CmoCh20G000580.1 (mRNA) Cucurbita moschata (Rifu)

NameCmoCh20G000580.1
TypemRNA
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionUnknown protein
LocationCmo_Chr20 : 316726 .. 328793 (-)
Sequence length2020
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AAGAAATCAAGATTCCTACCTTTTTCTCGGAGTAAAAGGCAAAGCGGATAGAGAAAAATTGTTGGCGAAAATACTCTGGAAAAGCCTGTAACGCCGCATAAGGAGTTTTCTTGACTCGTTATCTAGAATCATCTCTCAAGGGAAGGTGTTCTTCGGATTAATTCGTCGCGAATTTTTTGTTCTTGTTTCAGGTTTGCGATAAGGGATTTTTAATTCTCGATCGTGTTGGCGTGTTTTTGATCTGGAAAGCGAGAGAGATATTATCGTTCGATCTTTAATTTCTTCGTCAAAGCTTTAGGTTCGATATAGTTTGTCATGAACGATCAGAATCCGATAATAAATCAAGCGCAAATGATTAGTATGAACCATCCGCAGATGGCAAACCAGCCTCATGTAATCAATCAGTCTAAAATTATGAACCAGCCACAGGTAATTAATCAACCTCAATTTCTGAACCAAAACCAGCTATTGAGCCATTCTCAGATAATGTCTCAGTCGCGCGCCATCAACCAGGCAAATCTTTTGCCTCAGCCTCAGATGATCGTGAGTCATTCTCTGCCGCCTATGATGAGTAGAAACCATAAGGTATGGGCACGCCTGCAGGCCCCTTTGGATCAGAACAAGAAGTACCGCAATTTCCCGAAGCCCAGCTACGGAATTACGAAGCAGTCAAGGTCGGGACGAGGCAATTGGAAGGGGAAAGGCGTCAGTGACAAAAGGATAAACAATAGAAGAACGGTAAAACCCTTACCGGGTTCCTTAATTGGTCCGAATAATGCTGGAGGGTATCAACCTCCAAGTCTTCACGAGTTGCAGTCTCAAAATCGTATAAAAGCTCGAAAGTTTTACCCAAAAAAGAAGTTCAGTAATAGTTTTGCACCTTATGCGCCTCGGAATACCTCGTCTTTTATAATTCGTGCGAAGAAGTATGGTGGGATCGCTTCACTTGTGTCCCCTAGTCCCGTAACACCAGCCGTTCTTGCTACTCCAATGTTCTCCCCTTCAAGGGAGGCGTTGGGTGATATGGCCAAGGAGGAATGGGGTGTTGATGGTTATGGATCAATGAAAGGGTTGATAAGGCTTCGAGGGTCTGAGAATAAGGCGGAAGTGCAGGAGGAGGAGGAAGAGGACGGTGGTGGCGGGTCGAGTGATAGTGATGTAGAGGAACATCTGGAGGTAGAACGTAGATTGGACCATGACTTGAGTCGATTTGAAATGATATACCAGAACTATGGAGTAGAGTATAATAACTGTTTGGAAAATAGGGTCGATGATCAGGATAGCCATATAGCACAGTTGGAGGAGGAGAACTTGACATTGAAGGAGAGACTTTTTCTTATGGAGAGCGAGCTCGTTGACATGAGGAGGAAGTTGCAACTTCTCAGGGAGCAAAACACAGCAATTGACGATGTGAATGAGGAGGTAATGGAGAACGTATCTGAGAATGAAGGCGATGGAGGGTTGGAGACGTAGAGTACGTATCTGAGATTAGACCAAACCAAGATGTTGATATTGGTTCTAAGGAGGACGATGAAGAAGTCCTGGAGATTGAGGTAAAGTGGTTGAGGAGAAATACGTACGCTGTTTCAATAATTTTGGGTGTATACATGACACTTAAATTTAAGAAATGGGAAGACCAAAAACTAGTTTCTTACATCAAATACGAAACCGCTCATTCTCCCTCATTTTGTATTCCAAAGTCAGGCGTTCCCTTTCTTTTCCTTGAAATCGCATTCACTCTACCTTCTCACCCACCATGAAATTAGCCCTAGCTTACACGAAGAAGATGAGGACCCCAAGCTTCAAAGTCGCCCCGATGAAGAGCCCCACTTTCTACATTGAGATTGAAGTTGCGGCCATTGAAACAACTTCCCGTTGTTTTCAGGTTCAATTCCAAAGCTTTTTCTCTGTATTTGTTGAAATTTGTCTGACGAAAAGTGGAATATATCTTGTGAGATTCAATTGCTGCAGAAAGTCTTCTACTAGTTAAATGCCTCGAGTTTCCAAGTTCTTGTTTTTTTTCAAAGCTTTTTTAGTCAAACAATGTTCCTTGTGAGAAAAATGTTAATCAAAACAATGTAAGCCTTTGAGGATGTTGATCTTCATAGTTGGGAATCATCGTGTAATGTGCCGATGAGATTCTCCAATCACGGGTGCATGAATCTTCTTGGTAAGAAATGAGGTAATAGTTTTGAGGAAGAAGATGACACCATAGAATCTGTTACTAATCCATGTATTACTTCGGTTGTACCCACACTTAAATGCAATGTGGCGTTTTCTCACATCAACACAGCTGCTCTCTCCAAGTTGTATTATATTATTGTATTGTATTCTTTTTATAACACTGCCCATCTATTTCTTTTGTTGCCATTGTAATTGCCTTGTATAGCTGCTAAATTGTTATCAAAGACTTCTAGGTCTGTTTGTAAATTGAGCAGAGGATTTCATCCAAAGCATTATTCTTCGTTTATTTCCATATTTCTTTGGTGGAGGGGTGTCATTGTGTTACTTTCCATAAAATTTCTATGGTGCAGGGGGTGTAATTGTGTTTAGAGAGAGACTGTGAAGGTGTGTGATTGGCCATGGCTAAGAGAGAGGGATTAATGAGTTTTCGCTGATTTTTTCTCCCTCTTGGTCTTGATGGGTTAAGCTAAGGCAACATCATGAAGTGTTGTGCTGGTTACCATGACGATGTTGATGTTTGTGAGAACTGAGGTCCAATGGTGAAGCTCTAGTTGTTGGCTAACCCAAACCCATCACTGAACCTCTTGTAACTTGGTAACGTTTTCGCTATATGAGAAATAAAATGATTGTGTTGCAACTGTACTTATCCTGATTAATAATAGCGAACTCTGATATTAAAAACCATCAATTTAGGCAATAGTTTTGGCTTGTTAATAATTTCCTATGATTTTCTTTGTTGAGAAATATACCTCTCAAAGCATATACATGCAGAGTTTGTGTCAGTTCTATTGCCTTTTGTTCTTCCTGTGGTTTGGCTTTGTCATTTTTTTTTTTTCGTTCATTGGCCTTGTTATGGTTGGTTATTATGTTAAACTAATTCTGTGTGCTTGAATTGTTGGTGCCGGAAGTACTTCTCTTTGGAGTGGTTGTATGCTTTGACATTGTAAGGTAAGGTATTAATATTAGACCTAAGGTCATTATCGAATTTTGTGCTCTATTGTTATCATCTTTTGATTCCTATAAGATTTACATACCTTTTCTTGGAAAAGGAAATTGATCTTAACTCTAGTCATTTTTGTCTCTATTACCATCTTGCAATTTCAAAAGCTTTTGTTGTTTGTGGTTTCTTTTCTAGTACAAAAATCTCATAACTGATTTGGTTTTAAATTATGCTTTGCTTTGTAGGACAAGCAGAAGTGATTCTTGATATAGATAGCTAATTCCCTCTTCCTTTCTTGCATAAGCATATGTAGCAGCAGAAAAATGCGACATTCTCCTTTGTATTGGAAAGAAAGCGCATAAATATGCGAAGGTACCCATGGAAGTATTTGCAAGATGATAAGGTAGTGAACTTCGATAACTCACGAACATAGATGTCGTTGAATTGTGAGCTCAAGACTAATTAAGGTATGGTTACCAAAGTCAAATTTATTCTAATGAACTTTTCTACGTCTCTTATTTTAATAAAAAATTTTCCATGCAATATGTTTATTATTTGATTGAAGATTTTTGTCTTCAAGACTCAATTTCATCTATAGTCGAAATTGTTGTTGTGTTACTCCATAATTATTGGTGATGCATTCCTGAAAGTTTAGTCATGAGTTACTGCTGGAAGTTATTGAGCATACTTTCAAGTATATGTTTCATATTGGAGCACTTAATGTGTGCCTTCTACCTCACTTGTAAATCTACATGAACCTTTCATGTGAACCCTTTTCAACAAAGCTCCCTAAACCTTGTTTGTAATATTTGTATTTTCGATAGTCGTGTTGCTGTCTCAGGTTCATTGCAAATATGCCATCCAGTATCAATTTGGGCATTCTTCTATGAAGATTCATTTTGTATGGTCCTGCTTTCGATGCTAAAATCCTTACATTTCAGGAATTTTATTGCCTCAGATGTCTTTCCTAGAAGAGTAAATTTTGGAAATTTTGAAGAAACAATGGATTAAACAAAATTTTCCTTTAGGTGCAATCCGTATGCACTCTTAACTAAAAAGATGTTTCCCCAAAATTTGGAGTCCTGATCAATGAACCAATGCTCAATTATTTGAGGGATTGTGCCAAACTAAATTAGAAGGATAACTCTCTCATGCAGCTAATTATCGGTTATTGTTGGGAAAGCAGATGGTGATACGAGGAAGAAGAAAAAATGAGAAGTTAGGAAGGGAATTTCTTATGAAATTTCGCAAATTTTCTTGGATAGGTGAGTTTTAGAGAAGCATCCTGGATATTTCCCTTTTTTTTTTCTTTTTGATAAAAGGAAAAATCTATCCCGCATTGTAGGGATATGAATACCAATGGAATATTTTTACTGTGTCCACCCAATGGTTATTCATTAATATGGCTTATAAGTTTCCCTTTCATTCACAACTTTTTTTTTTGGTTCACACACATTCTTTCAATCGCTTGTACAATTGTTTTCATAAAGAAATTTATTTATTATTCTTTTTTTATAAGGCTATTTGGCCTAATTCTTTAGGTAATTTTTGTTTGACATGTTATTAGTGGGGCATATAAATGCTTTATTGAAGTTTGAATTATGTACTAGAAATGCTTCTATCTGAATCTGTTATACCTCATGTCGTAAGTTGGAGAGATTAAGTGATAGTGAAGGATGAAATGGGGAAGGAATCAGATGAAGAGCTTTGGGCAGACGATGTAGCAAATGATCAAGAAATGAAGGGCAAACTTGTTCTAGGAAGGAAAATGAAAGATAGGATATGGATTAAAATTTGGGGTAATATTTTGCACGCAAATTCAGGGATTAGAAATGAAACAATGGTCAATGATGAAGAAGAGCAAATAAGCATAATT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mRNA sequence

AAGAAATCAAGATTCCTACCTTTTTCTCGGAGTAAAAGGCAAAGCGGATAGAGAAAAATTGTTGGCGAAAATACTCTGGAAAAGCCTGTAACGCCGCATAAGGAGTTTTCTTGACTCGTTATCTAGAATCATCTCTCAAGGGAAGGTGTTCTTCGGATTAATTCGTCGCGAATTTTTTGTTCTTGTTTCAGGTTTGCGATAAGGGATTTTTAATTCTCGATCGTGTTGGCGTGTTTTTGATCTGGAAAGCGAGAGAGATATTATCGTTCGATCTTTAATTTCTTCGTCAAAGCTTTAGGTTCGATATAGTTTGTCATGAACGATCAGAATCCGATAATAAATCAAGCGCAAATGATTAGTATGAACCATCCGCAGATGGCAAACCAGCCTCATGTAATCAATCAGTCTAAAATTATGAACCAGCCACAGGTAATTAATCAACCTCAATTTCTGAACCAAAACCAGCTATTGAGCCATTCTCAGATAATGTCTCAGTCGCGCGCCATCAACCAGGCAAATCTTTTGCCTCAGCCTCAGATGATCGTGAGTCATTCTCTGCCGCCTATGATGAGTAGAAACCATAAGGTATGGGCACGCCTGCAGGCCCCTTTGGATCAGAACAAGAAGTACCGCAATTTCCCGAAGCCCAGCTACGGAATTACGAAGCAGTCAAGGTCGGGACGAGGCAATTGGAAGGGGAAAGGCGTCAGTGACAAAAGGATAAACAATAGAAGAACGGTAAAACCCTTACCGGGTTCCTTAATTGGTCCGAATAATGCTGGAGGGTATCAACCTCCAAGTCTTCACGAGTTGCAGTCTCAAAATCGTATAAAAGCTCGAAAGTTTTACCCAAAAAAGAAGTTCAGTAATAGTTTTGCACCTTATGCGCCTCGGAATACCTCGTCTTTTATAATTCGTGCGAAGAAGTATGGTGGGATCGCTTCACTTGTGTCCCCTAGTCCCGTAACACCAGCCGTTCTTGCTACTCCAATGTTCTCCCCTTCAAGGGAGGCGTTGGGTGATATGGCCAAGGAGGAATGGGGTGTTGATGGTTATGGATCAATGAAAGGGTTGATAAGGCTTCGAGGGTCTGAGAATAAGGCGGAAGTGCAGGAGGAGGAGGAAGAGGACGGTGGTGGCGGGTCGAGTGATAGTGATGTAGAGGAACATCTGGAGGTAGAACGTAGATTGGACCATGACTTGAGTCGATTTGAAATGATATACCAGAACTATGGAGTAGAGTATAATAACTGTTTGGAAAATAGGGTCGATGATCAGGATAGCCATATAGCACAGTTGGAGGAGGAGAACTTGACATTGAAGGAGAGACTTTTTCTTATGGAGAGCGAGCTCGTTGACATGAGGAGGAAGTTGCAACTTCTCAGGGAGCAAAACACAGCAATTGACGATGTGAATGAGGAGGTAATGGAGAACGTATCTGAGAATGAAGGCGATGGAGGGTTGGAGACGTAGAGTACGTATCTGAGATTAGACCAAACCAAGATGTTGATATTGGTTCTAAGGAGGACGATGAAGAAGTCCTGGAGATTGAGGTAAAGTGGTTGAGGAGAAATACGTACGCTGTTTCAATAATTTTGGGTGTATACATGACACTTAAATTTAAGAAATGGGAAGACCAAAAACTAGTTTCTTACATCAAATACGAAACCGCTCATTCTCCCTCATTTTGTATTCCAAAGTCAGGCGTTCCCTTTCTTTTCCTTGAAATCGCATTCACTCTACCTTCTCACCCACCATGAAATTAGCCCTAGCTTACACGAAGAAGATGAGGACCCCAAGCTTCAAAGTCGCCCCGATGAAGAGCCCCACTTTCTACATTGAGATTGAAGTTGCGGCCATTGAAACAACTTCCCGTTGTTTTCAGGCTATTTGGCCTAATTCTTTAGAACTGTTGAGAAGTGATAGGGAAAGCCAACCGGATTACCGGATCTCGCACGCCTTCCAAACCTTCCAGAACACTCACGGCCTGCTCGACATTCTGAAGAAATCAGTAGATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAATTAGCCCTAGCTTACACGAAGAAGATGAGGACCCCAAGCTTCAAAGTCGCCCCGATGAAGAGCCCCACTTTCTACATTGAGATTGAAGTTGCGGCCATTGAAACAACTTCCCGTTGTTTTCAGGCTATTTGGCCTAATTCTTTAGAACTGTTGAGAAGTGATAGGGAAAGCCAACCGGATTACCGGATCTCGCACGCCTTCCAAACCTTCCAGAACACTCACGGCCTGCTCGACATTCTGAAGAAATCAGTAGATTAA
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CmoCh20G000580CmoCh20G000580gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh20G000580.1CmoCh20G000580.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh20G000580.1.CDS.3CmoCh20G000580.1.CDS.3CDS
CmoCh20G000580.1.CDS.2CmoCh20G000580.1.CDS.2CDS
CmoCh20G000580.1.CDS.1CmoCh20G000580.1.CDS.1CDS


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh20G000580.1.five_prime_UTR.1CmoCh20G000580.1.five_prime_UTR.1five_prime_UTR


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh20G000580.1.exon.3CmoCh20G000580.1.exon.3exon
CmoCh20G000580.1.exon.2CmoCh20G000580.1.exon.2exon
CmoCh20G000580.1.exon.1CmoCh20G000580.1.exon.1exon