MELO3C015554T3 (mRNA) Melon (DHL92) v3.5.1

Overview
NameMELO3C015554T3
TypemRNA
OrganismCucumis melo (Melon (DHL92) v3.5.1)
DescriptionZinc finger FYVE domain-containing protein 16
Locationchr2 : 2804006 .. 2807249 (+)
Sequence length1816
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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AAAACAAAAGATTGCTTGAATCCTCGAAAGAGATTCATCGGTTCTTTCCCATTTCATCCCGCCATCGTCGTTTAGTTTTCATCGATTTCCCTCGAGCTCAAGCCCTAAACCTAACAATTCATTTCCTTCACCTCAATTCTTCTTATCACAAAGGTACGCCAATTCTCTCGTCTTCCCTTTCGCTTCCCTCTCATATTTTCTAGCTTCCTATGCCGTTTTCTTGTTCTATTTTATACCGACGACGAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCTAAATTTCGAATTAAGCTGCACGGACGACTCCTATTTGTGTAAGTTTTTTGAACTTCTAATCCACCCCATTTTGTCTTTGATGATTTTTCTCCCAACATTTGTATATAGGAGTCGAAAGTGAGGATTTTTTTTTAATTCCTTTGAAAGAGAAATTGAAATTGTTGTTTTTTGTAATCGGTTCTTGTAATTTGTTTACTGACGGTTGGTTTTGATATTAGTTATTGTAGTTCATGGCTACTTTAAACGGGAAAGTTACATATTCTTCGCTTTCTAATGTTGGGAAGGTGAATAGAGTTCATAATGATGATGAAGATTGTGATTCTCCATGGGCCATGCCTAATGGTAGTGTGTCCTTTCAGAACTCGAAGTTTTCTGCTGAATCTGAAGATTTTATTGAGGATGAGTATGAGTATGATTCAAGTGATGAGTTTGATATTCCTAAGCAAAATAGTATGCGTCCTGAGGTGAATTTAAAGAATGTTTTAAATGGGATGTTTGCTATATTGACTGGTGTGAATAAATCTTCGGATGTGTCGTCAGATAAACAAATTCCCAGTTCGAATGTTTCGTTTCTTGGTGCTGAAAAGAACGGTGATACCTATTTGCACTCCTCGGTGTACATTCCTAGTGCCCCACCTCTTCTTGAGCCGAATACGGTTAATTATACTGCTTATAAAGATGTTTTGGAGGCTGAGCCTCCAGAGTGGCTTCCAGATAGTTCTTCTTTAATTTGTATGCAATGTACTGCTCCTTTTACTGCAATCACTCGTGGTAGGCATCATTGTCGATTTTGTGGAGGGATTTTCTGCCGAGCCTGTTCGAAAGGGAGGTGTTTGATGCCCGTTAAGTTCAGAGAGAGAAATCCACAGAGGGTATGCGATGCTTGCTATGACAGGCTTGATCCTTTACAGGGTGTACTTATTAACAGCATTAGCAATGCTGTGCAAAGGGCGAAACATGATGTGATGGACTGGACCTGTTCAAGAGGGTGGTTGAATCTCCCTATTGGTTTGTCCATGGAACATGAGATATACAAAGCATCCCAAACGCTAAGAGGATACTTCCAGGTGCGCTTACTATGCAACTTAGTTGTTAAATGAAGTTGGTATAATGTGAACTGCTATATATATTATTTTACTCTGTGGGATCGATTATTATACTGTGATCTATTGGATGGTGGTTTGGATATTCTTTTGTGACATGCTATTTCCTGGCTGTTGAATTGTACAGGTCTCTAGACTAAATCCTGAAAGGTCTATACCTTTGGCTGTACTGAAGGGGGCCAAAGGTCTTGCCATTTTGACAGTTGCTAAAGGCGGTGTGTTGGTTGCTTACAAATTTGGCACTGGTTTGGTAATTGCCCGAAGGTCGGATGGTTCATGGTCTGCTCCTTCAGCTTTAATGTCTGTTGGATTAGGATGGGGTGCCCAGGTAAGACTTCTAATTCAAAGTTCTTTTACATTTGTAGAATTTCTGGAAGAATTTTCAATCTTCAGAAATGTTTAAGCTCATTTGTAGGATAGCTTGGCCGTAAGTTTTGGGTTTTCGTCTGTTTTATGAGATGTAGAACAAGGCCTTTTGACTCAAATCACAAGAATCTTGTGTGCATATGGAGTTCTGAATTACTTATATTTTTGTTTACTAGATTGGTGGTGAGCTCATGGATTTCATAATCGTACTTCATAATTCAAAAGCTGTTAAGACATTCTGTAGCCGAATGCACTTTTCTCTTGGTGCTGGGTGTAGTGTCGCTGCTGGACCTGTTGGTAGAGTGTTGGAAGCAGATCTTCGAGCTGGAGATGGGGGTTCTGGCATGTGCTATACATATAGCTGTAGCAAAGGTATCCCGATTAGATTGTGAATTTTCTGTTCTACTTAGAAGGCTTTTGACACCTATGTTATACCAAAACCTAAGTAGATCTCCATAAAGATAGCATATCAGATCATTGAAATAGCAGCTGCCCATAAACTTTGACTTTTTCAAAGTCTAAAACTATTTCGTGAATCATGCAGGATTTAGTCCTTAACTGCTTGTTCTGATGCTTAAAATATTTCCTTTTTGTGACATATATTACAAGTACAAATGTCTTGACTTGGGTCGTGGTAGTCAATATCACTACATCTTCGACTCTTATTTTGTCTTTGGAGGTGTGTGCCTTGTTGTGGCTCCTGGTCTGCCAGGATCACGCTTTGTTGTGAGTGAAAGGAACAATAGTGATAGAAATCCTAGAGGTTCCATGTTTCTCTTTGGGCTTCACTATCGAAGTTTTTGTGTAATTATTCTCTAGGTAACATATCCTATTTAGCCGAAAACCTTTTCCCAGAGGTTCCATGTTTCTCTTTGTGCACTTGATTTTTTGTATGTGCTTGTATTCTTTCATTTCTTCTAGCACTTGTCTTTGACTTCATATACTGCCAATGTAGACCTGGATTTGTTCTATAATTTGTCTTGAATTCTAAAGAACAGTGTTACCTTTATTTAACGATTATTTTACACTGACATCCTGGAGATGGTAACTGATGCATTCGCTTACTTATTGACGACAGGTGCATTTGTGGGAGTTTCATTGGAAGGAAACATTGTAGCAACAAGGATGAGCACAAATCTATGCTTTTATGGCGATCCATATCTCACCACCTCTGACATTCTGTTGGGAACAGTTGAGAGACCAAGAGCTGCAGAGCCATTGTACTCTGCTCTTGATGACTTCTATTCCGTTCTGCAATGACCAAACTCTCCTTGATGTACAGCAGACAGATATCTCCATGGAAGCTCTGATCCAAACCTTATACTTTCATAGATTGTAAATGATCATGCATCCAAAAGTAGAAGCATTATTATTCTTTTCTATTCTCCACCTTACACAATAAGAATCGTAATGTTGTATAAAGTTGGCTTTGTTTATTCTCGTGTAAATATATATTTTATTGCAACCGAGTTTGATTGAAATGGTTAAAATCACTTGGTTTTGC

mRNA sequence

AAAACAAAAGATTGCTTGAATCCTCGAAAGAGATTCATCGGTTCTTTCCCATTTCATCCCGCCATCGTCGTTTAGTTTTCATCGATTTCCCTCGAGCTCAAGCCCTAAACCTAACAATTCATTTCCTTCACCTCAATTCTTCTTATCACAAAGTTCATGGCTACTTTAAACGGGAAAGTTACATATTCTTCGCTTTCTAATGTTGGGAAGGTGAATAGAGTTCATAATGATGATGAAGATTGTGATTCTCCATGGGCCATGCCTAATGGTAGTGTGTCCTTTCAGAACTCGAAGTTTTCTGCTGAATCTGAAGATTTTATTGAGGATGAGTATGAGTATGATTCAAGTGATGAGTTTGATATTCCTAAGCAAAATAGTATGCGTCCTGAGGTGAATTTAAAGAATGTTTTAAATGGGATGTTTGCTATATTGACTGGTGTGAATAAATCTTCGGATGTGTCGTCAGATAAACAAATTCCCAGTTCGAATGTTTCGTTTCTTGGTGCTGAAAAGAACGGTGATACCTATTTGCACTCCTCGGTGTACATTCCTAGTGCCCCACCTCTTCTTGAGCCGAATACGGTTAATTATACTGCTTATAAAGATGTTTTGGAGGCTGAGCCTCCAGAGTGGCTTCCAGATAGTTCTTCTTTAATTTGTATGCAATGTACTGCTCCTTTTACTGCAATCACTCGTGGTAGGCATCATTGTCGATTTTGTGGAGGGATTTTCTGCCGAGCCTGTTCGAAAGGGAGGTGTTTGATGCCCGTTAAGTTCAGAGAGAGAAATCCACAGAGGGTATGCGATGCTTGCTATGACAGGCTTGATCCTTTACAGGGTGTACTTATTAACAGCATTAGCAATGCTGTGCAAAGGGCGAAACATGATGTGATGGACTGGACCTGTTCAAGAGGGTGGTTGAATCTCCCTATTGGTTTGTCCATGGAACATGAGATATACAAAGCATCCCAAACGCTAAGAGGATACTTCCAGGTCTCTAGACTAAATCCTGAAAGGTCTATACCTTTGGCTGTACTGAAGGGGGCCAAAGGTCTTGCCATTTTGACAGTTGCTAAAGGCGGTGTGTTGGTTGCTTACAAATTTGGCACTGGTTTGGTAATTGCCCGAAGGTCGGATGGTTCATGGTCTGCTCCTTCAGCTTTAATGTCTGTTGGATTAGGATGGGGTGCCCAGATTGGTGGTGAGCTCATGGATTTCATAATCGTACTTCATAATTCAAAAGCTGTTAAGACATTCTGTAGCCGAATGCACTTTTCTCTTGGTGCTGGGTGTAGTGTCGCTGCTGGACCTGTTGGTAGAGTGTTGGAAGCAGATCTTCGAGCTGGAGATGGGGGTTCTGGCATGTGCTATACATATAGCTGTAGCAAAGGTGCATTTGTGGGAGTTTCATTGGAAGGAAACATTGTAGCAACAAGGATGAGCACAAATCTATGCTTTTATGGCGATCCATATCTCACCACCTCTGACATTCTGTTGGGAACAGTTGAGAGACCAAGAGCTGCAGAGCCATTGTACTCTGCTCTTGATGACTTCTATTCCGTTCTGCAATGACCAAACTCTCCTTGATGTACAGCAGACAGATATCTCCATGGAAGCTCTGATCCAAACCTTATACTTTCATAGATTGTAAATGATCATGCATCCAAAAGTAGAAGCATTATTATTCTTTTCTATTCTCCACCTTACACAATAAGAATCGTAATGTTGTATAAAGTTGGCTTTGTTTATTCTCGTGTAAATATATATTTTATTGCAACCGAGTTTGATTGAAATGGTTAAAATCACTTGGTTTTGC

Coding sequence (CDS)

ATGGCTACTTTAAACGGGAAAGTTACATATTCTTCGCTTTCTAATGTTGGGAAGGTGAATAGAGTTCATAATGATGATGAAGATTGTGATTCTCCATGGGCCATGCCTAATGGTAGTGTGTCCTTTCAGAACTCGAAGTTTTCTGCTGAATCTGAAGATTTTATTGAGGATGAGTATGAGTATGATTCAAGTGATGAGTTTGATATTCCTAAGCAAAATAGTATGCGTCCTGAGGTGAATTTAAAGAATGTTTTAAATGGGATGTTTGCTATATTGACTGGTGTGAATAAATCTTCGGATGTGTCGTCAGATAAACAAATTCCCAGTTCGAATGTTTCGTTTCTTGGTGCTGAAAAGAACGGTGATACCTATTTGCACTCCTCGGTGTACATTCCTAGTGCCCCACCTCTTCTTGAGCCGAATACGGTTAATTATACTGCTTATAAAGATGTTTTGGAGGCTGAGCCTCCAGAGTGGCTTCCAGATAGTTCTTCTTTAATTTGTATGCAATGTACTGCTCCTTTTACTGCAATCACTCGTGGTAGGCATCATTGTCGATTTTGTGGAGGGATTTTCTGCCGAGCCTGTTCGAAAGGGAGGTGTTTGATGCCCGTTAAGTTCAGAGAGAGAAATCCACAGAGGGTATGCGATGCTTGCTATGACAGGCTTGATCCTTTACAGGGTGTACTTATTAACAGCATTAGCAATGCTGTGCAAAGGGCGAAACATGATGTGATGGACTGGACCTGTTCAAGAGGGTGGTTGAATCTCCCTATTGGTTTGTCCATGGAACATGAGATATACAAAGCATCCCAAACGCTAAGAGGATACTTCCAGGTCTCTAGACTAAATCCTGAAAGGTCTATACCTTTGGCTGTACTGAAGGGGGCCAAAGGTCTTGCCATTTTGACAGTTGCTAAAGGCGGTGTGTTGGTTGCTTACAAATTTGGCACTGGTTTGGTAATTGCCCGAAGGTCGGATGGTTCATGGTCTGCTCCTTCAGCTTTAATGTCTGTTGGATTAGGATGGGGTGCCCAGATTGGTGGTGAGCTCATGGATTTCATAATCGTACTTCATAATTCAAAAGCTGTTAAGACATTCTGTAGCCGAATGCACTTTTCTCTTGGTGCTGGGTGTAGTGTCGCTGCTGGACCTGTTGGTAGAGTGTTGGAAGCAGATCTTCGAGCTGGAGATGGGGGTTCTGGCATGTGCTATACATATAGCTGTAGCAAAGGTGCATTTGTGGGAGTTTCATTGGAAGGAAACATTGTAGCAACAAGGATGAGCACAAATCTATGCTTTTATGGCGATCCATATCTCACCACCTCTGACATTCTGTTGGGAACAGTTGAGAGACCAAGAGCTGCAGAGCCATTGTACTCTGCTCTTGATGACTTCTATTCCGTTCTGCAATGA
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006914 autophagy
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0046872 metal ion binding
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
MELO3C015554MELO3C015554gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C015554T3MELO3C015554T3-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MELO3C015554T3.cds1MELO3C015554T3.cds1CDS
MELO3C015554T3.cds2MELO3C015554T3.cds2CDS
MELO3C015554T3.cds3MELO3C015554T3.cds3CDS
MELO3C015554T3.cds4MELO3C015554T3.cds4CDS