CmoCh09G001940.1 (mRNA) Cucurbita moschata (Rifu)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATGTCATCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGCTCTCNGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGTGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGCAGCCACTGGAGCCGGGGTCTCAGACTCTACGAGTGCCTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGATTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCAGGTGAAGCGACCACTGGAGCCTCGGGTGAAGCGGCCACTGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCAGGCGATGGGGTCAACGGTGCTTCAGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGTGATGGGGCCACTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCACCGGTGCTTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGAGCCGCCGGGGAGTGAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCTGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCGGGGGTGTGAGAGTCGACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCTGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGATGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTGAACTGGTGGTTGGGGTGACGAGGGCGTTGGTGGTTGTGAATGTAATGAAGGTGGAGAAAGAGGATGATGAACACGTACTGGTGTTTGTGGTGTGTGTGGTGAGTGTGACTTCCATGGCCACGGCATCGACGACGGCGATGGCGCTCCTCCGCCGCACATAGCCTTACTGCAATCAACACTCTTGCTGGTCACCGGAGCACAAGCCTCAGCCGCCTTCTGCTTGGGCCTCTCGGGCAAGCAATTTGCAGTATCATCGAACACAACATCCTTTCTACTCTGCGGCACGCACTTCTCCGCCTCGCCATTGAAGAAATTGTGAGAGAAGGTGAATTCAGCCAATTTGGGCAAGTTGCATAAGCCTTCCTCCACAACCCCAGTCAAGGAATTGTTAGAAATATCCAAAATCTCGACCTTCTTTAGGCCATCGAAGCTCTTGGACAAGATCCCACTAAACATGTTGGCGGAAATATCGAAAACCACGACATTCCCAAGCATCCCAACTTCAGGGGGCAAACAACCAGCGAAATCATTGTTCAACATTACCAACTGGTTCAGTGTGTTCCCCATTTTTCCAATGCAGCTCGGAATGCATCCCGTGAAATGGTTGTAGGCAAACACAATCACCGACGCCGGCGAATCCCCAAAAGTATCGGGAATGTTGGAGGTGAATCTGTTGTTGTTAAGGAAAATGGCATCGAGTGTCTTGTTGAAAAGTTGAGGAGGCAATGGGCCTTCGAAATTATTGAACCTGAGGTCAAGAAATTTCAGATTAGGAATCCTCACAACCACCTCAGGAAAATAGCCAACAAATCGGTTGTTGCTAAGGTCGAGCTCGTGAAGCAGAGTCATCCTCGAGAAGCTCGTTGGGATGATTCCGCAGAATCTGTTGGTGTTGATGTGGAATAA ATGATGTCATCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGCTCTCNGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGTGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGCAGCCACTGGAGCCGGGGTCTCAGACTCTACGAGTGCCTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGATTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCAGGTGAAGCGACCACTGGAGCCTCGGGTGAAGCGGCCACTGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCAGGCGATGGGGTCAACGGTGCTTCAGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGTGATGGGGCCACTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCACCGGTGCTTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGAGCCGCCGGGGAGTGAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCTGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCGGGGGTGTGAGAGTCGACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCTGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGATGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTGAACTGGTGGTTGGGGTGACGAGGGCGTTGGTGGTTGTGAATGTAATGAAGGTGGAGAAAGAGGATGATGAACACGTACTGGTGTTTGTGGTGTGTGTGGCCATCGAAGCTCTTGGACAAGATCCCACTAAACATGTTGGCGGAAATATCGAAAACCACGACATTCCCAAGCATCCCAACTTCAGGGGGCAAACAACCAGCGAAATCATTGTTCAACATTACCAACTGGTTCAGTGTGTTCCCCATTTTTCCAATGCAGCTCGGAATGCATCCCGTGAAATGGTTGTAGGCAAACACAATCACCGACGCCGGCGAATCCCCAAAAGTATCGGGAATGTTGGAGGTGAATCTGTTGTTGTTAAGGAAAATGGCATCGAGTGTCTTGTTGAAAAGTTGAGGAGGCAATGGGCCTTCGAAATTATTGAACCTGAGGTCAAGAAATTTCAGATTAGGAATCCTCACAACCACCTCAGGAAAATAGCCAACAAATCGGTTGTTGCTAAGGTCGAGCTCGTGAAGCAGAGTCATCCTCGAGAAGCTCGTTGGGATGATTCCGCAGAATCTGTTGGTGTTGATGTGGAATAA ATGATGTCATCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGCTCTCNGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGTGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGCAGCCACTGGAGCCGGGGTCTCAGACTCTACGAGTGCCTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGATTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCAGGTGAAGCGACCACTGGAGCCTCGGGTGAAGCGGCCACTGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCAGGCGATGGGGTCAACGGTGCTTCAGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGTGATGGGGCCACTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCACCGGTGCTTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGAGCCGCCGGGGAGTGAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCTGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCGGGGGTGTGAGAGTCGACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCTGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGATGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTGAACTGGTGGTTGGGGTGACGAGGGCGTTGGTGGTTGTGAATGTAATGAAGGTGGAGAAAGAGGATGATGAACACGTACTGGTGTTTGTGGTGTGTGTGGCCATCGAAGCTCTTGGACAAGATCCCACTAAACATGTTGGCGGAAATATCGAAAACCACGACATTCCCAAGCATCCCAACTTCAGGGGGCAAACAACCAGCGAAATCATTGTTCAACATTACCAACTGGTTCAGTGTGTTCCCCATTTTTCCAATGCAGCTCGGAATGCATCCCGTGAAATGGTTGTAGGCAAACACAATCACCGACGCCGGCGAATCCCCAAAAGTATCGGGAATGTTGGAGGTGAATCTGTTGTTGTTAAGGAAAATGGCATCGAGTGTCTTGTTGAAAAGTTGAGGAGGCAATGGGCCTTCGAAATTATTGAACCTGAGGTCAAGAAATTTCAGATTAGGAATCCTCACAACCACCTCAGGAAAATAGCCAACAAATCGGTTGTTGCTAAGGTCGAGCTCGTGAAGCAGAGTCATCCTCGAGAAGCTCGTTGGGATGATTCCGCAGAATCTGTTGGTGTTGATGTGGAATAA
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: W4CG72_9BACL (Uncharacterized protein OS=Paenibacillus sp. FSL R7-269 GN=C162_03257 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 1.8e-25 Identity = 227/510 (44.51%), Postives = 304/510 (59.61%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0Q3EFG3_BRADI (Uncharacterized protein OS=Brachypodium distachyon GN=BRADI_4g05483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 112.5 bits (280), Expect = 2.8e-21 Identity = 58/137 (42.34%), Postives = 88/137 (64.23%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: A0A167ENS6_9ASCO (Uncharacterized protein OS=Sugiyamaella lignohabitans GN=AWJ20_5257 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 2.2e-18 Identity = 221/519 (42.58%), Postives = 269/519 (51.83%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: A0A151GYX6_TOXGO (Uncharacterized protein OS=Toxoplasma gondii TgCatPRC2 GN=TGPRC2_427510 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 2.2e-18 Identity = 93/177 (52.54%), Postives = 119/177 (67.23%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: Q98MG7_RHILO (Hypothetical glycine-rich protein OS=Rhizobium loti (strain MAFF303099) GN=mlr0587 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 100.1 bits (248), Expect = 1.4e-17 Identity = 241/559 (43.11%), Postives = 330/559 (59.03%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|573556340|gb|ETT55085.1| (hypothetical protein C162_03257 [Paenibacillus sp. FSL R7-269]) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 2.6e-25 Identity = 227/510 (44.51%), Postives = 304/510 (59.61%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|944050800|gb|KQJ86438.1| (hypothetical protein BRADI_4g05483 [Brachypodium distachyon]) HSP 1 Score: 112.5 bits (280), Expect = 4.0e-21 Identity = 58/137 (42.34%), Postives = 88/137 (64.23%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|992160821|gb|KXG23625.1| (hypothetical protein SORBI_008G119500 [Sorghum bicolor]) HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 2.6e-20 Identity = 60/159 (37.74%), Postives = 100/159 (62.89%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|992160820|gb|KXG23624.1| (hypothetical protein SORBI_008G119500 [Sorghum bicolor]) HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 2.6e-20 Identity = 60/159 (37.74%), Postives = 100/159 (62.89%), Query Frame = 1
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|522108205|ref|WP_020619414.1| (hypothetical protein [Paenibacillus daejeonensis]) HSP 1 Score: 109.4 bits (272), Expect = 3.3e-20 Identity = 259/554 (46.75%), Postives = 355/554 (64.08%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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