MELO3C023197.2.1 (mRNA) Melon (DHL92) v3.6.1
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAAATTTTGTTCTCGAATCAAGTTCCAAAAAGGATCCAGACTAGACAATTTTCTAGAAATACAGTCAGCCGAGCCGCTTAACTTCCGAGAAGAGCCAGCATGGCGTTGTGTATCTCTATTCCTTCCTTCTCCGATTCTGTTACCGCTCCTTCCCTATCTCAAACTTATTTCAGTCTCAGTCGCCGGCGGCCTTCCAATTTCATCCATTTTCTTAATTTAAGCCTTCCCAACCGCCCACCATGTCTTTGCCGAGCTTCCAATTCTCAGCCTGGACCGTTCCCCAAACAGTCTGCTTCTGCTTCTTCTAAGAAAAGGAAGAAAAAGGATAAGGGAGATTCCAAGGTTTTTAATCCTAACAACTTCGAAGTTGTGGACGATTTTAGCTTCGATGACGCTGGACCTTCTAGCTCCACTTCCACTTCCACTTATTTGTCGTACCATCCTTCGACCTTGCCCAAACCGCCAGCTGGGTTTGTACTAGACGACCATGGAAAGGTCCTCATGGCTTCAAACAAGCGAATTGCTACCATGGTAACATTTTTTTCTCAGTTCCCTCATGGAGGATTTGTTTAAAATTGGTATCATTTTAGTGCTTCCCTGTTCACCTAACCTCTAGTGCCTTTTGATTTTCATGTATGAACGAGAAGTTCAGAATATGTTAAACCACCAATATTAATAGGATATAATAGGAGAAACAAGGGGAAGTTGGCACAGGATAGGTTAGTTAGAGATGTGGAGGAGAATTCGGAAAGAGGAAACTATAGTGGTGGGCCCAGCAGTTAGTTGGGATTGGAGAGAGATTTAGGCCGGGGAGATAGCAGAAACAATTGGGCAGAATTTTGGTGAAGTCAAGAGGACTATCACACTCCTTGAGAGACAGGAGGAGTAGTACACTGGTTCTGAATTGTCCTTGTTTTCTTGTTACATTGTTCTGTCTTTTATTTTGTTTTAAATTTGATTGCTGTATCTTTGCTTCAGTTAGGGAAGGATTGAGATTCTAGCCATGCTGTTTTTTGCCTTTTGTTTTCATCGAATATTGTAATTACGTTTGGATAGCAATAAAAGTAGAATCACCATACTGGTATTCTATCAATTTGGTATCAGAGCATTAGAATCTGGAAAAGCGTAAGAAGATGGCCAAGAAAATCGAAGAACTGTTGGATTTTGTGGAATAGGAAATTAGGGAAATGCGAACAGAGTTGAAGAAGCTATCCGCAATGGAGGAGAATATGTCCTCGATTTTGAAGAGTATTGAAAATATAAATGCGCAGATGGAGAAACAACAAACACAATAGCAAGCGATCCTGAAATACATCGAAGGAATCATTCGAGAGAAGGCTGTTACAACGGTTGAATTGGAAGGATCTCCGAGTAGGGGAATGGGAAGCGACTTTACATCTAAAGTGTTGACTGGGGAATCGAAGGGAGAACGAAAGAGGGAGGATGATAAGACATTTGATAGGAGCAAGTTTAAGAAGGTAGAAATGCCGATCTTCAATGGAACAGACCCTCACTCATGGTTGTTTCGAGCAGACCGTTATTTCAAGATTCACAACTAACCGAATTAGAGAAGATGTCAGTGGCTATTATTAGCTTTGATGGTCCGGCCCTCGACTGGTATCGATCTCAGGATGAACGTGAATCTTTCAAGAGTTGAGATGATTTGAAGCAAAAGATGTTAACAAGGTTTCGAACGATCAGGGATGGTACGTTGGTAGGCAGTTTTTTGACGATTAAACAAGAGACCACGGTGAATGAGTaTCGAAATAGATTTGACAAATATCTAGCTTTGGTAGCATTCTTACAAACGATGGTGCTTGAGGAGATTTTCATGAATGGGCTCAGCCCATGGTTGAAGACCGAAGTTGATGTTTTGGAACCATAAGGGTTAGCCCAAATGATGAAGCTGGCTCTTAAGATTGAGAACAAAGAGAGTGAGGAAGGAATGTGGGTTGATCAGTGTGTATGAGAGTAAGTTCTAGTACAACCTGCCTAAGGCAAAGGAAGGGACAAAGACCAAAGCAATGGCAGCCACGACTAGTGGAAATACTCCAATGAGAACAGTCACATTCAGAGGAGTCACGACGACGGATAACTGAAGAGAAGGACCTTCCAAGCGTTTGACTGATGCTGAATTTTAGGCTAGGAGGGAAAAGAGGTTGTGTTTTAAGTGTGAAGAGAAATATCATGCTGGCCATCGTTGTAAAGCTAAAGAACACAAGGAGTTAAGAATGCTGGTAGTACGGGAGAATGAAGAAGAGTTTGAGATCATTGAGGAAGTCGGAGGAGAAGAAGTGGTGGATGAGAATGTTATTGAGGTAGGAGTAGTGGAGAATTTGAACATAGAGCTATCCATTAATTCGGTGGTGGGGTTGACCAATCCTGAAACTATGAAGGTGAAGGGAAAGCTGAAGGATGAGGATGTGGTGGTGCTGATTGACTGTGGGGCTACCTACAATTTTATATCTGAAAAATTGGTAACCAACCTAAATCTACCGTTGAAAGCTACAACCAATTATGGGGTGATTCTGGGTTCAGGAGAAGCCATTAAAGGAAAAGAAATTTGTGGAAAAGTAGAGGTATTGCTAGACAATCGGAAAGTAGTGGACAGCTTCTTGCCACTTGAGTTGGGTGGTGTTGATGTCATACTTGGTATGCGGTGGTTGCATTCTCTTGAGTGACTGAAGTGGATTGGAAGCACTTAGTCATGTCCTTTCAGCATGGAGGAAGAAAGGTTATAATTCATGGGGATCCAAGCCTCACTAAGAAGGGAGTGAATTTGAGGAGCATGATGAAAACTTGGGAAGGGGAAGACCAAGGGTTTTTGGTGGAATGCCGAGCTATTGAAGGGAAGGTACCAGTGGCAACCTTTTATGAAGAGGAACTTGAAACAACTGTAGATAATTCCATCCCTCCATTGTTAAAGAAATTTTTAGATGTGTTTGAATGGCCAGAAACATTGCCACCCAAGAGAGGGATAAAGCATCACATTCATTTAAAACATGGTACTAACCCAGTCAATGTGAGGGCTTATCGCATAGCTATCAGAGTAGATGGAAAGATCAGTTGACGAGATGCTGGCTTCTGGAATAATTCGACCTAGCACCAGTCCATATTCAAGTCCTGTATTGTTAGTAAGGAAGAAGGATGGAAGCTGGAGGTTTTGTGTTGACTACCGAGCGCTTAATAATGTCACCATACCGGACTAATTTCCAATTCCTATCATTGAAGAGCTGTTTGATGAGTTGAATGGTGTAAAGATGTTTTCCAAGATTGACCTTAAAGCTGACTATCATTAAATACGGATGTACTAAGAGGATGTGGAAAAGATAGCCTTTCGCACTCATGAAAAGTTTTACACCATAAGTACCTCCATATTACACTGAGTGGGATTCGACAATAGGTTTGAGTTAATGATTAGAAAACTTCCTTTTCTCGATCTTGATTCCTAGTCATGCCTTTTGGTTTGACTAATGCACTTTCTACTTTCCAAGCCATATATGAGGAGGTTTGTACTGGTTTTCTTTGATGACATCCTAGTATATAGCAAGGGATTGGAAGAACATATACAACACTTGGAATTGGTGCTGGAAATTCTGAGGGCAAACGAGTTGTATGCTAATCTGCGCAAGTGCAGTTTTGCTAAGGAGAGAGTGAACTGTTTGGGGCATGTTATCTCTGAAAAAGGAGTGGAAGTGAATCCCGAGAAGATTAGGGCTATTAGAGAATGACTTGCTCCAACCAATGTACGTGAGGTAAGAGGATTTTTGGGTTTGATTGGATATTACCATAGATTTGTACAAAATTATGGCAGCATAGCAGGAACCCTTACTCAGCTGTTGAACAATGGGAGTTTCAAGTGGAATGAAGAAGCCGAAACTTCCTTTGAAAAGCTAAAGACAACTATGATGACCTTGCCCGTGTTAGCAATGCCAAATTTCAATTTGCCTTTTGAAATTGAAATGGATGCATCTGGCTATGGAGTGGGGGCTGTGTTAACTCAAGCTAAACGACCTATTGCCTATTTTAGTCGAACTTTAAGCATGAAGGACAAGGCCAAACCGGTATATGAGAGGGAATTGATAGCTGTAGTATTTACAGTGTAAAGATGGAGGCCATATCTTTTGGGCCGCAAGTTCATTGTGAAAACTGATCAGAGGTCACTGAAGTTCTTGTTGGAAGAGCGTGTCATCCAACCACAATACCAGAAATGGATTGCTAAATTGCTTGGATACTCTTTTGGAGTGGTTTATAAACCAGGGTTAGAAAACAAAGCTGCCGATGCACTATCTAGGGTGCCACCTACAATCCATTTGAACCAACTTTCAGCCCCTGCCCTAATTGATTTGGGCAAAATACAAGAAGAGGTAGAGAATGACCCGAAATTGAAGGAGATTAGAAGTATAGTTGAGCAAGATCCAGAGGAGTTTCCAAATTTCACAGTGAACTAAGGAGTCTTGCAATTCAAAGGGAGGTTAGTAATTTCCAAGAATTCTTCTTTTTTACTTATCGTTTTACATACCTATCATGATTCAATATTTGGTGGACATTTTGGATTCTCGAGAACCTATAAAAGAATTGCTGGAGAATTGTATTGGGATGGAATGAAGAAGGATATAAAGAAGTACTGTGAGGAGCCTTTGATTTGTCAAAAGAATAAAACACTAGCTTTGTCACCAGCTGGATTGCTAACTCCCTTAGAAATACCGGTTACCATATGGACCGATATATTTGTGGACTCATAGATGGATTACCTAAGTCTACTAGTTTTGAAGTTATATTTGTAGTGGTAGATAGGATGAGTAAATACGCACACTTCATGGCACTCAAACACCCCTATATGGCTAAATCTGTTGTTGAACTCTTTGAGAAGGAAATTGTTAGATTACATGGATACTCGAGATCTATTGTTTCTGATCGGGACAGGGTGTTTGTTAGTAACTTTCGGAATGAACTATTTAAGTTGGCAGGCACAGAACTCCATAGAAGCCCAG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MALCISIPSFSDSVTAPSLSQTYFSLSRRRPSNFIHFLNLSLPNRPPCLCRASNSQPGPFPKQSASASSKKRKKKDKGDSKVFNPNNFEVVDDFSFDDAGPSSSTSTSTYLSYHPSTLPKPPAGFVLDDHGKVLMASNKRIATMVDPLNNLPLECVIRRIFRSSKGDDCMLLCPVDTPVQILKSKNIDGWSAVSDDEVEALLPAAAYALAKIHMHLVHSGFCYTARGAFCYSEDDIFDFRTDDGQDVDGLPNEGVEITCFHMDGAHYMIYTPSDPLLFVAIKDKLGQLTIADDELLEDPAIISAIDEETEFNALVEEEAALLESVLGKE
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. NCBI nr
Match: XP_016902634.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499586 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 562.0 bits (1447), Expect = 1.3e-156 Identity = 329/329 (100.00%), Postives = 329/329 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. NCBI nr
Match: XP_011649451.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101207357 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 543.9 bits (1400), Expect = 3.8e-151 Identity = 316/329 (96.05%), Postives = 318/329 (96.66%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. NCBI nr
Match: XP_016902635.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499586 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 500.4 bits (1287), Expect = 4.8e-138 Identity = 293/293 (100.00%), Postives = 293/293 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. NCBI nr
Match: XP_011649452.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC101207357 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 6.5e-135 Identity = 296/329 (89.97%), Postives = 298/329 (90.58%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022157759.1 (uncharacterized protein LOC111024390 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 476.1 bits (1224), Expect = 9.7e-131 Identity = 279/328 (85.06%), Postives = 294/328 (89.63%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. TAIR10
Match: AT4G33480.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 332.8 bits (852), Expect = 2.4e-91 Identity = 178/214 (83.18%), Postives = 199/214 (92.99%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S4E324|A0A1S4E324_CUCME (uncharacterized protein LOC103499586 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499586 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 562.0 bits (1447), Expect = 8.9e-157 Identity = 329/329 (100.00%), Postives = 329/329 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A1S4E3T2|A0A1S4E3T2_CUCME (uncharacterized protein LOC103499586 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499586 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 500.4 bits (1287), Expect = 3.2e-138 Identity = 293/293 (100.00%), Postives = 293/293 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A2P6RSX4|A0A2P6RSX4_ROSCH (Uncharacterized protein OS=Rosa chinensis OX=74649 GN=RchiOBHm_Chr2g0122781 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 3.9e-96 Identity = 195/241 (80.91%), Postives = 216/241 (89.63%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. TrEMBL
Match: tr|B9HF50|B9HF50_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN=POPTR_007G099900v3 PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 347.1 bits (889), Expect = 4.5e-92 Identity = 175/226 (77.43%), Postives = 193/226 (85.40%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C023197.2.1 vs. TrEMBL
Match: tr|A0A067LJ52|A0A067LJ52_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas OX=180498 GN=JCGZ_19485 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 346.7 bits (888), Expect = 5.9e-92 Identity = 196/247 (79.35%), Postives = 215/247 (87.04%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this mRNA:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Analysis Name: InterPro Annotations of melon v3.6.1
Date Performed: 2018-09-25
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