSPFKVGDLEIISLGKIVKDSKYFQNDGSVWPEGYTAVRKFSSLTDPNVCTLYRMEVLRDFESKFRPLFRVTLDNGEQFKGSSPSACWNKIYKRMKKIQHTSDASTETKGEFVYKSGSDMFGFSNPDVKKLIQGISKSGLSSSRSLSKVASKKYKDFPIGYRPVRVDWKDLDKCSVCHMDEEYENNLFLQCDKCRMMVHARCYGELEPVDGVIWLCNLCRPGSPDCPPPCCLCPVIGGAMKPTTDGRWAHLACAIWIPETCLSDIKKMEPIDGLNRINKDRWKLLCSICGVSYGACIQCSNNTCYVAYHPLCARAAGLCVELEEDDRLHLLAADEDEEDQCIRLLSFCKKHRPPSNERLMAEDRIGQAGQQCSNYTPPCNPSGCARTEPYNYFERRGRKAPEAVAAAALKRLFVENQPYIASGYSQHLLSGNLLPSSGVLGMKFSLQHLKTCQLDPRNILSVAEKYKFMRETFRKRLAFGKSGIHGFGIFAKHPHRAGDMVIEYTGEIVRPPIADRRERFIYNLLVGAGTYMFRIDDERVIDATRAGSIAHLINHSCEPNCYSRVISVNGDEHIIIFAKRDIKRWEELTYDYRFFSIDEQLACYCGYPRCRGVVNDTDEEERVSKLHVSRTDLVDWRGE*
BLAST of Cucsa.365640 vs. Swiss-Prot
Match: ATX2_ARATH (Histone-lysine N-methyltransferase ATX2 OS=Arabidopsis thaliana GN=ATX2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1317.0 bits (3407), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/1094 (60.60%), Postives = 805/1094 (73.58%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. Swiss-Prot
Match: ATX1_ARATH (Histone-lysine N-methyltransferase ATX1 OS=Arabidopsis thaliana GN=ATX1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1268.4 bits (3281), Expect = 0.0e+00 Identity = 649/1106 (58.68%), Postives = 801/1106 (72.42%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. Swiss-Prot
Match: ATX5_ARATH (Histone-lysine N-methyltransferase ATX5 OS=Arabidopsis thaliana GN=ATX5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 261.5 bits (667), Expect = 4.1e-68 Identity = 165/487 (33.88%), Postives = 240/487 (49.28%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. Swiss-Prot
Match: ATX4_ARATH (Histone-lysine N-methyltransferase ATX4 OS=Arabidopsis thaliana GN=ATX4 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 258.8 bits (660), Expect = 2.6e-67 Identity = 164/481 (34.10%), Postives = 242/481 (50.31%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. Swiss-Prot
Match: TRX_DROVI (Histone-lysine N-methyltransferase trithorax OS=Drosophila virilis GN=trx PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 160.2 bits (404), Expect = 1.3e-37 Identity = 77/156 (49.36%), Postives = 106/156 (67.95%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KAQ5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_6G022310 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2291.5 bits (5937), Expect = 0.0e+00 Identity = 1104/1104 (100.00%), Postives = 1104/1104 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TrEMBL
Match: A0A067LFK8_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_23831 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1622.1 bits (4199), Expect = 0.0e+00 Identity = 785/1104 (71.11%), Postives = 908/1104 (82.25%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TrEMBL
Match: M5XKJ9_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa000574mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1591.6 bits (4120), Expect = 0.0e+00 Identity = 777/1101 (70.57%), Postives = 908/1101 (82.47%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TrEMBL
Match: B9SP39_RICCO (Phd finger protein, putative OS=Ricinus communis GN=RCOM_0617250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1565.1 bits (4051), Expect = 0.0e+00 Identity = 772/1126 (68.56%), Postives = 910/1126 (80.82%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TrEMBL
Match: A0A061EJ66_THECC (Trithorax-like protein 2 isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_020057 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1559.3 bits (4036), Expect = 0.0e+00 Identity = 770/1089 (70.71%), Postives = 889/1089 (81.63%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TAIR10
Match: AT1G05830.1 (AT1G05830.1 trithorax-like protein 2) HSP 1 Score: 1317.0 bits (3407), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/1094 (60.60%), Postives = 805/1094 (73.58%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TAIR10
Match: AT2G31650.1 (AT2G31650.1 homologue of trithorax) HSP 1 Score: 1268.4 bits (3281), Expect = 0.0e+00 Identity = 649/1106 (58.68%), Postives = 801/1106 (72.42%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TAIR10
Match: AT5G53430.1 (AT5G53430.1 SET domain group 29) HSP 1 Score: 261.5 bits (667), Expect = 2.3e-69 Identity = 165/487 (33.88%), Postives = 240/487 (49.28%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TAIR10
Match: AT4G27910.1 (AT4G27910.1 SET domain protein 16) HSP 1 Score: 258.8 bits (660), Expect = 1.5e-68 Identity = 164/481 (34.10%), Postives = 242/481 (50.31%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. TAIR10
Match: AT5G42400.1 (AT5G42400.1 SET domain protein 25) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 3.8e-32 Identity = 69/156 (44.23%), Postives = 103/156 (66.03%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. NCBI nr
Match: gi|778709929|ref|XP_011656480.1| (PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase ATX2 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2291.5 bits (5937), Expect = 0.0e+00 Identity = 1104/1104 (100.00%), Postives = 1104/1104 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. NCBI nr
Match: gi|778709922|ref|XP_011656479.1| (PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase ATX2 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2286.1 bits (5923), Expect = 0.0e+00 Identity = 1104/1107 (99.73%), Postives = 1104/1107 (99.73%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. NCBI nr
Match: gi|659128699|ref|XP_008464329.1| (PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2239.5 bits (5802), Expect = 0.0e+00 Identity = 1079/1105 (97.65%), Postives = 1090/1105 (98.64%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. NCBI nr
Match: gi|778709933|ref|XP_011656481.1| (PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase ATX2 isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2192.5 bits (5680), Expect = 0.0e+00 Identity = 1060/1063 (99.72%), Postives = 1060/1063 (99.72%), Query Frame = 1
BLAST of Cucsa.365640 vs. NCBI nr
Match: gi|778709936|ref|XP_011656482.1| (PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase ATX2 isoform X4 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2192.5 bits (5680), Expect = 0.0e+00 Identity = 1060/1063 (99.72%), Postives = 1060/1063 (99.72%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of cucumber (Gy14)
Date Performed: 2017-01-17
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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