CsGy6G013320.1 (mRNA) Cucumber (Gy14) v2

NameCsGy6G013320.1
TypemRNA
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Gy14) v2)
DescriptionUnknown Protein
LocationChr6 : 11754766 .. 11757776 (+)
Sequence length267
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTAGGTTCCCCCACTTTTGATAATGCTATTTATTATGGGTTTGATCTCAAAGGCTTCTTTTCGGTCAAGAGTGCTTACCATTTGGCTATTAGTCTCAACGAGCCTAAAGAGGCTTTGGTTTTGGATGAGTTTAATATGAAAAAGTGTTGGAACGCTTATGGAAGACTAAGGTCTTTCCTAAAGTGAAGATTTGTATGTGGCAACTGTTAAATGATGTTATCCCTTCAAAGGGCTCAACTTCGAAAGAATGGAATCGAGATAGGCACTTTTTGAATTTTCTGTATAATTGAGAAGGAGTCTACCATCCATCTCTTTTTCACATTGCTGGTTTGTTAAACAAACATGGTCCTATTTTTCTTCCTTATTTATGTTTGCCTCTTTTCTTGTGTAGGGACAGTTTAATAAGTGTAGATACCGTATTTTGTCCTATATTTATTTATTATAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATTAAATTTGAATTTGAATTTGAATTTGAATTTGAATTTGAATTTGAATTTGAATTTGAATCTTAAATTTATATTTAAAAAAAACAATAATAATAATAATAAATACATTTAAAAATAAATAATAAAAATAAAACTAAAAGGTTTGATTTCCTTCCTATTTTTTCTCAACCATCCCTTTTTCTTCGTCAACACTCTCCCACTTTCTCCCACTCTATCACTTTCTCCCACTCTCCCACTTTCTTCCTATTTCTCTGTAATCTGCACTCCATCTCGTGATCTAAAAAAAACAATGGAGCTTGCCCTATAAAAAGGAAAGAGGAAAAAGAAAGGGGGGATCTTTTTTTTTATTATTGGAGGATTTAGAAAGAGGTGAAGAGTGAAAGAAGATCAAAAGGAATAACCTTTGGCATTGAAGGGCAGACCTGCTGGTAAGTTTTTTTCCTTTTTTCTCTTTTTGTTCTTATTCTTGTTTAATGATTTTTTTTTTCTTGTTTGATATACTGCTTTTAATTATGAACTATCGTGTTCATCATTTTACCATCATTTAACATGTTAATTTTATTATTTGTATCTTTCTTAATACTGAGCATTCTACCTTCCATTCTATATTAAATTTTTTATTTTTTGTTTTTAAATATTGAGCATTCTGTTCTGTGTTAATTTCTTTTTAATGGTTGGGTATCCATTCTGTATTAATTTCTTTTTAATTGTTGGGTATCCATTCTGTGTTAATTTTCTTTTATTATTGGGCATCCATTCTGTGTTAATTTTCTTTTATTACTAGGCATCCATTCTGTGTTAATTTCTTTTTAATTAATTAGCATCATATATTTGTATTTGGATACTCATTCTTCATTGACACCCATTTTACAGTTAATTACTTATATCCATATGGCATGCCTTAATAATTATGCATAATTAATCAATTAGCCTTCTTGGTAATACTCATTCTTTATTGGCACCCATTTTACAGTTAATTACTTATGTCCATATAACATGTTTTAATAATTATGCATAATTAATCAATTAACATCCTGTATTTGGTAATACTCATTCTTCATTGGCATCAATTTTACAGTCTTTGTTAATTACTTTATCCATGTATCCATATGGCATACTCCGTTAATAATTACTGCTATCCATATATTATTCATGTTAATAATTATGCATGATATAATTAATATTTGGCAACAACCATTTTTCATTTGGCCTATTAATTAATTAGCAACTTGTATGTGACATTTTCACTCCCTCATTCTAATTATTTGCATGATGTATTAGTTAATCAGTATGCATATGTGGCTATAATTATTTGATATTCATTTTGGTGTGATTGTTTATTTGCAATATTATTTATTTGCATATTGGGCCAAACCTACTTTGGCATTCAACTGTTAATTATTATTTGATATTCATTTGGCCATCGTTTAATTATGCATTAATCAATTATTTTGCATCCTGCATTAATCAATTATTTTGCATCATTTTGATTTAATTAATTATGTTGCATGTGTTGTATTAATTAATTATCTTGCATCCTACATTAATATCTTTTACATTTTGCATATATTATCAATGTATTTATTTTATCTCAGCATATTACTTCTAAGTATTTTTTCAAATTTCATAATGTTTTGCCATTGTTATTATTTTTTATTTAAATATAATAACGTAAATTGGAGAAAAAGTATTATTTTTTTATGGATTTTATAATTTAAAATCCATAAATACATGAAATTTTTCCTTTTGAAATTTAATTAATAGATTGTCTTTTAAATTAACACATTTCATATTTTAAATGAGACTGAGTAGTATTTTCTATGAATTTATTAATTCTAGATATATGAAATTTTTCATTAAACACCTATGATAGAGATTAAAATATCAAGTTTTGGTATCTTAATATTCTTAAGGTGAATAAAAATCTTTTAAAACAAAAATAAACTTAATTTTTCTAATGGCTCCTATGCCACCCATAATCATCAATTCATGCTTAGGTTTTACTTTCTTCGATATGAATTGATAAACATGGGACATTTAAACAAAACCTAAATAAAAACTTTGTTTTGTGAACCTCTATAATTTAATTTAAAAGATAAAATTGGGTAACCATTTTTTGGGTGTTGTAGGGTGCTAACACCTTCCCTACACACAACTGACTCCCGAACTTAAATCTCTGAATGTACGCAGACCATTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGGGTGACCAATCACACCCTAATATGGTTGGTGGCGACTCCAAAACTATTTATTAAAATTAAATAAACGGGAAGGTCGGCCGCTCCGCGTAGCGATCACGTCGCGACAATAAGTTAAACTTATGAGATTGGTTAGTTGTAAAGCTATTTAGGAGTTTGGTACCACTATTTTGATTTAGTCGTGTAGAAACTAATGGAATGCCACGAGTTCTATCCCTCATGTATTGAAAGTTGTGTTGTGCAGGCATCTCGTCTGATTGGTCGTGTCACTTTTGAGGTCACTTGTACAGGGCAGTTTGATATTACTCTTTTAGTGAAGAGTTAG

mRNA sequence

ATGTTAGGTTCCCCCACTTTTGATAATGCTATTTATTATGGGTTTGATCTCAAAGGCTTCTTTTCGGTCAAGAGTGCTTACCATTTGGCTATTAGTCTCAACGAGCCTAAAGAGGCTTTGGTTTTGGATGAGTTTAATATGAAAAAGTGTTGGAACGCTTATGGAAGACTAAGTTGTGTTGTGCAGGCATCTCGTCTGATTGGTCGTGTCACTTTTGAGGTCACTTGTACAGGGCAGTTTGATATTACTCTTTTAGTGAAGAGTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTAGGTTCCCCCACTTTTGATAATGCTATTTATTATGGGTTTGATCTCAAAGGCTTCTTTTCGGTCAAGAGTGCTTACCATTTGGCTATTAGTCTCAACGAGCCTAAAGAGGCTTTGGTTTTGGATGAGTTTAATATGAAAAAGTGTTGGAACGCTTATGGAAGACTAAGTTGTGTTGTGCAGGCATCTCGTCTGATTGGTCGTGTCACTTTTGAGGTCACTTGTACAGGGCAGTTTGATATTACTCTTTTAGTGAAGAGTTAG

Protein sequence

MLGSPTFDNAIYYGFDLKGFFSVKSAYHLAISLNEPKEALVLDEFNMKKCWNAYGRLSCVVQASRLIGRVTFEVTCTGQFDITLLVKS
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CsGy6G013320CsGy6G013320gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CsGy6G013320.1.exon.1CsGy6G013320.1.exon.1exon
CsGy6G013320.1.exon.2CsGy6G013320.1.exon.2exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CsGy6G013320.1.CDS.1CsGy6G013320.1.CDS.1CDS
CsGy6G013320.1.CDS.2CsGy6G013320.1.CDS.2CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CsGy6G013320.1CsGy6G013320.1-proteinpolypeptide