ClCG11G002760.1 (mRNA) Watermelon (Charleston Gray)

Overview
NameClCG11G002760.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (Charleston Gray))
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr11 : 2940957 .. 2944451 (-)
Sequence length264
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGGCATGAAGAAAGCGACGACTTTTGAGATTGTGGACATCAAAATTGGAGAACCCGACTTGGGTTCTTTGCTGCTTGTTATAGCTAGTAAAAATTGTAGTGGGGGAAATGAAGTTTTGAAAGCAACAAATTTAGAAGTTAATTGAAAATGTATTCCATTAATTAATGATTTGAGTCAGTTTGTTCACAATGTTTGTCGGATCAAGGAAGATGAAGCAAAAAATTTGCAATGGATTTCTGGGTTGAATTTGTCGGTTTGTTCAACATGAAAGTACTTGCATAAACAGAGAAATTATTTTGTTTTCAGAATGCTGATACACACCAGATCATCATCTTGCACGGTGGACAACAATGGTGATGTTTGTCATAGGTGAGGGAGAATAAGGGCAAAAAGGAAAAGATAGAAGGAGAGAGAACACCTTACTAATTATATTAATATATTTGTCTCGTCATCAATGCTCAATCAACAACCTAACCCTCCACGTCATTTTCCGTTAGTCACTTAACGAAAAGTACATTTAAAACTATTTATCAAACTCAAAGACTAAAGTGACCATTTTAAAACCTTAGGGACCAAATTGACACTAAACCCTCAAATTTTGGGATACAAAAAAGTGTATTTTGCCCTATAAATTATAAGCGAACAACCATCCCGTATGTATGATCATCAAATAATGTTTGACTTTAACTTAATTAAAAATTTTCATTAGCTTTCAACTTTATTGTTTAGCATGCGGAGTTGACTTCATATATTTATAAAGTTCATATGTCTATTTCTAAAGTGCGTTAGTTTTGGATGCTAAGTCGAGTTCATAGGAACTCTTTCTAAAGTGTGCTAGTTCAGAGTACAGAGTAAAGTTCATATATTAAGAACATTTGGTGCAGTTTTTTATGAGATGAATAATCTATTTTTATGGTGATTATTTTTGTTTTTGGAAACCTTTTTATTCAATAAACCTACATATTTTTTAATAAACTATGGAATCACTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTAAATACAAATGTATTGTTGAGAGTTTTGAAAAATGGGGTTTAGGGTTTACTTTTGGTTCACGTTCATTTTTTTTTTTAAAAAAATATAAACAATCATTTTACAAATTTGTGCCTGTGACATTTCTAATTAAGTTGGACAAAATTATATAGGATTCATTGGTACAAAACAAATTTAAATTTATATTGCAAGTGAAATATCCTCCAAAATGTAATTATATTGTAATTACCCTATATTATATTATAGTATACAAAACAAATTTGAATTTATATTAATGGTCATATTACATGGTTGCCACAAAAAATATATAACAAAAAGTATTTAGTTTGTGTATATGCTAAAAATGTTTTTATTAATGTATAATTACTATAAATAATGACTTGAATATAAAAGATTATGAAACTAATAAAAAAAAATTGAATGAAAACTTGTTTTAAACTGTTTGTGTATATACTAAACCATTTATTGACATTTTATAATAATCGATATATGTATTTTTTAAATTAATGATTATTTTTAAGCTCTAAATTAAAATTTTATGGATGGTTTTATGTCACGAGCGTCAACAAAACTCAAATTTGAAGTAGTGATAATTTAAAACAATGGTCATCAGAGTTGGTGGAGGTGGTAACTATTGGAGGTCGCTAGAGTTGGTTGTTGATGGTGGTGGTCAGATGTGACTAGAGTTGGCCGCCACTTTTTTAAGTACATTACCCCCATTCGTGCAATTTGATTGCTCTACCTGATGTGTCAATTTGATTACAATGAAAGCTATGTCCTGTATAGTAGAGAATGCCAGAACCAAATCCACGTGCATTATTATGCCATAGAAGCTCAATTGATTTAAAAACACTTCTCAAATGATGGAGTACTCAAAGGATTGGTTGAGATTTTAGAGAGTATTGAGAGAGATTTCATAAGGCAGATGACACTGATACACCACTCTGCTCTGTTTACAAAACCCACATCTCTCTCTAACACAATGTGTCTCTTTTTCAAACATAACATACTCATCAATGAAACTTTAAAAACATATATATCAATCACTTAAAATGTGAAAATGAAATATGAAAAAAATATACAATTCATTTTGATGAAAATATGTATAAAATAATGAAAATGATTGAGATACAATTAACTGTGCTAACAAAAAAAATTTAAATAATTGTTGATTAGGTAAGACAAAATCAAATTAAAAATAGGGGGAGAAAAATTATGAGGAAGAGGTTGGTTCATTTTGAATCCATTCGTAAAGTAGTTATCAAAATCTAATTTGAATATTAAAAATAAATTTGATTCTTAAAAGAGGGCATAAATTACATGATGACGCTCATTTTCATTATGAAATCGAATTTGTTAGATTCTAATTTGATTAATCAAGCTCTCCAATTACACTGGATTTATGTCATGGTTATTAATGAAGCTCTCCTCCACTTACACTGTATTTATATCTTAGTTATTAATCAGACTCTCCACTTACACTGTATTTCATATTATTCCGGACATACAAACCAACTAAGGGCAAATAAGGTATTATCAAAATGTCACCCACGTGCCTTAGCTTGCACACAATTTGCTATATATCCAAACGAATTCTCATTTGTTGCTATCTTATCCAATTTCCCTTAAAATAATTACTATTTCTTTTTAAATCCTTAGTTTGGGTATTAAATTTTTAAAAATTTTGAGGGTATTGTGGTAAAACACACACTTATTTATTTAATTATTAACAATTACACAAGTTAGTAAATACAACTAAAAGCAGTTTTGTTATAGTTGAGCCCCTTGTTTCTGTAAGTTCGTAAACATAATCAAAAGTAGTCCATTTACTATTGCATTTTAATTACTTTATAATGTAATATAATTATGAGAGTTATAAATACACTATAAAAAAAGTGAAGAAGAAAAAAAAGTAATCCCAAGTTGAGAATAGTGTAAATGCAAAAGGAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAACCCTAAATAGAAATAGATATATATTCTCTTCTTATCTTCATATATCTCTCAAGATTCCTTCATTTTGGAATTTGTTTGGTTGAAAAAACTTGTCTTCCACGTGTTTGATGACATGTCAACCTAAATCCAACGTGGCTACAGCTACATTGAAATCCCATTCGTGGTTGGAGTGCACCATGAGGAGCCCCTCACTCTGGCTCGTGCCCACCTTGCGCCACAAACGAGCCCACTCATAAATCAATCCCTTCTCACCTTTTCATCTTGCCTATATATAAAGTACCAAAGACCACACCAAATAACCAAAATCTGATCAACAATAATTCCTCTCCTCTTTATTTTCTTGATCTAGACATCAAAATATCAACATGGTTCCCATTTCTAAATCATCTTTTGCTTTGTGGTTGAAGAACCTTGAAGGTGGGGAACATGGTTATTGCGATTATATTGCTCTCGTTTCAACGGTAGAAGGGGATGGTGACGACGATGACGACGGCTACGACTATGCTCCGGCTGCTTGA

mRNA sequence

ATGGGCATGAAGAAAGCGACGACTTTTGAGATTGTGGACATCAAAATTGGAGAACCCGACTTGGGTTCTTTGCTGCTTTTTGTTCACAATGTTTGTCGGATCAAGGAAGATGAAGCAAAAAATTTGCAATGGATTTCTGGGTTGAATTTGTCGAACCTTGAAGGTGGGGAACATGGTTATTGCGATTATATTGCTCTCGTTTCAACGGTAGAAGGGGATGGTGACGACGATGACGACGGCTACGACTATGCTCCGGCTGCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGCATGAAGAAAGCGACGACTTTTGAGATTGTGGACATCAAAATTGGAGAACCCGACTTGGGTTCTTTGCTGCTTTTTGTTCACAATGTTTGTCGGATCAAGGAAGATGAAGCAAAAAATTTGCAATGGATTTCTGGGTTGAATTTGTCGAACCTTGAAGGTGGGGAACATGGTTATTGCGATTATATTGCTCTCGTTTCAACGGTAGAAGGGGATGGTGACGACGATGACGACGGCTACGACTATGCTCCGGCTGCTTGA

Protein sequence

MGMKKATTFEIVDIKIGEPDLGSLLLFVHNVCRIKEDEAKNLQWISGLNLSNLEGGEHGYCDYIALVSTVEGDGDDDDDGYDYAPAA
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
ClCG11G002760ClCG11G002760gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG11G002760.1ClCG11G002760.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG11G002760.1.cds3ClCG11G002760.1.cds3CDS
ClCG11G002760.1.cds2ClCG11G002760.1.cds2CDS
ClCG11G002760.1.cds1ClCG11G002760.1.cds1CDS