ClCG03G009930.1 (mRNA) Watermelon (Charleston Gray)

NameClCG03G009930.1
TypemRNA
OrganismCitrullus lanatus (Watermelon (Charleston Gray))
DescriptionUnknown protein
LocationCG_Chr03 : 16194515 .. 16216442 (+)
Sequence length267
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDS
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mRNA sequence

ATGCAAAGTTTGGAGAACCAAGTTTCCCAAATAGCCACCACCATAAGTAGGCTTGACAACCAAAACCGTAAGACCCCTGCTAGACTAGAGCACAAGGTAAGAAATGTAAGTGTTGTAACTGCTTTGGGTCCCTTTGAATCTCTTTATATGATGACTGAAAAAGAGTTTAATGAAGTGTTTGGTCTAGATGATGTGAGTGACGAAGAGGAATTTGAGACCTTACCCAACAGACTTGAACAGGTCTTCAAAGACAAGGTCTATGTATAG

Coding sequence (CDS)

ATGCAAAGTTTGGAGAACCAAGTTTCCCAAATAGCCACCACCATAAGTAGGCTTGACAACCAAAACCGTAAGACCCCTGCTAGACTAGAGCACAAGGTAAGAAATGTAAGTGTTGTAACTGCTTTGGGTCCCTTTGAATCTCTTTATATGATGACTGAAAAAGAGTTTAATGAAGTGTTTGGTCTAGATGATGTGAGTGACGAAGAGGAATTTGAGACCTTACCCAACAGACTTGAACAGGTCTTCAAAGACAAGGTCTATGTATAG

Protein sequence

MQSLENQVSQIATTISRLDNQNRKTPARLEHKVRNVSVVTALGPFESLYMMTEKEFNEVFGLDDVSDEEEFETLPNRLEQVFKDKVYV
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0008150 biological_process
cellular_component GO:0005575 cellular_component
molecular_function GO:0003674 molecular_function

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
ClCG03G009930ClCG03G009930gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG03G009930.1ClCG03G009930.1-proteinpolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ClCG03G009930.1.cds1ClCG03G009930.1.cds1CDS
ClCG03G009930.1.cds2ClCG03G009930.1.cds2CDS


Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableunknownCoilCoilcoord: 1..21
scor