ClCG05G008090.1 (mRNA) Watermelon (Charleston Gray)

Overview
NameClCG05G008090.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (Charleston Gray))
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr05 : 8702193 .. 8707881 (-)
Sequence length1191
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSthree_prime_UTR
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ATGAAGGGGACAAATATTTGTATGAAGAGTGAAATTCATAGTGATTGTGGGATGGAGTGCCTTGGCAAATTACTTTTAGGACGACAAATTTCTTTATCAATTGAGACCTACATCCGTGTGCCAGTTGAGTTATGTTCGATTTGGCTTTATCAACTATACTTGTTAAGGGTTATCTAAGGCAAGGTCCAAAGCCCACGGAGGGCCCAAGCCCAAAGGTACTGGAAGGAGGCATATAAAAATGTGCATCCTAAAAGGGAAAAGTTAGTGCCTCAAGGGTTTGACCTACCAACCAAGTCGGTAAATATATACCAATCAAAAAATATATGACTTACGCTCGATTTGACACCCTACAACCTTGAGCGCCATAAATAATCCAGACATTATCGATATTACACGTAACTAGAGGTGGTATCAGAGGAAGCGCTTATAAATAGTCTCATTCAACGACCCTAAAAGGGAGAATAGTAATCTCCAAAAGAGAGCCCTGCCCTCACTTCTTGTGTGCTTAGCTAAACTATACACTCCCTATACTAACTTAGACATTAGAGCTGTTTGTAGGCTCGGCACTACACCGATGTGAGGATCTCTTACGTAGGTCAACTCAAGAAGCGAGACCAAACCAAGAGAAGCAAGCTGAAGGTCAAGCCCATGAGGGGTCTGTAACAACAACAAACCCTACGAGATCCGAGCGCCAACAATACTCGTAATAGAATAAACATTTTATTCTATATTATTTTGATTCCTGAACATTTCGGTTGGAGTTCTTCTTTATTCATTTTCCAAATCAATTTTTTTTTCACATATTTTATTATTTAGTTCAATCAGAATTGCATATACATACCTCTTTGTTAACTATTTAGTTTTTCAAAATTAAGTTTTAAACACTACTCTTACCTATAAGTTCTTTTATTTTGGTTTTCACGATCTACTAAAGTTTTTAAAAAACCAAGCTAAATTACGAAAACTAAAAATAATAGTTTTTAAGGACTCAAATATAGCAAAACGAGTTAAACTATTTACAAATATATTAAAAATTTACTGTCTATCAACGATATACAATGATAGATTTCTATCACTTGTTCAGCGATGTATCGCGATAGAAGTCTATAGTGATATATCGCTGATAAACAGTGAACTTTTTCTATATATATGGGTAAATAGTTTAACATTTTTCTATATATAATAATTTTTTTTTAAAAAATTTGTTTTTATTTTTGAAATTTAATTAAAAATTTAGATGTTGCTTTAAGAAATGAGAAATCATAATAAAGAAATTAGAGAAAACAAACATAATTTTCGTAAATAGAAAATTTAAAACGAAATCTATAGTGATCGATTAAGAATGGACTGAAAGTGGGGTGTCATATATGAGTATAAAGCAATGTACATATACGTGTCATGTGTATATATATTTCTTGTAACACAAGATTGTATGAAAGTGGGGTTTAGAGCAGAAATTATTCAATTGTATTCCAAATTTTTTGAAAACATAAATATTTAGTGGTTATTAAGGTAGATTAACGCTCATATTTCTTTAAATGATACTGCCACATCGTTAAATAATTTTTCAACTTAGAACTGTGTTTCAAAGGACTTTTGAGAGCTCAATATTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAACAGATTCTCACTTTGGTAAACTTTACATAAATATGAGATGCATGTGAAGCTGCAGCTCTCAATGTCCCCATAAGTCTGTTTCTTTCAATTGAAAATCCCAATTTAAGCCAATATAAATGCACTCATGTGAATGTTGGATCCTTTCACAATACTATTCTGTTAACTTCAACAAAGTTGGTGATTCATAATAATTGAGGTGGGTTTGATAACCATTTTGTTTTTTAAATTTATGCTTATTTCTTTCTTTCCATCAATTATTGTATCACTTTTCTTTTAAAAAAAAAAAAATGTTGAACTTATAGTCAAATTCTAAAAACTAACGTAAATATATTTGAGAACTACTTTTTTTTTTTTTCCTCAAAACTTGGCTTGTTTTTTCTTTTTAAAAAAATGGCTTGATTTTTAAAAACGTTAGTAGTAGAGAGTGGATAACAAAACATAAAACCTTCAAAAGTATTGGAGCTTTGAGTTGATTATTATAGTTAGTGAATTGTAATAATATTTGTAGGTTATAATAGTACGTGTTGGAATGGATATTATTTTAGTCTAGGCCATAATAGTTTATATTTAGGGTGCATGCTGTTTTAGTTTGTGTAGGAAGTAGCAAACATTATCAAAGAGGAAAAGAGAAAATGCTTAGAAAATAGTAAATACTAAACAAAGAAGAATTTGAAATAGTAACACGATAGTTAATTGTAAGTTATAATAATTAGAAACACCAATAATTATCATTAGTTTCCCAAACATTGAATCAGATATAATAGTTCACTCCACCCACTTGTAGTTGGTGCCCCAAACACTCTCTTATTGATTTAAGTAGTGTTTATAAATCTTAATTTTAAAAATCTAAAATTAAATTGCTATCAAGCAGAGACTACTATTCTCTTAAAAGTTTTCCATTTGATAAACCAAATCAAACATAAAATATAAGAAAGCAAACTTTTTAAAAAGTAGTTTACTAGGAAAGTGTTTTCACTTAGCTACCAAATAGTTCTTAAATCAAATTGGGTTGTTGTACCAACTTTGCATGTGCAATATCCACGTTTTGCTTTTTAACTTGCACATGAGAGTTGTGGGAGTACCATCAAAACTTCGTATCAACCGAATAAAAAGAAGATTATGAGTATATATAAATAATAATAAACAACAAAAAAAAAAAAAATCAAAAACCAAAATTACAAGATCACTTATTATGTCGAAAGTGGACAATATCATACAATTGTATAGATTATAAAACACAAATTATGTCTAAAATCTCATGTTATGTACCATTCAAAATACACACAAAGTCTCAAGCTTTACCTTTGGCTTTAGTATATTGGTAAAGAACATAATGATAATTGATTCCCATGATATTGAAATATTGAGAAAGGTAAGCATGCAAAATAAAGAAGAAGGGGGAAAGAATAGGAATATGTCATTTTCTGAAATGGACTAATTGCTAAGTTTCTTCCCAGCAATATTAGCTGTTTGATTACAACTTTTATCTGTCTTTACAAAACAAATAGCATCAATATCTCCTTTATATATACCAATGGCTAATGCTCTCTACATTATCTTCTTTTGTGTCTTTTTCTTTCTGTCCTCGTTGTAACCATCAAACTTTAAATTGTGATTAACCAAAATTTAATGCAATGGAGCACACATGTCGCGATCTCATTGCTCGTTGTGTCCAAAAAATCAAGACGATTGAAGCTTTATATCGACCCGTTGGGAGGTCATTAGATTCTTCAAAACAAAAATAACTCATCTTTTCAGAATATGGTACATTTATGGTCTCAAATTATAGACAAAAGCTAAACCTAAATATTGAGATGGTGAAAACAATCTTTTTTCGTATAAATTCAAAAGAAAAGTATTCTTGACGCATACTTCTTTTTATTTTAGTTCAATATACGTAGGGTGGAAGTTCAAACCTTAAACGTCTTGGTCAAAGATATATATCTAAACCAACTGAATTTACTTTTTATCAATAAAGTAAAATGAAGATTAGTAATTTCACGAGGTGGGCATATTTGTTATCAAATTTGCCTAAATTACTCCAAACACACTAAAAACATGAGCATACAAGGAATAACAGATATAAGGTAAGCTAGTGGGACAAAACAAGCCCACTTGCCTATCTTTTCTTCTATAAATAACCTACAAAAAGACTATGCTAAATTAAGATACAAATATTTTGAAGACAAGCAAAGTTTCTGATACATATATAATCAATCTAACAAGTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTCCCTTCCTTTTCCATATTTTAGAGTATGAATCTTTGGTGCAGGTGGAGAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGATATTAGTCTCATCTTGTCGATGATGTCGGAGTTGATACCCGATCGATTATTGGATCGTGCGATCCCTTAGGAATCTTCCATCAGTAGCTCAATACTTGTGTTGCAAATTTGATGGATTTCTCCAGGTATGGAAGAGTAGTTCTTGTTATATATGTGTGTTATTGGTTTTCTTTCAGCTAATATAACTTTGTATAATTTACCTGTCTAAGCTGATTGATCCTCATATCTACAAAAGAACCATATGTTCCCTTGTGCTATTATTCTGTTTAATCTCATCCCTTCTCTTATAATATGCCTTTTTTTAGACATACAAATTACCTTCAAAATTAAGACTTTACCCTTCTCAAACACGCCTTATATTTTGTATTGTTTTTTTTTAATAATGAAAGATATATTTAGAAGGAGTTTTGGACCTTGATCACAAAATTTAATATATCCTTAAATTCTAATTGTCAAGGTGTACAATCAATTACGTAACAAATTAACTAGTCTAACTCTTGCCTTCTTGTTGTTTTGGTGCATTATTTTATATTTAAATTACTTTGATCGAATTTTATAAAATATATGTTAACAACCAAGAGGTATGTGATCAAAATCTTGACAGTCCATTGTATTAAAAAAAATTACAAATCATGACTTTTGTTAGACTAACTTATTCGCACAATTATCTTCTACCCATGTTTTTTAAAAAAAATAAACTGTTCAACTCTAAAAGTATGGAAAAATAATTAATGAATTGGTATTTGAGTGTAATGTGTTTAATTGAATAATATGTGGAATAAAGATTCAAAATTTGATCGAAGTTATACTCACGGATGGAGCTATATATATATATATATATAATTTTTTTTTTTTTTAAGAGATGGAGCTATGTTGAGGTTGGCATAGGTCACTTATTATTATTATTATTACTATTATTTTATTATTATTTTTTTTTGTTGTGGACCTTTTTTTTTTCTTTTAGATTTGTGTGTGTGAATTTTGATTGTATATATTATCTTTCAAAAATTAATTGGCTAAATATTTTGGA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mRNA sequence

ATGAAGGGGACAAATATTTGTATGAAGAGTGAAATTCATAGTGATTGTGGGATGGAGTGCCTTGGCAAATTACTTTTAGGACGACAAATTTCTTTATCAATTGAGACCTACATCCGTGTGCCAGTTGAGTTATGCAAGGTCCAAAGCCCACGGAGGGCCCAAGCCCAAAGGTACTGGAAGGAGGCATATAAAAATGTGCATCCTAAAAGGGAAAAGTTAGTGCCTCAAGGGTTTGACCTACCAACCAAGTCGGCTCGGCACTACACCGATGTGAGGATCTCTTACGTAGGTCAACTCAAGAAGCGAGACCAAACCAAGAGAAGCAAGCTGAAGGTCAAGCCCATGAGGGGTGGAGAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGATATTAGTCTCATCTTGTCGATGATGTCGGAGTTGATACCCGATCGATTATTGGATCGTGCGATCCCTTAGGAATCTTCCATCAGTAGCTCAATACTTGTGTTGCAAATTTGATGGATTTCTCCAGGCACTAACCTTTTTGTTCGGGTCGGGTCAGATCCATTAGCCCGGTTACTTAGACGGACAAGGGCCGAGCCCAAATTTTCCTTGTACGGGAACTTATTCAAATGGGCTTTCGTTTGCCTGGCCCATATATATCCTTACGCATTTACTTTTCTTTCATTTACCATAAAGTCTAAATTACAATACCATTTAAAGTTTGGGGTGCAAACAGTGACATTTATCATAATATTTGCTTTATAATTCAATAAGCACATATAAGAATACATTCTTGGACAATGTTTTGAAGGAAAACCTATTGTATAAATATAAATTGTAACACTCTTTAACATTTAGATAAAAACTGTAACTGTTATTAAGCTTGAAGCATAATTGGATGGTCAATTGGGTAACACATATACACATATTCGTGATTAAGAGATCATAGTACAATTCCTTATCCTATATGTTGTTGTACTAAGAATGAAATTAAAAATTTAGGGTAAAAACTAATATATCTTGTACGCGCTATCGTCCATCAAAAATCTCCATGCAACCAACTTGCAACCAATGTGAAAGAAGGGGAGAAATAGAAAATCGTGAAAGAGAAAAAAAGTGAATAAATAGAAAACCAGGAAGAGGAATAGAGCAATAAAATTGAGGATACGTATTATTGGCTAATGTTTACATAAAAGAAAAAAAATAATAAAAT

Coding sequence (CDS)

ATGAAGGGGACAAATATTTGTATGAAGAGTGAAATTCATAGTGATTGTGGGATGGAGTGCCTTGGCAAATTACTTTTAGGACGACAAATTTCTTTATCAATTGAGACCTACATCCGTGTGCCAGTTGAGTTATGCAAGGTCCAAAGCCCACGGAGGGCCCAAGCCCAAAGGTACTGGAAGGAGGCATATAAAAATGTGCATCCTAAAAGGGAAAAGTTAGTGCCTCAAGGGTTTGACCTACCAACCAAGTCGGCTCGGCACTACACCGATGTGAGGATCTCTTACGTAGGTCAACTCAAGAAGCGAGACCAAACCAAGAGAAGCAAGCTGAAGGTCAAGCCCATGAGGGGTGGAGAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGATATTAGTCTCATCTTGTCGATGA

Protein sequence

MKGTNICMKSEIHSDCGMECLGKLLLGRQISLSIETYIRVPVELCKVQSPRRAQAQRYWKEAYKNVHPKREKLVPQGFDLPTKSARHYTDVRISYVGQLKKRDQTKRSKLKVKPMRGGEFQRDRIDPILVSSCR
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
ClCG05G008090ClCG05G008090gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG05G008090.1ClCG05G008090.1-proteinpolypeptide


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG05G008090.1.three_prime_UTR2ClCG05G008090.1.three_prime_UTR2three_prime_UTR
ClCG05G008090.1.three_prime_UTR1ClCG05G008090.1.three_prime_UTR1three_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG05G008090.1.cds4ClCG05G008090.1.cds4CDS
ClCG05G008090.1.cds3ClCG05G008090.1.cds3CDS
ClCG05G008090.1.cds2ClCG05G008090.1.cds2CDS
ClCG05G008090.1.cds1ClCG05G008090.1.cds1CDS