MELO3C023197T1 (mRNA) Melon (DHL92) v3.5.1
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGTTCCAAAAAGGATCCAGACTAGACAATTTTCTAGAAATACAGTCAGCCGAGCCGCTTAACTTCCGAGAAGAGCCAGCATGGCGTTGTGTATCTCTATTCCTTCCTTCTCCGATTCTGTTACCGCTCCTTCCCTATCTCAAACTTATTTCAGTCTCAGTCGCCGGCGGCCTTCCAATTTCATCCATTTTCTTAATTTAAGCCTTCCCAACCGCCCACCATGTCTTTGCCGAGCTTCCAATTCTCAGCCTGGACCGTTCCCCAAACAGTCTGCTTCTGCTTCTTCTAAGAAAAGGAAGAAAAAGGATAAGGGAGATTCCAAGGTTTTTAATCCTAACAACTTCGAAGTTGTGGACGATTTTAGCTTCGATGACGCTGGACCTTCTAGCTCCACTTCCACTTCCACTTATTTGTCGTACCATCCTTCGACCTTGCCCAAACCGCCAGCTGGGTTTGTACTAGACGACCATGGAAAGGTCCTCATGGCTTCAAACAAGCGAATTGCTACCATGGTAACATTTTTTTCTCAGTTCCCTCATGGAGGATTTGTTTAAAATTGGTATCATTTTAGTGCTTCCCTGTTCACCTAACCTCTAGTGCCTTTTGATTTTCATGTATGAACGAGAAGTTCAGAATATGTTAAACCACCAATATTAATAGGATATAATAGGAGAAACAAGGGGAAGTTGGCACAGGATAGGTTAGTTAGAGATGTGGAGGAGAATTCGGAAAGAGGAAACTATAGTGGTGGGCCCAGCAGTTAGTTGGGATTGGAGAGAGATTTAGGCCGGGGAGATAGCAGAAACAATTGGGCAGAATTTTGGTGAAGTCAAGAGGACTATCACACTCCTTGAGAGACAGGAGGAGTAGTACACTGGTTCTGAATTGTCCTTGTTTTCTTGTTACATTGTTCTGTCTTTTATTTTGTTTTAAATTTGATTGCTGTATCTTTGCTTCAGTTAGGGAAGGATTGAGATTCTAGCCATGCTGTTTTTTGCCTTTTGTTTTCATCGAATATTGTAATTACGTTTGGATAGCAATAAAAGTAGAATCACCATACTGGTATTCTATCAATTTGGTATCAGAGCATTAGAATCTGGAAAAGCGTAAGAAGATGGCCAAGAAAATCGAAGAACTGTTGGATTTTGTGGAATAGGAAATTAGGGAAATGCGAACAGAGTTGAAGAAGCTATCCGCAATGGAGGAGAATATGTCCTCGATTTTGAAGAGTATTGAAAATATAAATGCGCAGATGGAGAAACAACAAACACAATAGCAAGCGATCCTGAAATACATCGAAGGAATCATTCGAGAGAAGGCTGTTACAACGGTTGAATTGGAAGGATCTCCGAGTAGGGGAATGGGAAGCGACTTTACATCTAAAGTGTTGACTGGGGAATCGAAGGGAGAACGAAAGAGGGAGGATGATAAGACATTTGATAGGAGCAAGTTTAAGAAGGTAGAAATGCCGATCTTCAATGGAACAGACCCTCACTCATGGTTGTTTCGAGCAACGTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATCGAAGGGAGAACGAAAGAGGGAGGATGATAAGACATTTGATAGGAGCAAGTTTAAGAAGGTAGAAATGCCGATCTTCAATGGAACAGACCCTCACTCATGGTTGTTTCGAGCAGACCGTTATTTCAAGATTCACAACTAACCGAATTAGAGAAGATGTCAGTGGCTATTATTAGCTTTGATGGTCCGGCCCTCGACTGGTATCGATCTCAGGATGAACGTGAATCTTTCAAGAGTTGAGATGATTTGAAGCAAAAGATGTTAACAAGGTTTCGAACGATCAGGGATGGTACGTTGGTAGGCAGTTTTTTGACGATTAAACAAGAGACCACGGTGAATGAGTATCGAAATAGATTTGACAAATATCTAGCTTTGGTAGCATTCTTACAAACGATGGTGCTTGAGGAGATTTTCATGAATGGGCTCAGCCCATGGTTGAAGACCGAAGTTGATGTTTTGGAACCATAAGGGTTAGCCCAAATGATGAAGCTGGCTCTTAAGATTGAGAACAAAGAGAGTGAGGAAGGAATGTGGGTTGATCAGTGTGTATGAGAGTAAGTTCTAGTACAACCTGCCTAAGGCAAAGGAAGGGACAAAGACCAAAGCAATGGCAGCCACGACTAGTGGAAATACTCCAATGAGAACAGTCACATTCAGAGGAGTCACGACGACGGATAACTGAAGAGAAGGACCTTCCAAGCGTTTGACTGATGCTGAATTTTAGGCTAGGAGGGAAAAGAGGTTGTGTTTTAAGTGTGAAGAGAAATATCATGCTGGCCATCGTTGTAAAGCTAAAGAACACAAGGAGTTAAGAATGCTGGTAGTACGGGAGAATGAAGAAGAGTTTGAGATCATTGAGGAAGTCGGAGGAGAAGAAGTGGTGGATGAGAATGTTATTGAGGTAGGAGTAGTGGAGAATTTGAACATAGAGCTATCCATTAATTCGGTGGTGGGGTTGACCAATCCTGAAACTATGAAGGTGAAGGGAAAGCTGAAGGATGAGGATGTGGTGGTGCTGATTGACTGTGGGGCTACCTACAATTTTATATCTGAAAAATTGGTAACCAACCTAAATCTACCGTTGAAAGCTACAACCAATTATGGGGTGATTCTGGGTTCAGGAGAAGCCATTAAAGGAAAAGAAATTTGTGGAAAAGTAGAGGTATTGCTAGACAATCGGAAAGTAGTGGACAGCTTCTTGCCACTTGAGTTGGGTGGTGTTGATGTCATACTTGGTATGCGGTGGTTGCATTCTCTTGAGTGACTGAAGTGGATTGGAAGCACTTAGTCATGTCCTTTCAGCATGGAGGAAGAAAGGTTATAATTCATGGGGATCCAAGCCTCACTAAGAAGGGAGTGAATTTGAGGAGCATGATGAAAACTTGGGAAGGGGAAGACCAAGGGTTTTTGGTGGAATGCCGAGCTATTGAAGGGAAGGTACCAGTGGCAACCTTTTATGAAGAGGAACTTGAAACAACTGTAGATAATTCCATCCCTCCATTGTTAAAGAAATTTTTAGATGTGTTTGAATGGCCAGAAACATTGCCACCCAAGAGAGGGATAAAGCATCACATTCATTTAAAACATGGTACTAACCCAGTCAATGTGAGGGCTTATCGCATAGCTATCAGAGTAGATGGAAAGATCAGTTGACGAGATGCTGGCTTCTGGAATAATTCGACCTAGCACCAGTCCATATTCAAGTCCTGTATTGTTAGTAAGGAAGAAGGATGGAAGCTGGAGGTTTTGTGTTGACTACCGAGCGCTTAATAATGTCACCATACCGGACTAATTTCCAATTCCTATCATTGAAGAGCTGTTTGATGAGTTGAATGGTGTAAAGATGTTTTCCAAGATTGACCTTAAAGCTGACTATCATTAAATACGGATGTACTAAGAGGATGTGGAAAAGATAGCCTTTCGCACTCATGAAAAGTTTTACACCATAAGTACCTCCATATTACACTGAGTGGGATTCGACAATAGGTTTGAGTTAATGATTAGAAAACTTCCTTTTCTCGATCTTGATTCCTAGTCATGCCTTTTGGTTTGACTAATGCACTTTCTACTTTCCAAGCCATATATGAGGAGGTTTGTACTGGTTTTCTTTGATGACATCCTAGTATATAGCAAGGGATTGGAAGAACATATACAACACTTGGAATTGGTGCTGGAAATTCTGAGGGCAAACGAGTTGTATGCTAATCTGCGCAAGTGCAGTTTTGCTAAGGAGAGAGTGAACTGTTTGGGGCATGTTATCTCTGAAAAAGGAGTGGAAGTGAATCCCGAGAAGATTAGGGCTATTAGAGAATGACTTGCTCCAACCAATGTACGTGAGGTAAGAGGATTTTTGGGTTTGATTGGATATTACCATAGATTTGTACAAAATTATGGCAGCATAGCAGGAACCCTTACTCAGCTGTTGAACAATGGGAGTTTCAAGTGGAATGAAGAAGCCGAAACTTCCTTTGAAAAGCTAAAGACAACTATGATGACCTTGCCCGTGTTAGCAATGCCAAATTTCAATTTGCCTTTTGAAATTGAAATGGATGCATCTGGCTATGGAGTGGGGGCTGTGTTAACTCAAGCTAAACGACCTATTGCCTATTTTAGTCGAACTTTAAGCATGAAGGACAAGGCCAAACCGGTATATGAGAGGGAATTGATAGCTGTAGTATTTACAGTGTAAAGATGGAGGCCATATCTTTTGGGCCGCAAGTTCATTGTGAAAACTGATCAGAGGTCACTGAAGTTCTTGTTGGAAGAGCGTGTCATCCAACCACAATACCAGAAATGGATTGCTAAATTGCTTGGATACTCTTTTGGAGTGGTTTATAAACCAGGGTTAGAAAACAAAGCTGCCGATGTTCACTATCTAGGGTGCCACCTACAATCCATTTGAACCAACTTTCAGCCCCTGCCCTAATTGATTTGGGCAAAATACAAGAAGAGGTAGAGAATGACCCGAAATTGAAGGAGATTAGAAGTATAGTTGAGCAAGATCCAGAGGAGTTTCCAAATTTCACAGTGAACTAAGGAGTCTTGCAATTCAAAGGGAGGTTAGTAATTTCCAAGAATTCTTCTTTTTTACTTATCGTTTTACATACCTATCATGATTCAATATTTGGTGGACATTTTGGATTCTCGAGAACCTATAAAAGAATTGCTGGAGAATTGTATTGGGATGGAATGAAGAAGGATATAAAGAAGTACTGTGAGGAGCCTTTGATTTGTCAAAAGAATAAAACACTAGCTTTGTCACCAGCTGGATTGCTAACTCCCTTAGAAATACCGGTTACCATATGGACCGATATATTTGTGGACTCATAGATGGATTACCTAAGTCTACTAGTTTTGAAGTTATATTTGTAGTGGTAGATAGGATGAGTAAATACGCACACTTCATGGCACTCAAACACCCCTATATGGCTAAATCTGTTGTTGAACTCTTTG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MALCISIPSFSDSVTAPSLSQTYFSLSRRRPSNFIHFLNLSLPNRPPCLCRASNSQPGPFPKQSASASSKKRKKKDKGDSKVFNPNNFEVVDDFSFDDAGPSSSTSTSTYLSYHPSTLPKPPAGFVLDDHGKVLMASNKRIATMVDPLNNLPLECVIRRIFRSSKGDDCMLLCPVDTPVQILKSKNIDGWSAVSDDEVEALLPAAAYALAKIHMHLVHSGFCYTARGAFCYSEDDIFDFRTDDGQDVDGLPNEGVEITCFHMDGAHYMIYTPSDPLLFVAIKDKLGQLTIADDELLEDPAIISAIDEETEFNALVEEEAALLESVLGKE*
BLAST of MELO3C023197T1 vs. TrEMBL
Match: M5WG33_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa008276mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 436.0 bits (1120), Expect = 4.0e-119 Identity = 222/337 (65.88%), Postives = 259/337 (76.85%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. TrEMBL
Match: A0A061DJE6_THECC (BTB/POZ domain-containing protein TNFAIP1 isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_001583 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 423.7 bits (1088), Expect = 2.1e-115 Identity = 227/336 (67.56%), Postives = 263/336 (78.27%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. TrEMBL
Match: A0A067LJ52_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_19485 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 419.1 bits (1076), Expect = 5.0e-114 Identity = 222/328 (67.68%), Postives = 258/328 (78.66%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. TrEMBL
Match: A0A059AJW1_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_I00111 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 416.8 bits (1070), Expect = 2.5e-113 Identity = 204/281 (72.60%), Postives = 233/281 (82.92%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. TrEMBL
Match: B9HF50_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0007s04730g PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 413.7 bits (1062), Expect = 2.1e-112 Identity = 219/327 (66.97%), Postives = 256/327 (78.29%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. TAIR10
Match: AT4G33480.1 (AT4G33480.1 unknown protein) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 7.2e-112 Identity = 212/333 (63.66%), Postives = 252/333 (75.68%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. NCBI nr
Match: gi|659121815|ref|XP_008460828.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499586 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 667.9 bits (1722), Expect = 9.0e-189 Identity = 329/329 (100.00%), Postives = 329/329 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. NCBI nr
Match: gi|778670353|ref|XP_011649451.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101207357 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 649.8 bits (1675), Expect = 2.5e-183 Identity = 321/329 (97.57%), Postives = 323/329 (98.18%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. NCBI nr
Match: gi|778670355|ref|XP_011649452.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101207357 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 596.7 bits (1537), Expect = 2.5e-167 Identity = 301/329 (91.49%), Postives = 303/329 (92.10%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. NCBI nr
Match: gi|645242558|ref|XP_008227601.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103327089 [Prunus mume]) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 2.6e-119 Identity = 223/337 (66.17%), Postives = 259/337 (76.85%), Query Frame = 1
BLAST of MELO3C023197T1 vs. NCBI nr
Match: gi|595863297|ref|XP_007211558.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa008276mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 436.0 bits (1120), Expect = 5.7e-119 Identity = 222/337 (65.88%), Postives = 259/337 (76.85%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this mRNA:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Analysis Name: InterPro Annotations of melon
Date Performed: 2016-09-28
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