ClCG05G006500.1 (mRNA) Watermelon (Charleston Gray)

Overview
NameClCG05G006500.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (Charleston Gray))
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr05 : 6518570 .. 6525838 (-)
Sequence length525
Genome Viewer
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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ATGGGAGTCGCAATTTATTGGCACGGAGGAAGAAGGGGAGCGAAAGAACGAAATCGGGTATTAACGTGCCACGTCATTCTTGGCTTGTTTGATGACGTGTCAGTTGGCTATTGGTTCCTAGAAAAGGTAACTTGTGATAATTTTTTATGTTATTTTTCTGTGGTAAAAATTTAAATTAACAAACTGCTCTTTAAAATTAGTTATCTAAAATGTAAAATTGTTTTGGGTGAAATTATAAAATTACTCCATGAATTTTAAAATTTGTGCCTATTTCACCCGATATGCCTAGACACAAAATTAAAACTTTAGAATTATGATAGAAATAAAATTTGAATTTAAATTTAATAAAATAATTAAATTTAGAAAATTTGAATTTATCAGCGAACTATTAAACACAAAATTTAAAATTAGAAACATATCAAACACCTTAAAAGTTTATAGACGAAAGAGACACAAATTTAAAAAATTACGTGTTAAACCTATAATTTAACCAATTATCCATTACACAAAGTAAAAATTTTATACCACTTCGGTAGTTTGTTAACAAATTTTCGTACTACAACCATTATGAGATGTAGTTTACGACTAATTTTTTTTTATGAAGTATCTGTTAATAAGTTACAAACTAGAGAGTTGGGAGTTCTAATTTATATATCAAAGATATCTATACTAATTAAACTTTACTTAAGTTGGCAATGTTATGTCTTATCATCTAGTCGACAACACAAAAAAAGTTATGAATCTAATCAATACATAAAAAACATTCAAACATATCTATACTAATTAATCTAATCGACAACACATAAAAAAAAATTATGAATTTGAATGTTTTTTTCCCCTTTAAGAGTTATAACACGTGGGTGAGAAATCGAAAATTAAGCCTCTTAATTGATAGCATGTGTCTTAAACAATTGAATTATGTTCAAATTATTTGAAGTTTGGAGATCTCTAATATTGAGAGTTTTGGCTATTTATATAGAAACTCTTGGGGAGTTTGTTATTGTAGTATGATTGATTGGTTTTATTACAAGCAAAACTTGAACAACATGCCGTGTATTATATCATAACATGTTTCATGCTATGCAAATTCTGCGCGAGGATTGTTTCCTTATATGTTGATATGTGTGATGCATATTTGTTCATGTGTTTTTCTATCCTCATCGACATGTCCTGCAATTTGTCAAGAACATTGTCACATGACAGACAACAAATTCTGCATATTGTTTTTTTTCTTATTTGTCAACATGATTCTGCAAATTCCATGGCTTGCTTTTTTTTTTTTTCCTTCTTTTTTCTTTTTCCCTACAAAGAGGATTTGTTATCTTCTCAAGGCTAGCCATATATATATTGTGGTTTTGTTCAATTTTAGGGTTAGCTTTCCTTATTGAAAAGTGAGTATTGAGAGTTTTGAGCTTAGAGATCGTCTTACCCTTAACCTTCATGTATTGTGTTTAAAAAGGTTTTATCTTTTATGATGGTTGGTTTTGTTCCAATTGTCAATGAGGCCTAAGTAAATTTTTGTGAGTGTAGCAAATCTCATAAAGAACTTGGAATTAGTTTTTTATGTTATACTAAAGGGAGCTCAATCAAAGCTTTGTTTTATGGAGGTGAGAAGATCTCACACTTGGGGAGAACTTAAATACATAAAAAGTGAGGGGATATCGCACTTAGGGGGAGCTTAAGTACGTTGTATTGAGGGGTCTCATACAAAACTTGGAGAAACATTATTTGTGGAAGTGAGGATATCTCAAACTTAGGGGAAACCTAAATTGAAATTTAAGAGTAAGTTGTATGTGTGAGTCACCGAAGATGAAGTTTATCGGATAAGTACTTCGTTGTAATTGCTAAACTCTTTACATAGTGAAGTTCCTTTCCACTGGGCACACAGGCCCCAGACGTAGGTTATATTACATTGAACTGGATTATTAATTTATGTGTCTCACTATCTTTGTTGTTATTGTTTGTATTGAGTTATTCCGTTTGCAAATAATCACGTTACAACGTCATGTATGACATTTGTATTTTGTGTTAGATCCACTTTATTTTTTAGGGATGAAAATGGTTTACTTACACTACACTGCCTTCCTTTTCCATTTCTTTTATAGTTTTATCTCGTCTTCTTAGATTTTTATGGCCCAACACTTATTCAATTCTCATTCGTTTCCTTCGCTTCTAAAATTACCGACTATATTATTTCCAGAAAAAAAAATTACCGAGTTTTCTCATTTATAAGCATGCCTAAATATTGATATGTGAAAGTTGAACACCTAACAACCTAATCACTTTTGAAGTTATATCTTAGTTTGAAAATAATTGGTAATTTAATAATACCAATTAAATTTCGACTATTCATTTATTATAGTTTGTATTAAACAAAATATATTGGTTATAAATGCACAATTAAAATGTATGTAAATTAAACCTTTATCTTTTAACATGGTAAGATGTCTTTTGGATTTCTATAAAAAAAATTCTAAAAAAATACTTCATTAAGAAAAATATATGAGTATTGCCTTAGTCGTACTTATCTTTGTATAAAAGAGAGCGAAACATGTGATTAGACATAACTTAGTAGACTAAACATTACTATTACAAGAGTTGTCCTCGTTTATAGTAGATAGAAATCACTTAGAAAACAATCTAAAATATTAATTACTAGACATCCAAAATCTTATTTAAAAGCAATCCAAAATTTCCTAAAAAAAACAAAAAAACCAAAATGTTATTAGCACTCTTCTAAGATTGAGATGTATGTGCTAAATCTATATTTTGAATCACAAGCCTGAATGTTATAATTACACTTTAAATAAAAATTGACAATATGATTAAAAGTGTTAATTACTTGGCCAACAAAAGCGATTATCTCAAACCATAGTGGCTAAAGAAAAATGAAATTAAAAAATTTAGGGCTCGTTTGATAACGCTCCTGTTTTTTGTTTGATGTTTCTTGTTTTCCGTTTCTTCTTTTTTGGGAACAAGAAACAAAATTATCTTTGATAACTATATCAATTTCCTATTTCTTGAAAAAAAGAATTAGAAATAGAAACTTGTTTGGTAACTGTTTTTTGTTTCCTATTTTTTTCTTTTTGTAATAATATAATATAAAAAAGAAAATTTGTACGCGAGAGAGCAAGAGAGAGAAAGTGTGAGAGAGAAAGCGAGAGCGAGAGAGTTGGTGCGACGGAAGGAACGATCTCTTTCTCTCTAGCTTTTGAATTCAAAACCCATAAAACAAAATTGAAGTTGATTCATAATATAGACCAAGGAAGAATATTCTGGGTACCTCGTGTATACAAGCTTTAGCTTGAGAGGAGAGAGTGGAAGAAGAGACGATGGAAGTCTTAACTTGAGAGGAGACCGAGATTGATTGTTGTTGAGAAGAAAGTGTGATTGCAATCCTAAAACGCGAAGAGAGAAACAAATCGAGTGAGAACAGACTGACGAAACTAGTTTTTGTGGTTTCCAAAAGTTTCTTTAATTTTTAGGAACGTTTCTTAAATTTTGGAAACGAAAAACGGGAACAATTATCAAACACGTCCATTTCTTAAAAAAAGAGAAATAGAAATAGGAAATAGAAAACGGAAACGTTATCAAACAGGCCCCTAAAAACCCATATCCATGTGTAACTGGACTTCAACCTTTAAAAATGTATTTTTGTATTTATATTTATAATAAAAGTATACGGTTCTCTTTTAAAATTGATTGTTCTCAAAGAACGGAAGTACAAATTTTCTTAAGAAAATGAATATATTGTAAATATCAAGTAGCTAATGTTATTATCATATCTGAATTACTAACGAATACGATAATTAAGAATTCACTACAAAATAACAAATAACAAATAGCAAATGCAATTAAATGTGAAATTTAGTAATCAACCGAAATTTGATAACTAAAAACATATTAAATATTAAGATAAATTGTAAAAATTACCTCTTAAGTAAATTACTAGCAATTATGCCCTTAAATTCTCAATTGAAAAATTGAGCCTTGGACATATACAAATGTTAAAATTGAACCTTCAAAATCTAGTTGTAGAAATTGAACCTCAAACATTCAATAGTATTGAAGACTCAAGTTATATGTTTGTTAAAATTGAGTGTCTAAACTTGTACACTTGTAGAAATTTGACTCTTTAACATTTAATTTTAAAAATTAATTTATAATTAGTTATTAACATTAATCGAATATCTAACTTCGTTAGATTGACGTTTGGCTCGATGGTAAGAGGAGTTCTAACACGAAGCGAAATGATGAAGAAAGAAAAAGCATAGAGATGGCATCATGGGTCTTAATCTGGTCATCGACTACGTATGAGAGACCTATGTCGATGAGATTGATGTTGTTGATCTTCGGGCTAGAACATTGAGGTTTTATTTATTTATTTATTATTATTATTATTTTTTTACGGATGACCCCTTTTTGGGGCCAAATGAAAAATGGGTACCTTTTTAGAAATTAAATGATAAGTGACATTTTGCTTGTGTCAGCACAATGTGAATTTACCCATTCGACCCTATAAACCATTCGCTTGCTGTGATTTATAAGTTTCCTTTATACTCGATGCTTAATACTCCACACTCTATGCTCTATGCTATATACTTGTCATTCAATGCTTGATGCTCGATGCTCTATGCTCTACATTCTATGCTTCATTTAGAAGTTCACTTGATGTTTAGTGCTCAATGCTCGATGCTCTACACACTGTGCTTGATTCAAAAGTTTACTCGATGCTCGATGTTTTTATGCTATATACTCTATGTTTGATGTTTGATGCTTGATGCAAAGAAACATATAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAGAAGAAAAAATACATAAAAAAACGAAAATGAAAGGAAGAACAAATGTAGGAAAAAAACCAAATGTAAAAAAAGAAATTGAAAAAGAAATCCAAGGAAAAATGTAGAAAAAAAGAAGAAAAATGAAGAAAAAGAAACTCAGAAAAAAAATCGATAAAAAAAACAAAAGAAGAATGCATTTAAAA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mRNA sequence

ATGGGAGTCGCAATTTATTGGCACGGAGGAAGAAGGGGAGCGAAAGAACGAAATCGGGTATTAACGTGCCACGTCATTCTTGGCTTGTTTGATGACGTGTCAGTTGGCTATTGGTTCCTAGAAAAGCACAGTCTTCCAATCTCAGAAGCTAAAGATGCAGTTGTTCACCGTTCAAGTTTTGTTGGGAATTTGCTGCTAACTCCATTGAAGGGTCAGGATATAATTCACGTTCATCTTGGCTTTGGTGTTCCTTCTGCTCTCTGTGAAATTTATGAGCATTCAGCTGTGTTAGACTATAGCTGCATTAGTGGTACTGCTAACTGCATTATGGGACATAGCTTGAGAGAGGGGTTTTGCAGAATAGCCAAAAGTTCAATGGGGAAAGAGGAGGTCTTTGAGGAAGATGTCCCAGGAGAAGGAATTCATGTGGGTATGACCTTGGTTACGAAAACCAAAGTGAAAGATCAACCATGGGCTCAAAGAAATATTCTTGAGCTCAAAGTCGTGGGATCACCTTCTAGATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGAGTCGCAATTTATTGGCACGGAGGAAGAAGGGGAGCGAAAGAACGAAATCGGGTATTAACGTGCCACGTCATTCTTGGCTTGTTTGATGACGTGTCAGTTGGCTATTGGTTCCTAGAAAAGCACAGTCTTCCAATCTCAGAAGCTAAAGATGCAGTTGTTCACCGTTCAAGTTTTGTTGGGAATTTGCTGCTAACTCCATTGAAGGGTCAGGATATAATTCACGTTCATCTTGGCTTTGGTGTTCCTTCTGCTCTCTGTGAAATTTATGAGCATTCAGCTGTGTTAGACTATAGCTGCATTAGTGGTACTGCTAACTGCATTATGGGACATAGCTTGAGAGAGGGGTTTTGCAGAATAGCCAAAAGTTCAATGGGGAAAGAGGAGGTCTTTGAGGAAGATGTCCCAGGAGAAGGAATTCATGTGGGTATGACCTTGGTTACGAAAACCAAAGTGAAAGATCAACCATGGGCTCAAAGAAATATTCTTGAGCTCAAAGTCGTGGGATCACCTTCTAGATAA

Protein sequence

MGVAIYWHGGRRGAKERNRVLTCHVILGLFDDVSVGYWFLEKHSLPISEAKDAVVHRSSFVGNLLLTPLKGQDIIHVHLGFGVPSALCEIYEHSAVLDYSCISGTANCIMGHSLREGFCRIAKSSMGKEEVFEEDVPGEGIHVGMTLVTKTKVKDQPWAQRNILELKVVGSPSR
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
ClCG05G006500ClCG05G006500gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG05G006500.1ClCG05G006500.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG05G006500.1.cds5ClCG05G006500.1.cds5CDS
ClCG05G006500.1.cds4ClCG05G006500.1.cds4CDS
ClCG05G006500.1.cds3ClCG05G006500.1.cds3CDS
ClCG05G006500.1.cds2ClCG05G006500.1.cds2CDS
ClCG05G006500.1.cds1ClCG05G006500.1.cds1CDS