CsGy1G032190.1 (mRNA) Cucumber (Gy14) v2

Overview
NameCsGy1G032190.1
TypemRNA
OrganismCucumis sativus (Cucumber (Gy14) v2)
DescriptionUnknown Protein
LocationChr1 : 31465241 .. 31470765 (+)
Sequence length600
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTCACTTATGGACTTAGGCTCACATTTTATCCTTTTATTCAAGAGTTTTTAACTTTATGTAAATATAGTCTCCTTCAATTATTTCTCGATTCTTACCGTGTTCAAAATTTCATTGTTCCATGTTCGACTGTCATAAGAGGATGTAAAGAACATTGGTTTTTCTTCGACGGCATCTGGCTCGCATTAGACTGTGAAGGTCGCGTCCTTCTTTTATGGTCCCAATCTAGTTCAGATGTTTTAGTAAGTTCCTCGCATATTAGCTAGAATGAAATCAGCTTTAACAACTCATTATAATGATGGGTAGTTTTCTTCAGTTTTGGGCATTTGATTGTAAACTTGTTTTGATCACTAGCACAATTCTCTATTTAGTCCTCTCAATTGACAATCATCTGTTATGCTCGATCTTGACTGAATCTAAAGACACTACTATGATTTATATATATATACTTTGTTTGGTAGCTTATATCTCTAAATTTCAAAATTATGGTTATTACAACGTGAAATATAGGTCTTAGATTATTGTGTGTTACACATTAATGGTGGCATAGGCAATTGTGAGTAAATTGTTGGTTTTGCAACATTTGGTTATGAAGTGTTATTATATAGTACATGAAAATCTAAATTTGTGTGTACATAAAAAGATAAGAATAGGGATAAGGGAGAAAATAAAAGGGGGCTTAAAAAAGAAGCGTCGGTGTGGAAAGGTGAATGGCACACGTGTGAGGCACTTTTCGAGGGAAAGATAACTGTGGGATCCACAAGAATTATTTTGCTTTTATTGAGGAGTGGGCCCAATGGGCCGTGAAGGAGAGTTTGATTAGCTGGGAAAGGCCCATAGGGGTATGGTGTTTGTCTGGTGCACGCCCAAGACAAGTCCCTATCCCTTTGTTTCTTCTCATCTGTGCTTCACTGTTTCTGTGATCCATTTCTCATCGCTTTCACATCCACTTACTTACTCTTAACTACATTTTAGTGCATCCATCAATCAAAAACCAACAACTATCTTTTGATATTAGTATATTATCCCTTTATACTAACACATAACACCCACATCTAAATCTACGATCAAATAACGTAGTCTAATTAATGAAGTATGAGTGTTCAATTCGAGTGCACCTACAAATTAAATACTTTGTTATACGATCATGCTTATAATTATCGTTGTGACTACCATTGTTGTTACTACTACGGCTTTAAAAATTATAAATTTTGACATCTTTACTATTTTTGCTTGACTCTAAGTGGCAGTAAGTATGATCCAGAAGCATCTCAATTCATATTGGTTTTTTTATTTTATTAATTCATGTAGGTTAAAATTTAAAAAGAAGTATAATGCATGTATTATTTACCAATTTTAGTATACAATGGGGTTTTGTGGATTTATTAATTGAGATACATCTAAGTTTATAGTTTTAGGGATCGTTTGGATTAAGGGAATCATATGAAAATTAGGGTGGGAATATGTAAGGAATAAATATGTCCTTGTTTGGTACAAGGTTTTTGTTGTTGCAATTCGTCGAGAATGAATGATTTATTGAGAAACCTTAATGCCTAGATTTAACGGCTAGACAAACCATGTGCTAGTTCTCCTTATATTTTGCTTTAAGATTTAGTGTCTTGCCTTGTTTAGCAAAGTGTCTAGATATATCACTTGTTGTCTTGCATTCGTTATTGATTAAAATGCCAAATAATCTGCTCGTTTGGTCAAAGGCTAAGTCGCGGATCTTGCTTTCTTTAAGACTTTTTGTGGTTCTGCTCCTTTGTACAAATAGATTTGAGTTGTCCCATCATTCACAGGATAAAACAATTATGTTCTTCACTTAGTTTTGTACTGAAACTAATCGGAATCTCAACACTCAAATAAACATTTTTTATATGCTTGAAAATCTTACCGAAAGAAAGTTTATAGAAAGCTTTTCTTATTTTTCACATCTATCAAAATGAAGAATGAAAGGTATTTGAGAATAAGAACGTTGGAACTTAATTATGAGAATCAAAACGTTTAGTAATTAAATAAAAAAATTAGTTTTCGAAAATGTTAGAAATTATATAAAAAAGAAACGAAATTGAAAATTTTAATTCTTTATGACGCAAAATGGTCATAATGATTTTTGTATTATAGAAACTAATTTAATACCATTATTACATCTCATCTTGCTTAGTCATCTCGCCTACGATGGCATCACGTAACTTATTTACTTATCTTCTTTCCTCTCCAAACTCTCATTTGGATTAATATGTTATAATAATGATGACATCTTCAATAGCTTAGGCATAAAAATAAGTTATTCTCATGCACCATTTATCCCCATTCAAATCAAGGGTTTTCTTCATGTCTACCATCTTTTCTCTTTTGCTACATTTCTTTATTCTTTTATTTTATATACTATTAAAATTAATTACATGAAAATTAAATTTTTGGTTTATAAAATGACATTAAAATTTAAATTATAGTGCATAAATTTAACTACTCCAATTTAATAAATTAATATGTATATGTACGGGGATCTTTTTTTAAAAAAAAATTGACAACTTATTTACACTTCATAGAACAAAATCACTAAACTACAATTTTTTTACTTTTGATTTTTCTATGAAGTGTAAATATTTTGTCAAATATTCTATTTTTAACAATTTTTCCTATAAAAGTAAAAGAATAAAGAAGTGTACTAAAAGAGAAAAGAGAGTGGACACGAAGAAAACTCATCATTTTGTATGGATATAGTTCATAAGCATAAATGATGGGTGAGAACTATTCTTATGCATAAGATACAAAACATTGTACCAAACAAGAATAAGTTCATCTCTTACTCATTTGCATCCTTATTCCCACATCAATTCCTTCAATCCAAACGCTCCTTTAGCATAGATAATTTTGTATGGGGTAAATTTTTCAAAAGCCAAAATGAATATTTTTTAGATATGTTCATATATGTAGGATTATTTTTAAAAGGAAATTAATTTGTTTATGTAAATTGGTTAACTTAACTCCCATTTTCTTCATTCAAATATATACACGATGCATGCACTCTTTCATTTTCTTTACAATTTTAATTTAGTGTTAACAATATGGACTCAATGGTATGTTATTTAATTTTGATTGTTGTAAAACTAGGTTTAATGTGTTTCTTTTCAGCTACTATGCATCCGCTACCATCTTTCTACTTTAGGGTATTTCTAACCTATATTTACTTTTATGATATTGAGATTTAGATTGAGTAATTTTTCAACGAAAAACAATCGTTTATTGAACTTTATATAGCATACTAGTTTACCAAATGAGATTGTAAACTAATTTATAGTATACTAATTCAACTTTGAAGGATTTAAATAAAGTTTTAACACCTTTAAACGTATTGAAAATGTAATAAATACTACAATGCCAAATCATTTTTTGATTTTTTTTTAAAAAATTGGAAACTCTTGCATACTTATTCTAGGGTTTTCAGCCACCTCCACATCAAATATTTGAGTTTTTCGAGGCGTTTGTAGCCACCTATTTTTTTTCAACCTACTTTGGTTACTTATATAGGTTTAATTTGAGGCTACTTTTAAAAAATAAGACAAAATAATAATAGTAATTAAATAAAGTTTTTTATTAATTAACATTTAAATATTTTTTTCAACTGTTGAAGATGTTTTGGTAAAAGTGGACAAGTTTCTTTTCCCCACAAACTTCATCATTCTAGATTACGAAGGTCATTGGGAGGTGCCTATTATCTTAGGGCGTCCATTCTTGTCAACTGGTCACGCCCTCATAGACGTTCACCAGAGAGAGTTGACCATGCATCTTAATAATGAAGAAATTAAATGCAACATTGCTGACTTGATGAAGCTTTTCGTTGATGTTGAAAACTGTAGTGCGATAGAGTCCTTTGGATGGGACTATTGCGAGGAAGAAGCTTATTTTGAGATGTTTAGCACTGAAGAATTCCTTGATGAAGATGAACTAGAATATATACTGAAGGGAGTGAGCATCGTGTCTGGTGAAAAGAAGTTTGAACCTTTGGATTTCCAAAGGGGAGAAGAAGACAAAGTCATCGATTGAAGAACCACCAAAATTAGAGCTCAAGCCTTTGTCTAACCACTTGAATGCATATTTGGGAGAGAATGACACTTTGCTCGTCATCATCTTTGCCCACATGAATACCACAAAAGAAAAGACATTGTTGAATATGCTAAAACTCCATAAGCAAGCGATAGGAAGGACCCCGGTAGTTATTCAAGGTATAAGTCCATCCTATTACATGCATAAGATCAAGTTGGAGGAGGATCAAACAGGCACCATTAAGTTAAAAATGTAATTCAAGAAAAGAAATTGTGGGTCCTCTCTCCAAGCCATCATTCTTCGTGGGTTTCATACGTGGGTCTCTTCTTGATTCTCTGTCATTCTCCTTTGTTCATCTTCATTCTTCGCCAGTCTCCTCTCATTGGTATCCTCCGACATGGGTTTGGGTTTTATGGTAGCCTTCCACGTCGATTTTGTTTTCAAGGTAGCCTCTAACGACGGTTGAAGCTTTTAATATATTTGACGATTTTATACTATTTTTTAGTTTGGTTCGGTTGGATACTATTGATTTTTAGTTTGATAAAAGAGGGGTGGATGTGGAGATGAAGAAGAAAGAAGTGTCACCTCTCAAGGATGCAGTGGTAAACAAGTGCTACTACAGGTGCTTTACCAACCTTCCAACCTAACTCTTCAACACTCCAAATTAATATGTGAAAACCTTGTCTTTTACATTATTACTAGTTGCTAATTTTAATGTTCTTAAAAATAGGCCTTCAAGTTCTTCGATTGAAACTTAGTTGGCTATATTTGGGTAAATCTAATTGTTGTTTGGTTTCATTTCTTGTTGGTTGTATTGTATCACTGTCTCACACACAAGGCAATATTCTTGTGAGGGTGGAGAGGTCTCCATATCTAGAATTGTTGCTCTGCTATACTGATATGAGCACATGGCAATATTCTTGTGAGATTACACAGTAAGCTGAGTTGTACATTCGTAACATGTGCAAACTTAAATCATGTAAGCATATTATTGAGAAGAGGGATTTGATTATTTGTAATTTGCTTATTGAGAAGAAGAAAGAGGGGATGTCTATAATGTATGATTTCTTAAGAAGAAGAAGGAGAAAAAAAATGACCCGACCCGACTCGACAAATTTCGACTTGACTCGAGTTGGGTCAGGTTGGATTAGGTTATATTAGTAAAATGTCCGTACATTTTGGTTCGAGTTGAATTTGAAGGAAAACCAACCGGACTCAACCCAATTATACCCCTAATTAGGATGTTACAACATATGATGATCTTTGTGCACTTGCATCTTTTAACTGCTTGGAGGTAAAGTTCTACTATGTGAATGAATACAAATGACTTGGTGTAGAAAATGTGGGTAGTTGTAGTTTGTTTTTGAATTAATATAAACGACTTAATGCAGAAAATGTGGCAACCGTTAATGAATGAAACAAAATGTTATCAATTTTTTTGGGGTACTTGTCTTTTTCTTCTCCTAGGTCCTAA

mRNA sequence

ATGTTCACTTATGGACTTAGGCTCACATTTTATCCTTTTATTCAAGAGTTTTTAACTTTATGTAAATATAGTCTCCTTCAATTATTTCTCGATTCTTACCGTGTTCAAAATTTCATTGTTCCATGTTCGACTGTCATAAGAGGATGTAAAGAACATTGGTTTTTCTTCGACGGCATCTGGCTCGCATTAGACTGTGAAGGTCGCGTCCTTCTTTTATGGTCCCAATCTAGTTCAGATGTTTTAGCAATTGTGAGTAAATTGTTGGTTTTGCAACATTTGGTTATGAAGTGTTATTATATAGTACATGAAAATCTAAATTTGTGTGTACATAAAAAGATAAGAATAGGGATAAGGGAGAAAATAAAAGGGGGCTTAAAAAAGAAGCGTCGGTGTGGAAAGCTACTATGCATCCGCTACCATCTTTCTACTTTAGGTCTCCTCTCATTGGTATCCTCCGACATGGGTTTGGGTTTTATGGTAGCCTTCCACGTCGATTTTGTTTTCAAGTTTGATAAAAGAGGGGTGGATGTGGAGATGAAGAAGAAAGAAGTGTCACCTCTCAAGGATGCAGTGGTAAACAAGTGCTACTACAGGTCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTCACTTATGGACTTAGGCTCACATTTTATCCTTTTATTCAAGAGTTTTTAACTTTATGTAAATATAGTCTCCTTCAATTATTTCTCGATTCTTACCGTGTTCAAAATTTCATTGTTCCATGTTCGACTGTCATAAGAGGATGTAAAGAACATTGGTTTTTCTTCGACGGCATCTGGCTCGCATTAGACTGTGAAGGTCGCGTCCTTCTTTTATGGTCCCAATCTAGTTCAGATGTTTTAGCAATTGTGAGTAAATTGTTGGTTTTGCAACATTTGGTTATGAAGTGTTATTATATAGTACATGAAAATCTAAATTTGTGTGTACATAAAAAGATAAGAATAGGGATAAGGGAGAAAATAAAAGGGGGCTTAAAAAAGAAGCGTCGGTGTGGAAAGCTACTATGCATCCGCTACCATCTTTCTACTTTAGGTCTCCTCTCATTGGTATCCTCCGACATGGGTTTGGGTTTTATGGTAGCCTTCCACGTCGATTTTGTTTTCAAGTTTGATAAAAGAGGGGTGGATGTGGAGATGAAGAAGAAAGAAGTGTCACCTCTCAAGGATGCAGTGGTAAACAAGTGCTACTACAGGTCCTAA

Protein sequence

MFTYGLRLTFYPFIQEFLTLCKYSLLQLFLDSYRVQNFIVPCSTVIRGCKEHWFFFDGIWLALDCEGRVLLLWSQSSSDVLAIVSKLLVLQHLVMKCYYIVHENLNLCVHKKIRIGIREKIKGGLKKKRRCGKLLCIRYHLSTLGLLSLVSSDMGLGFMVAFHVDFVFKFDKRGVDVEMKKKEVSPLKDAVVNKCYYRS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsGy1G032190.1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsGy1G032190.1 vs. TAIR10
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsGy1G032190.1 vs. Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsGy1G032190.1 vs. TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CsGy1G032190CsGy1G032190gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CsGy1G032190.1CsGy1G032190.1-proteinpolypeptide


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CsGy1G032190.1.exon.1CsGy1G032190.1.exon.1exon
CsGy1G032190.1.exon.2CsGy1G032190.1.exon.2exon
CsGy1G032190.1.exon.3CsGy1G032190.1.exon.3exon
CsGy1G032190.1.exon.4CsGy1G032190.1.exon.4exon
CsGy1G032190.1.exon.5CsGy1G032190.1.exon.5exon
CsGy1G032190.1.exon.6CsGy1G032190.1.exon.6exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CsGy1G032190.1.CDS.1CsGy1G032190.1.CDS.1CDS
CsGy1G032190.1.CDS.2CsGy1G032190.1.CDS.2CDS
CsGy1G032190.1.CDS.3CsGy1G032190.1.CDS.3CDS
CsGy1G032190.1.CDS.4CsGy1G032190.1.CDS.4CDS
CsGy1G032190.1.CDS.5CsGy1G032190.1.CDS.5CDS
CsGy1G032190.1.CDS.6CsGy1G032190.1.CDS.6CDS