Lsi07G008940.1 (mRNA) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)

NameLsi07G008940.1
TypemRNA
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls))
DescriptionUnknown protein
Locationchr07 : 10227356 .. 10233888 (+)
Sequence length503
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSthree_prime_UTR
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ATGGGTCGTGATTGTTATAAAAAAAAAAGTGAATCCAGTGACATATACGTTCTACATTGACCTAAACACGTCAAATATTGACATAACAACCTAACATATTGTACTACATAGTCGTGTTGAAGTGCTATCAAAATCTTGCATTGATTAAATAAGGAAAGTCAATCGTGAGCATATAAATGCTAACAATTATTTTTGCATAAACAAAATTACGAAGATGTATGTTCACAATGGTAAAAATATTTGGAGAGTTGAACTCTCAAAAGAAAGACAAAACAATGAAGCATAATTTGTTTTAATATTAGTTGAAAATAGCATTTTTTTAAAAAAATTTATTTTTTACAATAGTTGAAAACTGGATGTGCTATGCTTAATTAAATGGATTATTATTTGAAAAAAGGAAGGTCATTATTTTGCCATTCATGACATTATCAAATATTCAAATTAATGTGTTCAAAAGTATATTCAAATTAATATTAATTCAATAATGTGGACTAACCTTCCCCATTATTGGGTACAGATGCAGACCAACCAACCTTTTGGGTATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCTTCTAAATTATACAAAATGCACTTAAATTTTTTACTATTAAATATTTATGGACAGTCAAAAGTTTCAAAACTATCTTTAAACTTTTAAAAAAATAGTTTAAAAATACTCTTGTTGTTAGTTTTGGATGGAAATCGTTAATGTTTTGTTTAAAAAATACCTTTAAACTTTCAAAAGTTTCAAAAATACCCTTAAACTTAAAGAAAAGTTCAAAGATACCTTACTGAATAGAAATCGTTAATACCTTGTTACATAAATACCTAAAACTTTCAAAAGTTGCATTTGTACCCTTATTAAAAAAAAAAAAAAAGTTAAAAATACTCTTATCGTTTATCTACACCTCATCACCTCTTTCATTTTCTTTCTCTCCCCTACTTCAATTTATGATCTATCACTTCTCTATTTTCTCTGTTTTTTTTTTCTCCCCTCTTACTCTCCTTCTTGTTAACCATTTAACCTTTTGCTTATCTCATTAAAAAAAGAATTTCCCCATTCAATTATGGTATATAAATTATAACAAAAAGAAAGAGAATAATGGAAGCACCAAGGGAACCTTCAAAGTTATATGTTTTAACAAGATTATAAGTTAGTTAGTAGTTGAGTGTGTGTTAATAGCCAAATACGTTTATTTTCATATTTGGCTATTTATAATTTTGGTAAGTTTTAAGGTGAGATTTTTACTTTTGGAGTTTGGTGAGATTTTATGTTTTAACTTGAAGTTATGGTTTATATTATTTTGTGGCAAAATTGATGTAAGAATTGGAGAAATGAGATAAAAATGAGAGTATCCAATATGAAAAAAAAAATATATATCTACATAATTTGTTTTAAACTTGGTCATTTTCGAATTAAAAAAAAACTCCAAACAAATTTATCACTATATTAATGGTAAGAACATTTTAAAACTTTTTTTCTTTCGCAAGAAGAGTATTAATGCAATTTTTAAAAGTTTAAGGATATTTGAAACAAGTATTAACAATTTGTATAACTATTTTTTTCTCCCATTAACCAACCTTGCAAGTTACATTATGAAAAGAAAACAAAAATAGAAAAAAATATCAAATTATAAGTTTAGTGCTCATGCATTTGTTGTATTGTTTAAAAATTAAGTGGTAGACTGATTTAAGATATTTTAGGCCTTTGTAGTTGAATGAAAACCTACTAAAAACTGGAAAACAAAATACATAATTAAACTCAAATAATATTAGGTAGGTTAAAGAATATTTTCGGTACTACCTACTTTTACGTGGAATAACATTTAGTTCCATAAGTTAGAGCATATTTGGATCAGGAATATATGTTACCTGATACAATTTAAGTAAAATTAAATGTCCATTTTAGGTATTTTAATTTTAGATTTATGTCTTTATGATCTCTAAACTTTAAATGTGTGTAATAAATTCTTAACTTTCTAATTTTGTATGTAATAGAAATACATTATATATTTATAAATATAAAAAAAATTTCATTGTCTATACTGCGATAGACTTGAACAATAGAAGTCTATCGCGAATAGACAGTGAAATTTTCTATAGTCGTAAATAGTTTGATATTTTTCCATTTATAATAATTTTTCAAAAAAGATTCTAAAAAAAATAAATTATTACACATGGATTTTAATTTGGTGTTTGATAAGATTTTAACATTTTCAATATATTTTAAGATTCAAGTATCTAATAGACATTGTTTAAAGTTTAAAGTTTTATTCGATCTAAAATTAAAAATAATTTAAACGTCTATAAGAAATTGTTTAAACTATTAAGACATATTCCACACAAATTTAAAAATGAAAGAATTGAACTTATATTATTACCTTCCTATAATTATAATTTTAAATAAATATGTTAAAGTAATATTTCTTCCAAAATTATAACAAACCATCATAGGACACGTAGAGCTACCTCAATCCGTGCACCCCCGACTAATGATCTATGCATAGATTTTGGTAATTCATTAATATGAATTTACCTATATATATTATTAATATCTATTACTTACAATTTATATAAAAGGTACCAAAAGCAATAATTTGGAGCACGTACTCTTGGCACCTATCTAGATCATCAATTTGTATATTATTTTAAAATAATTAAAATTACTCTAAAATATGTTTTAATTTATGTAAAAAATTTCTATCAATAAAAGTGTTAACAATTTTTATTATGTTTGCCATAGTTAAGAAACAAACATACTTTTGAAGAATTAAAATGAATCTTTAAGCAATATTTTAGGATTATTTTGATAATTCATTTGTTTTTTTTCTATAGTTTAAACTCAACACATTCATGAATGAAATCCATTTAACATATTTGAAATGTTTGCTATAAATAGAACCACAAATTTCAGAAATCTATACTTTACATTATTATAGAGAGACCAATTGAGAATTCAAACACAGAAACAGAGAAATGGAAAAGAGAGTTTGATTCTTTCAGAAAGGTATCGACATAGTTTCACTTTCAGCAAGGTTTCCGGCGGCGGAGGCGGTGGCGGCGGTTTCATTGAAGATCAATCCGATCAGAAAATCGAAAACATCAGTGGCCAAAATGGCGGAAGCCACATCCTCTTTGTGAAGCATCCTCTTCTTGCTCTGCATCGCAATCATCCACGATCTCCTCGTCAATTCTTCGATGAACAGTTCACACGCCTTCGAGAAAACGATCGGAGCCTCGCCGGAGATCATCTTCACCTCCTCTCCGGATTTCTTCATGATCTTCTTTATCCTCGCCAAAGGCAGTGAGTGCGGCCCTGTCTTCCAGTACATCACGCCGGAATATGCTCCCGCTTGCCTCATCGGAATATTCCTCCGTGCTCTGCTTTTGATCGGAAACAGAGATTCTTCGATTCAAATTGAACTGAGAAAGCTTTCTCAATGGACGTATGAATTTATAGGCGTTGTGGAAATGCTGCTGCAGCCGGCCAGCCTGCTCCGATTAAGGTTACTCAGTCCATTTAACATATATTTTTTTTCCTTTTCTCAAATGGATTCATGATTAAGGGAGGGTTTATGATAATTAATTACACAAAACTTATAATTTTAATGTTTAAACACATATTAGCCGTCGTTATTGGTTTCAATTTAAATATTGGTTTTCGTTGCTTAAGATAAATTGTACCTTTTGGGTGATGTCACTCCCATATATTAATTTTTCAACCTACCGTTTGAATTTGTTTAAATTGTAAATTTAGAGCTTGATTTTTATTTTTTTTTATATCCGTGAGTGTCCGAACCAGCTTACACGCACATCGACTAAGACAATCCATTTGATCCTACAACATTTGAGACAACCCGTCCTTAAACCATTTGGGTGTCAAGGAAACCAATGTGATATTGAATCCTAGGCAGATAGTCACCATGAATTGAACCCATGATCCCCTATATTTTATGATGTTTCCACTACCATTAGGTCAACCCATGATAGTCGTTAGAGAGATGAATTCTTAGCCAAATTCTAAAAACAAAACAAATGTTAAAAAACAAGGGCTCTTTTCAAATATAGAAAAATGAGCAAAATTATTTATAAATACAGAAAAGTTTTACCGTCTATCAATGATAGACCGAGATAGAATTCTATGGCTTTCTATCACTCAAGCGATAGAATTTATTTGTTTGAGCGATAGAAAACGATATAATTCTATCGTGGTCTATCATTGATAGACAGTAAAAAAATTTTATATTTGTAAATAGTTTGATTATTTTTTATGTTTATAGTAATTTCCCAAAAAAAAAAAGCTATTTTTTTTTAATTTTTTAAAATAGATAACAAAACAAGTAATTTAGAGGTGGGATGAGTCTTAATAGGCTTACATTTTAAAAATTAAATGGTTATCAATCAGACTCTTATGAACTAAATTTTTAATTTAAAAAAAGTTCGGAGAGCAAATAGACTCAAATTTCAAACTTCATGAAATTAATAAATCTATAAATTTATGATTTTAATCTAGGTTTCTAACTTGGGTTTAGACCATGCTTATAGGATGATTAATAGATCTTAACACATTAATCATATTAATTTATTAGTGGGACAGTTGATAATGTCATATGAATATGTCATTGTTAATTTGAATATATGTTATTGCTTAAAAGATAAAATATACCTTTTAGGGTTGGAATATAAATTCATCTAACAATAGTTGAGCTTTTAGAGAGTCTCATAACCTTATGATTTCAACTAATAATTTGAGTAAAGTGTGGGAAATTTCTTATTCATTGGAGAGCAATATGTGAAATTAAAAGAAGTTCCTTTTTTAATGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTTAATTTGGTCTATAAAGTTTGTTTCCTCTCAAACAGATTCTTATGGCATATGCCAAAATCCCTAAACTAATGCAAATTAGTAGCCAGCCAGTTTAGACTTTGAATCTAATTTATTCCTCACTTCTCTCTTCAAGTTGTTAATGTAATGTCATGAAATATTTAAATATGAAAGCCATCACATATAGCTTAAGTCATCAAAAAGTATATGCTTGTCTCATGTGTATTTGTTTATTTGATTTAACACAAAAACAAATGGATCTTACATTATTTCATGTAGTTTCATTAGTAAATCAACCTTTTCCATCCATTTTAAATAAATTAAAAGAATTTCAACAAAAAATTGACGTTTTATCAAACTTGATTGAATGAGAAATGATTCAAAATGTTTGTCAGGATTGTCTCGAGCTAAAAAATTGACTATTAGGGGGTGTTTGAAAATTGGATTATAATCAGAATTACCGAAAATTAGAAGAGTATTGGAATGTGTGAGGTATCAAAGACAGAATATAAATAAGATCGTGAAATGTGAAAACGGTGGGAAAGAGTGTTTAGTTAAAAACTGTAAGAATGAAATGAGTTTAATATTACAAATTGAGCCTAAAACGCTCAATCTAAACATAGGTTTTAGATTACATTACAATCCAAACCTATTTTATTAGAGACCGTACCCCCAAATAGTCTCTTAAAGTTCTTTATGAGTAGATATGGTTGCCACTAACCGGCCAGCCTGCTTGGCTAAGGCAACAAAATATAACTTTTTGAGGTTAGATTAGGGTAATGGAATAAATACATATACGAATATTGGACTATGGACTTTTCAAATTTTCATTTGCCTATAATATATTAAACTTTGGTCAAACTCTCTTAATGGAATAATTAAGCATTATAATATGGTATGATCAAGTAAACAGAACTTGTTGATTGAACAAACATGAAGATCTGGTCTACTGTTTTCATGGGTATGTAGGAAACAATTCCTAGAAAATTTCAAATTCATTCATCTGAAGAAAGTTGTTTATGTACATGTTTTTTTTTTTTTCAACAATGAGAATAATCATTAGCTAATAAACTCTCATTTTCTTCATGGCAAGTTTACAAGGATTTAAGCAAAGGATCACATGGCTAGACATTAATGGAGATCTAACATTGAGCTTTTTCTGTAACCAAACAAGGCAGGGGATAATTTTTGAGGGAAAACAAATACAATATACAATTAATTTATTCACTTTAGTAAAATGAGCTCCTCAACTATACATTATATATGGGTATTCAAGTACAAGTGTGTTAGAGAAGAGTTAATTCCTCTTTGCATTCTTGAGATTGCGCACAGTCATTACCAGCTGCTGCCTTTCACCTTCTACCTCTGCAAATTTAAGACTTATCTCTGAATATCTCTCTTGCATATCCTTCAGTTCACTTTCCATTGATTGGTTCTTCTCTTTTAATGTTGACAATTCTGTCAACAGTTTATCAAGGTTTCTATCGCTATCGCTGACCGTGGATAGTTTCGGTGCTGTTTCAAATGAATTCTTGTTGCTGCAGGGAAAGACAGGAAATTGGATTCCAACAAGTAGAAGCAGAAAGGGAATATAAGAAAGGAATTCAACTTTGGTTGTTTTAAATTAGTACCTATTGACTGATAATTTATTGCTTAAGTCGTCTGCTGTCTTTCTCGTCTCCTCGGATATTCC

mRNA sequence

ATGGGTCAAAGGTATCGACATAGTTTCACTTTCAGCAAGGTTTCCGGCGGCGGAGGCGGTGGCGGCGGTTTCATTGAAGATCAATCCGATCAGAAAATCGAAAACATCAGTGGCCAAAATGGCGGAAGCCACATCCTCTTTGTGAAGCATCCTCTTCTTGCTCTGCATCGCAATCATCCACGATCTCCTCGTCAATTCTTCGATGAACAGTTCACACGCCTTCGAGAAAACGATCGGAGCCTCGCCGGAGATCATCTTCACCTCCTCTCCGGATTTCTTCATGATCTTCTTTATCCTCGCCAAAGGCAGCGTTGTGGAAATGCTGCTGCAGCCGGCCAGCCTGCTCCGATTAAGGGAAAGACAGGAAATTGGATTCCAACAAGTAGAAGCAGAAAGGGAATATAAGAAAGGAATTCAACTTTGGTTGTTTTAAATTAGTACCTATTGACTGATAATTTATTGCTTAAGTCGTCTGCTGTCTTTCTCGTCTCCTCGGATATTCC

Coding sequence (CDS)

ATGGGTCAAAGGTATCGACATAGTTTCACTTTCAGCAAGGTTTCCGGCGGCGGAGGCGGTGGCGGCGGTTTCATTGAAGATCAATCCGATCAGAAAATCGAAAACATCAGTGGCCAAAATGGCGGAAGCCACATCCTCTTTGTGAAGCATCCTCTTCTTGCTCTGCATCGCAATCATCCACGATCTCCTCGTCAATTCTTCGATGAACAGTTCACACGCCTTCGAGAAAACGATCGGAGCCTCGCCGGAGATCATCTTCACCTCCTCTCCGGATTTCTTCATGATCTTCTTTATCCTCGCCAAAGGCAGCGTTGTGGAAATGCTGCTGCAGCCGGCCAGCCTGCTCCGATTAAGGGAAAGACAGGAAATTGGATTCCAACAAGTAGAAGCAGAAAGGGAATATAA

Protein sequence

MGQRYRHSFTFSKVSGGGGGGGGFIEDQSDQKIENISGQNGGSHILFVKHPLLALHRNHPRSPRQFFDEQFTRLRENDRSLAGDHLHLLSGFLHDLLYPRQRQRCGNAAAAGQPAPIKGKTGNWIPTSRSRKGI
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Lsi07G008940Lsi07G008940gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lsi07G008940.1.CDS.1Lsi07G008940.1.CDS.1CDS
Lsi07G008940.1.CDS.2Lsi07G008940.1.CDS.2CDS
Lsi07G008940.1.CDS.3Lsi07G008940.1.CDS.3CDS
Lsi07G008940.1.CDS.4Lsi07G008940.1.CDS.4CDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lsi07G008940.1.three_prime_UTR.1Lsi07G008940.1.three_prime_UTR.1three_prime_UTR


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Lsi07G008940.1Lsi07G008940.1-proteinpolypeptide