CmoCh02G012820.1 (mRNA) Cucurbita moschata (Rifu) | Cucurbit Genomics Database (CuGenDB)

Overview


Name	CmoCh02G012820.1
Type	mRNA
Organism	Cucurbita moschata (Cucurbita moschata (Rifu))
Description	Unknown protein
Location	Cmo_Chr02 : 7645081 .. 7647600 (+)
Sequence length	2520

Genome Viewer

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAACTCGAAGATGATTTGATGTTACCTATCAAAAACCCTGAACTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCATCATCACAATACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGTCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCGCCACCGTCTCCTTATGTTTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCGTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCCCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCTCCCTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTACGTCTATAACTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTCTACAAGTCCCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCTCCCCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCACCACCACCATCTCCTTACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCCCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACATCTATAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCTCCACCACCACCTTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATGTATAAATCTCCGCCACCCCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAATCTCCACCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCGCCACCCCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCACCACCACCCTATGTCTATAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCACCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCTCCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCACCACCTTATTACTACAAATCACCTCCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAG

mRNA sequence

ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAACTCGAAGATGATTTGATGTTACCTATCAAAAACCCTGAACTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCATCATCACAATACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGTCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCGCCACCGTCTCCTTATGTTTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCGTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCCCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCTCCCTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTACGTCTATAACTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTCTACAAGTCCCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCTCCCCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCACCACCACCATCTCCTTACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCCCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACATCTATAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCTCCACCACCACCTTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATGTATAAATCTCCGCCACCCCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAATCTCCACCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCGCCACCCCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCACCACCACCCTATGTCTATAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCACCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCTCCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCACCACCTTATTACTACAAATCACCTCCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGGGCTATGAAGCCTTTGAGGCATTGGCCTCAGCTGCTCTCGGTGGTGGCGATTTGCCTCATTGCCACCACCGTAGTGACTGCTCAACTCGAAGATGATTTGATGTTACCTATCAAAAACCCTGAACTCGGTGGTGATTTACCAAAGCATCATCATCACAATACTTATCCGCCGGTGGATCATCACCATAAACCACCACAGTCGAAGTATGGACACCACCACAAGTCACCACCTCCACCAAAATACAAGCACCACCACATGCCACCCCCACCCAAACATTACCACCACCACAAGTCACCACCTCCATATCTTTACAAGTCTCCGCCGCCACCGTCTCCTTATGTTTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCGTATGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCCCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCTCCCTATGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCCCCGCCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCTTACGTCTATAACTCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCTTATGTCTACAAGTCCCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATATCTACAAATCTCCGCCGCCGCCACCCTACGTTTACAAGTCTCCCCCACCACCTCCCTACATTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCACCACCACCATCTCCTTACGTTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCATATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCCCCGCCACCATCTCCTTATGCTTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCCCCCTATGTCTACAAGTCTCCACCACCCCCACCGTACGTTTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTTTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACATCTATAAGTCTCCTCCACCGCCACCCTACGTCTATAAATCTCCTCCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCTCCACCACCACCTTATGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCTCCACCACCTCCTTATGTCTACAAGTCTCCTCCACCACCTCCCTACATCTATAAATCTCCGCCGCCACCATCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTATAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACATGTATAAATCTCCGCCACCCCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAATCTCCACCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCGCCACCCCCTCCCTACGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACATCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCTTACGTCTACAAGTCTCCACCACCACCTCCCTATGTCTACAAGTCCCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAAATCTCCGCCACCACCTCCCTACGTCTACAAATCTCCTCCACCACCACCCTATGTCTATAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCACCACCGCCTCCCTACGTCTACAAGTCTCCTCCACCTCCATCTCCATCTCCTCCCCCACCTTATATCTATAAATCACCACCTCCACCATCTCCATCACCACCTCCTCCATATATTTACAAATCTCCGCCTCCACCATCTCCATCACCTCCTCCACCTTATTACTATAAGTCACCTCCACCTCCATCCCCATCACCACCACCACCTTACTATTACAAGTCCCCTCCCCCTCCAGTGAAGTCTCCACCACCTCCATATTATTATAAGTCTCCACCACCACCATCTCCATCACCACCACCACCTTATTACTACAAATCACCTCCTCCACCGCATAAATCCAAATATCCACACTAG

Homology

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN2_ARATH (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 272.3 bits (695), Expect = 1.7e-71
Identity = 451/782 (57.67%), Postives = 462/782 (59.08%), Query Frame = 1


Query: 79  PPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPP-PYLYKSPPP---PSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 138
           PPP Y     P P   Y   K+PP PY+  SPPP   P+P V    PPPPYVY SPPPP 
Sbjct: 31  PPPLYSS---PLPEVEY---KTPPLPYVDSSPPPTYTPAPEVEYKSPPPPYVYSSPPPPT 90

Query: 139 YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 198
           Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP 
Sbjct: 91  Y----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYNSPPPPY 150

Query: 199 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 258
           Y     P P   YKSPPPP YVY+SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP 
Sbjct: 151 Y----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPY 210

Query: 259 YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI------YKSPPPPPYIYKSPPPP----S 318
           Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y       YKSPPPP Y+Y SPPPP    S
Sbjct: 211 Y----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPYYSPS 270

Query: 319 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 378
           P V    PPPPYVY SPPPP Y       PSP      PPPPYVY SPPPP Y     P 
Sbjct: 271 PKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYY------SPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYY----SPS 330

Query: 379 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 438
           P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y     P 
Sbjct: 331 PKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPS 390

Query: 439 PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPP 498
           P   YKSPPPP Y+Y SPPPP Y     P P   YKSPPPP Y+Y SPPPP Y     P 
Sbjct: 391 PKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPTY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPS 450

Query: 499 PPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 558
           P   YKSPPPP YVY SPPPP Y       PSP VY   PPPPYVY SPPPP   Y SP 
Sbjct: 451 PKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPTY------SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPP---YYSPS 510

Query: 559 PPPYMYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 618
           P  Y YKSPPPP YVY SPPPP Y      P P VY   PPPPYVY SPPPP Y      
Sbjct: 511 PKVY-YKSPPPP-YVYSSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----S 570

Query: 619 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP-----PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV 678
           P P VY   PPPPYVY SPPPP     P VY   PPPPYVY SPPPP Y      P P V
Sbjct: 571 PSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKV 630

Query: 679 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 738
           +   PPPPYVY SPPPP Y      P P V+   PPPPYVY SPPPP Y      P P V
Sbjct: 631 HYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVHYKSPPPPYVYNSPPPPYY-----SPSPKV 690

Query: 739 YKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYK 798
           Y   PPPPYVY SPPPP  SP P   YKSPPPP       Y+Y SPPPP  SP P  YYK
Sbjct: 691 YYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP-------YVYSSPPPPYYSPSPKVYYK 706

Query: 799 SPPPPSPSPPPPYYYKSPPPP---VKSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPHKSK 839
           SPPPP  SP P  YYKSPP P   V  PPPP Y  SP     SPPPPY Y SPPPP+ S 
Sbjct: 751 SPPPPYYSPSPKVYYKSPPHPHVCVCPPPPPCYSPSPKVVYKSPPPPYVYNSPPPPYYSP 706

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN3_ARATH (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 189.5 bits (480), Expect = 1.5e-46
Identity = 282/462 (61.04%), Postives = 297/462 (64.29%), Query Frame = 1


Query: 68  QSKYGHHHKSPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVY 127
           QS   + + SPPPP     H  PP KHY    SPPP  +  PPP   Y YKSPPPP   Y
Sbjct: 24  QSTANYFYSSPPPPV---KHYTPPVKHY----SPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHY 83

Query: 128 KSPPPPPYIYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPP 187
            SPPP   +Y SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP   YVYKSPPPP
Sbjct: 84  -SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPP 143

Query: 188 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKS 247
              Y SPPP   VY SPPPP   YVYKSPPPP   Y+ PP    VY SPPPP   YVYKS
Sbjct: 144 VKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPP----VYHSPPPPKKHYVYKS 203

Query: 248 PPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP--Y 307
           PPPP   Y SPPP   VY SPPPP   Y+YKSPPPP   Y SPPP   +Y SPPPP   Y
Sbjct: 204 PPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHY 263

Query: 308 IYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPP 367
           +YKSPPPP  +   SPPP   VY SPPPP   Y+YKSPPPP    + SPPP   VY SPP
Sbjct: 264 VYKSPPPPVKHY--SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPP--VKHYSPPP---VYHSPP 323

Query: 368 PPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 427
           PP   YVYKSPPPP   Y SPPP   VY SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP   VY
Sbjct: 324 PPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VY 383

Query: 428 KSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPP 487
            SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP   +Y SPPPP   YVYKSPPPP   Y SPPP 
Sbjct: 384 HSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP---VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY-SPPP- 428

Query: 488 PYIYKSPPPPP--YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPP 506
             +Y SPPPP   YVYKSPPPPP  + SPP  PY+YKSPPPP
Sbjct: 444 --VYHSPPPPKEKYVYKSPPPPPVHHYSPPHHPYLYKSPPPP 428

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. Swiss-Prot
Match: LRX3_ARATH (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 5.9e-35
Identity = 243/434 (55.99%), Postives = 264/434 (60.83%), Query Frame = 1


Query: 121 PPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSP 180
           P PP V  +P PPP +  SPPPP  ++ +PP       SPPPP     SPPPP Y   SP
Sbjct: 394 PRPPVV--TPLPPPSL-PSPPPPAPIFSTPP----TLTSPPPP-----SPPPPVY---SP 453

Query: 181 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSP 240
           PPP      PPPPP VY  PPPPP     PPPPP VY+ PPPPP     PPPPP VY  P
Sbjct: 454 PPP------PPPPPPVYSPPPPPP-----PPPPPPVYSPPPPPP----PPPPPPPVYSPP 513

Query: 241 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSP 300
           PP P     PPPPP VY  PPPPP     PPPPP VY SPPPPP +Y SPPPPP    SP
Sbjct: 514 PPSP-----PPPPPPVYSPPPPPP-----PPPPPPVY-SPPPPP-VYSSPPPPP----SP 573

Query: 301 PPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 360
            P   Y  + PPPPP+   SPPPP +   SPPPP PY Y SPPPP   + SPPP      
Sbjct: 574 APTPVYCTRPPPPPPH---SPPPPQF---SPPPPEPYYYSSPPPP---HSSPPP-----H 633

Query: 361 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 420
           SPPPP     SPPPP Y Y SPPPPP    SPPP P VY  PPPPP +   PPPP   Y 
Sbjct: 634 SPPPP----HSPPPPIYPYLSPPPPPTPVSSPPPTP-VYSPPPPPPCIEPPPPPPCIEYS 693

Query: 421 SPPPPPYV-YKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV-YKSPPPPPYIYKSPPPPPYV 480
            PPPPP V Y SPPPPP  Y SPPPPP  Y SPPPPP V Y SPPPP   Y SPPP P  
Sbjct: 694 PPPPPPVVHYSSPPPPPVYYSSPPPPPVYYSSPPPPPPVHYSSPPPPEVHYHSPPPSPVH 753

Query: 481 YKSPPPPPY--IYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 540
           Y SPPPPP     +SPPP P V+ S PPPP ++ SPPP  P +++SPPPP   Y+ P PP
Sbjct: 754 YSSPPPPPSAPCEESPPPAPVVHHS-PPPPMVHHSPPP--PVIHQSPPPPSPEYEGPLPP 759

Query: 541 --PYVYKSPPPPPY 549
                Y SPPPPP+
Sbjct: 814 VIGVSYASPPPPPF 759

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN1_ARATH (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 5.9e-35
Identity = 246/418 (58.85%), Postives = 259/418 (61.96%), Query Frame = 1


Query: 83  YKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPP-----SPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 142
           Y +   PPP KHY    SPPP +YKSPPPP      P VYKSPPPP   Y SPPP   +Y
Sbjct: 21  YFYSSPPPPVKHY----SPPP-VYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHY-SPPP---VY 80

Query: 143 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 202
           KSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP  VYKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP   Y
Sbjct: 81  KSPPPPVKYY-SPPP---VYKSPPPP--VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPPVKHY 140

Query: 203 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPP------PYVYKSPPPPPYVYKSPP 262
            SPPP   VYKSPPPP   Y+ PP    VYKSPPPP      P VYKSPPPP   Y SPP
Sbjct: 141 -SPPP---VYKSPPPPVKHYSPPP----VYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYY-SPP 200

Query: 263 PPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPP-----SPY 322
           P   VYKSPPPP   Y SPPP   VYKSPPPP   Y SPPP   +YKSPPPP      P 
Sbjct: 201 P---VYKSPPPPVKHY-SPPP---VYKSPPPPVKYY-SPPP---VYKSPPPPVKHYSPPP 260

Query: 323 VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 382
           VYKSPPPP   Y SPPP   +YKSPPPP  Y+     PPP VY SPPPP +      PPP
Sbjct: 261 VYKSPPPPVKYY-SPPP---VYKSPPPPVHYS-----PPPVVYHSPPPPVHY----SPPP 320

Query: 383 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 442
            VY SPPPP +      PPP VY SPPPP +      PPP VY SPPPP +      PPP
Sbjct: 321 VVYHSPPPPVHY----SPPPVVYHSPPPPVHY----SPPPVVYHSPPPPVHY----SPPP 373

Query: 443 YVYKSPPPPP--YIYKSPPPP-----PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPY 478
            VY SPPPP   Y YKSPPPP     P VY SPPPP + Y SPP  PY+YKSPPPP Y
Sbjct: 381 VVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHYSPPTVYHSPPPPVHHY-SPPHQPYLYKSPPPPHY 373

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. Swiss-Prot
Match: EXTN_DAUCA (Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 8.2e-21
Identity = 178/336 (52.98%), Postives = 195/336 (58.04%), Query Frame = 1


Query: 75  HKSPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 134
           + SPPPP+    H PPPP+H      PPPY Y+SPPPP      SPPPP  VYK      
Sbjct: 36  YSSPPPPE----HSPPPPEH----SPPPPYHYESPPPPK----HSPPPPTPVYK------ 95

Query: 135 YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 194
             YKSPPPP +     PPPPY ++SPPPP +   SPPPP  VYK   PPP  +   P   
Sbjct: 96  --YKSPPPPMH----SPPPPYHFESPPPPKH---SPPPPTPVYKYKSPPPPKHSPAPVHH 155

Query: 195 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 254
           Y YKSPPPP  VYK   PPP  ++  P   Y YKSPPPP    K  P P + YK      
Sbjct: 156 YKYKSPPPPTPVYKYKSPPPPKHSPAPEHHYKYKSPPPP----KHFPAPEHHYK------ 215

Query: 255 YVYKSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPP 314
           Y YKSPPPP   Y YKSPPPP  VYK        YKSPPPP +   SP P   Y YKSPP
Sbjct: 216 YKYKSPPPPTPVYKYKSPPPPTPVYK--------YKSPPPPKH---SPAPVHHYKYKSPP 275

Query: 315 PPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSP-YAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKS 374
           PP  VYKSPPPP +   SPPPP+P Y YKSPPPP +   SPPPP  VYK        YKS
Sbjct: 276 PPTPVYKSPPPPEH---SPPPPTPVYKYKSPPPPMH---SPPPPTPVYK--------YKS 303

Query: 375 PPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPP 406
           PPPP +   SPPPP Y   SPPPP   Y Y SPPPP
Sbjct: 336 PPPPMH---SPPPPVY---SPPPPKHHYSYTSPPPP 303

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L0P1_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G291360 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 667.5 bits (1721), Expect = 2.1e-188
Identity = 584/859 (67.99%), Postives = 600/859 (69.85%), Query Frame = 1


Query: 1   MGAMKPLRHWPQLLSVVAICLIATTVVTAQLEDDLMLPIKNPELGGDLPKHHHHNTYPPV 60
           MG MKPLRHWPQLLS VA+CLI  +VV AQ  D L LPIK PELG DLPKH HH+ +PP 
Sbjct: 1   MGTMKPLRHWPQLLSAVAMCLITASVVAAQFNDAL-LPIKKPELGFDLPKHQHHSKFPP- 60

Query: 61  DHHHKPPQSKYGHHHKSPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPPSPYVYKSP 120
                    KY H H  PPP KY HHH PPPPK Y HHKSPP Y+YKSPPPPSPY+YKSP
Sbjct: 61  ---------KYHHRHTPPPPVKY-HHHKPPPPK-YKHHKSPPSYVYKSPPPPSPYIYKSP 120

Query: 121 PPPPYVYKSPP-----------PPPYIYKSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 180
           PPPPYVYKSPP           PPPY+YKSPPPP PY+YKSPPPPPYVY SPPPP     
Sbjct: 121 PPPPYVYKSPPPPSPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPSPYIYKSPPPPPYVYNSPPPP----S 180

Query: 181 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYK 240
             PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP   +VY SPPPP       PPPPYVY SPPPP     
Sbjct: 181 PSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP---HVYSSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----S 240

Query: 241 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 300
             PPPPYVYKSPPPP       PPPPYV  SPPPP       PPPPYVYKSPPPP     
Sbjct: 241 PSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----S 300

Query: 301 SPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP------PYIYKSPPPPSPYAYKSP 360
             PPPPY+YKSPPPPSP      PPPPYVYKSPPPP      PY+YKSPPPPSP      
Sbjct: 301 PSPPPPYVYKSPPPPSP-----SPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSP-----S 360

Query: 361 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSP 420
           PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP       
Sbjct: 361 PPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPS 420

Query: 421 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP-YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKS 480
           PPPPY+YKSPPPP       PPPPYV  SPPPPP Y+YKSPPPP       PPPPYVYKS
Sbjct: 421 PPPPYIYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKS 480

Query: 481 PPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYK 540
           PPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPPPY+YKSPPPPSP    
Sbjct: 481 PPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSP---- 540

Query: 541 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYMYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK 600
             PPPPYVY SPPPP     SP PPP         PYVYK+PPPP       PPPPYVYK
Sbjct: 541 -SPPPPYVYSSPPPP-----SPSPPP---------PYVYKTPPPP----SPSPPPPYVYK 600

Query: 601 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 660
           SPPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYV  SPPPP       PPPPYVYK
Sbjct: 601 SPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPP----SPSPPPPYVYK 660

Query: 661 SPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 720
           SPPPP       PPPPYVY SPPPP       PPPPYVY SPPPP       PPPPYVY 
Sbjct: 661 SPPPP----SPSPPPPYVYSSPPPP----SPSPPPPYVYSSPPPP----SPSPPPPYVYS 720

Query: 721 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPP--SPSPPPP 780
           SPPPP       PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPP  SPSPPPP
Sbjct: 721 SPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPPPSPSPPPP 730

Query: 781 YIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPSPS 839
           Y+YKSPPPPSPSPPPPY YKSPPPPSPSPPPPY YKSPPPP  SPPPPY YKSPPPPSPS
Sbjct: 781 YVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPS 730

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TrEMBL
Match: Q9C668_ARATH (Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.10 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 639.4 bits (1648), Expect = 6.0e-180
Identity = 403/458 (87.99%), Postives = 417/458 (91.05%), Query Frame = 1


Query: 104 YLYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 163
           Y Y  P PPS YVYK   PP ++Y SPPPPPY+Y SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 28  YTYSPPSPPS-YVYK---PPTHIYSSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPP 87

Query: 164 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPP 223
           PY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPP
Sbjct: 88  PYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPP 147

Query: 224 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPP 283
           PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 148 PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 207

Query: 284 PYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPP 343
           PY+YKSPPPPPY+Y SPPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PY Y SPP
Sbjct: 208 PYVYKSPPPPPYVYSSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSPP 267

Query: 344 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 403
           PPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPP
Sbjct: 268 PPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPP 327

Query: 404 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 463
           PPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPP PYVYKSPPPPPYVY SPP
Sbjct: 328 PPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPSPYVYKSPPPPPYVYSSPP 387

Query: 464 PPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSP 523
           PPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PYVY SP
Sbjct: 388 PPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSP 447

Query: 524 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP---YMYKSPPPPPY 559
           PPPPYVYKSP PPPYVYKSPPPPP   Y Y SPPPP Y
Sbjct: 448 PPPPYVYKSPSPPPYVYKSPPPPPSYSYSYSSPPPPIY 478

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TrEMBL
Match: D8TDP8_SELML (Putative uncharacterized protein OS=Selaginella moellendorffii GN=SELMODRAFT_449207 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 621.3 bits (1601), Expect = 1.7e-174
Identity = 448/575 (77.91%), Postives = 478/575 (83.13%), Query Frame = 1


Query: 103 PYLYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YIYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYK 162
           P++Y +P P S   Y SPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP Y YKSPPPP   Y YK
Sbjct: 419 PFIYATPEPSSVCFYTSPP---YEYKSPPPPTPVYHYASPPPPVYYYKSPPPPSPVYYYK 478

Query: 163 SPPPPP--YVYKSPPPPPYVYKSPPPPP--YVYKSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 222
           SPPPP   Y YKSPPPPPY YKSPPPPP  Y YKSPPPP PY YKSPPPPPY YKSPPPP
Sbjct: 479 SPPPPSPVYYYKSPPPPPYYYKSPPPPPPKYYYKSPPPPSPYYYKSPPPPPYYYKSPPPP 538

Query: 223 PYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP 282
           PY Y SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPP Y Y+SPPPP Y YKSPPPP
Sbjct: 539 PYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPVYKYESPPPPVYKYKSPPPP 598

Query: 283 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPP 342
            Y Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPP PY Y+SPPPPPY Y+SPPPP Y YKSPPP
Sbjct: 599 -YKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPP-PYKYESPPPPPYKYESPPPPVYKYKSPPP 658

Query: 343 PSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 402
           P PY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPP
Sbjct: 659 P-PYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPP 718

Query: 403 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPP 462
           PP Y YKSPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPP
Sbjct: 719 PPVYKYKSPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPP 778

Query: 463 PPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPP 522
           PPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPP Y Y+SPPPP Y YKS PPPPY YKSPP
Sbjct: 779 PPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPVYKYESPPPPVYKYKS-PPPPYYYKSPP 838

Query: 523 PPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYMYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSP 582
           PP PY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY YKSP
Sbjct: 839 PP-PYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYYYKSP 898

Query: 583 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSP 642
           PPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SPPPPPY Y+SP
Sbjct: 899 PPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESPPPPPYKYESP 958

Query: 643 PPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 669
           PPPPY YKSPPPP Y       PPYVYKSPPPP Y
Sbjct: 959 PPPPYYYKSPPPPEY-----QSPPYVYKSPPPPSY 980

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TrEMBL
Match: Q9C669_ARATH (Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.9 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 1.9e-141
Identity = 361/443 (81.49%), Postives = 374/443 (84.42%), Query Frame = 1


Query: 149 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 208
           SP P PY     P PPYVY SPPP  YVY SP PPPYVYK   PPPY+Y SPPPPPYVY 
Sbjct: 28  SPTPTPY----SPLPPYVYNSPPP--YVYNSPSPPPYVYK---PPPYIYSSPPPPPYVYS 87

Query: 209 SPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 268
           SPPPPPYVYNSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y 
Sbjct: 88  SPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYS 147

Query: 269 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 328
           SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPY+Y SPPPP PYVY+SPPPPPYVY SPPPPPY+Y
Sbjct: 148 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVY-SPPPPPPYVYQSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 207

Query: 329 KSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 388
           KSPPPP PY Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYV
Sbjct: 208 KSPPPP-PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYV 267

Query: 389 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV 448
           YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPY+Y SPPPPPYV
Sbjct: 268 YKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYV 327

Query: 449 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK-SPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 508
           YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYV   SPPP PY+YK   PPPYVYK   PPPY
Sbjct: 328 YKSPPPPPYVYTSPPPPPYVYKSPPPPPYVDSYSPPPAPYVYK---PPPYVYK---PPPY 387

Query: 509 IYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYK-SPPPPPYVYKSPPPPPYMYK-SPPPPPYVYKSPPP 568
           +Y   PPP+PYVYK   PPPYVY  SPPP PYVYK   PPPY+Y  SPPP PYVYK   P
Sbjct: 388 VYNYSPPPAPYVYK---PPPYVYSYSPPPAPYVYK---PPPYVYSYSPPPAPYVYK---P 443

Query: 569 PPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 589
           PPY+Y SP PPPY Y SP PP Y
Sbjct: 448 PPYVYSSPSPPPY-YSSPSPPLY 443

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TrEMBL
Match: M4D3G5_BRARP (Uncharacterized protein OS=Brassica rapa subsp. pekinensis PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 2.8e-137
Identity = 316/363 (87.05%), Postives = 326/363 (89.81%), Query Frame = 1


Query: 308 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 367
           Y  P PPPY Y  P  PPY+YKSP    PYAY SPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPY
Sbjct: 27  YSPPSPPPYAYSYPWLPPYVYKSP----PYAYSSPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPY 86

Query: 368 VYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 427
           VYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY
Sbjct: 87  VYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPY 146

Query: 428 VYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 487
           VYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPY
Sbjct: 147 VYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPY 206

Query: 488 IYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 547
           +YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 207 VYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPP 266

Query: 548 YMYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 607
           Y+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY+SPPPPPYVYKSPPPPPYVY+SPPPPP
Sbjct: 267 YVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYRSPPPPPYVYKSPPPPPYVYRSPPPPP 326

Query: 608 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPP 667
           YVYKSPPPPPYVY S PPPPYVYKSPPPPPYVY SPP P YIY SPPPP Y Y    PPP
Sbjct: 327 YVYKSPPPPPYVYSSAPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPSPSYIYSSPPPPSYSYSYSSPPP 384

Query: 668 YVY 671
            +Y
Sbjct: 387 PIY 384

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TAIR10
Match: AT1G26240.1 (AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 639.4 bits (1648), Expect = 3.1e-183
Identity = 403/458 (87.99%), Postives = 417/458 (91.05%), Query Frame = 1


Query: 104 YLYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 163
           Y Y  P PPS YVYK   PP ++Y SPPPPPY+Y SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 28  YTYSPPSPPS-YVYK---PPTHIYSSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPP 87

Query: 164 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPP 223
           PY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPP
Sbjct: 88  PYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPP 147

Query: 224 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPP 283
           PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 148 PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 207

Query: 284 PYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPP 343
           PY+YKSPPPPPY+Y SPPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PY Y SPP
Sbjct: 208 PYVYKSPPPPPYVYSSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSPP 267

Query: 344 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 403
           PPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPP
Sbjct: 268 PPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPP 327

Query: 404 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 463
           PPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPP PYVYKSPPPPPYVY SPP
Sbjct: 328 PPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPSPYVYKSPPPPPYVYSSPP 387

Query: 464 PPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSP 523
           PPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PYVY SP
Sbjct: 388 PPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSP 447

Query: 524 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP---YMYKSPPPPPY 559
           PPPPYVYKSP PPPYVYKSPPPPP   Y Y SPPPP Y
Sbjct: 448 PPPPYVYKSPSPPPYVYKSPPPPPSYSYSYSSPPPPIY 478

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TAIR10
Match: AT1G26250.1 (AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 9.6e-145
Identity = 361/443 (81.49%), Postives = 374/443 (84.42%), Query Frame = 1


Query: 149 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 208
           SP P PY     P PPYVY SPPP  YVY SP PPPYVYK   PPPY+Y SPPPPPYVY 
Sbjct: 28  SPTPTPY----SPLPPYVYNSPPP--YVYNSPSPPPYVYK---PPPYIYSSPPPPPYVYS 87

Query: 209 SPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 268
           SPPPPPYVYNSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y 
Sbjct: 88  SPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYS 147

Query: 269 SPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 328
           SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPY+Y SPPPP PYVY+SPPPPPYVY SPPPPPY+Y
Sbjct: 148 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVY-SPPPPPPYVYQSPPPPPYVYSSPPPPPYVY 207

Query: 329 KSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 388
           KSPPPP PY Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYV
Sbjct: 208 KSPPPP-PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYV 267

Query: 389 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV 448
           YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVY SPPPPPY+Y SPPPPPYV
Sbjct: 268 YKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYV 327

Query: 449 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK-SPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 508
           YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYV   SPPP PY+YK   PPPYVYK   PPPY
Sbjct: 328 YKSPPPPPYVYTSPPPPPYVYKSPPPPPYVDSYSPPPAPYVYK---PPPYVYK---PPPY 387

Query: 509 IYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYK-SPPPPPYVYKSPPPPPYMYK-SPPPPPYVYKSPPP 568
           +Y   PPP+PYVYK   PPPYVY  SPPP PYVYK   PPPY+Y  SPPP PYVYK   P
Sbjct: 388 VYNYSPPPAPYVYK---PPPYVYSYSPPPAPYVYK---PPPYVYSYSPPPAPYVYK---P 443

Query: 569 PPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 589
           PPY+Y SP PPPY Y SP PP Y
Sbjct: 448 PPYVYSSPSPPPY-YSSPSPPLY 443

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TAIR10
Match: AT1G23720.1 (AT1G23720.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 3.0e-90
Identity = 507/833 (60.86%), Postives = 524/833 (62.91%), Query Frame = 1


Query: 54  HNTYPPVDHHHKPPQSKYGHHHKSPPPPKYKHHHMPPPPKHYH------HHKSPPPYLYK 113
           +++ PP  +    P+  Y    KSPPPP    +  PPPP  Y       +   PPPY+Y 
Sbjct: 11  YSSPPPPLYDSPTPKVDY----KSPPPPYV--YSSPPPPLSYSPSPKVDYKSPPPPYVYS 70

Query: 114 SPPPP----SPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI------YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 173
           SPPPP    SP V    PPPPYVY SPPPP Y       YKSPPPP YVY SPPPP   Y
Sbjct: 71  SPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPP---Y 130

Query: 174 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV------YKSPPPPPYVYKSPPPPPYV----- 233
            SP P P  YKSPPPP YVY SPPPP Y       YKSPPPP YVY SPPPP Y      
Sbjct: 131 YSPSPKP-TYKSPPPP-YVYNSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPYYSPSPKV 190

Query: 234 -YKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 293
            YKSPPPP YVYNSPPPP   Y SP P P  YKSPPPP Y+Y SPPPP   Y SP P P 
Sbjct: 191 DYKSPPPP-YVYNSPPPP---YYSPSPKP-TYKSPPPP-YIYSSPPPP---YYSPSPKP- 250

Query: 294 IYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 353
           +YKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP  YVY SPPPP   Y SP P P
Sbjct: 251 VYKSPPPP-YVYSSPPPP---YYSPSPKP-AYKSPPPP--YVYSSPPPP---YYSPSPKP 310

Query: 354 YIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 413
            IYKSPPPP  Y Y SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP YVY  PPPP   Y SP P 
Sbjct: 311 -IYKSPPPP--YVYNSPPPP---YYSPSPKP-AYKSPPPP-YVYSFPPPP---YYSPSPK 370

Query: 414 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP 473
           P VYKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P 
Sbjct: 371 P-VYKSPPPP-YVYNSPPPP---YYSPSPKP-AYKSPPPP-YVYSSPPPP---YYSPSPK 430

Query: 474 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPP 533
           P  YKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P P VYKSPPPP YIY SPPPP   Y SP P 
Sbjct: 431 P-TYKSPPPP-YVYSSPPPP---YYSPSPKP-VYKSPPPP-YIYNSPPPP---YYSPSPK 490

Query: 534 PYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYMYKSPPPPPYVYKSPPP 593
           P  YKSPPPP  YVY SPPPP Y     P P   YKS PPP Y+Y SPPPP Y     P 
Sbjct: 491 PS-YKSPPPP--YVYSSPPPPYY----SPSPKLTYKSSPPP-YVYSSPPPPYY----SPS 550

Query: 594 PPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 653
           P  +YKSPPPP YVY SPPPP   Y SP P P  YKSPPPP YVY SPPPP Y     P 
Sbjct: 551 PKVVYKSPPPP-YVYSSPPPP---YYSPSPKPS-YKSPPPP-YVYNSPPPPYY----SPS 610

Query: 654 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSP------PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV 713
           P  +YKSPP P +V   PPPPP    SP      PP PYVY SPPPPPY   SP P    
Sbjct: 611 PKVIYKSPPHP-HVCVCPPPPPCYSHSPKIEYKSPPTPYVYHSPPPPPYYSPSPKP---A 670

Query: 714 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPS 773
           YKS PPP YVY SPPPP   Y SP P P VYKSPPP PYVY S PPPPY   SP P   S
Sbjct: 671 YKSSPPP-YVYSSPPPP---YYSPAPKP-VYKSPPP-PYVYNS-PPPPYYSPSPKPTYKS 730

Query: 774 PPPPYIYKSPPPP--SP-------SPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPP--SPSP 833
           PPPPY+Y SPPPP  SP       SPPPPY+Y SPPPP  SP P   YKSPPPP    SP
Sbjct: 731 PPPPYVYSSPPPPYYSPTPKPTYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYVYSSP 746

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TAIR10
Match: AT4G08380.1 (AT4G08380.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 300.8 bits (769), Expect = 2.6e-81
Identity = 331/514 (64.40%), Postives = 342/514 (66.54%), Query Frame = 1


Query: 255 YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPP 314
           Y Y  P PPPY+Y SPPP  Y   SPPP PY+YKSPP   Y+Y SPPP   Y Y SPPP 
Sbjct: 28  YPYSPPSPPPYVYSSPPPYTY---SPPPSPYVYKSPP---YVYSSPPP---YAY-SPPPS 87

Query: 315 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 374
           PYVYKSPP   Y+Y SPPP   YAY SPPP PYVYKSPP   YVY SPPP  Y   SPPP
Sbjct: 88  PYVYKSPP---YVYSSPPP---YAY-SPPPSPYVYKSPP---YVYSSPPPYAY---SPPP 147

Query: 375 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 434
            PYVYKSPP   YVY SPPP  YVY SPPP  Y Y    PPPY Y SPPP PYVYKSPP 
Sbjct: 148 SPYVYKSPP---YVYSSPPP--YVYSSPPP--YAYS---PPPYAY-SPPPSPYVYKSPP- 207

Query: 435 PPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPP 494
             Y+Y SPPP  Y   SPPP PYVYKSPP   Y+Y SPPP  Y Y    PPPY Y SPPP
Sbjct: 208 --YVYSSPPPYAY---SPPPSPYVYKSPP---YVYSSPPP--YAYS---PPPYAY-SPPP 267

Query: 495 PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYMYKSPP 554
            PYVYKSPP   Y+Y SPPP   Y Y SPPP PYVYKSPP   YVY SPPP  Y   SPP
Sbjct: 268 SPYVYKSPP---YVYSSPPP---YAY-SPPPSPYVYKSPP---YVYSSPPPYAY---SPP 327

Query: 555 PPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 614
           P PYVYKS   PPY+Y S  PPPY Y SPPP PYVYKS   PPYVY S  PPPY Y SPP
Sbjct: 328 PSPYVYKS---PPYVYSS--PPPYAY-SPPPSPYVYKS---PPYVYSS--PPPYAY-SPP 387

Query: 615 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 674
           P PYVYKS   PPYVY S  PPPY Y SPPP PY+YKS   PPYVY S  PPPY Y SPP
Sbjct: 388 PSPYVYKS---PPYVYSS--PPPYAY-SPPPSPYVYKS---PPYVYSS--PPPYAY-SPP 435

Query: 675 PPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 734
           P PYVYKS   PPYVY S  PPPY Y    PPPY Y  PPP P VYK   PPPYVY S  
Sbjct: 448 PSPYVYKS---PPYVYSS--PPPYTYS---PPPYAYSPPPPCPDVYK---PPPYVYSS-- 435

Query: 735 PPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPP 769
                 PPPY+Y +PPP SP P P Y Y SPPPP
Sbjct: 508 ------PPPYVY-NPPPSSPPPSPSYSYSSPPPP 435

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TAIR10
Match: AT3G54580.1 (AT3G54580.1 Proline-rich extensin-like family protein)

HSP 1 Score: 285.0 bits (728), Expect = 1.5e-76
Identity = 474/858 (55.24%), Postives = 490/858 (57.11%), Query Frame = 1


Query: 49  PKHHHHNTYPPVDHHHKPPQSKYGH---HHKSPPPPKYKHHHMPPP---PKHYHHHKSPP 108
           PK  + +  PP  +   PP +        +KSPPPP Y +   PPP   P     +KSPP
Sbjct: 164 PKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPP 223

Query: 109 P-YLYKSPPPP----SPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 168
           P Y+Y SPPPP    SP V    PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY
Sbjct: 224 PPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYY----SPSPKVEYKSPPPP-YVY 283

Query: 169 KSPPPPPYV------YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP 228
            SPPPP Y       YKSPPPP YVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPP
Sbjct: 284 SSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPPYY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPP 343

Query: 229 PPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV------YKSPPPPPYVYKSPPPPPY 288
           PP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP Y       YKSPPPP YVY SPPPP Y
Sbjct: 344 PPTY----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPTYSPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPTY 403

Query: 289 IYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 348
                P P   YKSPPPP Y+Y SPPPP Y       PSP V    PPPPYVY SPPPP 
Sbjct: 404 ----SPSPKVEYKSPPPP-YVYSSPPPPTY------SPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPY 463

Query: 349 YIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 408
           Y       PSP      PPPPYVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP YVY SPPPP
Sbjct: 464 Y------SPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTY----SPSPKVDYKSPPPP-YVYSSPPPP 523

Query: 409 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP-----PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 468
            Y      P P VY   PPPPYVY SPPPP     P VY   PPPPYVY SPPPP   Y 
Sbjct: 524 YY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPP---YY 583

Query: 469 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK 528
           SP P  Y YKSPPPP Y      P P +Y   PPPPYVY SPPPP Y      P P VY 
Sbjct: 584 SPSPKVY-YKSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVYY 643

Query: 529 SPPPPPYIYKSPPPP----SPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYMYKSPPPP 588
             PPPPY+Y SPPPP    SP V    PPPPYVY SPPPP   Y SP P  Y YKSPPPP
Sbjct: 644 KSPPPPYVYSSPPPPYHSPSPKVQYKSPPPPYVYSSPPPP---YYSPSPKVY-YKSPPPP 703

Query: 589 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 648
            YVY SPPPP Y      P P VY   PPPPYVY SPPPP Y      P P VY   PP 
Sbjct: 704 -YVYSSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYY-----SPSPKVYYKSPPH 763

Query: 649 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 708
           P+V   PPPPP      P P  VYKSPPPP Y+Y SPPPP Y      P P VY   PPP
Sbjct: 764 PHVCVCPPPPPCY---SPSPKVVYKSPPPP-YVYSSPPPPHY-----SPSPKVYYKSPPP 823

Query: 709 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 768
           PYVY SPPPP Y     P P   YKSPPPP Y      P P V+   PPPPYVY SPPPP
Sbjct: 824 PYVYSSPPPPYY----SPSPKVHYKSPPPPYYA-----PTPKVHYKSPPPPYVYSSPPPP 883

Query: 769 SPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPP----PSP-----SPPPPYYYKSPPP---- 828
             SP P   YKSPPP       PY+Y SPPP    PSP     SPPPPY Y SPPP    
Sbjct: 884 YYSPSPKVHYKSPPP-------PYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYS 922

Query: 829 PSP-----SPPPPYYYKSPPPP---------VKSPPPPYYYKSPPP----PSP-----SP 839
           PSP     SPPPPY Y SPPPP          KSPPPPY Y SPPP    PSP     SP
Sbjct: 944 PSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPVVDYKSP 922

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. NCBI nr
Match: gi|727421422|ref|XP_010436500.1| (PREDICTED: extensin-2-like [Camelina sativa])

HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 4.3e-195
Identity = 443/509 (87.03%), Postives = 456/509 (89.59%), Query Frame = 1


Query: 100 SPPPYLYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKS 159
           SPPPY+Y SP PP PYVY SPP  PYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY S
Sbjct: 34  SPPPYIYNSPSPPPPYVYNSPPYAPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSS 93

Query: 160 PPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNS 219
           PPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY+S
Sbjct: 94  PPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPLPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSS 153

Query: 220 PPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKS 279
           PPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPP PY+YKSPPPPPYVY S
Sbjct: 154 PPPLPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPLPYVYKSPPPPPYVYSS 213

Query: 280 PPPPPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAY 339
           PPPPPY+YKSPPPPPY+Y SPPP  PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PY Y
Sbjct: 214 PPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPP-LPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVY 273

Query: 340 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 399
            SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY
Sbjct: 274 SSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 333

Query: 400 KSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 459
            SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY
Sbjct: 334 SSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 393

Query: 460 KSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYV 519
            SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PYV
Sbjct: 394 SSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYV 453

Query: 520 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYMYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYV 579
           Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY S   PPY+YK PPPPPYVY S   PPY+YK PPPPPY 
Sbjct: 454 YSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSS---PPYVYKPPPPPPYVYSS---PPYVYK-PPPPPYT 513

Query: 580 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPY 609
           Y S   PPYVY SPPPP Y Y SPPPP Y
Sbjct: 514 YSS---PPYVYTSPPPPSYSYSSPPPPKY 529

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. NCBI nr
Match: gi|778697644|ref|XP_011654367.1| (PREDICTED: extensin-2-like [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 683.7 bits (1763), Expect = 4.0e-193
Identity = 592/865 (68.44%), Postives = 609/865 (70.40%), Query Frame = 1


Query: 1   MGAMKPLRHWPQLLSVVAICLIATTVVTAQLEDDLMLPIKNPELGGDLPKHHHHNTYPPV 60
           MG MKPLRHWPQLLS VA+CLI  +VV AQ  D L LPIK PELG DLPKH HH+ +PP 
Sbjct: 1   MGTMKPLRHWPQLLSAVAMCLITASVVAAQFNDAL-LPIKKPELGFDLPKHQHHSKFPP- 60

Query: 61  DHHHKPPQSKYGHHHKSPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPPSPYVYKSP 120
                    KY H H  PPP KY HHH PPPPK Y HHKSPP Y+YKSPPPPSPY+YKSP
Sbjct: 61  ---------KYHHRHTPPPPVKY-HHHKPPPPK-YKHHKSPPSYVYKSPPPPSPYIYKSP 120

Query: 121 PPPPYVYKSP-----------PPPPYIYKSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 180
           PPPPYVYKSP           PPPPY+YKSPPPP PY+YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVY 
Sbjct: 121 PPPPYVYKSPPPPSPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPSPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYS 180

Query: 181 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYK 240
           SPPPP       PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP   +VY SPPPP    +  PPPPYVYK
Sbjct: 181 SPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP---HVYSSPPPP----SPSPPPPYVYK 240

Query: 241 SPPPP------PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPP 300
           SPPPP      PYVYKSPPPP       PPPPYV  SPPPP       PPPPYVYKSPPP
Sbjct: 241 SPPPPSPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPP 300

Query: 301 PPYIYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP------PYIYKSPPPPSP 360
           P       PPPPY+YKSPPPPSP      PPPPYVYKSPPPP      PY+YKSPPPPSP
Sbjct: 301 P----SPSPPPPYVYKSPPPPSP-----SPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSP 360

Query: 361 YAYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 420
                 PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP 
Sbjct: 361 -----SPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP- 420

Query: 421 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP-YIYKSPPPPPYVYKSPPPP 480
                 PPPPY+YKSPPPP       PPPPYV  SPPPPP Y+YKSPPPP       PPP
Sbjct: 421 ---SPSPPPPYIYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPPPPYVYKSPPPP----SPSPPP 480

Query: 481 PYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPP 540
           PYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPPPY+YKSPPPP
Sbjct: 481 PYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 540

Query: 541 SPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYMYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPP 600
           SP      PPPPYVY SPPPP     SP PPP         PYVYK+PPPP       PP
Sbjct: 541 SP-----SPPPPYVYSSPPPP-----SPSPPP---------PYVYKTPPPP----SPSPP 600

Query: 601 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 660
           PPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYV  SPPPP       PP
Sbjct: 601 PPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPP----SPSPP 660

Query: 661 PPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 720
           PPYVYKSPPPP       PPPPYVY SPPPP       PPPPYVY SPPPP       PP
Sbjct: 661 PPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYSSPPPP----SPSPPPPYVYSSPPPP----SPSPP 720

Query: 721 PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPP--S 780
           PPYVY SPPPP       PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPP  S
Sbjct: 721 PPYVYSSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPPPS 740

Query: 781 PSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSP 839
           PSPPPPY+YKSPPPPSPSPPPPY YKSPPPPSPSPPPPY YKSPPPP  SPPPPY YKSP
Sbjct: 781 PSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSP 740

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. NCBI nr
Match: gi|700199014|gb|KGN54172.1| (hypothetical protein Csa_4G291360 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 667.5 bits (1721), Expect = 3.0e-188
Identity = 584/859 (67.99%), Postives = 600/859 (69.85%), Query Frame = 1


Query: 1   MGAMKPLRHWPQLLSVVAICLIATTVVTAQLEDDLMLPIKNPELGGDLPKHHHHNTYPPV 60
           MG MKPLRHWPQLLS VA+CLI  +VV AQ  D L LPIK PELG DLPKH HH+ +PP 
Sbjct: 1   MGTMKPLRHWPQLLSAVAMCLITASVVAAQFNDAL-LPIKKPELGFDLPKHQHHSKFPP- 60

Query: 61  DHHHKPPQSKYGHHHKSPPPPKYKHHHMPPPPKHYHHHKSPPPYLYKSPPPPSPYVYKSP 120
                    KY H H  PPP KY HHH PPPPK Y HHKSPP Y+YKSPPPPSPY+YKSP
Sbjct: 61  ---------KYHHRHTPPPPVKY-HHHKPPPPK-YKHHKSPPSYVYKSPPPPSPYIYKSP 120

Query: 121 PPPPYVYKSPP-----------PPPYIYKSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 180
           PPPPYVYKSPP           PPPY+YKSPPPP PY+YKSPPPPPYVY SPPPP     
Sbjct: 121 PPPPYVYKSPPPPSPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPSPYIYKSPPPPPYVYNSPPPP----S 180

Query: 181 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYK 240
             PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP   +VY SPPPP       PPPPYVY SPPPP     
Sbjct: 181 PSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPP---HVYSSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----S 240

Query: 241 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYK 300
             PPPPYVYKSPPPP       PPPPYV  SPPPP       PPPPYVYKSPPPP     
Sbjct: 241 PSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----S 300

Query: 301 SPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP------PYIYKSPPPPSPYAYKSP 360
             PPPPY+YKSPPPPSP      PPPPYVYKSPPPP      PY+YKSPPPPSP      
Sbjct: 301 PSPPPPYVYKSPPPPSP-----SPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSP-----S 360

Query: 361 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSP 420
           PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPP       
Sbjct: 361 PPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPS 420

Query: 421 PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP-YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKS 480
           PPPPY+YKSPPPP       PPPPYV  SPPPPP Y+YKSPPPP       PPPPYVYKS
Sbjct: 421 PPPPYIYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKS 480

Query: 481 PPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYK 540
           PPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYVYKSPPPPPY+YKSPPPPSP    
Sbjct: 481 PPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSP---- 540

Query: 541 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYMYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYK 600
             PPPPYVY SPPPP     SP PPP         PYVYK+PPPP       PPPPYVYK
Sbjct: 541 -SPPPPYVYSSPPPP-----SPSPPP---------PYVYKTPPPP----SPSPPPPYVYK 600

Query: 601 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 660
           SPPPP       PPPPYVYKSPPPP       PPPPYV  SPPPP       PPPPYVYK
Sbjct: 601 SPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPP----SPSPPPPYVSSSPPPP----SPSPPPPYVYK 660

Query: 661 SPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYK 720
           SPPPP       PPPPYVY SPPPP       PPPPYVY SPPPP       PPPPYVY 
Sbjct: 661 SPPPP----SPSPPPPYVYSSPPPP----SPSPPPPYVYSSPPPP----SPSPPPPYVYS 720

Query: 721 SPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPP--SPSPPPP 780
           SPPPP       PPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPP  SPSPPPP
Sbjct: 721 SPPPP----SPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPPPSPSPPPP 730

Query: 781 YIYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPVKSPPPPYYYKSPPPPSPS 839
           Y+YKSPPPPSPSPPPPY YKSPPPPSPSPPPPY YKSPPPP  SPPPPY YKSPPPPSPS
Sbjct: 781 YVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPS 730

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. NCBI nr
Match: gi|923686284|ref|XP_013655185.1| (PREDICTED: extensin-2-like isoform X1 [Brassica napus])

HSP 1 Score: 664.8 bits (1714), Expect = 1.9e-187
Identity = 420/474 (88.61%), Postives = 432/474 (91.14%), Query Frame = 1


Query: 177 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYV 236
           Y  P PPPY Y SP  PPYVYKSPP PPYVY SPPPPPYVYNSPPPPPYVY SPPPPPYV
Sbjct: 27  YSPPSPPPYAYSSPWLPPYVYKSPPLPPYVYNSPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYV 86

Query: 237 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYI 296
           YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPY+
Sbjct: 87  YKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYV 146

Query: 297 YKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPPYVYKSPPPPP 356
           YKSPPPP PYVY SPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PY YKSPPPPPYVYKSPPPPP
Sbjct: 147 YKSPPPP-PYVYSSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 206

Query: 357 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 416
           YVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYV+KSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPP
Sbjct: 207 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVHKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPP 266

Query: 417 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPP 476
           YVY SPPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPP
Sbjct: 267 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPP 326

Query: 477 YVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 536
           YVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PYVY SPPPPPYVYKSPPPP
Sbjct: 327 YVYPSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSPPPPPYVYKSPPPP 386

Query: 537 PYVYKSPPPPPYMYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 596
           PYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPP
Sbjct: 387 PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP 446

Query: 597 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIY 651
           PYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPP Y+Y SPPPP Y Y    PPP IY
Sbjct: 447 PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPSYIYSSPPPPSYSYSYSSPPPPIY 497

[Close]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. NCBI nr
Match: gi|923686169|ref|XP_013655155.1| (PREDICTED: extensin-2-like [Brassica napus])

HSP 1 Score: 662.5 bits (1708), Expect = 9.6e-187
Identity = 420/485 (86.60%), Postives = 434/485 (89.48%), Query Frame = 1


Query: 227 YKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYI 286
           Y  P PPPY Y  P  PPYVYKSPP   Y Y SPPPPPY+Y SPPPPPYVY SPPPPPY+
Sbjct: 27  YSPPSPPPYAYSYPWLPPYVYKSPP---YAYSSPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYV 86

Query: 287 YKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYAYKSPPPPP 346
           YKSPPPPPY+Y SPPPP PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PY Y SPPPPP
Sbjct: 87  YKSPPPPPYVYSSPPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYPSPPPPP 146

Query: 347 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 406
           Y+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 147 YIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPP 206

Query: 407 YVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPP 466
           YVYKSPPPPPYVY  PPPPPYVYKSPPPPPY+Y SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPPP
Sbjct: 207 YVYKSPPPPPYVYSQPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYPSPPPPP 266

Query: 467 YIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPSPYVYKSPPPP 526
           YIYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPP PYVY SPPPP
Sbjct: 267 YIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP-PYVYSSPPPP 326

Query: 527 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYMYKSPPPPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPP 586
           PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 327 PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 386

Query: 587 PYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPP 646
           PYVYKSPPPPPYVY SPPPPPY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPPPPYVY SPPPP
Sbjct: 387 PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPP 446

Query: 647 PYIYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP-PPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPP 706
           PY+YKSPPPPPYVY SPPPPPYVYKSPPP PPYVY SPP P Y+Y SPPPP Y Y    P
Sbjct: 447 PYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPAPPYVYNSPPSPSYIYSSPPPPSYSYSYSSP 506

Query: 707 PPYVY 711
           PP +Y
Sbjct: 507 PPPIY 506

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
EXTN2_ARATH	1.7e-71	57.67	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]
EXTN3_ARATH	1.5e-46	61.04	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT3 PE=2 SV=3	[more]
LRX3_ARATH	5.9e-35	55.99	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=LRX3 PE=1...	[more]
EXTN1_ARATH	5.9e-35	58.85	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
EXTN_DAUCA	8.2e-21	52.98	Extensin OS=Daucus carota PE=2 SV=1	[more]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0L0P1_CUCSA	2.1e-188	67.99	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G291360 PE=4 SV=1	[more]
Q9C668_ARATH	6.0e-180	87.99	Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.10 P...	[more]
D8TDP8_SELML	1.7e-174	77.91	Putative uncharacterized protein OS=Selaginella moellendorffii GN=SELMODRAFT_449...	[more]
Q9C669_ARATH	1.9e-141	81.49	Proline-rich extensin-like family protein OS=Arabidopsis thaliana GN=F28B23.9 PE...	[more]
M4D3G5_BRARP	2.8e-137	87.05	Uncharacterized protein OS=Brassica rapa subsp. pekinensis PE=4 SV=1	[more]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. TAIR10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G26240.1	3.1e-183	87.99	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G26250.1	9.6e-145	81.49	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G23720.1	3.0e-90	60.86	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT4G08380.1	2.6e-81	64.40	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G54580.1	1.5e-76	55.24	Proline-rich extensin-like family protein	[more]

BLAST of CmoCh02G012820.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
gi\|727421422\|ref\|XP_010436500.1\|	4.3e-195	87.03	PREDICTED: extensin-2-like [Camelina sativa]	[more]
gi\|778697644\|ref\|XP_011654367.1\|	4.0e-193	68.44	PREDICTED: extensin-2-like [Cucumis sativus]	[more]
gi\|700199014\|gb\|KGN54172.1\|	3.0e-188	67.99	hypothetical protein Csa_4G291360 [Cucumis sativus]	[more]
gi\|923686284\|ref\|XP_013655185.1\|	1.9e-187	88.61	PREDICTED: extensin-2-like isoform X1 [Brassica napus]	[more]
gi\|923686169\|ref\|XP_013655155.1\|	9.6e-187	86.60	PREDICTED: extensin-2-like [Brassica napus]	[more]

Annotated Terms

The following terms have been associated with this mRNA:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR006706	Extensin_dom

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0005199	structural constituent of cell wall

Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
GO:0009664	plant-type cell wall organization

GO Annotation

GO Assignments

This mRNA is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
biological_process	GO:0042546	cell wall biogenesis
cellular_component	GO:0005618	cell wall
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh02G012820	CmoCh02G012820	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh02G012820.1	CmoCh02G012820.1-protein	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh02G012820.1.exon.1	CmoCh02G012820.1.exon.1	exon

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Type
CmoCh02G012820.1.CDS.1	CmoCh02G012820.1.CDS.1	CDS

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata
Date Performed: 2017-05-19


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR006706	Extensin domain	PFAM	PF04554	Extensin_2	coord: 664..706 score: 2.8E-5coord: 544..586 score: 3.4E-5coord: 363..415 score: 2.7E-4coord: 131..183 score: 2.4E-4coord: 403..455 score: 2.6E-4coord: 171..213 score: 2.6E-5coord: 584..626 score: 2.7E-5coord: 443..485 score: 2.4E-5coord: 524..566 score: 1.9E-5coord: 624..666 score: 3.0E-5coord: 634..676 score: 5.1E-5coord: 86..143 score: 1.1E-5coord: 644..686 score: 3.6E-5coord: 343..385 score: 2.3E-5coord: 181..223 score: 4.7E-5coord: 261..303 score: 5.0E-5coord: 604..646 score: 2.7E-5coord: 221..263 score: 2.6E-5coord: 201..243 score: 3.0E-5coord: 483..526 score: 7.6E-6coord: 463..505 score: 2.8E-5coord: 503..546 score: 3.8E-6coord: 564..606 score: 3.