Lsi06G007130.1 (mRNA) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTTGGAGGAGGAGGGGAGGAAAACAAGAAGAAATGCAAGCCTTGTGTTCTCAATTGATTCGAAGAAGAAGGAGCATGGTGATCGTTTTTCTGTAAATAGTTTGTCATTTTCGACATATGTGAGAATTTTCTTAAATAAATTAGATTTATTTAATTAATAGAGGAATTTTTAAAAATAGAAAAATAAGGGAAACTATTTACATAGAATAGCAATTTTTTAGATAGTTGTGATAGACGCTGATAGACGTCTATCAGTTATCAGTGTCTATCAGTGATAGAAATTATTGAAATCTATCATAGATGCTAATAGAAATCTATTAATGTCTATCTTTTTTGCTATTTTCAGTAAATAGTTTAACATTTTTTCTATATGTAAAAATTTTCCTAATTAATATTTAATTAATAAATATATTATTAAATTTGATTTATTTTTTATTTATTAATTAAAATACTCCTCGGCATTGTGGGTTAGTGGGAGGGGAGTGATAACACACACAATAAATATAAAGTCAAAACCCTAGCTTTGGCTTCCTTGAATCTCCTACGAATTTATATACTTTTTTAATTGCCTATTATTTGAAATCCCTCCATATTTCACTTGAAACCAAATCAAAATCAAAATTTCAAATATCTTAACCAATATATTTGAATTAATTATCTTATCAATTAATTAATTATCTTCTCAAATTAATTAATTACTGTTGGTAAAAAATTGGTTTTTAAACAAAAAGTGAATTTTTGGGAGAGATGAGAATCCCACGTTGCTTAAATAAGCATTAGGATCTCACCATATTTAACCCCTCCTTTAGCATTCGGCATGGGTCCCAAGGGATATTCATGTTTTAGAGGGAGTGAGGAGATAAATCAGGGTGGGTTTGGTGGCTTCTCCTCACACGCGCGTGTCGCGACTGTCCGGTCAGGCATGATGTGGAAATAAAATAAGTTTTATTTTATTTAATTATTTTTTAATATTTTTTAAATGAAAAATAAAATAGTATTTACCATTTTGCCCCTCGCCGCATCCACCGCGGGGTCAACCGGTTTACGCAACTGCGTCATTTTTTCGACACACGTTCTGCACGTTCTATGGCTGAGCACTCATCCAACATGCGTTCATTGGCCTTCAAGGCATATATAAAGCTGGCTTCACCAGCTAATTCTTTCAATGTGTTCGTCAGTTTTCATAATCCTCTTATTTTCCATCCTCCGAGCATTTGAAGGGTGTGAAAAATCTGATTATTACTTGTGCAAGTTCCGATCGAGACAGACTTTCTTCTAGGTTGTTTTATCCTGGGACGATGCGGCAACAAATTTGAAACTGCTTGCACCTTGGGTAGAGCCGCAAAACGTCTTAAAGAGAGCAAGCTTCGCGACTCAGCCTTTACAAGTTTTTTTTTTTGCAGGCATCCATCACTAGGCGTTCAGAACCAGGCGTCCAGAATCAAGCGTACAACACCAGGCGTCCAGTATCAGGCGCTCAAAACTAGGCGTCTAGCATCAGACGTTGATCACCAAGCGTTAACTGTCAGGCGTTTAACTTCTCAACGCATTTCCAGTACCGGTTTCAACAATTACCTTATCAAATTAACTCAAACTTTGGCCACAACAAAATAAACTCCCAAATAATTTAAGAAAAAATAAACTAAAATTACCTAAAATTTAGAATGTTACAATATGGTCCCCTTATCAGCTCACAACACATCAACAGGGATCAAAGGTATTGAAAGAAAAATTTGAAACGTTTAAATTTATTTGTTTAAGGAAAATATATTTATTGTATTTGATACAATTAATATAAGTATTGATGTATTATAATACATTAGTATTATAAAGTTAAATTGAATGAGATTCAAATTAAAACAATTATGAGATATTTGAATAAGATTCAAATAATTAATCATTTTATTATCGGATATTGAAATGATTAATTAATCGAATTAGGTTTTAACCTCATTAGGTCCTAGAAATAGGACCTTATAGAAGAAGTGAAGAGAAAAGAGAGAATACTAGAGTAATTTTGTAGTTCACGTATTTTCTCTAAACTCTCTCCCAAACCATAGAGAAAAGTTCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATCTCCCAATTCCTTTAGTTCTTTAAAAAATACTCTCACAAGTTGGATCCTTGCGGAGTCATGGCAAGGAAAACCTCGTAGAGGAGAACATTAATTGAAGAAGGATTTTGTTGCAGTTACGTTTCTACAAAAGTATGATTCTCATATGGTTACCCTCTTACTGGTTGTGTATGGTTTTAATTGAAAATTAAAGTGAGCAATTCCATCACTTCCGCAACAGGATCAAAGCTTTCGATCCCTTCCATCTTAAGTTAAATTGGCCAATTAATTAATATGCTAACGGAGTCTTAATGTTGAGAAAGTTAAGATAAAATTGATTTCATAAAAAAATATGAGACTAAAAGCTTAGAGAATGGATTGTCATGTATGCTTAGAGAAAAGATACACCATAGGATATAGAAATTGTATGAAATAATCTAAGATTCAGCTAACCATAGATATATAAGATTAGCTACTTATGCTTCTAAAGAAACTTGATACAATACCAAATAGGAGAAGTTTCCTGTCCATGTTGAATCACTATCGACGTGATACGACCGTATAGCCTAAGACATAAGCCTTTTTTGGTAGAAACTAGACTGTAATCCCCGTTTATCAACTATGATTTACTGCTTTTAATCAACAACCAATCAATCATCATTTTTTTAACTCGGTTACCATTGGTAATTGTTTGCATTATTTTAACAAAAATCTAAATAAATCTAGTCCTATGGGATACGTGATAACACCTTAAATATGCTAGCCTACCCTGCTTAATTCTATTTCATTCCTTGGTTTTACACATTTATTATTGACTTTACAGGGCTTGAGCGTAATTGAGGTGAAATTCAACCTTGAGGCCCAAATCAGGCTAAAAGAACCAAATCAGGGCTAAATAACATCAATTGGTGCAAAAGGATGAAGAAGGCATCCATGAGGTTGGCGCTGCGGCGTTGGTTGGGCACTTCAAACGGTGTGAAATCCAGTAGTACCATCTTGACGAAGTGCCGTAGTGCTACGAACTTTAACAGAACTAGTGTGCACTAGAGCGTCACAGCACTGCCACGATGCTATGGCATGATGCCACGACTTTAGGGTAGAAGCGTCGTGGCGCTTCCCTACAGTGTCGTGGCGCCAGTGCATTTTCTTATTTAAATGCCCTAGCGACCATTTCCAAGGGAGGCACAAATTTCTAGACCCTAGAAGCCATCATTTCTCATTCTCTCTTGTTCTTTACTGTTTTTGGCTTGTACGTTTGTTAATGAATCATTGGACGCTTATTTCAAAGATGATTCTCGGTTAATATTGTAAGTTATAGCTTGGGGATTTAGGTATTTCATCCTTCTATGTATTTGTGAGATATAAACTTCGTCTTAATATGATTTTCTTCATGCTTTTGGGTATCTTCTGCTGAAATTGAACCTTATGATCTTGTTCTACTATGATGGTCTAACGAACTAGTCGGTTTTGCATGATCGGTAGTTATAGAATCACCTTTAATATGCAATCGCTAAGTAAATGATTCACCAAGTGACAAATAGTGAGGTTAACTTGTAAATTGTTGAGGTTTCATAAACGAACATTGTTTAACCCACTATGTGGAAAATGCATTTGAATATTTAATTAAGCATCTCCTATTTTATGTTCATTTTAGCATTTCTCACCTTCACTTAGATTAATTAGATCACTTGGGTAATTAATTAGTGTTTCTAATTAGTTCGGGTAAACACGAAGCACAAATTGATTTACTAATGTTTTTGATGATCAAATTAGTTAAAGAAATCCTTACCAAACCCAAGCTAGATCCTTTAATCTTAATTTTCACTCTCAATCACCACTTCGACATTTACATTCGCATTCACTTAATTAAATTTCTTCAGGTACATAAGGCTCAAATTATTCTTTTAGGAAAATCAACGATTCTATGAGGTTCAACTCATACTACCGCTAACTCAAGCATAAGTAGGAACAAAATTATTTGACCTGGGACCTTCAACAAGTCACGACATACCAATACGATACTTGAAATACTCCCAAGTATTGACAGTGTATGCTTGCACTTAGACCACTCTTATT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Match: M5XVI7_PRUPE (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa022968mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 7.5e-36 Identity = 82/192 (42.71%), Postives = 109/192 (56.77%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007130.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0D3HL17_9ORYZ (Uncharacterized protein OS=Oryza barthii PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 156.8 bits (395), Expect = 3.7e-35 Identity = 93/213 (43.66%), Postives = 124/213 (58.22%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007130.1 vs. NCBI nr
Match: gi|659086035|ref|XP_008443732.1| (PREDICTED: 23 kDa jasmonate-induced protein-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 334.0 bits (855), Expect = 2.4e-88 Identity = 157/212 (74.06%), Postives = 175/212 (82.55%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007130.1 vs. NCBI nr
Match: gi|700211516|gb|KGN66612.1| (hypothetical protein Csa_1G642550 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 297.4 bits (760), Expect = 2.5e-77 Identity = 146/212 (68.87%), Postives = 163/212 (76.89%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007130.1 vs. NCBI nr
Match: gi|694188379|gb|AIS71930.1| (23 kDa jasmonate-induced protein [Citrullus lanatus]) HSP 1 Score: 295.4 bits (755), Expect = 9.6e-77 Identity = 140/213 (65.73%), Postives = 165/213 (77.46%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007130.1 vs. NCBI nr
Match: gi|778663970|ref|XP_004139150.2| (PREDICTED: 23 kDa jasmonate-induced protein-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 240.7 bits (613), Expect = 2.8e-60 Identity = 119/175 (68.00%), Postives = 130/175 (74.29%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi06G007130.1 vs. NCBI nr
Match: gi|743780066|ref|XP_010920410.1| (PREDICTED: 23 kDa jasmonate-induced protein-like [Elaeis guineensis]) HSP 1 Score: 231.9 bits (590), Expect = 1.3e-57 Identity = 112/214 (52.34%), Postives = 143/214 (66.82%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this mRNA:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
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