Cla97C01G011410.1 (mRNA) Watermelon (97103) v2

NameCla97C01G011410.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr01 : 19926239 .. 19931060 (-)
Sequence length603
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGGATGGTAAAGCTGAAATTGAAGTTAATCATGTGAATCTTTAGGTAAAAGCAGCGCTTACGGGATTGTTAAGCAATCTGGAGCAGCATGAAGTGATTTTGGAATAACTAGAGAACGAAGAAGAGTTAAGCCTTGAAATTTTGAGATAAGCTGTGAAACTCAATTCTCTACAAGTTTGTAGAAGGGAAGAAGTTCTAAATCCATCTGAATTTATGACTTTTAACAGATAGAAATAAGAACAAGAGGAAAGGAAGAAATCACAGTTGCAGGGTGCCGCTAAGAACCAAGTATCATTGCGCTGTTTAAGTACTGATAGCGAGACGAGTGTTGCTGAGACGCAAAGGAGTCTTCCGTCTCACAAAACTCGCTAGATATCGCTGGGTGTCGTTACTAAGGTAAGGTAACGCTAGTGTCGCTCAACCTAGTATCGCTAGTAACAGGTTCTGTTGGGTAGTACTGCTAGGAATCTCGCTTATGATGTTTGTTTCGGGAAAAGGGGAAGATTAAATGATAAGTAACAATTAGAATTTATGCATATTTAATGATCAAATGAAAGACAATGTAATGCAAGGTAAAATGTCTATTTCAGGCCAGGAAGAGATAGGGAAGGCGTATAACCCACGCAAGGCCTAGGAAGAGTAGTGAGTGACTCCTTTATTCTTCAATTCGATTTTTATTAAAAATGTTCTTATGAAATATGGTTTTGCGATGAACTGTTTAAAATGCATAATGTTTGATTGTATTACTCACAAGGCATGTTATATGTTTTCTAAAGTTGATAGAAAACATTTTCTTTTATGAAATGTTATTGAATAAAGATCTGTATGATTTTCTATGAAAGGATTTTCATATGAACTGTTATGTGAGTGGATTTCTAAAATGTTTTAGAGGAGGCTCAGTGCTCAAGGACACGAGAAGGCACGTGAGTTTCCCCAGGACCCAGTACTGAAGGACATGAGAAGGTACTTGGGCAACCTGTCATATTCCTATGTGCACATAAAGGTTGATTTGGCTGGTGCGTTGAGTTTGCTCCGCATTGAGCCAGGGATGATTTCGACATTAGATGTGTTGAGCCTTGCTCCAACCCCAACTAAGGTTGTTTTCGACGTTGAGAATGTTGAGCATTGCTCCGCCTCAACTAAGGGAAAAGTTTGAAAAACCAAACTGTTTACTGTTTAACTTCTTTTGGAAAACAATCATATACGATTTAAAATCGGATTCATGAGATTGATAGATTTGTGGAAAGTATGCTTTAGCTGAATAATATGTTAAATCCTCGTTTATTTGTTCATATGTAACATGTCTGTTTTCAATAAATGTTCGTTTTACAAAGATTAGTCACTCACTGGGCTGTTAGCTTATGTTTTCAATGTTTTCTTCCCCCCCCCCCCAAAGTAGCAAGGACGTTCCCAGTGCTTAGCCTACTTCAGCTCACCCTGCCTAAGTCTCGAGTTCTCAAAATTCAGTCACGTCTGAGAGTTGTACGTTATATAACCTTATGTAGGTGGCATGTAGATCTAGTTGTGTAAAGAGTGGGGATTGTAATGTAGTTTTGTACAAATGTACGGTGGATCTATGGAAGTTTAATTATGTTATGTGATAAAAGTGTACTCTGTGCAGGAAGAATTGTTATATTATGATCATGTGTAGTATGGCTGAGTTCTATGAATGTATATGTATGAAATGTGTGTACAGGAAGTTATGTAAGATGGGACAATATGCGTCACAAGAGGGGTGATGTTTATTGTCTTCACATTCCCTTTCAGGATAAGTAGGTAATCCGGGAGGGGGTGTGACACAAATAAATAGTTATCAAACAAATTTATGTTTCTGTTTCTTTTTTCCAAGAAATAGGAATAATTATAAAACATAGTCTTATTTCTTGTTTAAAAAAAAAAACAGGAAACAAGCAACAAGGAACGAGAAACAAGAAGCAAGAAACAAGAACATTATCAAACGGACGCTTAGCTTCTTGTTTTTCTTTTGCAAGTTCCACCTTGACCCTGAAAGAGAAAGCAGCCACTTAGAGAACCGAGAGTACCACCACCACTCAAAGATCCATGCACGAAACATTTCAAGGGAGAGTTTTTGTTCCTTTGTCTTTTCTTTAATGTGTTCTGATTAGAGATATATTGAGGAGAACGTATCATTTTAGGTTATGGTAGTTGGATATGCATGTCTAGCAAATCCTTGAGCACTTGAGCTTGGACCTTGTGGTTGGGTTTTAAGATGACGTTGCATGTTCTGTGATGATGACGACCGGTGATATTCTTTAGTTAATTTCTATTCGCATTAGTTTTTATTCATGAGAATGCATGCATGATTTTGGGTCAAATTAAAAAAAAAAAAAATTTCTTGAATCCCTTATAAATTTATTGAGTACACCAATGTATCATTAGTCTATCTAACATCAATCACACATTTTAACGATGAATTATTGGAATACATTTTTTTTTAAAAAAAAATCATTAGACTATAAGTTTAGTTTCCATTATGTGTTTTACCATTATTGCGAGTGACCCCTTTTTTTAATAGTACTTGTAATTAATTATCCAATCAAAATGATTATTTTATGATTAATTATCATATTAACATTATATAAGGTTACAAAATTAATTTTATCAAATAATTATAAACATAATTTGTTACTTTCAAATATTATAAATATTATAACAGGTACAACTTTTACTACAAGCAATCTTATTCCAAGACATGTTATCTGCATCCGTCATCCCACTGTCATTTTTCTCTTGTTCTTCTCTCTAGAAAAATTTATTTAATAATAATAGTAAGGGTAAATTGCAAAAATTACCCATGTATATGGTGCTAGTAACAATTAAACTACTAAACTTTCAAATTGAAAAATTAAACCTTCATACTATTAAAATTGTTAAAATTGAATCCCTAAACTTTCAAGTAAAAAAAATAAACCCTCAAACTTTAATAAAACAAGTTAAACCTTGAAACTCTTGAAAATTTAGGGGTTTAGGAGTTTAGGGGTTGTTTGGATTGAGGGAATTGGGATGGGAATGGAGAAGAGATACACATCCTTTTATTTGGTATATGTTTTGAAGTTTTAACATGGGAATGCATTCTATATACCCATGAAGGATACCATCCAAAAGGTGTGTGTTTTCTTAATGCCCACCCTCTATCCTCCTTTAATACATGGAGTTTATTTTTTTTATTTTATATATTATTAAAATTAATTAAAATTAATTAAAATATGAATATTAAATTTATACTTTAAAAAATTATAATAAATCAATTAATTAATCATATATATATACACACTTATTTTTTCAATAAACTTTAAATAATTGATGCATTAATACTATCAATTTATTAATAAATTATATATGTGGCTAATTAATATCATTATGATTAATATTTTACGAGACTATTTTGTAATAATTATAATTATTTTATCATTGATTAATTATAATTAATTAATTTTTAATCACAGAATGTTATGTTTGTTTTCTCAAACTAATTTTGATTGTTTTATTAATCAATACATCATAATTATATAAATTCATCAAATTGATACATCAAATTATGATTAAAGGTTGTTTTCAAATATAATAAAATGAGCCAAACTATTTACAAATATAGAAAAATTTCTATTTATCAGCGATAGATTATGATAGGTTTCTATCAATAAAGTGATAGAAGTCTATCGCGATTTATTATTATTGAAAATGAAAATTTTCTATATTTGTAAATAGTTTGATGTTTATCTATTTATAATAATTTTCCTAATTTTGATTATAAATTACTCATTTTACAAATACTTGTAATTAATATTTTAATTAATATTATTATTTGATTGTTAAATAATTAATTTTGCTTAAAACTTTGGATTGAATTTATTGTTCATCAACTAATTTATATAAAATTTTATAGAGGTGTTCATGATTAATTTTATAAATTGAATACAAAGATAATTTGTTTCAAAAATATTTTGATAATATTTCCATGTGCAATAAATTACAATTATTCTTGATAAATCTTATTCCTATACTTTTTATTTTGAGACATTCTTAATTTATAGACATCTATAAAATCTTAAACCGAACCATCCTTAATTGTGACTATTACCATGGTTGAAGGGTGTTGTTTGCAATTTACCCTAATAGTAATACTGTTAGAGCTAGCCCCCAAGTTAGTTTTCCCTCTTTCGGGTGCAAAAACCCTAAAATAATTTTCCCTCTTTTCAATTCATTCCTTTCTTTTCTTTCTTTTTGTTGCTCTCCACTCGTTTTTTCTTCTCCACTTCCTTCCTTCCTTCCCAGATCCAACATTCCGAGCTTTCTTCTCCTCCAGGTGAGCATCTTACTCCTCGTCAGTCAACTTTACCATTTCCCCCTTTTAATTCTTCCTTTTTTCTTTCTGGGGTTGTTGATCGGATCTTTTCTTTTCATTTCTCCGGGTTTCTCTATGCTTTAATCCAGAAATCAGAAATGTTTTCGGTAGATAATTAATTGTCTCCTTTTTCTGCCTTTGATCATCGTATAATTCTCTGTGTTTATCGATTTTTCTTTTTGATACATGGTTTTTGATTGCAGCTTGGAATTGTGGAAGCGCCTCTCTGATCATTTCCGGGTAAATTCGACTACTTAAAAGAGGGTTTTCTTGTTTAAAGTTCGAGGTCTGGGTCTCATGAGAATTTTTAGGGGAATGCAGAAATCGTTTTGCAAGGAGCAGCAGAAGGAGCTGGGCTGGAAGAATATTTTCTGCCGAGGGTTGGGTGTCACTGCTCCCAAAGCAAGAACTCGTGACAAACCCATGTCTACTGCCTTGTTCTTCACTCTCTGA

mRNA sequence

ATGAAGGATGGTAAAGCTGAAATTGAAGTTAATCATAGGAGGCTCAGTGCTCAAGGACACGAGAAGGCACGTGAGTTTCCCCAGGACCCAGTACTGAAGGACATGAGAAGGTACTTGGGCAACCTGTCATATTCCTATGTGCACATAAAGGTTGATTTGGCTGGTGCGTTGAGTTTGCTCCGCATTGAGCCAGGGATGATTTCGACATTAGATGTGTTGAGCCTTGCTCCAACCCCAACTAAGGTTGTTTTCGACGTTGAGAATGTTGAGCATTGCTCCGCCTCAACTAAGGGAAAAATCCAACATTCCGAGCTTTCTTCTCCTCCAGGTGAGCATCTTACTCCTCGTCAGTCAACTTTACCATTTCCCCCTTTTAATTCTTCCTTTTTTCTTTCTGGGGTTGTTGATCGGATCTTTTCTTTTCATTTCTCCGGCTTGGAATTGTGGAAGCGCCTCTCTGATCATTTCCGGAAATCGTTTTGCAAGGAGCAGCAGAAGGAGCTGGGCTGGAAGAATATTTTCTGCCGAGGGTTGGGTGTCACTGCTCCCAAAGCAAGAACTCGTGACAAACCCATGTCTACTGCCTTGTTCTTCACTCTCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGGATGGTAAAGCTGAAATTGAAGTTAATCATAGGAGGCTCAGTGCTCAAGGACACGAGAAGGCACGTGAGTTTCCCCAGGACCCAGTACTGAAGGACATGAGAAGGTACTTGGGCAACCTGTCATATTCCTATGTGCACATAAAGGTTGATTTGGCTGGTGCGTTGAGTTTGCTCCGCATTGAGCCAGGGATGATTTCGACATTAGATGTGTTGAGCCTTGCTCCAACCCCAACTAAGGTTGTTTTCGACGTTGAGAATGTTGAGCATTGCTCCGCCTCAACTAAGGGAAAAATCCAACATTCCGAGCTTTCTTCTCCTCCAGGTGAGCATCTTACTCCTCGTCAGTCAACTTTACCATTTCCCCCTTTTAATTCTTCCTTTTTTCTTTCTGGGGTTGTTGATCGGATCTTTTCTTTTCATTTCTCCGGCTTGGAATTGTGGAAGCGCCTCTCTGATCATTTCCGGAAATCGTTTTGCAAGGAGCAGCAGAAGGAGCTGGGCTGGAAGAATATTTTCTGCCGAGGGTTGGGTGTCACTGCTCCCAAAGCAAGAACTCGTGACAAACCCATGTCTACTGCCTTGTTCTTCACTCTCTGA

Protein sequence

MKDGKAEIEVNHRRLSAQGHEKAREFPQDPVLKDMRRYLGNLSYSYVHIKVDLAGALSLLRIEPGMISTLDVLSLAPTPTKVVFDVENVEHCSASTKGKIQHSELSSPPGEHLTPRQSTLPFPPFNSSFFLSGVVDRIFSFHFSGLELWKRLSDHFRKSFCKEQQKELGWKNIFCRGLGVTAPKARTRDKPMSTALFFTL
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Cla97C01G011410Cla97C01G011410gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C01G011410.1Cla97C01G011410.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C01G011410.1.CDS.5Cla97C01G011410.1.CDS.5CDS
Cla97C01G011410.1.CDS.4Cla97C01G011410.1.CDS.4CDS
Cla97C01G011410.1.CDS.3Cla97C01G011410.1.CDS.3CDS
Cla97C01G011410.1.CDS.2Cla97C01G011410.1.CDS.2CDS
Cla97C01G011410.1.CDS.1Cla97C01G011410.1.CDS.1CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C01G011410.1.exon.5Cla97C01G011410.1.exon.5exon
Cla97C01G011410.1.exon.4Cla97C01G011410.1.exon.4exon
Cla97C01G011410.1.exon.3Cla97C01G011410.1.exon.3exon
Cla97C01G011410.1.exon.2Cla97C01G011410.1.exon.2exon
Cla97C01G011410.1.exon.1Cla97C01G011410.1.exon.1exon


Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon 97103 v2
Date Performed: 2019-05-12
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 95..115