Cla97C01G008040.1 (mRNA) Watermelon (97103) v2

NameCla97C01G008040.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (97103) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCla97Chr01 : 8265004 .. 8272358 (-)
Sequence length225
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
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ATGGGTCACAGTGCCGTCGGAACTCGCACACCACAACCTGGTCGTTGTTTGTCTTTGGTGAGGGTTCTGTCTGATGCTACAGCCACCACGCGCAGCGCCTTGTCCCCGTCTGTAGATGCACCGTTGTCGGGCTGTCAGTTGCCGGAGTTCATTTTGGGGTAAGATTTAACTTTTTGAACCATCCATTAAGTGTTGGATCTGGTTTATTGATACTTGTTGCGTTTGATGGTAGATTGAAGGAATTTTAGAACCCTCATCATGATGTAGATTCGTTGTGTTTCCAACAAGGTTGGGTTGGCAATTTGGTGAGTTTTGAGTCATGGATTAATTTCAATTGCATACTGATTTTGGGAGTCGATCTTTAAGTCTTTATTTGGGCTTAGAGTTGACTAATTCATTGAGTTTGGACAGTGGTTTCTAGTGTGATTCAAGTTAGGTTGTGCGCAAATGTGGAGTGTTGAAGTTTATACTCACTTTTGGACTTAAATTTGGAGGTGATAGTTGGACCGTCACTCGTGGGAATATTGATTCGAGGTTTTTGTGAGATTTGGTTGCTTAGAAAGCTACTTGGACTTAATCACAAGGTAACCGGTTTACTACCGGTTCGCTCAAACCGGTGCACTAACTGCGCTATTTATGTTAAAGATTTGTGTATACTTTGTAAGCATGCATTCATTGACTAACTGAATTATCAAATTAATGTAATGTTATGGGTGTGTAGGGTGTCAATGAGCTTTTTGGGCATAAACATGATTTTTACGGTTCTGTGTATGAATTTTGTATGATTACTATGGTGGGTTTGAAGATATGATCATAATATGAAGTCTTTCGTGATCATGATGTTGGGTTGTGTACACACTATGACTGTGAACCTTCGGGATCACTACTTATGACTATGACTAGGTGTCTCATTAATTTTGAGAATTAAACATGCACTTTCTAAGAACCGAAAAGCAGAGGCATGACACTTACTTGTAGCTCAAAATTGAAGTAGTCTTCTCCAAGATTTTAATCACGAACACTTCATAATCAACCACAAGAGTCTTCCTCGTTATTTTCTGACCTTAGAACGGATTGTGGGATCCAAATCTTGATGAATTTTGAGCCAAATTGATAGAAAAATCAGTATTTGGAGAGTTTCGAGTGTTCTTGAATTTTCAGCAAAAATTCCACCGATTCTTCTTCTATATGAAGAAGAATCTTAGCTGAACACATCAGTCATGAAATTGACACTTAAATTGGTGATTTAGGGATTTGAAAAAGAGGTAGAAAGTGAGGAGGTGAGGTGAGCTTCAAAAGCTCCACCTCCTACTTCCATGCAAAAAGTGGTGATTATCCAATTTTCTATTTAATTAATTTAAAAAATTAATTAAATAATATTAATTTAATATTAAATATAGAATTAATTTAAATAATAATTAATTTAACAATTGAATTAATTATATTATATTAATATAAAATATTAGAATATTAAATTAATAATTCCTCCACTTGTCCTGAAAATTTTCGACCCGATGAATCTCTATTCATCTGATTGATATTTAAATATCCCAACTCTCCAATTTTGTTTAATTCTTAATTAAACGAACAAATCGTAAAATTTGCTCCTTAACCAAATTTGAACATTTTCAAATTCTTTCATCATACTATTCTAAGGTATAGTCCATGAGCTAATAAGGGGGCCTAATGGACATACAGATCATAAGCTCCAACGATCCAAAATTAACCAGCTAAACTTTTTTAACCAAGTTAATTAACATTCGTTAACTACCGGGACACTCCATTGTAGCCCAGTAGCTGCACTCTCCTTACTGTAGATATATTTCTGTCCACTTGATATAACCATGGTTAGTAAGTTGACCTTTCACAAGTTGTTCGTAACTACAGTTGGTTGAAAATTATCGTTTTAGTCCTGTAATTACTTCTTGTTCCTTAAGTCCCACTGATCCTCTAATGAACAATTGGTTTGTGGTCCAACCAACAAACCTAGTCCCTCTGTTCGACGAGATTTCCAAAGAAATTTGATTCATGGAATTTGAATTTCGTATTTGTATAAATTTTAGTGTTGTGAGTACAATCTCTAATATTTGATCCTTTGATTCTTTCTCTGGACAAAATAAACTAAAATACTTAGGTTTGTTGATTTTCTTGGACGATCGGCCTTTGGGCTTGATGATTTTCTTGGGTGATCGGTTTGCAAGCTTGTTGATCTTCTTGGGTAATCGATCTTTGGGCTTGATGATCTTCTTTGGTGATCGGCCTTTAGGCTTGTTGATATGCTTGGATGATCGGCCTTTAGACTTGTTGATATGCTTGGATCATCCAAGCATATCAACAAGCCTAAAGGCCGATCATCTGAATATTTTTTAAGCTTTTGCCTTTAAATCTTCAAGAAAATTATACTCTTCAGAGCTTTAGTCTTTTGATCTTCAAAGCTTCAAGAGTTTTGCATTCTTCGAAGCTTGTATTCTTCAGATCTTTTGAGCTGAGGGGTTGTGTTCTTCAGATATTTAGAGCTTCAATCTTTGGATTTTCGAATCTTTGGAGCTTCAGTCTTCAGAGTTTGATTAGAACTTTAAGAGGTCTTGGAATCTTCAGGATTTCGTCTTCAGAGCATTAGCCCTCCATTGTCGATGCTTCCCCCCAAATGAAGAGATAAAGCCTCTATTTATAAAGTTTCTATGGGCCTTCATGGGCTTGGACCCAATTGCTTTTGGGCCCAAAATTAGGGTTGGGATTGGGCTTAAGCCCAATATCTTCTTTGGCGCAAAAAAATTCACCATGAACTTGAATTGGGTTGGGCTTTTGACCCGAGCGACTTTACTTACTCGGCCCAATCTGATTTATAAATTCCACCACGCATTTGGACTTTGTTATGATGACGTGGCGAAATTTGGTTGACCGAAAATTTTCATTCAATACCCTCTCAGGTCAATGAAAGGGTGGGGCCCTTGTTCAAGATTTGGAGTTAGTACTTAAGAGAACAACTTCTCTACTAACTTTAAATAAGGTATAAGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGCAAGACTATGTCCCTAGCTATCTGACTAGTCTTATCCCTAAAATGGGGAACTTATTGAGTCGGCGAACTCGGGCCACTCTCACCCATGCAGATTAAAGGATAATCTCAAACAAACAAGAGTTCACAATTGACTCAGGATTAAGATCAAGTTACCTAGGTAAAAGTTGAAATAATTAGTTTTAACAATAAACAGTGTTATAAAGCAAAAGTGATTATTTTATAGTCTGGTCTTATGCATACTCATTGCATAAGATAACTCACTCACATGTCTCTACATGAACGATACATGATCACATGGTTTGTATCAACAAAATGGGTCTCATCCATAGTGTCCCCAGGATAAAGTACCTAACCTTATCCATACACAATAAACCGTTTTTTCTATTACTTAAACTCGGTCCACTTTTATGTCTACACATATAAAAGTCTAATAACCAAGAGTCTTAGTTTATTGGATTTAGAGAAGTGATATAAGCAATTCATATATTCAATAACGTTTTTATTGAATAAATCTCGATAACAACTTTATTGAGAATATGTTAAATGTTTACAAACCACGAGTTTTAAGTCATAAAACCCAACAATAATGTTGGTATAGGTTATTGCCCAATTTGATTATGAGTGTTCATACTTGTGGGTGTAGGTTATGACATCAATATTTTGGGCAATATTAATTGAGTTGGATAAGTTGTTGACATTGGAAAGGTAAAACCTTCTTTCATTATTATCATTGTCAATATTGATGTGTAGAGTTAGAACTCTAAAATCATTTTTTGTTCTCTTACTATGTTTTGCATTGGAGTAGTGAAGGCATGGAGAAATTGAAATGTTTATAAGATTTTTTGTAAGGTTAGTGGAAAAACTTTGAATGCAATGTACTTATTGTACCTAAATAGCTATAGATTCTTGTAAAACCTTCACCAATAGTAATTAGTCGATCTTTTTGTAAAAGTATTATCAACTTTATGATACTTATATTAAGGTATTTTATGGTTGTGTTATTATTCTTGGGTTTAATTAGAATTACTTGATTATGTAAATCATATGTTTCACACCCCAACCCAGATTTACTCTATACCTAGGAAGGAGCATGATCATATTTCCAACATAAGACTCTATAATGTAAACACCATAAAAGATTAACAAATCATACAACAATCTCATTATCTCATCACAGAAGAACGGGTAAACTTTTAATTACCATGTCTGTATACACATAATAAGTACAACACGTCCCCCTTTCACTACATTCTCATGAAAGATGTTTAGTACATGACATATGAACAATCTAAATATTTACAACTATCCCAGAGGTTCGCTTCCAGATAGGTCCAGACGAGATTCTTCAGTAGGCTAGGCGTCCTGGACACGCTCGCTACCTGAAACAACAAACAACAACAAACTGGATGAGCAAAAGGCTCAGTGAGTGACTAAATCTACTAAAACTAATCATGACAACTTGAATCCAGTTTATAAGATAGTAACCATCGCATAGCACATCCCAATGGACTATCAAAATTCACTTTTACACTATGCATATATAACTATCAAACTCTCATGTCTCACAAGCTTTCATCTATTTAGTGCTTTCACTTCCTGTCCCTCAGCACTTATTCATTTATAATTACTGTATCATGTGCCTTCACATGAAATCCCTCGGCACAGGTAACAAACTCTATCCATGCTCAAGTGCCTTCACTCATGATCCCTCGGCACGAGCTAGTGTGTGATGGATTACTACATGCCTTCACTTACAGTCCCTGAGCATTGTAGTCCATTTTCTACTGTTATTCAAGTGCCTTCTTAGATCCCTCAGCACTTAATTTCAAACTTACTCACATGTAGCTTTCACCATAAGGTCCCTCAGCCAATGTAGCTTTCACCATAAGGTCCCTCAGCCACTTATGTGTTTAGACATTTGTAATAATATTCTCTTAAATCACCAACACATCTCATACATAA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mRNA sequence

ATGGGTCACAGTGCCGTCGGAACTCGCACACCACAACCTGGTCGTTGTTTGTCTTTGGTGAGGGTTCTGTCTGATGCTACAGCCACCACGCGCAGCGCCTTGTCCCCGTCTGTAGATGCACCGTTGTCGGGCTGTCAGTTGCCGGAGTTCATTTTGGGTTTATTCATTATTCTCTACTCACATGGCGGCATCAATCCATTGGGGGCTAAGAAATCAGATTATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGTCACAGTGCCGTCGGAACTCGCACACCACAACCTGGTCGTTGTTTGTCTTTGGTGAGGGTTCTGTCTGATGCTACAGCCACCACGCGCAGCGCCTTGTCCCCGTCTGTAGATGCACCGTTGTCGGGCTGTCAGTTGCCGGAGTTCATTTTGGGTTTATTCATTATTCTCTACTCACATGGCGGCATCAATCCATTGGGGGCTAAGAAATCAGATTATTAG

Protein sequence

MGHSAVGTRTPQPGRCLSLVRVLSDATATTRSALSPSVDAPLSGCQLPEFILGLFIILYSHGGINPLGAKKSDY
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Cla97C01G008040Cla97C01G008040gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C01G008040.1.CDS.2Cla97C01G008040.1.CDS.2CDS
Cla97C01G008040.1.CDS.1Cla97C01G008040.1.CDS.1CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C01G008040.1.exon.2Cla97C01G008040.1.exon.2exon
Cla97C01G008040.1.exon.1Cla97C01G008040.1.exon.1exon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Cla97C01G008040.1Cla97C01G008040.1-proteinpolypeptide