CmoCh20G010000.1 (mRNA) Cucurbita moschata (Rifu) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	CmoCh20G010000.1
Type	mRNA
Organism	Cucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
Description	Coagulation factor V
Location	Cmo_Chr20 : 6003586 .. 6015829 (-)
Sequence length	1617

Genome Viewer

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGAAGTACCCTCGAAAGCGTCCATCAACTGGACCTGTGTTTACAAGTTCATCTCCTAGAGTACATGATAAAAAATCCAAGTTTCAGCGGTACAATTCAAGATTTTCTGCAATGCCCAGGCTATTTGGTTTCCGTGAGGGTGGTCGTGCTACTGAACTTGGAAATCGTACCACGTCCCCAACCAGGTCTAGACCATAACCTATGTCGAGGTATGCTTTTCAACTAATCTAATATTATTGTTTTGGTAGTTAGTTCTATTGTAAATGCTTTTAGGAGTAGTGAGTAGATTTTGTGTCATAGATGGCACTATTATAGTTGCCTTCGTTCTAGAAGGTGTTCAACTTGCAAAAATGTGCTGGCATGACATGAAAATGTTAGTTTTGTAGATTTTTGCGTGGTTGACCTAGATAGAAACATCAATGTTGATATCCAACCCTCAAACTTATACATATATTGATGTATATTTGAATATCAATGGCTATTCTGGAAAAAAGTTATATTGATGTATCCTGCCTAGCAAGATTATGCATTTTAATTTTTAGGTGAGTTTAAAGGAACTTTGATGCTTTTGAAGTTTTGGTCTTGGGGAAACGAGGACGAAGGGTTCTATTCTTCTTCCTGCCTTTGCCTTGTCAACCGCAGTTGAATTAGGGGTTTTCTTCTTCCTGGCCTAATTTATTCTTTTTGATTTTCGATTTTCTCCACCTTTTTGTTGTTCCACCATTTTGCCCTAATCTATCATTCTTCTTGATCTTCTTTTTCTCTATGCCTTCAAAAGTTTTTCTTCCGGCCCTCTAGTTTTACATCAGAAACAGTTGCTGTGTCTTCTCGTGTCTTCTCCGTTTGAAAGAGTTGCTGCGTCTTCTCGCGTCTTCTCCGTTTGGGAACGCTTGCTGCGCCTTCTCCGTTTGGGGGAACGCTTGCTGCGCCTTCTCCGTTTGGGGGAACGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGACGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGGGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGGGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGGGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGGGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCCCCGTTTGGGGGGCGATTGCTGCGCCTTCTGTGTGATCCTAGCAACTGGTATCTTAACAAATGTACTTTTTGTATTCTCTGTATTCTTACTGTACATACTTGAAGTCATCAATATAAATCCTTTAGTCAGAGTTCTCCTTGCATTTTCTCTATCCTGTTCTTTGTATTCATCTAGATCGTATAAATCCTTTAGTCAGAGTTCTCCTTGCATTTTCTCTATCCTGTTCTTTGTATTCATCTAGATCGAGTGTGTGCGTTGTTGTGCGATCCTAACGGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTNATATAAATCCTTTAGTCAGAGTTCTCCTTGCATTTTCTCTATCCTGTTCTTTGTATTCATCTAGATCGAGTGTGTGCGTTGTTGTGCGATCCTAACGGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGTGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTACGTCTTCCACCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCACCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCACCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCACCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCACCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTACCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGGTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTTCTTCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTTCTTCGTTTAGGGGACGCTTGGCTGCGTCTTTCTTCGTTTAGGGGACGCTTGGCTGCGTCTTTCTTCGTTTAGGGGACGCTTGGCTGCGTCTTTCTTCGTTTAGGGGACGCTTGGCTGCGTCCGTTGTTGTGCGATCCTAACAGTGTCTTCCTCCGTGATCCTAACAGCGTCTTTCTTCGTTTGGGGGGACGCTTGCCGCGTCTTCTCGATGTTGGATTGGATGATGAAAGTCCCACATCGGCTACTTTAGGGAATGATCATGGGTTTATAATCAAGGAATATTCTCTCCATTGGAATGAGGTATTTTGGGAAAGCCCTTAGGGAATGATCATGGGTTTATAATCAAGGAATATTCTCTCCATTGGAATGAGGTATTTTGGGAAAGCCCTTAGGGAATGATCATGGGTTTATAATCAAGGAATATTCTCTCCATTGGAATGAGGTATTTTGGGAAAGCCCTTAGGGAATGATCATGGGTTTATAATCAAGGAATATTCTCTCCATTGGAATGAGGTATTTTGGGAAAGCCCAAAGTTAAAGTCACGAGAGCATATATTCAAAGTGGACAATATCATACCATTCTGGAGAGTTGTTCATCTAATATGGTATCAGAGTCAAATTTAGTCATGCCAATAGATTGGTAAATCTTGACTCCAAAAGAAAAGAGTCAAGCCTCTTCGAAGGCATAGTCAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCGCGTCTTCGTTGTGTCTTCTTTGTGTGAAGTAGATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTTGTGTGAAGTAGATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTTGTGTGAAGTAGATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGATGTCGTGCCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGATGTCGCGTCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGTTGTTGCGTCTTCTCCGTTTCCGTGTGAAGCAGTTGTTGCGTCTTCTCTGTTTCCGTGTGAAACAGTTGTCGCGTCTTCTCCGTTTGAAACAGTTGCTGTGTCTTCTCGAAAAAGAGTAAATCGTCTACCTAGAATGTTCCTAATTCGGTAGTTGATTGTAATTTTCATGTTATCCTAAAAAAATTTGCTTTTTGTATTGTTTCAGAATTAGGGTTGCTGTCTACCTAGGATGTTCTTAATTTGGTAGTGGATTGTAATTTTCATGTTATACTCGGAAAAATTTGCTTTTCGCATGGTTGCAGAATCAGGGTTAGCAATTTGTAAAGACATTAGCAATTTGTAAAGACATTTATCGTCATTATTTTTAGATGTGCTATAGCATCATGGTTCAACATAAATGTTATGAAATTTTACCAAATAACTCAATGAAATGTACAATTAGTCTTGAATTATGTAAATTGATATTCTTTTCCTTGAAATGTACAATTAGTTTCGAATTATGCAAATTGATATTCTTTTCCTGTTGAACCACACTGGACAATTGGACAATTTTAGGCTTAATAATTATAATAAATGGAGCAATTAATGAGAAAATGGTGCGTCAAATTAATGGCAAAAAAAGATGTACAATTCTACTTTGGTAGAGTTATCACTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAACATTACTACACGAACATGTAATTGTGAAAAATCAGTTTAGAGGAAGAAAACTCGATTTGCCTACACATTGGTTGTGGTAGTAGAGATTGCATAGAAGAAGGTAAAGAGGCATTGCTTGAACTTGACGATGAAGGGTTAGCCCCTTGATGATATGATGTTGACATGTTGCTTCGTCCCTCTCGTTCCTACCATTGTAAGCTTAACGAGGTCGAGTCTACTATAACCCTTATAACAAGTGAATAGCGAGCTTGACCTAAATCTCCTTGACAAATCTCTCCTCAAGCCTTCCTCGCACTTGCCTTGAACGAACTTCAACGATACATTACTTGTAGAAGAGAAGAACCAATATAGTTTGGCCAAGGCAAGGTTCTAGCAAGATGACCCAATATAGTTCGGCCCGGACAAAGTTCTAGCGACTTTGCAACATCACATAAGTGCCACACCTCTTATAAGGTCTTTAATTCGACTCAGTTTCAATGAACTTCAAGCTTTGGAAGCATGAAAGAAAATAGAAGTAGCTTAGCACCAAGTATATTAATGTATTGGTGAAAAATTATAAGTATGATATTTAATATTGATGTGTTTTGATTATTTTCCTACTAGTATAAACATGGTAATCTTATTTCTTTTAAATTGTGTAAGATCAATTTTCTTCTCGTCTCTTGAGTTTAGTGAGGATCTACTGCATTTTTAACGAGTGGTATCTAGCTCAAGATCAAAAGTGGCAACAAGGGTAAGCTATTGCAACCCCACCTTCCTTCGTTTAGTGGGAAGAATCATAATCAATGGAGTATTCAAATGAAAGTGTTATTAGATTCTGACTTATTTATTGAAAATTGTCCGAGAGAGAATATATTGAAGTTGAGAATTGGAACAAATTGACAAATTAATTATTTTTTCGATGAGAAAAAAATTTCAAGTAACCATTAATAAAATAAAAGTCCTAAATGGTTGTAAATTTTGGGAATTAGATCTAATAATTTTATTGAAAAATAACTTTTTAGATCTAAATATCCAAGAGTCTCAAAATGATAAAGAATCCTTCGAAAAAAAAAAAGTAAGATTTGGATTATCTTATTGATCTAATATCTTAAGTTTGAATGATTTTAAGCATACAACTAAAGTCCTAAATGGATGTAAATTCTTTTTACTGCATTTTATTTGAGGCATTTCATACATAGTTTTATATAGCCTTAAAACAAAATCGTTCACTTTGATGAGATATTTCAAGAGTCCGTAATTTTTGTAGTCTATAAACATAATTTACTTTTATGTAAATGTAACTTTAAAATAAATGAAAAATCATAAAATATATGTAACGACCCTACATATTCTACATAACCTAAGGTCACTATTGACTACTGTTTACATATCATGAATATTTAATATGGAAATAATTCAATTAGAACTCCGTAATAAAATTAACTTTAGTCTTCACATGCTCATTTAAGGCCCTTAAACACACTAATTCAATTTGAACTAAAAAGAAAAACAATATAAAATAAAATATCATATACTAACCTGTGTGCTATTAAATGAAAATGCAATTAACAACCTATAGTTTACTAATATTTAAATACGAAACTATCTTAAGTATGTGTCATAGTCTCGTAGTTGCGATGTCACCGTCAGTCGTACAGGGAAGCCTTGCATTTATCTGAAAAAGCGACCTCCCTATTGGGGTTAAATGCAAACATATACAGTTACATGCATGAAACCTATCATAAGAGTAAGAGTCTATTTTCCTATGGCAGCTATCCTAACGAGAAACTTGGATGTGTACTTAATTTTCCTACATGATCCACACGTGCGAGTATGGACCCACCAGTTGGTTTGCACACGTCCTGTGCCCCTTTCTGGTCGGGCGAGCATTCTCTGGTAGCTATTGATGTCGGACACCTGTTAGGAGTAGTGATAGTCATGGCAACATTATGATAAACATAATGAACGTTCCCCTGCCTAGTAGCGTATGCGTTCGTACTATCGTGACGGAATAAGGGTATTTCACGATGCATGAGCACACAATAATGCATGAGGTCTCAACATTCTTTCGTTTTAATTATCATTAATACAACTTCACTAGGGTTTTGTACATATCATATCATTTTTTATATCATTTCTCATAGAATTTTTCATATCATTTATCATAATTCTCATGCGTATGCCGAAGTTGGATTTCAGCTAGTTCGTCGATTGTTGTGTCAATCATAGTGTATCACTCATGTCATATATTAATCATATCATAAAGTTTTCATGTCACAATAATTCATATCGTACACAGATCATATCATATATCATAACAGCCACATAATAATCCCAAGCATGTTGTCAACATATCATAATATAACATATCATAAACCATATCAATTCATCAAATTCAGCATAACAATCATATCGCATAACATTTACATATCATTTCTCATAACAGTTTACATATACGCTCTATGACACATGCGAAGCCATGGACATGTGTAATCATACAACACACGATTATAACCAATGACGGTAAGGCCACTTACTTGGTTGGCCTTAGCCGGCGTTCTCCCTAATTCAAGTACGTTAACTCTCGTTCCTCGAAAATGCTCCAAATTATCGCCAGTTGTCGTTTCCTATTGGAATATCCGTTTGGTTAGTAATTTAATAATTCCTAACTCAATTGAACTTAAATGGAGAGTTTTCCCCTTATATAAACCTTATTTGACTTAAATAAGGAAAAATTTAGCTTCGAAACAAACGGAATGGTGGGAATTGGCTAGTTTTTCTTTACCGAGTCGAGAGGAGCCAAAATTGAGTCGCAGAGCCGAGCAGCCTAAGCCGACTGAATCAAAGGGGTGTCATGCTGCAAGTGTGCCACATGACACAATTAGAGACTGATGCGTGTGCATGCAGTTTTGGGTCGAGGCGCAGGTTATAGGTCATGGGCTACTGTAGATGTGAGGTTGGGCTGGTTGTGTGAATCGGGCCGAAATGTGGGTCCTAGGTCGAGGCGTGCGCGTACGCAGGTAGCAACTGCAAGGCTGATCTAGGTTCTAGGCTGCAATGGATTGGGCCTTGATATTTGGTTTCACTCGGGTTGCAGGTTAGGTTGCGGGTTGTGTCTAACCCGGATTTGGATCCATCGTATCTTATCTTCTTCGCCCGATTCTACGCGATTTTTTGGTTGTTTTTCTCTCTCTCTCCTTTGAAATGGTGCTCTATTGTCCATTTTGTTGGGATATAGAGCATGATGCCTATTTACCGTGAAAGAAAGATCTGACATAGATATGTATGACAGATATTTCGTAGAGATATACAATATATTTGACAGATATTTCGTAGAGATATACACGGTAGATATTCCGTAAAAATTTGGTAGATTATCTCTGTTAAATTATTAAACTTATATTTAGGAATAAACTTAAATGAAAAAAATAAAAAAGTAGTTTTATGATCCAAAGGTGGGTCATGAGGTAGCCAATTTTAGATTTTAGAAACCTATAAATTAATTCGTATTACATGGTAAAAAACAGAGCAAGAGGGGTTACAGAGTTAAAAAGAACAGTGTAATATAAAAGGGTTTTTCAGAATTTCTGTCTCCTTGTCTCTTCCCTCTCGACGTCTCCTTCACAACTTCGTAAGTGTTATTTTAACAAGTTAGTTTCAGGGCGAGCGTTTATTTCTAAAAATTGGTATCAGAGTGAATTTCTATTTCAACAAATTGGTATCAGAGCCGATGGCGAACATAATGGGACAAATGCTGCTACCACGATTGACGAATACGAACTATGAGAATTGGAGCATCCAAATGAAAGCTCTTCTCGGTTCTCAAGACGCATGGGAGGTGGTTGAAGAAGGTTTCGAAGAACCAAAGGATACCACGGGTTATACGGCGGCGCAGAACAAGGCGCTAAAAGAATTACGATCAAAGGATAAGGCAGCATTATACATGCTGTTTCGGGCTGTTGATGAGTTGGACTTTGAGAAGATTGCAAGGGCAACTACTTCAAAAGATGCGTGGGACACTTTAGAAAAAGTGTTCAAAGGAACCAACCGAATCAATCAGGTGCGTCTCCAAACTCTGCGTGGCGAGTTGGAGAGAATGAAGATGAAGGAGTCAGAAAATATATCTGACTACATTACGCAACTAAATCGAAATGGAGAAATGTTACCCGAGATGCAGGTTGTGGAGAAGATCTTAAGGTCGTTAACAAACAACTTCGAGAATGTTGTATGTATCATAGAAGAGTCGAAGGACCTAGCGACGTTCATGGTTGATGAGCTCGCCGGTTCTCTCAAGGCACACGAGCAACGTAAGAAAAAGAAGGAGGAGACACTCGATCAAACGCTTTAGACTAAGACATCAATAAAGGATGAAAAGGTACTCTACTTTCAAAATACTCATGGTAGAGATCATGGAACTCGTGGGAATGGTCGAGGTGGTCAAGACAATAGTTATGAAGAAAATTATAAGGAGAAGAGACAATCGAGCCAAGCAAATCGGCGTGGAAGAGGACATAATCAAGGACGCGGTCAAAGATATAATTCCAACGTCTAGTGTTACAAATGTAAAAAATATGGCCACTATGCAAATAATTATAACTCCAACAAGTGTTAGAATTGTGGTAGAATGGGTCACTATGCAAGAGATTGTCGAGTCGAGGAAAAGGTGGAAGAAACGATCAACCTGGCCTTGGATGACACAACAAACGGAGACATTCTCTTGATGGTCCAAAATGAAGAGCTGAAAACAAAAGAACACGACGGTGCGAAAGACGATGGCGATAATGATGAGGTAGTGAAACTGTTGGAAATGAGGTGATGTACAACGGATGTGGCGAAATCCTGATAGCGGTGACGAAAAAATCGAAGAAAGATGAACAACCGAATAACATAGAGCCCAAGCTCGAAGAGAGAGAGAGCTCCAATGGTCGGAAAGGCAATTTGAGCAAGAAATAAGAAAGAGGATGAAAATGGGAGAAGAAAAGAAAGAATTGGAAATAAAGATTGAAAGGTTAGAGAAAGAAATTGATGAGCTGAGTGAGAGTTCCTCCTCTCTCAAACAGGAGAAGGAAGAGAATACACAGGAAATCTCTGAACTTGGGAAGAAAGTTGAAGGTGTGAAGAAAGAGGATGACCTATTAATGGAGATTGATGCTCTAGTGGACGAGCTAGTGAGGGATGAGAAAGATATAGAGATGCTGACTCAACAGAGAGGCTCACTCGACGTGAACCTGAATCAAGTCCAACAGGAGGCAGTGAATTTACGACACACGATTGAGACACTCGTGATAAAGCCGAAATGGAGGAAGCAAAAATGGAAGTTGAAAATGTCGTTGTGGACTTGCGAAGGGAATTGAGTAAACTGAACGGAGCAATGACGTCTGAATCGAGCGTGGTTGAGAACGGGAGAAATGAGGAGTTGGTATCTCAAATGGGCTGTTCTCGAAAAGCTCCAAATGAAGTCTCATAAGAAAAGGACAAACTCAGTTTGCAACTCGAGGACAAGGGGAGGAAATTGAAGAAACTATGCCTGAGCTCGAGAAAACGAAAGTGGCACAGGTGGAATCATTGAATAGAGCATTTAAGTTTGTGGGAGAGTTTTGTTGGGAATAAACTTAAATGAAAAAAAGATAGTTTTTAATTTTGTTAATTTTAGTAAGGTTTTTGAAATTGAGACGTAAGAACCAAGAGCAAACCAAAAGAATGGAGAAGGAAAAGGCCAAAGAAAGAGGGTGGGTTATGGGATAGCCAATTTTAGATTTTTGAAAACCTATCAATTAATTCCTTTTCCATTGTAAAAAACAGAGCAAGAGCAGAGCAAGAGTTACCGAGTTAAAAAGTACAGTCTAATAGAAAAGGGCTTTTCAGAATTTCTTTGTCTCCTTGTCTCTCCCCTCTCGACATCTCCTTCACATCTTCGTGAGTGTTATTTTAACAAGTTAGTTTCAGAGCGAGCGTTTATTTCTACAAATTGGTATCAGAGCAGATTGTTATTTTCTACAAATTAGTATCGGAGCGAATTTTGTTTCAACAGAAACCATATATATACCCGGTGCTTCCAAGATGTACTCTCTCCATTCTCTGTATTCTCTCTTGTTGTACATACTGAAGTTATCAATAAAACCTTTAGCCAATATTTCTCCTTGAATTTTCTCTCTCCTATTCTTTGTATTCATCTTGATCGAGTATGTGCGTTGTTGAGCGATCCTAACACGTTTCTCGTCATTTTCCTTCAGTTCTTCGTCGTTTCTCCTTCCTCTTCACCTCCCACGTGTTATTATGGATTGTAAACACCTATAACACATAGATCTGTGAGGGGCTGACCAATTCGAAATTCAAATCATCTTTTCTAACAACGAATCACATTGCTAAGGCGTGAAAGCTTACCTTCTTCGTGTGTATAGTCCTCGGTGATCCCTTTTGTGGTGTGAGTAGGTTGTTTCAACGTTGGATATGTGGGGTTTCTTTGCAGGTGGTTTTTGAGAAGGTTGAGGACCATTTTGGCGTTGTTTTGGTGAGTCGTGGGGATCGGGGAGAGTGTGTTCGAGAGGTATGCGAGAATTCCAGGAGTTCATGTCTCTAGATCATCTTTGAGGTTCATCTTTAGATCATCATCTACTCAAAAATTGTAACGATCTTAGAATAAATGTTGACTTTATTTTAGAGTGATTAAATAACATTTTTTTTCCCTTAAAGTTCATTAAAGCTCACAATGATAAATATAAAAGTTCCTTTATTGTCTCATTACATGATGATGGAAAATGATATATTGATGTATAATGGTTTGAAGGATTCCATGAAAAAGGTAGTTGAAATGTGACTTGTTGAAAAAGTTAAAAATGGAAAATGTTTTGCCTTCTAACACTTGTATCTTCTATGGATAAAAATTTGAGATTAAGTAAAGATGATGTTGGAGACTTGATGTACTTACCATAATGAGACCTAATATGTTATTTATTGTAAGTATGTGATGTAGATCTATGACAACCCCAAACACAAAGTCATTCGGAGCATATAAACTTGTGACACAATTCAAAATTTGTATTGATTGAATATTGTGATAGTGATTGGGTGGTAATGTTGATGATAAAAAAAGTACATCAGATTACGTTCTTAATGTTGGTTGAGGTGTTTTTACGTACTTTTACATAGGGTTTAAAGAAACCACTCATTACTTTTTTTGCTATGATTGAAGTAGAGTATATCTCATTATCTACTACCGGATGGTTGAAAGAATTGAAATATACTAACATTACTAAAGAATTCAACTTTTTATGGACGAAACAAACATATTATAATCAAATATCATTTCATTAGAGACTTCTAGCTTGAGGAACTACTTAAGTCTAGATTAAGGGATAGACACATGTTGAATGCATGAATAGTTTAATACGTTGATCGGTATGTACATTAATGTATGCTGATCGGTATGTACATTAATGTATGCTGATGTATTGGTGAAAAGTTACATACCAATGTCTTTTAATATATTTTCCTATTAGTATAAACTGA

mRNA sequence

ATGAAGTACCCTCGAAAGCGTCCATCAACTGGACCTGTGTTTACAAGTTCATCTCCTAGAGTACATGATAAAAAATCCAAGTTTCAGCGGTACAATTCAAGATTTTCTGCAATGCCCAGGCTATTTGGTTTCCGTGAGGGTGGTCGTGCTACTGAACTTGGAAATCGTACCACGTCCCCAACCAGTTTTGGTCTTGGGGAAACGAGGACGAAGGGTTCTATTCTTCTTCCTGCCTTTGCCTTGTCAACCGCAGTTGAATTAGGGAGTTGCTGCGTCTTCTCGCGTCTTCTCCGTTTGGGAACGCTTGCTGCGCCTTCTCCGTTTGGGGGAACGCTTGCTGCGCCTTCTCCGTTTGGGGGAACGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGACGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGGTTAGGGGACGCTTGCTGCTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCGCGTCTTCGTTATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTTGTGTGAAGTAGATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTATGTCGTGCCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGATGTCGCGTCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGTTGTTGCGTCTTCTCCGTTTCCGTGTGAAGCAGTTGTTGCGTCTTCTCTGTTTCCGTGTGAAACAGTTGTCGCGTCTTCTCCGTTTGAAACAGTTGCTGTGTCTTCTCGAAAAAGATATAAACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGTACCCTCGAAAGCGTCCATCAACTGGACCTGTGTTTACAAGTTCATCTCCTAGAGTACATGATAAAAAATCCAAGTTTCAGCGGTACAATTCAAGATTTTCTGCAATGCCCAGGCTATTTGGTTTCCGTGAGGGTGGTCGTGCTACTGAACTTGGAAATCGTACCACGTCCCCAACCAGTTTTGGTCTTGGGGAAACGAGGACGAAGGGTTCTATTCTTCTTCCTGCCTTTGCCTTGTCAACCGCAGTTGAATTAGGGAGTTGCTGCGTCTTCTCGCGTCTTCTCCGTTTGGGAACGCTTGCTGCGCCTTCTCCGTTTGGGGGAACGCTTGCTGCGCCTTCTCCGTTTGGGGGAACGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGACGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGTGGGGAGGGCGCTTGCTGCGCCTTCTCCTTTTGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGTTTAGGGGACGCTTGCTGCGTCTTCCTCCGGTTAGGGGACGCTTGCTGCTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCACCTTGTCTTCTCCGTTTGAAGTCGTCGCGTCTTCGTTATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTTGTGTGAAGTAGATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGATGTCGCGCCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTATGTCGTGCCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGATGTCGCGTCTTCGCTGTGTCTTCTTCGTGTGAAGCAGTTGTTGCGTCTTCTCCGTTTCCGTGTGAAGCAGTTGTTGCGTCTTCTCTGTTTCCGTGTGAAACAGTTGTCGCGTCTTCTCCGTTTGAAACAGTTGCTGTGTCTTCTCGAAAAAGATATAAACTGA

Homology

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. TrEMBL
Match: A0A150GLD1_GONPE (Uncharacterized protein OS=Gonium pectorale GN=GPECTOR_15g350 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 7.4e-22
Identity = 78/188 (41.49%), Postives = 122/188 (64.89%), Query Frame = 1


Query: 245 PVRGRLLLVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPF 304
           PV   L    L+SP EV  ++S  EV  ++SP EV  ++SP EV  ++SP EV  ++SP 
Sbjct: 54  PVASHLETDPLTSPLEVDPVASSLEVDPVASPLEVDPVASPLEVDPVASPLEVDPVASPL 113

Query: 305 EVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLS 364
           E+  ++SP EV  ++SP E+  ++SP EV  ++SP E+  ++SP EV  ++SP E+  ++
Sbjct: 114 EIDPVASPLEVDPVASPLEIDPVASPLEVDPVASPLEIDPVASPLEVDPVASPLEIAPVA 173

Query: 365 SPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVV 424
           SP EV  ++SP EV  ++SP E+  ++SP EV  ++SP EV  ++SP EV  ++SP EV 
Sbjct: 174 SPLEVDPVASPLEVDPVASPLEIDPVASPLEVDPVASPLEVDPVASPLEVDPVTSPLEVG 233

Query: 425 TLSSPFEV 433
            ++SP EV
Sbjct: 234 PVTSPLEV 241

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. TrEMBL
Match: E0VWD6_PEDHC (Putative uncharacterized protein OS=Pediculus humanus subsp. corporis GN=Phum_PHUM478280 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 2.5e-14
Identity = 67/202 (33.17%), Postives = 129/202 (63.86%), Query Frame = 1


Query: 253 VTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSP 312
           V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P
Sbjct: 403 VSYSAPAQGVSYSAPAQGVSYSAPAQGVSYSAPAQGVSYSAPAQGVSYSAPTQGVSYSAP 462

Query: 313 FEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTL 372
            + V+ S P + VT+S+P + V++S+P + V+ S+P   V++S+P   V+ S+P + V++
Sbjct: 463 AQGVSFSGPAQTVTVSAPAQTVSVSAPAQGVSYSAPVSGVSVSAPTHGVSFSAPAQTVSV 522

Query: 373 SSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEV 432
           S+P + V +S+P +  + S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + +T+S+P + 
Sbjct: 523 SAPAQTVAVSAPAQGASFSAPAQSVSFSAPAQSVSYSAPAQGVSYSAPAQTLTVSAPAQS 582

Query: 433 VASSLCRAFAVSSLCEVDVAPS 455
           VA S        S   V  AP+
Sbjct: 583 VAVSAPAQTVSVSPAPVHSAPA 604

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. TrEMBL
Match: W4YD03_STRPU (Uncharacterized protein OS=Strongylocentrotus purpuratus GN=Sp-Hypp_725 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 1.8e-12
Identity = 53/143 (37.06%), Postives = 88/143 (61.54%), Query Frame = 1


Query: 251 LLVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLS 310
           L++++ SP  +VTL SP  +VT+ +P   VT+ SP  +VT+ +P   VT+ S   +V + 
Sbjct: 511 LILSVISPANIVTLMSPAYIVTMMNPAHTVTMMSPACIVTMMNPAHTVTMMSFAHIVIMM 570

Query: 311 SPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVV 370
           SP  +V +  P  +VT+ SP  +VT++SP   VT+ S   +V + SP  +V + SP  +V
Sbjct: 571 SPAYIVIMMGPVNIVTMMSPAYIVTMTSPAHTVTMMSFAHIVIMMSPAHIVIMISPANIV 630

Query: 371 TLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSP 394
           T++SP   VT+ S  ++V++ SP
Sbjct: 631 TMTSPAHTVTMMSHAQIVSMMSP 653

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. TrEMBL
Match: M3D150_SPHMS (Uncharacterized protein OS=Sphaerulina musiva (strain SO2202) GN=SEPMUDRAFT_109305 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 5.7e-06
Identity = 48/116 (41.38%), Postives = 67/116 (57.76%), Query Frame = 1


Query: 244 PPVRGRLLLVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSP 303
           PPVR   +LVT       + L+ P + +   +P+  VT  +PF  VT S+PF  VT S+P
Sbjct: 146 PPVR--TVLVTPVPAERTIALAVPLDALNRRAPYANVTSVAPFANVTSSAPFANVTSSAP 205

Query: 304 FEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFE 360
           F  +T S+PF  +T S+PF  +T+S+PF  VT  +    VT S+PF  VT S P E
Sbjct: 206 FANLTSSAPFANITSSAPFANITISAPFANVTTPASVVDVTSSAPFFEVTSSEPAE 259

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0LMH5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G277090 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 7.4e-06
Identity = 31/48 (64.58%), Postives = 35/48 (72.92%), Query Frame = 1


Query: 1    MKYPRKRP-STGPVFTSSSPRVHDKKSKFQRYNSRFSAMPRLFGFREG 48
            M++PRK+P  T PVF SS PRVHD+ S FQRYNSRF  M  LFG  EG
Sbjct: 1076 MRHPRKQPCQTRPVFLSSLPRVHDETSMFQRYNSRFMGMHGLFGLHEG 1123

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. TAIR10
Match: AT5G19810.1 (AT5G19810.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 3.9e-06
Identity = 65/154 (42.21%), Postives = 69/154 (44.81%), Query Frame = 1


Query: 249 RLLLVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVT 308
           R LL +   P  +V LS P   V +SSP   V LS P   V LS P   V LS P   V 
Sbjct: 27  RKLLTSAPEPAPLVDLSPPPPPVNISSPPPPVNLSPPPPPVNLSPPPPPVNLSPPPPPVN 86

Query: 309 LSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFE 368
           LS P   V LS P   V LS P   V LS P   V LS P   V LS P   V LS P  
Sbjct: 87  LSPPPPPVLLSPPPPPVNLSPPPPPVNLSPPPPPVLLSPPPPPVLLSPPPPPVNLSPPPP 146

Query: 369 VVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSP 403
            V LS P   V  S P   VT   P   +T S P
Sbjct: 147 PVLLSPPPPPVLFSPPPPTVTRPPPPPTITRSPP 180

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1005461681|ref|XP_015767915.1| (PREDICTED: mucin-5AC-like [Acropora digitifera])

HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 6.2e-22
Identity = 98/226 (43.36%), Postives = 110/226 (48.67%), Query Frame = 1


Query: 253 VTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSP 312
           VT  SPFEVVT  SP E V   SP E VT  SPFEVVT  SP E V   SP E VT  SP
Sbjct: 341 VTTESPFEVVTTKSPAERVATESPSEKVTTESPFEVVTTKSPAERVATESPSEKVTTESP 400

Query: 313 FEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTL 372
           FEVVT  SP E V   SP E VT  SPFEVVT  SP E V   SP E V    P ++V  
Sbjct: 401 FEVVTTKSPAERVATESPSEKVTTESPFEVVTTKSPAERVATESPSEKVETELPSKMVAT 460

Query: 373 SSPFEVVTLSSPFEVVTLSS---------------------------PFEVVTLSSPFEV 432
            SP + V   SP E V   S                           P ++V   SP ++
Sbjct: 461 ESPSKKVATDSPSEEVATESAANGASSVSVLEEATTESPSVKVKTELPSKMVATESPSKI 520

Query: 433 VTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVASSLCRAFAVSSLCEVDV 452
           V   SP E VT  SP+EVVT  SP + V +      AV+    V+V
Sbjct: 521 VATESPSEQVTTESPYEVVTTESPPDEVTTESPSEKAVTESTAVEV 566

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1004142680|gb|KXZ50666.1| (hypothetical protein GPECTOR_15g350 [Gonium pectorale])

HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 1.1e-21
Identity = 78/188 (41.49%), Postives = 122/188 (64.89%), Query Frame = 1


Query: 245 PVRGRLLLVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPF 304
           PV   L    L+SP EV  ++S  EV  ++SP EV  ++SP EV  ++SP EV  ++SP 
Sbjct: 54  PVASHLETDPLTSPLEVDPVASSLEVDPVASPLEVDPVASPLEVDPVASPLEVDPVASPL 113

Query: 305 EVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLS 364
           E+  ++SP EV  ++SP E+  ++SP EV  ++SP E+  ++SP EV  ++SP E+  ++
Sbjct: 114 EIDPVASPLEVDPVASPLEIDPVASPLEVDPVASPLEIDPVASPLEVDPVASPLEIAPVA 173

Query: 365 SPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVV 424
           SP EV  ++SP EV  ++SP E+  ++SP EV  ++SP EV  ++SP EV  ++SP EV 
Sbjct: 174 SPLEVDPVASPLEVDPVASPLEIDPVASPLEVDPVASPLEVDPVASPLEVDPVTSPLEVG 233

Query: 425 TLSSPFEV 433
            ++SP EV
Sbjct: 234 PVTSPLEV 241

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. NCBI nr
Match: gi|242019959|ref|XP_002430425.1| (hypothetical protein Phum_PHUM478280 [Pediculus humanus corporis])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 3.7e-14
Identity = 67/202 (33.17%), Postives = 129/202 (63.86%), Query Frame = 1


Query: 253 VTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSP 312
           V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P
Sbjct: 403 VSYSAPAQGVSYSAPAQGVSYSAPAQGVSYSAPAQGVSYSAPAQGVSYSAPTQGVSYSAP 462

Query: 313 FEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTL 372
            + V+ S P + VT+S+P + V++S+P + V+ S+P   V++S+P   V+ S+P + V++
Sbjct: 463 AQGVSFSGPAQTVTVSAPAQTVSVSAPAQGVSYSAPVSGVSVSAPTHGVSFSAPAQTVSV 522

Query: 373 SSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEV 432
           S+P + V +S+P +  + S+P + V+ S+P + V+ S+P + V+ S+P + +T+S+P + 
Sbjct: 523 SAPAQTVAVSAPAQGASFSAPAQSVSFSAPAQSVSYSAPAQGVSYSAPAQTLTVSAPAQS 582

Query: 433 VASSLCRAFAVSSLCEVDVAPS 455
           VA S        S   V  AP+
Sbjct: 583 VAVSAPAQTVSVSPAPVHSAPA 604

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. NCBI nr
Match: gi|780146344|ref|XP_011681403.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC105446365 [Strongylocentrotus purpuratus])

HSP 1 Score: 82.4 bits (202), Expect = 2.6e-12
Identity = 53/143 (37.06%), Postives = 88/143 (61.54%), Query Frame = 1


Query: 251 LLVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLS 310
           L++++ SP  +VTL SP  +VT+ +P   VT+ SP  +VT+ +P   VT+ S   +V + 
Sbjct: 520 LILSVISPANIVTLMSPAYIVTMMNPAHTVTMMSPACIVTMMNPAHTVTMMSFAHIVIMM 579

Query: 311 SPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVV 370
           SP  +V +  P  +VT+ SP  +VT++SP   VT+ S   +V + SP  +V + SP  +V
Sbjct: 580 SPAYIVIMMGPVNIVTMMSPAYIVTMTSPAHTVTMMSFAHIVIMMSPAHIVIMISPANIV 639

Query: 371 TLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSP 394
           T++SP   VT+ S  ++V++ SP
Sbjct: 640 TMTSPAHTVTMMSHAQIVSMMSP 662

[Close]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. NCBI nr
Match: gi|929319333|ref|XP_014041718.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC106594858 isoform X1 [Salmo salar])

HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.6e-09
Identity = 83/193 (43.01%), Postives = 105/193 (54.40%), Query Frame = 1


Query: 248 GRLLLVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVV 307
           G+  ++TLSS   V  L   F+V+TLSS   V  L   F+V+TLSS   V  L   F+V 
Sbjct: 75  GQFQVLTLSSYCRVSHLLGQFQVLTLSSYCRVRHLLGKFQVLTLSSYCRVSHLLGQFQVF 134

Query: 308 TLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPF 367
           TLSS   V  L    + +TLSS   V  L   F+V+TLSS   V  L   F+V+TLSS  
Sbjct: 135 TLSSYCRVRHLLEQLQALTLSSYCRVRHLLGQFQVLTLSSYCRVSHLLGQFQVLTLSSYC 194

Query: 368 EVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLSSPFEVVTLS 427
            V  L   F+V+TLSS   V  L   F+V+TLSS   V  L   F+V+TLSS   V  L 
Sbjct: 195 RVSHLLGQFQVLTLSSYCRVRHLLGKFQVLTLSSYCRVSHLLGQFQVLTLSSYCRVSYLL 254

Query: 428 SPFEVVA-SSLCR 440
             F+V+  SS CR
Sbjct: 255 GQFQVLTLSSYCR 267

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A150GLD1_GONPE	7.4e-22	41.49	Uncharacterized protein OS=Gonium pectorale GN=GPECTOR_15g350 PE=4 SV=1	[more]
E0VWD6_PEDHC	2.5e-14	33.17	Putative uncharacterized protein OS=Pediculus humanus subsp. corporis GN=Phum_PH...	[more]
W4YD03_STRPU	1.8e-12	37.06	Uncharacterized protein OS=Strongylocentrotus purpuratus GN=Sp-Hypp_725 PE=4 SV=...	[more]
M3D150_SPHMS	5.7e-06	41.38	Uncharacterized protein OS=Sphaerulina musiva (strain SO2202) GN=SEPMUDRAFT_1093...	[more]
A0A0A0LMH5_CUCSA	7.4e-06	64.58	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G277090 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT5G19810.1	3.9e-06	42.21	Proline-rich extensin-like family protein	[more]

BLAST of CmoCh20G010000.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|1005461681\|ref\|XP_015767915.1\|	6.2e-22	43.36	PREDICTED: mucin-5AC-like [Acropora digitifera]	[more]
gi\|1004142680\|gb\|KXZ50666.1\|	1.1e-21	41.49	hypothetical protein GPECTOR_15g350 [Gonium pectorale]	[more]
gi\|242019959\|ref\|XP_002430425.1\|	3.7e-14	33.17	hypothetical protein Phum_PHUM478280 [Pediculus humanus corporis]	[more]
gi\|780146344\|ref\|XP_011681403.1\|	2.6e-12	37.06	PREDICTED: uncharacterized protein LOC105446365 [Strongylocentrotus purpuratus]	[more]
gi\|929319333\|ref\|XP_014041718.1\|	1.6e-09	43.01	PREDICTED: uncharacterized protein LOC106594858 isoform X1 [Salmo salar]	[more]

GO Annotation

GO Assignments

This mRNA is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0008150	biological_process
cellular_component	GO:0005575	cellular_component
molecular_function	GO:0003674	molecular_function

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh20G010000	CmoCh20G010000	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh20G010000.1	CmoCh20G010000.1-protein	polypeptide

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh20G010000.1.CDS.8	CmoCh20G010000.1.CDS.8	CDS
CmoCh20G010000.1.CDS.7	CmoCh20G010000.1.CDS.7	CDS
CmoCh20G010000.1.CDS.6	CmoCh20G010000.1.CDS.6	CDS
CmoCh20G010000.1.CDS.5	CmoCh20G010000.1.CDS.5	CDS
CmoCh20G010000.1.CDS.4	CmoCh20G010000.1.CDS.4	CDS
CmoCh20G010000.1.CDS.3	CmoCh20G010000.1.CDS.3	CDS
CmoCh20G010000.1.CDS.2	CmoCh20G010000.1.CDS.2	CDS
CmoCh20G010000.1.CDS.1	CmoCh20G010000.1.CDS.1	CDS

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh20G010000.1.exon.8	CmoCh20G010000.1.exon.8	exon
CmoCh20G010000.1.exon.7	CmoCh20G010000.1.exon.7	exon
CmoCh20G010000.1.exon.6	CmoCh20G010000.1.exon.6	exon
CmoCh20G010000.1.exon.5	CmoCh20G010000.1.exon.5	exon
CmoCh20G010000.1.exon.4	CmoCh20G010000.1.exon.4	exon
CmoCh20G010000.1.exon.3	CmoCh20G010000.1.exon.3	exon
CmoCh20G010000.1.exon.2	CmoCh20G010000.1.exon.2	exon
CmoCh20G010000.1.exon.1	CmoCh20G010000.1.exon.1	exon