Cp4.1LG01g02930.1 (mRNA) Cucurbita pepo (Zucchini)

NameCp4.1LG01g02930.1
TypemRNA
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (Zucchini))
DescriptionUnknown protein
LocationCp4.1LG01 : 2127871 .. 2138636 (-)
Sequence length1537
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CGCGGTGAGACTCCTGATTTCCATCTGAATCCGCGGGAAAAAGAGAGATCAAAGTCCTATGGAAAATCGATCGCGTCCAGGTTCTCTGTAGTCGATTCTCTTCTTTGTTCTCTCTCGTTGGAGTTCTTCATTGCTTTACAGGTTTTGTGCTGTGTTCCTGTTCAGAATCATCCATGTGGCGGTTTTCTGGCTCGGGGCTCGATCACTTACTTTCTTTACGAGAGCTTTGCGCTTCCAGGTAATGTCGTTTTTCCTCAGTTACCTTCTCATTTCCAATCAGTACAGATTACTGCGGTGTTTCTGTTTTTTTTCTTCCATGGTGGTAATGAATGTTTTCTTCCTTTCGTAGTAGATGATCTTGATTTTTGATCGTTGTGTGTTGTTTTTTTTAACGGAAGTTGAGTTTCTTTGTATGTAATGAATGCATGGCTGGGATACTGGCATCGGATGATTCTTAGGTGAACTATTTAAGACTTATATCATTGTTTATTTCAGGATTTTGACGCGATGTGTATAATGTTCTTGCTTAAATGTTTTATACTTCACTTGCATGACGAGCTATCTGATTTTCTCACAGAATGCAGCCTCAGGGATATTGCATCCACGCTATTTTTTTACGGCTCATTCATTTCTAAAAAAATAATTTAGCAACCTACATACTCAATATTTTCTCATTATCTTATAAAATTTTGACGTAAGATAGGTGGAATCTCGGGCTGCTGATGGCTGGCCACCACGTAAATGAATGTGAAACCAAAGGTGCCCTTACAATATTTATTTGTTTGAAATTTTACACTCATTTGACGTCTATGCGTTTTCGTGAATTTGGAACTGGATGTTAAGACACAAAGTGCACAATGGAAGGAATTGTCATATAGGAGTGAATTTCAAGTAGCCTGTTTGTGCTATTGTCTTTTACCTTTGATGTTTAGAAGACAATTGTCTATGCAGAACTTGTGATAAGATTATAGAAGATTCATCATATTTGAAAGCCAGCGGATGAAATTATATGAGTTTGCAGACATGTTCTGAAAGTAAGTCTGCATTTTATATCTGTAGGATTTTTATCATTATCTTGTATGATTTAATATTCCTGTTTAGTTTTGCACTCAATGCGTACCATTAGCTATCTTTTGTTTTGTTAACTGATCATAGCAGTAACCTCATAAGTAAGTTATTGCCTGCTTGTACCTTAGACACTTCGTTCCAAGTTTTATGTAAGGATTTTTTATATTTTTTCTAAATGTTAAATATGGACCTTAATTACCAATTTTAGGACTCTTGTTATTTTTTTGTTAATATTATTACTTGTGCTTATACGATGGATGGTTAACATGCATATCATTTTTTAGTGTGTTCAATGTCTCTTCTTATATTTCTTAAATTGTTAATAGCACTGTTTTCATCAGATATAATCATTATCTTTCAGGACCAGTTGTAATGTGGGAAATGTATATAGTATTTCTATACATTATACAGGTATATATTTAAAATATTTTTGGCTAATTGAAGAAGTTGGTGGCTGTGACCATCTGAATTGACGTTGTAATGGAGGTATCTTATCAAAAGACGATATTAGAAGTCAAAGAATAGAAAAGAACCTTGAGAAGGCATAATATTGTAGAACCCTTCACAGTTCTACGGATCCATTTAGTGTTTTCTGGCTTGAATCCACTACTGTTGATGTGCTTTTTTGTCTAGGTAGTGTTTGGGCCGCCTTCTTTTGAGCTTTTGAAATCAAGGACTTTAGTGCTTATAGTAAGGTCCCAAGGAGTCTTATTTCTTTTATCTCTTGATTTGCAAATTCAAATGTGATTAGGTCTGAGAGTTCTTTTCCTTTATCTCTTGGTAATTCCCTGATTTTTTTACATTAATCATCTAATGATTTTATCCTTCAGTTTCATAGATCGAATCTACCCAGCTTGATTTATTTTTAAAATTTATGAGTTACTGATATCTCTCTAGCAAGGTCATACCACATACTATAAATGGCAAATAGAAATGGCTGTTGATGCTCTGTTTATTCTTGTGTATGTACAGGAAAGTTTAGTGCCTAAAAGATGCATTAGCTTGCTGGTATACAAAATTTCACCCAGTAACACATAAATTTTAGGTTGCGTACCTCTCTTCAAAAGGTAAGGGGTTGAGTATGTTTATGAACAAGGGCTTAAGTTTATATTGAACCAATTTATAAAGATTGTATTAATTTTAGATGTGGAAAAGGCTTAAATGTTGTTGCAAGCTATTAAATGTGGTTGATGCTAAATTCAAAATTAGATTCTTGTTGTCTTTGATATGTAATAGCTATTTTCTTGCTTTTGTAATATTCACTCTTTAATTGGTTTAAGTAAAGCATGATTCTAGTTGAAATATCTGGCTAAATGAGGTGTAAGTGAGCCTTTTCTTTTAATATTGAATTCATGGTTTTTACGCATGTTACCAGTTAGGTACATTAGCAGTAGAGCTGTACATGGTTATAATCTGGACCTGTTTGTGATTCAAGGAGCAATATTTATTTATTCACTCTGCATTTTCTTGGGTGGTTTTGTCTATGTTTTCCTTCCACCTTTTTCTTATTTACCTGTGGGTCATAATTGCTTATCACTCATGTTATTGCTGGTGATTTCTTTTCTGTGTTAACCCTTACATTGGGCTATGGGACATGGCTGGATTTATGATTTCCACTATATTGCATATCCTACATACTTTATTATCTGTAAGAAGCCCAAGTTCTTCGTTTATATGCTGTATACTTTTGACTTCTACTTTACTAATTAGTTTGAAGTTTATTTCTGGTTAGAATGAAATTGTGTAATAGGTGCATGTATAATCTTGTGCACAAATGTTTTTGTTTTCTCAGCTTTTACTTTTTAGATAAGAAACATCATGTTTCAAGTAAAAATTACGACTAATTGTAGGCATGATTGGATAGAATACAAATATTACATCCATAGAGGGATGATCATATATGTGTGTAAATTTTTTTTAACTTCCAACTAGAGAGAATACAAGTTACATTTGTTACAGCATCAATCCATAATACATAAAATTCTATATCATCAGAGATATCATCTTTTTTTGCTGATCCACATTACATTTATTCTTGTATTTAAAGTGACAAAGTTCTTAAATAATTGAAAATAGTTATCTTATGTTTTATGTTAGTATTTGACGATCATGCCATAGGATGTTTAGGATCGTGAATGATATATCTGGACATTTGTTATTATCTTGTTTATCCAGAAGGTTAAATTTATTATATCTAATAATAATTATTAAAAAAATATGTTTTACTATATTCCTTTTGTTATGATATGGTGTCGCAAGTATGCAAGGGAAGAGGTTAGATAGAATGAACATTCCTTTCCATTAGGTGTCATTTGGTTCATGGAAAAATGGACCACTCTAGAACTGAGAATGTAGGTATGCGATTATGAGAATCAAATGTTTGAGAAAGAAAGCTAGTATGTGTTCTTATGCTTGAAAAGCTGAAGGAAAAATTATGGATTATATAACTACTAGTGATTGCAGGAGATATGCATACTTCATAAATTGATTATTAGTTTCAAATGTTAATGAAACTTCAAACCATTATTATAAAACCACATAATAACAACAAATGTGATGACGTGATGCCATATCCTCTCTGTGGAAATCCAGAGGTCCTGTAAGAGGGTTCCACATTACCATGAAGCTGAAGGAATTAGATTTCTTTTTCTACAAAAACAACTTGTATGCTAATAAAAGGAGAATCCAAACTGAGCAGCGAACACCACCCTAAAGAAGCAAACATACCCTTAGAGGCGTAACATAATTCTGGGAAAAACATGTAATATATCCTAATTACAAAATACAAAGGCATCATGGATTGACATTTTTCTATAATATTACTGGAAGTTGGGTATGCCAGGAAGAGATTACAGAATGATTAAAACATTAGATTAAATTAATCATAAGCTAACAGCTCAATTTTTGAGGATTGGTGATGATAAAAGTGAACTGAGAACTTTTGTTTCAGATTCTTTTACTGGTTTAAAATTCCGTAGTCTTATAGCTTCTTTACATTGCTGAATCTCATTCATTAATCATTATAGTAAAGTTTGGAAACACACGCAAGTGTAATATTAGCAAAGGATGTGAATGGACCCTCAAAACAGCCAACTTTTTTAGGATAAAGGACCAGTGGTTGGTTTTGGCAACTCAACAACAGGATGCCCAGATTTTAGACATCTCATATGCAATTCAGTATCTACCAACTTAGTACCACCTTATATAAGATTGTATGAACATTAATTTTCATTCAGCTAATAGGCATCAGGAGTCTGGTCTAATTAATTAACACAACAAACTTTTAATAACAGCTAGAACAACACATGGCACATATGGTGCATTGTCATTATTTGTAAACTTACATAGGTAGCTGGTCTGGCTGCTAAATTTATCGCATATATAGAGTTTGAAGAACATTGCATACCAAATGTGAGGGATCTGGTGATAACGGAAGCAGGAGACACCTTCATGTTGAACATGACTCATACTGTATGATGAGTTGTTGAAGAAATGACCATGGATAAAATATCCATGATCTAACTGCTGTTATTGCAGTTGCAATCTGTTGCAAGTTTCAATTATATCTATTCAGCTTGGGAGAAAAAATTGTCTAGTACATATTGATACTCAGATGAATGTGATTGCAATTTAATTCATATGTCATGAACATAGATTGCTAGAACATACCCCAGCTTTATCCCTGGTACTGATGTTTCACTGTTTTGTGGTTGTGGCTGTCTTAGCTGTAGAGCAGGCATACTGTATCTATTGGTGATAGTGAATTGTTGAGTTGAGCTACTGCTCGTTTTATCCACTTCCATTGGTCCATAAACCTGATATACTTAAAAAACCCACCATTAAGCTTATTTAAAAGGAAATAAAAGTCCGCTTTCAGGACAATTGAACTCCCGCTGTCGAACTAAAAAAATCTTATGACTAAACAAGAGTAG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ATAAACTGGAATTGCAGATGAATGAAGATTTTACCTGGAGTTCTGAAACAGAGTTCATCAGCTGATTTTGCTCCTCTTTCACCTTGTAGTAACGATCGGTAATTGATCTTATGCTGATAAGATAGAAACTGTTAATTCAGTTCATAACCACACCTGAAATCAAATCTTGAATTTTTAATTTCCATGTCACCATCATAAGGATTTATTACGTGAGTTGTGAATATAATCTGCTCATAGCATGCTGTAGAGTGATCGGTTTGTTCGCTATCTCATATAAGCACGTCGAATTTGGGTGCTTGTCAGTTATTGAAACTCACCCAAACTCCTATTTCACATAATATTTCAAATTAGAAAGAGAATCTCAATGCCTTTCTTTCAGAAGCCATGGAACTTTGTACAAAGACGTTACGAAGATGGATCGGTACAATTTTCCCAACTTAGCTGCAATTTATGCCGTATTTTTTCTGGTAAGGGTTGTGATCTGTGTTGCTAGAAGGCTATGATAGCTTGATTCTGATTATCGTGTTCTTTTAATATGACATAGCAACAATGCCTAATAAATGATTTTTGTAACTTAGTGTACAGAAAGCATAGTACTCTTATCTCTTATTCCTACTTGATAAATAAATAAACATCTGCAACAATAGATGGAAATTTTTGTTCTATTTTCTTGTTTCCTTTTCTTTTCTGGCTTAATAGGCAAAAATACTTGAAAAGGAAATGAGTTTAAATCATAGTGGTTAAGACAGGTGGTCGTGTAAGAATA

mRNA sequence

CGCGGTGAGACTCCTGATTTCCATCTGAATCCGCGGGAAAAAGAGAGATCAAAGTCCTATGGAAAATCGATCGCGTCCAGGTTCTCTGTAGTCGATTCTCTTCTTTGTTCTCTCTCGTTGGAGTTCTTCATTGCTTTACAGGTTTTGTGCTGTGTTCCTGTTCAGAATCATCCATGTGGCGGTTTTCTGGCTCGGGGCTCGATCACTTACTTTCTTTACGAGAGCTTTGCGCTTCCAGGTGGAATCTCGGGCTGCTGATGGCTGGCCACCACGTAAATGAATGTGAAACCAAAGAACTTGTGATAAGATTATAGAAGATTCATCATATTTGAAAGCCAGCGGATGAAATTATATGAGTTTGCAGACATGTTCTGAAAGAAAGTTTAGTGCCTAAAAGATGCATTAGCTTGCTGGTATACAAAATTTCACCCAGTAACACATAAATTTTAGGTTGCGTACCTCTCTTCAAAAGGTAAATACAAGAAGTAAACATCTGTATTCAAGAGGCTTTATCAGATTTTGTAGATCTTTGACACTCAGGCCAGATAGTTCTTCGCCCATCAATTGTCTGCAAATATAGAAGCACAAGATATATTATGAATTCTTTTGCGTATTTGTTTGAAGTGTTGGATTATATTACCATTTCCAATGGATCAGTACAGCAGGGTTGGAGTACCTGTGACATTCTTGCAAGTAATGCAGTTGTTGCTTCAAAGCAGCTGCCTCTCTTTTCCAAAACTAGCAATTATAGAACAGATGATCAGCATTGCAGTTTTACTTGTAGCATGATGAATGAAGATTTTACCTGGAGTTCTGAAACAGAGTTCATCAGCTGATTTTGCTCCTCTTTCACCTTGTAGTAACGATCGGTAATTGATCTTATGCTGATAAGATAGAAACTGTTAATTCAGTTCATAACCACACCTGAAATCAAATCTTGAATTTTTAATTTCCATGTCACCATCATAAGGATTTATTACGTGAGTTGTGAATATAATCTGCTCATAGCATGCTGTAGAGTGATCGGTTTGTTCGCTATCTCATATAAGCACGTCGAATTTGGGTGCTTGTCAGTTATTGAAACTCACCCAAACTCCTATTTCACATAATATTTCAAATTAGAAAGAGAATCTCAATGCCTTTCTTTCAGAAGCCATGGAACTTTGTACAAAGACGTTACGAAGATGGATCGGTACAATTTTCCCAACTTAGCTGCAATTTATGCCGTATTTTTTCTGGTAAGGGTTGTGATCTGTGTTGCTAGAAGGCTATGATAGCTTGATTCTGATTATCGTGTTCTTTTAATATGACATAGCAACAATGCCTAATAAATGATTTTTGTAACTTAGTGTACAGAAAGCATAGTACTCTTATCTCTTATTCCTACTTGATAAATAAATAAACATCTGCAACAATAGATGGAAATTTTTGTTCTATTTTCTTGTTTCCTTTTCTTTTCTGGCTTAATAGGCAAAAATACTTGAAAAGGAAATGAGTTTAAATCATAGTGGTTAAGACAGGTGGTCGTGTAAGAATA

Coding sequence (CDS)

ATGAATTCTTTTGCGTATTTGTTTGAAGTGTTGGATTATATTACCATTTCCAATGGATCAGTACAGCAGGGTTGGAGTACCTGTGACATTCTTGCAAGTAATGCAGTTGTTGCTTCAAAGCAGCTGCCTCTCTTTTCCAAAACTAGCAATTATAGAACAGATGATCAGCATTGCAGTTTTACTTGTAGCATGATGAATGAAGATTTTACCTGGAGTTCTGAAACAGAGTTCATCAGCTGA

Protein sequence

MNSFAYLFEVLDYITISNGSVQQGWSTCDILASNAVVASKQLPLFSKTSNYRTDDQHCSFTCSMMNEDFTWSSETEFIS
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG01g02930Cp4.1LG01g02930gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG01g02930.1Cp4.1LG01g02930.1-proteinpolypeptide


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:001Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:001five_prime_UTR
Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:002Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:002five_prime_UTR
Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:003Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:003five_prime_UTR
Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:004Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:004five_prime_UTR
Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:005Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:005five_prime_UTR
Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:006Cp4.1LG01g02930.1:five_prime_utr:006five_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG01g02930.1:cds:001Cp4.1LG01g02930.1:cds:001CDS
Cp4.1LG01g02930.1:cds:002Cp4.1LG01g02930.1:cds:002CDS
Cp4.1LG01g02930.1:cds:003Cp4.1LG01g02930.1:cds:003CDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG01g02930.1:three_prime_utr:001Cp4.1LG01g02930.1:three_prime_utr:001three_prime_UTR