Cp4.1LG03g05410.1 (mRNA) Cucurbita pepo (Zucchini)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGGTTAATGATCTTGTTCACTACGAAACGCACGCTATCAGACGAAAACGGATGAAGATTTCGAAGATTACTCACCGTGCCGGCCGTTGATCTTGGACTTGCAGGAAGTTCTTCTGCAATTCTGGATAGTTGTTAGAGAAATCGAGACAGAGAGCTGCCATGGACGCGATCGAACACACCACCATCAACACCAATGGAATCAAAATGCACATCGCCTCCATAGGCACAGGCCCCGTCGTTCTTCTTCTCCACGGCTTCCCCGAGCTCTGGTACTCATGGCGCCACCAGCTTCTCTACCTTTCTTCCGTCGGATATCGAGCCATCGCGCCGGACCTCCGCGGGTATGGCGATACCGAGTCCCCGGAATCGCATACTTCCTACACTGTGCTCCATATCGTCGGCGATTTGGTTGGGGCTTTGGATGAGCTTGGGATTGAGAAGGTGTTTCTTGTAGGGCACGATTGGGGGGCGATCATCGCGTGGTACCTTTGCCTGTTTAGACCTGATAGAATCAAGGCGTTGGTGAATCTGAGCGTCCAGTTCATACCTAGGAACCCTGCAATTCCTTTTGTTGAGGGTTTCAGATCTGCGTTTGGTGATGACTTCTACATTTGCAGGTTTCAGGTGAATATAATTTGTATTACTTGCTTATATTAGAGGGTTAATTATAAGATTGGTCTAACTCATGATTGTTTAGGCTTCTTAGTTATAGCAAGCATTGGATCTTCACCGTTAAAAAAAAAAAATGATTCGTTTCCCTTTCCAACCACAATCCAACCAGAGATCTCACAATGACCTTTTATTTATAGGCGTCGGCCTCCACAATCCATCTCCTTAGTGGCCTCAGTCTCCACCCTTATAAAGAATGCTTCGACCCTTATAAAGAATGCTTCGTTCTCCTTTCCAACCAATGTGAGTCGGCCTCCACAATCCATCCCCTAAGTGGCCTCAGTCTCCACCCTTATAAAGAATGCTTCGTTCCCCTCTCCAACCAATGTGAGATCGAGATCTCACAATCCATCCCCTAAGTTCAGCTAATAGAGATAGATTTCCACACCCCAACTATCGTGAGATCTCACAATCCATCCATTTGAGGCCTAGCTACTAGAGAGATTTCCACACCCTTTTAGCTTGCTCTACAATCAATGTGGATCTCATTATCCATCCCTTTGGGGTGCAACTAATAGGGAGAGGTTTTCACACCTTCATAAGGAATACTTCGTTCCCCTCGTTAATCAATGTGGGATCTCACAATCCATCCCCTTGGAGGCCACGTCCTCGCTGGCACACCACTCGGCGTCTGACTCTAATACTATTTGTAACGGGTCTACTTTGTCCCGTTACGTATCGCTGTTAGCCTCACGATTTCAAAATGCGTCTACGAGGGAGAAATTCCTCACAAGAAATGCTTCGACCCCTCTCCAATCAATGTGAAATCTCACGATATGTCTTTTAAACATATAAAAGAATCATGTTCTCTTTAATTTGTTAAGTTATCTAGAGAGTCCCATTTGATTGAATCACCAGAAAGTTTCACGTTCATATAAACAGCAGAAACTAAAATGAATTGGTTCTTAACAGGTTCCAGGAGAGGCTGAAGAAGATTTTGCCTCCATTGACACAGCTGAGTTATTCAAGAAATTTCTCTGTAGTAGAAGATCAGATCCTCCAAAACTGCCTAAAGGGGTTGGAGTTCGTTCTATCCCATCCCCAGAAAACCTTCCTTCTTGGCTGACAGAAAACGATATCAACTATTTTGCTACCACTTTCAAGCGGACAGGCTTTACTGGAGGATTGAACTACTACAGAGCCTTCGACCTGTAAGTCGTAGATTTAGCCATTCAGATTGCTCTGTTCTTATTAGTTCAATACAATTGTTCCATGCTTTCAAGTTCAAATCATGTTTCTTTGTTGCAGAACTTGGGAGCTGACTGCATCATGGACAAAGGCACAGGTTCGAGTGCCGGTAAAGTTCATCGTCGGGGATTTGGATCTGACCTACCAGTTTCCAGGAGCCAAGGAATATATCCACAATGGGGGATTCAAGAAGGATGTGCCGTTTCTGGAGGAAGTGATAGTAATGAAAGATACTGCTCACTTCATCAACCAAGAAAGGCCACATGAAATCAGTACTCACATCCATGACTTTATCAAGAAATTTTGAACTCCATCCATTCTCCATTGCTTGAATTGTTCTTTCTTTTTTCAGTGACTTTGAGTAAAGGATAATTTTCATCACATATATGTAGCCCGTTTGCATGAATGTAGTTTCTAATTATAAATAAAGGCTATAAGGTCGTTGGTTGTGACGTTCATCGAGGATCAACTATATGGGTTTCGTCGAAGAATAGGAAAAGATGACTACTAAATTTGGAACTTTTCTCTTATATACGACACCATCTAATGCCCTCTTACCTCCCTCGCTCTCAAAACTCCTCTCCAATGAGACTGGCCACTTGAGGATGTGTTGAATTCAAGTCAATCATGTGTGTTGTTTTCTTTAAGGTTAACTTCAAAATGAGTCCCAACCATCTTTTGAACTATGTGAACTTACGAGTTCATGTCAAAGCTTAACGGGACAAATATCAGAAGATACTTCCATTTTATTACGATAAAAGGCCTACATCCAAGTTTCATAAGCTTTGGGTCCACTATTCTGATCGTCATTTTCCTACTCCCAACAGAAGCCATCAGAAACTCAAGGGTCGCCGAACCCTATATAAGGGCCAATCTAATCTCACATATCTAATCATTTTTCACAGTTATTTTGATTCATATGCTTAAATAAATGTTTTGTTCATACAAACTTTTTTCTTCCAGCCAACTCTCATTCTCCAATATAACAAATACAAAATCTACAATATCAACCATACTCGAACTCGCTATGTTTAAAAGTAAAATTCTGCTACACCTAAGGCTCGAGTAATCTACATACTAGACAAAATTCAGTTAAAGAATTAAGCTGTACTTACTGGATTTCTCCCTCAACACTTCAGCAGCAGCTCATTGTGCTTGCACGGTGGAATTGTTGTAATCTTGTACCGGTAGAGCTTGCTGTTCAGTAAAATAAAGTCTGTACCAAATTAGATCTCAACATCATCAGCACTTCAATCTCTTAATTATAAGAGCTTTCGGTCTATTTTATAGCACAACTAGAAGGAAATACTACTATGAAAATGAGAACAAAATGTGATGATGAATATCTAACTTTACAAAGAGTTCACGGCTAATCATGGCAACCACTGTGATCCCGCTGTGATCATGTGATCTGAGATCTCTTCTATTCCTGGTTAAGAGAACTGATCTGATTATATCATACAAGTCATGGCCGAGGAGAATTTCCAGCCAGAACGAGATGACCATATCTTACAAATAATCTCCTGTACTGAGCATCGAATAATAGCGCCTTTCCATACAGTGAAGAACGAGATTCATATCCTATTTCTTCGCGTAGGTTATCAACATTGAATTTTGTGGATTCATCTTAAAGCCTTGGAGTGCTTGCATGGCTACTGTCGATTGTACCTCATCGCCATACTCTACAAATGCAATACCCGGCTTTGCTTCGACCATACGAACCTCCTTAAAACCAGGATACTGACAGAAAAGCATTTGTAGCATCGTTGGAGTTGTCTCCTGGGGAAGATTTTGTATAAACAAAATGCTATTGGGCGGGGCAGGTGCTTCTGGTACCATAACTCCGCCTGGATAAGGGACTTGAGAGTGCTGCACCATTTTCAGAAGGGGGGAAGGAAAGAGACTGTGCGTTAGTAACATATAAATTCCAATAAATAAACATAATTAAGTATCAAAATTATTCATACGATGAATGTCAACCAAGATTTGCCACCTTAAAACTCTCAGTCAATAGATAAAAGACATACAAGAATACATCTACTCATGAAGACATCACCAACTAAGTCCCAGAAAATTAAAGCGTTGAATCACTTGGCAAAGGCTTCTTTAACAATCATCACATTGTGATATATGAAATGAAAAAAAGAAATAAATGCAAATAACCCTCACGGTACGTTTCTTTGTTCTCTATATATATATCTTTCTCTCTCTGCGCAAGGAAATAAAAAGGCAGATAAAATCCAAATGAATAACTAAAAATAACAATGAACTTTCACTACCAGGAGGAGGGAGTAAGAGAATGAAGTGCTTCCTATTGCATAGAATAACATACAGATTACTGAAAAGAGTGAGAAATCAGAATGGAAGAGAGAGCATCATTCTTAGTAAGCAAAATTAGCCTCAAGAAGTGAAGTTCTACCTCTTATTACTTGTCCTTTATGATTTTATAGTTTACAATCACGTCAGCGAAACACTTGGAATACATTTTTTACCAACAGATGAACATAATATCCTAAACTGACTTTGTGGGAGAATCAACTATGCAAGTTAGTGAAGGCTCAAATAGAAAATAAAGAATTTTCGAAAACCTAATGTTTAGGTATTAAATAGAGATACTTACCCCTGTTGCGCCATATGCTCCAGAAAAAGCAGGATTCAGACCCATCCCAGCTTGATTAGTATCATGCTGCTCTTTCTTCTTCCTCCCTACCACATCAAGAGAATGGACAAATCTTTGATTAAACACTGCTACATAAGCAATAGGACAACACGTTCCTTCACTTTCTTGAATTGTCAAATAGAAAATAGAGACAAATTATACCCTTTTCCCCATGCCTCTTTCGTTTCTCCCGGGGAACAAATGTACCGTCAGACTTTGCAATTATATCTGATTTTGTCTTTGCATATTGGATCCTCTACACCATTGCAAAACAACATCACTTAGTTTTGTATTACACCACACTCCCACAAAATATTAGTCCAGCTAACAAAAGATGAATAATAGACCAGAGGAATAAATGATATATAAAGTTGTCTGCACTTTATACCATGGAAAAAGATATAAAGCCTATGACACATTTTCATAAATGCAAAGAAAATATGGATATTAGCCACCAGATTTACAAACAAGAAATG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MRQRAAMDAIEHTTINTNGIKMHIASIGTGPVVLLLHGFPELWYSWRHQLLYLSSVGYRAIAPDLRGYGDTESPESHTSYTVLHIVGDLVGALDELGIEKVFLVGHDWGAIIAWYLCLFRPDRIKALVNLSVQFIPRNPAIPFVEGFRSAFGDDFYICRFQVPGEAEEDFASIDTAELFKKFLCSRRSDPPKLPKGVGVRSIPSPENLPSWLTENDINYFATTFKRTGFTGGLNYYRAFDLTWELTASWTKAQVRVPVKFIVGDLDLTYQFPGAKEYIHNGGFKKDVPFLEEVIVMKDTAHFINQERPHEIKILNSIHSPLLELRGYTAEAMAASQRAARDDGMMKKEEQAERSREKVAWVPDPVTGYYRPENYSDEIDAVDLRAMIETERATAMDAIEHTTINTNGIKMHIASIGTGPVVLLLHGFPELWYSWRHQLLYLSSVGYRAIAPDLRGYGDTDSPESHTSYTALHIVGDLVGALDELGIEKVFLVGHDWGAIIAWYFCLFRPDRIKALVNLSVQFFPRNPEISFIERFRAVYGDDFYMCRFQVPGEAEADFFCIDTAQLFKVTLSNRSTHAPCLPKEYGFRAIPPPENLPSWLTEEDINHYASKFKETGFTGALNYYRAFDLTWELTGPWTGAQIQVPVKFIVGDLDITYHFEGAKEYIHKGGFKRDVPLLEEVVIVEDAGHFVHEERPHEINTHIHDFFNKF
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. Swiss-Prot
Match: HYES_HUMAN (Bifunctional epoxide hydrolase 2 OS=Homo sapiens GN=EPHX2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 6.7e-48 Identity = 102/305 (33.44%), Postives = 161/305 (52.79%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. Swiss-Prot
Match: HYES_MOUSE (Bifunctional epoxide hydrolase 2 OS=Mus musculus GN=Ephx2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 191.4 bits (485), Expect = 3.3e-47 Identity = 103/298 (34.56%), Postives = 160/298 (53.69%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. Swiss-Prot
Match: HYES_RAT (Bifunctional epoxide hydrolase 2 OS=Rattus norvegicus GN=Ephx2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 190.3 bits (482), Expect = 7.4e-47 Identity = 101/298 (33.89%), Postives = 160/298 (53.69%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. Swiss-Prot
Match: HYES_PIG (Bifunctional epoxide hydrolase 2 OS=Sus scrofa GN=EPHX2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 190.3 bits (482), Expect = 7.4e-47 Identity = 101/302 (33.44%), Postives = 163/302 (53.97%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. Swiss-Prot
Match: YFHM_BACSU (AB hydrolase superfamily protein YfhM OS=Bacillus subtilis (strain 168) GN=yfhM PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 2.9e-35 Identity = 97/319 (30.41%), Postives = 154/319 (48.28%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0D9Y675_9ORYZ (Uncharacterized protein OS=Oryza glumipatula PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 713.4 bits (1840), Expect = 2.8e-202 Identity = 357/714 (50.00%), Postives = 466/714 (65.27%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0D9Y674_9ORYZ (Uncharacterized protein OS=Oryza glumipatula PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 689.1 bits (1777), Expect = 5.6e-195 Identity = 342/724 (47.24%), Postives = 450/724 (62.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TrEMBL
Match: A0A103XQP3_CYNCS (Uncharacterized protein OS=Cynara cardunculus var. scolymus GN=Ccrd_002847 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 661.8 bits (1706), Expect = 9.6e-187 Identity = 334/688 (48.55%), Postives = 435/688 (63.23%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KT70_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G001920 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 630.9 bits (1626), Expect = 1.8e-177 Identity = 293/316 (92.72%), Postives = 303/316 (95.89%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KY86_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G001830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 574.7 bits (1480), Expect = 1.5e-160 Identity = 263/307 (85.67%), Postives = 282/307 (91.86%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TAIR10
Match: AT4G02340.1 (AT4G02340.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 466.5 bits (1199), Expect = 3.0e-131 Identity = 200/316 (63.29%), Postives = 253/316 (80.06%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TAIR10
Match: AT3G05600.1 (AT3G05600.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 5.9e-111 Identity = 182/323 (56.35%), Postives = 234/323 (72.45%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TAIR10
Match: AT4G15960.1 (AT4G15960.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 380.6 bits (976), Expect = 2.2e-105 Identity = 175/324 (54.01%), Postives = 233/324 (71.91%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TAIR10
Match: AT2G26740.1 (AT2G26740.1 soluble epoxide hydrolase) HSP 1 Score: 362.8 bits (930), Expect = 4.7e-100 Identity = 174/325 (53.54%), Postives = 228/325 (70.15%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. TAIR10
Match: AT4G15955.3 (AT4G15955.3 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 361.7 bits (927), Expect = 1.0e-99 Identity = 173/323 (53.56%), Postives = 223/323 (69.04%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1012182854|ref|XP_015968662.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107492180 [Arachis duranensis]) HSP 1 Score: 770.4 bits (1988), Expect = 2.8e-219 Identity = 367/709 (51.76%), Postives = 474/709 (66.85%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. NCBI nr
Match: gi|976907889|gb|KVH95128.1| (hypothetical protein Ccrd_002847 [Cynara cardunculus var. scolymus]) HSP 1 Score: 661.8 bits (1706), Expect = 1.4e-186 Identity = 334/688 (48.55%), Postives = 435/688 (63.23%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. NCBI nr
Match: gi|659108663|ref|XP_008454322.1| (PREDICTED: bifunctional epoxide hydrolase 2-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 632.5 bits (1630), Expect = 9.0e-178 Identity = 293/316 (92.72%), Postives = 304/316 (96.20%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. NCBI nr
Match: gi|449469066|ref|XP_004152242.1| (PREDICTED: bifunctional epoxide hydrolase 2-like isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 630.9 bits (1626), Expect = 2.6e-177 Identity = 293/316 (92.72%), Postives = 303/316 (95.89%), Query Frame = 1
BLAST of Cp4.1LG03g05410.1 vs. NCBI nr
Match: gi|449469072|ref|XP_004152245.1| (PREDICTED: bifunctional epoxide hydrolase 2-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 574.7 bits (1480), Expect = 2.2e-160 Identity = 263/307 (85.67%), Postives = 282/307 (91.86%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this mRNA:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo
Date Performed: 2017-12-02
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