CmoCh09G001940.1 (mRNA) Cucurbita moschata (Rifu)

NameCmoCh09G001940.1
TypemRNA
OrganismCucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
DescriptionChrom
LocationCmo_Chr09 : 872060 .. 875081 (-)
Sequence length2700
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATGTCATCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGCTCTCNGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGTGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGCAGCCACTGGAGCCGGGGTCTCAGACTCTACGAGTGCCTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGATTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCAGGTGAAGCGACCACTGGAGCCTCGGGTGAAGCGGCCACTGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCAGGCGATGGGGTCAACGGTGCTTCAGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGTGATGGGGCCACTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCACCGGTGCTTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGAGCCGCCGGGGAGTGAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCTGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCGGGGGTGTGAGAGTCGACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCTGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGATGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTGAACTGGTGGTTGGGGTGACGAGGGCGTTGGTGGTTGTGAATGTAATGAAGGTGGAGAAAGAGGATGATGAACACGTACTGGTGTTTGTGGTGTGTGTGGTGAGTGTGACTTCCATGGCCACGGCATCGACGACGGCGATGGCGCTCCTCCGCCGCACATAGCCTTACTGCAATCAACACTCTTGCTGGTCACCGGAGCACAAGCCTCAGCCGCCTTCTGCTTGGGCCTCTCGGGCAAGCAATTTGCAGTATCATCGAACACAACATCCTTTCTACTCTGCGGCACGCACTTCTCCGCCTCGCCATTGAAGAAATTGTGAGAGAAGGTGAATTCAGCCAATTTGGGCAAGTTGCATAAGCCTTCCTCCACAACCCCAGTCAAGGAATTGTTAGAAATATCCAAAATCTCGACCTTCTTTAGGCCATCGAAGCTCTTGGACAAGATCCCACTAAACATGTTGGCGGAAATATCGAAAACCACGACATTCCCAAGCATCCCAACTTCAGGGGGCAAACAACCAGCGAAATCATTGTTCAACATTACCAACTGGTTCAGTGTGTTCCCCATTTTTCCAATGCAGCTCGGAATGCATCCCGTGAAATGGTTGTAGGCAAACACAATCACCGACGCCGGCGAATCCCCAAAAGTATCGGGAATGTTGGAGGTGAATCTGTTGTTGTTAAGGAAAATGGCATCGAGTGTCTTGTTGAAAAGTTGAGGAGGCAATGGGCCTTCGAAATTATTGAACCTGAGGTCAAGAAATTTCAGATTAGGAATCCTCACAACCACCTCAGGAAAATAGCCAACAAATCGGTTGTTGCTAAGGTCGAGCTCGTGAAGCAGAGTCATCCTCGAGAAGCTCGTTGGGATGATTCCGCAGAATCTGTTGGTGTTGATGTGGAATAA

mRNA sequence

ATGATGTCATCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGCTCTCNGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGTGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGCAGCCACTGGAGCCGGGGTCTCAGACTCTACGAGTGCCTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGATTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCAGGTGAAGCGACCACTGGAGCCTCGGGTGAAGCGGCCACTGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCAGGCGATGGGGTCAACGGTGCTTCAGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGTGATGGGGCCACTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCACCGGTGCTTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGAGCCGCCGGGGAGTGAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCTGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCGGGGGTGTGAGAGTCGACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCTGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGATGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTGAACTGGTGGTTGGGGTGACGAGGGCGTTGGTGGTTGTGAATGTAATGAAGGTGGAGAAAGAGGATGATGAACACGTACTGGTGTTTGTGGTGTGTGTGGCCATCGAAGCTCTTGGACAAGATCCCACTAAACATGTTGGCGGAAATATCGAAAACCACGACATTCCCAAGCATCCCAACTTCAGGGGGCAAACAACCAGCGAAATCATTGTTCAACATTACCAACTGGTTCAGTGTGTTCCCCATTTTTCCAATGCAGCTCGGAATGCATCCCGTGAAATGGTTGTAGGCAAACACAATCACCGACGCCGGCGAATCCCCAAAAGTATCGGGAATGTTGGAGGTGAATCTGTTGTTGTTAAGGAAAATGGCATCGAGTGTCTTGTTGAAAAGTTGAGGAGGCAATGGGCCTTCGAAATTATTGAACCTGAGGTCAAGAAATTTCAGATTAGGAATCCTCACAACCACCTCAGGAAAATAGCCAACAAATCGGTTGTTGCTAAGGTCGAGCTCGTGAAGCAGAGTCATCCTCGAGAAGCTCGTTGGGATGATTCCGCAGAATCTGTTGGTGTTGATGTGGAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGATGTCATCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGCTCTCAGACTCGACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGCTCTCNGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGTGTGATGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGTTGGGGTCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTCTCAGACTCTACTGGTGCCTCGGGTGATGCAGCCACTGGAGCCGGGGTCTCAGACTCTACGAGTGCCTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGATTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGACGCGGCCACCGGAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGAAGACTCGGGTGAAGCGGCCACCGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCAGGTGAAGCGACCACTGGAGCCTCGGGTGAAGCGGCCACTGGAGCTTCAGAGTCAATTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCAGGCGATGGGGTCAACGGTGCTTCAGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCGGGCGATGGGGCCACCGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATTGGGTCAACGGTGCTTCAGGCGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACAGTTGCTTCGGGTGATGGGGTCGCCGGTGCTTCGGGTGATGGGGCCACTGGTGCTTCGGGTGATGGGGTCACCGGTGCTTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGAGTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCCGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGAGCCGCCGGGGAGTGAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCTGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCTCGGGTGATGGTGCAGCCGGGGTTTCAGATTCGACTGTTGCCCCGGGTGATGGGGCAGCGGGGGTGTGAGAGTCGACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCTGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGCTTCGGGTGACGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTCAACGGGTGATGAGGCCGATGGTGTGTGAGAGTGAACTGGTGGTTGGGGTGACGAGGGCGTTGGTGGTTGTGAATGTAATGAAGGTGGAGAAAGAGGATGATGAACACGTACTGGTGTTTGTGGTGTGTGTGGCCATCGAAGCTCTTGGACAAGATCCCACTAAACATGTTGGCGGAAATATCGAAAACCACGACATTCCCAAGCATCCCAACTTCAGGGGGCAAACAACCAGCGAAATCATTGTTCAACATTACCAACTGGTTCAGTGTGTTCCCCATTTTTCCAATGCAGCTCGGAATGCATCCCGTGAAATGGTTGTAGGCAAACACAATCACCGACGCCGGCGAATCCCCAAAAGTATCGGGAATGTTGGAGGTGAATCTGTTGTTGTTAAGGAAAATGGCATCGAGTGTCTTGTTGAAAAGTTGAGGAGGCAATGGGCCTTCGAAATTATTGAACCTGAGGTCAAGAAATTTCAGATTAGGAATCCTCACAACCACCTCAGGAAAATAGCCAACAAATCGGTTGTTGCTAAGGTCGAGCTCGTGAAGCAGAGTCATCCTCGAGAAGCTCGTTGGGATGATTCCGCAGAATCTGTTGGTGTTGATGTGGAATAA
BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: W4CG72_9BACL (Uncharacterized protein OS=Paenibacillus sp. FSL R7-269 GN=C162_03257 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 1.8e-25
Identity = 227/510 (44.51%), Postives = 304/510 (59.61%), Query Frame = 1

Query: 4   STGASGV-GVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTG 63
           +TGA+G  GV G++  TGA+G GV      TGA+G GV G   +TGA+GVGV G   +TG
Sbjct: 76  ATGATGATGVTGVTGPTGATGAGV------TGATGAGVTG---ATGATGVGVTG---ATG 135

Query: 64  ASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGDGVAGLSDSTGASGD 123
           A+GVGV      TGA+G G  G + +TGA+G GV G   +TGA+G GV G   +TGA+G 
Sbjct: 136 ATGVGV------TGATGAGTTGATGATGATGAGVTG---ATGATGAGVTG---ATGATGV 195

Query: 124 GVAGVSDSTGASCDGVAGVSDSTGASGVGVAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDGAAG 183
           GV G + +TG       GV+ +TGA+GVGV G + +TG       GV+ +TGA+G    G
Sbjct: 196 GVTGATGATGV------GVTGATGATGVGVTGATGATGV------GVTGATGATG---VG 255

Query: 184 VSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDAATGAGVS 243
           V+ +TGA+G   AGV+ +TGA+G G  G + +TG    GA G    TGA+G  ATGAGV+
Sbjct: 256 VTGATGATG---AGVTGATGATGVGVTGATGATGVGVTGATGAG-VTGATG--ATGAGVT 315

Query: 244 DSTSASGEAATEDSGDAATGDSGDAATGDSGDAATGDSGDAATGDSGDAATGDSGEAATE 303
            +T A+G   T  +G   TG +G  ATG +G  ATG +G+  TG +G  ATG +G   T 
Sbjct: 316 GATGATGVGVTGATGAGVTGATG--ATGVTG--ATGATGE--TGVTG--ATGATGVGVT- 375

Query: 304 DSGEAATEDSGEAATGASESIGASGEATTGASGEAATGASESIGASG-DGVAGASGDGVN 363
                AT  +G   TGA+ + G      TGA+G   TGA+ + G +G  G  GA+G GV 
Sbjct: 376 ----GATGATGVGVTGATGATGVGVTGATGATGAGVTGATGATGETGVTGATGATGVGVT 435

Query: 364 GASGDGAAGVSESTVASGDGVAVASGDGVAGASGDGATGASGDGATGASGDWVNGASGDW 423
           GA+G    GV+ +T A+G GV  A+  G  GA   GATGA+G G TGA+     GA+G  
Sbjct: 436 GATGATGVGVTGATGATGVGVTGAT--GATGAGVTGATGATGVGVTGAT-----GATGAG 495

Query: 424 VNGASGDGAAGVSESTVASGDGVAGASGDGATGASGDGVTGASGDGAAGVSESTVASGDG 483
           V GA+G    GV+ +T A+G GV GA+  GATGA+G GVTGA+G    GV+ +T     G
Sbjct: 496 VTGATGATGVGVTGATGATGVGVTGAT--GATGATGVGVTGATGATGVGVTGAT-----G 513

Query: 484 AAGVSDSTVASGD-GAAGVSDSTVASGDGA 511
           A G + +T A+GD GA GV+  T  +  GA
Sbjct: 556 ATGATGATGATGDTGATGVTGPTGVAVAGA 513

BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0Q3EFG3_BRADI (Uncharacterized protein OS=Brachypodium distachyon GN=BRADI_4g05483 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 112.5 bits (280), Expect = 2.8e-21
Identity = 58/137 (42.34%), Postives = 88/137 (64.23%), Query Frame = 1

Query: 763 HPNFRGQTTSEIIVQHYQLVQCVPHFSNAARNASREMVVGKHNHRRRRIPKSIGNVGGES 822
           HP  R     E +V+ ++LVQ   H  +A R+ S E+VVG+H+HRRR +   + +   E+
Sbjct: 367 HPQLRRHAAVEPVVEQHELVQRPRHHPHAPRDTSHELVVGEHHHRRRGVADVVRDEAHEA 426

Query: 823 VVVKENGIECLVEKLRRQWAFEIIEPEVKKFQIRNPHNHLRKIANKSVVAKVELVKQSHP 882
           V V+ +G+E L+E+L  Q   EIIEP+++  +  N  NHL +  +++VVA VELV++  P
Sbjct: 427 VAVEHDGVEALLEELLGQLPLEIIEPQIEVLEHGNVENHLGERPHEAVVADVELVEEGEP 486

Query: 883 REARWDDSAESVGVDVE 900
            E   DD+AE+VGVDVE
Sbjct: 487 GEGLRDDAAEAVGVDVE 503

BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: A0A167ENS6_9ASCO (Uncharacterized protein OS=Sugiyamaella lignohabitans GN=AWJ20_5257 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 2.2e-18
Identity = 221/519 (42.58%), Postives = 269/519 (51.83%), Query Frame = 1

Query: 3    SSTGASGVGVAGLSDSTGASGV-GVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDST 62
            +S    G G AG S S GASG  G +G   S+GAS  G AG S S GASG    G S S 
Sbjct: 1443 ASGSTGGSGTAGASGSAGASGTTGSSG--GSSGASAGGSAGSSGSAGASG----GSSGSA 1502

Query: 63   GASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGDGVAGLSD--STGA 122
            GAS  G +G S S GAS  G      S GAS  G +G S S GAS  G AG S   S+G+
Sbjct: 1503 GASSGGSSGSSGSAGASAGG------SAGASAGGSSGSSGSAGASSGGSAGASSGGSSGS 1562

Query: 123  SGDGVAGVSDSTGASCDGVAGVSDSTGASGVGVAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDG 182
            SG   A    S GAS  G +G S S GAS  G AG S S  +   G+AG SD   A   G
Sbjct: 1563 SGSAGASAGGSAGASSSGSSGSSGSAGASTGGSAGASSSGSSGSSGSAGSSDGGSAGSSG 1622

Query: 183  AAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDGAAGVS----DSTGASGDGAAGVSD--STGASG 242
            +A    S GAS  G++G S S GAS  G+AG S     S GAS  G+AG S   S+G+SG
Sbjct: 1623 SASSGGSAGASAGGSSGSSGSAGASSGGSAGASAGSSGSAGASSGGSAGASSGGSSGSSG 1682

Query: 243  DAATGAGVSDSTSASGEAATEDSGDAATGDSGDAATGDSGDAATGDSGDAATGDSGDAAT 302
             A   +G S   SA G A +  S  A++G S  A++G S  A+ G S    +G SG A  
Sbjct: 1683 SAGASSGGSAGASAGGSAGSSGSAGASSGGSAGASSGGSAGASAGGS----SGSSGSAGA 1742

Query: 303  GDSGEAATEDSGEAATEDSGEAATGASESIGASGEATTGASGEAATGASESIGASGDGVA 362
               G A     G A +  S  A+ G+S S GAS   + GAS           GAS  G A
Sbjct: 1743 SSGGSAGASAGGSAGSSGSAGASAGSSGSAGASAGGSAGASA----------GASSGGSA 1802

Query: 363  GASGDGVNGASGDGAAGVSESTVASGDGVAVASGDGVAGASGDGATGASGDGATGASGDW 422
            GAS  G +G+SG   A    S  AS  G + +SG   AGAS  G+ GAS  G++G+SG  
Sbjct: 1803 GASAGGSSGSSGSAGASSGGSAGASAGGSSGSSGS--AGASSGGSAGASAGGSSGSSGS- 1862

Query: 423  VNGASGDWVNGASGDGAAGVSESTVASGDGVAGASGDGATGASGD---GVTGASGDGAAG 482
              GAS     GAS  G+AG S S  AS  G AGAS  G++G++GD   G  GAS  G+AG
Sbjct: 1863 -AGASSGGSAGASAGGSAGSSGSAGASSGGSAGASA-GSSGSAGDSAGGSAGASAGGSAG 1922

Query: 483  VSESTVASGDGAAGVSDSTVASGDGAAGVSDSTVASGDG 510
             S S  AS  G+AG S    A   G+ G + S+ +S  G
Sbjct: 1923 SSGSAGASAGGSAGASSGGSAGAGGSGGSASSSGSSSSG 1930

BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: A0A151GYX6_TOXGO (Uncharacterized protein OS=Toxoplasma gondii TgCatPRC2 GN=TGPRC2_427510 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 2.2e-18
Identity = 93/177 (52.54%), Postives = 119/177 (67.23%), Query Frame = 1

Query: 3   SSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTG 62
           +S+GASG G+ G S S+GASG G    SDS+GASG G    SDS+GASG G    SDS+G
Sbjct: 6   NSSGASGSGMGGWSSSSGASGSGSGACSDSSGASGSGSGACSDSSGASGSGSGACSDSSG 65

Query: 63  ASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGDGVAGLSDSTGASGD 122
           ASG G    SDS+GASG G    SDS+GASG G+   S+S+GASG G+   S+S+GASG 
Sbjct: 66  ASGSGSGACSDSSGASGSGSGACSDSSGASGSGIGAWSNSSGASGTGLGIWSNSSGASGS 125

Query: 123 GVAGVSDSTGASCDGVAGVSDSTGASGVGVAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDG 180
           G+   S+S+GAS  G+   S S+GASG G+   S+S+ AS  G+ G S+S+ ASG G
Sbjct: 126 GIGAWSNSSGASGTGLGIWSKSSGASGTGIGAWSNSSAASRSGSGGWSNSSAASGTG 182

BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. TrEMBL
Match: Q98MG7_RHILO (Hypothetical glycine-rich protein OS=Rhizobium loti (strain MAFF303099) GN=mlr0587 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 100.1 bits (248), Expect = 1.4e-17
Identity = 241/559 (43.11%), Postives = 330/559 (59.03%), Query Frame = 1

Query: 4    STGASGV-GVAGLSDSTGASG-VGVAGLSDSTGASG-VGVAGLSDSTGASGV-GVAGLSD 63
            +TGA+G  G  G + STGA+G  G  G +  TGA+G  G  G + +TGA+G  G  G + 
Sbjct: 1234 ATGATGATGDTGATGSTGATGSTGATGATGDTGATGSTGDTGATGATGATGATGATGDTG 1293

Query: 64   STGASGV-GVAGLSDSTGASG-VGVAGLSDSTGASG----VGVAGLSDSTGASGD----G 123
            +TG++G  G  G +  TGA+G  G  G + +TGA+G     G  G + +TGA+GD    G
Sbjct: 1294 ATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGATGDTGATGATGATGATGATGDTGATG 1353

Query: 124  VAGLSDSTGASGDGVAGVSDSTGASCDGVAGVSDSTGASGVGVAGVSDSTGASGD----G 183
              G + STGA+GD   G + STGA+  G  G +  TGA+G    G + +TGA+GD    G
Sbjct: 1354 STGATGSTGATGD--TGATGSTGAT--GATGATGDTGATGS--TGATGATGATGDTGATG 1413

Query: 184  AAGVSDSTGASGD----GAAGVSDSTGASGD-GAAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGD 243
            + G + +TGA+GD    G+ G + STGA+GD GA G + +TGA+GD   G + STGA+G 
Sbjct: 1414 STGATGATGATGDTGATGSTGATGSTGATGDTGATGSTGATGATGD--TGATGSTGATG- 1473

Query: 244  GAAGVSDSTGASGDAATGAGVSDSTSASGEAATEDSGDAATGDSGDAATGDSGDAATGDS 303
             A G + STGA+GD     G + ST A+G          ATGD+G  ATG +G  ATG +
Sbjct: 1474 -ATGATGSTGATGDT----GATGSTGATGATG-------ATGDTG--ATGSTG--ATGAT 1533

Query: 304  GDAATGDSGDA-ATGDSGEAATEDSGEAATEDSGEAATGASESIGASGEATTGASGEAAT 363
            G  ATGD+G   ATG +G  AT D+G A        ATGA+ + GA+G+  TGA+G  +T
Sbjct: 1534 G--ATGDTGSTGATGATG--ATGDTG-ATGSTGATGATGATGATGATGD--TGATG--ST 1593

Query: 364  GASESIGASGDGVAGASGD-GVNGASGD----GAAGVSESTVASGDGVAVAS--GDGVAG 423
            GA+ + GA+GD   GA+G  G  GA+GD    G+ G + +T A+GD  A  S    G  G
Sbjct: 1594 GATGATGATGD--TGATGSTGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATG 1653

Query: 424  ASGD-GATGASG-DGATGASGDWVNGASGDWVNGASGDGAAGVSESTVASGD----GVAG 483
            A+GD GATG++G  GATGA+G    GA+GD   GA+  G+ G + ST A+GD    G  G
Sbjct: 1654 ATGDTGATGSTGATGATGATG--ATGATGD--TGAT--GSTGATGSTGATGDTGATGATG 1713

Query: 484  ASGD-GATGASG-DGVTGASGD----GAAGVSESTVASGD----GAAGVSDSTVASGD-- 509
            A+GD GATGA+G  G TGA+GD    GA G + +T A+GD    G+ G + +T A+GD  
Sbjct: 1714 ATGDTGATGATGATGATGATGDTGATGATGSTGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTG 1750

BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|573556340|gb|ETT55085.1| (hypothetical protein C162_03257 [Paenibacillus sp. FSL R7-269])

HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 2.6e-25
Identity = 227/510 (44.51%), Postives = 304/510 (59.61%), Query Frame = 1

Query: 4   STGASGV-GVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTG 63
           +TGA+G  GV G++  TGA+G GV      TGA+G GV G   +TGA+GVGV G   +TG
Sbjct: 76  ATGATGATGVTGVTGPTGATGAGV------TGATGAGVTG---ATGATGVGVTG---ATG 135

Query: 64  ASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGVGVAGLSDSTGASGDGVAGLSDSTGASGD 123
           A+GVGV      TGA+G G  G + +TGA+G GV G   +TGA+G GV G   +TGA+G 
Sbjct: 136 ATGVGV------TGATGAGTTGATGATGATGAGVTG---ATGATGAGVTG---ATGATGV 195

Query: 124 GVAGVSDSTGASCDGVAGVSDSTGASGVGVAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDGAAG 183
           GV G + +TG       GV+ +TGA+GVGV G + +TG       GV+ +TGA+G    G
Sbjct: 196 GVTGATGATGV------GVTGATGATGVGVTGATGATGV------GVTGATGATG---VG 255

Query: 184 VSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASGDAATGAGVS 243
           V+ +TGA+G   AGV+ +TGA+G G  G + +TG    GA G    TGA+G  ATGAGV+
Sbjct: 256 VTGATGATG---AGVTGATGATGVGVTGATGATGVGVTGATGAG-VTGATG--ATGAGVT 315

Query: 244 DSTSASGEAATEDSGDAATGDSGDAATGDSGDAATGDSGDAATGDSGDAATGDSGEAATE 303
            +T A+G   T  +G   TG +G  ATG +G  ATG +G+  TG +G  ATG +G   T 
Sbjct: 316 GATGATGVGVTGATGAGVTGATG--ATGVTG--ATGATGE--TGVTG--ATGATGVGVT- 375

Query: 304 DSGEAATEDSGEAATGASESIGASGEATTGASGEAATGASESIGASG-DGVAGASGDGVN 363
                AT  +G   TGA+ + G      TGA+G   TGA+ + G +G  G  GA+G GV 
Sbjct: 376 ----GATGATGVGVTGATGATGVGVTGATGATGAGVTGATGATGETGVTGATGATGVGVT 435

Query: 364 GASGDGAAGVSESTVASGDGVAVASGDGVAGASGDGATGASGDGATGASGDWVNGASGDW 423
           GA+G    GV+ +T A+G GV  A+  G  GA   GATGA+G G TGA+     GA+G  
Sbjct: 436 GATGATGVGVTGATGATGVGVTGAT--GATGAGVTGATGATGVGVTGAT-----GATGAG 495

Query: 424 VNGASGDGAAGVSESTVASGDGVAGASGDGATGASGDGVTGASGDGAAGVSESTVASGDG 483
           V GA+G    GV+ +T A+G GV GA+  GATGA+G GVTGA+G    GV+ +T     G
Sbjct: 496 VTGATGATGVGVTGATGATGVGVTGAT--GATGATGVGVTGATGATGVGVTGAT-----G 513

Query: 484 AAGVSDSTVASGD-GAAGVSDSTVASGDGA 511
           A G + +T A+GD GA GV+  T  +  GA
Sbjct: 556 ATGATGATGATGDTGATGVTGPTGVAVAGA 513

BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|944050800|gb|KQJ86438.1| (hypothetical protein BRADI_4g05483 [Brachypodium distachyon])

HSP 1 Score: 112.5 bits (280), Expect = 4.0e-21
Identity = 58/137 (42.34%), Postives = 88/137 (64.23%), Query Frame = 1

Query: 763 HPNFRGQTTSEIIVQHYQLVQCVPHFSNAARNASREMVVGKHNHRRRRIPKSIGNVGGES 822
           HP  R     E +V+ ++LVQ   H  +A R+ S E+VVG+H+HRRR +   + +   E+
Sbjct: 367 HPQLRRHAAVEPVVEQHELVQRPRHHPHAPRDTSHELVVGEHHHRRRGVADVVRDEAHEA 426

Query: 823 VVVKENGIECLVEKLRRQWAFEIIEPEVKKFQIRNPHNHLRKIANKSVVAKVELVKQSHP 882
           V V+ +G+E L+E+L  Q   EIIEP+++  +  N  NHL +  +++VVA VELV++  P
Sbjct: 427 VAVEHDGVEALLEELLGQLPLEIIEPQIEVLEHGNVENHLGERPHEAVVADVELVEEGEP 486

Query: 883 REARWDDSAESVGVDVE 900
            E   DD+AE+VGVDVE
Sbjct: 487 GEGLRDDAAEAVGVDVE 503

BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|992160821|gb|KXG23625.1| (hypothetical protein SORBI_008G119500 [Sorghum bicolor])

HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 2.6e-20
Identity = 60/159 (37.74%), Postives = 100/159 (62.89%), Query Frame = 1

Query: 741 EALGQDPTKHVGGNIENHDIPKHPNFRGQTTSEIIVQHYQLVQCVPHFSNAARNASREMV 800
           E L Q   + V  ++ +  + +    R     E +V+ ++LV+   H ++AAR+AS E V
Sbjct: 477 EPLRQRANERVPADVHHRGVDELGELRRDAAVEAVVEKHELVERAGHAADAARDASYEGV 536

Query: 801 VGKHNHRRRRIPKSIGNVGGESVVVKENGIECLVEKLRRQWAFEIIEPEVKKFQIRNPHN 860
           V +H+H  RR+ + + +   E+V V E+G+E LVE++RRQ A E++EPEV+  +  +  +
Sbjct: 537 VREHHHGGRRVAEVVRDEADEAVAVDEDGVEVLVEEVRRQGAVEVVEPEVEVLEHGDLQH 596

Query: 861 HLRKIANKSVVAKVELVKQSHPREARWDDSAESVGVDVE 900
            + + A+++VVA VELV++    EA  DD+AE+VGVDVE
Sbjct: 597 DVGEAADEAVVADVELVEEREAAEALGDDAAEAVGVDVE 635

BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|992160820|gb|KXG23624.1| (hypothetical protein SORBI_008G119500 [Sorghum bicolor])

HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 2.6e-20
Identity = 60/159 (37.74%), Postives = 100/159 (62.89%), Query Frame = 1

Query: 741 EALGQDPTKHVGGNIENHDIPKHPNFRGQTTSEIIVQHYQLVQCVPHFSNAARNASREMV 800
           E L Q   + V  ++ +  + +    R     E +V+ ++LV+   H ++AAR+AS E V
Sbjct: 319 EPLRQRANERVPADVHHRGVDELGELRRDAAVEAVVEKHELVERAGHAADAARDASYEGV 378

Query: 801 VGKHNHRRRRIPKSIGNVGGESVVVKENGIECLVEKLRRQWAFEIIEPEVKKFQIRNPHN 860
           V +H+H  RR+ + + +   E+V V E+G+E LVE++RRQ A E++EPEV+  +  +  +
Sbjct: 379 VREHHHGGRRVAEVVRDEADEAVAVDEDGVEVLVEEVRRQGAVEVVEPEVEVLEHGDLQH 438

Query: 861 HLRKIANKSVVAKVELVKQSHPREARWDDSAESVGVDVE 900
            + + A+++VVA VELV++    EA  DD+AE+VGVDVE
Sbjct: 439 DVGEAADEAVVADVELVEEREAAEALGDDAAEAVGVDVE 477

BLAST of CmoCh09G001940.1 vs. NCBI nr
Match: gi|522108205|ref|WP_020619414.1| (hypothetical protein [Paenibacillus daejeonensis])

HSP 1 Score: 109.4 bits (272), Expect = 3.3e-20
Identity = 259/554 (46.75%), Postives = 355/554 (64.08%), Query Frame = 1

Query: 4    STGASGV-GVAGLSDSTGASGV-GVAGLSDSTGASGV-GVAGLSDSTGASGV-------G 63
            +TGA+G  GVAG + +TGA+GV G  G + +TGA+G  G  G++ +TGA+GV       G
Sbjct: 782  ATGATGATGVAGATGATGATGVAGATGATGATGAAGATGATGVAGATGATGVAGATGATG 841

Query: 64   VAGLSDSTGASGV-GVAGLSDSTGASGV----GVAGLSDSTGASGV-GVAGLSDSTGASG 123
            VAG + +TGA+G  G  G++ +TGA+GV    G  G++ +TGA+GV G  G +  TGA+G
Sbjct: 842  VAGATGATGAAGATGATGVAGATGATGVAGATGATGVAGATGATGVAGATGATGVTGATG 901

Query: 124  -DGVAGLSDSTGASG-DGVAGVSDSTGASCDGVAGVSDSTGASGV-GVAGVSDSTGASGD 183
              GVAG + +TG +G  G  GV+ +TGA+  GVAG + +TG +G  G  GV+ +TGA+G 
Sbjct: 902  ATGVAGATGATGVAGATGATGVAGATGAT--GVAGATGATGVAGATGATGVAGATGATG- 961

Query: 184  GAAGVSDSTGASGD-GAAGVSDSTGASG----DGAAGVSDSTGASGDGAAGVSDSTGASG 243
             A GV+ +TGA+G+ GA GV+ +TGA+G     GA G++ +TGA+  G AG + +TG +G
Sbjct: 962  -ATGVAGATGATGEAGATGVAGATGATGVAGATGATGIAGATGAT--GVAGATGATGVTG 1021

Query: 244  -DGAAGVSDSTGASGDA-ATGA-GVSDSTSASGEAATEDSGDAATGDSGDA-ATGDSGDA 303
              GA GV+ +TGA+G A ATGA GV+ +T A+GEA        ATG +G A ATG +G A
Sbjct: 1022 ATGATGVAGATGATGVAGATGATGVAGATGATGEA-------GATGATGVAGATGATGVA 1081

Query: 304  -ATGDSGDA-ATGDSGDA-ATGDSGEA-ATEDSGEAATEDSGEAATGASESIGASGEA-T 363
             ATG +G+A ATG +G A ATG +G A AT  +G A        ATGA+ + GA+G A  
Sbjct: 1082 GATGATGEAGATGATGVAGATGATGVAGATGATGVA-------GATGAAGATGATGVAGA 1141

Query: 364  TGASGEA-ATGASESIGASGDGVAGASG-DGVNGASG-DGAAGVSESTVASGDGVAVASG 423
            TGA+G A ATGA+ + GA+  GVAGA+G  GV GA+G  GA GV+ +T A+G        
Sbjct: 1142 TGATGVAGATGAAGATGAT--GVAGATGATGVTGATGATGATGVAGATGAAG-ATGATGA 1201

Query: 424  DGVAGASG----DGATGASG-DGATGASGDWVNGASGDWVNGASG-DGAAGVSESTVASG 483
             GVAGA+G     GATGA+G  GATGA+G  + GA+G    G +G  GA GV+ +T A+G
Sbjct: 1202 TGVAGATGATGEAGATGATGVAGATGATG--LAGATG--ATGVAGATGATGVAGATGATG 1261

Query: 484  -DGVAGASG-DGATGASG----DGVTGASG-DGAAGVSESTVASGDGAAGVSDST-VASG 508
              G  GA+G  GATGA+G     G TGA+G  GA GV+ +T A+  GAAG + +T VA  
Sbjct: 1262 VAGATGATGVAGATGATGVAGATGATGAAGATGATGVAGATGAT--GAAGATGATGVAGA 1306

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
W4CG72_9BACL1.8e-2544.51Uncharacterized protein OS=Paenibacillus sp. FSL R7-269 GN=C162_03257 PE=4 SV=1[more]
A0A0Q3EFG3_BRADI2.8e-2142.34Uncharacterized protein OS=Brachypodium distachyon GN=BRADI_4g05483 PE=4 SV=1[more]
A0A167ENS6_9ASCO2.2e-1842.58Uncharacterized protein OS=Sugiyamaella lignohabitans GN=AWJ20_5257 PE=4 SV=1[more]
A0A151GYX6_TOXGO2.2e-1852.54Uncharacterized protein OS=Toxoplasma gondii TgCatPRC2 GN=TGPRC2_427510 PE=4 SV=... [more]
Q98MG7_RHILO1.4e-1743.11Hypothetical glycine-rich protein OS=Rhizobium loti (strain MAFF303099) GN=mlr05... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|573556340|gb|ETT55085.1|2.6e-2544.51hypothetical protein C162_03257 [Paenibacillus sp. FSL R7-269][more]
gi|944050800|gb|KQJ86438.1|4.0e-2142.34hypothetical protein BRADI_4g05483 [Brachypodium distachyon][more]
gi|992160821|gb|KXG23625.1|2.6e-2037.74hypothetical protein SORBI_008G119500 [Sorghum bicolor][more]
gi|992160820|gb|KXG23624.1|2.6e-2037.74hypothetical protein SORBI_008G119500 [Sorghum bicolor][more]
gi|522108205|ref|WP_020619414.1|3.3e-2046.75hypothetical protein [Paenibacillus daejeonensis][more]
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CmoCh09G001940CmoCh09G001940gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh09G001940.1CmoCh09G001940.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh09G001940.1.CDS.2CmoCh09G001940.1.CDS.2CDS
CmoCh09G001940.1.CDS.1CmoCh09G001940.1.CDS.1CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CmoCh09G001940.1.exon.2CmoCh09G001940.1.exon.2exon
CmoCh09G001940.1.exon.1CmoCh09G001940.1.exon.1exon