Lsi10G001750.1 (mRNA) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATGTTAAATCAGTCCTAAATACTATTACATATTTCTTTATTTAATACGAGATAAGACATTTAAACTATGGCAACAAGTTGATGATTTAATAATTAAGTTGTACTGATGTTGTTGAAATTGGTACGTTTGTGAATAACAGAGTTTGGATGGGTAGTTCCTTGATCACTCCAGATAAAGACACATTATGGAGAACCTGGCTCCCAGATTCTGAATTCATGGCTCTTTCATCTCCTGCAAAAACCGTCACCTTCAACGAAAAATTAAACTTCGATAAAAAAGAAACAATTTATGTAGCCCCAATTTACGTTTTCAGTACTGCAAAAGCATTGGATGTGAACACCACCTCCAGCTCAACACATACTTCAAAGCTAACTTGGGTTTTTAATGTCAAGAAGAAATCCAAGTATTTTCTTCGCCTACTCTGGTGCGACATCATTACCCCACATCTCACAACTTTCAATTTTGATATATTCATTGGCGTTAATTATACTTCGCTCCAATCCAGCGATGTTACTGAAGAAGAAGAGTTTGCATTGCCATTTTGGTACGAGTTTCTCATTGTTACAGACAGTTCGGGATTCTTCAATGTGGGTATAGGCCAAAGTGAAAGTGCTCCATTGTCAAGGGCATTCTTGAATGGAATTGAGATTATGGAGTTAATTGAGAAATCGTTTGTGGGTCCTGTTGATTTGAGCATAAAAGAGGAGAAACAGAGTCCAAAGATGATTATTGTTGGGGTTTGTGTTGGTGGGGTTGTGATTGTTGGTTTGATAATTGGGTTGGCTGTGTATTGTTTTATTAGAAATCGGAAATTAAGAAAGCATCGTCCTTTGCTTCTTCCTCAAAATGATCCATCTGAAAAGATTGTTTCTATTGCGGATCTTGCTCCTGATTTGAACCTTGAATTGAAGATCTCGTTTGGGGTAATAAATGATGCAACTGATGGTTTTAATGAGAAGAAAATGATTGGAATTGGAGGATTTGGAAAGGTTTATGTTGGGAGAATTGGGGAGAAGGATGTGGCTGTGAAGCGAAGTGAGCCTGGACATGGACAAGGAATTAAGGAGTTTCAAACTGAGGTTATTATATTCTCTCAAATTCGCCATCGTTTTCTGGTTTCCTTATATGGGTATGTTACCACACTGCCACTCAACTCCAATTCAATATATTTAACTTTCAATTTTCTTTTAAATTTCTTCTATTTTGTTTAGGACTATTTTCAAATATATAAAAATGAGACAAACTATTTACACATATAGAAAAATTTTACTGTCTATCGGGATAGACGGTAAAAGAATTCTATCGCTTAAGCGATAGACTTTGAAATTTATCGCTGATAAACAGTAAAAAAATTTTATATTTGTAAATAGTTTGATATTTTTTCTGTTTATAGTAATTTTTCATTTTGTTTATTAGCACTCGGTTTGATAATAAGTTCGGTCTCTTTAGTAACTATTTCAGTTTTAGTTCTTAATTTTTTAAAATGAAATCTATTTTCTCTCAATTTCTTGTTTGCATTCCCAAGTATGAGGGTTCATTATTTGTTTTTTTTTAAGTTTTTAAAAACTTTGTTTTGTTTTTTGAAAAATTTTGTAAAACGTAGAGAACAAAGCAAAAAATTTAGAGGTGAATGAGATGTTTATAAGTTTAATTTTTAAAAATTGAAAACAAAAAACAAAATGGTTACTAAACGGTGCCTTCGTTTTTTGTTTTTTATTTTTAAGATTTGTGTTTGTTTTCTTCCAATTTGTATATATTATTTTCTCATTTCTTAAAGAATTACTTGAATTCTCAGTCAAATTTTAAAACGAAAAATAAGTTTTGGAAACTAGAGTAGAAAGTAGATAACAAAACAAAGAAATTTATTAGCGTGGATGTTGAAATATTTATTTAAATTGGTAAATAAACATTATACATTGTTTTTAACAAATTTAAATATTTATTATTTATATTATATTCATATTAGTTATATTTGGTTACTTATTTTTATGTTTGATAGACTTTTAGGGGCTGTTTGGGGGCACCAACTAGAAGTTGGTAGAGTGAGTTATTATAGCTCAATCCATGTTTGGAGCACCAAATATAATAGTGATGTATATAACTATTTATAACTTACAATTAAGTATAGTAAATATTATTTCAAAACCATCTTTGCTACAATATTTACTATTTTTAGCTCATTATCTATTTTCTTCTTTACTATGGTTTTTATCATTTTTTACTAAAACAAAATAGTTTATACCTCAAATACAAATTATTATAACTTAGACTAAAATGACCTGCTCTCAAACACTAACTATTATAACTTATTGACTATAATAACTAACTCAGTGCCATATTATTCACCTTTTATGTCGATATCGAATCCATGAAAAGAGGAATTTATTGATGAAAATATTGACATGTTGAGTGAATATTCACTCTATTTACTTTGTTGTAAAATAGACAATTGCATTCCACTAATATTTTTGTACATATTCTCTACAGGTATTGCGATGAAAACCAAGAGATGATCTTAGTTTACGAATACATGGAGGGGGGAACTTTGAAAGATTATCTATATGGTTCAAAAGCCAAAGATCGTGTTCCATTGTCATGGAAAAAAAGGCTTGAAATCTGCATCGATGCAGCAAAAGGCCTTGATTATCTACACACCGACTCGACCGCAGGCGTTATCATACATCGAGACATTAAAACCACAAACATCTTGCTCGACAAAGACTTGAATGCAAAGGTCGCCGATTTTGGCATATCGAAAACTGGAGTACCCGACCCCAAAGAATTAGACATCTCCATTAAAGGCACTTATGGATATCTTGACCCAGAATACTTCGACACCGGAAAGTTGACGGAGAAATCCGACATCTATGCGTTTGGCGTCGTGCTTTTTGAAGTTCTCTTGGCTAGAGCACCAATTGATAAGAACGTTCCAAGTGAAGAGACAAACTTAGCAGACTGGGCAGTTCTTTGCAAAAGTAGAGGAGAGATTGAAAACGTGATTGATCCTTTTCTTGTTGGAACAATCGAAACGAATTCGTTGAGGAAATTTGTGGAAGTTGCAGTGAAGTGTGTGGATGAAATTGGGGCAAATAGGCCTTCAATGCACGACGTGGTGTATGATTTAGAATTGGCTTTTCAGTTTCAGTTCACGCCTGTGGGGGATGGGAAAGGGTTTGAAGGAATGAGCACCACCATTGTTGAAGCTCCATGGGAGATTGATTCGGGGATTCTTGATCGGATTCCTTCCAAAGGGATTGATGATTCAGTGATGCTAGATGAGGATAGCACCACTATGAATGCCAGAGAATTGGCTGCGAAGTTTAAGATTGATTGTCCTAGATAATTTGATTCCATATGTGAGAGTTTAAATTGGCTTTCTTGTGGATGGTTTTAATCATCAAGTACATGGATTGTATTGTGTGTATTATATTGTATGGTATGTAGCTTAGACAGTCAGAGGGTGTTTTGACCTACAAATTTGAAATTTTAAGTCTGAAAATGTTAAACGTGGACAATTATACTAGGGGTTTAGGTACTCTATGTTTAAGGGTGTATTTAAAAATTTAGGATTAAAGAAGTTTATGTTTGGAGTGCAAGTTTAAGAAATCTAATAATGGAGTGTAAACTTTCAAATATTGGATTCTTTTGGTCGTATTGTGAACGTGTGGCACGTGTTCGTCTATTTTGAAATATAAGTTAGAAAAATTGTGCAAATATAAAGGGTTTAAATAATCTAATTTGTTGAAGGAAATTAGTCAGTTTTTTGGTATTTATAATAGGTGACAATTTGAATGTGCTATTTTTGTAGGCATGTATATTTTACAAATATGGCAAAAATTTCAAATAAAAAAATCTTATTATTTTTTATTCCACATTGCACTTATTCCTTTTATTCTTCCATGCTCACTCCTTTTACACTCTTTTTTCTTTCTAATTTTTGAATTTTAATTTGGTTGAGAATTAAGTTGAGATAATAAGGGTTATTTTGAAATATATCAAAATGAGCCAAAATATTTACAAATATATCAAAATGTCATTGTCTATCAGTTATAGACAATGATAGACACTTATAGACATCTATCAGTGTCTATCAATGATAAATGATAGTAGCTAGTCTATTGATAGCATCCAAAATGTGTTATTTTAGTGCCTCTAATCTTTCTTGTGTATGAAGATTAATGTGTTTATATTACGGAATCGACAATTAAAGAATACAAAAAATAGGGAAGATCAACACATATATTTTCGTGGTTAATTAATAATGTGTTAGCTACGTCCATGGGACAGAGGGAGAACAATTTTATTAGAGAGAATCTTATATGATTACATAATTAATTGAATATCAATAATTAATAATGCCTATAGGGTTAGAGAGTTTATATAGTGCACTTCTCTAAACCCCAAGTGGAGAAGAACAAGAATTAAATAATTAATTAAACATCTCCTAAACCAATTCTAATATAGATTCAAGGTGTTCAAACAAATCTCCACCTTGACTTAAATTCTCCCATAGACCAAATATGATTAGGATTCAAGGAAATTCCAACAAATCTCCACCTTGACTTAATTCTCTTATAGATAACAGATGTACCAGATGCAACAAAAACACATTGCCAAACGTACTTAGACTTCTCCCTCATGTCTCAAAGTATCCCATAAGGAACCACTAACAATTTTGATTAGGATTCAAAGCATTCCAACAACTCTCCACCTTGACTTGAATTCTCTCACAAATAATAAATGTACCAAATGCAACATAAAACACATTACCAAACTTACTCAGACTTCTCCCTCAAACTTGAGTTTGTGAAGAAAAACTTATGAATCAAATCAGCAGATCTGGAATGAAACGAAAATCTCACAAAAAACGGAAACAATAACTCCTGGGCTAACAAAGATTGTCATAAAGAGATCTAAAACACAAACACCCACAAAGAATGGAAACAAGAACTTCTGCGCTGACAAAGATCGTCATAAAGAGATCTAAAACA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BLAST of Lsi10G001750.1 vs. Swiss-Prot
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BLAST of Lsi10G001750.1 vs. Swiss-Prot
Match: Y2232_ARATH (Probable receptor-like protein kinase At2g23200 OS=Arabidopsis thaliana GN=At2g23200 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 448.0 bits (1151), Expect = 4.2e-124 Identity = 253/567 (44.62%), Postives = 347/567 (61.20%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. Swiss-Prot
Match: Y5241_ARATH (Probable receptor-like protein kinase At5g24010 OS=Arabidopsis thaliana GN=At5g24010 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 8.2e-120 Identity = 285/783 (36.40%), Postives = 433/783 (55.30%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. Swiss-Prot
Match: Y5613_ARATH (Probable receptor-like protein kinase At5g61350 OS=Arabidopsis thaliana GN=At5g61350 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 421.8 bits (1083), Expect = 3.2e-116 Identity = 290/812 (35.71%), Postives = 423/812 (52.09%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. Swiss-Prot
Match: Y2393_ARATH (Probable receptor-like protein kinase At2g39360 OS=Arabidopsis thaliana GN=At2g39360 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 421.0 bits (1081), Expect = 5.5e-116 Identity = 289/797 (36.26%), Postives = 439/797 (55.08%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LTD8_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G425780 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1118.2 bits (2891), Expect = 0.0e+00 Identity = 567/757 (74.90%), Postives = 630/757 (83.22%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LR61_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G425790 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 991.5 bits (2562), Expect = 1.1e-285 Identity = 516/775 (66.58%), Postives = 601/775 (77.55%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TrEMBL
Match: D7TTD9_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_07s0129g00960 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 568.9 bits (1465), Expect = 1.8e-158 Identity = 347/783 (44.32%), Postives = 479/783 (61.17%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TrEMBL
Match: D7TTE0_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_07s0129g00970 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 558.9 bits (1439), Expect = 1.9e-155 Identity = 335/778 (43.06%), Postives = 479/778 (61.57%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TrEMBL
Match: A5BGL8_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VITISV_030033 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 557.8 bits (1436), Expect = 4.2e-155 Identity = 335/778 (43.06%), Postives = 478/778 (61.44%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TAIR10
Match: AT5G54380.1 (AT5G54380.1 protein kinase family protein) HSP 1 Score: 470.7 bits (1210), Expect = 3.4e-132 Identity = 303/792 (38.26%), Postives = 435/792 (54.92%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TAIR10
Match: AT2G23200.1 (AT2G23200.1 Protein kinase superfamily protein) HSP 1 Score: 448.0 bits (1151), Expect = 2.4e-125 Identity = 253/567 (44.62%), Postives = 347/567 (61.20%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TAIR10
Match: AT5G24010.1 (AT5G24010.1 Protein kinase superfamily protein) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 4.6e-121 Identity = 285/783 (36.40%), Postives = 433/783 (55.30%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TAIR10
Match: AT5G61350.1 (AT5G61350.1 Protein kinase superfamily protein) HSP 1 Score: 421.8 bits (1083), Expect = 1.8e-117 Identity = 290/812 (35.71%), Postives = 423/812 (52.09%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. TAIR10
Match: AT2G39360.1 (AT2G39360.1 Protein kinase superfamily protein) HSP 1 Score: 421.0 bits (1081), Expect = 3.1e-117 Identity = 289/797 (36.26%), Postives = 439/797 (55.08%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. NCBI nr
Match: gi|449468420|ref|XP_004151919.1| (PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At2g23200 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1118.2 bits (2891), Expect = 0.0e+00 Identity = 567/757 (74.90%), Postives = 630/757 (83.22%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. NCBI nr
Match: gi|778673640|ref|XP_004151918.2| (PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At2g23200 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 991.5 bits (2562), Expect = 1.6e-285 Identity = 516/775 (66.58%), Postives = 601/775 (77.55%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. NCBI nr
Match: gi|659111587|ref|XP_008455810.1| (PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At2g23200 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 634.0 bits (1634), Expect = 6.6e-178 Identity = 314/406 (77.34%), Postives = 355/406 (87.44%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225438855|ref|XP_002278713.1| (PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At5g24010 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 568.9 bits (1465), Expect = 2.6e-158 Identity = 347/783 (44.32%), Postives = 479/783 (61.17%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi10G001750.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225438853|ref|XP_002278695.1| (PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At5g24010 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 558.9 bits (1439), Expect = 2.7e-155 Identity = 335/778 (43.06%), Postives = 479/778 (61.57%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this mRNA:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
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